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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-11-04 |
Advances and emerging perspectives in arsenic bioremediation: a review study on mechanisms and innovations
2026-May-12, Environmental geochemistry and health
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10653-026-03243-3
PMID:42118411
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综述 | 该综述整合金属蛋白质组学和合成生物学,连接实验室尺度微生物机制与现场尺度部署,探讨砷生物修复的机制与创新 | 整合金属蛋白质组学与合成生物学,提出AST生产和植物吸力技术等创新方法,并倡导循环经济方法将砷从有害污染物转化为工业回收的有价值资源 | 当前研究多基于受控实验室条件,从实验室到真实现场场景存在“放大差距”,需依赖2025-2026建模数据库和相关根际微生物群落研究来弥合 | 综述砷生物修复的机制与创新进展,为开发未来基于微生物的修复方法提供战略指导,以保护全球水资源和净化环境 | 砷污染环境及参与砷转化的微生物(如Alishewanella agri和Bacillus cereus) | 环境生物技术 | NA | 金属蛋白质组学, 合成生物学 | NA | 文献数据 | NA | NA | NA | NA | 环境, 医学, 工业生物技术 |
| 2 | 2026-11-04 |
Elucidating the regulatory role of the Shine-Dalgarno sequence in structural gene expression of the malolactic enzyme operon using a GFP/mCherry model
2026-May-08, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-026-04999-7
PMID:42101569
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研究论文 | 该文通过GFP/mCherry报告系统研究苹果酸乳酸酶操纵子中Shine-Dalgarno序列对结构基因表达的调控作用 | 构建了模拟天然重叠(翻译偶联)和工程化非重叠结构的平行GFP/mCherry报告系统,结合定点SD2突变、16S rRNA杂交能(ΔG)计算和mRNA二级结构最小自由能(MFE)预测,揭示了SD2在翻译偶联系统中的非线性、架构特异性调控逻辑 | 研究仅在E. coli和L. lactis异源宿主中进行,未在天然宿主O. oeni中验证;未涉及MLF实际发酵条件下的调控表现 | 阐明苹果酸乳酸酶操纵子中Shine-Dalgarno序列对结构基因表达的转录后调控机制 | 苹果酸乳酸酶操纵子(mleA和mleP基因)的基因间序列及SD2序列 | 合成生物学 | NA | 定点突变、GFP/mCherry双荧光报告系统、16S rRNA杂交能(ΔG)计算、mRNA二级结构最小自由能(MFE)预测 | NA | 荧光表达数据、计算预测数据 | NA | 定点突变 | E. coli, L. lactis | GFP/mCherry双报告基因翻译偶联系统及非偶联系统 | 食品, 合成生物学 |
| 3 | 2026-11-04 |
Engineering a high-efficiency expression system in Tremella fuciformis using novel promoters and optimized transformation conditions
2026-May-08, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-026-05004-x
PMID:42101779
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研究论文 | 该研究通过鉴定强效内源启动子和系统优化根癌农杆菌介导的转化方案,在银耳中建立了高效表达系统 | 鉴定了三个新的内源启动子(P4、P5、P7),其驱动eGFP表达效率分别比对照野生型菌株高67.8倍、11.8倍和7倍,且优于组成型gpd启动子(效率提升高达1476.74%);同时发现使用棕色氧化铝处理酵母样细胞表面损伤可促进T-DNA转移,使转化子数量增加2.25倍 | 未提及具体局限性 | 开发银耳的高效表达系统以促进其分子育种和合成生物学研究 | 银耳(Tremella fuciformis)的酵母样细胞 | 合成生物学 | NA | 根癌农杆菌介导转化、扫描电子显微镜观察 | NA | 图像、实验数据 | 未明确说明样本数量 | 根癌农杆菌介导转化 | 银耳 | NA | 医学、工业生物技术 |
| 4 | 2026-11-04 |
Parabiotics as Next-Generation Microbiome Therapeutics: Insights into Mechanisms, Evidence, and Therapeutic Potential
2026-May-02, Current microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00284-026-04942-x
