合成生物学相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['synthetic biology']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价9.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 142 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2026-09-16 |
A Comprehensive Review on the Biosynthesis of Tropane Alkaloids
2026-Aug-23, Molecules (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/molecules31172951
PMID:42738612
|
综述 | 本文全面综述了托烷类生物碱生物合成从前体形成到结构多样终产物的研究进展 | 整合了基因组学、结构生物学和合成生物学的最新进展，重点阐述了催化机制、底物特异性结构决定因素、代谢区室化以及茄科和古柯科中托烷类生物碱生物合成的趋同进化 | 作为综述文章，未提供原始实验数据，且未解决的关键问题仍有待进一步研究 | 全面总结托烷类生物碱生物合成的研究现状，为植物特化代谢、合成生物学和天然产物工程提供更新框架 | 托烷类生物碱及其生物合成途径，包括莨菪碱、东莨菪碱、可卡因和卡利斯特碱 | na | na | 基因组学, 结构生物学, 合成生物学, 代谢工程, 进化生物学 | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 医药, 工业生物技术 |
| 22 | 2026-09-16 |
Amaryllidaceae Alkaloids and Isoquinoline Alkaloids: A Perspective on Historical Approaches to Pathway Elucidation
2026-Aug-22, Plants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/plants15172553
PMID:42739321
|
综述 | 本文比较了异喹啉生物碱和石蒜科生物碱生物合成途径解析的历史与方法学轨迹，从化合物分离、放射性示踪到多组学、功能酶学和异源途径重建 | 系统性对比了异喹啉生物碱与石蒜科生物碱在分类分布、骨架形成化学、途径解析程度和生物技术发展方面的差异，并整合生化逻辑、组学引导发现、酶进化、组织特异性、调控和合成生物学提出未来生物碱途径发现的优先方向 | 石蒜科生物碱中3,4-二羟基苯甲醛的酶促形成机制尚未解析，较少研究的异喹啉生物碱骨架类别的功能验证仍不完整 | 比较异喹啉生物碱和石蒜科生物碱途径解析的历史与方法学轨迹，识别未来生物碱途径发现和可持续生产的优先方向 | 异喹啉生物碱和石蒜科生物碱及其生物合成途径 | 植物代谢组学 | NA | 转录组学, 代谢组学, 功能酶学, 同位素引导活性组织鉴定, 异源途径重建, 放射性示踪实验 | NA | 文本 | NA | NA | NA | 异源生物合成途径重建 | 医药, 工业生物技术 |
| 23 | 2026-09-10 |
Optimized Yeast Surface Display Workflow for Directed Evolution of Proteases
2026-08-04, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/72559
PMID:42612041
|
研究论文 | 本文介绍了一种优化的酵母表面展示工作流程，用于蛋白酶的直接进化，通过荧光激活细胞分选（FACS）筛选高特异性蛋白酶变体。 | 提出了一种优化的分步协议，包括DNA插入文库和底物盒的设计、高效电转化（转化效率高达每微克DNA 10个转化子）、多轮FACS富集和测序，并演示了将TEV蛋白酶从天然底物进化到新底物的过程。 | 信息不足，未明确提及局限性。 | 通过直接进化工程化蛋白酶，使其具有对非天然底物序列的高特异性，应用于生物技术、医学和合成生物学。 | 蛋白酶变体，特别是烟草蚀刻病毒核内蛋白酶A（TEVp）。 | 合成生物学 | NA | 酵母表面展示、FACS、电转化、DNA测序 | NA | 序列数据、流式细胞术数据 | 使用酵母细胞文库，具体数量未提及。 | CRISPR-Cas9 | 酿酒酵母（S. cerevisiae） | 基因电路设计涉及底物盒的构建，包含融合蛋白和信号肽序列。 | 生物技术, 医学, 工业生物学 |
| 24 | 2026-09-10 |
Design and optimization of a kinase-controlled allosteric switch
2026-Aug, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-026-03163-1
PMID:42481857
|
