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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2026-08-05 |
Transcriptional regulation: Efficient genetic engineering tools for non-conventional yeasts
2026-Aug-03, FEMS yeast research
IF:2.4Q3
DOI:10.1093/femsyr/foag032
PMID:42545751
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综述 | 本文综述了非传统酵母中用于转录调控的经典工具和合成生物学创新方法,以促进代谢工程生产高价值产品。 | 重点介绍了CRISPR/Cas介导的转录激活和抑制等可编程技术,以及动态调控系统,用于精细调节代谢途径。 | 未提供实证数据,仅基于现有文献总结,且讨论了当前挑战和未来方向。 | 探讨优化非传统酵母基因表达和代谢途径的转录调控工具,以促进可持续生物产品开发。 | 非传统酵母菌株,用于生产生物燃料、药物和其他高价值化学品。 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas介导的转录调控,启动子工程 | NA | 文献数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 非传统酵母 | 动态调控系统,代谢途径重布线 | 工业生物技术,能源,医药 |
| 22 | 2026-08-05 |
Graduate Student Literature Review: Methodologies and tools for synthetic biology for the production of next-generation dairy foods
2026-Aug-03, Journal of dairy science
IF:3.7Q2
DOI:10.3168/jds.2026-28550
PMID:42547020
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综述 | 本文综述了合成生物学在乳制品行业中的应用,重点探讨了蛋白质工程、基因修饰和异源表达技术在下一代乳制品生产中的方法与工具。 | 系统性地总结了利用合成生物学平台工业化生产高附加值乳制品成分(如生物活性蛋白和功能性代谢物)的技术框架。 | 未详细讨论具体的技术挑战、经济成本和监管问题。 | 为研究人员和行业利益相关者提供一个技术框架,以加速合成生物学在下一代乳制品开发中的整合。 | 高价值的乳制品成分(如生物活性蛋白和功能性代谢物)以及非天然宿主中的异源表达系统。 | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程、基因修饰、异源表达 | NA | NA | NA | NA | 非天然宿主(具体不详) | NA | 食品工业 |
| 23 | 2026-08-04 |
Autonomous intranasal delivery systems for central nervous system therapeutics
2026-Aug-03, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-026-01781-5
PMID:42543397
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综述 | 本文综述了用于中枢神经系统治疗的自主动脉内给药系统,涵盖合成纳米颗粒、细胞外囊泡和活体治疗剂等策略。 | 强调通过纳米技术和合成生物学实现自主、可编程的鼻脑给药,模块化设计功能组件并整合宿主响应机制。 | 未明确讨论临床转化中的安全性、长期稳定性或实际人体验证。 | 探讨自主鼻内给药系统在治疗神经系统疾病中的潜力和设计原理。 | 自主鼻内给药系统,包括合成纳米颗粒、细胞外囊泡和活体给药剂。 | 合成生物学 | 神经系统疾病 | 纳米技术 | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 24 | 2026-08-04 |
Mitigating chromium-induced oxidative stress in plants: a cross-talk between phytohormones and rhizospheric microbes
2026-Aug-03, International journal of phytoremediation
IF:3.4Q2
DOI:10.1080/15226514.2026.2703740
PMID:42545045
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综述 | 本文综述了六价铬诱导植物氧化应激的机制,以及植物激素与根际微生物之间的相互作用,并提出了缓解铬胁迫的策略 | 整合了多组学和合成生物学方法,提出了ACC脱氨酶AP2/ERF通路是PGPR介导的Cr(VI)耐受的关键途径,并揭示了植物激素组合策略优于单一激素 | 缺乏田间规模验证,所有有效性指标均为实验室估计,需要多季节农艺确认 | 总结Cr(VI)诱导的氧化应激机制,探讨植物激素与根际微生物在缓解铬胁迫中的协同作用 | 植物、根际微生物(PGPR) | 植物科学 | 重金属胁迫 | 多组学、合成生物学 | NA | 文献数据 | NA | 合成生物学 | 植物 | 植物激素与微生物信号通路 | 农业、环境 |
| 25 | 2026-08-04 |
Can Cells Be Fully Programmed and Engineered?
