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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2026-06-09 |
Protein coacervation-driven active forces power protocell dynamics
2026-Apr-07, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-71593-8
PMID:41946707
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研究论文 | 开发一种温度响应的弹性蛋白原细胞模型,展示蛋白质凝聚驱动的主动力生成及力学放大机制 | 首次证明蛋白质凝聚物可以独立于ATP驱动马达产生主动力,并通过交联弹性蛋白膜放大皮牛级力量以实现大规模机械工作 | 未明确讨论模型在生物体内环境中的稳定性和长期应用潜力 | 探索蛋白质液-液相分离凝聚物作为主动力发生器的力学协调与缩放机制 | 温度响应的弹性蛋白原细胞模型中的蛋白质凝聚动力学 | 合成生物学 | NA | 液-液相分离、弹性蛋白交联 | 数学模型 | 实验数据与模拟数据 | NA | NA | NA | 温度调控收缩性与力捕获的蛋白质凝聚回路 | 合成生物学、生物材料、下一代软体机器人 |
| 62 | 2026-06-08 |
Genetic toolbox development for engineering Bacteroides and other bacterial species
2026-Apr, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2026.102709
PMID:41643388
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综述 | 介绍非模式细菌物种合成生物学工具箱的开发策略,重点以拟杆菌属为例 | 系统总结了针对非模式共生菌和益生菌的基因工程工具开发方法,填补了该领域系统性指导的空白 | 未提供具体实验验证数据,主要基于文献总结和策略建议 | 为跨学科研究人员开发非模式细菌的遗传操作工具提供方法论框架 | 非模式细菌菌株,特别是拟杆菌属 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 拟杆菌属、大肠杆菌、非模式细菌 | NA | 医学 |
| 63 | 2026-06-08 |
Metabolomics-guided engineering of drought-resilient crops: Integrating multi-omics and AI for climate-smart agriculture
2026-Apr, Plant science : an international journal of experimental plant biology
IF:4.2Q1
DOI:10.1016/j.plantsci.2026.113025
PMID:41662977
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综述 | 本综述文章探讨了如何通过整合代谢组学、CRISPR基因组编辑、合成生物学和人工智能技术,培育抗旱作物的方法 | 强调将代谢组学与前沿技术(CRISPR、人工智能等)相结合,建立从诊断到预测和处方平台的转化框架,用于抗旱作物改良 | 未明确提及具体局限性,但综述性质可能缺乏实验验证和定量评估 | 建立代谢组学驱动的抗旱作物改良转化框架,促进气候智能农业 | 干旱胁迫下的植物代谢物,包括初级和次级代谢产物 | 机器学习, 数字农业 | NA | 代谢组学, CRISPR, 基因编辑, 合成生物学, 单细胞和空间代谢组学, 生态代谢组学, AI驱动的预测建模 | NA | 代谢组学数据, 基因组数据, 表型数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 植物(作物) | NA | 农业 |
| 64 | 2026-06-07 |
From toxin to biofuel: engineering microbes for methanol biomanufacturing
2026-Apr, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2026.103442
PMID:41610456
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综述 | 综述甲醇生物转化合成生物燃料的最新进展,包括甲醇细胞毒性机制及工程化策略 | 系统总结了甲醇细胞毒性机制并提出了整合系统生物学和合成生物学以实现可持续甲醇生物制造的新路径 | 未提及 | 探讨将甲醇作为一碳原料用于生物燃料生产的可行性和工程化改造策略 | 天然和合成甲基营养菌中的甲醇利用与耐受性工程 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | 代谢通路重编程、区室化、适应性进化 | 天然甲基营养菌、合成甲基营养菌 | 甲醇毒性耐受回路、甲醇生物转化代谢通路 | 能源、工业生物技术 |