研究论文 | 本文设计并优化了一种由激酶控制的变构开关，使其能够响应磷酸化信号，从而调控转录输出 | 利用工程化变构技术，将激酶FRET生物传感器架构应用于磷酸化控制蛋白开关的设计，实现了20倍的磷酸化依赖性转录输出变化，且具有可推广性 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 开发一种通用的基于激酶响应的合成生物学工具，用于生物传感和合成生物学应用 | ERK控制的转录因子，哺乳动物发育类器官 | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程，FRET | NA | 生物数据 | NA | NA | 哺乳动物细胞 | 磷酸化控制的变构开关 | 合成生物学，生物传感 |
| 25 | 2026-09-09 |
Microbial Metabolites as Systemic Signaling Molecules: Integrating Metabolism, Immunity, and Organ Crosstalk in Health and Disease
2026-Aug-28, Current pharmaceutical design
IF:2.6Q2
|
综述 | 本文综述了肠道微生物代谢物作为系统信号分子在宿主代谢、免疫和器官串扰中的关键作用，并探讨了基于这些代谢物的治疗策略及其临床转化挑战 | 强调微生物代谢物作为系统信号分子的整合作用，提出结合多组学技术、人工智能和精准微生物组干预以开发个性化治疗策略 | 对微生物代谢物的机制理解、标准化、安全性及临床转化仍存在重大挑战 | 探讨微生物代谢物在健康和疾病中的系统调控作用及治疗潜力 | 肠道微生物代谢物、宿主生理和代谢过程、慢性疾病 | 微生物组学、代谢组学 | 肥胖、2型糖尿病、非酒精性脂肪肝病、心血管疾病、癌症、自身免疫性疾病、神经系统疾病 | 多组学技术、人工智能 | NA | 文本 | NA | 合成生物学方法 | 肠道微生物 | NA | 医学 |
| 26 | 2026-09-06 |
Autonomous intranasal delivery systems for central nervous system therapeutics
2026-Aug, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-026-01781-5
PMID:42543397
|
综述 | 本文综述了用于中枢神经系统治疗的自控式鼻内给药系统的最新进展，重点介绍了合成纳米颗粒、细胞外囊泡和活体治疗药物等载体如何通过模块化设计和宿主响应互动实现自主的鼻脑通路药物递送 | 提出了结合纳米技术和合成生物学构建自主可编程的鼻内给药载体，并强调了模块化功能组件、宿主响应互动与编程功能的整合，以实现递送自主性和治疗效力 | 摘要中未提及具体局限性 | 总结并分析现有鼻内给药载体策略，以推动中枢神经系统疾病的治疗平台发展 | 自控式鼻内给药载体，包括合成纳米颗粒、细胞外囊泡和活体治疗药物（如工程微生物、病毒或干细胞） | 纳米医学、合成生物学 | 神经系统疾病 | 基因工程、纳米技术 | NA | NA | NA | 基因工程技术（未具体说明工具，如CRISPR） | 微生物、病毒、干细胞 | 用于精确货物生产的基因编程闭环 | 医学、药物治疗 |
| 27 | 2026-09-05 |
Metabolic engineering of Taxus chinensis suspension cell lines for overproduction of paclitaxel reveals insights into pathway regulation
2026-Aug-22, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2026.102524
PMID:42628595
|
研究论文 | 本文通过代谢工程改造红豆杉悬浮细胞系，过表达紫杉醇生物合成途径中的四个关键基因，显著提高紫杉醇产量，并揭示了途径调控机制 | 首次在红豆杉植物细胞培养中通过遗传工程方法过表达多个紫杉醇合成途径基因，发现DBAT是调控紫杉醇及其他紫杉烷类化合物合成的关键限速步骤，并揭示了途径基因的协同激活模式 | 研究主要集中于特定细胞系和所选基因，可能未涵盖全部调控因素，且过表达DBAT导致紫杉烷杂质增加，需进一步优化以降低杂质 | 通过代谢工程和合成生物学手段优化红豆杉植物细胞培养，以提高紫杉醇产量并理解途径调控机制 | 红豆杉（Taxus chinensis）悬浮细胞系 | 代谢工程 | 癌症 | 基因过表达 | NA | 基因表达数据 | 四种转基因红豆杉细胞系 | 农杆菌介导转化 | 红豆杉（Taxus chinensis） | 紫杉醇生物合成途径的基因过表达 | 医药 |
| 28 | 2026-09-05 |
Scientometric analysis of mycosporine-like amino acids from 1989 to 2025: Current trends and applications
2026-Aug-22, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2026.135690
