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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2026-07-17 |
Plant-derived indole alkaloids in chronic inflammatory diseases: molecular mechanisms, therapeutic potential and translational challenges
2026-May, Inflammopharmacology
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s10787-026-02244-z
PMID:42009998
|
综述 | 本文综述了植物来源吲哚生物碱在慢性炎症性疾病中的作用机制、治疗潜力及转化挑战 | 系统整合了吲哚生物碱对NF-κB、JAK/STAT、MAPK、PI3K/AKT、NLRP3炎症小体和AhR信号等关键炎症轴的调控机制,并强调了单萜和色氨酸衍生的吲哚生物碱在微生物群和器官选择性治疗中的前景 | 大部分证据来自临床前研究,缺乏足够的临床转化数据 | 评估植物来源吲哚生物碱在慢性炎症性疾病中的治疗潜力和转化可行性 | 植物来源的吲哚生物碱类化合物 | NA | 结肠炎、骨关节炎、慢性阻塞性肺疾病、动脉粥样硬化、慢性肾病、炎症驱动的癌症 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 22 | 2026-07-10 |
Advances in biotechnological methods for genetic and metabolic engineering in Methylomonas sp. DH-1
2026-May-16, Journal of biological engineering
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13036-026-00700-6
PMID:42143386
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综述 | 综述了甲基单胞菌DH-1菌株遗传和代谢工程生物技术方法的最新进展 | 系统总结了针对DH-1菌株的分子工具开发,包括优化转化方法、无质粒基因组工程、可调启动子库和合成小调控RNA平台 | 未明确提及局限性 | 促进甲基单胞菌DH-1菌株作为甲烷利用底盘细胞的代谢工程和合成生物学研究 | 甲基单胞菌DH-1菌株 | 机器学习 | NA | NA | NA | NA | NA | Cre重组酶 | 甲基单胞菌DH-1 | 可调启动子库、合成小调控RNA平台 | 工业生物技术, 环境 |
| 23 | 2026-07-09 |
Rare-codon-tuned fluorescent biosensor for high-throughput selection of Escherichia coli strain capable of L-arginine overproduction
2026-05-12, BMC microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.1186/s12866-026-05154-w
PMID:42121024
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研究论文 | 开发一种稀有密码子调控的荧光生物传感器,用于高通量筛选能够过量生产L-精氨酸的大肠杆菌菌株 | 该传感器利用稀有密码子AGG编码的富含L-精氨酸肽模块与StayGold荧光蛋白融合,建立荧光强度与胞内L-精氨酸水平的严格关联,无需正交翻译系统即可在野生型菌株中应用 | 未具体说明局限性,但可能包括传感器对特定代谢物的特异性及长期稳定性待验证 | 开发高通量表型分析方法以加速菌株优化和生物制造 | 大肠杆菌ARG文库及其突变菌株 | 合成生物学 | NA | 紫外线诱变、荧光激活细胞分选、基因组分析 | NA | 基因组序列和荧光数据 | 大肠杆菌ARG文库(未指定具体数量),以及分离的菌株ARG-B10和B10 | NA | 大肠杆菌 | 稀有密码子依赖的荧光生物传感器,包含AGG稀有密码子富集的L-精氨酸肽模块与StayGold融合基因 | 工业生物技术 |
| 24 | 2026-07-04 |
[Cloning of cytochrome P450 reductase genes from Carthamus tinctorius and comparison of electron donation activity]
2026-May, Zhongguo Zhong yao za zhi = Zhongguo zhongyao zazhi = China journal of Chinese materia medica
|
research paper | 本研究从红花中克隆了三个细胞色素P450还原酶基因,并比较了它们与不同CYP450酶组合时的电子供体活性 | 首次从红花中克隆并鉴定了三个CPR基因,发现CtCPR1与红花内源KO酶组合时电子供体活性增强,而CtCPR3与拟南芥AtKO组合时活性更优,揭示了CPR与CYP450之间的高合作伙伴兼容性 | NA | 克隆红花中CPR基因并评估其电子供体活性,为通过合成生物学高效生产红花生物活性化合物提供遗传资源 | 红花中的细胞色素P450还原酶基因CtCPR1、CtCPR2和CtCPR3 | machine learning | NA | 克隆、测序、序列比对、系统发育分析、酵母发酵 | NA | 序列数据、文本 | 3个CPR基因 | CRISPR-Cas9 | 酵母 | 代谢途径工程(将CPR与KO基因共表达生产ent-kaurenoic acid) | medicine, industrial biotechnology |
