合成生物学相关文章

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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 工程工具 宿主生物 回路设计 应用领域
41 2026-05-30
Classical Phytohormones and Peptide Plant Hormones in Abiotic Stress Tolerance: Crosstalk, Physiological Integration, and Crop Improvement
2026-May-18, Plants (Basel, Switzerland)
综述 本文综述了经典植物激素与肽类植物激素在非生物胁迫耐受中的相互作用、生理整合及作物改良应用 首次综合阐述了植物褪黑素作为整合枢纽在经典激素与肽激素网络中的双重作用(直接抗氧化和双向调控经典激素信号) 存在网络复杂性、激素响应的上下文依赖性、实验室到田间应用的转化差距,以及多胁迫条件下肽激素作用机制理解不完整等问题 探讨植物激素信号网络在非生物胁迫适应中的作用,并提出利用这些网络改良作物的策略 植物激素信号通路及其在非生物胁迫响应中的整合网络 植物生物学 NA 转录组学,蛋白质组学,磷酸化蛋白质组学,代谢组学,系统生物学,CRISPR基因编辑 NA 组学数据 NA CRISPR-Cas9 植物 激素信号调控网络(包括褪黑素抗氧化级联、CEP通路等) 农业
42 2026-05-30
The NRT1.1-NLP7 Nexus: An Integrative Signaling Nexus from Nitrate Sensing to Systemic Adaptation and Structure-Guided Engineering
2026-May-18, Plants (Basel, Switzerland)
综述 该文章综述了植物中硝酸盐感知与系统性适应中的NRT1.1-NLP7整合信号中枢,并提出了结构引导的工程改造框架 揭示了NRT1.1和NLP7形成整合信号中枢的新机制,并提出了三层次理性设计框架,将作物改良从经验选择转向结构引导设计 该研究为综述性质,未提供实验验证数据,缺乏对跨物种保守性差异的定量分析 探讨硝酸盐感知与核内转录反应之间的耦合机制,并提出利用结构生物学和合成生物学设计提高氮利用效率的作物工程策略 植物中的NRT1.1和NLP7蛋白及其相互作用网络 NA NA NA NA NA NA NA 植物 氮响应回路改造 农业
43 2026-05-30
Biotic Stress Resistance in Sweet Potato: Mechanisms, Perspectives, and Sustainable Production Strategies
2026-May-15, Plants (Basel, Switzerland)
综述 本文综述了甘薯生物胁迫抗性的机制、挑战及可持续生产策略,重点分析了真菌、病毒、线虫、害虫和细菌等胁迫的防御机制及分子调控网络 首次从多维度系统剖析甘薯防御机制,并提出了结合人工智能、基因编辑、新型组学和合成生物学等新兴技术的十年品种改良路线图 未提供具体的实验验证数据,且对多种胁迫交叉作用的分子机制仍缺乏深入解析 总结过去两年甘薯生物胁迫抗性研究的最新进展,提出可持续生产策略和品种改良路线 甘薯(Ipomoea batatas)及其生物胁迫因子(真菌、病毒、线虫、害虫、细菌) 数字病理学 植物病害 NA NA NA NA CRISPR-Cas9 甘薯(Ipomoea batatas) NA 农业
44 2026-05-30
Engineered Biocatalytic Strategies for Pesticide Degradation in Food Systems: From Catalytic Performance to Practical Applications
2026-May-14, Journal of agricultural and food chemistry IF:5.7Q1