2026-Aug-02, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.70331
PMID:42543882
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观点文章 | 本文从视角角度探讨了合成生物学中细胞编程和工程化的范式,提出应利用生物复杂性而非强制模拟硅基芯片,并展望了生物物理混合实体与生物安全措施的发展 | 提出将细胞视为动态计算资源而非刚性硅基芯片,倡导利用生物物理混合实体(如细胞-半导体壳、硅纳米线、聚合物水凝胶)增强细胞功能,并强调生物安全的重要性 | 作为观点文章,缺乏实验数据支持,主要基于理论论证和已有案例总结 | 探讨合成生物学中细胞编程和工程化的合理范式,主张顺应生物复杂性而非强制模拟数字计算 | 合成生物学中的细胞编程与工程化,包括生物物理混合实体(如细胞与半导体、硅纳米线、聚合物水凝胶的整合) | 合成生物学 | 癌症(提及癌症摧毁电路) | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 细胞电路(如癌症摧毁电路、爆炸物检测、炎症记录型益生菌电路) | 医学、环境、工业生物技术 |
| 26 | 2026-08-03 |
Bacterial surface layer ⸻ Properties, role, applications and challenges ⸻ A review of the next-generation nanotechnological tool
2026-Aug-01, Journal of microbiological methods
IF:1.7Q4
DOI:10.1016/j.mimet.2026.107648
PMID:42542137
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综述 | 本文综述了细菌表面层(S层)蛋白的结构特性、生物学功能、应用潜力及面临的挑战,并探讨其作为下一代纳米技术工具的应用前景 | 本文独特地将S层蛋白的机制生物学与面向制造的工程化、蛋白质设计流程和商业化路线图相结合,提供了以往综述未涵盖的可行方案和基准 | S层蛋白向商业化规模应用转化仍面临挑战,包括高纯度蛋白生产的可扩展性、成本效益高的重组表达、恶劣工业条件下的稳定性以及生物来源纳米材料的监管路径未明确 | 综述S层蛋白在纳米生物技术、疫苗开发、生物传感、药物递送和超滤等领域的应用,并分析其从理论向功能原型转化的前景 | 细菌和古菌的表面层(S层)蛋白 | 合成生物学、纳米生物技术 | NA | 重组表达、融合蛋白技术、交联域工程、计算建模 | NA | 综述文献 | NA | NA | 细菌、古菌 | S层自组装二维结晶晶格,用于酶固定化、纳米图案化、脂质双分子层稳定化 | 医学、工业、环境 |
| 27 | 2026-08-02 |
Applying the design-build-test-learn framework to precision fermentation for sustainable food ingredients
2026-Aug, Food science and biotechnology
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s10068-026-02116-w
PMID:42534763
|
综述 | 本文综述了设计-构建-测试-学习(DBTL)框架在精准发酵中的应用,用于可持续食品成分的合成,重点关注食品级微生物平台的开发。 | 系统性地将DBTL框架应用于食品级精准发酵,强调安全、法规和消费者接受度对菌株选择及工程策略的影响,并整合计算设计、自动化构建、高通量测试和数据驱动学习。 | 未提及具体局限性,可能缺乏对工业规模化挑战或法规细节的深入讨论。 | 探讨DBTL框架作为系统性迭代方法,用于开发食品级微生物细胞工厂,生产可持续的食品成分,如替代蛋白、风味化合物和功能性碳水化合物。 | 食品级微生物菌株,用于精准发酵生产可持续食品成分。 | 合成生物学 | NA | 精准发酵 | NA | 文献数据 | NA | NA | 微生物 | DBTL循环(设计-构建-测试-学习) | 食品工业 |
| 28 | 2026-08-01 |
Genetic code expansion: Bridging synthetic biology precision and cellular complexity to decipher molecular mechanisms of diseases
2026-Aug, Current opinion in chemical biology
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.cbpa.2026.102690
PMID:42085977