| 25 | 2026-07-03 |
Reprogramming probiotic for uric acid modular degradation and hyperuricemia treatment by synthetic biology regulation
2026-May-07, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-026-03022-w
PMID:42098719
|
研究论文 | 通过合成生物学调控,重组工程益生菌用于尿酸模块化降解及高尿酸血症治疗 | 首次构建表达PucL和PucM酶的重组益生菌株,并通过模块化优化RBS强度、过表达尿酸转运蛋白基因ygfU和过氧化氢降解酶基因katG,显著提高了尿酸降解效率,同时在小鼠模型中验证了其通过调节肠道菌群改善高尿酸血症的机制 | 仅限于体外实验和小鼠模型验证,未进行人体临床试验,且工程菌的长期安全性及稳定性需进一步评估 | 开发一种更安全有效的工程益生菌疗法,用于尿酸降解和高尿酸血症的治疗 | 重组益生菌Escherichia coli Nissle 1917及高尿酸血症小鼠模型 | 合成生物学 | 高尿酸血症 | 合成生物学、RBS优化、基因过表达 | NA | 实验数据 | 小鼠模型,具体数量未说明 | CRISPR-Cas9 | Escherichia coli Nissle 1917 | 尿酸降解模块(pucL和pucM基因)、尿酸转运模块(ygfU基因)和过氧化氢降解模块(katG基因) | 医学 |
| 26 | 2026-06-28 |
Engineering Strategies for Plant-Derived Extracellular Vesicles: Modification, Drug Delivery Performance, and Synergistic Effects with Gel Composite Systems
2026-May-27, Pharmaceutics
IF:4.9Q1
DOI:10.3390/pharmaceutics18060659
PMID:42357274
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综述 | 本文构建了一个整合工程策略、载药性能及凝胶复合系统的概念框架,系统评述植物源细胞外囊泡的改性方法及其在精准纳米医学中的应用 | 首次建立了整合工程策略、载体-性能-协同范式以及凝胶复合设计原则的三维概念框架,区别于以往仅关注疾病应用或单一工程技术的综述 | 当前植物源细胞外囊泡面临靶向性、稳定性及装载效率等固有局限,且临床转化仍需克服挑战 | 为植物源细胞外囊泡的理性设计和临床转化提供理论框架,推动其在精准纳米医学中的创新发展 | 植物源细胞外囊泡及其凝胶复合材料 | 纳米医学、合成生物学 | 皮肤疾病 | NA | NA | NA | NA | NA | 植物 | NA | 医学 |
| 27 | 2026-06-28 |
Engineering Plant-Associated Microorganisms for Bioremediation and Sustainable Agriculture
2026-May-26, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms14061203
PMID:42354828
|
综述 | 本文综述了植物相关微生物基因组工程在生物修复和可持续农业中的应用进展 | 系统分析了随机诱变、CRISPR-Cas靶向编辑、基因过表达、基因组重排、RNA干扰、代谢途径工程和合成生物学等多种基因修饰策略,以优化固氮、解磷、次生代谢物生产、生物防治、胁迫耐受和生物修复等功能 | 需进一步讨论各国对转基因微生物的监管和使用,同时确保这些修饰对目标作物的有益微生物群、人类、动物和环境安全高效 | 探讨通过基因组工程技术增强植物有益微生物对作物性能和环境污染修复的正面影响 | 植物有益微生物(PGPM) | 自然语言处理 | NA | CRISPR-Cas、基因过表达、RNA干扰、代谢途径工程、合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas, RNA干扰, 合成生物学 | 植物有益微生物 | 固氮回路、解磷回路、次生代谢途径、生物防治回路、胁迫耐受回路、生物修复回路 | 农业, 环境 |
| 28 | 2026-06-26 |
Transcriptome-Guided Identification of N-Acetyltransferases Involved in Melatonin Biosynthesis in a Streptomyces-Based Cell Factory
2026-May-27, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.70390
PMID:42178992
|
研究论文 | 通过转录组引导挖掘,在链霉菌细胞工厂中鉴定参与褪黑素生物合成的N-乙酰转移酶,并优化产量 | 首次利用转录组引导策略在链霉菌中鉴定参与褪黑素合成的内源N-乙酰转移酶,并通过工程改造显著提高褪黑素产量 | 未提及具体局限性 | 实现微生物中褪黑素的高效生物合成 | 工程链霉菌白色亚种菌株 | 合成生物学 | NA | 转录组测序、基因工程 | NA | 基因表达数据 | NA | 基因敲除、基因过表达 | 链霉菌白色亚种 | 褪黑素从头合成途径 | 医药,工业生物技术 |
