合成生物学相关文章
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当前共找到 150 篇文献，本页显示第 81 - 100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2026-05-22 |
Recurrent neural chemical reaction networks that approximate arbitrary dynamics
2026-May-20, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2026.101572
PMID:42025162
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研究论文 | 提出一种名为“递归神经化学反应网络”（RNCRN）的模块化分子架构，用于逼近任意动力学行为 | 首次将递归人工神经网络的概念引入化学反应网络，并证明其可以系统训练以模拟任意动力学，且具有DNA链置换技术的实验可行性 | 需要足够多的化学神经元和快速反应才能实现精确逼近，且实际训练中只能使用少量神经元和中等反应速率范围 | 解决合成生物学和分子纳米技术中构建具有丰富动力学特性的新型化学系统的难题 | 递归神经化学反应网络的分子实现和动力学近似能力 | 机器学习 | NA | DNA链置换技术 | 递归神经网络 | NA | NA | DNA链置换技术 | NA | 递归神经化学反应网络（类似合成神经电路） | 合成生物学, 分子纳米技术 |
| 82 | 2026-05-22 |
Functional diversity, evolution, and translational potential of isoprenoids in eukaryotic membranes
2026-May-20, Trends in biochemical sciences
IF:11.6Q1
DOI:10.1016/j.tibs.2026.04.014
PMID:42161681
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综述 | 本文综述了真核生物膜中类异戊二烯的功能多样性、进化及合成生物学应用潜力 | 系统总结了类异戊二烯在真核生物膜中的结构多样性及其对膜流动性、稳定性、渗透性和组织性的调控作用，并探讨了合成生物学在相关化合物生产中的最新进展与挑战 | 合成生物学方法生产膜相关类异戊二烯仍存在产率低、调控复杂等限制 | 探讨类异戊二烯在真核生物膜中的进化、多样性及其在合成生物学中的应用前景 | 真核生物膜中的类异戊二烯及其衍生化合物 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学相关技术 | 植物、真菌、动物 | 膜相关类异戊二烯的代谢通路设计 | 工业生物技术, 医学, 农业 |
| 83 | 2026-05-22 |
PHYCUT: Scalable Multiplex CRISPR/Cas9 Editing for Genome Engineering in the Diatom Phaeodactylum tricornutum
2026-05-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00843
PMID:41979903
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研究论文 | 开发了一种名为PHYCUT的多重CRISPR/Cas9编辑工具，用于硅藻基因工程，特别是减少免疫原性岩藻糖基化 | 首次在硅藻中实现基于质粒的多重CRISPR/Cas9编辑系统，利用Csy4核糖核酸酶处理多导向RNA阵列，可同时编辑多个基因 | 文章未明确讨论长期遗传稳定性或脱靶效应，且系统在非模式硅藻中的适用性尚未验证 | 解决硅藻多重基因组编辑效率低的问题，并实现人源化糖基化修饰以支持生物制药应用 | 三角褐指藻（Phaeodactylum tricornutum）及其α(1,3)-岩藻糖基转移酶基因 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9, Csy4核糖核酸酶处理, 多重基因编辑 | NA | NA | 三个α(1,3)-岩藻糖基转移酶基因的编辑, 多个菌株获得低岩藻糖基化 | CRISPR-Cas9 | 三角褐指藻（Phaeodactylum tricornutum） | 多导向RNA阵列处理系统，基于Csy4核糖核酸酶 | 生物制药, 藻类生物技术 |
| 84 | 2026-05-22 |
Yeast MoClo Secretion and Surface Display Toolkit 2.0: Improvements and Applications for Analysis of protein-protein Interactions and Whole-Cell Biocatalysis
2026-05-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00085
PMID:42025218
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研究论文 | 介绍了酵母MoClo分泌和表面展示工具包2.0的改进及其在蛋白质相互作用分析和全细胞生物催化中的应用 | 通过添加基于截短Aga1的N端融合和Aga2的C端融合的锚蛋白新部件，以及GFP荧光互补检测和分泌增强蛋白部件，实现了高通量检测和表达优化 | 未提及具体局限性 | 改进和扩展酵母MoClo分泌和表面展示工具包，用于蛋白质相互作用分析和全细胞生物催化 | 酵母细胞、异源蛋白、抗GFP纳米抗体、PET降解酶、疏水蛋白1、MHETase | 合成生物学 | NA | 模块化克隆(MoClo)、流式细胞术、酵母免疫共沉淀 | NA | 蛋白质相互作用数据、酶活性数据 | NA | MoClo | 酿酒酵母 | 分泌和表面展示系统、荧光互补系统 | 工业生物技术、环境科学 |
| 85 | 2026-05-22 |
Systematic Evaluation of Different Ribonucleoprotein Complexes as Posttranscriptional Biosensors in Cell-Free TX-TL Systems
2026-05-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00170
PMID:42086502
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研究论文 | 系统评估了三种不同核糖核蛋白复合物在无细胞转录翻译系统中作为转录后生物传感器的性能 | 首次系统比较了三种RNP电路（RISC、MS2-CNOT7和L7Ae）在不同无细胞平台（真核、原核和重组）中的表现，并展示了L7Ae电路在蛋白酶响应性病毒检测中的潜力 | IVT RNA基miRNA传感器中报告基因基线表达水平的可靠量化存在瓶颈；MS2-CNOT7电路在真核裂解液中受裂解液依赖性限制，降低了其可编程性 | 评估RNP复合物作为无细胞转录后生物传感器的可行性及平台通用性 | 三种核糖核蛋白电路（RISC、MS2-CNOT7和L7Ae）在不同无细胞转录翻译系统（真核、原核和重组）中的性能 | 合成生物学 | NA | 无细胞转录翻译系统 | NA | NA | NA | NA | NA | 转录后生物传感器电路（RISC、MS2-CNOT7和L7Ae） | 医学, 环境 |
| 86 | 2026-05-22 |
AHR: The Overlooked Mediator in SkincareBridging Environmental Sensing and Skin Physiology
2026-May-15, Environment & health (Washington, D.C.)
