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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-06-15 |
Diterpene Synthases as Gatekeepers of Bioactive Diterpenoids: A Resource for Discovery and Engineering toward Efficient Synthesis
2026-May-29, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00190
PMID:42215860
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综述 | 综述二萜合酶作为生物活性二萜类化合物合成的守门酶,为发现和工程化改造以实现高效合成提供资源 | 建立了包含562个功能表征二萜合酶的综合性功能数据库,并通过整合生物信息学分析阐明不同功能类别的催化机制、产物多样性和系统发育分布 | 未提及具体局限性 | 总结二萜类化合物的生物活性和应用,构建二萜合酶功能数据库,并探讨其在合成生物学中的发展方向 | 二萜合酶(diTPSs)以及代表性二萜类化合物 | 合成生物学 | NA | 合成生物学,代谢工程 | NA | 序列数据库 | 562个功能表征的二萜合酶 | NA | 微生物(如微生物细胞工厂) | 二萜类化合物生物合成途径 | 医药,农业,化妆品,食品 |
| 2 | 2026-06-15 |
Valorizing renewable biomass into potential prebiotic oligosaccharides: Enzymatic, microbial, and synthetic biology strategies
2026-May-26, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2026.134974
PMID:42203116
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综述 | 本文综述了利用酶工程、微生物工程和合成生物学策略将可再生生物质转化为潜在益生元低聚糖的最新进展 | 系统整合了从海洋和陆地生物质资源生产多种新型低聚糖(如新琼寡糖、纤维寡糖等)的酶法和微生物技术,并强调了GRAS级微生物宿主合成人乳低聚糖的生物制造途径 | 未详细讨论大规模生产的经济可行性和下游纯化挑战 | 总结可再生生物质转化为益生元低聚糖的生物技术方法及其在个性化营养和微生物组靶向治疗中的应用潜力 | 海洋大型藻类、木质纤维素残渣、富含果胶作物等可再生生物质 | 合成生物学 | NA | 酶工程、代谢工程、微生物共培养 | NA | NA | NA | 代谢工程、合成生物学 | GRAS级微生物宿主 | 微生物生物合成途径(如人乳寡糖合成) | 食品、医学 |
| 3 | 2026-06-15 |
Microbial lipids for a sustainable future: the growing potential of synthetic microbial engineering for consumer oils
2026-May, Critical reviews in biotechnology
IF:8.1Q1
DOI:10.1080/07388551.2026.2615047
PMID:41692578
|
综述 | 探讨合成微生物工程在生产可持续消费油和脂类中的潜力 | 总结了合成酵母基因组学和自动化生物铸造厂等最新进展,为微生物脂类可持续生产提供新思路 | 未具体讨论实际应用中的技术瓶颈或经济可行性 | 推动可持续微生物脂类生物制造经济的发展 | 微生物脂类及合成生物学方法 | 合成生物学 | NA | 合成酵母基因组学、自动化生物铸造厂 | NA | NA | NA | NA | 酵母 | 微生物脂类合成途径 | 食品、保健品、塑料、动物饲料、化妆品、制药、燃料 |
| 4 | 2026-06-14 |
The Promise of Synthetic Biology for Redesigning Plant Architecture
2026-May-28, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27114876
PMID:42278408
|
综述 | 探讨利用合成生物学重新设计植物结构以实现作物改良的潜力 | 整合自然多样性、发育生物学和合成调控工程,提出理性重新设计植物结构的框架,强调合成生物学与育种及建模框架的整合 | NA | 探索通过合成生物学重塑植物结构以增强作物适应气候变化的能力 | 植物结构及相关发育过程 | 合成生物学 | NA | CRISPR-based regulatory systems, synthetic gene circuits, orthogonal signalling pathways, plant artificial chromosomes | NA | NA | NA | CRISPR, 人工染色体 | 植物(作物) | 可编程转录因子、合成基因电路、正交信号通路 | 农业 |