PMID:42069941
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综述 | 综述副益生菌(非活性微生物细胞及其组分)的作用机制、临床证据与治疗潜力 | 系统整合副益生菌在安全性、稳定性及制剂适用性上的优势,并结合多组学、CRISPR与合成生物学等新技术讨论其精准化与规模化生产 | 副益生菌在标准化和法规协调方面仍存在挑战,相关证据仍需进一步规范与统一 | 总结副益生菌的治疗应用、技术进展与转化潜力,强调其在精准健康和下一代功能性营养中的作用 | 副益生菌(非活性微生物细胞及其组分,如肽聚糖、磷壁酸、表面蛋白) | 微生物组学 | 儿科腹泻, 肠易激综合征, 特应性皮炎, 呼吸道感染, 抗生素相关菌群失调 | 宏基因组学, NGS, 蛋白质组学, 代谢组学, CRISPR-Cas系统, 合成生物学 | NA | 文本 | NA | CRISPR-Cas | NA | NA | 医学, 食品 |
| 5 | 2026-11-04 |
Plant-derived indole alkaloids in chronic inflammatory diseases: molecular mechanisms, therapeutic potential and translational challenges
2026-May, Inflammopharmacology
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s10787-026-02244-z
PMID:42009998
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综述 | 本文综述植物来源吲哚生物碱在慢性炎症性疾病中的化学结构、来源、分子机制、治疗潜力及转化挑战 | 系统整合吲哚生物碱对NF-κB、JAK/STAT、MAPK、PI3K/AKT、NLRP3炎症小体和AhR等多条炎症轴的多靶点调控机制,并强调AhR与NF-κB/STAT3通路整合及微生物群和器官选择性治疗前景 | 主要证据来自临床前研究,临床转化证据不足,存在合成生物学、代谢组学和合理杂交设计等转化障碍 | 整合植物来源吲哚生物碱的化学、来源和机制通路证据,评估其作为慢性炎症性疾病多靶点治疗骨架的潜力和转化挑战 | 植物来源吲哚生物碱及其在慢性炎症性疾病中的作用 | 药理学, 天然产物化学, 免疫学 | 慢性炎症性疾病, 结肠炎, 骨关节炎, 慢性阻塞性肺疾病, 动脉粥样硬化, 慢性肾脏病, 炎症驱动癌症 | 文献综述, 数据库检索 | NA | 文本 | PubMed、Scopus和Google Scholar数据库截至2025年12月的相关临床前、临床和综述文献 | NA | NA | NA | 医学, 药物开发 |
| 6 | 2026-04-24 |
Synthetic biology's uncertain regulatory future in the wake of Loper Bright Enterprises v. Raimondo
2026-May, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-026-03114-3
PMID:42020847
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 7 | 2026-10-06 |
Programmable living therapeutics for cancer immunotherapy
2026-05-21, Cell chemical biology
IF:6.6Q1
DOI:10.1016/j.chembiol.2026.04.007
PMID:42119557
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综述 | 该综述将合成生物学驱动的活体疗法在肿瘤免疫治疗中的应用划分为工程化CAR-T细胞、溶瘤细菌和溶瘤病毒三大模态,并系统梳理了各模态的合成线路设计与临床转化挑战 | 首次将工程化CAR-T细胞、溶瘤细菌和溶瘤病毒三大活体治疗模态统一纳入合成生物学框架进行系统分类比较,并综合提出线路复杂度、靶向精度、底盘优化和跨平台协同四大转化瓶颈 | 作为综述性文章,未提供原始实验数据,缺乏对所述合成线路的定量性能比较与标准化评估,且临床转化可行性分析主要停留在理论层面 | 系统梳理可编程活体疗法在肿瘤免疫治疗中的合成生物学设计策略,总结三大模态的最新进展,并探讨临床转化面临的关键挑战与未来方向 | 工程化CAR-T细胞、溶瘤细菌、溶瘤病毒等活体治疗平台 | 合成生物学 | 癌症 | 合成生物学线路工程 | NA | 文本 | NA | NA | CAR-T细胞, 细菌, 病毒 | 小分子响应开关, 物理信号响应开关, 肿瘤标志物响应开关, 群体感应线路, 肿瘤微环境响应逻辑门, 肿瘤选择性启动子, miRNA靶向模块, 衣壳/配体重靶向 | 医学 |
| 8 | 2026-09-29 |
Developmentally inspired synthetic kidney engineering
2026-May, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-026-03011-9
PMID:41667710
|