DOI:10.1021/envhealth.5c00424
PMID:42164887
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综述 | 本文综述了芳香烃受体（AHR）在护肤品中作为环境传感与皮肤生理学桥梁的媒介作用，及其在化妆品生物活性物质效应中的新角色 | 挑战了AHR仅作为外源物传感器的传统观点，将其重新定义为整合环境与生物活性信号的转录因子，并探讨了AI驱动建模和合成生物学等新兴工具在AHR研究中的应用潜力 | 基于现有研究的综述性质，可能受限于已发表研究的范围；缺乏直接的实验验证；未详细讨论AHR激活的潜在副作用或个体差异 | 建立AHR在皮肤功能调节中的整合枢纽作用，并展望未来研究方向以制定更精准的护肤策略 | AHR及其在皮肤生理中的调控机制 | 数字病理学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 87 | 2026-05-22 |
Incorporation of Cryptic Plasmid Energetics Improves Genome-Scale Metabolic Predictions in Probiotic E. coli Nissle 1917
2026-May, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.70361
PMID:42152457
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研究论文 | 本研究将隐性质粒能量代谢整合进益生菌大肠杆菌Nissle 1917的基因组规模代谢模型，以提高代谢预测的准确性 | 首次在基因组规模代谢模型中考虑隐性质粒相关的能量成本，并系统比较不同模型细化深度与预测性能之间的权衡 | 未详细说明模型在复杂体外或体内环境下验证的局限性，且依赖单一菌株和特定实验条件 | 提高益生菌大肠杆菌Nissle 1917代谢预测的定量可靠性和生理相关性，支持益生菌工程和合成生物学 | 益生菌大肠杆菌Nissle 1917（EcN）及其隐性质粒 | 机器学习 | NA | 代谢组学分析 | 基因组规模代谢模型（GEM）、可能性代谢通量分析 | 代谢组学数据 | 一种菌株（EcN）在模拟肠道培养基和厌氧条件下的代谢组学分析 | NA | 大肠杆菌（E. coli Nissle 1917） | 隐性质粒能量代谢模块 | 医学、生物技术、合成生物学 |
| 88 | 2026-05-21 |
PlantGFM: A Genomic Foundation Model for Discovery and Creation of Plant Genes
2026-May-20, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.75772
PMID:42160034
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research paper | 提出PlantGFM，一种基于Hyena算子的植物基因组基础模型，支持长上下文预测和序列生成，并成功设计出有转录活性的新植物基因 | 首次在植物中展示了大型语言模型生成序列的DNA-RNA-蛋白质表达，并实现从头设计具有转录活性的植物基因，包括NLR基因的生成 | NA | 开发人工智能驱动的植物基因发现和生成方法 | 植物基因序列 | 机器学习 | NA | NA | Hyena算子 | 基因组序列 | 从12个植物物种的108.4亿个核苷酸进行预训练，并在10个注释植物基因组上微调 | NA | 本氏烟草 | NA | 农业, 合成生物学 |
| 89 | 2026-05-19 |
Betacyanin biofortification in wheat via synthetic biology for nutritional enhancement
2026-May-06, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiag266
PMID:42148553
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 90 | 2026-05-21 |
The Leptin Renaissance: Orchestrating the Next Endocrine Paradigm
2026-May, Journal of cellular biochemistry
IF:3.0Q3
DOI:10.1002/jcb.70091
PMID:42159080
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评论 | 文章讨论瘦素从传统代谢激素向多系统免疫-代谢调控因子的范式转变，并强调整合精准医学、合成生物学和微生物组干预的新策略 | 提出将瘦素视为多效性全身激素，整合免疫调节、工程化瘦素类似物和微生物组靶向治疗的系统级方法 | 未提供具体实验数据或验证，仅基于观点性论述；瘦素抵抗的分子机制仍需进一步阐明 | 提出瘦素作为内分泌新范式的核心，探索克服瘦素抵抗的创新治疗策略 | 瘦素及其在代谢、免疫和微生物组中的多系统作用 | NA | 肥胖及相关代谢紊乱 | 多组学分析、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 91 | 2026-05-20 |
One Yeast, Sixteen Synthetic Chromosomes, Infinite Possibilities
2026-May-19, Yeast (Chichester, England)
DOI:10.1002/yea.70026
PMID:42152749
