合成生物学相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['synthetic biology']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价9.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 150 篇文献，本页显示第 121 - 140 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 121 | 2026-05-11 |
Meta-analysis of fruit waste-derived single-cell protein for programmable nutrition via synthetic biology in sustainable food systems
2026-May-09, NPJ science of food
IF:6.3Q1
DOI:10.1038/s41538-026-00850-3
PMID:42106370
|
meta-analysis | 通过荟萃分析系统评估水果废弃物来源的单细胞蛋白在可持续食品系统中的生产潜力，并探讨合成生物学在可编程营养中的应用 | 首次通过荟萃分析整合水果废弃物单细胞蛋白生产数据，结合合成生物学框架提出可编程营养系统概念 | 工程菌株验证缺乏水果废渣直接数据，人类临床或体内数据缺失，底物异质性和高能耗预处理影响结果泛化 | 评估水果废弃物单细胞蛋白作为可持续蛋白质替代品的潜力，并探索合成生物学在优化营养方面的应用 | 水果加工残渣及微生物单细胞蛋白生产系统 | 机器学习 | NA | meta分析 | NA | NA | 来源多个同行评审研究的生物量0.24-37.40克/升和蛋白质含量20.58-54.74%数据 | NA | 多种微生物平台 | NA | 食品, 环境, 农业 |
| 122 | 2026-05-11 |
Genetic basis of phytoalexin-mediated chemical defense in plants
2026-May-08, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2026.04.021
PMID:42105761
|
研究论文 | 该文章揭示了植物中基于植物抗毒素的化学防御机制的遗传基础 | 首次阐明了debneyol的完整生物合成途径及其关键调控因子MCD1，并证明了MCD1能增强酶活性从而提升植物对多种病原体的抗性 | 未涉及MCD1在非模型植物中的适用性或大规模田间验证 | 解析植物抗毒素介导的化学防御的遗传机制 | 烟草等植物中的debneyol生物合成途径及其调控因子 | 分子生物学 | 植物病害 | 生物合成途径分析 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 植物（烟草等） | NA | 农业，生物技术 |
| 123 | 2026-05-11 |
Plant formins pave the way for endosymbiosis
2026-May-08, Trends in plant science
IF:17.3Q1
DOI:10.1016/j.tplants.2026.04.017
PMID:42106252
|
研究论文 | 本文揭示了formin蛋白在豆科植物根瘤菌侵染和多种植物菌根共生中协调细胞骨架重排的机制 | 发现单个formin蛋白能同时协调根瘤菌侵染和菌根形成两种不同的内共生过程，为工程化微生物进入作物提供新靶点 | 未提供具体实验数据或工程应用验证，仅基于Qiao等人研究进行概念阐述 | 阐明植物formin蛋白在有益微生物内共生中的核心作用机制 | 豆科植物和多种植物的根细胞，涉及根瘤菌和丛枝菌根真菌 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 豆科植物、多种植物 | 内共生信号通路调控模块（formin介导的细胞骨架重排途径） | 农业, 合成生物学 |
| 124 | 2026-05-10 |
Profiling Selectivity for the Shigella Virulence Factor OspF
2026-May-05, Biochemistry
IF:2.9Q3
DOI:10.1021/acs.biochem.6c00109
PMID:42018782
|
研究论文 | 本研究通过合成磷酸肽和化学蛋白质组学方法，探究了志贺氏菌毒力因子OspF的底物选择性，发现其不仅能修饰MAPK家族蛋白，还能作用于多种细胞靶标 | 首次揭示OspF对MAPK家族内部的底物选择性，并发现其修饰范围远超MAPK家族，包括Rab1A和酪蛋白激酶2β等新靶标 | 未完全阐明OspF在志贺氏菌感染中的全部功能角色，需要进一步研究 | 研究志贺氏菌毒力因子OspF的底物选择性及其在宿主细胞中的修饰靶标 | 志贺氏菌分泌的磷酸苏氨酸裂合酶OspF | 微生物学, 化学生物学 | 细菌感染性疾病 | 合成磷酸肽分析, 化学蛋白质组学, 亲核膦化学探针 | NA | 蛋白质组数据 | 细胞裂解液样本和志贺氏菌感染样本 | NA | 志贺氏菌, 宿主细胞（被感染细胞） | NA | 医学, 化学生物学, 合成生物学 |
| 125 | 2026-05-07 |
Followers' Choice: The Trends Transforming Precision Medicine, Synthetic Biology, and Sustainable Microbiology
2026-May, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.70370
PMID:42087404
