合成生物学相关文章
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当前共找到 126 篇文献，本页显示第 101 - 120 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2026-05-16 |
Understanding Cell Wall Enzyme Function: From Classical Approaches to New Biotechnology
2026-May-14, Journal of experimental botany
IF:5.6Q1
DOI:10.1093/jxb/erag227
PMID:42135035
|
综述 | 综述了植物细胞壁相关碳水化合物活性酶的功能研究方法，从经典技术到合成生物学和人工智能等新兴工具 | 整合了经典生化与遗传方法以及高通量筛选、无细胞系统、微生物宿主、植物平台和CRISPR/Cas9等合成生物学工具，并强调了AI蛋白质模型和实验室自动化的潜力 | 未提及具体实验结果或定量比较不同方法的效率 | 提供研究植物细胞壁相关CAZymes功能的策略概述，以推动食品、生物能源和生物产品应用 | 植物细胞壁中碳水化合物活性酶 | 合成生物学 | NA | 高通量筛选，无细胞系统，CRISPR/Cas9基因组编辑，碱基编辑，AI蛋白质模型 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9，碱基编辑 | 微生物宿主，植物 | NA | 食品，生物能源，生物产品，材料 |
| 102 | 2026-05-16 |
Harnessing biosynthetic logic for next-generation ADC payloads
2026-May-12, Chemical Society reviews
IF:40.4Q1
DOI:10.1039/d5cs01487e
PMID:42015662
|
综述 | 本文综述了基于生物合成逻辑开发新一代抗体药物偶联物（ADC）载药的研究进展 | 通过基因组挖掘和合成生物学方法揭示临床载药的生物合成基因簇和酶学逻辑，拓展载药化学空间，并讨论非毒素模式以补充传统细胞毒素 | 未明确说明该领域的当前挑战或未来研究的具体局限性 | 总结临床载药的发现、生物合成和生产进展，利用生物合成知识推动更安全、高效和机制复杂的ADC疗法 | 抗体药物偶联物及其载药 | 合成生物学 | 肿瘤 | 基因组挖掘、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 103 | 2026-05-12 |
Epigenome regulators imbue a single eukaryotic promoter with diverse gene expression dynamics
2026-May-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2026.115805
PMID:42111206
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研究论文 | 通过筛选80种染色质相关蛋白，研究单个真核启动子如何产生多样的基因表达动态 | 首次揭示单个基因可驱动丰富多样的动态表达谱，并建立了三状态启动子动力学模型 | 研究仅在酵母中进行，可能无法直接推广到其他真核生物 | 探索单个真核启动子产生多样基因表达动态的机制 | 酿酒酵母中的染色质相关蛋白 | 机器学习 | NA | 活细胞显微成像 | 动力学模型 | 图像， 时间序列数据 | 80种染色质相关蛋白在单细胞水平进行分析 | NA | 酿酒酵母 | NA | 合成生物学 |
| 104 | 2026-05-12 |
Synthesis of Amines for Active Pharmaceutical Ingredients Using the Whole-Cell Factory Saccharomyces Cerevisae
2026-May-14, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.202500898
PMID:42107106
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综述 | 该综述总结了利用全细胞工厂酿酒酵母合成活性药物成分中胺类化合物的最新进展 | 系统总结了代谢工程和基因工程策略，包括基因组编辑、基因表达优化和代谢通路平衡，以克服酶基因表达、辅因子再生和前体通道化等瓶颈 | 当前挑战包括系统生物学和合成生物学工具的整合，以实现酿酒酵母作为工业胺生产可扩展平台的目标 | 回顾酿酒酵母在胺类生物催化中的工程化策略，并展望其工业应用前景 | 酿酒酵母工程菌株及其合成的胺类、氨基醇、氨基酸和复杂生物碱化合物 | 合成生物学 | NA | 代谢工程, 基因工程, 基因组编辑 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly | 酿酒酵母 | 代谢通路 | 医药, 工业生物技术 |
