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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2026-06-24 |
AI-microbial hybrid biosensors: the next generation of intelligent detection systems
2026-May, Future microbiology
IF:2.5Q3
DOI:10.1080/17460913.2026.2678101
PMID:42212947
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综述 | 本文全面综述了人工智能与微生物生物传感器融合技术,用于病原体检测和环境监测 | 首次系统整合了AI-微生物混合生物传感器的系统架构、计算策略、转化障碍和监管考量,并强调了合成生物学、CRISPR传感和边缘计算等新兴方向 | 领域仍分散,缺乏统一的理论框架,且临床转化和监管方面存在挑战 | 全面分析和总结AI-微生物混合生物传感器在实时病原体检测和自适应生物监测中的应用现状与未来方向 | AI-微生物混合生物传感器的设计原理、集成方法、性能指标及关键挑战 | 机器学习, 数字病理学 | NA | 人工智能, 机器学习, 深度神经网络 | CNN, 集成模型 | 电化学阻抗数据, 拉曼光谱数据, 高光谱显微图像 | NA | CRISPR, 合成生物学 | 微生物 | 生物传感器 | 医学, 环境 |
| 42 | 2026-06-21 |
Recent advances in bioengineering and functional applications of microbial biocomposites: integrating bacterial cellulose, fungal mycelium and synthetic biology
2026-May-19, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-026-05021-w
PMID:42154349
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综述 | 该综述综合了2020-2026年微生物生物复合材料在制备、修饰及功能应用方面的最新进展,重点涉及细菌纤维素和真菌菌丝体 | 将微生物生物复合材料与合成生物学、3D打印和矿物功能化等新兴方法相结合,突出了跨学科协同创新的潜力 | 讨论了当前工业规模化、功能稳定性和批次间标准化方面的监管和技术挑战 | 为应用微生物学、材料科学和工业生物技术领域的研究人员和专业人士提供关键且全面的视角,强调微生物生物复合材料作为可持续性、功能创新和仿生设计交汇平台的潜力 | 微生物生物复合材料,重点包括细菌纤维素和真菌菌丝体 | 材料科学,应用微生物学 | NA | 3D打印,合成生物学,矿物功能化 | NA | NA | NA | NA | Komagataeibacter spp., Ganoderma spp. | NA | 医药,环境,工业生物技术 |
| 43 | 2026-06-19 |
Hypergraph learning with multi-dimensional metabolite feature extractions and static-dynamic attention mechanisms to fill missing reactions in metabolic networks
2026-May-04, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag314
PMID:42308419
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研究论文 | 提出一种基于超图学习的多维代谢物特征提取与静动态注意力机制方法,用于预测和填补代谢网络中的缺失反应 | 首次结合超图神经网络、多种预训练语言模型和静动态多头注意力机制,实现代谢网络中缺失反应的高精度预测 | 仅在计算层面验证,未在湿实验中对预测的缺失反应进行生物学验证 | 提高基因组规模代谢模型重建质量,自动填补知识空白中的缺失反应 | 108个BiGG数据库中的基因组规模代谢模型及24种细菌的表型数据 | 机器学习 | NA | 超图学习、预训练语言模型、多头注意力机制 | 超图神经网络、有向图神经网络 | 代谢物特征和反应数据 | 108个GEMs和24种细菌生物体 | NA | 细菌 | NA | 合成生物学、生物制造、生物医学 |
| 44 | 2026-06-15 |
Microbial lipids for a sustainable future: the growing potential of synthetic microbial engineering for consumer oils
2026-May, Critical reviews in biotechnology
IF:8.1Q1
DOI:10.1080/07388551.2026.2615047
PMID:41692578
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综述 | 探讨合成微生物工程在生产可持续消费油和脂类中的潜力 | 总结了合成酵母基因组学和自动化生物铸造厂等最新进展,为微生物脂类可持续生产提供新思路 | 未具体讨论实际应用中的技术瓶颈或经济可行性 | 推动可持续微生物脂类生物制造经济的发展 | 微生物脂类及合成生物学方法 | 合成生物学 | NA | 合成酵母基因组学、自动化生物铸造厂 | NA | NA | NA | NA | 酵母 | 微生物脂类合成途径 | 食品、保健品、塑料、动物饲料、化妆品、制药、燃料 |
| 45 | 2026-06-14 |
The Promise of Synthetic Biology for Redesigning Plant Architecture
2026-May-28, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27114876
PMID:42278408
|