| 65 | 2026-06-06 |
A synthetic gene circuit to convert biochemical signals to electrical signal in engineered sensory bacteria for electrochemical biosensing
2026-Apr-15, Biosensors & bioelectronics
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.bios.2026.118391
PMID:41548356
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研究论文 | 构建了一个综合合成基因电路,将生物化学信号(NO)转化为电信号,实现电化学生物传感 | 通过合成生物学工具设计间接电子传递(IET)通路,结合NO响应模块和PCA合成模块,创制电活性细菌以增强电信号输出,首次实现单细胞水平NO的原位电化学检测 | 受限于合成基因电路的复杂性和工程改造细菌的稳定性,实际应用可能面临长期运行和转化效率挑战 | 开发基于工程电活性微生物的电化学生物传感器,用于细胞内信号分子的高灵敏检测 | 作为电活性细菌模型的大肠杆菌(Escherichia coli),以及信号分子一氧化氮(NO) | 合成生物学、电化学生物传感 | NA | 合成生物学、电化学检测、间接电子传递通路、基因电路工程 | NA | 电化学信号数据 | 单细胞水平检测,具体样本数量未提及 | Synthetic Biology, 基因电路设计 | 大肠杆菌 (Escherichia coli) | NO响应模块与PCA合成模块耦合的合成基因电路,实现生化信号转电信号 | 医学(如生物传感诊断)、环境监测、生物技术 |
| 66 | 2026-06-06 |
One-step construction of robust protocells and prototissues in water
2026-Apr-08, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-71650-2
PMID:41951631
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研究论文 | 提出一种气液微流控辅助扩散抑制络合策略,实现原细胞和原组织的一步法稳健构建 | 首次实现低成本、高通量原细胞制造及厘米级三维原组织精确构建,所得原组织在水和空气中均具良好机械完整性 | 未说明具体限制 | 开发稳健原细胞和原组织的构建方法并模拟复杂生命行为 | 原细胞和原组织 | NA | NA | 气液微流控辅助扩散抑制络合 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学, 生物工程 |
| 67 | 2026-06-06 |
Engineering microbial therapeutics for metabolic disorders: synthetic biology strategies and future direction
2026-Apr, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2026.103440
PMID:41592357
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review | 综述利用合成生物学设计工程微生物疗法治疗代谢紊乱的策略和未来方向 | 提出将合成生物学应用于工程益生菌和微生物系统作为自我调节的活体疗法,实现精准治疗与可持续生物生产的融合 | 主要讨论临床前研究,缺乏临床应用的详细分析和挑战 | 评估合成生物学如何使工程益生菌和微生物系统成为治疗代谢紊乱的自调节疗法 | 代谢紊乱,包括2型糖尿病、肥胖症和代谢功能障碍相关脂肪性肝炎等 | NA | 代谢紊乱 | NA | NA | NA | NA | NA | 微生物宿主 | 可分泌治疗分子、降解有害代谢物、重塑宿主代谢微环境、响应生理信号的自适应反馈控制回路 | 医学 |
| 68 | 2026-06-04 |
Prolyl hydroxylase-dependent proteolysis enables the orthogonal hypoxia responses in plants
2026-Apr-09, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-71366-3
PMID:41957032
