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当前共找到 142 篇文献，本页显示第 61 - 80 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2026-08-27 |
Toward Complex Polyketide Biosynthesis in Yarrowia lipolytica via Metabolic Reprogramming
2026-Aug-21, Journal of microbiology and biotechnology
IF:2.5Q3
DOI:10.4014/jmb.2606.06035
PMID:42625493
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综述 | 本文综述了通过代谢重编程在解脂耶氏酵母中实现复杂聚酮类化合物生物合成的最新策略、案例、局限性与未来方向 | 系统总结了从经典代谢重排到细胞器工程和亚细胞区室化等新兴策略，并评估了该酵母作为可编程工业平台的前景 | 当前聚酮类化合物在解脂耶氏酵母中的产量仍有待提高，且存在代谢负担和产物多样性限制等问题 | 建立解脂耶氏酵母作为可编程、工业可行的聚酮类化合物生物合成平台 | 解脂耶氏酵母及其聚酮类化合物生物合成途径 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、合成生物学 | NA | 文本 | NA | NA | 解脂耶氏酵母 | 代谢途径重构、细胞器工程、亚细胞区室化 | 医药、工业生物技术 |
| 62 | 2026-08-27 |
Inter-species horizontal transfer of biosynthetic gene clusters: an evolutionary driver for chemical diversity in bacterial communities
2026-Aug-19, Essays in biochemistry
IF:5.6Q1
DOI:10.1042/EBC20250014
PMID:41847751
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评论文章 | 本文探讨了生物合成基因簇（BGCs）在细菌种间水平转移的机制及其对化学多样性的进化影响，并讨论了其对合成生物学的启示 | 将BGCs视为可移动的基因组单元，挑战了传统的以基因组为中心的次级代谢观点，并提出模仿自然模块化转移系统来工程化可移植的生物合成平台 | 未提供具体实验数据或案例研究，主要基于理论分析和现有文献的综述性讨论 | 分析BGCs在细菌种间水平转移的机制和进化意义，并探讨其在合成生物学中的应用潜力 | 细菌中的生物合成基因簇（BGCs） | 微生物学 | NA | NA | NA | 文本 | NA | NA | 细菌 | 可移植的生物合成平台 | 合成生物学, 工业生物技术 |
| 63 | 2026-08-27 |
A guide to Direct Pathway Cloning (DiPaC) for natural product discovery
2026-Aug-19, Essays in biochemistry
IF:5.6Q1
DOI:10.1042/EBC20250016
PMID:42210810
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综述 | 本文是一篇关于直接途径克隆（DiPaC）技术的综述，重点介绍其在天然产物发现中的应用，包括技术原理、优势、应用案例和操作指南。 | 系统总结了DiPaC技术在不同天然产物类别中的应用，并提供了选择生物合成基因簇、扩增困难序列和组装策略的实用指导。 | 未提及具体局限性，但作为综述，可能缺乏对DiPaC技术本身潜在缺点的深入分析。 | 介绍DiPaC技术作为现代天然产物研究的关键工具，促进生物合成基因簇的克隆和重构。 | 生物合成基因簇（BGCs）及其编码的天然产物生物合成途径。 | 合成生物学 | NA | 长片段PCR、体外DNA组装 | NA | 基因组序列、生物信息学数据 | NA | DiPaC（直接途径克隆） | NA | 生物合成途径的克隆和重构，包括启动子交换、调控元件移除和模块化重建 | 药物发现、生物技术 |
| 64 | 2026-08-26 |
Probiotic-Derived Antimicrobial Proteins and Peptides: Molecular Mechanisms, Clinical Applications, and Future Therapeutic Perspectives
2026-Aug-24, Probiotics and antimicrobial proteins
IF:4.4Q2
DOI:10.1007/s12602-026-11180-x
PMID:42635917
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综述 | 本文综述了益生菌来源的抗菌蛋白和肽（PAPs）的分子机制、临床用途及未来治疗前景，重点介绍了其直接抗菌作用和宿主调节功能。 | 系统总结了PAPs的四类直接抗菌机制及其与宿主调节的双重功能，并探讨了合成生物学和人工智能等前沿技术在其开发和递送中的应用。 | PAPs的转化应用仍面临稳定性、可扩展性、安全性和监管分类等挑战，相关解决方案尚处早期阶段。 | 评估PAPs的抗菌机制、宿主调节效应及其在临床和食品等领域的应用潜力，并为未来开发提供方向。 | 益生菌（特别是乳酸菌）产生的抗菌蛋白和肽，如细菌素和酪蛋白水解片段。 | 微生物学、医学、蛋白质工程 | 感染性疾病（包括多重耐药病原体感染） | NA | NA | 文献资料 | NA | 合成生物学、人工智能辅助发现 | 乳酸菌（作为产生菌） | NA | 医学、食品工业、生物技术 |
