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当前共找到 126 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2026-07-06 |
Data storage and retrieval with unnatural proteins expressed via E. coli
2026-Feb-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-70061-7
PMID:41764153
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研究论文 | 通过大肠杆菌表达的人工随机序列蛋白质实现数据存储与检索 | 将数字数据编码为氨基酸序列并整合到类胶原蛋白模板中，利用大肠杆菌表达实现数据存储；通过胰蛋白酶消化结合LC-MS/MS分析实现完整数据恢复，并展示蛋白质比DNA更高的稳定性以及利用亲和标签实现随机访问和加密数据保护 | 文中未明确提及局限性 | 建立基于蛋白质的数据存储框架，实现高效、稳定的数据存储与检索 | 人工随机序列蛋白质、类胶原蛋白模板、大肠杆菌表达系统 | 合成生物学 | NA | LC-MS/MS | NA | 氨基酸序列、数字数据 | NA | NA | 大肠杆菌 | NA | 数据存储、合成生物学、蛋白质工程 |
| 22 | 2026-07-03 |
A Bacteroides synthetic biology toolkit to build an in vivo malabsorption biosensor
2026-Feb-19, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2025.12.052
PMID:41610848
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研究论文 | 本文开发了一套用于脆弱拟杆菌的合成生物学工具包，并构建了体内吸收不良生物传感器，以非侵入方式监测肠道渗透压变化 | 首次为拟杆菌属构建了模块化的合成生物学工具包，包括可抑制启动子、DNA调控系统、模块化荧光转录报告电路及替代质粒整合模式，并验证其在哺乳动物肠道中的长期非侵入性监测能力 | 该生物传感器目前仅针对渗透压诱导的吸收不良模型验证，对其他肠道环境变化（如pH、氧气）的监测能力尚未探索；小鼠模型与人体肠道环境的差异可能限制直接转化 | 开发用于肠道健康诊断的非侵入性监测工具，利用遗传可操作的共生菌构建生物传感器 | 脆弱拟杆菌及小鼠模型中的肠道环境 | 合成生物学 | 吸收不良综合征、渗透性腹泻 | 荧光报告系统、质粒整合 | NA | 荧光数据 | 小鼠模型（泻药诱导渗透性腹泻） | CRISPR-Cas9 | 脆弱拟杆菌 | 可抑制启动子、荧光转录报告电路 | 医学 |
| 23 | 2026-07-02 |
Synthesis of Plant-Inspired O-Acetylated Hemicellulose Structures in the Yeast Yarrowia lipolytica
2026-Feb-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00595
PMID:41611228
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研究论文 | 在酵母解脂耶氏酵母中成功重建两种植物半纤维素骨架结构及其O-乙酰化变体的生物合成 | 首次在微生物系统中实现了植物来源O-乙酰化半纤维素结构（包括β-葡甘露聚糖和β-葡聚糖及其乙酰化变体）的从头合成，超越了天然存在的结构多样性 | 未明确讨论产量优化或大规模生产可行性，可能受限于微生物宿主中多糖合成效率及后修饰调控的复杂性 | 利用合成生物学方法在微生物工厂中重建植物半纤维素生物合成途径，生产具有定制化理化性质的功能化多糖 | β-葡甘露聚糖和β-葡聚糖骨架及其O-乙酰化变体 | 合成生物学 | NA | 糖基转移酶表达, 乙酰转移酶表达, 寡糖质谱分析, 组成及糖苷键分析 | NA | 质谱数据, 组成分析数据 | NA | NA | 解脂耶氏酵母 (Yarrowia lipolytica) | 植物来源糖基转移酶及乙酰转移酶表达路径 | 生物材料, 医药, 工业生物技术 |
| 24 | 2026-07-02 |
Yeast Stress Response to Synthetic Constructs
2026-Feb-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00715
PMID:41615018
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综述 | 综述酵母在合成生物学改造中产生的应激响应及缓解策略 | 提出了应激感知设计原则，涵盖CRISPR电路重连、适应性实验室进化、合成细胞器构建及数据驱动菌株工程等新兴方法 | 未提及具体实验验证或定量比较不同缓解策略的效果 | 理解合成构建体与酵母应激通路相互作用，开发更稳健的酵母菌株 | 酿酒酵母作为底盘细胞的应激响应机制 | 合成生物学 | NA | CRISPR | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 酿酒酵母 | 应激响应调控回路 | 工业生物技术 |