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 126 | 2026-05-09 |
Reprogramming probiotic for uric acid modular degradation and hyperuricemia treatment by synthetic biology regulation
2026-May-07, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-026-03022-w
PMID:42098719
|
研究论文 | 通过合成生物学调控构建重组益生菌株，实现对尿酸的模块化降解，并用于高尿酸血症治疗 | 创新性地通过调节不同强度的核糖体结合位点实现尿酸降解模块的优化，并过表达尿酸转运蛋白和过氧化氢降解酶以提高降解效率 | 研究主要基于小鼠模型，临床转化尚需进一步验证 | 开发安全有效的微生物策略用于高尿酸血症治疗 | 工程化大肠杆菌Nissle 1917菌株及其对高尿酸血症小鼠模型的治疗作用 | 机器学 | 高尿酸血症 | 合成生物学 | NA | 基因序列 | 小鼠模型 | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌Nissle 1917 | 尿酸降解模块 | 医学 |
| 127 | 2026-05-09 |
Hybrid AI in synthetic biology: next era in agriculture
2026-May, Trends in plant science
IF:17.3Q1
DOI:10.1016/j.tplants.2025.08.011
PMID:40930858
|
研究论文 | 文章讨论混合人工智能在合成生物学中应用于农业的潜力 | 提出混合AI能够更有效地处理多组学复杂性，用于工程化气候智能、高产量作物，超越传统数据驱动方法 | 发挥全部潜力需要清晰的流程、精选的数据集和自动化平台 | 探索混合AI在合成生物学中推动农业转型的作用 | 多基因组、多性状、多环境数据以及作物工程 | 机器学习 | NA | NA | 混合AI | 多组学数据 | NA | NA | 作物 | NA | 农业 |
| 128 | 2026-05-09 |
Rewiring holobiont systems with synthetic biology
2026-May, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.09.017
PMID:41109795
|
综述 | 本文综述了合成生物学如何帮助理解和操控全生物体（宿主及其微生物群组成的复杂群落）中的相互作用 | 提出了de novo全生物设计这一新领域，整合全生物研究与合成生物学，并重点介绍了细菌生物传感器、跨王国通讯工程、表面展示及CRISPR系统等前沿技术 | 未提及具体局限性 | 探索合成生物学在解析和操控全生物体相互作用中的应用，推动生物技术新前沿 | 全生物体（宿主与微生物群）及其相互作用 | 合成生物学 | NA | 细菌生物传感器设计、跨王国通讯工程、表面展示、CRISPR系统 | NA | NA | NA | CRISPR系统 | NA | 细菌生物传感器、跨王国通讯回路 | 生物技术 |
| 129 | 2026-05-09 |
Transforming toxic element remediation: a necessary path for 21st-century food security
2026-May, Trends in plant science
IF:17.3Q1
DOI:10.1016/j.tplants.2025.10.008
PMID:41139567
|
综述论文 | 探讨利用基因编辑、合成生物学和混合技术修复有毒元素污染，以保障21世纪粮食安全 | 提出基因编辑和合成生物学等新兴技术可实现可扩展、永久性的土壤解毒和污染土地恢复，超越传统临时修复方法 | NA | 阐述新兴修复技术在应对全球有毒元素污染和保障粮食安全方面的潜力和必要性 | 有毒元素污染的土壤和农业系统 | 数字病理学 | NA | 基因编辑、合成生物学 | NA | 文本 | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN | 植物 | 修复途径、生物传感器 | 农业, 环境 |
| 130 | 2026-05-08 |
Peptide-Ligand Cooperative Interplay Drives Gold Nanoparticle Encapsulation by Protein Cages
2026-May-07, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.73690
PMID:42093323
|
研究论文 | 揭示多肽与配体协同作用驱动金纳米颗粒被蛋白质笼包裹的分子机制 | 通过实验与分子动力学模拟相结合，首次揭示了盐浓度、配体和肽段协同控制金纳米颗粒在包裹蛋白笼中包裹的分子尺度自由能景观，阐明了包裹鲁棒性的分子基础 | NA | 理解金纳米颗粒在包裹蛋白笼中包裹的分子机制，指导生物启发纳米笼的理性设计 | 包裹蛋白笼和金纳米颗粒 | 合成生物学、生物催化、治疗递送 | NA | 分子动力学模拟 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学、生物催化、治疗递送 |
| 131 | 2026-05-08 |
Engineering an Optogenetic pH-Modulator in Bacteria
2026-May-07, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202524319