| 5 | 2026-06-13 |
Sugarcane Biorefinery from Component Separation to High-Value Outputs: Technical Progress and Future Perspectives
2026-May-26, Foods (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/foods15111877
PMID:42279664
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综述 | 系统总结了甘蔗汁、蔗渣和滤泥的高值化利用途径,并提出甘蔗加工全组分高值化利用框架 | 构建'甘蔗加工树'全组分高值化框架,定量揭示功能糖高利润、蔗渣预处理成本占比40-50%以及滤泥粗蜡回收率仅5-8%等关键瓶颈,并提出耦合生物炼制、合成生物学和标准化框架的未来方向 | 当前瓶颈包括预处理效率低、菌株性能不佳和分离成本高 | 解决甘蔗加工单一产品依赖和副产品利用率低的问题,推动低碳循环转型 | 甘蔗汁、蔗渣、滤泥 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术、农业 |
| 6 | 2026-06-13 |
Molecular recruitment and release using DNA host condensates
2026-May-12, Nanoscale horizons
IF:8.0Q1
DOI:10.1039/d5nh00586h
PMID:41774821
|
研究论文 | 使用DNA宿主凝聚体实现分子招募与释放 | 在DNA纳米星中整合适配体以构建具有招募和释放目标生物分子能力的凝聚体,并研究适配体位置对凝聚和招募效率的影响 | 仅研究了链霉亲和素(SA)一种模型蛋白,且适配体定位对凝聚和招募无显著影响可能限制了设计灵活性 | 探索DNA纳米星凝聚体作为可调控分子招募与释放平台的潜力 | DNA纳米星凝聚体及其招募的链霉亲和素(SA)分子 | 合成生物学 | NA | DNA纳米自组装、适配体技术 | NA | 实验数据 | 未明确说明 | DNA纳米星 | 无细胞系统 | 适配体修饰的DNA纳米星凝聚体 | 合成生物学 |
| 7 | 2026-06-13 |
Beyond text generation: large language models as autonomous agents for orchestrating synthetic biology cycles
2026-May, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2026.134309
PMID:41763131
|
综述 | 探讨大语言模型作为自主智能体在合成生物学设计-构建-测试-学习周期中的协同作用 | 将LLM定位为自主智能体而非单纯预测工具,提出语义驱动范式替代传统人工特征工程,并系统分析不同LLM架构与生物任务的适配性 | 计算成本、模型可解释性及伦理治理挑战 | 推动合成生物学在可持续制造、医学等领域突破 | 大语言模型在合成生物学中的应用范式 | 自然语言处理, 合成生物学 | NA | 大语言模型 | 各类LLM架构 | 生物序列数据 | NA | NA | NA | NA | 医药, 可持续制造 |
| 8 | 2026-06-13 |
Engineering non-ribosomal peptide synthesis: tuning the antibiotics engine of the microbial world
2026-May, Critical reviews in biotechnology
IF:8.1Q1
DOI:10.1080/07388551.2026.2615819
PMID:41771683
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综述 | 综述通过合成生物学工程非核糖体肽合成酶以优化抗菌肽产量和活性的研究进展 | 系统总结了通过前体代谢工程、代谢流调控、强启动子和调控因子引入以及异源表达等策略提升非核糖体肽产量和生物活性的方法,并指出糖肽类抗生素作为合成生物学工程新方向的潜力 | 未提及具体实验数据验证或比较不同工程策略的效率,且综述范围可能未涵盖所有非核糖体肽类型 | 综述通过合成生物学方法工程改造非核糖体肽合成酶,以提高产量和生物活性 | 非核糖体肽合成酶及其生产的抗菌肽,特别是糖肽类抗生素 | 合成生物学 | NA | 非核糖体肽合成酶工程、代谢工程、启动子工程、异源表达 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医药 |
| 9 | 2026-06-11 |