综述 | 探讨利用合成生物学重新设计植物结构以实现作物改良的潜力 | 整合自然多样性、发育生物学和合成调控工程,提出理性重新设计植物结构的框架,强调合成生物学与育种及建模框架的整合 | NA | 探索通过合成生物学重塑植物结构以增强作物适应气候变化的能力 | 植物结构及相关发育过程 | 合成生物学 | NA | CRISPR-based regulatory systems, synthetic gene circuits, orthogonal signalling pathways, plant artificial chromosomes | NA | NA | NA | CRISPR, 人工染色体 | 植物(作物) | 可编程转录因子、合成基因电路、正交信号通路 | 农业 |
| 46 | 2026-06-13 |
Sugarcane Biorefinery from Component Separation to High-Value Outputs: Technical Progress and Future Perspectives
2026-May-26, Foods (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/foods15111877
PMID:42279664
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综述 | 系统总结了甘蔗汁、蔗渣和滤泥的高值化利用途径,并提出甘蔗加工全组分高值化利用框架 | 构建'甘蔗加工树'全组分高值化框架,定量揭示功能糖高利润、蔗渣预处理成本占比40-50%以及滤泥粗蜡回收率仅5-8%等关键瓶颈,并提出耦合生物炼制、合成生物学和标准化框架的未来方向 | 当前瓶颈包括预处理效率低、菌株性能不佳和分离成本高 | 解决甘蔗加工单一产品依赖和副产品利用率低的问题,推动低碳循环转型 | 甘蔗汁、蔗渣、滤泥 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术、农业 |
| 47 | 2026-06-13 |
Molecular recruitment and release using DNA host condensates
2026-May-12, Nanoscale horizons
IF:8.0Q1
DOI:10.1039/d5nh00586h
PMID:41774821
|
研究论文 | 使用DNA宿主凝聚体实现分子招募与释放 | 在DNA纳米星中整合适配体以构建具有招募和释放目标生物分子能力的凝聚体,并研究适配体位置对凝聚和招募效率的影响 | 仅研究了链霉亲和素(SA)一种模型蛋白,且适配体定位对凝聚和招募无显著影响可能限制了设计灵活性 | 探索DNA纳米星凝聚体作为可调控分子招募与释放平台的潜力 | DNA纳米星凝聚体及其招募的链霉亲和素(SA)分子 | 合成生物学 | NA | DNA纳米自组装、适配体技术 | NA | 实验数据 | 未明确说明 | DNA纳米星 | 无细胞系统 | 适配体修饰的DNA纳米星凝聚体 | 合成生物学 |
| 48 | 2026-06-13 |
Beyond text generation: large language models as autonomous agents for orchestrating synthetic biology cycles
2026-May, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2026.134309
PMID:41763131
|
综述 | 探讨大语言模型作为自主智能体在合成生物学设计-构建-测试-学习周期中的协同作用 | 将LLM定位为自主智能体而非单纯预测工具,提出语义驱动范式替代传统人工特征工程,并系统分析不同LLM架构与生物任务的适配性 | 计算成本、模型可解释性及伦理治理挑战 | 推动合成生物学在可持续制造、医学等领域突破 | 大语言模型在合成生物学中的应用范式 | 自然语言处理, 合成生物学 | NA | 大语言模型 | 各类LLM架构 | 生物序列数据 | NA | NA | NA | NA | 医药, 可持续制造 |
| 49 | 2026-06-13 |
Engineering non-ribosomal peptide synthesis: tuning the antibiotics engine of the microbial world
2026-May, Critical reviews in biotechnology
IF:8.1Q1
DOI:10.1080/07388551.2026.2615819
PMID:41771683
|
综述 | 综述通过合成生物学工程非核糖体肽合成酶以优化抗菌肽产量和活性的研究进展 | 系统总结了通过前体代谢工程、代谢流调控、强启动子和调控因子引入以及异源表达等策略提升非核糖体肽产量和生物活性的方法,并指出糖肽类抗生素作为合成生物学工程新方向的潜力 | 未提及具体实验数据验证或比较不同工程策略的效率,且综述范围可能未涵盖所有非核糖体肽类型 | 综述通过合成生物学方法工程改造非核糖体肽合成酶,以提高产量和生物活性 | 非核糖体肽合成酶及其生产的抗菌肽,特别是糖肽类抗生素 | 合成生物学 | NA | 非核糖体肽合成酶工程、代谢工程、启动子工程、异源表达 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医药 |
| 50 | 2026-06-11 |
Degradation dynamics: an insight into microbial interactions with explosive compounds
2026-05-10, Biodegradation
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s10532-026-10299-6
PMID:42107032
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综述 | 综述了爆炸物与微生物相互作用中的降解动力学,涵盖降解途径、关键酶及最新研究进展 | 将传统降解动力学与合成生物学工具(如CRISPR/Cas系统)结合,提出通过工程化微生物菌株提升降解活性 | 未详细讨论工程菌株的实际应用效果及环境影响评估 | 提供爆炸物降解动力学的研究现状概述 | 微生物(细菌和真菌)与爆炸物(如硝胺、硝基取代芳香族化合物、苦味酸、TETRYL、HEXYL、RDX等)的相互作用 | 环境科学 | NA | 降解动力学分析、生物组学(Bio-omics)、合成生物学工具 | NA | NA | NA | CRISPR/Cas | 微生物(细菌、真菌) | NA | 环境科学 |
