合成生物学相关文章
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当前共找到 154 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-09-21 |
Cross incompatibility restricting genome exchange and diversification of primary gene pool in plants: challenges and opportunities
2026-Aug-25, TAG. Theoretical and applied genetics. Theoretische und angewandte Genetik
DOI:10.1007/s00122-026-05347-x
PMID:42642494
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综述 | 本文综述了植物种间杂交中存在的合子前和合子后障碍及其遗传因素，并探讨了体细胞杂交和胚胎拯救等生物技术手段以及合成生物学在克服杂交不亲和中的应用前景。 | 强调合成生物学可重新编程生殖障碍，把杂交不亲和转变为可控制的性状以促进杂交品种开发。 | 未提及具体的实验验证，侧重于理论综述与现有技术总结，缺乏原始数据支撑。 | 探索植物种间杂交不亲和的障碍机制，并总结克服这些障碍以利用作物野生近缘种遗传多样性的策略。 | 植物，尤其是作物野生近缘种与栽培作物的种间杂交。 | 植物遗传学与育种 | NA | 体细胞杂交、胚胎拯救、合成生物学 | NA | 文本 | NA | NA | 植物 | NA | 农业 |
| 2 | 2026-09-21 |
Fluorogenic RNA Aptamer-Based Activity Quantification of T7 RNA Polymerase
2026-Aug-18, Biochemistry
IF:2.9Q3
DOI:10.1021/acs.biochem.6c00336
PMID:42610739
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研究论文 | 本文开发了一种基于荧光RNA适配体的体外转录 assay，用于定量测定T7 RNA聚合酶的活性单位 | 使用Broccoli RNA适配体作为转录报告基因，以荧光信号替代传统放射性聚合 assay，实现简便且安全的T7 RNAP活性定量 | 未明确提及 | 开发一种荧光基的体外转录 assay，以简便、定量地测定T7 RNA聚合酶活性单位 | T7 RNA聚合酶及其工程化变体 | 合成生物学 | NA | 体外转录 assay, 荧光RNA适配体 | NA | 荧光信号 | NA | NA | NA | NA | 医学, 工业生物技术 |
| 3 | 2026-09-19 |
Synthetic transcriptional repression systems in plants
2026-Aug-26, Plant cell reports
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s00299-026-03949-9
PMID:42645592
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综述 | 本文综述了在植物中利用原核抑制蛋白构建合成转录抑制系统的策略，包括模块化启动子与抑制蛋白架构、化学诱导性调控以及设计面临的挑战 | 系统总结了利用原核抑制蛋白在植物中构建可编程转基因抑制系统的模块化设计框架，并探讨了通过操作子位置和抑制结构域融合进行调控调节的策略 | 未涉及具体实验验证，主要基于已有文献的理论总结，缺乏对合成抑制系统在植物中实际应用效果的定量评估 | 探讨在植物中构建合成转录抑制系统的策略，实现可调控的转基因表达 | 植物中的合成转录抑制系统 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 文本 | NA | NA | 植物 | 合成转录抑制系统，包括模块化启动子与抑制蛋白架构、操作子位置调控、抑制结构域融合、化学诱导去抑制机制 | 农业, 工业生物技术 |
| 4 | 2026-09-19 |
Mixed positive and negative feedback loops drive diverse single-cell gene expression dynamics
2026-08-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-75107-4
PMID:42744773
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研究论文 | 本文结合随机建模与单细胞延时显微技术，揭示了混合正负反馈回路如何产生多种单细胞基因表达动态行为 | 通过最小随机模型揭示了混合正负反馈回路可产生十种不同的动态输出类别，包括随机脉冲、振荡和双稳态，并在枯草芽孢杆菌的两种混合反馈回路中进行了实验验证，实现了通过调控体内参数在不同动态行为之间切换 | 研究仅在一个细菌（枯草芽孢杆菌）中验证了两种混合反馈回路，模型是否适用于其他生物体系及其他混合反馈回路尚待进一步验证 | 建立混合正负反馈回路产生多样化单细胞动态的定量框架，理解这一常见生物网络基序的工作原理，并为合成生物学工程化应用提供指导 | 枯草芽孢杆菌（Bacillus subtilis）中的两种混合正负反馈回路（σ因子相关回路） | 合成生物学、系统生物学 | NA | 随机建模、单细胞延时显微技术 | 最小随机模型 | 图像、时间序列数据 | NA | NA | 枯草芽孢杆菌（Bacillus subtilis） | 混合正负反馈回路 | 合成生物学 |