| 25 | 2026-07-02 |
Enhancing Stress Tolerance of Probiotics: Mechanisms, Strategies, and Translational Challenges
2026-Feb-11, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c12872
PMID:41614565
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综述 | 系统总结了益生菌应激耐受的分子机制及增强策略，并探讨了转化应用中的挑战 | 首次系统整合CRISPR基因编辑、合成生物学和纳米材料辅助递送等新兴技术，提出克服益生菌应激耐受性转化瓶颈的解决方案 | 监管审批和大规模制造等挑战仍需进一步解决 | 阐释益生菌应激耐受机制并评估增强策略，推动其工业应用转化 | 益生菌（包括食品、制药和农业领域使用的菌株） | NA | NA | CRISPR基因编辑、合成生物学、纳米材料辅助递送 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 益生菌（如乳酸菌等） | 应激响应代谢通路、基因调控回路 | 食品, 制药, 农业 |
| 26 | 2026-07-02 |
Classification, Pharmacological Properties, and Applications of Bioactive Constituents in Mentha Species
2026-Feb-11, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c13261
PMID:41614637
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综述 | 本文综述了薄荷属植物中生物活性成分的分类、药理特性及其在食品、医药和现代农业等领域中的应用 | 重点探讨了利用合成生物学方法生产薄荷醇以应对传统生产方法的可持续性挑战 | 未具体说明研究方法的局限性，可能缺乏对现有研究不足的深入分析 | 总结薄荷属生物活性成分的分类、药理特性及其工业应用，并探讨合成生物学在解决资源约束方面的潜力 | 薄荷属植物及其生物活性成分（如薄荷醇和黄酮类） | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | 食品, 医药, 现代农业 |
| 27 | 2026-07-02 |
Characterization of the Key Enzymes and a Gene Pair in Triterpenoid Biosynthesis of Ficus microcarpa
2026-Feb-11, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c12253
PMID:41615816
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研究论文 | 表征了榕树中八种氧化角鲨烯环化酶的功能，揭示了关键酶和一对基因在五环三萜生物合成中的作用 | 首次鉴定出桑科植物中罕见的多功能ψ-蒲公英甾醇合酶FmOSC1，并确定了区分FmOSC1与主要产生α-香树脂醇的FmOSC2的关键氨基酸残基，同时发现了具有广泛底物适应性的细胞色素P450酶FmCYP716A520 | 仅在一个植物物种中进行研究，未涉及体内验证或更广泛的进化分析 | 阐明榕树五环三萜生物合成的关键酶和分子机制，为合成生物学提供生物催化工具 | 榕树的氧化角鲨烯环化酶和细胞色素P450酶 | NA | NA | 功能表征、酶活性分析 | NA | 序列数据、酶产物数据 | 8种氧化角鲨烯环化酶和1个细胞色素P450酶，以及5个其他植物物种的同源蛋白 | NA | NA | NA | 生物技术、合成生物学 |
| 28 | 2026-06-23 |
Global reports on Glutamicibacter: a mini review
2026-Feb-28, Cellular and molecular biology (Noisy-le-Grand, France)
DOI:10.14715/cmb/2025.72.2.2
PMID:42322567
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综述 | 这篇综述全面整合了最新关于谷氨酸杆菌的分类、生态、形态、基因组和代谢知识 | 提供关于谷氨酸杆菌这一稀有放线菌群的综合当代视角，并指出通过基因组挖掘、代谢组学和合成生物学方法开展未来研究的方向 | 大多数物种中的生物合成基因簇尚未表征，植物-微生物和昆虫-微生物相互作用的机制了解有限，酶和代谢产物的工业开发受到限制 | 整合关于谷氨酸杆菌的分类、生态、形态、基因组和代谢知识，并识别未来研究前景 | 谷氨酸杆菌物种 | NA | NA | 16S rRNA测序, 系统基因组学, 基因组挖掘, 代谢组学, 合成生物学 | NA | 基因组数据, 代谢组数据, 生态数据 | NA | NA | 谷氨酸杆菌（Glutamicibacter） | NA | 食品安全, 农业, 生物修复, 治疗 |
| 29 | 2026-06-15 |
