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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-06-20 |
Bacterial mRNA Vaccines: Programming Immunity Against Antimicrobial Resistance
2026-Aug, Drug development research
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/ddr.70335
PMID:42318873
|
综述 | 这篇综述概述了细菌mRNA疫苗在应对抗菌药物耐药性方面的最新进展,包括抗原设计、mRNA工程和递送平台优化 | 整合了人工智能引导的抗原发现、合成生物学和下一代递送系统以加速临床转化,强调克服现有障碍以建立mRNA疫苗作为对抗耐药感染的可行策略 | 细菌抗原结构的复杂性、实现有效黏膜和细胞递送的挑战、诱导平衡Th1/Th17主导免疫反应的困难以及免疫持久性问题 | 应对抗菌药物耐药性威胁,开发细菌mRNA疫苗 | 结核分枝杆菌、铜绿假单胞菌、肺炎链球菌等关键细菌病原体 | 合成生物学, 疫苗学 | 细菌感染性疾病, 抗菌药物耐药性 | mRNA工程, 脂质纳米颗粒递送, 人工智能引导的抗原发现, 合成生物学 | NA | NA | NA | 脂质纳米颗粒, 人工智能, 合成生物学 | NA | NA | 医学 |
| 2 | 2026-06-19 |
Marine bioactive compounds in the management of zoonotic parasitic diseases: public health ramifications, mechanisms, and translational prospects
2026-Aug, Microbial pathogenesis
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.micpath.2026.108574
PMID:42155906
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综述 | 探讨海洋生物活性化合物在管理人畜共患寄生虫病中的潜力,涵盖作用机制、药物发现新方法和可持续生产途径 | 整合了海洋来源抗寄生虫化合物的多种作用机制,并提出了AI辅助筛选、网络药理学和纳米技术递送系统等创新药物开发方法 | 海洋生物活性化合物的药代动力学、安全性和临床应用仍需进一步研究 | 评估海洋生物活性物质作为抗人畜共患寄生虫病创新药物的潜力 | 海洋生物活性化合物 | 数字病理学 | 人畜共患寄生虫病(包括溶组织内阿米巴、十二指肠贾第鞭毛虫、微孢子虫和阴道毛滴虫感染) | NA | NA | 文献数据 | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 3 | 2026-06-13 |
Opportunities for artificial intelligence and synthetic biology in designing living drug delivery systems
2026-Aug, Advanced drug delivery reviews
IF:15.2Q1
DOI:10.1016/j.addr.2026.115883
PMID:42055250
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综述 | 本文综述了人工智能和合成生物学在工程化人类细胞和细菌作为活体药物递送系统中的应用 | 首次系统探讨AI和合成生物学协同设计下一代活体药物递送系统,重点揭示序列到功能和组成到功能的设计原理 | 未提供具体实验数据验证所讨论技术的有效性,可能缺乏对实际应用挑战的深入分析 | 探讨人工智能和合成生物学在工程化活体药物递送系统中的机遇 | 人类细胞和细菌作为活体药物递送载体 | 合成生物学,人工智能 | NA | 合成生物学,人工智能模型 | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | 人类细胞,细菌 | 合成受体,信号处理网络,基因回路 | 医学 |
| 4 | 2026-06-11 |
Metabolic engineering strategies for microbial amino acid production: From molecular mechanisms to systems optimization
2026-Aug, Enzyme and microbial technology
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.enzmictec.2026.110901
PMID:42166812
|
综述 | 从分子机制到系统优化,系统综述微生物氨基酸生产的代谢工程策略 | 提出一个涵盖分子、网络和系统三个层面的层级约束策略框架,并评估各策略的权衡与边界条件 | 未提供具体的实验验证或定量比较不同策略的性能 | 指导理性选择代谢工程策略,推动氨基酸生物制造的高效可持续发展 | 微生物细胞工厂 | NA | NA | 代谢工程、合成生物学、系统生物学 | NA | 综述文献 | NA | NA | 微生物 | NA | 医药、食品、保健品、化工 |
| 5 | 2026-06-02 |
Employing synthetic biology to modulate metabolic flux: Current strategies and applications