| 29 | 2026-06-26 |
Spatial Regulation of CAR Signaling Enables Logic-Gated Activity
2026-May-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.22.726983
PMID:42239424
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研究论文 | 设计了一种通过空间调控CAR信号实现逻辑门控活性的新型受体MANTIS | 利用细胞外受体维度差异来空间调控CAR信号,通过空间位阻和抗原顺序结合实现AND门控逻辑 | 可能涉及复杂的工程化设计及体内应用的潜在挑战 | 开发一种新型AND门控受体,使CAR T细胞更特异性识别癌细胞,减少对正常细胞的杀伤 | CAR T细胞及其对癌细胞的杀伤活性 | 合成生物学 | 癌症 | CAR技术 | NA | NA | NA | NA | T细胞 | 逻辑门控受体MANTIS | 医学 |
| 30 | 2026-06-26 |
Emerging Applications of CAR-T Cell Therapy in Overcoming Resistance and Expanding Targets in Hematologic Malignancies: Insights from Recent Research
2026-May-23, Current treatment options in oncology
IF:3.8Q2
DOI:10.1007/s11864-025-01371-z
PMID:42176091
|
综述 | 总结CAR-T细胞疗法在克服血液恶性肿瘤耐药性和扩展靶点方面的最新研究进展 | 提出CRISPR增强型CAR和基于合成生物学的异体系统以提高CAR-T疗法的疗效和可及性 | 未明确说明具体局限性,但指出抗原逃逸、T细胞耗竭及在急性髓系白血病和T细胞白血病中疗效有限等问题仍存在 | 总结2015年以来的人类试验成果,重点关注近两年创新,探讨克服耐药性策略及提升安全性和可及性的方法 | 血液恶性肿瘤患者,包括B细胞急性淋巴细胞白血病、弥漫大B细胞淋巴瘤和多发性骨髓瘤 | 数字病理学 | 血液恶性肿瘤 | NA | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 哺乳动物细胞 | 多靶点CAR、下一代构建体、合成生物学异体系统 | 医学 |
| 31 | 2026-06-26 |
The interaction between the RNA aptamer Dap1 and DasR mirrors DNA operator site recognition in GntR repressors
2026-May-20, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag489
PMID:42165134
|
研究论文 | 研究RNA适配体Dap1与细菌阻遏蛋白DasR的相互作用机制,揭示其模拟DNA操纵子位点识别,并指导新型适配体设计 | 首次解析SELEX衍生适配体Dap1与GntR/HutC家族阻遏蛋白DasR的复合物晶体结构,发现RNA适配体与蛋白的相互作用高度模仿DNA-蛋白识别模式,并基于结构信息设计出靶向同源蛋白NagR的新型适配体 | 未明确提及在更广泛的阻遏蛋白家族中的适用性验证,适配体设计策略的普适性有待进一步探索 | 阐释RNA适配体与细菌阻遏蛋白的分子识别机制,推动合成生物学中新型适配体-蛋白互作对的设计 | RNA适配体Dap1及其突变体Dap1m1、GntR/HutC家族阻遏蛋白DasR和NagR | 合成生物学 | NA | 晶体结构解析、SELEX、定点突变 | NA | 结构数据、序列数据 | NA | SELEX | 细菌(未明确具体菌种) | 基因表达调控回路(基于适配体诱导的阻遏蛋白去抑制) | 合成生物学、生物技术 |
| 32 | 2026-06-24 |
Elucidating the regulatory role of the Shine-Dalgarno sequence in structural gene expression of the malolactic enzyme operon using a GFP/mCherry model
2026-May-08, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-026-04999-7
PMID:42101569
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研究论文 | 通过GFP/mCherry报告系统研究苹果酸乳酸酶操纵子中Shine-Dalgarno序列在结构基因表达中的调控作用 | 揭示了翻译耦合系统中Shine-Dalgarno序列通过上游翻译和局部mRNA结构的整合效应实现精确蛋白质表达调控的非线性、架构特异性调控逻辑 | 未提及明确局限性 | 阐明苹果酸乳酸酶操纵子中Shine-Dalgarno序列在翻译后水平调控结构基因表达的作用机制 | 苹果酸乳酸酶操纵子中的mleA和mleP基因,以及Shine-Dalgarno序列SD2 | 分子生物学 | NA | 定点突变、16S rRNA杂交能预测、mRNA二级结构最小自由能计算 | NA | 序列和表达数据 | 多个SD2变体在大肠杆菌和乳酸乳球菌的翻译耦合和非耦合系统中表达 | NA | 大肠杆菌 (Escherichia coli),乳酸乳球菌 (Lactococcus lactis) | 翻译耦合系统及非耦合系统的GFP/mCherry双报告系统 | 葡萄酒发酵,合成生物学 |