| 65 | 2026-08-25 |
CRISPR-CAS9-Mediated Genetic Enhancement and Metabolic Engineering of Medicinal Crops: An Integrative Review
2026-Aug-03, Current pharmaceutical design
IF:2.6Q2
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综述 | 本文全面综述了通过CRISPR-Cas9基因组编辑技术改良药用植物的最新进展，强调其在生物技术和生药学中的变革潜力 | 系统性地整合了CRISPR-Cas9在药用植物遗传改良和代谢工程中的应用，并突出了与组学技术和合成生物学协同优化次生代谢物生物合成的策略 | 未明确讨论该技术的潜在脱靶效应、长期稳定性及法规限制 | 探讨CRISPR-Cas9在提升药用植物次生代谢物产量、增强逆境耐受性和调控代谢通路中的应用 | 药用植物，包括青蒿和长春花等代表性物种 | 基因组编辑 | NA | CRISPR-Cas9 | NA | 文献数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 药用植物（如青蒿、长春花） | 代谢生物合成途径 | 医药, 生物技术 |
| 66 | 2026-08-25 |
[Construction of a butyrate-producing engineered bacteria and its therapeutic effects on atopic dermatitis]
2026-Aug, Xi bao yu fen zi mian yi xue za zhi = Chinese journal of cellular and molecular immunology
PMID:42634901
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研究论文 | 本研究构建了能够高效稳定分泌丁酸盐的工程化大肠杆菌Nissle 1917（EcN-But），并在钙泊三醇（MC903）诱导的特应性皮炎小鼠模型中评估其治疗效果 | 利用合成生物学策略，将源自普拉梭菌的丁酸合成基因模块（bcd, but）进行密码子优化并导入益生菌底盘EcN，构建了能原位分泌丁酸盐的活体生物治疗产品，为特应性皮炎提供了一种新的治疗策略 | 摘要中未提及研究的局限性 | 构建能高效稳定分泌丁酸盐的工程化大肠杆菌Nissle 1917菌株，并评估其在特应性皮炎小鼠模型中的治疗功效 | 工程化大肠杆菌Nissle 1917菌株（EcN-But）及MC903诱导的特应性皮炎小鼠模型 | 合成生物学 | 特应性皮炎 | 高效液相色谱法（HPLC）、RT-qPCR、电穿孔 | NA | 实验数据 | 未明确样本数量，使用MC903诱导的AD小鼠模型 | 电穿孔 | 大肠杆菌Nissle 1917 | 丁酸合成基因模块（bcd, but） | 医学 |
| 67 | 2026-08-24 |
Engineering an Artificial Taxol Biosynthetic Pathway from Baccatin III in Yeast
2026-Aug-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00148
PMID:42186953
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研究论文 | 本研究在酵母中构建了一条人工紫杉醇生物合成途径，利用(2R,3S)-3-苯基异丝氨酸作为底物，通过三步酶促反应将巴卡亭 III 转化为紫杉醇 | 构建了仅需三步酶促反应的人工紫杉醇合成途径，利用β-苯丙氨酰辅酶A连接酶的广谱底物特性，并通过对Baccatin III:3-氨基-3-苯基丙酰转移酶的结构-活性分析提升其对非天然底物的催化效率，为紫杉醇的可持续生产提供了新策略 | 摘要未明确提及具体局限性，但可推断酵母与植物系统差异导致的规模化生产瓶颈仍需进一步优化 | 利用合成生物学方法实现紫杉醇的可持续生产，克服天然生物合成途径复杂和半合成方法成本高的问题 | 酵母细胞中的人工紫杉醇合成途径，涉及β-苯丙氨酰辅酶A连接酶和巴卡亭III:3-氨基-3-苯基丙酰转移酶 | 合成生物学、代谢工程 | 癌症 | 合成生物学、代谢工程、结构-活性分析 | NA | NA | NA | 代谢工程 | 酵母 | 人工紫杉醇生物合成途径 | 医药 |
| 68 | 2026-08-24 |
Heterologous Expression of an Abandoned Termite Mound Fungus Gene Cluster Reveals a Protective Aldehyde-Alcohol Cycle and a Candidate Termiticidal Metabolite
2026-Aug-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00101
PMID:42402854
