合成生物学相关文章
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当前共找到 150 篇文献，本页显示第 101 - 120 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2026-05-17 |
Abiotic Stress Sensing in Plants: Biochemical and Biophysical Basis
2026-May-14, Molecular plant
IF:17.1Q1
DOI:10.1016/j.molp.2026.05.007
PMID:42141723
|
综述 | 综述植物感知非生物胁迫的生化和生物物理机制，并讨论主要未解决问题和新兴研究方法 | 系统整合温度、干旱、盐碱、洪涝及土壤压实等多种胁迫的感知机制，强调生物物理过程与化学信号编码的逻辑，并引入AI建模、单细胞技术等前沿方法 | 未明确定量描述各感知机制的相对贡献，缺乏在单细胞或全株水平上空间组织的实验证据 | 阐明植物将环境胁迫从物理化学信号转化为生物信号的分子逻辑 | 植物（模式植物及农作物）中感知多种非生物胁迫的分子机制 | 植物生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, 合成生物学 | 植物 | NA | 农业 |
| 102 | 2026-05-17 |
TargetGAN: A generative AI framework for the design of plant core promoters with targeted activity
2026-May-11, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2026.101851
PMID:41981910
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研究论文 | 提出TargetGAN，一个基于生成对抗网络和预训练活性预测器的深度学习框架，用于设计具有目标活性的植物核心启动子 | 首次将GAN与活性预测器结合，实现用户自定义活性的植物核心启动子从头设计，并发现合成启动子可超越天然启动子的活性上限 | 预测活性与实验活性仅为中等相关性，且STARR-seq验证后只有约55%的合成启动子成功表征 | 开发一个能够设计具有目标活性的植物核心启动子的通用框架 | 植物核心启动子的设计和功能验证 | 机器学习 | NA | STARR-seq，荧光素酶报告基因检测，深度测序 | 生成对抗网络 (GAN) 和预训练活性预测器 | DNA序列 | 训练集包含76,851个天然启动子；生成了55,296个合成启动子，其中5,250个用于高通量功能验证，2,909个成功表征 | NA | 植物（拟南芥原生质体用于STARR-seq验证） | 植物核心启动子设计（包含激活基序的精确排列） | 农业，合成生物学 |
| 103 | 2026-05-17 |
Growth versus decline: root aging and plant performance
2026-May-05, The Plant cell
DOI:10.1093/plcell/koag115
PMID:41990352
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综述 | 综述根老化对植物生长的影响及延迟根老化的潜在策略 | 首次从概念上桥接根系生长调节与根老化过程，并提出利用遗传学和合成生物学方法延迟根老化以提升作物生产力 | 由于技术挑战，对老根采样和分析的研究有限 | 探讨根老化机制及其对植物生长的影响，并评估延迟根老化的策略在提高作物产量和应对气候变化中的潜力 | 根系 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学方法 | 植物 | 延迟根老化或再激活老根生长的遗传和合成生物学回路 | 农业, 环境 |
| 104 | 2026-05-17 |
RNA Aptamers and Epitranscriptomics: Charting Unexplored Territories in RNA Biology
2026-May, Molecular diagnosis & therapy
IF:4.1Q1
DOI:10.1007/s40291-026-00841-w
PMID:41838348
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评论文章 | 探讨RNA适配体与表观转录组学在RNA生物学中的交叉领域及其潜在应用 | 首次系统性地提出RNA适配体与表观转录组学之间的相互作用，包括RNA修饰如何影响适配体折叠或结合，以及适配体如何用于检测或调节表观转录组状态 | 这两个领域之间的直接调控联系尚未完全阐明，内容主要基于概念性探讨而非实验验证 | 激发RNA适配体和表观转录组学领域之间的跨学科讨论，并吸引对这些交叉领域进行未来研究 | RNA适配体和表观转录组学修饰（如N6-甲基腺苷、假尿苷和5-甲基胞嘧啶） | 分子生物学, 合成生物学 | NA | SELEX | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学, 诊断, 合成生物学 |