Advancing codon language modeling with synonymous codon constrained masking
2026-Feb-24, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag166
PMID:41736545
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研究论文 | 提出了一种受生物学约束的同义密码子掩码语言模型SynCodonLM，用于建模蛋白质编码DNA序列 | 在密码子语言模型中引入同义密码子约束，使模型仅从同义选项中预测掩码密码子，从而分离密码子层面与蛋白质层面的语义，捕捉核苷酸特异性模式 | NA | 开发能更好捕获DNA层面生物学特征的密码子语言模型，推进合成生物学中的序列设计 | 蛋白质编码DNA序列 | 自然语言处理 | NA | 密码子语言建模 | SynCodonLM (基于Transformer的密码子语言模型) | DNA序列 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 30 | 2026-06-15 |
Design prokaryotic cis-regulatory elements using language model
2026-Feb-05, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag122
PMID:41693567
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研究论文 | 提出了一个名为PromoGen2的语言模型，用于设计原核生物顺式调控元件（CREs），无需先验实验数据 | 该模型在无明显实验数据下设计CREs，从17000个原核生物基因组预训练，零样本预测启动子强度相关性显著提升（平均Spearman相关从0.27提高到0.50），参数减少10^3倍，并在多种细菌中实现100%设计成功率 | 原文未明确提及局限性 | 开发一个广泛适用的平台，用于生成数千种原核生物的功能性启动子 | 原核生物顺式调控元件（CREs） | 机器学习 | NA | 语言模型 | PromoGen2, PromoGen2-proka | DNA序列 | 17000个原核生物基因组 | NA | Escherichia coli, Bacillus subtilis, Bacillus licheniformis, Agrobacterium tumefaciens, Jejubacter sp. L23 | 启动子 | 合成生物学, 微生物学 |
| 31 | 2026-06-15 |
Precision Fermentation Processes for Producing Novel Foods and Its Sustainable Applications
2026-Feb, Journal of basic microbiology
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/jobm.70160
PMID:41735245
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综述 | 系统综述精准发酵技术用于生产新型食品及其可持续应用的研究进展 | 首次在统一框架内整合微生物菌株设计、生物过程工程、技术经济可行性、环境绩效和监管准备度，填补了以往产品导向或生物体导向综述的空白 | 存在高资本和能源成本、放大效率低、下游处理复杂、消费者接受度低及监管不确定性等挑战 | 系统分析精准发酵在可持续食品生产中的进展与挑战 | 精准发酵生产新型食品的相关研究和案例 | NA | NA | 精准发酵 | NA | 文献数据 | 37项研究纳入综述 | 代谢途径工程 | 微生物 | 代谢途径 | 食品, 工业生物技术 |
| 32 | 2026-06-08 |
Engineering Basal Cognition: Minimal Genetic Circuits for Habituation, Sensitization, and Massed-Spaced Learning
2026-Feb-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00766
PMID:41666326
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research paper | 采用合成生物学方法设计最小遗传电路，在单细胞系统中实现习惯化、敏感化和间隔学习效应 | 首次通过合成基因回路在单细胞层面复现非联想学习行为，揭示基因调控网络与神经学习系统的时序动力学差异 | 目前仅基于理论模型和计算机模拟，缺乏实验验证数据 | 探索最小遗传电路实现单细胞非联想学习的可行性 | 合成基因回路中的调控元件（激活子、抑制子、荧光报告基因、群体感应分子） | 合成生物学 | NA | 合成基因回路设计、计算机模拟 | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | 单细胞生物 | 习惯化回路、敏感化回路、间隔学习效应回路（含激活子、抑制子、荧光报告基因、群体感应分子） | 基础生物学、合成生物学 |
| 33 | 2026-06-08 |
