合成生物学相关文章
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当前共找到 196 篇文献，本页显示第 61 - 80 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2026-04-28 |
Modular Deep Learning for Direct RNA Sequence Design via Self-Contained RNA Units
2026-Apr-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.16.719021
PMID:42039474
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研究论文 | 提出了一种基于自包含RNA单元（SCRU）的模块化深度学习框架，用于直接设计RNA序列 | 通过构建包含超过61,000个自包含RNA单元（SCRU）的SCRU-DB数据库，将RNA分解为结构自主的模块，突破了传统方法依赖高分辨率3D结构数据的瓶颈，并实现了直接O(1)预测和高效扩散采样 | 未提及具体局限性，但可能依赖于SCRU数据库的完整性和结构聚类准确性 | 开发可扩展且物理合理的RNA序列设计方法 | RNA序列及其自包含结构单元 | 合成生物学, 深度学习 | 不适用 | 深度学习, 3D结构聚类, GNN | 图神经网络（GNN）, 扩散模型 | 序列, 3D结构数据 | 超过61,000个自包含RNA单元（SCRU），涵盖8,200多个独特结构簇 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 合成生物学 |
| 62 | 2026-04-28 |
Nanoparticle-Based Membranes on Coacervates: From Interfacial Assembly to Biomimetic Applications
2026-Apr, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202514620
PMID:41848017
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综述 | 介绍基于纳米颗粒膜包覆凝聚液滴的形成机制、理化性质及仿生应用 | 系统分类纳米颗粒膜形成的主要驱动力（界面能驱动自组装、静电相互作用主导组装、协同多机制组装），并强调膜包覆显著提升凝聚液滴的结构完整性和选择性分子渗透性 | 当前在纳米颗粒包覆凝聚液滴的设计和调控方面存在局限性 | 通过概述纳米颗粒基膜包覆凝聚液滴的研究进展，推动其在合成生物学和仿生材料领域的进一步研究和应用 | 凝聚液滴和基于纳米颗粒的膜包覆系统 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学, 仿生材料 |
| 63 | 2026-04-27 |
Ion- and Temperature-Programmable Reconfiguration of Subcompartments in Synthetic Cells
2026-Apr-28, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.202500928
PMID:42029428
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研究论文 | 提出一种纯镁离子介导的可逆子区室组装机制，实现合成细胞内的动态重构 | 首次利用镁离子作为可逆调控因子，通过离子浓度和温度变化实现合成细胞子区室的空间重构，克服了合成细胞设计中动态重组的挑战 | 未研究镁离子在生理浓度下的长期稳定性及多离子协同效应，也未验证该系统在复杂生物环境中的适用性 | 开发一种基于物理刺激的合成细胞动态组织机制，模拟活细胞子区室的空间重组 | 带负电的巨型单层囊泡和中性大单层囊泡，分别作为合成细胞底盘和子区室模型 | 数字病理学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学、工业生物技术 |
| 64 | 2026-04-27 |
From transport to regulation: systems engineering for high-efficiency dicarboxylic acid biosynthesis
2026-Apr-24, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2026.103499
PMID:42034010
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综述 | 总结了通过酶工程、系统代谢工程和合成生物学方法提高中长链二羧酸生物合成效率的策略 | 重点探讨了疏水底物跨膜转运增强机制、新型转运蛋白挖掘、关键酶（如细胞色素P450）的蛋白工程改进以及反向β-氧化循环构建等系统级代谢调控创新 | 仍存在疏水底物质传效率低、关键氧化酶系统不稳定和细胞代谢失衡等瓶颈 | 克服中长链二羧酸生物合成中的应用瓶颈，推动高效可持续的生物制造 | 中长链二羧酸 | NA | NA | 酶工程、系统代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | 反向β-氧化循环 | 工业生物技术、材料 |
| 65 | 2026-04-27 |
Genetic encoding of multiple distinct noncanonical amino acids
2026-Apr-24, Trends in biochemical sciences
IF:11.6Q1
DOI:10.1016/j.tibs.2026.03.006
PMID:42034479