综述 综述了食品体系中农药降解的工程生物催化策略,从催化性能到实际应用 重点介绍了通过工程策略提升酶降解性能和稳定性的进展,包括天然酶、纳米酶及多酶或杂合级联系统,并讨论了基于人工智能辅助设计和合成生物学的新兴方法 实验室系统向实际食品基质转化面临关键障碍,包括有限催化效率、稳定性不足、可重复使用性差、规模化限制以及监管不确定性 提供关于酶法降解农药的应用导向综述,重点探讨工程策略以提升性能和鲁棒性 天然酶、纳米酶、多酶或杂合级联系统 机器学习 NA NA NA NA NA 合成生物学, 人工智能辅助设计 NA 多酶或杂合级联系统 食品, 农业
45 2026-05-30
Advances in Functional Genomics and Biotechnology for Enhancing Therapeutic Potential of Medicinal Plants
2026-May-10, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
综述 综述了功能基因组学和植物生物技术在提升药用植物治疗潜力方面的最新进展 提出了一个整合框架,将功能基因组发现与途径工程、合成生物学、人工智能辅助预测及可扩展生产系统相关联 对基因组发现如何与途径工程、规模化生产系统和医疗应用相联系的综合理解仍不充分,限制了分子见解向可持续生产转化的有效性 提供药用植物研究中前沿方法的全面概述,重点关注通过功能基因组学和生物技术优化关键生物活性化合物的生产 药用植物中的关键生物活性化合物,包括青蒿素、大麻素、人参皂苷和紫杉醇 机器学习 NA RNA-seq, CRISPR/Cas9 NA 文本 NA CRISPR-Cas9, 合成生物学, 代谢工程 植物 代谢途径, 合成途径设计 医学, 农业, 工业生物技术
46 2026-05-30
Rethinking Microbial Chemical Ecology: Secondary Metabolites as Concentration-Dependent Signaling Hubs with Implications for Anti-Virulence Intervention
2026-May-09, Microorganisms IF:4.1Q2
综述 提出将微生物次级代谢产物视为浓度依赖性信号中枢的综合信号网络框架,并探讨其对抗毒力干预的启示 突破传统线性信号模型,将次级代谢产物重新定义为连接微生物集体行为与环境适应的关键节点,并引入空间组学和合成生物学工具 未给出具体实验验证,主要基于理论框架和已有研究的整合分析 重新认识微生物化学生态学,建立动态信号网络视角以指导抗毒力干预和应用 微生物次级代谢产物及其在群体感应中的双重功能 微生物组学 抗生素耐药性 空间组学, 合成生物学 NA NA NA 合成生物学工具 微生物 信号网络解耦 工业生物技术, 环境生物修复, 医学
47 2026-05-29
Engineering Bacillus Subtilis for Efficient Biosynthesis of Riboflavin: Current Knowledge and Future Perspectives
2026-May-28, Applied biochemistry and biotechnology IF:3.1Q2
综述 综述枯草芽孢杆菌高效合成核黄素的研究进展与未来展望 系统总结了代谢工程策略(如强化合成途径、解除反馈抑制、平衡代谢流)与合成生物学工具(核糖开关、调控元件设计、高通量筛选)在核黄素生产中的整合应用 精确调控困难、多基因表达优化不足、基因组整合效率低,以及过量生产带来的代谢负担和缺乏跨工业规模的通用调控模型 提升枯草芽孢杆菌核黄素的生物合成效率 枯草芽孢杆菌 合成生物学 营养缺乏症 代谢工程, 合成生物学 NA NA NA 核糖开关 枯草芽孢杆菌 代谢途径工程(核黄素合成途径) 工业生物技术, 食品, 医药
48 2026-05-29
Synthetic Biology-Enabled Biosensing Platforms for Point-of-Care In Vitro Diagnostics: Programmable Modules, Clinical Applications, and Translational Challenges
2026-May-20, Biosensors