| 5 | 2026-09-16 |
A Comprehensive Review on the Biosynthesis of Tropane Alkaloids
2026-Aug-23, Molecules (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/molecules31172951
PMID:42738612
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综述 | 本文全面综述了托烷类生物碱生物合成从前体形成到结构多样终产物的研究进展 | 整合了基因组学、结构生物学和合成生物学的最新进展，重点阐述了催化机制、底物特异性结构决定因素、代谢区室化以及茄科和古柯科中托烷类生物碱生物合成的趋同进化 | 作为综述文章，未提供原始实验数据，且未解决的关键问题仍有待进一步研究 | 全面总结托烷类生物碱生物合成的研究现状，为植物特化代谢、合成生物学和天然产物工程提供更新框架 | 托烷类生物碱及其生物合成途径，包括莨菪碱、东莨菪碱、可卡因和卡利斯特碱 | na | na | 基因组学, 结构生物学, 合成生物学, 代谢工程, 进化生物学 | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 医药, 工业生物技术 |
| 6 | 2026-09-16 |
Amaryllidaceae Alkaloids and Isoquinoline Alkaloids: A Perspective on Historical Approaches to Pathway Elucidation
2026-Aug-22, Plants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/plants15172553
PMID:42739321
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综述 | 本文比较了异喹啉生物碱和石蒜科生物碱生物合成途径解析的历史与方法学轨迹，从化合物分离、放射性示踪到多组学、功能酶学和异源途径重建 | 系统性对比了异喹啉生物碱与石蒜科生物碱在分类分布、骨架形成化学、途径解析程度和生物技术发展方面的差异，并整合生化逻辑、组学引导发现、酶进化、组织特异性、调控和合成生物学提出未来生物碱途径发现的优先方向 | 石蒜科生物碱中3,4-二羟基苯甲醛的酶促形成机制尚未解析，较少研究的异喹啉生物碱骨架类别的功能验证仍不完整 | 比较异喹啉生物碱和石蒜科生物碱途径解析的历史与方法学轨迹，识别未来生物碱途径发现和可持续生产的优先方向 | 异喹啉生物碱和石蒜科生物碱及其生物合成途径 | 植物代谢组学 | NA | 转录组学, 代谢组学, 功能酶学, 同位素引导活性组织鉴定, 异源途径重建, 放射性示踪实验 | NA | 文本 | NA | NA | NA | 异源生物合成途径重建 | 医药, 工业生物技术 |
| 7 | 2026-09-15 |
Host-aware Identification of Intrinsic Gene Expression Biopart Parameters using Combinatorial Libraries
2026-Aug-11, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-76332-7
PMID:42717201
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研究论文 | 该文章提出了一个宿主感知的框架，利用组合文库定量表征质粒型组成型表达构建体中的生物元件参数，通过结合大肠杆菌数字孪生和模型在环参数识别，分离生物元件属性与宿主依赖效应 | 引入了宿主感知的框架，整合大肠杆菌数字孪生与模型在环参数识别，从组合文库中识别机制可解释且可转移的参数，定义了内在翻译起始能力，并揭示了模块化的局部失效 | 未明确说明 | 解决合成生物学中基于模型的设计受限于生物元件相对指标在不同遗传和生理背景下变化的问题，实现生物元件的定量表征和预测性设计 | 质粒型组成型表达构建体中的生物元件，包括质粒复制起点、启动子和核糖体结合位点 | 合成生物学 | 不适用 | 组合文库构建、模型在环参数识别、数字孪生 | 数字孪生 | 实验测量数据 | 未明确说明 | 不适用 | 大肠杆菌 | 质粒型组成型表达构建体 | 医学、工业生物技术 |
| 8 | 2026-09-13 |
Integrated multi-omics analysis reveals a pH-driven metabolic and translational switch in Ureaplasma parvum
2026-08-04, Microbiology spectrum
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/spectrum.03463-25
PMID:42429378