综述 | 提出一种'发育工程'策略,利用胚胎肾脏发育中的时空线索指导体外多尺度结构形成,构建合成肾脏组织 | 将合成生物学、空间图案化和微环境控制工具整合到发育工程框架中,提出通过引导和菊花链连接组织基序来实现可扩展的肾脏组织工程 | 该策略仍处于概念阶段,尚未在临床转化中验证;干细胞来源肾脏组织存在结果变异性、细胞类型缺失、功能成熟度不足和可扩展性问题 | 探索利用发育启发策略进行合成肾脏组织工程,以实现临床可行的肾脏替代组织 | 干细胞来源的肾脏组织、胚胎肾脏发育过程 | 合成生物学 | 肾脏疾病 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 9 | 2026-09-26 |
Exploring marine-derived compounds as potential anti-cancer agents: Mechanisms and therapeutic implications
2026-May, Cancer pathogenesis and therapy
DOI:10.1016/j.cpt.2025.08.004
PMID:41732213
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综述 | 本文综述了海洋来源化合物作为潜在抗癌剂的作用机制、治疗应用及临床开发进展 | 系统整合了海洋来源抗癌化合物的多种作用机制、已获批药物及新型递送系统,并强调海洋生物技术(基因组挖掘、合成生物学、发酵技术)在可持续生产中的应用 | 海洋天然产物产率低、结构复杂、水溶性差、生物利用度低,限制其更广泛的临床应用 | 全面概述海洋来源抗癌化合物的作用机制、治疗应用和临床开发,并探讨与现有化疗药物的协同使用潜力 | 海洋来源化合物及其在癌症治疗中的应用 | 机器学习 | 癌症 | 基因组挖掘, 合成生物学, 发酵技术, 纳米颗粒递送, 脂质体递送, 偶联物递送 | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 10 | 2026-09-24 |
Spatial Regulation of CAR Signaling Enables Logic-Gated Activity
2026-May-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.22.726983
PMID:42239424
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研究论文 | 该论文设计了一种新型的AND门控CAR受体MANTIS,利用细胞外受体尺寸差异来调控CAR信号,实现对两种抗原组合的特异性识别 | 提出了一种基于细胞外受体尺寸差异来调控CAR信号的全新AND门控受体MANTIS,通过空间位阻阻断和脱落机制实现逻辑门控活性 | 摘要中未提及该研究的局限性 | 设计能够识别抗原组合的AND门控CAR,提高CAR T细胞对癌细胞的特异性并扩大可靶向抗原范围 | CAR T细胞、癌细胞、正常细胞 | 合成生物学 | 癌症 | NA | NA | NA | NA | NA | T细胞 | AND门控受体MANTIS,利用细胞外受体尺寸差异和空间位阻阻断机制 | 医学 |
| 11 | 2026-09-23 |
Machine learning-assisted single-cell Raman imaging for rapid, sensitive detection and intracellular mapping of carotenoids in plant cell cultures
2026-May-23, Plant cell reports
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s00299-026-03858-x
PMID:42176120
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研究论文 | 该研究结合拉曼成像与多层感知器神经网络,实现烟草BY-2细胞中类胡萝卜素的无标记、无损检测与胞内定位。 | 首次将拉曼成像与多层感知器神经网络结合,用于基于类胡萝卜素组成的烟草BY-2细胞无标记分类,并实现胞内类胡萝卜素的高灵敏度成像与定位。 | 需要表面增强拉曼散射技术,可能受限于金纳米星的制备和重复性;样本量未明确说明,分类模型的泛化能力有待验证。 | 开发一种无标记、无损的单细胞分析平台,用于快速、灵敏地检测和胞内定位植物细胞培养物中的类胡萝卜素。 | 烟草BY-2细胞(野生型和转基因细胞系)中的类胡萝卜素。 | 机器学习 | NA | 拉曼成像、表面增强拉曼散射、高效液相色谱 | 多层感知器神经网络 | 图像、光谱数据 | NA | NA | 烟草BY-2细胞 | NA | 医药、工业生物技术 |
| 12 | 2026-09-19 |
WRKY Transcription Factors: Integral Regulators of Defence Responses to Biotic Stress in Crops
2026-May, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70542
PMID:41524271
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综述 | 本文综述了WRKY转录因子在作物生物胁迫防御中的调控作用,涵盖其结构分类、基因组分布及抗真菌、细菌、卵菌、病毒和害虫的调控模块 | 系统整合了多组学、精准基因组编辑、合成生物学、基因驱动和人工智能等前沿技术,提出以WRKY为中心的广谱持久抗性育种与工程化策略 | 作为综述,未提供原始实验数据验证所提出的WRKY调控模块和工程化策略 | 总结WRKY转录因子在作物生物胁迫防御中的功能与调控机制,并探讨利用WRKY网络改良作物抗病抗虫性的途径 | 作物中的WRKY转录因子及其介导的生物胁迫防御调控网络 | 植物基因组学与分子生物学 | 作物真菌性病害、细菌性病害、卵菌病害、病毒病及虫害 | 多组学、精准基因组编辑、合成生物学、基因驱动技术、人工智能 | NA | 文本 | NA | 精准基因组编辑、合成生物学、基因驱动技术 | 作物 | WRKY为中心的免疫调控网络模块 | 农业 |