综述 综述了合成生物学赋能的可编程即时检测体外诊断平台,涵盖模块化元件、临床转化挑战及未来方向 首次提出将合成生物学体外诊断系统分解为分子识别、信号转导与放大、输出生成及系统集成四个功能层,并系统分析了从2021至2025年代表性临床应用及实际转化考量 主要基于文献综述,未包含原创实验数据;实际临床应用中的大规模验证数据有限,且聚焦于近五年进展,可能忽略早期重要工作 系统总结合成生物学驱动的可编程即时检测生物传感平台的模块化设计、临床转化进展及面临的关键挑战 合成生物学赋能的可编程诊断平台,包括无细胞蛋白合成系统、适配体与核糖开关传感器、CRISPR-Cas诊断平台及微流控集成技术 机器学习, 数字病理学 感染性疾病, 肿瘤, 代谢性疾病 无细胞蛋白合成, CRISPR-Cas, 微流控, 适配体传感 NA 文本 NA CRISPR-Cas9, 适配体, 核糖开关 无细胞体系(如E. coli提取物) 可编程生物传感电路,包括无细胞蛋白合成回路、核糖开关传感器、CRISPR-Cas诊断系统 医学, 工业生物技术
49 2026-05-29
Synergistic Integration of Enzyme and Microbial Platforms for Sustainable Management of Pharmaceutical Pollutants: Towards a Greener Pharmaceutical Lifecycle
2026-May-19, Biology
综述 本综述旨在为构建环保且经济可行的药物污染可持续管理系统提供理论依据和科学参考 提出了“级联降解”、“共生保护”和“功能互补”三种协同机制,并通过共固定化技术、工程生物膜和合成生物学改造的工程菌等策略,实现了酶与微生物的协同整合 NA 为药物污染构建环保且经济可行的可持续管理系统提供理论基础 酶和微生物协同平台在药物污染物处理中的应用 NA NA 合成生物学 NA NA NA CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM 大肠杆菌, 酿酒酵母, 枯草芽孢杆菌 双稳态开关, 振荡器, 逻辑门, 生物传感器, 代谢通路 医药, 工业生物技术
50 2026-05-29
Mycogenic Nanomaterials: What Fungal Nanoparticles Promise and What Still Holds Them Back
2026-May-16, Journal of fungi (Basel, Switzerland)
综述 采用“承诺与障碍”框架综合评述真菌纳米技术在生物合成机制、真菌生物多样性、纳米材料组合、生物医学应用、环境和农业利用及工业可扩展性方面的前景与挑战 首次采用结构化“承诺与障碍”框架跨越六个相互关联的主题支柱,同步绘制机理前沿、生物多样性空白和转化障碍 机理知识差距、非模式真菌有限遗传工具包及缺乏标准化协议仍阻碍进展,且临床验证、长期毒性数据、制造可重复性和监管清晰度方面存在关键缺陷 批判性审视真菌纳米技术在多个领域的巨大前景与持续障碍,并提出分层路线图推动从实验室成果到实际应用的转化 真菌纳米粒子(纳米材料) NA NA 多组学方法(转录组学、蛋白质组学、代谢组学)、基因组挖掘、机器学习 NA NA NA NA 真菌 NA 生物医学、环境、农业、食品包装
51 2026-05-29
Quantitative Measurement of Synthetic Repression Curves Reveals Design Challenges for Genetic Circuit Engineering under Growth Arrest
2026-May-13, ACS synthetic biology IF:3.7Q1
研究论文 测量生长停滞条件下合成抑制曲线,揭示遗传电路工程的设计挑战 首次系统量化生长停滞对基因NOT门抑制曲线的影响,发现未抑制表达水平降低超过100倍是主要挑战 仅针对单一基因电路类型(NOT门),未探索其他电路类型或更复杂环境 研究生长停滞对工程化遗传电路性能的影响 大肠杆菌中基因NOT门文库 合成生物学 NA 单细胞分辨率测量 NA 基因表达数据 基因NOT门文库 NA 大肠杆菌 遗传NOT门 工业生物技术
52 2026-05-29
Expanding the Microbial Genomic Landscape and Biotechnological Applications of CRISPR-Cas Systems
2026-May-08, Biology
