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当前共找到 155 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2026-09-23 |
BxbI-mediated insertion of a 77kb human RET sensitive haplotype into the mouse genome to generate a humanized model of Hirschsprung disease
2026-Jul-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.07.05.736620
PMID:42465522
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研究论文 | 该研究通过Bxb1介导的重组将77kb人类RET敏感单倍型插入小鼠基因组，构建了人类化Hirschsprung病模型，并验证了非编码变异对疾病发病机制的影响 | 首次利用大DNA合成生物学和Bxb1介导的重组将完整77kb人类RET基因组位点（包括所有外显子、内含子和上游调控元件）插入小鼠安全港位点，构建了人类化HSCR模型，并通过CRISPR/Cas9修复保守Sox10结合位点证明非编码变异的关键作用 | 初始HSCR相关敏感单倍型的表达水平仅为野生型的21%，不足以挽救内源性小鼠Ret缺失导致的生存能力，且该模型可能无法完全再现人类疾病的复杂性 | 研究人类RET基因增强子元件中的调控变异如何导致Hirschsprung病的无神经节细胞症，并建立人类化小鼠模型来模拟人类特异性调控疾病 | 人类RET基因组位点、小鼠基因组、Hirschsprung病相关敏感单倍型、增强子元件中的风险SNPs | 基因组学、合成生物学、疾病模型 | Hirschsprung病 | Nanopore测序、短读长测序、CRISPR/Cas9基因编辑、Bxb1介导的重组 | 人类化小鼠模型 | 基因组序列数据、基因表达数据 | 未明确提及样本数量，涉及人类RET位点和小鼠模型 | CRISPR-Cas9, Bxb1重组酶 | 小鼠 | NA | 医学 |
| 22 | 2026-09-23 |
A self-replicating artificial module-genome that generates bacterial chromosome replication system in vitro
2026-Jul-03, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag663
PMID:42406626
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研究论文 | 该研究构建了一个53 kb的环状DNA（RCR模块基因组），编码全部26种RCR蛋白，在PURE系统中实现体外自我复制，并命名为PRIMES系统 | 首次实现了由自身编码的复制机器驱动的人工模块基因组在体外进行基因组规模的自我复制，支持超过28次递归自我复制 | 仅在体外PURE系统中验证，尚未在人工细胞或活细胞环境中实现，离真正的自主自我繁殖人工细胞仍有距离 | 构建能够自我复制的人工基因组，推动自下而上合成生物学中人工细胞自主自我繁殖的目标 | 53 kb环状DNA（RCR模块基因组）及其编码的26种RCR蛋白 | 合成生物学 | NA | PURE系统（重组元件蛋白合成系统）、RCR（复制循环反应） | NA | NA | NA | NA | NA | RCR模块基因组编码全部26种染色体复制蛋白，在PURE系统中表达后驱动自身DNA复制 | 医学,工业生物技术 |
| 23 | 2026-09-19 |
From gene discovery to synthetic biology: recent advances in the biosynthesis of oleanane-type pentacyclic triterpenoids
2026-Jul-22, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d6np00013d
PMID:42187150