| 105 | 2026-05-12 |
Advances in anthocyanins: Chemical foundations, synthetic biology, molecular mechanisms, physicochemical properties, and applications in the food industry
2026-May, Food chemistry: X
DOI:10.1016/j.fochx.2026.103938
PMID:42111325
|
综述 | 综述花青素从化学合成到食品工业应用的最新进展，重点关注结构修饰、生物合成机制和食品化学挑战 | 整合了化学、合成生物学、机制研究和应用领域知识，强调AI辅助设计和高通量工程在解决生产效率和稳定性瓶颈中的作用 | 研究在化学、合成、机制和应用领域仍然分散，阻碍了功能性食品、智能材料和个性化健康的整合发展 | 总结花青素化学、生物合成、健康机制和工业应用，特别关注食品相关限制如pH驱动降解、抗坏血酸诱导氧化还原反应和蛋白质-多酚相互作用 | 花青素的结构工程、合成生物学生产和食品配方挑战 | 数字病理学 | NA | 合成生物学 | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 食品 |
| 106 | 2026-05-11 |
Plant formins pave the way for endosymbiosis
2026-May-08, Trends in plant science
IF:17.3Q1
DOI:10.1016/j.tplants.2026.04.017
PMID:42106252
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研究论文 | 本文揭示了formin蛋白在豆科植物根瘤菌侵染和多种植物菌根共生中协调细胞骨架重排的机制 | 发现单个formin蛋白能同时协调根瘤菌侵染和菌根形成两种不同的内共生过程，为工程化微生物进入作物提供新靶点 | 未提供具体实验数据或工程应用验证，仅基于Qiao等人研究进行概念阐述 | 阐明植物formin蛋白在有益微生物内共生中的核心作用机制 | 豆科植物和多种植物的根细胞，涉及根瘤菌和丛枝菌根真菌 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 豆科植物、多种植物 | 内共生信号通路调控模块（formin介导的细胞骨架重排途径） | 农业, 合成生物学 |
| 107 | 2026-05-10 |
Profiling Selectivity for the Shigella Virulence Factor OspF
2026-May-05, Biochemistry
IF:2.9Q3
DOI:10.1021/acs.biochem.6c00109
PMID:42018782
|
研究论文 | 本研究通过合成磷酸肽和化学蛋白质组学方法，探究了志贺氏菌毒力因子OspF的底物选择性，发现其不仅能修饰MAPK家族蛋白，还能作用于多种细胞靶标 | 首次揭示OspF对MAPK家族内部的底物选择性，并发现其修饰范围远超MAPK家族，包括Rab1A和酪蛋白激酶2β等新靶标 | 未完全阐明OspF在志贺氏菌感染中的全部功能角色，需要进一步研究 | 研究志贺氏菌毒力因子OspF的底物选择性及其在宿主细胞中的修饰靶标 | 志贺氏菌分泌的磷酸苏氨酸裂合酶OspF | 微生物学, 化学生物学 | 细菌感染性疾病 | 合成磷酸肽分析, 化学蛋白质组学, 亲核膦化学探针 | NA | 蛋白质组数据 | 细胞裂解液样本和志贺氏菌感染样本 | NA | 志贺氏菌, 宿主细胞（被感染细胞） | NA | 医学, 化学生物学, 合成生物学 |
| 108 | 2026-05-07 |
Followers' Choice: The Trends Transforming Precision Medicine, Synthetic Biology, and Sustainable Microbiology
2026-May, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.70370
PMID:42087404
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 109 | 2026-05-09 |
Hybrid AI in synthetic biology: next era in agriculture