| 51 | 2026-06-05 |
Microbial production of xanthohumol driven by synthetic biology approaches
2026-May-26, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-026-05037-2
PMID:42189397
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综述 | 该文综述了利用合成生物学方法微生物生产黄腐酚的研究进展 | 总结了用于商业化规模生产黄腐酚的生物策略,并评估了技术经济可行性 | 黄腐酚的产量和成本问题仍待解决,未来需要进一步尝试使用合成生物学进行生产 | 综述利用合成生物学实现黄腐酚可持续生产的研究进展 | 黄腐酚 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 微生物 | NA | 化妆品、制药、营养保健品、食品工业 |
| 52 | 2026-06-05 |
Bottom-Up Synthetic Biology for Artificial Cell Design: From Scaffold Materials to Functional Integration
2026-May-25, Journal of microbiology and biotechnology
IF:2.5Q3
DOI:10.4014/jmb.2604.04021
PMID:42225276
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综述 | 回顾自下而上合成生物学在人工细胞设计中的最新进展,涵盖支架材料与功能整合 | 系统总结了五种支架材料(包括新兴的凝聚层基和混合层级隔室)及四大功能类别(级联代谢、蛋白质合成、分裂和能量生产) | 模块兼容性、操作稳定性和监管挑战等关键技术限制 | 探讨自下而上人工细胞的设计原则及其生物技术应用 | 人工细胞系统 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 人工细胞、级联代谢、蛋白质合成、分裂、能量生产模块 | 工业生物催化, 治疗性蛋白质递送, 生物传感, 生命起源研究 |
| 53 | 2026-06-05 |
Phenazine-Based Synthetic Biology to Signal Between Cells and Electrodes
2026-May, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.70169
PMID:41653016
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研究论文 | 开发了一种基于吩嗪的模块化系统,实现电子设备与工程菌群之间的双向氧化还原通信 | 利用商品化电极和吩嗪修饰,实现电子与生物领域之间信号接收的调控,构建了包含电子信号编码、生物信号传输、双域信号接收和可控噪声的模块化通信框架 | NA | 建立电子设备与活体系统之间无缝通信的生物电子系统 | 工程细菌群体与商用电子设备之间的氧化还原信号传递 | 合成生物学 | NA | 电化学生物传感、吩嗪生物合成调控 | NA | 信号数据 | NA | NA | 工程细菌 | 双域通信通道,包含电子信号编码、生物信号传输、双域信号接收和可控噪声模块 | 环境监测、自适应生物制造、响应式生物医学设备 |
| 54 | 2026-06-05 |
Biotechnological advances in key regulatory genes of phenylpropanoid and terpenoid biosynthesis pathways in Panax ginseng: Current insights and future prospects
2026 May-Jun, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108840
PMID:41663015
|
综述 | 本文综述了人参苯丙烷类和萜类生物合成通路中关键调控基因的生物技术进展,包括基因发现、功能鉴定、基因组编辑、CRISPR调控、代谢工程和合成生物学等前沿方法 | 重点总结了基因编辑、CRISPR调控、代谢工程和合成生物学在人参代谢通路改造中的转化应用,并整合了组学策略、系统生物学模型及生物反应器与细胞培养平台 | NA | 概述人参中苯丙烷类和萜类生物合成关键调控基因的生物技术进展,为开发高活性化合物的人参品种和精准育种及工业规模生产提供理论框架 | 人参的苯丙烷类和萜类生物合成通路相关关键调控基因 | NA | NA | 基因组编辑、CRISPR调控、代谢工程、合成生物学、组学技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 人参 | NA | 医学, 工业生物技术 |
| 55 | 2026-06-04 |
Enhancement Strategies for Bioelectrocatalytic Conversion of Organic Waste
2026-May-28, Chem & bio engineering
DOI:10.1021/cbe.5c00179
PMID:42232028
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综述 | 系统综述生物电催化转化有机废弃物的基本原理、发展历程、微生物工程策略及过程优化方向 | 独特整合生物创新与过程工程进展,从分子、微生物和反应器尺度提供协同优化的整体视角,并明确连接微生物碳/电子流工程与生物反应器设计及过程耦合 | NA | 建立加速生物电催化技术工业化应用的全面路线图 | 有机废弃物的生物电催化转化过程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly | 微生物 | 生物电催化回路 | 环境, 工业生物技术 |
| 56 | 2026-06-04 |
