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当前共找到 35 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-05-07 |
Metabolic Engineering of Aureobasidium melanogenum for Efficient Production of Gluconic Acid
2026-May-06, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c13595
PMID:42017485
|
research paper | 通过代谢工程改造出芽短梗霉菌高效生产葡萄糖酸 | 首次通过敲除普鲁兰、聚苹果酸、liamocin和黑色素关键基因并结合过表达内源葡萄糖氧化酶基因，构建出目前报道产量最高的葡萄糖酸生产菌株 | 未提及该工程菌株在工业规模化生产中的长期稳定性和经济性评估 | 高效生产葡萄糖酸 | 出芽短梗霉菌株TSYW-58 | 合成生物学 | NA | 代谢工程 | NA | NA | 一个出发菌株和多个工程菌株 | CRISPR-Cas9等基因编辑工具（未明确说明具体工具） | Aureobasidium melanogenum（出芽短梗霉） | 葡萄糖氧化酶过表达及副产物合成通路敲除 | 工业生物技术 |
| 2 | 2026-05-07 |
Optimizing Bispecific Antibody Expression via Multi-Omics Analysis and Vector Redesign
2026-May-06, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.70228
PMID:42089360
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研究论文 | 通过多组学分析和载体重设计优化双特异性抗体的表达 | 提出了整合序列级生物信息学和合成生物学诊断的方法，直接提高了复杂生物制品的可制造性，为解决隐蔽表达缺陷提供通用框架 | NA | 解决双特异性抗体在中国仓鼠卵巢细胞中表达效率低的问题 | 三种IgG-scFv格式的双特异性抗体 | 机器学习 | NA | RNA测序、剪接预测、密码子优化评估、基序筛选 | NA | 文本、序列数据 | 三种双特异性抗体候选物 | NA | 中国仓鼠卵巢细胞 | NA | 医学 |
| 3 | 2026-05-07 |
Profiling Selectivity for the Shigella Virulence Factor OspF
2026-May-05, Biochemistry
IF:2.9Q3
DOI:10.1021/acs.biochem.6c00109
PMID:42018782
|
研究论文 | 探索志贺菌毒力因子OspF的底物选择性，揭示其修饰多种细胞靶点 | 首次联合使用合成磷酸肽分析和自下而上化学蛋白质组学谱分析，发现OspF在MAPK家族内具有选择性，并识别出MAPK家族外的新靶点如Rab1A和酪蛋白激酶2β | 需要进一步研究以揭示OspF在志贺菌致病中的完整作用 | 表征OspF的底物谱并阐明其选择性 | 志贺菌毒力因子OspF及其底物 | 数字病理学 | 感染性疾病 | NA | NA | NA | NA | NA | 志贺氏菌 | NA | 医学 |
| 4 | 2026-05-07 |
Multiplexed Engineering of Salmonella Typhimurium for Targeted Cancer Therapies
2026-May-05, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00119
PMID:42085230
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综述 | 系统综述基于合成生物学的鼠伤寒沙门氏菌工程化改造方法，将其从病原体转化为安全高效的抗癌活体生物治疗产品 | 提出自适应优化与治疗增强的系统工程框架，涵盖减毒、靶向增强、定植优化、治疗剂生产、裂解控制释放及辅助模块等多维改造策略 | 未涉及临床试验数据，工程菌的遗传稳定性与临床转化瓶颈仍需进一步突破 | 总结鼠伤寒沙门氏菌工程化改造的关键方法，推动其从病原体向抗肿瘤载体的转化应用 | 鼠伤寒沙门氏菌及其工程化改造策略 | 合成生物学 | 癌症 | 合成生物学基因电路设计 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9,TALEN,Gibson组装,Golden Gate组装 | 鼠伤寒沙门氏菌 | 减毒电路、靶向增强电路、定植优化电路、治疗剂生产通路、裂解控制释放系统、辅助模块 | 医学 |
| 5 | 2026-05-07 |
Systematic Evaluation of Different Ribonucleoprotein Complexes as Posttranscriptional Biosensors in Cell-Free TX-TL Systems