| 105 | 2026-05-16 |
Plant Synthetic Biology Takes Off: Bryophytes Onboard with New Tools, Systems, and Opportunities
2026-05-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00092
PMID:41984537
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综述 | 本文综述了苔藓植物在植物合成生物学作为新型工具、系统和机遇平台的最新进展 | 强调苔藓植物作为替代实验平台可弥补被子植物系统复杂性限制，推动跨植物谱系的通用和协同生物工程方法建立 | 未明确提及具体限制 | 突出苔藓植物作为植物合成生物学系统的重要性，并讨论其技术发展与应用前景 | 苔藓植物（包括藓类、角苔类和地钱类），特别是作为主要模型的物种 | NA | NA | 模块化克隆、基因回路、基因组编辑、合成基因组学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 苔藓植物（藓类、角苔类、地钱类） | 基因回路 | 农业, 工业生物技术 |
| 106 | 2026-05-16 |
Engineering Rapamycin-Induced Dimerization for Control of Gene Expression in Plants
2026-05-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00125
PMID:41990133
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研究论文 | 开发了一种雷帕霉素诱导的FKBP-FRB分裂转录因子系统，用于植物中基因表达的精确控制 | 通过系统优化多种DNA结合域、FRB重复序列和启动子架构，将诱导倍数提升至87倍，且诱导表达水平超过2×CaMV35S组成型启动子；雷帕霉素可通过简单喷洒或土壤施用实现控制 | 研究提及现有化学诱导系统的局限性，但未明确阐述本系统在非目标植物或环境中的潜在风险如持久性 | 实现植物基因表达的时间、空间和定量精确控制，替代现有诱导系统缺陷 | 植物（具体物种未明述，但数据表型涉及叶、土壤施用等通用植物模型） | 合成生物学 | NA | 雷帕霉素诱导系统、分裂转录因子系统 | NA | 基因表达数据、应用方法数据 | NA | NA | 植物（具体物种未明述） | 雷帕霉素诱导的二聚化分裂转录因子系统；包含hFRB-结合域和hFKBP12-转录激活域的回路设计 | 农业、生物技术 |
| 107 | 2026-05-16 |
Construction and Application of a Multicolor Bactosensor for Detecting Bioavailable Antibiotic Mixtures in the Environment
2026-05-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00891
PMID:42027138
|
研究论文 | 构建了一种多色细菌传感器，用于同时检测环境中的四环素和红霉素 | 首次将两个基于转录因子的传感模块整合到一个质粒中，并通过引入抗生素抗性基因提升性能，实现了通过智能手机图像颜色差异定量区分二元抗生素混合物 | 主要针对两种抗生素的检测，对于更复杂混合物的适用性未在论文中明确讨论 | 开发一种可现场部署的细菌传感器，用于环境中抗生素混合物的定量检测 | 四环素和红霉素 | NA | NA | 合成生物学、荧光传感 | NA | 图像 | 真实水样（未明确数量） | NA | 大肠杆菌 | 多色细菌传感器，包含基于转录因子的四环素和红霉素传感模块 | 环境监测 |
| 108 | 2026-05-16 |
Metabolic Engineering of Bacillus subtilis for High-Level Production of Salidroside from Potato Starch
2026-05-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00803
PMID:42048483
|
研究论文 | 通过代谢工程手段，在枯草芽孢杆菌中利用马铃薯淀粉高效生产红景天苷 | 首次在枯草芽孢杆菌中引入芳香醛合酶合成酪醇，结合群体感应动态调控系统优化红景天苷生产，并利用马铃薯淀粉作为碳源实现高效发酵 | 目前仅在摇瓶发酵水平实现生产，未提及工业规模放大及成本分析 | 开发可持续的红景天苷生产方法，推动天然产物生物合成的工业化应用 | 枯草芽孢杆菌工程菌株 | 代谢工程 | NA | 代谢工程、发酵工程 | NA | 实验数据 | 工程菌株BS18及其他中间菌株 | NA | 枯草芽孢杆菌 | 异源芳香醛合酶合成酪醇途径、内源醇脱氢酶筛选、群体感应动态调控系统、磷酸葡萄糖变位酶和UDP-葡萄糖焦磷酸化酶过表达 | 生物医药，化妆品，工业生物技术 |
| 109 | 2026-05-16 |
A Streamlined and High-Osmolarity Bacillus subtilis Cell-Free Platform for Rapid Characterization of Genetic Regulatory Elements