2026-May, Trends in plant science
IF:17.3Q1
DOI:10.1016/j.tplants.2025.08.011
PMID:40930858
|
研究论文 | 文章讨论混合人工智能在合成生物学中应用于农业的潜力 | 提出混合AI能够更有效地处理多组学复杂性，用于工程化气候智能、高产量作物，超越传统数据驱动方法 | 发挥全部潜力需要清晰的流程、精选的数据集和自动化平台 | 探索混合AI在合成生物学中推动农业转型的作用 | 多基因组、多性状、多环境数据以及作物工程 | 机器学习 | NA | NA | 混合AI | 多组学数据 | NA | NA | 作物 | NA | 农业 |
| 110 | 2026-05-09 |
Rewiring holobiont systems with synthetic biology
2026-May, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.09.017
PMID:41109795
|
综述 | 本文综述了合成生物学如何帮助理解和操控全生物体（宿主及其微生物群组成的复杂群落）中的相互作用 | 提出了de novo全生物设计这一新领域，整合全生物研究与合成生物学，并重点介绍了细菌生物传感器、跨王国通讯工程、表面展示及CRISPR系统等前沿技术 | 未提及具体局限性 | 探索合成生物学在解析和操控全生物体相互作用中的应用，推动生物技术新前沿 | 全生物体（宿主与微生物群）及其相互作用 | 合成生物学 | NA | 细菌生物传感器设计、跨王国通讯工程、表面展示、CRISPR系统 | NA | NA | NA | CRISPR系统 | NA | 细菌生物传感器、跨王国通讯回路 | 生物技术 |
| 111 | 2026-05-09 |
Transforming toxic element remediation: a necessary path for 21st-century food security
2026-May, Trends in plant science
IF:17.3Q1
DOI:10.1016/j.tplants.2025.10.008
PMID:41139567
|
综述论文 | 探讨利用基因编辑、合成生物学和混合技术修复有毒元素污染，以保障21世纪粮食安全 | 提出基因编辑和合成生物学等新兴技术可实现可扩展、永久性的土壤解毒和污染土地恢复，超越传统临时修复方法 | NA | 阐述新兴修复技术在应对全球有毒元素污染和保障粮食安全方面的潜力和必要性 | 有毒元素污染的土壤和农业系统 | 数字病理学 | NA | 基因编辑、合成生物学 | NA | 文本 | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN | 植物 | 修复途径、生物传感器 | 农业, 环境 |
| 112 | 2026-05-08 |
A bacterial-derived quorum-sensing platform enables dynamic metabolic control in yeast
2026-May-05, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2026.04.007
PMID:42091429
|
研究论文 | 在酿酒酵母中建立基于细菌的群体感应平台，实现对代谢途径的动态调控 | 通过改造非经典的RpaI/RpaR系统，克服了细菌群体感应在真核生物中功能化的代谢障碍，构建了低泄漏、高灵敏度、宽动态范围的工程回路，并结合CRISPR干扰模块实现了自主转录激活和抑制的双功能级联系统 | 未明确说明局限性 | 在真核微生物中建立功能性细菌群体感应系统，用于动态代谢调控以优化微生物生产 | 酿酒酵母中的代谢途径和生产菌株 | 合成生物学 | NA | 群体感应系统、CRISPR干扰 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 酿酒酵母 | 群体感应回路、双功能级联系统（包含信号放大和CRISPR干扰模块） | 工业生物技术 |
| 113 | 2026-05-08 |
Specialized proresolving mediator-loaded extracellular vesicles mitigate pulmonary inflammation
2026-May-01, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2025-0398OC
PMID:41124277