综述 该文章综述了CRISPR-Cas系统的多样性、在微生物中的基因组景观及其前沿生物技术应用 系统性地总结了通过计算挖掘微生物基因组和宏基因组发现的新型CRISPR效应物,包括独特性质、不同PAM需求及RNA靶向能力等,并讨论了其扩展分子生物学工具库的潜力 未明确提及具体研究限制,但可推断类1系统的递送挑战和伦理生物安全问题仍需解决 全面概述CRISPR-Cas系统的多样性、微生物基因组分布及生物技术应用,并强调其在合成生物学、治疗、诊断、环境修复和农业中的变革潜力 细菌和古菌中的CRISPR-Cas系统 机器学习和数字病理学以外的领域,更偏向合成生物学与生物技术,因此选择NA NA 计算微生物基因组挖掘、宏基因组分析 NA 基因组和宏基因组序列数据 NA CRISPR-Cas9, CRISPR-Cas12, CRISPR-Cas13 细菌, 古菌 碱基编辑、先导编辑、基因敲入/敲除、活细胞DNA/RNA成像 合成生物学, 治疗, 诊断, 环境修复, 农业
53 2026-05-29
Synthetic multicolor antigen-stabilizable nanobody platform for intersectional labeling and functional imaging
2026-May, Nature methods IF:36.1Q1
研究论文 开发了一种覆盖整个可见光谱的抗原稳定荧光纳米抗体合成工具包,用于多色标记和功能成像 首次将20多种荧光蛋白和生物传感器工程化到8种纳米抗体中,建立了一种可泛化设计的抗原稳定荧光纳米抗体平台,实现无背景可视化、多色检测和选择性靶向 NA 开发一种合成生物学驱动的抗原稳定荧光纳米抗体平台,用于精确研究蛋白质动态、细胞过程和复杂生物系统 抗原稳定荧光纳米抗体 合成生物学 NA 荧光蛋白工程, 生物传感器工程 NA 图像 小鼠脑组织样本和斑马鱼胚胎样本 NA 小鼠, 斑马鱼 抗原稳定荧光纳米抗体 医学, 基础生物学
54 2026-05-28
AI and mechanistic modeling for characterizing biosynthetic pathways of natural products
2026-May-27, Natural product reports IF:10.2Q1
综述 探讨人工智能和机械建模在表征天然产物生物合成途径中的应用 全面分析2020至2025年间人工智能与机械建模在预测生物合成途径和酶-底物相互作用中的最新进展,并讨论整合这些策略以加速天然产物发现、工程和应用的未来方向 该领域仍面临复杂基因型-表型关系带来的挑战,且整合不同计算方法存在技术障碍 揭示天然产物生物合成途径以加速药物发现、生物技术和合成生物学应用 天然产物及其生物合成途径相关数据库、AI方法及机械模拟 机器学 NA AI, 机械建模 NA 文本(数据库) NA NA NA NA 药物发现, 生物技术, 合成生物学
55 2026-05-28
Charting the path for L-tyrosine derivatives: from engineering strategies to microbial cell factories
2026-May-27, Natural product reports IF:10.2Q1
综述 系统总结了利用微生物细胞工厂生产L-酪氨酸及其衍生物的工程策略 聚焦酪醇、对香豆酸和左旋多巴三大关键节点,综述近五年在酶、代谢和细胞水平上的前沿工程策略 未深入探讨工业放大中的工艺瓶颈和成本问题 为加速L-酪氨酸衍生物的绿色生物制造提供战略路线图 L-酪氨酸及其衍生物(酪醇、对香豆酸、左旋多巴) 合成生物学 NA 合成生物学 NA NA NA NA 大肠杆菌, 酵母 代谢通路 食品, 医药, 化工
56 2026-05-28
Bioethics-in-Science : An Invitation
2026-May-27, Journal of bioethical inquiry IF:1.8Q3
研究论文 提出“科学中的生物伦理学”概念,探讨将生物伦理探究直接融入科学实践的方法论途径 重新定义伦理与科学关系,将科学实践视为内在地承载价值,并开发具体方法(如伦理笔记本、协作研讨会、概念映射)实现持续伦理反思而非外部评估 跨学科边界挑战与操作实践中的困难分析 为生物伦理探究提供超越科学边缘位置、积极参与知识生产规范维度的新路径 合成生物学、神经多样性研究、蛋白质组学案例 生物伦理学 NA NA NA 案例研究 三个案例(合成生物学、神经多样性、蛋白质组学) NA NA NA NA
57 2026-05-28