Systematic Reprogramming of Rhodobacter sphaeroides for Efficient Biosynthesis of Coenzyme Q10 and Porphyrins
2026-May-26, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00032
PMID:42186703
|
综述 | 系统综述了利用光合细菌Rhodobacter sphaeroides高效生物合成辅酶Q10和卟啉类化合物的代谢工程策略 | 系统总结了R. sphaeroides作为底盘菌株的代谢灵活性、内源调控网络及工程改造方法,突出其在辅酶Q10和卟啉生物合成中的多功能性和鲁棒性 | 未涉及多种高价值萜类与氢气的具体产量优化数据及实际工业化应用的经济可行性评估 | 评述R. sphaeroides的代谢特征、天然调控网络和工程化改造策略,评估其作为合成生物学平台菌株在工业生物生产中的应用潜力 | 紫色非硫光合细菌Rhodobacter sphaeroides | 合成生物学 | NA | 代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA | 代谢工程、发酵工程 | Rhodobacter sphaeroides | 萜类和四吡咯生物合成途径优化、前体供应增强、氧化还原与能量平衡调控、全局调控系统操纵 | 工业生物技术、医药 |
| 10 | 2026-06-11 |
Engineering an Artificial Taxol Biosynthetic Pathway from Baccatin III in Yeast
2026-May-26, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00148
PMID:42186953
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研究论文 | 在酵母中构建了从巴卡亭III合成紫杉醇的人工生物合成途径 | 首次在酵母中构建了仅需三个酶促步骤即可将巴卡亭III转化为紫杉醇的人工途径,并展示了β-苯丙氨酰辅酶A连接酶(PCLs)的广泛底物范围 | 需要进一步系统代谢工程以克服多个瓶颈,当前知识尚不足以实现规模化生物技术生产 | 实现紫杉醇的可持续生物合成,提供替代传统昂贵半合成方法的新策略 | 酵母中人工紫杉醇生物合成途径的构建和优化 | 合成生物学 | 癌症 | 代谢工程 | 结构-活性分析 | NA | NA | 代谢工程 | 酿酒酵母(S. cerevisiae) | 人工紫杉醇生物合成途径(包含β-苯丙氨酰辅酶A连接酶和巴卡亭III:3-氨基-3-苯丙酰转移酶) | 医药 |
| 11 | 2026-06-11 |
Degradation dynamics: an insight into microbial interactions with explosive compounds
2026-05-10, Biodegradation
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s10532-026-10299-6
PMID:42107032
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综述 | 综述了爆炸物与微生物相互作用中的降解动力学,涵盖降解途径、关键酶及最新研究进展 | 将传统降解动力学与合成生物学工具(如CRISPR/Cas系统)结合,提出通过工程化微生物菌株提升降解活性 | 未详细讨论工程菌株的实际应用效果及环境影响评估 | 提供爆炸物降解动力学的研究现状概述 | 微生物(细菌和真菌)与爆炸物(如硝胺、硝基取代芳香族化合物、苦味酸、TETRYL、HEXYL、RDX等)的相互作用 | 环境科学 | NA | 降解动力学分析、生物组学(Bio-omics)、合成生物学工具 | NA | NA | NA | CRISPR/Cas | 微生物(细菌、真菌) | NA | 环境科学 |
| 12 | 2026-06-11 |
AI-microbial hybrid biosensors: the next generation of intelligent detection systems
2026-May, Future microbiology
IF:2.5Q3
DOI:10.1080/17460913.2026.2678101
PMID:42212947
|
综述 | 综述人工智能与微生物生物传感器融合技术,用于病原体检测、环境监测和抗菌素耐药性分析 | 首次系统整合AI-微生物混合生物传感器的系统架构、计算策略、转化障碍及监管考虑,涵盖深度学习(如CNN)和集成模型在多传感器数据集中的应用 | 未提供具体实验数据或性能比较,缺乏对混合系统长期稳定性和临床验证的深入讨论 | 分析AI-微生物混合生物传感器作为下一代病原体检测和适应性生物监测平台的关键方面 | AI-微生物混合生物传感器系统 | 机器学习, 数字病理学 | 感染性疾病(病原体相关) | 卷积神经网络, 集成模型, 电化学阻抗谱, 拉曼光谱, 高光谱显微镜 | CNN, 集成模型 | 多传感器数据集(电化学阻抗、拉曼光谱、高光谱显微镜图像) | NA | CRISPR(CRISPR介导的传感) | 微生物(未具体指定) | 生物传感器电路(合成生物学相关) | 医学, 环境监测 |