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研究论文 | 本文提出一种基于合成生物学的新策略，将促消退脂质介质装载到细胞外囊泡中，以减轻肺部炎症 | 首次利用合成生物学方法选择性装载促消退脂质介质（如resolvin D和E系列）到细胞外囊泡中，通过共表达三种生物合成酶（COX-2、5-LOX、15-LOX）实现 | 未明确提及，但可能存在规模化生产及体内递送效率的挑战 | 开发一种可扩展的装载促消退脂质介质的细胞外囊泡平台，用于治疗急性肺损伤等炎症性疾病 | 人胚胎肾293T细胞、THP-1来源的巨噬细胞、脂多糖处理的小鼠 | 合成生物学 | 急性肺损伤 | 多基因表达载体、细胞外囊泡装载技术 | NA | NA | NA | 合成生物学, 多基因表达载体 | 人胚胎肾293T细胞 | 共表达环氧化酶2、5-脂氧合酶和15-脂氧合酶的代谢通路，用于合成resolvin系列脂质介质 | 医学 |
| 114 | 2026-05-07 |
Metabolic Engineering of Aureobasidium melanogenum for Efficient Production of Gluconic Acid
2026-May-06, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c13595
PMID:42017485
|
research paper | 通过代谢工程改造出芽短梗霉菌高效生产葡萄糖酸 | 首次通过敲除普鲁兰、聚苹果酸、liamocin和黑色素关键基因并结合过表达内源葡萄糖氧化酶基因，构建出目前报道产量最高的葡萄糖酸生产菌株 | 未提及该工程菌株在工业规模化生产中的长期稳定性和经济性评估 | 高效生产葡萄糖酸 | 出芽短梗霉菌株TSYW-58 | 合成生物学 | NA | 代谢工程 | NA | NA | 一个出发菌株和多个工程菌株 | CRISPR-Cas9等基因编辑工具（未明确说明具体工具） | Aureobasidium melanogenum（出芽短梗霉） | 葡萄糖氧化酶过表达及副产物合成通路敲除 | 工业生物技术 |
| 115 | 2026-05-07 |
Multi-Targeting Non-Specific Genome Engineering in Bacteria
2026-May, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202521532
PMID:41801001
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研究论文 | 开发了一种基于多靶向整合酶系统的通用基因组工程方法MNGE，用于在多种细菌中高效整合代谢基因或途径 | 提出MNGE方法，基于多靶向整合酶系统实现多拷贝、高度随机（仅需核心TT二核苷酸）的基因整合，适用于革兰氏阳性和阴性菌，并显著提高异源宿主中化合物产量 | NA | 开发一种宿主独立的通用基因组工程方法，以高效整合和表达代谢基因或途径 | 多种细菌，包括革兰氏阳性菌（链霉菌、糖多孢菌）和革兰氏阴性菌（伯克霍尔德菌、紫色杆菌） | NA | NA | MNGE, 多靶向整合酶系统 | NA | NA | NA | NA | 链霉菌 (Streptomyces albus), 伯克霍尔德菌 (Burkholderia gladioli) | 代谢途径整合 | 代谢工程，合成生物学，工业生物技术 |
| 116 | 2026-05-06 |
Gibson Assembly of Highly Repetitive DNA
2026-May-05, Biochemistry
IF:2.9Q3
DOI:10.1021/acs.biochem.6c00002
PMID:42021475
|
研究论文 | 报道了一种基于Gibson组装的模块化质粒框架，用于可扩展和序列定义地组装高度重复DNA，并以弹性蛋白样多肽为模型验证其有效性 | 提出了一种通过Gibson消化与组装工作流实现迭代重复扩增的模块化质粒框架，能够高效构建大片段重复DNA序列，并通过全质粒测序验证序列完整性 | 仅以特定重复序列（GVGVP）为模型，未测试其他类型重复序列的适用性；表征限于NEB 5-alpha细胞，未评估在更复杂宿主中的表达效果 | 开发一种通用策略用于合成高度重复DNA序列，并编码可编程蛋白质聚合物 | 编码五肽Gly-Val-Gly-Val-Pro重复序列的弹性蛋白样多肽（ELP）质粒 | 合成生物学 | NA | Gibson组装、DNA消化与组装、全质粒测序 | NA | DNA序列数据 | 构建了最大513个GVGVP重复的质粒，并表征了257个重复的功能 | Gibson Assembly | 大肠杆菌NEB 5-alpha细胞 | 迭代重复扩增的质粒架构（通过dIII和HI消化及Gibson组装实现） | 生物技术、材料科学 |
| 117 | 2026-05-05 |