PMID:42632472
|
研究论文 | 对1989年至2025年间类菌孢素氨基酸研究的科学计量分析，揭示其发展趋势、研究主题和应用前景 | 首次对类菌孢素氨基酸研究进行全面的科学计量分析，覆盖1989至2025年，识别出四个研究主题并指出合成生物学和组学方法的新兴趋势 | 数据仅来源于Web of Science核心合集，可能遗漏其他数据库中的相关文献 | 评估类菌孢素氨基酸研究的全球发展态势，绘制知识结构图，并为其商业化发展提供路线图 | 类菌孢素氨基酸相关的研究文献 | 科学计量学 | NA | 科学计量分析 | NA | 文献数据 | 859篇文献 | NA | NA | NA | 海洋生物学, 生物化学, 环境科学, 生物技术, 医学 |
| 29 | 2026-09-05 |
[Pharmacological effects, biosynthesis, and production of coumarin compounds: a review]
2026-Aug, Zhongguo Zhong yao za zhi = Zhongguo zhongyao zazhi = China journal of Chinese materia medica
|
综述 | 本文综述了香豆素类化合物的药理作用、生物合成途径及生物制造方法，并重点介绍了提高香豆素产量的策略。 | 系统总结了基于定向进化的酶工程、代谢工程和发酵工程在提高香豆素产量中的应用策略。 | 未提及具体限制。 | 为香豆素的绿色、高效和可持续生产提供重要参考，促进新型香豆素类药物开发。 | 香豆素类化合物 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 药物开发 |
| 30 | 2026-09-04 |
Navigating regulatory fragmentation in the convergence of synthetic biology, artificial intelligence, and automation
2026-08-29, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-77338-x
PMID:42668325
|
研究论文 | 本文分析了合成生物学、人工智能和自动化融合（SynBioxAI）领域面临的监管碎片化问题，并提出一个七透镜的制度框架（RIOT）以帮助研究机构高效、透明地应对监管分歧 | 首次对SynBioxAI融合领域的监管格局进行跨十六国的全面分析，并提出监管摩擦是乘性而非加性的观点，同时开发了实用的RIOT框架 | 由于本文为政策分析类研究，未涉及具体的实验或技术验证，其局限性可能在于框架的实际应用效果尚未经过实证检验 | 探讨合成生物学、人工智能和自动化融合领域监管碎片化带来的挑战，并提出解决方案 | 十六国的监管框架以及七个现实合作场景中的SynBioxAI研究活动 | 政策分析 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 文本 | 十六个国家及七个合作场景 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 生物安全、人工智能治理、出口管制、数据主权 |
| 31 | 2026-09-04 |
Peptide barcoding: an alternative to the phenotype-genotype problem
2026-Aug-23, New biotechnology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.nbt.2026.08.007
PMID:42633869
|
综述 | 综述了肽条形码技术的最新进展及其在结合亲和力筛选、脂质纳米颗粒、mRNA非翻译区和设计蛋白文库等领域的应用，并讨论了条形码设计、文库构建和质谱方法中的关键挑战 | 提出肽条形码作为基因型-表型映射的概念转变，强调其在AI驱动的蛋白质工程、递送技术和合成生物学中的重要作用 | 未详细说明 | 总结肽条形码技术的进展并展望其在蛋白质工程和合成生物学中的应用前景 | 肽条形码技术及其在蛋白质和文库筛选中的应用 | 合成生物学 | NA | 质谱 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学, 医学 |
| 32 | 2026-09-04 |
Uniform Microscale Thermoresponsive Liposomes for Controlled Release Above Body Temperature
2026-08, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.74496
PMID:42434866
|