Modular Biosurface Engineering of Magnetotactic Bacteria for Multimodal Synergistic Cancer Therapy
2026-May-28, Chem & bio engineering
DOI:10.1021/cbe.5c00177
PMID:42232030
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研究论文 | 介绍一种可扩展的模块化生物表面工程平台,用于功能化野生型趋磁细菌,实现多模态协同癌症治疗 | 提出模块化生物表面工程平台,实现趋磁细菌的多功能化,整合小分子、聚合物、纳米颗粒和金属有机框架等多种材料,并以AMB-1@Fe-PDA为例展示肿瘤靶向递送、免疫抑制微环境重编程、先天免疫激活与光热-化学动力学治疗的协同机制 | 临床转化前需进一步评估长期生物安全性和有效性,以及规模化生产的可行性 | 开发一种可规模化、模块化的趋磁细菌生物表面工程平台,用于癌症治疗 | 趋磁细菌(AMB-1菌株) | 合成生物学 | 乳腺癌 | 纳米材料修饰 | 小鼠模型 | 实验数据 | 小鼠模型中两个治疗周期,中位生存期从45天延长至67天 | NA | 趋磁细菌 | Fe-PDA涂层与趋磁细菌结合的模块化生物表面工程平台 | 医学 |
| 57 | 2026-06-02 |
Powering next-generation precision therapeutics through integrated synthetic transcriptional systems
2026-May-26, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2026.117308
PMID:42035420
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综述 | 综述整合合成转录系统在精准治疗中的应用进展,涵盖启动子工程、模块化转录因子设计和人工智能辅助的理性设计 | 从经验试错转向理性预测设计,通过人工智能辅助实现了合成启动子和转录因子的协同整合,支持多输入感知、可调表达和高正交性 | 未明确讨论系统在体内应用的长期稳定性和免疫原性等潜在问题 | 推动合成转录系统在哺乳动物精准治疗中的应用,增强治疗精确性并减少脱靶效应 | 合成启动子与合成转录因子的整合系统 | 合成生物学 | 复杂疾病 | 合成生物学技术 | NA | NA | NA | NA | 哺乳动物细胞 | 逻辑门、反馈回路、可调系统 | 医学 |
| 58 | 2026-06-01 |
Beyond natural evolution: multi-scale in vivo mutagenesis toolkits for synthetic evolution
2026-May-30, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2026.05.008
PMID:42218072
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综述 | 本文综述了按突变规模分类的最新体内诱变工具包,包括全基因组、中等规模和位点特异性诱变,并讨论了其在合成进化中的应用 | 按突变规模(全基因组、中等规模、位点特异性)对体内诱变工具包进行分类,并分析各规模下的机制、能力及局限性 | 当前技术的局限性如脱靶效应、筛选效率不足等被提及,同时指出下一代基因编辑技术、高通量筛选和人工智能的潜力尚未完全开发 | 系统阐述合成进化中多尺度体内诱变工具包的最新进展和应用场景 | 生物分子和生物体(如工业微生物、药用菌株等) | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas工程, DNA合成 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, DNA合成 | NA | 连续体内诱变系统 | 工业生物技术, 医学, 农业 |
| 59 | 2026-06-01 |
Virtual cell: Current perspectives and future prospects
2026-May, The Journal of international medical research
IF:1.4Q4
DOI:10.1177/03000605261425080
PMID:42200280
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综述 | 本文综述了虚拟细胞技术在多学科融合、平台发展和应用潜力方面的当前进展与未来展望 | 提出虚拟细胞技术作为整合生物学、计算机科学和人工智能的综合方法,并探讨了其在跨物种模拟、量子计算和多学科协作中的新兴应用前景 | 包括数据整合难度、模型可解释性不足和计算成本高等挑战 | 介绍虚拟细胞技术的现状、应用领域及未来发展方向 | 虚拟细胞技术及其在精准医学、药物发现和合成生物学中的应用 | 机器学习 | NA | 单细胞测序, 亚细胞成像 | NA | 图像 | NA | NA | NA | 虚拟细胞模拟平台(如E-Cell和CellPACK) | 医学, 药物发现, 合成生物学 |
| 60 | 2026-05-31 |
Self-driving medicine: closed-loop therapeutics for autonomous disease control
2026-May-28, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2026.05.003
PMID:42209322
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综述 | 综述了由合成生物学驱动的闭环基因电路在自主疾病控制中的应用,迈向自动驾驶医疗 | 将治疗剂量定义为对生理状态的连续计算响应而非固定方案,通过反馈控制实现自稳态维持 | NA | 探讨闭环基因电路在自主疾病控制中的原理与实现路径 | 模块化传感器、处理器和效应器组成的反馈控制疗法 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | 闭环基因电路(包含传感器、处理器和效应器) | 医学 |