| 33 | 2026-06-24 |
Engineering a high-efficiency expression system in Tremella fuciformis using novel promoters and optimized transformation conditions
2026-May-08, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-026-05004-x
PMID:42101779
|
研究论文 | 报道了通过鉴定内源强启动子和优化农杆菌介导转化方法,在金耳中建立高效表达系统 | 首次在金耳中鉴定出三个超强内源启动子,其表达效率最高可达对照的1476.74%,并通过扫描电镜发现棕色氧化铝处理酵母样细胞表面损伤可提高转化效率2.25倍 | 未说明长期稳定性或在不同遗传背景下的适用性 | 开发金耳的高效表达系统以推进分子育种和合成生物学 | 金耳(Tremella fuciformis)的酵母样细胞 | 合成生物学 | NA | 农杆菌介导转化、扫描电镜、荧光蛋白表达分析 | NA | 图像(扫描电镜)、荧光强度数据 | 三种启动子(P4、P5、P7)分别在转化酵母样细胞中测试,对照为野生型菌株 | 农杆菌介导转化 | 金耳(Tremella fuciformis) | 强内源启动子驱动的eGFP表达系统 | 农业、工业生物技术 |
| 34 | 2026-06-24 |
AI-microbial hybrid biosensors: the next generation of intelligent detection systems
2026-May, Future microbiology
IF:2.5Q3
DOI:10.1080/17460913.2026.2678101
PMID:42212947
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综述 | 本文全面综述了人工智能与微生物生物传感器融合技术,用于病原体检测和环境监测 | 首次系统整合了AI-微生物混合生物传感器的系统架构、计算策略、转化障碍和监管考量,并强调了合成生物学、CRISPR传感和边缘计算等新兴方向 | 领域仍分散,缺乏统一的理论框架,且临床转化和监管方面存在挑战 | 全面分析和总结AI-微生物混合生物传感器在实时病原体检测和自适应生物监测中的应用现状与未来方向 | AI-微生物混合生物传感器的设计原理、集成方法、性能指标及关键挑战 | 机器学习, 数字病理学 | NA | 人工智能, 机器学习, 深度神经网络 | CNN, 集成模型 | 电化学阻抗数据, 拉曼光谱数据, 高光谱显微图像 | NA | CRISPR, 合成生物学 | 微生物 | 生物传感器 | 医学, 环境 |
| 35 | 2026-06-21 |
Recent advances in bioengineering and functional applications of microbial biocomposites: integrating bacterial cellulose, fungal mycelium and synthetic biology
2026-May-19, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-026-05021-w
PMID:42154349
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综述 | 该综述综合了2020-2026年微生物生物复合材料在制备、修饰及功能应用方面的最新进展,重点涉及细菌纤维素和真菌菌丝体 | 将微生物生物复合材料与合成生物学、3D打印和矿物功能化等新兴方法相结合,突出了跨学科协同创新的潜力 | 讨论了当前工业规模化、功能稳定性和批次间标准化方面的监管和技术挑战 | 为应用微生物学、材料科学和工业生物技术领域的研究人员和专业人士提供关键且全面的视角,强调微生物生物复合材料作为可持续性、功能创新和仿生设计交汇平台的潜力 | 微生物生物复合材料,重点包括细菌纤维素和真菌菌丝体 | 材料科学,应用微生物学 | NA | 3D打印,合成生物学,矿物功能化 | NA | NA | NA | NA | Komagataeibacter spp., Ganoderma spp. | NA | 医药,环境,工业生物技术 |
| 36 | 2026-06-19 |
Machine learning-assisted single-cell Raman imaging for rapid, sensitive detection and intracellular mapping of carotenoids in plant cell cultures
2026-May-23, Plant cell reports
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s00299-026-03858-x
PMID:42176120
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研究论文 | 将拉曼成像与多层感知器神经网络结合,用于烟草BY-2细胞中类胡萝卜素的无损、无标记分类和细胞内定位 | 首次结合拉曼成像与神经网络对植物细胞进行基于类胡萝卜素组成的无标记分类,实现活细胞水平的无损检测和代谢物分布成像 | 文中未明确提及局限性,但可能包括神经网络模型对特定拉曼峰特征的依赖以及通用性需要进一步验证 | 开发一种基于拉曼成像与机器学习结合的植物细胞分析平台,以无标记方式分类和定位类胡萝卜素 | 烟草BY-2细胞(野生型与转基因细胞系) | 机器学习 | NA | 拉曼成像, 表面增强拉曼散射(SERS), 高效液相色谱(HPLC) | 多层感知器神经网络 | 图像 | 涉及野生型和转基因烟草BY-2细胞系,具体样本数量未明确 | NA | 烟草(Nicotiana tabacum)BY-2细胞 | NA | 农业, 工业生物技术 |