2026-05-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00165
PMID:42052911
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研究论文 | 建立了一种简化且高渗透压的枯草芽孢杆菌无细胞平台，用于快速表征遗传调控元件 | 系统重新评估了传统的提取制备和反应环境，省略了常规所需的流出培养和透析步骤，并通过将钾谷氨酸浓度提高至400 mM并添加渗透保护剂甜菜碱，显著增强了翻译能力 | 未提及具体局限性 | 开发一种简化的枯草芽孢杆菌无细胞系统，用于快速表征遗传调控元件 | 枯草芽孢杆菌无细胞系统中的遗传调控元件 | 合成生物学 | NA | 无细胞蛋白质合成 | NA | NA | NA | NA | 枯草芽孢杆菌 | 遗传调控元件，包括启动子强度分析和catabolite抑制子CcpA介导的阻遏 | 合成生物学、工业生物技术 |
| 110 | 2026-05-16 |
Multiplexed Engineering of Salmonella Typhimurium for Targeted Cancer Therapies
2026-05-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00119
PMID:42085230
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综述 | 提出一个系统性工程框架，用于将鼠伤寒沙门氏菌改造为有效的抗癌活体生物治疗产品 | 提出了一个多模块协同工程框架，涵盖菌株减毒、靶向增强、定植优化、治疗生产、裂解控制释放和辅助模块，将鼠伤寒沙门氏菌从病原体转化为抗肿瘤载体 | 工程化鼠伤寒沙门氏菌在遗传稳定性和临床转化方面存在挑战和瓶颈 | 总结通过合成生物学方法工程化鼠伤寒沙门氏菌用于靶向癌症治疗的关键方法，并推动其临床应用 | 鼠伤寒沙门氏菌 | 合成生物学 | 癌症 | 合成生物学重组 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Golden Gate Assembly | 鼠伤寒沙门氏菌 | 多模块协同工程回路，包括减毒回路、靶向增强回路、定植优化回路、治疗生产回路、裂解控制释放回路和辅助模块 | 医学 |
| 111 | 2026-05-16 |
Modeling of Conjugative- and Phage- Mediated CRISPR-based System against Antimicrobial Resistant Bacteria
2026-May-14, IEEE transactions on bio-medical engineering
DOI:10.1109/TBME.2026.3693402
PMID:42133510
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研究论文 | 利用系统生物学方法建立数学模型，模拟结合型和噬菌体介导的CRISPR系统对抗抗菌耐药细菌的动态过程 | 通过数学建模整合突变效应和传递系统动力学，比较了工程化益生菌和噬菌体在CRISPR切割与CRISPR干扰两种抗菌执行器中的表现，为合成生物学抗耐药策略提供了定量优化框架 | 模型基于数学假设，未在真实生物系统中验证；参数简化可能忽略宿主免疫反应等复杂生物学因素 | 评估工程化结合型益生菌和噬菌体通过CRISPR系统沉默耐药基因或直接切割基因组来对抗抗菌耐药细菌的潜力 | 耐药细菌、工程化益生菌和工程化噬菌体组成的递送系统及抗菌执行器（CRISPR切割与CRISPR干扰） | 系统生物学 | 抗菌耐药感染 | 数学建模 | 动力学模型 | 模拟数据 | NA | CRISPR-Cas9, CRISPR干扰 | 益生菌, 噬菌体 | CRISPR基因编辑和基因沉默回路 | 医学 |
| 112 | 2026-05-16 |
Understanding Cell Wall Enzyme Function: From Classical Approaches to New Biotechnology
2026-May-14, Journal of experimental botany
IF:5.6Q1
DOI:10.1093/jxb/erag227
PMID:42135035
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综述 | 综述了植物细胞壁相关碳水化合物活性酶的功能研究方法，从经典技术到合成生物学和人工智能等新兴工具 | 整合了经典生化与遗传方法以及高通量筛选、无细胞系统、微生物宿主、植物平台和CRISPR/Cas9等合成生物学工具，并强调了AI蛋白质模型和实验室自动化的潜力 | 未提及具体实验结果或定量比较不同方法的效率 | 提供研究植物细胞壁相关CAZymes功能的策略概述，以推动食品、生物能源和生物产品应用 | 植物细胞壁中碳水化合物活性酶 | 合成生物学 | NA | 高通量筛选，无细胞系统，CRISPR/Cas9基因组编辑，碱基编辑，AI蛋白质模型 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9，碱基编辑 | 微生物宿主，植物 | NA | 食品，生物能源，生物产品，材料 |