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研究论文 | 该研究通过工程化三组分系统,在植物中实现了氧依赖性蛋白降解,从而模拟动物缺氧响应机制 | 首次在植物中构建了基于脯氨酰羟化酶的氧依赖性蛋白降解系统,实现了植物与动物缺氧响应机制的功能性整合 | 人工系统仅部分恢复缺氧响应,且主要验证了转录调控功能,未全面测试对其他细胞过程的影响 | 利用合成生物学重新编程植物信号通路,探索植物与动物缺氧响应机制的同源性 | 拟南芥中的转录因子和报告蛋白 | 合成生物学 | NA | 蛋白降解工程、转录调控分析 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9(推断用于突变体构建) | 拟南芥 | 氧依赖蛋白降解系统(三组分:脯氨酰羟化酶、底物标签、泛素连接酶) | 农业、作物改良 |
| 69 | 2026-06-04 |
In Situ Synthesis of Glycosaminoglycan-Mimicking Coatings Driven by Local Pathological Microenvironment: Boosting Bladder Mucosal Regeneration and Barrier Function
2026-Apr, Advanced healthcare materials
IF:10.0Q1
DOI:10.1002/adhm.202505017
PMID:41589795
|
研究论文 | 利用内源性病理微环境触发原位合成糖胺聚糖模拟涂层,促进膀胱黏膜再生和屏障功能恢复 | 首次利用内源性过氧化氢和过氧化氢酶驱动原位聚合反应,在膀胱黏膜表面构建糖胺聚糖模拟涂层,实现抗炎和屏障功能修复的协同作用 | 研究仅在啮齿动物模型中进行验证,未评估在大型动物或人类中的效果和安全性 | 开发一种利用局部病理微环境驱动的原位合成策略,用于膀胱黏膜修复和屏障功能恢复 | 膀胱黏膜损伤的大鼠模型(环磷酰胺诱导的间质性膀胱炎) | 合成生物学、生物材料 | 间质性膀胱炎 | 内源性酶驱动聚合 | NA | 组织学图像、分子表达数据 | 多个大鼠模型样本,未具体说明数量 | NA | 大鼠 | 海藻酸寡糖-聚多巴胺共聚物的原位合成路径,用于模拟糖胺聚糖涂层 | 医学 |
| 70 | 2026-05-30 |
Engineering and Biological Mechanisms of Microalgal CO2 Fixation: A Review from Molecular Regulation to System Optimization
2026-Apr-29, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms14050999
PMID:42197385
|
综述 | 综述了微藻CO₂固定的工程与生物机制,涵盖从分子调控到系统优化的多尺度整合 | 全面整合了多尺度视角,从气液传质、CO₂同化途径、关键酶系统到代谢调控和工程策略,并提出了合成生物学、人工智能与系统工程融合的未来路线图 | 未提供定量比较或实验验证,仅基于文献总结,可能缺乏具体数据支持 | 为开发高效、智能和可持续的微藻CO₂固定系统提供理论框架和前瞻视角 | 微藻的CO₂固定机制,包括碳浓缩机制、Rubisco和碳酸酐酶系统等 | 机器学习 | NA | 代谢通量分析、系统建模 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 微藻 | CO₂固定途径、碳浓缩机制 | 环境、能源、工业生物技术 |
| 71 | 2026-05-29 |
Marine Polysaccharides Modulating the Gut Microbiota-Immune Axis in Digestive Tract Tumors: An Update
2026-Apr-23, Marine drugs
IF:4.9Q1
DOI:10.3390/md24050148
PMID:42188283
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综述 | 系统综述了海洋多糖通过调节肠道菌群-免疫轴影响消化道肿瘤的最新研究进展 | 从多糖结构、菌群调节、免疫激活、肿瘤抑制和递送优化的逻辑框架出发,系统阐述了海洋多糖对肠道菌群-免疫轴的调控作用及机制,并整合多组学、合成生物学和纳米递送策略提出未来研究方向 | 海洋多糖的结构-活性关系仍不明确,口服生物利用度较低 | 总结海洋多糖调节消化道肿瘤中肠道菌群-免疫轴的研究,并促进其临床转化 | 海洋多糖(来自藻类、动物和微生物来源) | 机器学习 | 消化道肿瘤 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 72 | 2026-05-22 |
Transforming a fragile protein helix into an ultrastable scaffold via a hierarchical AI and chemistry framework
2026-Apr-02, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.109753
PMID:41925723