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综述 | 本文综述了齐墩果烷型五环三萜类化合物（OPTs）从基因发掘到合成生物学的最新研究进展，涵盖关键酶解析、转录及转录后调控、多组学与人工智能辅助的基因发现，以及微生物和植物异源表达平台和基因组编辑等合成生物学策略。 | 系统整合了多组学与人工智能/机器学习在OPTs生物合成基因簇发掘、关键酶理性改造和通路优化中的应用，提出从经验试错向预测性优化转变的新范式，并全面总结了微生物与植物异源表达及基因组编辑克服OPTs生产瓶颈的前沿策略。 | 作为综述性文章，未提供新的原始实验数据；OPTs天然丰度低、生物合成途径复杂且调控机制繁琐，现有异源表达和基因组编辑策略在产量、稳定性和规模化应用方面仍面临瓶颈，AI/ML预测方法的实际应用仍需实验验证。 | 总结OPTs生物合成基因发现、调控机制及合成生物学策略的最新进展，探讨实现OPTs可持续、可规模化高产的未来机遇。 | 齐墩果烷型五环三萜类化合物（OPTs）及其生物合成途径、关键酶、转录因子、microRNA和异源表达体系。 | 合成生物学 | 癌症, 炎症性疾病, 糖尿病 | 基因组学, 转录组学, 蛋白质组学, 代谢组学, 基因组编辑 | 人工智能, 机器学习 | 文本 | NA | 基因组编辑技术 | 微生物, 植物 | OPTs生物合成代谢通路 | 医药, 工业生物技术 |
| 24 | 2026-09-11 |
Tumor-specific antibodies elicited by engineered bacteria promote bladder cancer immunotherapy in preclinical mouse models
2026-Jul-22, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adv7600
PMID:42485436
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研究论文 | 该研究通过工程化益生菌Nissle 1917表达CXCL13，增强膀胱癌免疫检查点阻断疗法的疗效 | 利用合成生物学工程化细菌递送CXCL13至肿瘤微环境，促进生发中心形成和肿瘤特异性抗体应答，从而增强PD-1阻断免疫疗法 | 研究仅在临床前小鼠模型中进行，尚未在人体临床试验中验证安全性和有效性 | 探索工程化细菌表达CXCL13能否增强膀胱癌免疫检查点阻断疗法的抗肿瘤效果 | 膀胱癌原位小鼠模型 | 肿瘤免疫学 | 膀胱癌 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | Nissle 1917 | 表达CXCL13的工程化细菌 | 医学 |
| 25 | 2026-09-05 |
Engineered Biocatalytic Strategies for Pesticide Degradation in Food Systems: From Catalytic Performance to Practical Applications
2026-Jul-08, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.6c01905
PMID:42133536
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综述 | 综述了食品系统中农药降解的工程化生物催化策略，从催化性能到实际应用进行了全面概述。 | 强调工程策略提升酶性能与稳定性，并探讨人工智能辅助设计和合成生物学等新兴方法。 | 实际应用中存在酶催化效率有限、稳定性不足、可重复使用性差、规模化受限以及监管不确定性等障碍。 | 为食品系统中农药酶促降解提供应用导向的综述，重点介绍工程化策略并分析转化瓶颈。 | 食品系统中的农药残留及降解用酶（天然酶、纳米酶、多酶或混合级联系统）。 | 合成生物学 | NA | 人工智能辅助设计、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | 多酶级联系统、纳米酶和混合级联系统 | 食品加工、食品保鲜、食品安全 |
| 26 | 2026-09-05 |
From tumor targeting to tumor accessibility: surface-engineered bacteria as precision living therapeutics for translational medicine
2026-Jul-07, Journal of hematology & oncology
IF:29.5Q1
DOI:10.1186/s13045-026-01827-1
PMID:42415153
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综述 | 本文从临床视角探讨细菌疗法在转化医学中的瓶颈，提出“肿瘤可及性”概念，并系统总结细菌表面工程策略及联合治疗应用。 | 首次提出“肿瘤可及性”概念，指出其不足是当前细菌疗法临床应用的关键瓶颈，并借鉴抗体药物偶联物精确递送经验，提出“精准活体治疗”新范式。 | 摘要未明确提及具体局限性，但从全文推断可能包括缺乏临床数据支持、技术转化难度大等。 | 从临床导向角度分析细菌疗法转化鸿沟，强调表面工程在提升肿瘤可及性、免疫逃逸和治疗效果中的作用，并提出未来应注重系统可及性。 | 表面工程细菌，包括化学偶联（如SpyTag/SpyCatcher）、物理包被（如细胞膜封装）、生物策略（如基因调控表面结构）。 | 合成生物学 | 癌症 | 基因工程 | NA | NA | NA | SpyTag/SpyCatcher系统 | 细菌 | 细菌表面工程 | 医学 |