| 13 | 2026-06-06 |
Decoding heavy metal tolerance in rice: Nucleic acid-based technologies shaping global food security
2026-May-25, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2026.152693
PMID:42190784
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综述 | 回顾核酸基技术在提升水稻重金属耐受性中的应用,从QTL定位到CRISPR编辑及多组学分析的最新进展 | 系统梳理了从QTL定位、群体GWAS、泛基因组到CRISPR基因组编辑的完整技术演化路径,整合转录组、表观基因组和宏基因组工具揭示重金属耐受机制 | 特异性与必需性困境、多金属拮抗(镉/砷氧化还原冲突)以及调控分歧(SDN-1豁免与转基因分类差异)构成主要障碍 | 阐明核酸基技术如何重构水稻重金属耐受性的发现到部署流程,保障全球粮食安全 | 水稻(特别是镉和砷耐受性与低累积品系) | 机器学习 | 肺癌 | QTL定位,GWAS,CRISPR-Cas9,转录组学,表观基因组学,宏基因组学 | NA | 基因组数据,转录组数据,表观基因组数据,宏基因组数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 水稻 | NA | 农业,食品 |
| 14 | 2026-06-06 |
Bottom-Up Creation of Virus-like Particles via Post-Insertion of Protein-Lipid Conjugates
2026-May-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00172
PMID:42160665
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research paper | 本文报道了一种通过将蛋白-脂质偶联物后插入到预先形成的脂质体中,自下而上生成病毒样颗粒的方法 | 利用SNAP-tag/BG生物正交反应实现蛋白-脂质共价偶联,并实现无洗涤剂插入脂质双层,解耦偶联物设计与脂质体设计,促进病毒样颗粒的快速系统优化 | NA | 开发一种自下而上的方法生成脂质体病毒样颗粒,用于疫苗递送和合成生物学等应用 | SARS-CoV-2 Spike蛋白与绿色荧光蛋白(GFP)构建的病毒样颗粒 | synthetic biology | COVID-19 | NA | NA | NA | NA | SNAP-tag/BG反应 | Expi293F细胞 | 蛋白-脂质偶联物后插入脂质体形成病毒样颗粒 | medicine, vaccine development, drug delivery, synthetic biology |
| 15 | 2026-06-06 |
Bibliometric-Based Analysis of Global Trends and Collaborative Networks in Plant Genetic Engineering (1994-2024)
2026-May, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70550
PMID:41553078
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综述 | 对1994-2024年间植物基因工程领域的全球趋势和合作网络进行文献计量分析 | 首次系统揭示植物基因工程领域的国际合作双核心结构,并预测未来技术方向包括种质数字化、多基因编辑、智能育种和合成生物学 | NA | 系统分析植物基因工程全球趋势及合作网络 | 全球植物基因工程相关文献 | 文献计量学 | NA | 文献计量分析 | NA | 文本 | 1994-2024年全球文献数据 | CRISPR-Cas9, 农杆菌介导转化, RNA干扰 | 烟草 | NA | 农业 |
| 16 | 2026-06-05 |
Microbial production of xanthohumol driven by synthetic biology approaches
2026-May-26, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-026-05037-2
PMID:42189397