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综述 | 本文综述了在活细胞中同时编码多种不同非经典氨基酸（ncAAs）的遗传改造技术的进展 | 提出了利用相互正交的翻译系统和扩展密码子储备库实现多种ncAAs的位点特异性整合，特别强调了在哺乳动物系统中结合稀有密码子重编码和终止密码子抑制技术首次实现最多五种不同ncAAs的编码 | 文中未具体说明同时串联多种ncAAs编码时的效率、误差率及潜在的蛋白毒性等限制因素，且主要关注技术路线而较少讨论通用性和可扩展性的挑战 | 总结同时遗传编码多种非经典氨基酸的方法以实现合成多功能生物聚合物的目的 | 多种非经典氨基酸（ncAAs）及对应的翻译系统 | 合成生物学 | NA | 遗传密码子扩展, 正交翻译系统, 终止密码子抑制, 稀有密码子重编码 | NA | NA | NA | NA | 哺乳动物细胞, 细菌 | 多功能生物传感器, 下一代治疗性蛋白, 合成生物学回路 | 医学, 合成生物学 |
| 66 | 2026-04-27 |
Membrane-Based Assembly and Interactions in Immune Receptors
2026-Apr-22, Chemical reviews
IF:51.4Q1
DOI:10.1021/acs.chemrev.5c00993
PMID:41865294
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综述 | 本文综述了免疫受体的膜基组装和相互作用，探讨了其在脂质双层中的分子原理和结构基序 | 系统总结了跨膜结构域（TMD）在免疫受体组装和信号传导中的关键作用，并揭示了膜内与膜间的分子相互作用对受体结构和功能的重复性解决方案 | NA | 理解免疫受体在脂质双层中的组装和调控机制，以及它们在合成生物学应用中的潜力 | 免疫受体，特别是单跨膜蛋白组成的受体复合物 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 67 | 2026-04-27 |
Engineering oncolytic bacteria as precision cancer therapeutics: design principles, therapeutic strategies, and translational perspectives
2026-Apr-01, Protein & cell
IF:13.6Q1
DOI:10.1093/procel/pwaf085
PMID:41128615
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综述 | 综述了工程化溶瘤细菌作为精准癌症治疗平台的设计原则、治疗策略和转化前景 | 系统整合了合成生物学调控回路设计（感知外源信号、细菌自身信号、肿瘤微环境特征）与多种治疗模态的联合策略 | 未提及临床试验中宿主免疫反应对细菌活性的具体影响及长期安全性数据 | 为开发安全有效的个性化细菌癌症疗法提供设计框架和转化路线 | 工程化溶瘤细菌及其基因调控回路 | 合成生物学 | 癌症 | NA | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, 群体感应系统, 合成基因回路 | 细菌（如溶瘤细菌） | 诱导型/自主调控回路（包括群体感应开关、细菌入侵开关、一氧化氮响应启动子、缺氧/低pH/乳酸响应启动子），产物释放模块（前药转化酶、细胞因子、抗体/纳米抗体片段） | 医学 |
| 68 | 2026-04-26 |
Unveiling the mechanistic principles and engineered exploitation of bacteria and derivatives in precision drug delivery
2026-Apr-20, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108902
PMID:42019701
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综述 | 系统综述细菌及其衍生物在精准药物递送中的工程策略和应用潜力 | 首次全面比较四种前沿细菌衍生递送系统的机制、载荷特性和工程灵活性，并展望合成生物学与纳米技术的深度融合 | 临床转化挑战分析仍较宏观，缺乏具体案例的定量数据支持 | 阐明细菌衍生递送系统用于精准药物递送的工程原理并评估其应用前景 | 活体生物治疗产品、细菌分泌系统、胞外收缩注射系统、细菌胞外囊泡四种递送平台 | 合成生物学, 纳米技术 | NA | 基因回路设计, 蛋白质工程, 纳米工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson组装, Golden Gate组装 | 细菌（大肠杆菌、沙门氏菌等）, 哺乳动物细胞 | 基因回路（传感疾病微环境）, 分泌系统（分子注射器）, 收缩注射系统（纳米注射器）, 胞外囊泡工程改造 | 医学 |
| 69 | 2026-04-25 |
A combinatorial screening platform for in situ gene delivery to adherent cells via digital microfluidics and flexible electrodes
2026-Apr-24, Lab on a chip
IF:6.1Q2
DOI:10.1039/d6lc00124f
PMID:42029944
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研究论文 | 提出一种集成数字微流控与柔性电极的组合筛选平台，实现贴壁细胞原位基因递送 | 通过数字微流控与柔性叉指电极阵列结合，实现了贴壁细胞的低电压自动电穿孔，避免了酶消化带来的生理应激，并显著降低试剂消耗 | 平台验证主要在eGFP mRNA转染和circRNA重编程上，未评估长期基因编辑效果或体内应用 | 开发一种高吞吐、低试剂消耗且不依赖细胞悬浮的原位基因递送平台 | 贴壁细胞（如人皮肤成纤维细胞） | 数字病理学 | NA | 电穿孔 | NA | 细胞图像 | NA | 数字微流控、柔性叉指电极 | 人皮肤成纤维细胞 | NA | 再生医学, 合成生物学 |
| 70 | 2026-04-25 |
Systematic Categorization and Functional Diversity of Secondary Metabolites from Bacillus spp.: A Review
2026-Apr-24, Probiotics and antimicrobial proteins