2026-Aug, Journal of bioscience and bioengineering
IF:2.3Q3
DOI:10.1016/j.jbiosc.2026.03.012
PMID:42020273
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综述 | 本综述总结了代谢工程中用于调控代谢流的最新基因调控工具和策略及应用 | 根据中心法则的分子调控水平对工具进行分类,并讨论了尚未充分开发的潜在工具 | 未提供具体实验数据或比较分析,仅基于文献综述 | 总结代谢工程中的基因调控工具和策略,以促进可持续生物制造 | 细菌、古菌和真核生物中的多酶途径基因调控工具 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 细菌, 古菌, 真核生物 | 代谢调控回路,包括基因开关、振荡器、逻辑门、生物传感器、代谢途径 | 工业生物技术, 医药, 农业, 环境, 能源, 材料, 食品 |
| 6 | 2026-06-02 |
Enhanced tRNA array method version 2 for simultaneous in vitro synthesis of 21 tRNAs
2026-Aug, Journal of bioscience and bioengineering
IF:2.3Q3
DOI:10.1016/j.jbiosc.2026.03.014
PMID:42025521
|
研究论文 | 开发了改进版tRNA阵列方法,实现21种tRNA的同步体外合成 | 通过序列修饰和引入前导序列,解决了原tRNA阵列方法中特定tRNA组限制翻译活性的问题 | NA | 提高tRNA阵列方法的翻译活性,使之与单独制备tRNA的性能相当 | tRNA阵列方法及翻译活性受限的tRNA组 | 合成生物学 | NA | 体外转录与翻译,序列修饰 | NA | NA | NA | NA | NA | tRNA阵列,包含前导序列的基因表达系统 | 合成生物学,生物技术 |
| 7 | 2026-06-02 |
Tailored base editing toolkits for functional genomics and metabolic engineering in the halophile Salinivibrio
2026-Aug, Journal of biotechnology
IF:4.1Q2
DOI:10.1016/j.jbiotec.2026.04.012
PMID:42031218
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研究论文 | 开发了适用于嗜盐菌Salinivibrio的碱基编辑工具包,用于功能基因组学和代谢工程 | 首次在非模式嗜盐菌中开发高效的碱基编辑平台,实现单、双、三位点替换,以及新型融合蛋白实现协同双碱基编辑 | 未提及在更广泛嗜盐菌中的适用性或长期稳定性 | 开发高效遗传工具以促进嗜盐菌的工业应用 | 嗜盐菌Salinivibrio sp. TGB4 | 合成生物学 | NA | 碱基编辑 | NA | NA | NA | ABE, CBE, PmCDA-TadA8e-nCas9-UGI | Salinivibrio sp. TGB4 | 碱基编辑工具,包括腺嘌呤和胞嘧啶碱基编辑器及协同双碱基编辑器 | 工业生物技术 |
| 8 | 2026-06-02 |
Engineering AraC L9K for inducer-independent pBAD activation in Salmonella Gallinarum
2026-Aug, Journal of biotechnology
IF:4.1Q2
DOI:10.1016/j.jbiotec.2026.04.019
PMID:42061758
|
研究论文 | 通过在肠炎沙门氏菌血清型鸡伤寒沙门氏菌中结合宿主基因组修饰和定点诱变,生成不依赖诱导剂的AraC变体L9K,实现pBAD启动子的组成型高表达 | 首次在沙门氏菌中通过L9K单点突变获得不依赖阿拉伯糖的AraC组成型激活变体,且与常用pBAD载体兼容,避免了代谢负担 | NA | 开发不依赖外源诱导剂的AraC-pBAD表达系统,用于微生物制造和合成生物学应用 | 肠炎沙门氏菌血清型鸡伤寒沙门氏菌 | 合成生物学 | NA | 定点诱变,基因敲除,结构建模 | NA | NA | NA | 靶向诱变 | 肠炎沙门氏菌血清型鸡伤寒沙门氏菌 | 不依赖诱导剂的组成型基因表达系统 | 工业生物技术,医学,合成生物学 |
| 9 | 2026-06-02 |
Synthetic biology-driven innovations in triple-negative breast cancer: Integrating engineering design with targeted therapeutics
2026-Aug, Journal of biotechnology
IF:4.1Q2
DOI:10.1016/j.jbiotec.2026.04.017
PMID:42082082
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综述 | 综述合成生物学驱动的三阴性乳腺癌精准诊疗工程化策略 | 系统整合合成生物学与工程化设计原理,涵盖细胞工程、微生物工程和核酸工程三大类策略,并提出联合免疫肿瘤学与精准医学克服肿瘤异质性和耐药性的协同潜力 | 未提及具体临床转化障碍或体内验证数据,理论框架多于实验证据 | 总结合成生物学方法在三阴性乳腺癌中的最新进展,探索下一代自适应个性化治疗方案 | 三阴性乳腺癌(TNBC) | 合成生物学 | 三阴性乳腺癌 | 合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 哺乳动物细胞 | 基因回路 | 医学 |