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综述 | 庆祝《Yeast》期刊40周年，回顾合成酵母基因组计划（Sc2.0）在构建全部16条合成染色体中的技术与概念进展，并展望新型合成染色体的未来潜力 | 系统总结了Sc2.0项目在构建真核生物首个全合成基因组中的里程碑式成就，并引入新型模块化合成染色体（neochromosomes）作为正交于天然基因组的工程平台，拓展了酵母工程的通用性和可编程性 | 未详细讨论合成染色体在长期稳定性或生物安全性方面的潜在挑战 | 回顾Sc2.0项目进展并展望合成酵母的下一个发展方向，强调从模型生物到工程化底盘的转变 | 酿酒酵母及其16条合成的染色体 | 合成生物学 | NA | 设计-构建-测试-学习（DBTL）循环, 基因组规模工程 | NA | NA | NA | NA | 酿酒酵母（Saccharomyces cerevisiae） | 模块化合成染色体（neochromosomes） | 工业生物技术, 医学, 农业 |
| 92 | 2026-05-20 |
Substrates reconfigure picosecond electric field fluctuations in dihydrofolate reductase
2026-May-19, Journal of biomolecular structure & dynamics
IF:2.7Q2
DOI:10.1080/07391102.2026.2672099
PMID:42153902
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研究论文 | 本研究通过分子动力学模拟，探讨底物对二氢叶酸还原酶中皮秒电场波动的影响 | 揭示了底物结合显著改变催化剂中局部电场波动，影响能量势垒跨越事件的新机制 | NA | 理解酶催化中快速静电波动的作用，为酶抑制剂设计和工程酶开发提供基础 | 大肠杆菌二氢叶酸还原酶（DHFR）及其配体结合态和未结合态 | NA | NA | 分子动力学模拟（MD） | NA | 模拟数据 | NA | NA | 大肠杆菌 | NA | 合成生物学, 蛋白质工程 |
| 93 | 2026-05-20 |
TALEs, TALENs, and TALE Base Editors: From Plant Pathology to Biotechnology
2026-May-18, Annual review of phytopathology
IF:9.1Q1
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综述 | 探讨TALE蛋白从植物病理学到生物技术的应用，重点关注TALEN和TALE碱基编辑器的基因组编辑作用 | 系统总结TALE蛋白的模块化DNA结合域特性及其在合成生物学中的最新进展，包括叶绿体和线粒体基因组编辑工具的开发 | 未详细讨论TALEN技术与其他基因编辑工具（如CRISPR）的比较及潜在脱靶效应 | 综述TALE蛋白在自然发生、基因组编辑和合成生物学中的当前角色和最新进展 | TALE蛋白及其衍生的TALEN和TALE碱基编辑器 | 合成生物学, 基因组编辑 | NA | TALE, TALEN, TALE碱基编辑器 | NA | NA | NA | TALEN, TALE碱基编辑器 | 植物细胞 | NA | 农业, 生物技术 |
| 94 | 2026-05-20 |
Translation efficiency covariation identifies conserved coordination patterns across cell types
2026-May, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-025-02718-5
PMID:40715459
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研究论文 | 通过翻译效率协变分析跨细胞类型的协调翻译模式 | 首次定义翻译效率协变概念并发现哺乳动物跨细胞类型的保守翻译协调模式 | 未明确说明局限性 | 探究翻译效率在跨细胞类型中的协调模式及其保守性 | 人类和小鼠的翻译效率协变模式 | 机器学习 | NA | 核糖体足迹测序 | NA | 核糖体足迹数据 | 人类117种和小鼠94种组织及细胞系的3819个核糖体足迹数据集 | NA | 人类和小鼠 | NA | 合成生物学, 生物技术 |
| 95 | 2026-05-19 |
Biological treatment strategies for antibiotic contamination: mechanisms, applications, and future perspectives
2026-May-13, RSC advances
IF:3.9Q2
DOI:10.1039/d6ra00375c
PMID:42148262
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综述 | 系统阐述基于微生物共代谢的抗生素降解机制及从传统工艺到新兴强化技术的综合评估 | 整合了过程强化、新型材料耦合、合成生物学工具、资源回收和智能模型控制等前沿方法，以协同提升处理效率并降低环境风险 | 未提供具体实验数据或案例研究的局限性分析 | 为开发更高效、更安全的含抗生素废水生物处理技术提供参考 | 抗生素污染物及水环境中的残留问题 | 环境科学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 环境 |
| 96 | 2026-04-24 |