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研究论文 | 本文通过整合蛋白质组学、代谢组学和RNA修饰图谱，构建了微小脲原体pH适应的系统级模型 | 揭示了微小基因组细菌通过预先存在的共调控功能模块的分岔式激活来实现pH适应，并强调了表观转录组动态重组在适应性中的重要性 | 未明确说明样本量，且研究结果可能受限于单一物种，需进一步验证是否可推广至其他基因组缩减微生物 | 构建微小脲原体pH适应的系统级模型，探究其适应机制 | 微小脲原体（Ureaplasma parvum） | 多组学 | NA | 蛋白质组学, 代谢组学, RNA修饰图谱 | NA | 组学数据 | NA | NA | NA | NA | 医学, 合成生物学 |
| 9 | 2026-09-10 |
Nitrene generation and transfer for unnatural biosynthesis in living cells
2026-Aug-18, Nature chemistry
IF:19.2Q1
DOI:10.1038/s41557-026-02224-4
PMID:42613447
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研究论文 | 本文展示了在活细胞内通过细胞色素P450催化的氮宾转移反应，实现非天然产物的生物合成，从简单碳源产生多种含氮化合物 | 首次在活细胞中实现代谢中间体的分子间氮宾转移反应，拓展了合成生物学的化学空间，能够合成传统有机化学难以制备的化合物 | 未明确提及，但可能受限于底物范围和产率 | 开发活细胞中的非天然生物合成途径，将氮宾化学与代谢工程结合以生产高价值含氮化合物 | 细胞色素P450酶及代谢途径中的酶 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 活细胞（具体宿主未指明） | 代谢途径设计，包括N-乙酰氧基苯胺的生物合成以及氮宾转移反应 | 工业生物技术、医药、农业 |
| 10 | 2026-09-10 |
Optimized Yeast Surface Display Workflow for Directed Evolution of Proteases
2026-08-04, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/72559
PMID:42612041
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研究论文 | 本文介绍了一种优化的酵母表面展示工作流程，用于蛋白酶的直接进化，通过荧光激活细胞分选（FACS）筛选高特异性蛋白酶变体。 | 提出了一种优化的分步协议，包括DNA插入文库和底物盒的设计、高效电转化（转化效率高达每微克DNA 10个转化子）、多轮FACS富集和测序，并演示了将TEV蛋白酶从天然底物进化到新底物的过程。 | 信息不足，未明确提及局限性。 | 通过直接进化工程化蛋白酶，使其具有对非天然底物序列的高特异性，应用于生物技术、医学和合成生物学。 | 蛋白酶变体，特别是烟草蚀刻病毒核内蛋白酶A（TEVp）。 | 合成生物学 | NA | 酵母表面展示、FACS、电转化、DNA测序 | NA | 序列数据、流式细胞术数据 | 使用酵母细胞文库，具体数量未提及。 | CRISPR-Cas9 | 酿酒酵母（S. cerevisiae） | 基因电路设计涉及底物盒的构建，包含融合蛋白和信号肽序列。 | 生物技术, 医学, 工业生物学 |
| 11 | 2026-09-10 |
Design and optimization of a kinase-controlled allosteric switch
2026-Aug, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-026-03163-1
PMID:42481857
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研究论文 | 本文设计并优化了一种由激酶控制的变构开关，使其能够响应磷酸化信号，从而调控转录输出 | 利用工程化变构技术，将激酶FRET生物传感器架构应用于磷酸化控制蛋白开关的设计，实现了20倍的磷酸化依赖性转录输出变化，且具有可推广性 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 开发一种通用的基于激酶响应的合成生物学工具，用于生物传感和合成生物学应用 | ERK控制的转录因子，哺乳动物发育类器官 | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程，FRET | NA | 生物数据 | NA | NA | 哺乳动物细胞 | 磷酸化控制的变构开关 | 合成生物学，生物传感 |
| 12 | 2026-09-09 |
Microbial Metabolites as Systemic Signaling Molecules: Integrating Metabolism, Immunity, and Organ Crosstalk in Health and Disease
2026-Aug-28, Current pharmaceutical design
IF:2.6Q2
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综述 | 本文综述了肠道微生物代谢物作为系统信号分子在宿主代谢、免疫和器官串扰中的关键作用，并探讨了基于这些代谢物的治疗策略及其临床转化挑战 | 强调微生物代谢物作为系统信号分子的整合作用，提出结合多组学技术、人工智能和精准微生物组干预以开发个性化治疗策略 | 对微生物代谢物的机制理解、标准化、安全性及临床转化仍存在重大挑战 | 探讨微生物代谢物在健康和疾病中的系统调控作用及治疗潜力 | 肠道微生物代谢物、宿主生理和代谢过程、慢性疾病 | 微生物组学、代谢组学 | 肥胖、2型糖尿病、非酒精性脂肪肝病、心血管疾病、癌症、自身免疫性疾病、神经系统疾病 | 多组学技术、人工智能 | NA | 文本 | NA | 合成生物学方法 | 肠道微生物 | NA | 医学 |
| 13 | 2026-09-06 |
Autonomous intranasal delivery systems for central nervous system therapeutics
2026-Aug, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-026-01781-5
PMID:42543397
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综述 | 本文综述了用于中枢神经系统治疗的自控式鼻内给药系统的最新进展，重点介绍了合成纳米颗粒、细胞外囊泡和活体治疗药物等载体如何通过模块化设计和宿主响应互动实现自主的鼻脑通路药物递送 | 提出了结合纳米技术和合成生物学构建自主可编程的鼻内给药载体，并强调了模块化功能组件、宿主响应互动与编程功能的整合，以实现递送自主性和治疗效力 | 摘要中未提及具体局限性 | 总结并分析现有鼻内给药载体策略，以推动中枢神经系统疾病的治疗平台发展 | 自控式鼻内给药载体，包括合成纳米颗粒、细胞外囊泡和活体治疗药物（如工程微生物、病毒或干细胞） | 纳米医学、合成生物学 | 神经系统疾病 | 基因工程、纳米技术 | NA | NA | NA | 基因工程技术（未具体说明工具，如CRISPR） | 微生物、病毒、干细胞 | 用于精确货物生产的基因编程闭环 | 医学、药物治疗 |
| 14 | 2026-09-05 |
Metabolic engineering of Taxus chinensis suspension cell lines for overproduction of paclitaxel reveals insights into pathway regulation
2026-Aug-22, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2026.102524
PMID:42628595
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研究论文 | 本文通过代谢工程改造红豆杉悬浮细胞系，过表达紫杉醇生物合成途径中的四个关键基因，显著提高紫杉醇产量，并揭示了途径调控机制 | 首次在红豆杉植物细胞培养中通过遗传工程方法过表达多个紫杉醇合成途径基因，发现DBAT是调控紫杉醇及其他紫杉烷类化合物合成的关键限速步骤，并揭示了途径基因的协同激活模式 | 研究主要集中于特定细胞系和所选基因，可能未涵盖全部调控因素，且过表达DBAT导致紫杉烷杂质增加，需进一步优化以降低杂质 | 通过代谢工程和合成生物学手段优化红豆杉植物细胞培养，以提高紫杉醇产量并理解途径调控机制 | 红豆杉（Taxus chinensis）悬浮细胞系 | 代谢工程 | 癌症 | 基因过表达 | NA | 基因表达数据 | 四种转基因红豆杉细胞系 | 农杆菌介导转化 | 红豆杉（Taxus chinensis） | 紫杉醇生物合成途径的基因过表达 | 医药 |
| 15 | 2026-09-05 |
Scientometric analysis of mycosporine-like amino acids from 1989 to 2025: Current trends and applications
2026-Aug-22, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2026.135690
PMID:42632472
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研究论文 | 对1989年至2025年间类菌孢素氨基酸研究的科学计量分析，揭示其发展趋势、研究主题和应用前景 | 首次对类菌孢素氨基酸研究进行全面的科学计量分析，覆盖1989至2025年，识别出四个研究主题并指出合成生物学和组学方法的新兴趋势 | 数据仅来源于Web of Science核心合集，可能遗漏其他数据库中的相关文献 | 评估类菌孢素氨基酸研究的全球发展态势，绘制知识结构图，并为其商业化发展提供路线图 | 类菌孢素氨基酸相关的研究文献 | 科学计量学 | NA | 科学计量分析 | NA | 文献数据 | 859篇文献 | NA | NA | NA | 海洋生物学, 生物化学, 环境科学, 生物技术, 医学 |
| 16 | 2026-09-05 |
[Pharmacological effects, biosynthesis, and production of coumarin compounds: a review]
2026-Aug, Zhongguo Zhong yao za zhi = Zhongguo zhongyao zazhi = China journal of Chinese materia medica
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综述 | 本文综述了香豆素类化合物的药理作用、生物合成途径及生物制造方法，并重点介绍了提高香豆素产量的策略。 | 系统总结了基于定向进化的酶工程、代谢工程和发酵工程在提高香豆素产量中的应用策略。 | 未提及具体限制。 | 为香豆素的绿色、高效和可持续生产提供重要参考，促进新型香豆素类药物开发。 | 香豆素类化合物 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 药物开发 |
| 17 | 2026-09-04 |
Navigating regulatory fragmentation in the convergence of synthetic biology, artificial intelligence, and automation
2026-08-29, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-77338-x
PMID:42668325
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研究论文 | 本文分析了合成生物学、人工智能和自动化融合（SynBioxAI）领域面临的监管碎片化问题，并提出一个七透镜的制度框架（RIOT）以帮助研究机构高效、透明地应对监管分歧 | 首次对SynBioxAI融合领域的监管格局进行跨十六国的全面分析，并提出监管摩擦是乘性而非加性的观点，同时开发了实用的RIOT框架 | 由于本文为政策分析类研究，未涉及具体的实验或技术验证，其局限性可能在于框架的实际应用效果尚未经过实证检验 | 探讨合成生物学、人工智能和自动化融合领域监管碎片化带来的挑战，并提出解决方案 | 十六国的监管框架以及七个现实合作场景中的SynBioxAI研究活动 | 政策分析 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 文本 | 十六个国家及七个合作场景 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 生物安全、人工智能治理、出口管制、数据主权 |
| 18 | 2026-09-04 |
Peptide barcoding: an alternative to the phenotype-genotype problem
2026-Aug-23, New biotechnology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.nbt.2026.08.007
PMID:42633869
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综述 | 综述了肽条形码技术的最新进展及其在结合亲和力筛选、脂质纳米颗粒、mRNA非翻译区和设计蛋白文库等领域的应用，并讨论了条形码设计、文库构建和质谱方法中的关键挑战 | 提出肽条形码作为基因型-表型映射的概念转变，强调其在AI驱动的蛋白质工程、递送技术和合成生物学中的重要作用 | 未详细说明 | 总结肽条形码技术的进展并展望其在蛋白质工程和合成生物学中的应用前景 | 肽条形码技术及其在蛋白质和文库筛选中的应用 | 合成生物学 | NA | 质谱 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学, 医学 |
| 19 | 2026-09-04 |
Uniform Microscale Thermoresponsive Liposomes for Controlled Release Above Body Temperature
2026-08, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.74496
PMID:42434866
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研究论文 | 本文提出了一种利用电晕放电处理的PDMS双乳液装置规模化制备单分散热响应脂质体的方法，实现了在高于体温（约41-45°C）时的触发释放。 | 首次实现了可规模化生产均匀热响应脂质体，这些脂质体在高于体温时发生突然释放，解决了现有方法中生物相容性差、响应慢和不可扩展的问题。 | 未提及具体局限性。 | 开发一种可扩展的方法，用于生成在体温以上激活的均匀热敏脂质体，以用于药物递送、生物传感和合成生物学。 | 热响应脂质体及其释放行为。 | 纳米技术 | NA | 双乳液微流控、溶剂萃取 | NA | 实验数据 | 涉及不同厚度的脂质体样本，具体数量未说明。 | NA | NA | 热响应脂质体释放系统 | 医学、生物技术 |
| 20 | 2026-09-03 |
Reprogramming RNA Degraders as Intracellular Molecule Sensors for Tumor Cell Sensing and Manipulation
2026-Aug-28, ACS sensors
IF:8.2Q1
DOI:10.1021/acssensors.6c01983
PMID:42681980
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研究论文 | 本文介绍了一种名为TRADER的可编程平台，通过重编程RNA降解酶，实现细胞内分子触发的转基因表达，用于肿瘤细胞感知与调控 | 首次利用催化失活的Cas6与工程化RNase（barnase）融合构建邻近依赖性RNA降解系统，并通过miRNA或蛋白酶两种机制解除抑制，以及正反馈环路实现信号放大，实现细胞内分子的特异性感应与细胞操控 | 摘要未提供明显局限性信息 | 开发一种模块化平台，实现细胞内分子触发的转基因表达，用于细胞状态监测和功能调控 | 肿瘤细胞及细胞内miRNA、ATP、组织蛋白酶B | 合成生物学、细胞治疗 | 肿瘤 | RNA降解、转基因表达 | NA | 实验数据 | NA | 蛋白质工程 | 哺乳动物细胞 | 正反馈环路，RNA降解系统 | 医学、合成生物学 |