|
综述 | 本文综述了遗传密码扩展技术在疾病生物学研究中的最新进展,重点介绍其如何通过定点引入非天然氨基酸来解析动态蛋白互作、翻译后修饰和信号事件,并讨论该技术面临的挑战及未来发展方向 | 强调遗传密码扩展技术作为合成生物学平台,在生理相关环境中以高时空精度剖析疾病分子机制的独特优势,并展望新兴方法学 | 遗传密码扩展技术在更广泛应用中仍面临关键挑战,如效率、特异性和体内适用性等限制 | 探讨遗传密码扩展技术在疾病机制研究中的应用潜力和局限,提出其作为转化性合成生物学平台的愿景 | 疾病相关的分子通路、蛋白质相互作用、翻译后修饰和信号事件 | 合成生物学 | 多种疾病(未具体指明) | 遗传密码扩展 | NA | NA | NA | 非天然氨基酸定点掺入 | 活体系统(如细胞) | 遗传密码扩展系统 | 医学 |
| 29 | 2026-08-01 |
Discovery and engineering of polymerases and ligases for the synthesis of modified nucleic acids
2026-Aug, Current opinion in chemical biology
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.cbpa.2026.102697
PMID:42143538
|
综述 | 本文综述了利用工程化聚合酶和连接酶合成含非天然构建块的寡核苷酸的最新进展,并提供了一个简化生物催化剂家族脚手架发现的网络应用。 | 重点关注计算工具加速核酸修饰酶的发现与工程化,并提供了一个公开的网络应用以辅助生物催化剂家族探索。 | 未提及明确局限性。 | 综述酶促寡核苷酸合成中工程化聚合酶和连接酶的最新方法,并推动该领域的工具化应用。 | 寡核苷酸、聚合酶、连接酶、非天然构建块 | 合成生物学 | NA | 酶促合成 | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 医疗、诊断、合成生物学 |
| 30 | 2026-08-01 |
Synthetic DNA circuits for programming cell functions
2026-Aug, Current opinion in chemical biology
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.cbpa.2026.102701
PMID:42214130
|
综述 | 本文综述了合成DNA电路在细胞功能编程中的最新进展,重点介绍了DNA逻辑网络与细胞环境的整合,以实现对细胞功能的逻辑门控控制。 | 强调从体外演示向体内功能实施的范式转变,并探讨了将DNA电路与内源通路接口的策略。 | 未明确提及具体局限性。 | 探讨利用合成DNA电路编程细胞功能的方法,以推动精准治疗和自主生物制造的发展。 | 合成DNA电路及其在细胞环境中的集成。 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 链置换、逻辑门、放大器、神经形态架构 | 医学、工业生物技术 |
| 31 | 2026-07-30 |
Learning from nature's plant engineers: Hijacking metabolism and development beyond genetics
2026-Aug, Current opinion in plant biology
IF:8.3Q1
DOI:10.1016/j.pbi.2026.102905
PMID:42250525
|
综述 | 本文探讨了除基因工程外,利用自然界中细菌、真菌和昆虫等生物劫持植物代谢和发育的机制,为合成生物学提供新思路 | 提出超越传统基因工程视角,从物种间相互作用中学习植物代谢重编程的新策略 | NA | 研究自然界生物劫持植物代谢的机制,扩展合成生物学的概念边界 | 植物代谢网络及其与细菌、真菌、昆虫的相互作用 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 植物 | NA | 农业, 工业生物技术, 材料 |
| 32 | 2026-07-30 |
Living sensors: Engineering plants to sense and report on their environments
2026-Aug, Current opinion in plant biology
IF:8.3Q1
DOI:10.1016/j.pbi.2026.102923
PMID:42391913