Synthetic biology's uncertain regulatory future in the wake of Loper Bright Enterprises v. Raimondo
2026-May, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-026-03114-3
PMID:42020847
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 97 | 2026-05-18 |
Advances in biotechnological methods for genetic and metabolic engineering in Methylomonas sp. DH-1
2026-May-16, Journal of biological engineering
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13036-026-00700-6
PMID:42143386
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综述 | 综述了用于Methylomonas sp. DH-1遗传和代谢工程的生物技术方法进展 | 总结了针对该菌株优化的转化方法、无质粒基因组工程、可调启动子文库和合成小调控RNA平台等新型遗传工具，以及适应性实验室进化、合成菌群和系统生物学等互补策略 | NA | 概述Methylomonas sp. DH-1的遗传和代谢工程方法进展，为甲烷氧化菌的代谢工程和合成生物学奠定基础 | Methylomonas sp. DH-1（一种革兰氏阴性甲烷氧化细菌） | 合成生物学 | NA | 基因组工程， 转化， 可调启动子文库， 合成小调控RNA， 适应性实验室进化 | NA | NA | NA | Cre重组酶 | Methylomonas sp. DH-1 | 合成小调控RNA平台， 可调启动子文库 | 工业生物技术， 环境 |
| 98 | 2026-05-18 |
Discovery and engineering of polymerases and ligases for the synthesis of modified nucleic acids
2026-May-15, Current opinion in chemical biology
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.cbpa.2026.102697
PMID:42143538
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综述 | 本文综述了利用工程化聚合酶和连接酶合成含非天然构建块的寡核苷酸的最新方法 | 聚焦于工程化聚合酶和连接酶在非天然寡核苷酸合成中的应用，并提供了加速核酸修饰酶发现与工程化的计算工具及网络应用程序 | 未明确提及具体局限性 | 综述利用工程化聚合酶和连接酶合成含非天然构建块的寡核苷酸的研究进展 | 工程化聚合酶和连接酶 | 合成生物学 | NA | 酶促合成 | NA | NA | NA | NA | NA | 非天然核酸聚合物合成通路 | 医学, 诊断, 合成生物学 |
| 99 | 2026-05-17 |
PromoterAtlas: decoding regulatory sequences across Gammaproteobacteria using a transformer model
2026-May-15, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-72837-3
PMID:42140912
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研究论文 | 提出基于Transformer的模型PromoterAtlas，从3371种γ-变形菌的900万调控序列中学习，实现全基因组启动子注释 | 首次使用大规模跨物种调控序列训练Transformer模型，实现启动子序列的跨物种进化关系聚类与转录/翻译水平预测 | 模型训练数据仅限于γ-变形菌，可能无法直接推广到其他细菌类群 | 开发能识别多种调控元件并预测转录/翻译水平的通用启动子注释工具 | γ-变形菌的调控序列 | 机器学习 | NA | Transformer深度学习模型 | Transformer | 基因组序列 | 3371种细菌的900万条调控序列 | NA | NA | NA | 合成生物学, 比较基因组学 |
| 100 | 2026-05-17 |
A synthetic cell microreactor with two types of interacting dynamic DNA-based pores
2026-May-15, Nature chemistry
IF:19.2Q1
DOI:10.1038/s41557-026-02124-7
PMID:42141071
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研究论文 | 构建了一个含有两种动态DNA基孔的双颈合成细胞微反应器，用于模拟和扩展天然细胞系统的功能复杂性 | 创新地利用巨型单层囊泡膜动力学介导的信号通路，协调光响应小孔与自组装可密封大孔之间的相互作用，实现具有高时空精度的按需顺序递送分子反应物 | NA | 在合成生物学中重建细胞复杂性，通过动态DNA基孔实现膜渗透性的可控调节 | 巨型单层囊泡膜上的动态DNA基孔系统 | 合成生物学 | NA | DNA纳米技术 | NA | 图像 | NA | DNA折纸 | NA | 光响应小孔和自组装可密封大孔的信号通路，以及酶联反应、细胞骨架模拟和细胞外无细胞系统 | 生物技术, 纳米技术 |