2026-May-05, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00170
PMID:42086502
|
研究论文 | 系统评估不同核糖核蛋白复合体在无细胞转录翻译系统中作为转录后生物传感器的性能 | 首次系统比较三种核糖核蛋白复合体（RISC、MS2-CNOT7、L7Ae）在不同无细胞平台中的传感能力，并成功实现蛋白酶响应的L7Ae条件性抑制，拓宽了无细胞生物传感器的应用范围 | 体外转录RNA传感器存在报告基因基础表达水平量化困难的问题，MS2-CNOT7系统受裂解液依赖性限制而降低可编程性 | 评估核糖核蛋白复合体作为无细胞转录后生物传感器的可行性及鲁棒性 | 三种核糖核蛋白复合体（RISC、MS2-CNOT7、L7Ae）及其在无细胞系统中的应用 | 合成生物学 | NA | 无细胞转录翻译系统（TX-TL）、体外转录（IVT） | NA | 实验数据 | NA | NA | 真核细胞、原核细胞、重组系统 | 转录后生物传感器（RISC、MS2-CNOT7、L7Ae核糖核蛋白电路）、蛋白酶响应的条件性抑制电路 | 医学、环境 |
| 6 | 2026-05-07 |
Genetic code expansion: Bridging synthetic biology precision and cellular complexity to decipher molecular mechanisms of diseases
2026-May-04, Current opinion in chemical biology
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.cbpa.2026.102690
PMID:42085977
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综述 | 本文概述了遗传密码扩展技术在生理相关背景下研究疾病生物学的进展、挑战和新兴方法 | 将GCE定位为转化合成生物学平台，用于机制性解析疾病过程，强调其在越来越接近生理环境中的应用 | 该技术广泛实施的主要挑战仍待解决，但具体局限性文中未详细说明 | 利用遗传密码扩展技术解析疾病的分子机制 | 动态蛋白质相互作用、翻译后修饰和信号事件 | 合成生物学 | NA | 遗传密码扩展 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 7 | 2026-05-07 |
HySimODE: a hybrid stochastic-deterministic simulation framework for multiscale models of biological systems
2026-May-03, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag185
PMID:41999207
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研究论文 | 介绍HySimODE，一个用于生物系统多尺度模型的混合随机-确定性模拟框架 | 通过机器学习分类器自动分配物种至随机或确定性区间，消除手动指定和模型重构需求，实现数据驱动的混合模拟 | 可能依赖于训练数据集的多样性，对超出训练分布的新模型泛化能力有限 | 开发自动化混合模拟框架，处理包含低拷贝随机和丰度确定性的生物化学模型 | 生物化学ODE模型，包括合成生物学的宿主-电路相互作用模型和神经生物学的长期突触增强模型 | 机器学习 | NA | 混合模拟、ODE求解器、机器学习分类器 | 机器学习分类器、随机模拟、确定性ODE集成器 | 生物化学ODE模型数据 | 多个动态区域的生物化学ODE模型数据集 | NA | NA | NA | 合成生物学、神经生物学 |
| 8 | 2026-05-07 |
Recombinant human serum albumin-A paradigm shift: From laboratory development to industrial-scale production, and clinical translation
2026-May-03, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108914
PMID:42086096
|
综述 | 综述了重组人血清白蛋白从实验室开发到工业规模生产和临床转化的范式转变 | 强调范例转变不仅仅来自产量考量，而是来自可扩展性、成本效益、法规可行性与下一代纯化策略兼容性的最优整合，并指出其工程化潜力可作为创新药物递送和先进疗法中的通用平台 | 实现全部潜力取决于克服生产规模化的经济挑战、确保产品一致性，以及利用合成生物学和智能制造来开创新一代多功能生物治疗药物 | 阐述重组人血清白蛋白的工业化路径和临床验证，并展望其未来应用方向 | 重组人血清白蛋白 | 合成生物学 | NA | 重组蛋白生产、下一代纯化策略 | NA | 文献资料 | NA | NA | Komagataella phaffii, 转基因水稻 | NA | 医学 |
| 9 | 2026-05-07 |