IF:4.4Q2
DOI:10.1007/s12602-026-11007-9
PMID:42029996
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综述 | 系统分类基于芽孢杆菌属的次级代谢产物，并总结其功能多样性 | 基于生物合成逻辑和化学骨架系统分类芽孢杆菌次级代谢产物，并整合其作用机制与结构-功能关系 | 代谢产物在复杂混合物中的异质性、产量和可制造性、细胞毒性和稳定性，以及体内特定化合物因果归因的挑战 | 系统分类和总结芽孢杆菌属次级代谢产物的功能多样性及潜在应用 | 芽孢杆菌属产生的次级代谢产物 | 微生物学 | NA | 基因组挖掘、代谢组学去重复、合成生物学 | NA | 化学结构数据、代谢物数据 | NA | 合成生物学 | 芽孢杆菌 | NA | 农业, 食品, 医药 |
| 71 | 2026-04-25 |
Tunable low-rate genomic recombination with Cre-lox in Escherichia coli: a versatile tool for anoxic environmental biosensing and synthetic biology
2026-Apr-22, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.01768-25
PMID:41870091
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研究论文 | 开发了一种在大肠杆菌中通过Cre-lox系统实现低速率可调控基因组重组的工具，并展示了其在厌氧环境砷生物传感和合成生物学中的应用 | 首次实现了严格调控、可滴定的低速率Cre重组酶系统，在染色体上实现优越的遗传记忆保持，并将暴露检测与测量解耦，用于厌氧条件下的砷传感 | NA | 开发一种可在厌氧环境中实现低速率、可遗传基因组重组的工具，用于环境生物传感和合成生物学应用 | 大肠杆菌中的Cre重组酶系统及其在砷传感中的应用 | 合成生物学 | NA | Cre-lox重组，全细胞生物传感 | NA | 荧光信号 | NA | Cre-lox系统 | 大肠杆菌 | 可诱导的Cre重组酶系统，用于基因组可逆记忆存储 | 环境监测，合成生物学，生物工程 |
| 72 | 2026-04-25 |
Recurrent neural chemical reaction networks that approximate arbitrary dynamics
2026-Apr-22, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2026.101572
PMID:42025162
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研究论文 | 提出一种名为“递归神经化学反应网络”的分子版递归人工神经网络，可逼近任意动力学 | 首次将递归神经网络架构与化学反应网络结合，实现可训练、可编程的复杂动力学系统 | 实验验证依赖DNA链置换技术，实际合成网络的反应速率可能受限于现有实验条件 | 构建能模拟多稳态、振荡、混沌等生物化学动力学的合成化学反应网络 | 化学神经元组成的递归化学反应网络 | 合成生物学 | NA | DNA链置换技术 | 递归神经网络 | NA | NA | DNA链置换 | NA | 递归神经网络化学电路 | 合成生物学,分子纳米技术 |
| 73 | 2026-04-25 |
Enhanced tRNA array method version 2 for simultaneous in vitro synthesis of 21 tRNAs
2026-Apr-22, Journal of bioscience and bioengineering
IF:2.3Q3
DOI:10.1016/j.jbiosc.2026.03.014
PMID:42025521
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研究论文 | 开发了tRNA阵列方法第二版，实现21种tRNA的同步体外合成并提升翻译活性 | 通过鉴定限制翻译的tRNA组（PIEN组）并引入序列修饰和前导序列，使阵列合成tRNA的翻译活性达到与单独制备tRNA相当的水平 | NA | 改进tRNA阵列方法以构建自我复制的基因表达系统 | tRNA阵列方法和翻译活性 | 合成生物学 | NA | 体外转录、翻译耦合实验 | NA | NA | 21种tRNA及多种报告蛋白 | NA | NA | tRNA表达阵列（含前导序列修饰） | 合成生物学、生物技术 |
| 74 | 2026-04-15 |
The next frontier: Exploring plant hypoxia sensing and response mechanisms through synthetic biology
2026-Apr-21, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2606254123
PMID:41973930
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 75 | 2026-04-24 |
Synthetic biology's uncertain regulatory future in the wake of Loper Bright Enterprises v. Raimondo
2026-Apr-22, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-026-03114-3
PMID:42020847
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 76 | 2026-04-24 |
Protein-free membrane fusion: A refined view of the delicate fusogenic properties of calcium
2026-Apr-21, Biophysical journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1016/j.bpj.2026.03.040