| 37 | 2026-06-19 |
Hypergraph learning with multi-dimensional metabolite feature extractions and static-dynamic attention mechanisms to fill missing reactions in metabolic networks
2026-May-04, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag314
PMID:42308419
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研究论文 | 提出一种基于超图学习的多维代谢物特征提取与静动态注意力机制方法,用于预测和填补代谢网络中的缺失反应 | 首次结合超图神经网络、多种预训练语言模型和静动态多头注意力机制,实现代谢网络中缺失反应的高精度预测 | 仅在计算层面验证,未在湿实验中对预测的缺失反应进行生物学验证 | 提高基因组规模代谢模型重建质量,自动填补知识空白中的缺失反应 | 108个BiGG数据库中的基因组规模代谢模型及24种细菌的表型数据 | 机器学习 | NA | 超图学习、预训练语言模型、多头注意力机制 | 超图神经网络、有向图神经网络 | 代谢物特征和反应数据 | 108个GEMs和24种细菌生物体 | NA | 细菌 | NA | 合成生物学、生物制造、生物医学 |
| 38 | 2026-06-18 |
Parabiotics as Next-Generation Microbiome Therapeutics: Insights into Mechanisms, Evidence, and Therapeutic Potential
2026-May-02, Current microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00284-026-04942-x
PMID:42069941
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综述 | 本文综述了后生元作为下一代微生物组疗法的机制、证据和治疗潜力 | 系统阐述了后生元在免疫调节、抗炎和屏障增强方面的独特机制,并总结了其在脆弱人群中的安全优势 | 标准化和监管协调方面仍存在挑战 | 评估后生元作为微生物组靶向干预策略的临床应用前景 | 后生元(非活菌微生物细胞或其成分) | NA | 儿科腹泻、肌肉衰减、肠易激综合征、特应性皮炎、呼吸道感染、内脏脂肪堆积、抗生素相关菌群失调 | 宏基因组学、新一代测序、蛋白质组学、代谢组学、CRISPR-Cas系统、合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas系统 | 嗜酸乳杆菌、副干酪乳杆菌、植物乳杆菌、双歧杆菌 | NA | 医学, 食品 |
| 39 | 2026-06-15 |
Microbial lipids for a sustainable future: the growing potential of synthetic microbial engineering for consumer oils
2026-May, Critical reviews in biotechnology
IF:8.1Q1
DOI:10.1080/07388551.2026.2615047
PMID:41692578
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综述 | 探讨合成微生物工程在生产可持续消费油和脂类中的潜力 | 总结了合成酵母基因组学和自动化生物铸造厂等最新进展,为微生物脂类可持续生产提供新思路 | 未具体讨论实际应用中的技术瓶颈或经济可行性 | 推动可持续微生物脂类生物制造经济的发展 | 微生物脂类及合成生物学方法 | 合成生物学 | NA | 合成酵母基因组学、自动化生物铸造厂 | NA | NA | NA | NA | 酵母 | 微生物脂类合成途径 | 食品、保健品、塑料、动物饲料、化妆品、制药、燃料 |
| 40 | 2026-06-14 |
The Promise of Synthetic Biology for Redesigning Plant Architecture
2026-May-28, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27114876
PMID:42278408
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综述 | 探讨利用合成生物学重新设计植物结构以实现作物改良的潜力 | 整合自然多样性、发育生物学和合成调控工程,提出理性重新设计植物结构的框架,强调合成生物学与育种及建模框架的整合 | NA | 探索通过合成生物学重塑植物结构以增强作物适应气候变化的能力 | 植物结构及相关发育过程 | 合成生物学 | NA | CRISPR-based regulatory systems, synthetic gene circuits, orthogonal signalling pathways, plant artificial chromosomes | NA | NA | NA | CRISPR, 人工染色体 | 植物(作物) | 可编程转录因子、合成基因电路、正交信号通路 | 农业 |