研究论文 | 本文提出了一种利用电晕放电处理的PDMS双乳液装置规模化制备单分散热响应脂质体的方法，实现了在高于体温（约41-45°C）时的触发释放。 | 首次实现了可规模化生产均匀热响应脂质体，这些脂质体在高于体温时发生突然释放，解决了现有方法中生物相容性差、响应慢和不可扩展的问题。 | 未提及具体局限性。 | 开发一种可扩展的方法，用于生成在体温以上激活的均匀热敏脂质体，以用于药物递送、生物传感和合成生物学。 | 热响应脂质体及其释放行为。 | 纳米技术 | NA | 双乳液微流控、溶剂萃取 | NA | 实验数据 | 涉及不同厚度的脂质体样本，具体数量未说明。 | NA | NA | 热响应脂质体释放系统 | 医学、生物技术 |
| 33 | 2026-09-02 |
Methylotrophic yeast engineering for secreted protein production via precision fermentation: food ingredient proteins and synthetic biology strategies
2026-Aug-29, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2026.102532
PMID:42668082
|
综述 | 本文综述了甲基营养型酵母在精密发酵中用于生产食品蛋白质成分的工程化进展，重点关注Komagataella phaffii，并讨论了合成生物学和代谢工程策略。 | 系统梳理了甲基营养型酵母在食品蛋白生产中的应用，特别聚焦于基因组工程、基因表达工具、蛋白分泌途径工程和糖基化工程，以满足产量和质量的双重目标。 | 未提及具体实验数据或定量比较，可能缺乏对实际生产挑战的深入分析。 | 探讨甲基营养型酵母在食品蛋白生产中的工程化策略，以提升分泌效率和时空产量。 | 甲基营养型酵母，特别是Komagataella phaffii。 | 合成生物学 | NA | 基因组工程、基因表达工具 | NA | 文献数据、文本 | NA | NA | Komagataella phaffii | 蛋白分泌途径工程、糖基化工程 | 食品工业 |
| 34 | 2026-09-02 |
[Construction and practice of a talent training model for synthetic biology]
2026-Aug-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.260172
PMID:42638071
|
研究论文 | 本文探讨了江南大学在合成生物学人才培养模式上的改革措施，包括课程体系、实践教育体系及数字化平台建设 | 创新性地提出了跨学科融合、工程实践导向和数字化智能化驱动的合成生物学人才培养范式 | 未提及具体局限性 | 总结江南大学合成生物学专业及人才培养模式的改革举措，为同类院校提供参考 | 江南大学合成生物学专业的人才培养体系 | 教育 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 教育 |
| 35 | 2026-08-31 |
Self-sufficient killing of malignant tumors by an engineered cancer-selective gene circuit
2026-Aug-18, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2026.102936
PMID:42492518
|
研究论文 | 该论文介绍了一种通过工程化基因电路选择性杀死恶性肿瘤细胞的方法，该电路利用机器学习指导的随机森林框架开发出癌症选择性启动子，并在腺病毒载体中实现肿瘤限制性复制和长期肿瘤抑制。 | 创新点在于利用机器学习指导的随机森林框架设计癌症选择性启动子，该启动子仅在ETS转录因子过表达或基因融合事件中激活，而在正常组织中保持沉默，实现了严格意义上的癌症特异性。 | 论文摘要未明确提及研究局限性。 | 开发一种能够选择性消除肿瘤细胞的基因治疗策略，克服合成生物学和溶瘤病毒疗法的关键障碍。 | ETS转录因子过表达或基因融合的癌细胞，以及携带转移性肺肿瘤的小鼠模型。 | 合成生物学、机器学习、肿瘤学 | 肺癌 | 基因电路工程、腺病毒载体递送 | 随机森林 | 基因组数据、实验数据 | 小鼠模型（具体数量未提及） | 未提及 | 小鼠 | 癌症选择性基因电路，包含癌症选择性启动子P，用于驱动腺病毒复制。 | 医学、肿瘤治疗 |
| 36 | 2026-08-31 |
Synthetically engineered probiotic suppresses colorectal cancer via inhibition of Wnt/β-catenin signaling
2026-Aug-18, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2026.102913
PMID:42612617
|