Specialized proresolving mediator-loaded extracellular vesicles mitigate pulmonary inflammation
2026-May-01, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2025-0398OC
PMID:41124277
|
研究论文 | 利用合成生物学策略载入特异性促消退介质的外泌体减轻肺部炎症 | 首次通过合成生物学方法，利用多基因表达载体共表达消退素生物合成酶，将生物活性脂质介质（消退素）选择性装载到细胞外囊泡中，并验证其在减轻肺部炎症中的治疗潜力 | 研究仅在小鼠模型中进行验证，未涉及人类临床试验；对细胞外囊泡装载消肿素的具体机制及体内长期安全性尚无深入探讨 | 开发一种可扩展的载有消退素的细胞外囊泡平台，用于治疗急性肺损伤及其他慢性炎症性疾病 | 人胚肾293T细胞、THP-1巨噬细胞、内皮细胞、脂多糖处理小鼠 | 数字病理学 | 急性肺损伤, 慢性炎症性疾病 | 合成生物学, 细胞外囊泡装载, 多基因表达载体 | NA | 实验数据, 图像（内皮细胞粘附与通透性评估） | 体外细胞实验（多组重复）；体内小鼠实验（脂多糖处理组与对照组，样本量未具体说明） | 多基因表达载体 | 人胚肾293T细胞 | 消退素生物合成酶（环加氧酶2, 5-脂氧合酶, 15-脂氧合酶）共表达通路 | 医学 |
| 10 | 2026-05-07 |
Multi-Targeting Non-Specific Genome Engineering in Bacteria
2026-May, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202521532
PMID:41801001
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研究论文 | 开发了一种基于多靶向整合酶系统的通用基因组工程方法MNGE，用于在多种细菌中高效整合代谢基因或途径 | 提出MNGE方法，基于多靶向整合酶系统实现多拷贝、高度随机（仅需核心TT二核苷酸）的基因整合，适用于革兰氏阳性和阴性菌，并显著提高异源宿主中化合物产量 | NA | 开发一种宿主独立的通用基因组工程方法，以高效整合和表达代谢基因或途径 | 多种细菌，包括革兰氏阳性菌（链霉菌、糖多孢菌）和革兰氏阴性菌（伯克霍尔德菌、紫色杆菌） | NA | NA | MNGE, 多靶向整合酶系统 | NA | NA | NA | NA | 链霉菌 (Streptomyces albus), 伯克霍尔德菌 (Burkholderia gladioli) | 代谢途径整合 | 代谢工程，合成生物学，工业生物技术 |
| 11 | 2026-05-07 |
Followers' Choice: The Trends Transforming Precision Medicine, Synthetic Biology, and Sustainable Microbiology
2026-May, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.70370
PMID:42087404
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 12 | 2026-05-06 |
Gibson Assembly of Highly Repetitive DNA
2026-May-05, Biochemistry
IF:2.9Q3
DOI:10.1021/acs.biochem.6c00002
PMID:42021475
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研究论文 | 报道了一种基于Gibson组装的模块化质粒框架，用于可扩展和序列定义地组装高度重复DNA，并以弹性蛋白样多肽为模型验证其有效性 | 提出了一种通过Gibson消化与组装工作流实现迭代重复扩增的模块化质粒框架，能够高效构建大片段重复DNA序列，并通过全质粒测序验证序列完整性 | 仅以特定重复序列（GVGVP）为模型，未测试其他类型重复序列的适用性；表征限于NEB 5-alpha细胞，未评估在更复杂宿主中的表达效果 | 开发一种通用策略用于合成高度重复DNA序列，并编码可编程蛋白质聚合物 | 编码五肽Gly-Val-Gly-Val-Pro重复序列的弹性蛋白样多肽（ELP）质粒 | 合成生物学 | NA | Gibson组装、DNA消化与组装、全质粒测序 | NA | DNA序列数据 | 构建了最大513个GVGVP重复的质粒，并表征了257个重复的功能 | Gibson Assembly | 大肠杆菌NEB 5-alpha细胞 | 迭代重复扩增的质粒架构（通过dIII和HI消化及Gibson组装实现） | 生物技术、材料科学 |
| 13 | 2026-05-06 |
RATEX: A Scalable RNA-Based Platform for Logical and Multi-Layered Cellular Programming
2026-May-05, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202520600