PMID:42095488
|
研究论文 | 在细菌中工程化一种光遗传pH调节器，实现细胞外pH的动态可逆切换 | 首次在合成生物学中实现光诱导的微生物pH双向调控系统，结合基因电路、降解标签和环境优化实现长期稳定运行 | 系统在非典型实验室环境中的性能尚需验证，pH调节范围可能受限于细菌代谢特性 | 工程化一种能自动切换细胞外高/低pH状态的微生物系统 | 大肠杆菌工程菌株 | 合成生物学 | NA | 光遗传学调控 | NA | NA | NA | NA | 大肠杆菌 | 光诱导启动子控制脲酶表达的基因回路，结合脲酶降解标签 | 工业生物技术, 环境保护 |
| 132 | 2026-05-08 |
A bacterial-derived quorum-sensing platform enables dynamic metabolic control in yeast
2026-May-05, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2026.04.007
PMID:42091429
|
研究论文 | 在酿酒酵母中建立基于细菌的群体感应平台，实现对代谢途径的动态调控 | 通过改造非经典的RpaI/RpaR系统，克服了细菌群体感应在真核生物中功能化的代谢障碍，构建了低泄漏、高灵敏度、宽动态范围的工程回路，并结合CRISPR干扰模块实现了自主转录激活和抑制的双功能级联系统 | 未明确说明局限性 | 在真核微生物中建立功能性细菌群体感应系统，用于动态代谢调控以优化微生物生产 | 酿酒酵母中的代谢途径和生产菌株 | 合成生物学 | NA | 群体感应系统、CRISPR干扰 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 酿酒酵母 | 群体感应回路、双功能级联系统（包含信号放大和CRISPR干扰模块） | 工业生物技术 |
| 133 | 2026-05-08 |
Specialized proresolving mediator-loaded extracellular vesicles mitigate pulmonary inflammation
2026-May-01, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2025-0398OC
PMID:41124277
|
研究论文 | 本文提出一种基于合成生物学的新策略，将促消退脂质介质装载到细胞外囊泡中，以减轻肺部炎症 | 首次利用合成生物学方法选择性装载促消退脂质介质（如resolvin D和E系列）到细胞外囊泡中，通过共表达三种生物合成酶（COX-2、5-LOX、15-LOX）实现 | 未明确提及，但可能存在规模化生产及体内递送效率的挑战 | 开发一种可扩展的装载促消退脂质介质的细胞外囊泡平台，用于治疗急性肺损伤等炎症性疾病 | 人胚胎肾293T细胞、THP-1来源的巨噬细胞、脂多糖处理的小鼠 | 合成生物学 | 急性肺损伤 | 多基因表达载体、细胞外囊泡装载技术 | NA | NA | NA | 合成生物学, 多基因表达载体 | 人胚胎肾293T细胞 | 共表达环氧化酶2、5-脂氧合酶和15-脂氧合酶的代谢通路，用于合成resolvin系列脂质介质 | 医学 |
| 134 | 2026-05-07 |
Metabolic Engineering of Aureobasidium melanogenum for Efficient Production of Gluconic Acid
2026-May-06, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c13595
PMID:42017485
|
research paper | 通过代谢工程改造出芽短梗霉菌高效生产葡萄糖酸 | 首次通过敲除普鲁兰、聚苹果酸、liamocin和黑色素关键基因并结合过表达内源葡萄糖氧化酶基因，构建出目前报道产量最高的葡萄糖酸生产菌株 | 未提及该工程菌株在工业规模化生产中的长期稳定性和经济性评估 | 高效生产葡萄糖酸 | 出芽短梗霉菌株TSYW-58 | 合成生物学 | NA | 代谢工程 | NA | NA | 一个出发菌株和多个工程菌株 | CRISPR-Cas9等基因编辑工具（未明确说明具体工具） | Aureobasidium melanogenum（出芽短梗霉） | 葡萄糖氧化酶过表达及副产物合成通路敲除 | 工业生物技术 |
| 135 | 2026-05-07 |
Optimizing Bispecific Antibody Expression via Multi-Omics Analysis and Vector Redesign
2026-May-06, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.70228
PMID:42089360
|
研究论文 | 通过多组学分析和载体重设计优化双特异性抗体的表达 | 提出了整合序列级生物信息学和合成生物学诊断的方法，直接提高了复杂生物制品的可制造性，为解决隐蔽表达缺陷提供通用框架 | NA | 解决双特异性抗体在中国仓鼠卵巢细胞中表达效率低的问题 | 三种IgG-scFv格式的双特异性抗体 | 机器学习 | NA | RNA测序、剪接预测、密码子优化评估、基序筛选 | NA | 文本、序列数据 | 三种双特异性抗体候选物 | NA | 中国仓鼠卵巢细胞 | NA | 医学 |
| 136 | 2026-05-07 |
Genetic code expansion: Bridging synthetic biology precision and cellular complexity to decipher molecular mechanisms of diseases
2026-May-04, Current opinion in chemical biology