PMID:41863074
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研究论文 | 本文使用微流控捕获平台结合共聚焦显微镜，定量研究了钙离子介导的巨型单层囊泡融合，揭示了其作为无蛋白质融合剂的精细特性 | 首次在细胞大小的膜上系统量化钙离子介导的融合效率，并发现融合依赖于狭窄的参数空间，澄清了不同尺寸囊泡实验间的长期矛盾 | 研究仅限于特定脂质成分和钙浓度，未涵盖生理条件下其他离子或蛋白质的影响 | 阐明钙离子在无蛋白质条件下促使细胞大小膜融合的机制及其应用潜力 | 巨型单层囊泡 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 图像 | 数百个单个囊泡 | NA | NA | NA | 合成生物学, 膜重构研究 |
| 77 | 2026-04-24 |
Employing synthetic biology to modulate metabolic flux: Current strategies and applications
2026-Apr-21, Journal of bioscience and bioengineering
IF:2.3Q3
DOI:10.1016/j.jbiosc.2026.03.012
PMID:42020273
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综述 | 综述了利用合成生物学调控代谢通量的最新基因调控工具和策略，及其在生物制造中的应用 | 根据基因调控的分子层面（中心法则及以外）对工具进行分类，并指出了尚未充分探索但具有潜力的工具 | 单一策略无法适用于所有系统，需根据具体系统采用定制化方法 | 总结代谢工程中用于调控代谢通量的基因调控工具和策略，推动生物制造发展 | 细菌、古菌和真核生物中的多酶途径基因调控工具 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术, 能源, 材料, 医药, 食品 |
| 78 | 2026-04-24 |
Vacuum and Sonication Treatment Enable Efficient Transient Gene Expression in Various Monocot and Eudicot Plant Seedlings
2026-Apr-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00855
PMID:41865287
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research paper | 介绍了一种名为VAST的瞬时转化方法，通过真空和超声处理显著提高了多种单子叶和双子叶植物幼苗中瞬时基因表达的效率和通用性 | 首次将真空浸润和超声预处理结合应用于农杆菌共培养前的幼苗转化，系统优化植物生长条件，大幅提升瞬时基因表达效率并减少组织损伤，成功应用于包括小麦、玉米在内的多种关键作物 | NA | 开发一种高效、通用且简单的瞬时转化方法，用于功能基因组学、合成生物学和生物技术研究 | 多种单子叶和双子叶植物幼苗，包括番茄、谷子、柳枝稷、玉米和小麦等 | machine learning | NA | 真空浸润、超声处理、农杆菌介导转化 | NA | NA | 涉及多种植物物种，具体样本数量未提及 | 农杆菌 | 番茄、谷子、柳枝稷、玉米、小麦等植物 | 瞬时基因表达系统 | 农业、生物技术 |
| 79 | 2026-04-23 |
Natural Food Pigments: From Biosynthesis to Application
2026-Apr-22, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c05093
PMID:41954457
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综述 | 本文综述了天然食品色素的生物合成、合成生物学策略、药理活性机制以及在医药、保健和化妆品中的应用进展 | 系统整合了天然色素的生物合成路径、合成生物学策略、药理活性机制及多领域应用，结合代谢工程、人工智能辅助筛选和生物传感等新兴技术，提出了从基础合成到高价值应用的跨学科发展路径 | NA | 探讨天然色素的生物合成、应用潜力及作为功能性色素在天然药物开发中的多重价值 | 天然食品色素，包括吡咯、类异戊二烯、醌类、酚类和甜菜碱五大结构类别 | NA | NA | 代谢工程、人工智能辅助筛选、生物传感 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医药、保健、化妆品 |
| 80 | 2026-04-23 |
Decoding Outer Membrane β-Barrels: From Structural Curiosity to Engineered Nanotherapeutics
2026-Apr-22, Chemical reviews
IF:51.4Q1
DOI:10.1021/acs.chemrev.5c00902
PMID:41973831
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综述 | 本文综述了外膜β-桶状蛋白（OMPs）的结构、功能多样性及其在生物传感、药物递送和纳米医学等领域的工程应用前景 | 将OMPs从结构研究对象提升为可工程化的精准生物分子设计平台，并系统整合了其从基础发现到纳米治疗应用的全链条发展 | 作为综述文章，未提出新的实验数据或具体技术方案，主要基于现有文献进行整合分析 | 探讨外膜β-桶状蛋白的结构功能特性及其在生物工程与纳米治疗领域的应用潜力 | 革兰氏阴性细菌、线粒体和叶绿体中的跨膜β-桶状外膜蛋白（OMPs） | 结构生物学与合成生物学 | NA | 冷冻电镜（cryo-EM）、核磁共振（NMR）、分子动力学模拟（MD simulations）、AlphaFold | NA | 结构数据、生物化学数据、相互作用组数据 | NA | 理性设计工程 | 革兰氏阴性细菌、线粒体、叶绿体 | 生物传感器、药物递送系统、诊断平台 | 医学、合成生物学、纳米医学、生物传感、诊断 |