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研究论文 | 提出一种结合AI引导设计与基础化学原理的分层框架,将脆弱的α-螺旋结构域转化为超稳定支架 | 首次将AI工具(如AlphaFold3)与化学原理(盐桥、金属配位)系统结合,实现多层级稳定化设计,使α-螺旋蛋白在热、机械和化学应力下具有前所未有的多轴稳定性 | 未说明 | 设计在同时热、机械和化学应力下保持结构完整性的蛋白质 | α-螺旋结构域 | 蛋白质工程 | NA | AI引导设计、分子动力学模拟 | AlphaFold3 | NA | 数百万个设计被筛选至最小候选集,具体样本量未说明 | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 73 | 2026-05-21 |
Recent advances in pathway engineering for the biosynthesis of 1,4-butanediol
2026-Apr-10, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-026-13816-y
PMID:41961299
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综述 | 综述了路径工程在1,4-丁二醇生物合成中的最新进展 | 系统总结了三条从头合成路径的设计和动态代谢调控策略,并评估了体外酶级联与全细胞转化体系的建立 | 工业放大受限于细胞内源性分解代谢、宿主耐受性不足和经济可行性欠佳 | 实现1,4-丁二醇的可持续生物合成并解决商业化瓶颈 | 微生物合成途径、酶工程和代谢调控策略 | NA | NA | 多组学、酶工程 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | CoA依赖路径、木质纤维素糖代谢路径、氨基酸分解代谢路径、体外酶级联、全细胞转化 | 工业生物技术 |
| 74 | 2026-05-21 |
Human Allele Frequency Distributions Contradict Current Narratives of Imminent Danger From Genetically Targeted Bioweapons
2026-Apr, Health security
IF:2.1Q3
DOI:10.1177/23265094261434692
PMID:41937340
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research paper | 分析遗传变异在种族间分布,驳斥基因生物武器迫在眉睫的说法 | 从自然遗传变异角度系统评估基因目标武器可行性,对比病原体和药物反应变异的种族分布差异 | 仅分析149个已验证的感染相关变异和136个药物反应相关变异,未覆盖全基因组范围 | 验证基因生物武器叙事的真实性基础,评估种族目标武器的可行性 | 人类种族间遗传变异分布数据 | machine learning | NA | 遗传变异分析 | NA | 遗传变异数据 | 149个感染相关变异和136个药物反应相关变异 | NA | NA | NA | medicine |
| 75 | 2026-05-16 |
Probiotics and the Human Microbiome: Classical Functions, Emerging Systemic Roles, and Future Therapeutic Frontiers
2026-Apr-23, Biology
DOI:10.3390/biology15090665
PMID:42117804
|
综述 | 系统综合益生菌在维持肠道稳态、免疫调节、感染预防等经典功能及肠脑轴、肠皮轴等新兴系统作用方面的证据 | 采用系统级框架关联益生菌作用与共享机制(如微生物代谢物信号、病原体竞争排斥、屏障强化及免疫神经内分泌调节),并整合翻译进展(靶向递送平台、工程化菌株、后生元策略)及未来方向(精准微生物组干预、合成生物学、AI辅助多组学分析) | 未提及具体研究的样本量或实验验证,且作为综述依赖现有文献证据,可能忽略特定菌株或宿主环境的异质性 | 系统综述益生菌的经典功能与新兴系统作用,并提出未来治疗前沿方向 | 益生菌与人体微生物组互作网络 | 微生物组学 | NA | NA | NA | 文献证据 | NA | NA | NA | NA | 医学、工业生物技术 |
| 76 | 2026-05-16 |
Enzymatic and microbial routes to bioplastics: The green chemistry frontier of biopolymers
2026-Apr, FEBS open bio
IF:2.8Q3
DOI:10.1002/2211-5463.70241
PMID:41891232
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综述 | 全面综述微生物和酶法在聚羟基脂肪酸酯生物塑料生产中的代谢途径、结构特性及技术创新 | 整合生化、结构与生物加工见解,强调工程酶和无细胞系统在生物塑料可扩展、可定制生产中的应用 | 未讨论具体技术经济挑战和监管框架的详细解决方案 | 为酶法生物塑料作为可循环生物经济中的可持续替代品提供战略方向 | 聚羟基脂肪酸酯类生物塑料及其微生物和酶法合成路径 | 合成生物学 | NA | PHA合成酶、无细胞代谢工程、酶固定化、表面展示 | NA | 综述性文献 | NA | NA | 细菌 | 聚羟基脂肪酸酯生物合成途径、体外酶促聚合系统 | 环境、工业生物技术 |