From gene discovery to synthetic biology: recent advances in the biosynthesis of oleanane-type pentacyclic triterpenoids
2026-May-26, Natural product reports IF:10.2Q1
综述 综述了齐墩果烷型五环三萜生物合成的最新进展,涵盖关键酶、转录调控、合成生物学及人工智能应用 系统整合组学技术、合成生物学工具与人工智能在OPT生物合成中的应用前景,强调从经验试错向预测优化的范式转变 静态综述,未提供实验验证数据或定量比较不同策略的优劣 总结OPT生物合成基因发现、调控机制及合成生物学策略的研究进展,实现可持续高效生产 齐墩果烷型五环三萜类化合物及其生物合成途径相关基因和调控元件 自然语言处理, 机器学习 NA 组学技术, 基因组编辑, 异源表达 NA NA NA CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN 微生物, 植物 合成生物电路、代谢途径工程 医药, 工业生物技术
58 2026-05-28
Extrachromosomally co-encoded toxin-immunity pairs in yeast and their application potential
2026-May-26, Applied microbiology and biotechnology IF:3.9Q2
综述 本文综述了酵母中由染色体外元件共编码的毒素-免疫因子对的研究进展及其在合成生物学和生物技术中的应用潜力 系统总结了酵母毒素-免疫因子对的分子机制、克隆和研究方法,并类比细菌毒素-抗毒素系统,提出其在合成生物学中的开发前景 目前对多数免疫因子的保护机制了解尚少,限制了实际应用 推动对酵母毒素-免疫因子对的分子理解,并促进其在合成生物学和生物技术中的应用 酵母中的染色体外毒素-免疫因子对(包括dsRNA真菌病毒卫星和DNA病毒样元件) 合成生物学 NA 基因克隆、分子生物学研究、工程改造 NA 文本 NA Gibson Assembly, Golden Gate Assembly 酵母 毒素-免疫因子对(如毒素分泌系统、自我保护回路) 食品防腐剂, 医药, 生物技术, 合成生物学
59 2026-05-28
From design-build-test-learn cycles to AI-driven digital twins for bioprocess scale-up in the Genesis Mission era
2026-May-26, Current opinion in biotechnology IF:7.1Q1
评论文章 探讨在Genesis Mission时代,从设计-构建-测试-学习循环转向AI驱动的数字孪生技术以加速生物制造工艺放大的前景与挑战 提出将合成生物学与AI生态系统整合,并开发共享的AI就绪生物系统数据库和混合数字细胞模型来克服工业放大中的不确定性 研究仍处于概念阶段,缺乏具体的实验验证和实际应用案例 促进生物制造工艺放大的多尺度优化和数字孪生发展 微生物菌株在工业生物反应器中的性能 机器学习 NA 合成生物学, 机器学习, 大语言模型 迁移学习, 强化学习, 贝叶斯优化 文献数据, 实时数据 NA NA 微生物 混合数字细胞模型 工业生物技术
60 2026-05-28
Advances in the heterologous biosynthesis of QS saponins: a review
2026-May-26, Microbial cell factories IF:4.3Q1
综述 系统综述QS皂苷的异源生物合成进展,重点探讨利用微生物细胞工厂生产QS-21等化合物的合成生物学策略 全面梳理了最具有前景的QS皂苷QS-21的作用机制和应用,并深入探索了微生物合成QS皂苷的合成生物学策略,同时针对当前研究挑战提出了靶向应对策略 未具体说明,但综述性质决定了其受限于已有文献的覆盖范围和数据可用性 为促进QS皂苷的医学应用和可持续生产奠定理论基础 QS皂苷(特别是QS-21)及其生物合成途径和异源生产策略 合成生物学 NA 合成生物学技术、异源生物合成 NA NA NA NA 微生物细胞工厂(具体种类未指明) QS皂苷的生物合成途径(包括QS-21的代谢通路设计) 医学、疫苗学、食品、化妆品、洗涤剂
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