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综述 | 综述了利用合成生物学改造植物作为活体传感器,以感知和报告环境胁迫的研究进展 | 总结了三类主要策略:利用天然启动子系统、工程化蛋白基生物传感器以及构建植物-微生物跨界信号网络,并结合光学报告系统实现远程检测 | 未明确讨论现有传感器植物在田间部署中的稳定性、可扩展性及环境安全评估等具体限制 | 设计可部署于田间的工程植物传感器,用于实时环境监测和土地管理 | 工程改造的传感器植物(包括植感器或哨兵植物) | 合成生物学 | NA | 合成生物学, 基因工程 | NA | 光学信号(荧光、生物发光、色素信号等) | NA | NA | 植物 | 感知-响应模块(包括天然启动子系统、蛋白基生物传感器、植物-微生物跨界信号网络) | 环境监测, 农业 |
| 33 | 2026-07-29 |
Global research trends and hotspots of plant physiologically active substances: quantitative visualization analysis based on CiteSpace
2026-Aug, Plant biology (Stuttgart, Germany)
DOI:10.1111/plb.70219
PMID:42287740
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综述 | 利用CiteSpace对植物生理活性物质领域2000-2024年间8096篇文献进行文献计量与可视化分析 | 首次系统揭示植物生理活性物质研究从基础化合物分离向机制研究、功能食品和纳米递送系统转变的趋势 | 仅基于Web of Science核心合集数据,可能遗漏其他重要数据库来源 | 分析植物生理活性物质全球研究趋势与热点演变 | 2000-2024年间植物生理活性物质相关研究文献 | 文献计量学 | NA | 文献计量分析、可视化分析 | NA | 文本 | 8096篇文献 | NA | NA | NA | 健康、营养、工业 |
| 34 | 2026-06-21 |
Synergistic dual ring-cleavage pathways enable efficient degradation of chlorobenzenes by Pseudomonas putida BS-1 in groundwater
2026-Aug-01, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2026.142676
PMID:42320103
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研究论文 | 发现恶臭假单胞菌BS-1中一种新型协同双环裂解途径,可有效降解地下水中的氯苯类污染物 | 首次揭示一种由质粒携带的tod-clc基因簇介导的邻位和间位裂解途径协同作用机制,能够快速解毒中间代谢产物氯代儿茶酚 | 研究主要基于单一菌株和实验室条件,未评估长期现场应用中的稳定性和生态影响 | 阐明氯苯类化合物生物降解过程中氯代儿茶酚解毒的新机制,并提供用于地下水修复的微生物资源 | 恶臭假单胞菌BS-1菌株及其降解对二氯苯、氯苯和苯的代谢途径 | 环境微生物学 | NA | 基因敲除、异源表达、代谢产物分析 | NA | 实验数据 | 单一菌株BS-1,以及实际受污染地下水样本(含p-DCB 6.83 mg·L⁻¹和o-DCB 13.31 mg·L⁻¹) | NA | 恶臭假单胞菌 | 由tod-clc基因簇编码的邻位和间位双环裂解途径 | 环境修复 |
| 35 | 2026-07-26 |
Quo vadis reconstituted cell surfaces? Purpose and future perspectives for minimal systems of the cell plasma membrane
2026-Aug, Current opinion in cell biology
IF:6.0Q1
DOI:10.1016/j.ceb.2026.102667
PMID:42349351
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 36 | 2026-05-22 |
Metabolic Engineering Strategies for Flavonoid Biosynthesis in Saccharomyces cerevisiae: Current Advances and Future Perspectives
2026-Aug, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.70248
PMID:42163627
|