| 77 | 2026-05-15 |
Reset-free DNA logic circuits for real-time input processing and memory
2026-Apr-03, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aeb1699
PMID:41921006
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研究论文 | 提出一种基于立足点介导链反应的无复位DNA逻辑电路,用于实时输入处理和记忆存储 | 首次实现无需复位操作的DNA逻辑电路,通过连续可逆链迁移机制支持实时数据处理和记忆功能,并基于DNA折纸平台构建多种组合逻辑门和记忆元件 | NA | 开发无复位DNA逻辑电路,实现实时输入处理和记忆功能 | DNA逻辑电路元件(逻辑门、触发器、寄存器) | 合成生物学 | NA | 立足点介导链反应(TCR)、DNA折纸 | NA | NA | NA | NA | NA | 组合逻辑门(AND、OR)、置位复位触发器、数据锁存器、级联寄存器 | 生物传感、诊断、合成生物学 |
| 78 | 2026-05-12 |
Leveraging pre-trained AI models for robust promoter sequence design in synthetic biology
2026-Apr-30, Biophysics reports
DOI:10.52601/bpr.2025.240033
PMID:42109830
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研究论文 | 利用预训练AI模型实现合成生物学中稳健启动子序列的设计 | 首次将预训练模型概念应用于启动子序列分析,通过创新的预训练与微调范式,结合基础突变模型,实现高效筛选高表达且抗突变的启动子 | 依赖预训练模型(如DNABERT)的性能,可能受限于训练数据质量和模型泛化能力 | 探索预训练AI模型在合成生物学启动子设计中的应用,减少对传统实验方法的依赖 | 酵母启动子序列及其表达水平 | 机器学习 | NA | DNABERT预训练模型,基础突变模拟 | DNABERT, Pymaker | 序列数据 | 多种数据集规模下的启动子样本 | NA | 酿酒酵母 | NA | 生物制药 |
| 79 | 2026-05-12 |
Rhodo-Box: A Synthetic Biology Toolbox to Facilitate Metabolic Engineering of Rhodobacter sphaeroides
2026-04-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00808
PMID:41832780
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研究论文 | 介绍了一种针对荚膜红细菌的合成生物学工具箱Rhodo-Box,旨在促进其代谢工程改造 | 通过适应和扩展Zymo-Parts模块化克隆框架,开发了首个针对荚膜红细菌的标准化基因元件工具集,包括多种复制起点、启动子、诱导系统、核糖体结合位点和转录终止子,并引入了半自动化的克隆方法 | 未对工具在复杂代谢途径中的应用效果进行验证,也未评估长期稳定性 | 开发标准化遗传工具以推进荚膜红细菌在可持续生物制造中的应用 | 荚膜红细菌及其遗传元件 | 合成生物学 | NA | 模块化克隆框架、半自动化克隆方法 | NA | NA | NA | Zymo-Parts模块化克隆框架 | 荚膜红细菌 | 基因表达调控线路(启动子、RBS、终止子等) | 工业生物技术 |
| 80 | 2026-05-12 |
Vibrio natriegens, a Promising Chassis from Strain Property to Protein Expression: A Review
2026-04-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00761
PMID:41886740
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综述 | 系统介绍Vibrio natriegens的基本生物学特性及其在蛋白质表达中的应用进展 | 重点关注Vibrio natriegens在蛋白质表达中的最新研究与应用成就,弥补了以往综述中对该方面的关注不足 | 未明确提及具体限制 | 为研究人员提供使用Vibrio natriegens进行蛋白质表达的综合概述,突出其优势和应用前景,并提出挑战和未来展望 | Vibrio natriegens菌株及其工程化底盘 | 合成生物学 | NA | 蛋白质表达技术 | NA | NA | NA | NA | Vibrio natriegens | NA | 合成生物学 |