| 10 | 2026-06-02 |
Sustainable production of natural sweeteners through synthetic biology
2026-Aug, Journal of bioscience and bioengineering
IF:2.3Q3
DOI:10.1016/j.jbiosc.2026.04.001
PMID:42103513
|
综述 | 综述合成生物学在天然甜味剂可持续生产中的应用 | 系统总结了12种代表性天然甜味剂的代谢途径和微生物合成方法,分析不同合成方案的优缺点及核心技术瓶颈 | 未提供具体实验数据或定量比较 | 为天然甜味剂的工业优化和生产提供理论支持和技术参考 | 12种代表性天然甜味剂(包括甜蛋白、萜类糖苷、黄酮类、多元醇和单糖) | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | 代谢工程,酶工程 | 微生物细胞工厂 | 代谢通路 | 食品 |
| 11 | 2026-05-29 |
Micropeptides in Cancer and Immunity: Diagnostic, Therapeutic, and Synthetic Biology Frontiers
2026-Aug-20, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2026.150217
PMID:42140456
|
综述 | 综述微肽在癌症和免疫中的功能,以及作为诊断、治疗和合成生物学前沿工具的潜力 | 揭示微肽作为隐藏的蛋白质组新层,重新定义编码和非编码基因组区域的界限,并整合单细胞蛋白质基因组学、核糖体图谱、质谱和深度学习进行发现 | 未明确讨论微肽检测的标准化挑战、体内递送效率及临床转化的障碍 | 探索微肽在癌症和免疫中的双重作用,并评估其在诊断、治疗和合成生物学中的应用前景 | 微肽(包括癌基因微肽如SMIM30、circPDHK1-241aa、PDL1P41,以及肿瘤抑制微肽如HOXB-AS3、CIP2A-BP、SPAR、ASRPS) | 机器学习 | 癌症 | 单细胞蛋白质基因组学, 核糖体图谱, 质谱, 深度学习 | 深度学习模型 | 基因组数据, 蛋白质组数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 哺乳动物细胞 | CRISPR激活的肽回路, 靶向肽嵌合物 | 医学, 免疫治疗 |
| 12 | 2026-05-26 |
RNA-based cancer immunotherapy: Harnessing the power of RNA nanoparticles for melanoma treatment
2026-Aug, Pathology, research and practice
DOI:10.1016/j.prp.2026.156512
PMID:42119359
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综述 | 本文综述了基于RNA的癌症免疫疗法在黑色素瘤治疗中的应用,重点介绍了RNA纳米颗粒的作用 | 总结了环状RNA、PIWI相互作用RNA和自扩增RNA等新型RNA在黑色素瘤免疫治疗中的机制,并探讨了RNA纳米颗粒在递送中的创新作用 | NA | 综合评估基于RNA的癌症免疫疗法在黑色素瘤治疗中的机制、临床前和临床证据,并突出RNA纳米颗粒的潜力 | 黑色素瘤和RNA纳米颗粒 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | RNA测序、信使RNA疫苗、小干扰RNA、微小RNA、环状RNA、PIWI相互作用RNA、自扩增RNA | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 13 | 2026-05-24 |
Unveiling the adaptive structure-function synergy in thermophilic translation initiation factor 1: A molecular dynamics framework
2026-Aug, Biophysical chemistry
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.bpc.2026.107644
PMID:42085878
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研究论文 | 通过分子动力学模拟揭示嗜热翻译起始因子1的结构-功能协同适应性机制 | 首次通过全原子分子动力学模拟系统比较嗜热与中温翻译起始因子1的动态特性,揭示嗜热因子通过扩展氢键和盐桥网络增强结构刚性的分子机制 | 仅基于计算机模拟,缺乏体外实验验证;仅研究了单一嗜热菌株的IF1蛋白 | 阐明嗜热细菌翻译起始因子1的热稳定性分子机制,为工程化耐热蛋白建立框架 | 嗜热菌Thermoanaerobacterium thermosaccharolyticum的IF1蛋白(TT_IF1)与中温菌Flavobacterium kingsejongi的IF1蛋白(FK_IF1) | 分子生物学 | 不适用 | 分子动力学模拟,主成分分析 | 不适用 | 模拟轨迹数据 | 每种IF1蛋白3次独立模拟,每次1000纳秒 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 合成生物学,工业生物技术 |