综述 | 系统总结了酿酒酵母中黄酮类化合物生物合成的代谢工程策略,涵盖途径重建、定量比较及未来展望 | 首次对酿酒酵母中黄酮类化合物代谢工程策略进行定量比较,提出结合智能调控系统、代谢网络合理设计和微生物联合体的未来研究方向 | 未讨论工业规模放大过程中具体的技术挑战,且缺乏对不同策略在不同黄酮类化合物生产中的适用性分析 | 回顾酿酒酵母中黄酮类生物合成途径重建进展,指出从实验室到工业生物反应器放大的关键瓶颈,并展望智能工程策略 | 酿酒酵母中的黄酮类化合物生物合成途径 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 酿酒酵母 | 黄酮类化合物生物合成途径重建 | 工业生物技术 |
| 37 | 2026-07-25 |
Microbial-derived natural bionematicides in sustainable agriculture: Advances in biological control of Phytonematodes
2026-Aug, Pesticide biochemistry and physiology
IF:4.2Q1
DOI:10.1016/j.pestbp.2026.107186
PMID:42493005
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 38 | 2026-07-22 |
S-layers as natural building blocks for nanobiotechnology and synthetic biology
2026-Aug, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2026.102787
PMID:42398461
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综述文章 | 综述了S层作为可编程二维生物材料在纳米生物技术和合成生物学中的架构、组装和功能化应用 | 将S层定位为统一的平台,结合其自组装和遗传可工程化特性,设计有序生物分子界面,并强调其在宿主-微生物互作中未被充分认识的作用 | 大规模生产、稳定性和系统集成方面的当前局限性是解锁S层全部潜力的关键障碍 | 将S层作为天然构建块用于纳米生物技术和合成生物学 | 细菌和古菌的结晶表面层(S层) | 合成生物学 | NA | 遗传工程、自组装 | NA | NA | NA | NA | 细菌、古菌 | 分子筛分、生物传感器、生物矿化、纳米图案化、S层融合蛋白模块化展示 | 纳米生物技术、合成生物学、免疫学、微生物组工程 |
| 39 | 2026-07-22 |
Progress in engineered bacterial cancer therapies
2026-Aug, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2026.102785
PMID:42349372
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综述 | 综述了利用工程细菌进行癌症治疗的最新进展,重点介绍工程策略及其在临床前体内肿瘤模型中的效果 | 系统总结了工程细菌在癌症治疗中的多种设计策略,包括毒素分泌、肿瘤抑制蛋白表达、靶向递送及与免疫疗法协同作用 | 仍面临临床转化挑战,如安全性、选择性及免疫应答持久性等问题 | 回顾工程细菌癌症治疗领域的进展,展望未来发展方向 | 工程细菌及其在癌症治疗中的应用 | 合成生物学 | 肿瘤 | NA | NA | NA | 临床前体内肿瘤模型(具体样本量未说明) | NA | 细菌(如大肠杆菌等工程菌株) | 设计细菌分泌毒素、肿瘤抑制蛋白、促凋亡蛋白,并介导靶向细胞内递送;感应肿瘤特异性代谢物并黏附肿瘤相关细胞表面抗原 | 医学 |
| 40 | 2026-07-13 |
Metabolic engineering strategies for neuroactive postbiotic production: Current progress and perspectives
2026-Aug, Journal of microbiological methods
IF:1.7Q4
DOI:10.1016/j.mimet.2026.107571
PMID:42251865
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综述 | 系统审查代谢工程和合成生物学策略在增强神经活性后生元微生物合成中的最新进展 | 整合技术就绪水平评估,桥接实验室规模创新与商业实施,并强调可持续蛋白质原料和农工副产物作为经济氨基酸前体的利用 | 未明确提及具体局限性 | 探讨通过代谢工程和合成生物学提高神经活性后生元产量的策略,并评估其转化和工业潜力 | 神经活性后生元(如GABA、短链脂肪酸、血清素、多巴胺、吲哚衍生物)的微生物合成系统 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 微生物(未具体指定) | 代谢途径优化、调控元件调整、辅因子平衡 | 功能性食品、营养保健品、神经治疗 |