APMSR: an intelligent QA system for synthetic biology empowered by adaptive prompting and multi-source knowledge retrieval
2026-Feb-05, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-38006-8
PMID:41644613
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研究论文 | 提出了一种结合自适应提示生成与多源知识检索的合成生物学智能问答系统APMSR | 利用LinUCB算法引导自适应提示生成与动态多源知识检索的平衡，增强领域信息检索的相关性和精准性 | 未提及具体限制 | 解决大语言模型在合成生物学领域知识问答中的知识缺口和幻觉问题 | 合成生物学领域的复杂专业级查询 | 机器学习 | NA | 大语言模型、自适应提示、多源知识检索、LinUCB算法 | LinUCB | 文本 | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 34 | 2026-06-07 |
Biosynthesis of Indigoidine in Microorganisms: Strategies and Applications
2026-Feb-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00800
PMID:41576205
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综述 | 系统综述了微生物合成靛蓝苷的策略与应用进展 | 聚焦于合成生物学驱动的微生物细胞工厂工程化优化靛蓝苷产量，并总结代谢工程与酶工程方法 | 靛蓝苷的途径优化、产量提升及应用多样性方面仍存在挑战 | 为下一代微生物细胞工厂生产颜料提供路线图 | 微生物宿主系统（如大肠杆菌、酵母等）及靛蓝苷生物合成途径 | 合成生物学 | NA | 非核糖体肽合成酶（NRPS） | NA | NA | NA | 合成生物学技术 | 微生物底盘菌株（如大肠杆菌、酵母等） | 靛蓝苷生物合成途径及代谢工程修饰 | 纺织工业、颜料制造 |
| 35 | 2026-06-06 |
The Coli Toolkit (CTK): An Extension of the Modular Yeast Toolkit for Use in E. coli
2026-Feb-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00489
PMID:41581077
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研究论文 | 本文介绍了Coli Toolkit（CTK），一个基于Golden Gate的模块化克隆系统，扩展了Yeast Toolkit用于大肠杆菌的遗传电路构建 | 通过将启动子细分为子部件（启动子、绝缘核酶和核糖体结合位点），增强了对转录和翻译的灵活控制，并提供预组装的NOT门基本部件以加快大型遗传电路的克隆 | 未明确讨论该工具包在大规模复杂电路设计中的潜在挑战或与其他系统的直接性能比较 | 为大肠杆菌提供一个快速高效的遗传电路组装模块化工具包，填补细菌合成生物学基础设施的关键空白 | 大肠杆菌中的遗传电路 | 合成生物学 | NA | Golden Gate组装 | 校准模型 | 表征数据 | NA | Golden Gate Assembly | 大肠杆菌 | 遗传电路，NOT门，可诱导和组成型启动子 | 健康、可持续性、生物技术 |
| 36 | 2026-06-05 |
Advances in site-specific knock-in techniques for gene editing
2026-Feb-20, Yi chuan = Hereditas
DOI:10.16288/j.yczz.25-076
PMID:41669806
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综述 | 系统总结了定点敲入技术在基因编辑中的最新进展 | 整合了位点特异性重组酶（如Bxb1整合酶）和可编程核酸酶系统（如CRISPR/Cas9）的最新进展，并比较了twinPE+Bxb1和PASTE系统的优缺点 | 实际应用中仍受脱靶活性和低效率的限制 | 提高基因敲入的精确性和效率，推动精准医学和合成生物学应用 | 位点特异性重组酶系统和可编程核酸酶系统 | 基因编辑 | NA | 位点特异性重组酶系统（Bxb1整合酶）、CRISPR/Cas9、Cas9-Bxb1整合酶系统、twinPE+Bxb1、PASTE | NA | 多组学数据 | NA | CRISPR-Cas9 | NA | NA | 精准医学、合成生物学 |
| 37 | 2026-06-05 |
Development of a Tool for High-Efficiency, Markerless and Iterative Genome Editing in Shouchella clausii
2026-Feb, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.70287