| 27 | 2026-09-03 |
ERAD-level gene switches for on-demand protein secretion and rapidly controlled gene therapies
2026-07-30, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-76203-1
PMID:42669721
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研究论文 | 本文开发了基于内质网相关降解（ERAD）的基因开关，用于诱导型、可调型和可逆型蛋白分泌，并通过AAV介导实现体内远程调控的基因治疗 | 首次利用ERAD-中心策略设计条件性降解子标签，实现对治疗性蛋白分泌的快速、可逆调控，无需复杂基因电路，且与AAV基因传递系统兼容 | 未明确提及，可能包括需要进一步验证临床安全性和长期效果 | 开发可快速响应、远程控制的基因开关，以按需调控治疗性蛋白分泌，用于基因治疗，特别是心血管疾病和慢性疼痛 | 治疗性蛋白，雄性小鼠，AAV载体，心血管疾病和慢性疼痛 | 基因治疗 | 心血管疾病，慢性疼痛 | AAV介导的基因传递，内质网相关降解（ERAD），条件性降解子系统 | NA | 实验数据（包括体内小鼠数据） | NA（未具体说明） | NA | 小鼠（体内） | 条件性降解子标签结合ERAD的基因开关 | 医学 |
| 28 | 2026-08-30 |
Next-Generation Probiotics in Poultry: From Conventional Strains to Engineered and Synbiotic Approaches
2026-Jul-31, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms14081680
PMID:42655025
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综述 | 本文全面综述了下一代益生菌在家禽生产中的作用机制、技术进展及其在改善生产性能和健康方面的应用，并探讨了其面临的挑战和未来发展方向 | 系统整合了多组学驱动的菌株鉴定、工程化微生物系统、合成生物学、微胶囊化和合生元配方等先进技术，提出下一代益生菌相比传统益生菌具有更优的肠道定植、靶向抗菌和宿主免疫调节能力 | 存在菌株特异性差异、监管限制和现场验证不足等挑战，且目前缺乏大规模实际应用数据 | 评估下一代益生菌作为抗生素生长促进剂替代品的潜力，以维持家禽生产效率、动物健康和食品安全 | 家禽及其肠道微生物群，涉及传统益生菌和下一代益生菌菌株 | 微生物学 | 肠道感染性疾病 | 多组学、合成生物学、微胶囊化 | NA | 文献数据 | NA | CRISPR-Cas9, 合成生物学工具 | 家禽 | 工程化微生物系统 | 农业, 食品, 工业生物技术 |
| 29 | 2026-08-30 |
Microbiome Engineering in Dairy Cattle: A Critical Review of Strategies for Disease Resistance, Productivity, and Sustainable Farming
2026-Jul-31, Veterinary sciences
IF:2.0Q2
DOI:10.3390/vetsci13080766
PMID:42655786
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综述 | 本文评估了益生菌、益生元、粪便微生物群移植、宏基因组工具和基于CRISPR的合成生物学在奶牛微生物组工程中的应用，并利用技术就绪水平框架评估其转化成熟度 | 采用技术就绪水平1-9框架系统评估奶牛微生物组工程策略的转化成熟度，并强调从群体水平向精准个体化给药转变的关键转化缺口 | 干预失败主要源于宿主-微生物组错配而非微生物产品设计，且缺乏标准化数据基础设施和监管框架 | 解决奶牛生产中的抗微生物耐药性、全球食品需求和减少肠道甲烷排放的监管要求三大挑战 | 奶牛微生物组工程策略，包括益生菌、益生元、粪便微生物群移植、宏基因组工具和CRISPR合成生物学 | 微生物组工程 | 抗微生物耐药性 | 宏基因组、CRISPR | NA | 文献数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 奶牛 | 工程化瘤胃细菌 | 农业、环境 |
| 30 | 2026-08-30 |