研究论文 | 该论文开发了一种合成生物学改造的益生菌，通过抑制Wnt/β-catenin信号通路来治疗结直肠癌，并实现了非侵入性诊断和靶向治疗的结合 | 首次利用鸟氨酸响应性生物发光报告系统和局部释放DKK3的工程益生菌，将诊断与治疗功能整合于单一平台，并在多种临床前模型及患者来源类器官和异种移植模型中验证了其抗癌疗效 | 摘要未提及具体的局限性，如潜在的安全性、长期疗效或临床转化障碍 | 开发一种基于工程益生菌的结直肠癌诊断和治疗平台，通过抑制Wnt/β-catenin信号通路以减缓肿瘤生长，并改善患者预后 | 结直肠癌小鼠模型、结直肠癌患者、工程化大肠杆菌Nissle 1917（EcN） | 合成生物学、肿瘤学 | 结直肠癌 | 粪便代谢组学分析、基因工程改造细菌 | 生物发光报告系统、基因表达系统 | 代谢组学数据、临床前模型数据（小鼠模型、患者来源类器官和异种移植模型） | 涉及结直肠癌小鼠模型和患者样本，具体数量未提及 | 基因工程技术 | 大肠杆菌Nissle 1917（EcN） | 鸟氨酸响应性生物发光报告系统；局部释放Dickkopf 3（DKK3）的基因回路 | 医学、预防肿瘤学 |
| 37 | 2026-08-31 |
Chemical Synthesis of Mirror-Image Proteins Reveals Chirality-Dependent Cellular Uptake Mediated by a Cell-Penetrating Peptide
2026-08-12, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.6c03792
PMID:42307060
|
研究论文 | 通过化学合成镜像蛋白，揭示了细胞穿透肽介导的细胞摄取具有手性依赖性 | 首次系统性地研究货物手性对细胞摄取的影响，同时保持递送载体恒定，发现天然L型货物比镜像D型货物更易被细胞摄取 | 未明确提及研究的局限性 | 探究镜像肽和蛋白质的细胞内摄取效率与天然L-形式相比的情况 | 三种不同大小和结构复杂性的模型货物，包括L型和D型构型，以及环状十精氨酸细胞穿透肽 | 化学生物学 | 不适用 | 化学合成、流式细胞术、凝胶分析、共聚焦显微镜 | 不适用 | 细胞图像、流式细胞术数据 | 多种哺乳动物细胞系 | 化学合成 | 哺乳动物细胞 | 不适用 | 医学、合成生物学 |
| 38 | 2026-06-28 |
Better synthetic biology outcomes through balanced push-pull engineering
2026-Aug-04, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiag437
PMID:42361298
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 39 | 2026-08-30 |
Revisiting plant-microbe interaction mechanisms for developing efficient biostimulants
2026-Aug-28, Folia microbiologica
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s12223-026-01575-2
PMID:42663807
|
综述 | 本文综述了根际通讯和根系分泌物介导的信号机制，探讨了促进有益植物-微生物互作的策略，并分析了影响其田间应用的技术挑战，旨在开发高效微生物生物刺激素。 | 重新审视植物-微生物互作的基本机制，整合微生物群落、多组学技术、合成生物学和制剂技术等新兴策略，以开发可规模化田间验证的微生物生物刺激素。 | 当前对植物如何与微生物通讯、建立根系定殖和适应田间环境的机制理解不足，导致微生物生物肥料应用效果不稳定。 | 通过深入理解根际通讯和根系分泌物介导的信号机制，开发高效、可持续的微生物生物刺激素，促进可持续农业发展。 | 植物根际微生物互作，包括根际微生物群落、根系分泌物和信号分子。 | 微生物组学 | NA | 多组学技术 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 植物（根际微生物） | 微生物群落信号通路 | 农业 |
| 40 | 2026-08-30 |
Integrating Machine Learning and Transcriptomics to Enhance β‑Carotene Production in Saccharomyces cerevisiae
2026-Aug-25, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.6c06012
PMID:42662202
|
研究论文 | 本研究利用机器学习指导的组合菌株工程和转录组分析，在酿酒酵母中增强β-胡萝卜素的产量 | 将XGBoost机器学习模型应用于DBTL循环以预测复杂的组合设计，并结合转录组洞察指导铁补充策略，从而显著提高β-胡萝卜素产量 | 未明确说明局限性 | 通过合成生物学和机器学习优化微生物生产，增强β-胡萝卜素在酿酒酵母中的产量 | 酿酒酵母（Saccharomyces cerevisiae）及其甲羟戊酸（MVA）途径 | 合成生物学、机器学习 | NA | 转录组学（RNA-seq） | XGBoost | 转录组数据、产量数据 | 涉及多个菌株变体及培养条件（未提供具体样本数） | 启动子和终止子组合工程 | 酿酒酵母 | MVA途径的限速酶表达微调（通过启动子和终止子组合） | 工业生物技术 |