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综述 | 该文综述了利用合成生物学方法微生物生产黄腐酚的研究进展 | 总结了用于商业化规模生产黄腐酚的生物策略,并评估了技术经济可行性 | 黄腐酚的产量和成本问题仍待解决,未来需要进一步尝试使用合成生物学进行生产 | 综述利用合成生物学实现黄腐酚可持续生产的研究进展 | 黄腐酚 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 微生物 | NA | 化妆品、制药、营养保健品、食品工业 |
| 17 | 2026-06-05 |
Bottom-Up Synthetic Biology for Artificial Cell Design: From Scaffold Materials to Functional Integration
2026-May-25, Journal of microbiology and biotechnology
IF:2.5Q3
DOI:10.4014/jmb.2604.04021
PMID:42225276
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综述 | 回顾自下而上合成生物学在人工细胞设计中的最新进展,涵盖支架材料与功能整合 | 系统总结了五种支架材料(包括新兴的凝聚层基和混合层级隔室)及四大功能类别(级联代谢、蛋白质合成、分裂和能量生产) | 模块兼容性、操作稳定性和监管挑战等关键技术限制 | 探讨自下而上人工细胞的设计原则及其生物技术应用 | 人工细胞系统 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 人工细胞、级联代谢、蛋白质合成、分裂、能量生产模块 | 工业生物催化, 治疗性蛋白质递送, 生物传感, 生命起源研究 |
| 18 | 2026-06-05 |
Spatial Regulation of CAR Signaling Enables Logic-Gated Activity
2026-May-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.22.726983
PMID:42239424
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研究论文 | 设计了一种新型的AND门控嵌合抗原受体MANTIS,通过空间调控实现逻辑门控活性 | 利用细胞外受体尺寸差异来空间调控细胞内信号通路,首次通过空间位阻和去屏蔽机制实现AND门控CAR T细胞 | NA | 开发一种新型AND门控CAR T细胞,提高对癌细胞的靶向特异性,减少对正常细胞的杀伤 | 嵌合抗原受体(CAR)和T细胞 | 合成生物学,细胞工程 | 癌症 | NA | NA | NA | NA | NA | T细胞 | AND门控受体(MANTIS),包含空间位阻域和去屏蔽机制 | 医学 |
| 19 | 2026-06-05 |
Scarless one-tube genome assembly via computationally optimized uracil-DNA glycosylase reactions
2026-May-13, RSC chemical biology
IF:4.2Q2
DOI:10.1039/d5cb00317b
PMID:42238783
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研究论文 | 提出一种基于尿嘧啶-DNA糖基化酶的单管无缝基因组组装平台,用于快速构建工程化噬菌体 | 无需长同源重叠、限制性酶切位点去除、CRISPR-Cas系统或同源重组,通过尿嘧啶-DNA糖基化酶实现模块化、高效的一锅法基因组组装,并最小化二级结构形成风险 | NA | 开发一种快速、灵活的合成基因组构建方法,应用于噬菌体工程和生物传感 | T7噬菌体基因组及重组NanoLuc荧光素酶报告基因 | 合成生物学 | NA | 尿嘧啶-DNA糖基化酶反应 | NA | NA | NA | 尿嘧啶-DNA糖基化酶 | 噬菌体 (T7) | 模块化基因组组装平台 | 医学, 环境 |
| 20 | 2026-06-05 |
Phenazine-Based Synthetic Biology to Signal Between Cells and Electrodes
2026-May, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.70169
PMID:41653016
|
研究论文 | 开发了一种基于吩嗪的模块化系统,实现电子设备与工程菌群之间的双向氧化还原通信 | 利用商品化电极和吩嗪修饰,实现电子与生物领域之间信号接收的调控,构建了包含电子信号编码、生物信号传输、双域信号接收和可控噪声的模块化通信框架 | NA | 建立电子设备与活体系统之间无缝通信的生物电子系统 | 工程细菌群体与商用电子设备之间的氧化还原信号传递 | 合成生物学 | NA | 电化学生物传感、吩嗪生物合成调控 | NA | 信号数据 | NA | NA | 工程细菌 | 双域通信通道,包含电子信号编码、生物信号传输、双域信号接收和可控噪声模块 | 环境监测、自适应生物制造、响应式生物医学设备 |