| 113 | 2026-05-16 |
Harnessing biosynthetic logic for next-generation ADC payloads
2026-May-12, Chemical Society reviews
IF:40.4Q1
DOI:10.1039/d5cs01487e
PMID:42015662
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综述 | 本文综述了基于生物合成逻辑开发新一代抗体药物偶联物（ADC）载药的研究进展 | 通过基因组挖掘和合成生物学方法揭示临床载药的生物合成基因簇和酶学逻辑，拓展载药化学空间，并讨论非毒素模式以补充传统细胞毒素 | 未明确说明该领域的当前挑战或未来研究的具体局限性 | 总结临床载药的发现、生物合成和生产进展，利用生物合成知识推动更安全、高效和机制复杂的ADC疗法 | 抗体药物偶联物及其载药 | 合成生物学 | 肿瘤 | 基因组挖掘、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 114 | 2026-05-16 |
Recent advances in decoding biosynthetic pathways and synthetic biology approaches for plant alkaloids
2026-May-12, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d5np00089k
PMID:42132682
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综述 | 综述2018至2025年间植物生物碱生物合成途径解析与合成生物学方法的最新进展 | 对主要类别的代表性植物生物碱的途径解析挑战（立体化学控制、重要环化、定制修饰）及长途径解码创新方法进行系统总结，并讨论合成生物学与代谢工程策略在微生物高效生产中的应用 | 未具体说明局限性，但该领域对特定酶催化步骤和途径完整性的理解仍存在挑战 | 促进植物生物碱功能基因表征、合成生物系统开发、产量优化和药物创新，加速高价值植物生物碱的发现和规模化生产 | 单萜吲哚生物碱、四氢异喹啉生物碱、托品烷生物碱等主要类别的代表性植物生物碱 | NA | NA | 合成生物学, 代谢工程, 微生物生产 | NA | NA | NA | NA | 微生物（大肠杆菌、酵母等） | 生物合成途径重构 | 药学, 药物发现, 可持续生产 |
| 115 | 2026-05-15 |
Base modifications shift tertiary structure and activity in synthetic RNA origami and a natural ribozyme
2026-May-13, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-72891-x
PMID:42128887
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研究论文 | 研究碱基修饰对合成RNA折纸纳米结构和天然四膜虫核酶的三级结构折叠及功能的影响 | 首次揭示5-甲基胞嘧啶和N1-甲基假尿苷等碱基修饰通过影响碱基堆积能量而非碱基配对，改变RNA折叠景观和结构-功能关系，对合成生物学和治疗用RNA设计具有指导意义 | 未探讨其他碱基修饰类型或更高阶结构对RNA折叠的影响，且实验温度依赖性机制尚需进一步验证 | 阐明碱基修饰对RNA三级结构折叠和功能的影响机制 | 合成RNA折纸纳米结构和天然四膜虫核酶 | 合成生物学，结构生物学 | NA | 低温电子显微镜（cryo-EM），荧光共振能量转移（FRET），生化分析 | NA | 图像，荧光数据，生化数据 | NA | NA | NA | NA | 医学，合成生物学 |
| 116 | 2026-05-15 |
Recombinant Protein Drugs: A 2025 Update
2026-May-13, BioDrugs : clinical immunotherapeutics, biopharmaceuticals and gene therapy
IF:5.4Q1
DOI:10.1007/s40259-026-00783-z
PMID:42129013
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综述 | 本文对2025年重组蛋白药物领域进行综述，整合了生产平台、蛋白质工程和监管科学的进展 | 强调蛋白质从替代疗法向多功能治疗平台的转变，涵盖下一代蛋白格式如双特异性抗体、纳米抗体和自组装生物材料 | 未提及具体临床失败案例或新兴技术的潜在风险 | 更新重组蛋白药物的现状，并概述塑造下一代生物制剂的技术 | 重组蛋白药物及其生产平台、工程策略和监管框架 | 机器学习 | 肿瘤、炎症、代谢性疾病 | 重组蛋白生产 | NA | 文本 | NA | NA | 微生物菌株、哺乳动物细胞、植物平台 | 双特异性抗体、纳米抗体、融合蛋白、自组装生物材料 | 医学 |
| 117 | 2026-05-12 |