Engineering Plant-Associated Soil Microbiomes for Sustainable and Climate-Resilient Agriculture: Mechanisms, Technologies, and Applications
2026-Jul-28, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms14081648
PMID:42654994
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综述 | 本文全面综述了植物相关土壤微生物组在可持续和气候适应性农业中的机制、技术及应用，包括微生物组组装、功能、植物-微生物互作、胁迫抗性以及多种工程策略。 | 整合了多组学技术、系统生物学和人工智能在微生物组工程中的应用，强调了精准微生物组工程和合成生物学方法的前景。 | 大规模实施仍面临田间变异性、定殖稳定性、生物安全、监管框架和数据集成等挑战。 | 探讨植物相关土壤微生物组的工程策略及其在可持续和气候适应性农业中的应用，以提升作物生产、养分管理和生物防治。 | 植物相关土壤微生物组及其在农业生态系统中的功能和互动。 | 微生物组学，人工智能 | NA | 高通量测序、多组学技术（包括宏基因组学、代谢组学、宏转录组学）、系统生物学、人工智能 | 机器学习 | 多组学数据（基因组、转录组、代谢组） | NA | 合成生物学 | 植物相关土壤微生物 | 合成微生物群落（SynComs），微生物接种剂，微生物组移植，根际引导，合成生物学干预 | 农业、环境 |
| 31 | 2026-08-29 |
AI-Assisted Spatial Metabolic Engineering in Plants: Integrating Flux Design, Spatial Omics, and Synthetic Biology
2026-Jul-23, Metabolites
IF:3.4Q2
DOI:10.3390/metabo16080519
PMID:42646258
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综述 | 本文综述了机器学习方法与植物代谢工程在空间工程四个层面的融合，并讨论了空间组学作为验证层的作用及未来自动化工作流的发展方向 | 提出了将预测性机器学习与空间工程整合以设计复杂生物合成途径的策略，并分类评估了各技术的证据水平 | 植物特异性训练数据集不完整、组织异质性和体内验证有限，限制了AI生成设计的转化 | 探讨机器学习与植物空间代谢工程融合的现状与未来方向 | 植物合成生物学中的空间工程层级（亚细胞、细胞/组织/器官、发育或诱导、基因组水平） | 机器学习 | NA | 空间组学 | 机器学习模型（如生成算法、约束型代谢模型） | 空间组学数据 | NA | NA | 植物 | 生物合成途径设计 | 农业, 工业生物技术 |
| 32 | 2026-08-27 |
Probiotics unveiled: bridging general health benefits to the era of precision medicine
2026-Jul-17, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-026-05143-1
PMID:42463603
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综述 | 本文综述了益生菌从一般健康促进剂向精准医学中个性化靶向疗法的转变，涵盖其作用机制及与新技术结合的应用前景。 | 将益生菌与心理生物学、下一代益生菌、改造菌株、人工智能和合成生物学技术相结合，提出个性化益生菌疗法的概念。 | 未提供具体的临床试验数据或实证研究结果，主要基于理论综述。 | 探讨益生菌在精准医学中的应用潜力，强调个性化治疗的必要性。 | 益生菌及其在宿主生理中的作用机制，以及与新兴技术的结合。 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学技术 | NA | NA | 医学 |
| 33 | 2026-08-26 |
Next-Generation Food Enzymology: From Metagenomic Discovery to AI-Driven Biocatalyst Design
2026-Jul-29, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.6c04349
PMID:42461222
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评述 | 本文探讨了宏基因组学、人工智能和合成生物学融合如何推动食品酶学进入新时代，实现从传统生物催化剂到定制化新型酶的转变。 | 强调宏基因组发现与AI驱动的生物催化剂设计的整合，将酶工程从经验性过程转变为预测性学科。 | 未提供实验验证或具体案例，仅基于前瞻性视角讨论。 | 探讨宏基因组学、AI和合成生物学在开发定制化生物催化剂用于可持续、精准的下一代食品加工中的应用。 | 食品酶学生物催化剂 | 合成生物学 | NA | 宏基因组学、多组学、蛋白质结构预测、de novo蛋白设计 | NA | 序列数据、结构数据 | NA | NA | NA | NA | 食品 |