| 13 | 2026-09-19 |
Bibliometric-Based Analysis of Global Trends and Collaborative Networks in Plant Genetic Engineering (1994-2024)
2026-May, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70550
PMID:41553078
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研究论文 | 该研究通过文献计量分析1994年至2024年全球植物遗传工程的研究趋势和合作网络 | 揭示了以中国和美国为中心的双核国际合作结构,并划分了技术生命周期的三个阶段,预测了未来技术方向 | 仅基于文献计量数据,可能未涵盖未发表的研究或非英语文献,且分析范围限于1994-2024年 | 系统考察全球植物遗传工程的研究趋势和合作网络 | 1994年至2024年全球植物遗传工程相关的文献数据 | 机器学习 | NA | 文献计量分析 | NA | 文本 | 未明确说明具体文献数量 | CRISPR-Cas9, RNA干扰 | 烟草, 植物 | NA | 农业 |
| 14 | 2026-09-14 |
Vesicle-Templated Self-Assembly of Programmable Freestanding Multi-μm DNA Shells
2026-05-27, Nano letters
IF:9.6Q1
DOI:10.1021/acs.nanolett.6c00402
PMID:42130031
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研究论文 | 本文介绍了一种简单且广泛适用的方法,通过先在巨型单层囊泡上组装DNA壳,再经表面活性剂介导去除脂质体,获得保留膜模板几何形状的独立DNA壳 | 首次实现了独立、膜模拟的DNA壳,通过囊泡模板化自组装及表面活性剂去除脂质体,利用两种不同DNA构造(复杂桶状DNA折纸和简单11寡核苷酸纳米星基序)展示方法的普适性,并通过DNA折纸的位点特异性可寻址性实现多层壳的可控形成 | 摘要中未明确提及 | 开发一种简单、广泛适用的方法,构建独立、膜模拟的DNA壳,用于自下而上的合成生物学中可调谐的DNA-only区室化 | 巨型单层囊泡、DNA折纸结构、11寡核苷酸纳米星基序、DNA壳 | 合成生物学 | NA | DNA折纸、囊泡模板化自组装、表面活性剂介导脂质体去除 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学、材料 |
| 15 | 2026-09-10 |
HySimODE: a hybrid stochastic-deterministic simulation framework for multiscale models of biological systems
2026-05-03, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag185
PMID:41999207
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研究论文 | 介绍HySimODE,一个用于生物系统多尺度模型的混合随机-确定性模拟框架,自动分配随机或确定性机制并执行混合模拟 | 利用确定性预模拟和机器学习分类器自动分配物种的随机或确定性机制,避免手动指定,无需模型重构,支持缺乏一致反应网络表示的生化模型 | 未在摘要中明确说明局限性 | 开发一个自动化、可复现且可扩展的混合模拟框架,用于基于ODE的生化系统的多尺度建模 | 生化系统模型,包括宿主-回路相互作用模型和长期突触增强模型 | 计算生物学 | NA | 混合模拟,机器学习分类器,ODE求解 | 机器学习分类器 | 生化ODE模型数据 | 涵盖多种动力学机制的生化ODE模型数据集 | NA | NA | 宿主-回路相互作用模型 | 医学, 合成生物学, 神经科学 |
| 16 | 2026-08-24 |
From Genome to Pharmacome: Current Status and Future Perspectives of Multi-Omics Integration in Traditional Chinese Medicine Research
2026-05-30, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes17060634
PMID:42353793
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综述 | 本文综述了多组学整合在中药研究中的现状与未来前景,涵盖基因组、转录组、蛋白质组和代谢组数据的整合应用,并提出实验验证框架。 | 提出分层实验验证框架和迭代计算-实验反馈循环,以弥补多组学分析停留在统计关联层面的不足,推动从描述性模式向机制模型的转变。 | 多数已发表的多组学分析缺乏因果水平验证,且文章未提供实验数据或具体案例。 | 探讨多组学整合在中药研究中的应用进展,并提出迈向基于机制的精确医学的策略。 | 中药材料(如道地药材)、生物活性化合物及其生物合成途径。 | 系统药理学、多组学整合 | 不适用 | 高通量测序、多组学技术(基因组、转录组、蛋白质组、代谢组) | 不适用 | 基因组、转录组、蛋白质组、代谢组数据 | 不适用 | 合成生物学平台(未具体提及工具) | 不适用 | 不适用 | 医学、工业生物技术 |