Epigenome regulators imbue a single eukaryotic promoter with diverse gene expression dynamics
2026-May-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2026.115805
PMID:42111206
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研究论文 | 通过筛选80种染色质相关蛋白，研究单个真核启动子如何产生多样的基因表达动态 | 首次揭示单个基因可驱动丰富多样的动态表达谱，并建立了三状态启动子动力学模型 | 研究仅在酵母中进行，可能无法直接推广到其他真核生物 | 探索单个真核启动子产生多样基因表达动态的机制 | 酿酒酵母中的染色质相关蛋白 | 机器学习 | NA | 活细胞显微成像 | 动力学模型 | 图像， 时间序列数据 | 80种染色质相关蛋白在单细胞水平进行分析 | NA | 酿酒酵母 | NA | 合成生物学 |
| 118 | 2026-05-12 |
Synthesis of Amines for Active Pharmaceutical Ingredients Using the Whole-Cell Factory Saccharomyces Cerevisae
2026-May-14, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.202500898
PMID:42107106
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综述 | 该综述总结了利用全细胞工厂酿酒酵母合成活性药物成分中胺类化合物的最新进展 | 系统总结了代谢工程和基因工程策略，包括基因组编辑、基因表达优化和代谢通路平衡，以克服酶基因表达、辅因子再生和前体通道化等瓶颈 | 当前挑战包括系统生物学和合成生物学工具的整合，以实现酿酒酵母作为工业胺生产可扩展平台的目标 | 回顾酿酒酵母在胺类生物催化中的工程化策略，并展望其工业应用前景 | 酿酒酵母工程菌株及其合成的胺类、氨基醇、氨基酸和复杂生物碱化合物 | 合成生物学 | NA | 代谢工程, 基因工程, 基因组编辑 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly | 酿酒酵母 | 代谢通路 | 医药, 工业生物技术 |
| 119 | 2026-05-12 |
Genome Position Does Not Impact Transgene Expression Efficiency in the Ancient Red Alga Cyanidioschyzon merolae
2026-May-08, New biotechnology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.nbt.2026.05.004
PMID:42107704
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研究论文 | 本研究在古老红藻 Cyanidioschyzon merolae 中验证了基因组位置不影响转基因表达效率 | 首次在 C. merolae 中建立并验证了一组中性整合位点，证明基因组位置对转基因表达影响极小，并开发了高通量转化协议 | 未提及明显的局限性 | 系统研究基因组位置对转基因表达的影响，并为 C. merolae 开发可扩展的核基因组工程框架 | Cyanidioschyzon merolae（古老红藻） | 合成生物学 | NA | 同源重组、机器人辅助转化、生物信息学分析、气相色谱分析 | NA | 基因表达数据、代谢产物数据 | 40个候选中性位点（分布于16条染色体），其中38个通过转化验证 | 同源重组 | Cyanidioschyzon merolae | 异源异戊二烯合酶表达通路 | 工业生物技术 |
| 120 | 2026-05-12 |
Advances in anthocyanins: Chemical foundations, synthetic biology, molecular mechanisms, physicochemical properties, and applications in the food industry
2026-May, Food chemistry: X
DOI:10.1016/j.fochx.2026.103938
PMID:42111325
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综述 | 综述花青素从化学合成到食品工业应用的最新进展，重点关注结构修饰、生物合成机制和食品化学挑战 | 整合了化学、合成生物学、机制研究和应用领域知识，强调AI辅助设计和高通量工程在解决生产效率和稳定性瓶颈中的作用 | 研究在化学、合成、机制和应用领域仍然分散，阻碍了功能性食品、智能材料和个性化健康的整合发展 | 总结花青素化学、生物合成、健康机制和工业应用，特别关注食品相关限制如pH驱动降解、抗坏血酸诱导氧化还原反应和蛋白质-多酚相互作用 | 花青素的结构工程、合成生物学生产和食品配方挑战 | 数字病理学 | NA | 合成生物学 | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 食品 |