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.cbpa.2026.102690
PMID:42085977
|
综述 | 本文概述了遗传密码扩展技术在生理相关背景下研究疾病生物学的进展、挑战和新兴方法 | 将GCE定位为转化合成生物学平台，用于机制性解析疾病过程，强调其在越来越接近生理环境中的应用 | 该技术广泛实施的主要挑战仍待解决，但具体局限性文中未详细说明 | 利用遗传密码扩展技术解析疾病的分子机制 | 动态蛋白质相互作用、翻译后修饰和信号事件 | 合成生物学 | NA | 遗传密码扩展 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 137 | 2026-05-07 |
Multi-Targeting Non-Specific Genome Engineering in Bacteria
2026-May, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202521532
PMID:41801001
|
研究论文 | 开发了一种基于多靶向整合酶系统的通用基因组工程方法MNGE，用于在多种细菌中高效整合代谢基因或途径 | 提出MNGE方法，基于多靶向整合酶系统实现多拷贝、高度随机（仅需核心TT二核苷酸）的基因整合，适用于革兰氏阳性和阴性菌，并显著提高异源宿主中化合物产量 | NA | 开发一种宿主独立的通用基因组工程方法，以高效整合和表达代谢基因或途径 | 多种细菌，包括革兰氏阳性菌（链霉菌、糖多孢菌）和革兰氏阴性菌（伯克霍尔德菌、紫色杆菌） | NA | NA | MNGE, 多靶向整合酶系统 | NA | NA | NA | NA | 链霉菌 (Streptomyces albus), 伯克霍尔德菌 (Burkholderia gladioli) | 代谢途径整合 | 代谢工程，合成生物学，工业生物技术 |
| 138 | 2026-05-06 |
Gibson Assembly of Highly Repetitive DNA
2026-May-05, Biochemistry
IF:2.9Q3
DOI:10.1021/acs.biochem.6c00002
PMID:42021475
|
研究论文 | 报道了一种基于Gibson组装的模块化质粒框架，用于可扩展和序列定义地组装高度重复DNA，并以弹性蛋白样多肽为模型验证其有效性 | 提出了一种通过Gibson消化与组装工作流实现迭代重复扩增的模块化质粒框架，能够高效构建大片段重复DNA序列，并通过全质粒测序验证序列完整性 | 仅以特定重复序列（GVGVP）为模型，未测试其他类型重复序列的适用性；表征限于NEB 5-alpha细胞，未评估在更复杂宿主中的表达效果 | 开发一种通用策略用于合成高度重复DNA序列，并编码可编程蛋白质聚合物 | 编码五肽Gly-Val-Gly-Val-Pro重复序列的弹性蛋白样多肽（ELP）质粒 | 合成生物学 | NA | Gibson组装、DNA消化与组装、全质粒测序 | NA | DNA序列数据 | 构建了最大513个GVGVP重复的质粒，并表征了257个重复的功能 | Gibson Assembly | 大肠杆菌NEB 5-alpha细胞 | 迭代重复扩增的质粒架构（通过dIII和HI消化及Gibson组装实现） | 生物技术、材料科学 |
| 139 | 2026-05-05 |
Deep learning architectures achieve state-of-the-art (SOTA) accuracy in protein secondary structure prediction
2026-May-03, Molecular diversity
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s11030-026-11570-x
PMID:42071121
|
综述 | 本文综述了深度学习架构在蛋白质二级结构预测中达到最先进精度的最新进展 | 系统总结了混合模型设计、基准数据集和评估指标的最新进展，并讨论了未来方向如跨物种验证、不确定性感知建模和异构生物数据整合 | 当前方法存在数据依赖性和数据集偏差问题 | 综述深度学习在蛋白质二级结构预测领域的进展并指出未来方向 | 蛋白质二级结构预测方法 | 深度学习 | NA | NA | CNN, RNN, Transformer, AlphaFold2 | 蛋白质序列数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学, 药物开发, 疾病研究 |
| 140 | 2026-05-04 |
The tryptophan prenyltransferase ComQ from Bacillus subtilis 168 can prenylate daptomycin at Trp1
2026-May-02, The FEBS journal
DOI:10.1111/febs.70578
PMID:42068243
|
研究论文 | 本研究首次证明来自枯草芽孢杆菌168的色氨酸异戊二烯转移酶ComQ能够异戊二烯化环状抗菌肽达托霉素，显示出其作为合成生物学工具的潜力 | 首次发现ComQ不仅修饰线性肽，还能异戊二烯化环状肽，扩大了底物范围，为生物活性化合物的生物合成工程提供了新工具 | 未提及体内应用或工程化ComQ变体的具体效果 | 探究ComQ作为合成生物学工具异戊二烯化环状抗菌肽的可行性 | 枯草芽孢杆菌168的异戊二烯转移酶ComQ及其底物ComX和信息素和达托霉素 | 合成生物学 | NA | 克隆、蛋白纯化、AlphaFold建模 | AlphaFold | 蛋白质结构 | NA | NA | 大肠杆菌 | NA | 医学、工业生物技术 |