| 17 | 2026-08-22 |
Base modifications shift tertiary structure and activity in synthetic RNA origami and a natural ribozyme
2026-May-13, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-72891-x
PMID:42128887
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研究论文 | 研究碱基修饰(如5-甲基胞嘧啶和N1-甲基假尿苷)对合成RNA折纸纳米结构和天然四膜虫核酶三级结构及功能的影响 | 首次揭示碱基修饰通过改变碱基堆叠能量而非碱基配对,重塑RNA折叠景观,影响合成RNA纳米结构和天然核酶的结构-功能关系 | 主要依赖体外实验,未深入探索体内环境的影响,且仅考察了特定修饰和特定RNA系统 | 阐明常见碱基修饰对RNA三级结构和功能的影响机制,为合成生物学和疗RNA设计提供指导 | 合成RNA折纸纳米结构和天然四膜虫核酶 | 结构生物学 | NA | 冷冻电镜,FRET,生化实验 | NA | 结构图像和生化数据 | 多个RNA折纸样品和四膜虫核酶样品 | NA | NA | NA | 合成生物学,医药 |
| 18 | 2026-08-14 |
RpaA Overexpression Enhances Bioluminescence Intensity and Elevates Rhythmic Extracellular Vesicle Yield in Synechococcus elongatus PCC 7942
2026-May-25, Life (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/life16060885
PMID:42355412
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研究论文 | 本研究探讨了蓝细菌昼夜节律输出调控因子RpaA对PCC 7942细胞外囊泡产量的调控作用,发现RpaA过表达可增强生物发光强度并提高细胞外囊泡的产量 | 首次揭示昼夜节律输出信号与细胞外囊泡生物发生之间的关联,并提出RpaA过表达作为提高细胞外囊泡产量的有效策略 | 摘要未提及研究的局限性 | 研究RpaA在调节蓝细菌PCC 7942细胞外囊泡生产中的作用,并探索提高细胞外囊泡产量的策略 | 蓝细菌PCC 7942及其RpaA基因 | 合成生物学 | NA | 转录分析 | NA | 基因表达数据 | NA | 基因敲除和过表达 | Synechococcus elongatus PCC 7942 | 昼夜节律输出调控回路 | 工业生物技术、医学(纳米载体技术) |
| 19 | 2026-08-14 |
From Discovery to Manufacturing: A Quantitative Review of Phosphonates and Strategies for High-Titer Production
2026-May-22, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms14061170
PMID:42354795
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综述 | 本文对膦酸酯天然产物进行了定量综述,涵盖其发现趋势、生物活性、产生菌分类及高产策略,并提出加速发现和改善生产可及性的建议 | 首次对1959年至今的71篇膦酸酯天然产物报告进行系统性定量分析,整合发现趋势与生物功能及规模化生产之间的联系,并总结结构-活性关系和工程策略 | 综述依赖已发表的报告,可能遗漏未发表或非细菌来源的数据,且定量分析受限于原始报告的质量和完整性 | 系统梳理膦酸酯天然产物的发现、生物活性和生产策略,为加速新膦酸酯发现和提高产量提供方向 | 膦酸酯天然产物及其产生菌(主要为细菌) | 天然产物研究 | NA | 代谢工程、合成生物学、生物催化级联 | NA | 文献数据 | 71篇报告(1959年至今) | NA | 细菌 | 代谢途径工程 | 医学、农业 |
| 20 | 2026-08-14 |
Therapeutic Applications of Natural Products in Biomedicine and Pharmacotherapy
2026-May-22, Life (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/life16060873
PMID:42355401
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综述 | 本文对天然产物在药物化学、生物医学和药物治疗中的治疗应用进行了批判性和整合性分析,重点探讨其结构、功能和转化之间的联系 | 提出一个连接结构、功能和转化的系统,结合化学、药理学和转化方法,以应对天然产物开发中的挑战 | 未提供具体实验数据,仅基于文献综述,可能缺乏实证验证 | 分析天然产物在药物发现和精准医学中的潜力,并批判性评估当前策略和挑战 | 代表性天然产物如紫杉醇、青蒿素和姜黄素 | 药物化学 | NA | 基因组挖掘、合成生物学、网络药理学 | NA | 文献数据 | NA | 基因组挖掘 | NA | NA | 医学 |