PMID:41662148
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研究论文 | 开发了一种高效、无标记、可迭代的Shouchella clausii基因组编辑工具 | 首次在Shouchella clausii中建立基于温度敏感型穿梭载体和Golden Gate组装的基因编辑系统，实现无疤痕、可迭代的基因组修改 | 尚未在更多难操作菌株中验证，且高渗电转化协议可能对部分菌株无效 | 开发适用于Shouchella clausii的高效基因组编辑工具，推动其作为微生物底盘的应用 | Shouchella clausii DSM 8716和Bacillus subtilis 168菌株 | 合成生物学 | NA | 高渗电转化、Golden Gate组装 | NA | NA | S. clausii DSM 8716和B. subtilis 168菌株，多次实验 | Golden Gate Assembly | Shouchella clausii, Bacillus subtilis | 温度敏感型穿梭载体（pM4B522），采用pop-in/pop-out整合策略，包含壮观霉素抗性标记和红色荧光蛋白报告基因 | 医学, 工业生物技术, 环境 |
| 38 | 2026-06-03 |
Multilayer Host Engineering of Saccharomyces cerevisiae to Enhance Cricket Paralysis Virus (CrPV) Internal Ribosome Entry Site Mediated Translation
2026-Feb-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00744
PMID:41546634
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研究论文 | 通过多层次的宿主工程改造酿酒酵母，增强蟋蟀麻痹病毒内部核糖体进入位点介导的翻译活性 | 首次结合翻译起始、tRNA修饰和mRNA稳定性三个机制层面的宿主改造，实现了CrPV IRES介导翻译活性数量级的提升 | 仅建立了概念验证框架，未具体量化各改造步骤对翻译效率的独立贡献，且可能存在工程菌株生长适应性代价 | 通过宿主工程策略提高CrPV IRES在酿酒酵母中的翻译效率，以扩展其在合成生物学中的RNA调控应用 | 酿酒酵母宿主菌株及CrPV IRES报告系统 | 合成生物学 | NA | 报告基因筛选、基因工程改造 | NA | 报告基因表达数据 | 多个改造菌株（具体数量未明示） | CRISPR-Cas9 | 酿酒酵母 | CrPV IRES介导的非经典翻译调控元件 | 合成生物学 |
| 39 | 2026-06-03 |
Phage-mediated delivery of CRISPR payloads
2026-Feb, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2025.102704
PMID:41547318
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综述 | 综述利用噬菌体递送CRISPR有效载荷以工程改造微生物群落的最新进展 | 系统总结了利用噬菌体递送各种CRISPR-Cas效应器进行精准基因组编辑和原位扰动的方法 | 部署的系统发育广度仍存在挑战 | 讨论利用噬菌体递送CRISPR有效载荷以工程改造微生物群落 | 微生物群落和噬菌体 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas, 噬菌体递送 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas, 噬菌体工程 | 细菌, 宿主环境 | CRISPR有效载荷, 精准基因组编辑 | 医学, 食品, 农业 |
| 40 | 2026-05-27 |
Mind Everywhere: A Framework for Conceptualizing Goal-Directedness in Biology and Other Domains-Part One
2026-Feb-01, Biological theory
IF:1.9Q1
DOI:10.1007/s13752-025-00523-6
PMID:42183019
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研究论文 | 提出一个框架来概念化生物及其他领域中的目标导向性，强调经验可检验性、新能力的发现、术语操作化以及人类目标导向性与单细胞起源的连续性 | 从多元智能领域出发，反对生物学中对目标导向性的最小化倾向，倡导用心理概念如智能、认知和意向性来理解生物学中的目的论，并强调经验可检验性和研究工具的操作化 | 可能面临传统还原论者的反对，且框架的经验验证和实际应用仍需进一步证据 | 建立一种基于心理概念的目标导向性框架，以更好地理解生命系统中的智能和目标导向行为，推动哲学思考及生物医学和生物工程应用 | 生物系统中的目标导向性，包括形态发生、合成生物学和生物电网络等领域中细胞行为的协调 | 生物信息学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 生物医学, 生物工程 |