Deep learning architectures achieve state-of-the-art (SOTA) accuracy in protein secondary structure prediction
2026-May-03, Molecular diversity
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s11030-026-11570-x
PMID:42071121
|
综述 | 本文综述了深度学习架构在蛋白质二级结构预测中达到最先进精度的最新进展 | 系统总结了混合模型设计、基准数据集和评估指标的最新进展，并讨论了未来方向如跨物种验证、不确定性感知建模和异构生物数据整合 | 当前方法存在数据依赖性和数据集偏差问题 | 综述深度学习在蛋白质二级结构预测领域的进展并指出未来方向 | 蛋白质二级结构预测方法 | 深度学习 | NA | NA | CNN, RNN, Transformer, AlphaFold2 | 蛋白质序列数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学, 药物开发, 疾病研究 |
| 118 | 2026-05-04 |
The tryptophan prenyltransferase ComQ from Bacillus subtilis 168 can prenylate daptomycin at Trp1
2026-May-02, The FEBS journal
DOI:10.1111/febs.70578
PMID:42068243
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研究论文 | 本研究首次证明来自枯草芽孢杆菌168的色氨酸异戊二烯转移酶ComQ能够异戊二烯化环状抗菌肽达托霉素，显示出其作为合成生物学工具的潜力 | 首次发现ComQ不仅修饰线性肽，还能异戊二烯化环状肽，扩大了底物范围，为生物活性化合物的生物合成工程提供了新工具 | 未提及体内应用或工程化ComQ变体的具体效果 | 探究ComQ作为合成生物学工具异戊二烯化环状抗菌肽的可行性 | 枯草芽孢杆菌168的异戊二烯转移酶ComQ及其底物ComX和信息素和达托霉素 | 合成生物学 | NA | 克隆、蛋白纯化、AlphaFold建模 | AlphaFold | 蛋白质结构 | NA | NA | 大肠杆菌 | NA | 医学、工业生物技术 |
| 119 | 2026-05-03 |
Advances and opportunities for computational interrogation of plant proteins
2026-May, The Plant journal : for cell and molecular biology
DOI:10.1111/tpj.70899
PMID:42055456
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综述 | 综述了计算分析方法在植物蛋白质研究中的进展与机遇 | 强调了计算工具在加速植物蛋白质功能发现方面的潜力，并整合了新兴方法与传统实验手段的优势 | 植物内研究仍受限于遗传转化方法的可用性和效率 | 推动计算与实验结合，以克服植物蛋白质研究瓶颈，促进农业、生态和气候韧性进展 | 植物蛋白质 | 机器学习 | NA | 蛋白质结构预测、动力学模拟、相互作用分析 | NA | 蛋白质序列、结构数据 | NA | NA | 植物 | NA | 农业, 生态, 气候韧性 |
| 120 | 2026-03-09 |
Recent advances in computer-aided engineering of microbial synthesis and nutritional functions of fucosylated oligosaccharides
2026 May-Jun, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108849
PMID:41740692
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综述 | 本文综述了岩藻糖基化寡糖的微生物合成进展，重点介绍了计算机辅助工程在提高产量和工业应用中的作用 | 结合生物信息学与合成生物学方法，实现岩藻糖基化寡糖的精确和可扩展生产 | NA | 探讨岩藻糖基化寡糖的微生物合成策略及其计算机辅助生产的潜力 | 岩藻糖基化寡糖 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、代谢工程、生物信息学、虚拟筛选 | NA | NA | NA | 合成生物学方法 | 工程微生物菌株 | 代谢途径工程，包括提高岩藻糖基转移酶活性和供应GDP-岩藻糖前体 | 医药、食品 |