PMID:42083989
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研究论文 | 介绍了一种名为RATEX的可扩展RNA平台，用于逻辑和多层细胞编程 | 整合了翻译到转录的转换器与合成RNA调节器，实现了紧凑且可扩展的RNA编程电路架构，并利用天然核糖体介导的多种环境输入感知 | 构建具有宽动态范围和多重调控级联的合成RNA电路仍是一个挑战 | 开发可扩展的遗传电路以实现细胞中的复杂功能 | RNA调节器和多输入逻辑门 | 合成生物学 | NA | RNA调控、基因电路设计 | 逻辑门（OR、AND） | RNA信号、代谢物信号 | NA | RATEX平台 | 活细胞（未具体说明） | 逻辑门（多输入OR和AND门）、信号放大和级联级联 | 合成生物学、生物技术 |
| 14 | 2026-05-06 |
Synthetic Biology-Driven Innovations in Triple-Negative Breast Cancer: Integrating Engineering Design with Targeted Therapeutics
2026-May-02, Journal of biotechnology
IF:4.1Q2
DOI:10.1016/j.jbiotec.2026.04.017
PMID:42082082
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综述 | 本文综述了合成生物学驱动三阴性乳腺癌精准医疗的创新方法，整合工程设计与靶向治疗 | 整合合成生物学、免疫肿瘤学和精准医学，提出细胞工程、微生物系统和核酸工程相结合的多模式治疗策略 | 仅回顾现有进展，未提供实验验证或比较不同方法的疗效 | 探讨合成生物学在克服三阴性乳腺癌异质性、耐药性和免疫抑制方面的潜力，促进下一代个性化治疗 | 三阴性乳腺癌 | 合成生物学 | 乳腺癌 | CRISPR/Cas | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 免疫细胞、细菌、诱导多能干细胞 | 合成基因回路、嵌合抗原受体（CAR） | 医学 |
| 15 | 2026-05-05 |
Engineering the Liquid-to-Solid Transition of Biomolecular Condensates: Molecular Mechanisms, Control Strategies, and Applications
2026-May-03, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.73582
PMID:42070290
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综述 | 系统梳理了生物分子凝聚体从液态到固态转变的分子机制、控制策略及应用 | 整合生物物理学、合成生物学和材料科学，首次全面阐述液固转变的分子语法、时空控制工程策略及在生物系统设计中的新兴应用 | 当前对液固转变的精确时空控制仍面临挑战，未来需进一步探索其在系统化学和合成生物学中的设计原则 | 探讨生物分子凝聚体液固转变的工程化调控及其在疾病治疗和合成生物学中的应用 | 生物分子凝聚体及其液固转变过程 | 合成生物学 | NA | 液-液相分离观察技术、分子工程方法 | NA | NA | NA | NA | NA | 液固转变调控回路 | 医学、系统化学、合成生物学 |
| 16 | 2026-05-05 |
Deep learning architectures achieve state-of-the-art (SOTA) accuracy in protein secondary structure prediction
2026-May-03, Molecular diversity
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s11030-026-11570-x
PMID:42071121
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综述 | 本文综述了深度学习架构在蛋白质二级结构预测中达到最先进精度的最新进展 | 系统总结了混合模型设计、基准数据集和评估指标的最新进展，并讨论了未来方向如跨物种验证、不确定性感知建模和异构生物数据整合 | 当前方法存在数据依赖性和数据集偏差问题 | 综述深度学习在蛋白质二级结构预测领域的进展并指出未来方向 | 蛋白质二级结构预测方法 | 深度学习 | NA | NA | CNN, RNN, Transformer, AlphaFold2 | 蛋白质序列数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学, 药物开发, 疾病研究 |
| 17 | 2026-05-05 |
Recent advances in Chlamydomonas reinhardtii as a green factory for sustainable biofuels and bioproduct production