| 14 | 2026-05-15 |
Structure-function relationships and industrial integration of extremophilic xylanases for sustainable xylo-oligosaccharide production
2026-Aug, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2026.134751
PMID:42067162
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综述 | 系统总结了利用蛋白质工程和合成生物学策略工程化改造极端微生物木聚糖酶,以实现从木质纤维素生物质中可持续生产低聚木糖的研究进展 | 全面分析了极端微生物木聚糖酶在不同严苛条件下的结构适应性(如离子对网络、疏水核心和表面静电)及其在工业整合中的技术经济与生命周期评估 | 未来仍需进一步努力增强极端微生物木聚糖酶的商业化应用以实现可持续生物加工 | 探索极端微生物木聚糖酶的结构功能关系及其工业整合,以实现可持续的低聚木糖生产 | 极端微生物木聚糖酶(来源于嗜热、嗜盐、嗜酸/嗜碱微生物)及其在低聚木糖生产中的应用 | NA | NA | 蛋白质工程、合成生物学 | NA | NA | NA | 蛋白质工程, 合成生物学 | 嗜热微生物, 嗜盐微生物, 嗜酸/嗜碱微生物 | NA | 工业生物技术, 环境 |
| 15 | 2026-05-10 |
Prediction of gene expression levels in Saccharomyces cerevisiae based on chromatin accessibility using multiple machine learning models
2026-Aug, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
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研究论文 | 基于染色质可及性使用多种机器学习模型预测酿酒酵母基因表达水平 | 首次使用染色质可及区域的k-mer特征通过监督机器学习模型预测基因表达,并发现与mRNA剪接相关的关键基序 | NA | 从染色质可及区域预测基因表达水平 | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)的染色质可及区域和基因表达 | 机器学习 | NA | 机器学习建模、染色质可及性分析 | 监督机器学习模型(Yeast-Gene) | 序列数据(k-mer特征) | NA | NA | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae) | NA | 合成生物学 |
| 16 | 2026-05-09 |
Engineering Corynebacterium glutamicum as a multifunctional biofactory for living therapeutic materials and controlled ectoine delivery
2026-Aug, Biomaterials advances
IF:5.5Q2
DOI:10.1016/j.bioadv.2026.214847
PMID:41950672
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研究论文 | 将谷氨酸棒杆菌工程化为多功能生物工厂,用于活体治疗材料和受控的依克多因递送 | 首次将谷氨酸棒杆菌作为多功能平台开发用于活体治疗材料,整合了生物感应、报告和依克多因生产功能,并实现了在聚合物基质中的封装与受控释放 | 未明确讨论在体内环境中的长期稳定性和免疫原性等潜在挑战 | 设计和构建工程化谷氨酸棒杆菌,用于活体治疗材料的开发及相关应用 | 谷氨酸棒杆菌菌株及基于聚合物的活体材料(膜-凝胶贴片和核壳水凝胶系统) | 合成生物学 | 炎症及应激相关疾病 | 合成生物学 | NA | 生物传感数据 | NA | 合成生物学 | Corynebacterium glutamicum | 生物传感器、报告系统、依克多因合成通路 | 医学, 环境 |
| 17 | 2026-05-04 |
Efficient cell factory design by combining meta-heuristic algorithm with enzyme-constrained metabolic models
2026-Aug, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2026.134706
PMID:42034297
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研究论文 | 提出MetaStrain框架,将酶约束代谢模型与元启发式算法结合,用于高效设计微生物细胞工厂 | 首次将元启发式算法与酶约束模型整合,通过降维预筛选和数值编码策略高效探索组合基因编辑空间,实现非直觉组合靶点的快速识别 | 未提供实验验证中脱靶效应的分析,且对大型代谢网络的计算复杂度评估不充分 | 开发一种计算框架以优化微生物细胞工厂中多基因靶点设计,提高目标产物产量 | 酿酒酵母和大肠杆菌的代谢网络模型 | NA | NA | 酶约束代谢模型 | 元启发式算法 | NA | 通过计算模拟涉及酿酒酵母的2-苯乙醇和亚精胺生物合成,实验验证使用大肠杆菌的五靶点组合菌株 | CRISPR-Cas9, 代谢工程 | 酿酒酵母, 大肠杆菌 | 组合基因编辑策略,包括敲除、过表达和酶修饰 | 工业生物技术 |