| 34 | 2026-08-25 |
Synthetic developmental engineering of human liver organogenesis
2026-07-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.205040
PMID:42440359
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综述 | 本文综述了人类肝脏发育过程及当前用于体外生成肝脏类器官的模型，并探讨了如何整合合成生物学和计算分析来提升类器官的成熟度和复杂性 | 提出将合成生物学与计算分析相结合，以促进血管化、建立分区、优化命运特化和增强对外部信号的响应，从而推动下一代多细胞人类干细胞来源系统的开发 | 当前模型在重现性和成人水平成熟度方面存在挑战 | 探讨如何利用发育工程原理和合成生物学手段改进肝脏类器官模型，以用于疾病建模和再生医学 | 人类胚胎肝脏发育过程及体外肝脏类器官模型 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 人类多能干细胞 | NA | 医学、再生医学 |
| 35 | 2026-08-23 |
Scanning the horizon: deep mutational scanning approaches in virology
2026-Jul-21, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/jvi.01784-25
PMID:42267826
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综述 | 本文综述了深度突变扫描（DMS）技术在病毒学中的最新进展，包括技术方法、应用及其对理解病毒进化的贡献。 | 系统总结了DMS技术在病毒学中的最新应用，特别是跨宿主物种、组织环境和免疫压力下的突变效应测量，并探讨了合成生物学在突变文库构建中的新作用。 | 文中未明确指出局限性，但作为综述，可能受限于现有文献的覆盖范围和技术的当前状态。 | 总结DMS技术在病毒学中的最新技术和概念进展，探讨其应用和未来研究方向。 | DMS技术及其在病毒学和病毒进化中的应用。 | 病毒学 | NA | 深度突变扫描（DMS），高通量突变生成，深度测序 | NA | 序列数据 | NA | 合成生物学（未具体指定工具） | 病毒 | 突变文库构建（未具体指定电路） | 医学，工业生物技术 |
| 36 | 2026-08-22 |
Characterization and Wound-Healing Effects of Fucoidan from Sargassum polycystum Collected in South Sulawesi in a Staphylococcus aureus-Infected Rat Model
2026-Jul-21, Marine biotechnology (New York, N.Y.)
DOI:10.1007/s10126-026-10659-6
PMID:42479226
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研究论文 | 从南苏拉威西采集的羊栖菜中提取岩藻多糖，并评估其对金黄色葡萄球菌感染大鼠模型的伤口愈合效果 | 首次研究了来自南苏拉威西潮间带的羊栖菜中岩藻多糖的伤口愈合潜力，并证实其安全性和有效性 | 未提供具体局限性信息 | 评估羊栖菜中提取的岩藻多糖对金黄色葡萄球菌感染伤口的愈合效果及其安全性 | 羊栖菜中提取的岩藻多糖以及金黄色葡萄球菌感染的大鼠模型 | 海洋生物学、医学 | 皮肤感染、伤口愈合 | FTIR、¹H NMR、¹³C NMR、溶血试验、组织学分析 | NA | 图像、光谱、组织学数据 | 大鼠，6毫米切除伤口，感染金黄色葡萄球菌（0.1 mL，10⁷ CFU/mL），对照组使用凡士林 | NA | 大鼠 | NA | 医学、可持续海洋生物技术 |
| 37 | 2026-08-22 |
Bacteria mediated tumor therapy recent advances challenges and future perspectives
2026-Jul-17, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-05611-y
PMID:42467272