2026-May-01, New biotechnology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.nbt.2026.04.005
PMID:42070768
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综述 | 本文综述了莱茵衣藻作为绿色工厂在可持续生物燃料和高价值生物产品集成生产方面的最新进展 | 强调将生物燃料生产与高价值生物产品生产相结合的综合视角，以推动循环生物经济发展 | 面临碳和氧化还原分配、叶绿体-脂滴相互作用、产品一致性等挑战，以及规模化限制、生长-产量权衡和下游加工成本高等瓶颈 | 评估莱茵衣藻在可持续生物燃料和高价值生物产品集成生产中的潜力和工程策略 | 莱茵衣藻 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | 莱茵衣藻 | 三酰甘油积累、乙醇发酵、光生物产氢、重组蛋白表达、类胡萝卜素合成、多糖合成、可降解聚合物合成等代谢途径 | 医药, 营养品, 材料, 工业生物技术, 环境, 能源 |
| 18 | 2026-05-04 |
The tryptophan prenyltransferase ComQ from Bacillus subtilis 168 can prenylate daptomycin at Trp1
2026-May-02, The FEBS journal
DOI:10.1111/febs.70578
PMID:42068243
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研究论文 | 本研究首次证明来自枯草芽孢杆菌168的色氨酸异戊二烯转移酶ComQ能够异戊二烯化环状抗菌肽达托霉素，显示出其作为合成生物学工具的潜力 | 首次发现ComQ不仅修饰线性肽，还能异戊二烯化环状肽，扩大了底物范围，为生物活性化合物的生物合成工程提供了新工具 | 未提及体内应用或工程化ComQ变体的具体效果 | 探究ComQ作为合成生物学工具异戊二烯化环状抗菌肽的可行性 | 枯草芽孢杆菌168的异戊二烯转移酶ComQ及其底物ComX和信息素和达托霉素 | 合成生物学 | NA | 克隆、蛋白纯化、AlphaFold建模 | AlphaFold | 蛋白质结构 | NA | NA | 大肠杆菌 | NA | 医学、工业生物技术 |
| 19 | 2026-05-04 |
Parabiotics as Next-Generation Microbiome Therapeutics: Insights into Mechanisms, Evidence, and Therapeutic Potential
2026-May-02, Current microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00284-026-04942-x
PMID:42069941
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综述 | 综述了后生元作为下一代微生物组疗法的机制、证据和治疗潜力 | 首次系统总结后生元（非活性微生物或其组分）在安全性、稳定性和功能食品应用中的优势，并整合组学技术（如宏基因组学、CRISPR-Cas）对其研发的加速作用 | 标准化和监管协调仍面临挑战 | 探讨后生元在微生物组靶向干预中的应用及其转化潜力 | 后生元（非活性微生物细胞或其组分） | NA | 儿科腹泻、肌肉衰减、肠易激综合征、特应性皮炎、呼吸道感染、代谢性疾病 | 宏基因组学、下一代测序、蛋白质组学、代谢组学、CRISPR-Cas系统、合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas系统 | NA | NA | 医学、食品 |
| 20 | 2026-05-04 |
The convergence of AI-driven engineering biology and emerging technologies advancing globally networked autonomous biofoundries
2026-May-01, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2026.103503
PMID:42068969
|
综述 | 综述了人工智能驱动的工程生物学与新兴技术的融合，推动全球网络化自主生物铸造厂的发展 | 提出AI驱动自主生物铸造厂概念，整合计算设计、自动化制造与数据驱动学习于自适应框架，并强调数字孪生和全细胞建模等技术的融合 | 未具体说明当前技术融合的实证验证或实际部署面临的挑战细节 | 探讨人工智能与合成生物学融合以构建全自主生物铸造厂的技术趋势 | AI驱动的合成生物学技术、自动化生物铸造厂、全细胞建模与数字孪生系统 | 人工智能, 合成生物学 | NA | 全细胞建模, 数字孪生, 自动化实验 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |