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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-08-07 |
Fungal biodiversity and oxidative enzymes: nature-based solutions for lignin degradation and circular economy applications
2026-Aug-06, Preparative biochemistry & biotechnology
IF:2.0Q3
DOI:10.1080/10826068.2026.2690415
PMID:42557892
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综述 | 本文系统综述了真菌氧化酶在木质素降解中的应用,涵盖酶结构、催化机制、协同作用及工业转化前景。 | 整合了真菌木质素降解系统的多样性、酶工程和合成生物学进展,并建立与循环生物经济的直接联系。 | 未提及具体实验数据或量化比较,依赖已有文献,缺乏实际工业案例的深度分析。 | 探讨真菌氧化酶用于木质素降解和生物质转化的可持续工业生物技术解决方案。 | 真菌氧化酶,包括木质素过氧化物酶、锰过氧化物酶、多功能过氧化物酶、漆酶及辅助氧化酶。 | 工业生物技术 | NA | 蛋白质工程、定向进化、异源表达、固定化酶系统、合成生物学、人工智能辅助酶优化 | NA | 文献综述 | NA | CRISPR-Cas9, 定向进化, 异源表达 | 真菌 | 木质素降解途径 | 工业生物技术, 环境, 能源, 材料 |
| 2 | 2026-08-07 |
Programmable short peptide condensates with intrinsic enzyme-like activity
2026-Aug-05, Journal of materials chemistry. B
DOI:10.1039/d6tb00685j
PMID:42478940
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研究论文 | 本研究通过短肽共组装构建具有内在酶样催化活性的可编程肽基凝聚物,实现选择性富集底物并促进水解反应 | 首次通过短肽共组装策略将催化功能直接编码到凝聚物形成单元中,赋予凝聚物内在酶样活性,无需外部酶或模拟物封装 | 尚未明确催化活性对局部环境(如pH、温度)的敏感性和长期稳定性,且应用范围有待进一步验证 | 开发一种生物启发的策略来构建具有内在催化功能的可编程肽基凝聚物,模拟天然催化性生物分子凝聚物 | 短肽共组装形成的液态凝聚物(组氨酸标记短肽与三苯丙氨酸基肽) | 合成生物学 | NA | 液相-液相相分离 | NA | 实验数据(包括相分离观察、催化活性测定) | NA | NA | NA | 用于催化水解反应的肽基凝聚物作为生物传感器或仿生反应器 | 合成生物学 |
| 3 | 2026-08-07 |
Interactions between fungi, algae, and bacteria: multispecies engineered living materials leverage function and structure
2026-Aug-05, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2026.102806
PMID:42556013
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综述 | 本文综述了真菌、藻类和细菌之间的自然相互作用,并探讨如何利用这些相互作用设计基于丝状真菌作为结构骨架的多物种工程活材料(ELMs),以引入动态功能。 | 提出利用多物种联合体(真菌、细菌和藻类)构建工程活材料,结合合成生物学和光合作用特性,解决单物种ELM功能有限的问题。 | 未详细讨论具体实验数据,主要基于已有研究综述,且多物种系统的稳定性和可控性仍是挑战。 | 探讨真菌、藻类和细菌之间的相互作用如何用于设计和实施工程活材料,并分析其在工业过程(如废水处理和生物技术生产)中的应用及未来前景。 | 真菌、藻类、细菌及其相互作用,特别是在工程活材料中的应用。 | 合成生物学、材料科学 | NA | NA | NA | 文本(综述文献) | NA | 合成生物学 | 丝状真菌 | NA | 环境、工业生物技术 |
| 4 | 2026-08-07 |
Life beyond 6,000 genes: From sequence to synthesis in a post-genomics era
2026-Aug-05, FEMS yeast research
IF:2.4Q3
DOI:10.1093/femsyr/foag034
PMID:42556387
|
综述 | 本文回顾了酿酒酵母基因组测序三十年来对现代生物学的影响,并展望了后基因组时代合成基因组学、人工智能和生物电子学在酵母工程中的未来趋势。 | 将测序成就与合成基因组学(如Sc2.0项目)及AI和生物电子学的新兴趋势相结合,提出了对酵母基因组学未来的展望。 | 未提供 | 庆祝酵母基因组测序项目成就,并探讨基因组学如何从描述性资源演变为工程生物学的核心基础设施,以及未来发展方向。 | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)及其基因组 | 基因组学、合成生物学 | 未提供 | 基因组测序、功能基因组学、系统生物学、合成基因组学 | 未提供 | 基因组序列数据 | 未提供 | 未提供 | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae) | 未提供 | 生物技术、工业生物技术 |
| 5 | 2026-08-07 |
Cascading Attrition of In Vivo CAR-T Therapy: From Systemic Delivery Failure to Functional Collapse
2026-Aug-05, Critical reviews in oncology/hematology
DOI:10.1016/j.critrevonc.2026.105521
PMID:42556595
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综述 | 本文综述了体内CAR-T疗法从系统递送失败到功能崩溃的级联损耗过程,并探讨了通过合成生物学工具实现精确导航的策略。 | 提出通过理性整合合成生物学工具(如免疫隐身表面、逻辑门控电路)实现确定性设计,而非被动增加剂量,以克服体内复杂微环境中的随机失败级联。 | 尚需临床验证,且体内微环境的复杂性可能限制工程化设计的实际效果。 | 探讨体内CAR-T疗法的递送障碍及其克服策略,以推动其临床应用。 | 体内CAR-T细胞疗法的递送系统(包括慢病毒载体和脂质纳米颗粒)及内源性T细胞。 | 生物工程 | 恶性血液肿瘤、实体瘤、自身免疫疾病 | 慢病毒载体、脂质纳米颗粒、合成生物学工具 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, 逻辑门控电路(合成生物学工具) | T细胞 | 免疫隐身表面、逻辑门控电路 | 医学 |
| 6 | 2026-08-07 |
Engineering programmable floating wetlands: synthetic biology, sensing, and AI control for water quality
2026-Aug-03, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2026.135561
PMID:42546780
|
综述 | 本文综述了浮动处理湿地的生物强化证据,探讨了通过合成生物学、传感和AI控制提升水质处理性能的途径,并提出了可编程浮动湿地的转化路线图 | 提出了将合成生物学、传感和AI控制集成到浮动处理湿地中的可测试转化路线图,并引入了报告和治理指标以确保负责任部署 | 未明确阐述,但指出了某些污染物的破坏性转化难以实现,以及翻译过程中存在菌群逆转、抑制性中间产物等失败模式 | 评估浮动处理湿地的性能限制,并提出通过生物强化、工程改造和智能控制实现可编程水处理的策略 | 浮动处理湿地及其相关湿地的植物-微生物联合体、生物膜、微生物燃料电池和电化学过程 | 环境工程、合成生物学 | NA | 多组学、生物强化、微生物燃料电池、电化学氧化、电絮凝 | NA | 综述文献数据 | NA | CRISPR-Cas9、合成生物学工具 | 植物、微生物联合体 | 生物传感器、逻辑门、代谢通路 | 环境、水处理 |
| 7 | 2026-08-07 |
Mechanism underlying the high regulatory performance of the doxycycline riboswitch G12
2026-Aug-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-76256-2
PMID:42547503
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研究论文 | 本文鉴定并表征了名为G12的多西环素结合适体,该适体在酵母和人类细胞中表现出高调控性能,并揭示了其调控机制。 | 通过RNA Capture-SELEX技术富集配体响应性构象切换的适体,首次鉴定出G12适体,其具有低纳摩尔亲和力和高动态范围调控能力,并揭示了其折叠中间体的稳定机制。 | 未提及具体局限性。 | 探究合成核糖开关的调控机制并提升其性能,扩展合成生物学工具箱。 | 多西环素结合适体G12及其在酵母和人类细胞中的调控行为。 | 合成生物学 | NA | RNA Capture-SELEX, NGS, 单分子力谱, 停流荧光光谱, 化学探针 | NA | 序列数据, 荧光光谱数据, 力谱数据 | NA | NA | 酿酒酵母, 人类细胞 | 多西环素响应性核糖开关 | 医学, 工业生物技术 |
| 8 | 2026-08-07 |
Bacteriophage P22 Virus-Like Particles as Nanoscale Protein Scaffolds for Plant Synthetic Biology
2026-Aug-03, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70735
PMID:42547846
|
研究论文 | 本文首次在真核生物中展示了肠杆菌噬菌体P22病毒样颗粒作为植物合成生物学纳米级蛋白质支架的可行性,通过在本氏烟草中瞬时表达验证了其组装、货物封装及外部蛋白展示功能 | 首次在植物中表达P22 VLP,并证明其能在真核生物中正确组装和封装重组蛋白,同时通过SpyTag/SpyCatcher系统实现货物封装与外部展示的同步编程 | 摘要未提及具体局限性,可能需要进一步研究P22 VLP在植物中长期表达的稳定性和效率 | 探索P22病毒样颗粒作为植物合成生物学的新型蛋白质工程支架,扩展植物中蛋白质工程工具的可用性 | 肠杆菌噬菌体P22病毒样颗粒、本氏烟草(Nicotiana benthamiana)、重组蛋白货物 | 合成生物学 | NA | 瞬时表达、蛋白质共封装、SpyTag/SpyCatcher介导的蛋白质缀合 | NA | 蛋白质数据 | 未明确说明样本量,涉及本氏烟草植物的瞬时表达实验 | NA | 本氏烟草(Nicotiana benthamiana) | P22病毒样颗粒支架,用于货物封装和外部蛋白展示 | 植物合成生物学 |
| 9 | 2026-08-07 |
Harnessing human tumor organoids for cancer modeling and precision therapy
2026-Aug-01, Protein & cell
IF:13.6Q1
DOI:10.1093/procel/pwag007
PMID:41698840
|
综述 | 本文综述了人类肿瘤类器官在癌症建模和精准治疗中的应用,涵盖类器官的生成、技术进展、临床应用及未来发展方向。 | 强调了类器官作为动态“活体生物传感器”的潜力,并整合了合成生物学、功能基因组学和机器学习等前沿技术。 | 完全模拟肿瘤微环境仍然困难,尤其是在复制血管复杂性和全身免疫反应方面。 | 探讨人类肿瘤类器官作为功能性精准医学工具,架起基础研究与临床转化之间的桥梁。 | 人类肿瘤类器官,包括患者来源的类器官、基因工程平台以及共培养系统。 | 生物医学 | 癌症 | 类器官培养、共培养系统、类器官芯片、三维生物打印、人工智能分析、合成生物学、功能基因组学 | 类器官模型 | 基因、图像、药物反应数据 | 不适用(综述文章) | CRISPR-Cas9(基因工程) | 人类 | 不适用(主要通过基因工程平台构建类器官,未详细描述特定电路) | 医学 |
| 10 | 2026-08-07 |
Peptide-Ligand Cooperative Interplay Drives Gold Nanoparticle Encapsulation by Protein Cages
2026-Aug, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.73690
PMID:42093323
|
研究论文 | 本研究结合实验与分子动力学模拟,揭示了金纳米颗粒被 encapsulin 蛋白笼封装过程中肽-配体协同作用对封装效率和盐浓度依赖性的分子机制 | 首次从分子层面阐明了配体与肽段在金纳米颗粒封装中的协同效应,通过自由能景观分析解释了不同盐浓度下的封装行为差异 | 研究主要聚焦于初始结合阶段,未涵盖封装后续步骤及体内应用验证 | 理解并指导生物启发的纳米笼用于选择性递送和模板合成 | encapsulin 蛋白笼与金纳米颗粒的相互作用 | 合成生物学 | NA | 分子动力学模拟 | NA | 实验数据及模拟数据 | 未明确样本数量,涉及不同盐浓度和配体功能化条件 | NA | NA | NA | 医学, 工业生物技术 |
| 11 | 2026-08-07 |
From design-build-test-learn cycles to AI-driven digital twins for bioprocess scale-up in the Genesis Mission era
2026-Aug, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2026.103516
PMID:42190350
|
评论 | 本文讨论了Genesis Mission倡议下,将合成生物学与人工智能结合以加速生物生产,并指出了AI驱动生物技术发展中的挑战与机遇 | 提出将AI驱动的数字孪生技术与设计-构建-测试-学习循环相结合,以解决生物过程放大中的不确定性 | 未提供具体的实验数据或案例研究,仅从概念层面进行探讨 | 探讨如何利用AI和数字孪生技术优化生物制造过程,促进工业规模的应用 | 微生物菌株、生物反应器操作和生物制造过程 | 机器学习 | NA | NA | 迁移学习、强化学习、贝叶斯优化 | 实时数据、文献数据 | NA | NA | 微生物 | NA | 工业生物技术 |
| 12 | 2026-08-07 |
Emergent bioengineering
2026-Aug, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2026.103520
PMID:42235106
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研究论文 | 本文探讨了利用合成生物学改造现有生态系统,以增强其恢复力并防止突变,提出从经典工程向涌现工程设计的范式转变 | 提出了一种从经典工程到涌现工程的设计哲学转变,强调适应、反馈和多尺度复杂性作为生态系统设计的基础 | 未提供具体的实验结果或案例研究,主要基于理论探讨 | 探讨合成生物学在生态系统工程中的应用,以及如何实现可控且可持续的生态干预 | 现有生态系统及其中的生物群落 | 合成生物学 | 不适用 | 合成生物学 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 生态系统工程中的合成生物电路设计 | 环境 |
| 13 | 2026-08-07 |
Harnessing natural variation for photosynthetic improvement in next-generation crop breeding
2026-Aug, Journal of integrative plant biology
IF:9.3Q1
DOI:10.1111/jipb.70317
PMID:42290551
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综述 | 本文综述了自然遗传变异在光合作用改进中的应用,探讨了从生理、发育到冠层尺度的光合性状变异、分子调控机制、光合效率与产量形成的关系,以及合成生物学和光合遗传工程的策略,为下一代作物育种提供框架。 | 整合了自然遗传变异与合成生物学方法,强调利用光合性状的自然多样性作为育种资源,并提出了跨尺度(生理、发育、冠层)的综合分析框架。 | 未提供具体实验数据,主要基于文献综述,可能缺乏实证验证。 | 探讨如何利用自然遗传变异和现代生物技术优化光合作用,以提高作物产量潜力和气候适应性。 | 作物光合性状及相关遗传资源。 | 植物科学 | NA | NA | NA | 文献资料 | NA | 合成生物学技术(未具体指明工具) | 作物(如水稻、小麦等,未具体指明) | 光合作用相关遗传工程路径(如碳固定途径优化) | 农业 |
| 14 | 2026-08-07 |
Engineered diazotrophs with host-inducible nitrogen supply systems: Transforming rice farming through innovative nitrogen biofertilizers
2026-Aug, Journal of integrative plant biology
IF:9.3Q1
DOI:10.1111/jipb.70320
PMID:42367143
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综述 | 本文综述了通过改造具有宿主诱导氮供应系统的联合固氮菌,将其作为创新生物氮肥应用于水稻种植,以减少对工业氮肥依赖的研究进展与前景 | 结合合成生物学和微生物组研究,提出开发氮输出型联合固氮菌和合成微生物群落,并筛选对微生物干预有响应的水稻品种,以实现可持续农业 | 未涉及具体实验验证,缺乏实际田间应用数据 | 探索利用生物固氮替代工业氮肥,提升水稻氮营养和农业可持续性 | 联合固氮菌和水稻品种 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | 联合固氮菌 | 氮供应系统 | 农业 |
| 15 | 2026-08-07 |
Bioinspired Artificial Bioenergetic Organelles: Design Principles, Nanofabrication and Therapeutic Translation
2026-Aug, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.73889
PMID:42377939
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综述 | 本文综述了仿生人工生物能量细胞器的设计原理、纳米制造方法及其在疾病治疗中的应用,重点关注其通过恢复细胞能量稳态来重塑病理微环境的潜力。 | 创新点在于将线粒体和类囊体工程化的生物能量细胞器作为自主代谢模块,不仅作为递送载体,而是主动整合代谢恢复与多靶点治疗作用,以重塑病理微环境。 | 面临靶向递送、免疫兼容性、功能持久性、生物安全性以及长期代谢命运等关键转化挑战。 | 概述人工生物能量细胞器的设计原理、机制基础及疾病特异性应用,并探讨其临床转化的挑战与前景。 | 人工生物能量细胞器,由线粒体和类囊体工程化而来,用于治疗多种疾病。 | 合成生物学 | 肿瘤、心血管疾病、神经退行性疾病、炎症性疾病 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 16 | 2026-08-07 |
Design and optimization of a kinase-controlled allosteric switch
2026-Aug, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-026-03163-1
PMID:42481857
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研究论文 | 本文设计并优化了一种由激酶控制的变构开关,通过工程化变构技术构建磷酸化控制的蛋白质开关,实现快速精确的细胞行为调控 | 利用工程化变构技术将经典激酶FRET生物传感器架构作为设计起点,开发出可调控的磷酸化开关,并优化实现了ERK控制的转录因子,具有20倍的磷酸化依赖性转录输出变化 | 摘要中未明确提及局限性,可能包括对特定激酶的特异性、体内应用的复杂性或稳定性等问题 | 开发一种通用的激酶响应工具平台,用于生物传感和合成生物学应用 | 以变构可控的Gal4转录因子为支架,构建磷酸化控制的蛋白质开关,并应用于ERK控制的转录因子 | 合成生物学 | NA | 工程化变构技术、FRET生物传感器 | NA | 实验数据 | 研究中使用了哺乳动物发育类器官样本,具体数量未提及 | NA | 哺乳动物细胞 | 磷酸化控制的蛋白质开关 | 医学, 合成生物学 |
| 17 | 2026-08-06 |
TolC Is Required for a Mixed-Linkage β-Glucan (MLG) Biosynthesis: Engineering Bacteria for MLG Overproduction
2026-Aug, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.70424
PMID:42552791
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研究论文 | 本研究证明外膜蛋白TolC对苜蓿中华根瘤菌中混合连接β-葡聚糖的生物合成至关重要,并开发了过量生产该聚合物的遗传模块 | 首次发现TolC是MLG生物合成机制的关键组分,提出其与BgsA和BgsB形成三部分复合体,并实现了产物的显著过量生产和跨宿主移植 | TolC与BgsA和BgsB形成三部分复合体的机制仍为推测,缺乏直接实验证据,且未在更大规模或更广泛工业条件下验证 | 阐明MLG生物合成机制并开发提高产量的策略,实现聚合物的规模化生产 | 苜蓿中华根瘤菌(Sinorhizobium meliloti)和日本中生根瘤菌(Mesorhizobium japonicum)等根瘤菌 | 合成生物学 | NA | 基因敲除、基因过表达、生物反应器培养 | NA | 基因序列 | 多个根瘤菌菌株(具体数量未提及) | CRISPR-Cas9 | 苜蓿中华根瘤菌、日本中生根瘤菌 | 生物合成途径(含bgsBA、tolC和pleD*基因模块) | 工业生物技术、材料 |
| 18 | 2026-08-05 |
Phage as a prospective arsenal against superbugs
2026-Aug-04, Molecular biology reports
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s11033-026-12537-9
PMID:42550335
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综述 | 本文全面回顾了噬菌体疗法作为抗生素替代策略的现状,涵盖噬菌体分类、治疗优势、基因工程应用、临床转化流程及主要治疗领域,并讨论了面临的挑战和未来发展方向。 | 整合了现代基因组学分类、基因工程改造、噬菌体-抗生素协同作用等前沿技术,并强调了合成生物学和人工智能在推动噬菌体疗法精准化和适应性中的潜力。 | 临床证据主要来自同情使用和试验,缺乏大规模随机对照试验;监管和商业化障碍尚未解决。 | 评估噬菌体疗法作为应对抗菌素耐药性危机的治疗策略的现状、挑战和未来前景。 | 噬菌体及其衍生蛋白、噬菌体-抗生素组合,用于治疗慢性伤口和肺部感染等疾病。 | 机器学习 | 抗菌素耐药性感染(慢性伤口、肺部感染) | 基因组测序、基因工程 | NA | 文本和临床证据 | NA | CRISPR-Cas9 | 细菌 | 噬菌体基因回路 | 医学, 工业生物技术 |
| 19 | 2026-08-05 |
Abiotic stress sensing in plants: Biochemical and biophysical basis
2026-Aug-03, Molecular plant
IF:17.1Q1
DOI:10.1016/j.molp.2026.05.007
PMID:42141723
|
综述 | 本文综述了植物非生物胁迫感知的生化和生物物理基础,探讨了温度、干旱、盐碱、淹水和土壤压实等胁迫的感知机制,以及钙离子和活性氧等通用信使的整合作用,并展望了未来研究方向。 | 系统整合了植物非生物胁迫感知的生化和生物物理机制,强调了物理与化学环境变化编码和转化为生物信号的分子逻辑,并提出了结合AI建模、单细胞技术、合成生物学和基因组编辑等新兴方法。 | 主要识别了尚未解决的关键问题,如主要胁迫相关线索的鉴定、感知的空间组织、复合胁迫的感知,但未提供具体实验数据。 | 阐明植物非生物胁迫感知的生化和生物物理基础,并指出未来研究方向和新兴工具。 | 植物非生物胁迫感知机制,包括温度、干旱、盐碱、淹水和土壤压实等胁迫。 | 植物生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | 基因组编辑 | 植物 | NA | 农业 |
| 20 | 2026-08-05 |
A minimal four-enzyme suite enables biosynthesis of the C20 diterpenoid alkaloid atisinium
2026-Aug-03, Molecular plant
IF:17.1Q1
DOI:10.1016/j.molp.2026.07.004
PMID:42421322
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研究论文 | 本研究定义了一个由四种酶组成的最小酶套件,可将ent-atiserene转化为C20二萜生物碱atisinium,并揭示了其在乌头属中的生物合成途径。 | 首次阐明了二萜生物碱核心骨架组装的最小四酶套件,包括多功能细胞色素P450和功能新化的短链脱氢酶/还原酶,并实现了异源重构。 | 未提及具体局限性,但可能受限于体内验证的复杂性及异源表达的效率。 | 阐明二萜生物碱核心骨架的生物合成分子机制,并实现其在异源宿主中的重构。 | 露蕊乌头中的二萜生物碱生物合成酶(CYP701A216, CYP71FH3, CYP729G3, AgDAS)及底物ent-atiserene。 | 合成生物学 | NA | 病毒诱导基因沉默、异源表达(烟草和酵母)、细胞色素P450和脱氢酶/还原酶活性分析 | NA | 基因序列、蛋白结构、代谢物谱 | 露蕊乌头植物样本以及烟草和酵母异源表达体系 | 病毒诱导基因沉默 | 烟草、酵母 | 合成途径:四酶级联反应,涉及氧化、自发缩合和还原步骤 | 医药、工业生物技术 |