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综述 | 系统总结了细菌介导肿瘤治疗的历史发展、内在抗肿瘤机制、基因工程策略及多模式生物杂合系统，并讨论了临床转化中的挑战与未来方向 | 提出下一代智能化、可控且临床可转化的细菌来源活体抗肿瘤系统的合理设计策略 | 临床转化受限于生物安全控制不足、脱靶定植、不受控制的增殖、免疫清除以及缺乏标准化生产和监管指南 | 综述细菌介导肿瘤治疗的研究进展，分析不同平台的优缺点和核心瓶颈，并展望未来设计方向 | 工程化细菌及细菌来源的生物杂合系统 | 合成生物学 | 肿瘤 | 合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick | 细菌 | 基因修复、环境响应可编程表达、细胞毒性蛋白生产、多模式联合治疗系统 | 医学 |
| 38 | 2026-08-20 |
Deep Learning Predicts Dissimilar DNA-DNA Binding and Engineers Hyperconnected Networks
2026-Jul-09, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-75395-w
PMID:42426013
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研究论文 | 本文介绍了BINND，一种结合超高通量平台和深度学习模型的工具，用于预测DNA-DNA结合相互作用，并展示了其在构建超连接网络中的应用 | 利用深度学习模型快速准确预测非正交DNA相互作用，速度比现有模型快50倍，并能在多样序列上泛化 | 未提及具体的局限性 | 开发一种能够准确快速预测非正交DNA相互作用的模型，以利用完整的序列空间 | DNA-DNA相互作用 | 机器学习 | NA | 超高通量测量平台 | 深度学习模型（BINND） | 分子相互作用数据 | 未提供具体样本量，但平台测量数百万个相互作用 | NA | NA | 超连接网络（基于DNA相互作用的合成网络） | 生物工程，合成生物学 |
| 39 | 2026-08-20 |
A portable Cas6f-based system for multiplex translational repression in bacteria
2026-Jul-08, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-75135-0
PMID:42420316
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研究论文 | 本文介绍了一种基于Cas6f的紧凑型系统MORTISE，用于革兰氏阴性细菌中的多重翻译抑制，不依赖宿主Hfq或RNase，并在大肠杆菌和恶臭假单胞菌中实现稳健的多重基因敲低 | 该系统利用Cas6f蛋白构建紧凑型平台，无需宿主Hfq或RNase，可在多种革兰氏阴性菌中工作，支持单启动子多重抑制和一步克隆装配多达9个引导序列，实现翻译起始区域的精确靶向 | 未明确提及局限性，但可能受限于革兰氏阴性菌宿主范围，且引导与靶转录匹配需要优化 | 开发一种不依赖宿主因子、可移植且可调的多重翻译抑制平台，以促进代谢工程和合成生物学应用 | 革兰氏阴性细菌（大肠杆菌和恶臭假单胞菌）及相关的基因表达系统 | 合成生物学 | NA | sRNA设计、染色体报告基因分析、克隆装配 | NA | 基因表达和代谢产物数据 | 未明确样本数量，涉及大肠杆菌和恶臭假单胞菌中的实验 | CRISPR-Cas6f系统 | 大肠杆菌, 恶臭假单胞菌 | 基于Cas6f的翻译抑制系统（MORTISE），支持多重基因敲低 | 工业生物技术、合成生物学 |
| 40 | 2026-08-18 |
Tangled Tail of Mechanically Interlocked Peptides
2026-07-08, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.6c05395
PMID:42334221
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综述 | 本文综述了机械互锁肽（MIPs）在自然界中的发现及化学合成进展，并提出了统一命名法，以促进分子生物学与超分子化学领域的融合。 | 首次系统比较自然界存在的机械互锁生物分子与化学合成的肽基机械互锁分子，并提出统一的命名法，为跨学科研究奠定基础。 | 未提及具体实验数据或量化分析，可能缺乏对实际应用挑战的深入讨论。 | 综述机械互锁肽的研究现状，建立统一命名法，并促进生物学与化学领域的跨学科合作。 | 自然界存在的机械互锁生物分子（如连环DNA、HK97噬菌体衣壳蛋白）及化学合成的机械互锁肽。 | 化学生物学，合成生物学 | NA | NA | NA | 文本，综述数据 | NA | NA | NA | 机械互锁肽结构（如连环肽、链甲结构） | 基础研究，化学生物学 |