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研究论文 | 通过异源表达废弃白蚁巢真菌基因簇，揭示了保护性醛-醇循环和候选杀白蚁代谢物 | 采用合成生物学驱动的方法，结合宏基因组和转录组挖掘，在米曲霉中异源重构了保守的生物合成基因簇，并阐明了一个空间分离的醛-醇循环系统，该系统涉及胞外氧化酶和胞内还原酶的协同作用 | 未提及 | 探索药用真菌乌灵参在白蚁巢中生态适应的分子基础，并揭示其隐秘的生态代谢途径 | 废弃白蚁巢中的药用真菌乌灵参（多种炭角菌属物种）及其中的生物合成基因簇 | 合成生物学、功能基因组学 | NA | 宏基因组、转录组测序、异源表达 | NA | 基因组序列、转录组序列、代谢物数据 | NA | NA | 米曲霉 | 醛-醇循环系统（胞外氧化酶WlsA催化醇前体转化为反应性醛，胞内还原酶WlsE催化逆反应） | 农业、生态学 |
| 69 | 2026-08-24 |
Engineering 2,4-Diacetylphloroglucinol-Hyper-Tolerant Escherichia coli via Adaptive Evolution for Efficient Biosynthesis and an Organic Solvent-Free Downstream Process
2026-Aug-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00194
PMID:42429219
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研究论文 | 本研究通过适应性实验室进化工程化DAPG超耐受性大肠杆菌，实现了高效生物合成和无有机溶剂的下游处理过程 | 首次通过适应性进化获得DAPG超耐受性菌株，并开发了一种无有机溶剂的下游提取方法，同时鉴定并验证了关键突变位点 | 未明确提及，但从上下文推断可能涉及生产滴度仍需提高或工业化放大挑战 | 解决DAPG生物合成中的宿主毒性和低效下游处理瓶颈，提高产量并简化提取过程 | 大肠杆菌菌株，特别是进化后的突变株Bdt03和构建的Bb03 | 合成生物学 | NA | 适应性实验室进化、基因组重测序 | NA | 基因组序列数据、发酵数据 | 涉及多个大肠杆菌菌株，具体数量未明确 | NA | 大肠杆菌 | DAPG响应型遗传电路 | 农业 |
| 70 | 2026-08-24 |
A Programmable mRNA Platform for miRNA Detection via miRNA-mRNA2 Triplex-Mediated Ribosomal Frameshifting
2026-Aug-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00883
PMID:42464604
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研究论文 | 本文介绍了一种可编程的mRNA平台，通过miRNA-mRNA三链体介导的核糖体移码来检测特定的成熟miRNA，将其转化为可量化的蛋白质输出 | 利用三链体形成触发核糖体移码作为miRNA开关 | 仅限于富含嘌呤的miRNA，未进行体内验证 | 开发可编程mRNA平台用于miRNA检测 | 特定的成熟miRNA和设计的mRNA平台 | 合成生物学 | 多种疾病相关miRNA（未特定） | 生物层干涉测量法、荧光结合研究、无细胞双荧光素酶翻译系统 | NA | 生物化学数据 | NA | NA | 无细胞系统（大肠杆菌提取物） | 三链体形成mRNA（TF-mRNA）平台，作为miRNA依赖性分子开关 | 医学、生物技术 |
| 71 | 2026-08-24 |
Biosensor-Based Detection and Quantification of Arsenic in Drinking Water
2026-Aug-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00308
PMID:42469591
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综述 | 本文综述了基于合成生物学的砷生物传感器从早期大肠杆菌传感器到现代全细胞和无细胞平台的演变，重点介绍信号放大策略、固定化格式、微流控架构及转导机制，并讨论生物设计自动化、AI工具和生物安全监管考虑。 | 强调信号放大策略与保质期、生物安全和监管简洁性的交叉，并首次将生物设计自动化、高通量DBTL工作流和AI工具（如监督学习和贝叶斯优化）引入砷响应基因电路的优化，提出将砷生物传感器集成到分布式水质监测网络的愿景。 | 综述指出，虽然现代平台在受控条件下接近WHO检测限，但现场部署的稳健性、保质期、生物安全性和监管简洁性仍面临挑战，且尚未在发展中国家实际应用。 | 系统评估砷生物传感器的工程原理、技术进展和部署障碍，以促进其在低成本现场监测中的应用。 | 砷响应基因电路（源自ars操纵子）、全细胞与无细胞生物传感器平台、固定化格式和微流控设备。 | 合成生物学 | 砷中毒 | 无细胞表达系统、比色/荧光/生物发光/电化学检测、微流控 | 监督学习、贝叶斯优化 | 传感器输出信号（如光学、电化学数据） | NA | 生物设计自动化、Design-Build-Test-Learn工作流 | E. coli | 基于ars操纵子的砷响应基因电路，包含检测、处理和宿主工程层 | 环境监测、公共卫生 |
| 72 | 2026-08-23 |
Applications of synthetic biology in biomedicine
2026-Aug-19, Molecular biomedicine
IF:6.3Q1
DOI:10.1186/s43556-026-00545-x
PMID:42616280
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综述 | 本文系统综述了合成生物学在生物医学领域中的应用，涵盖基础工具、关键技术、临床转化进展以及挑战和未来方向 | 系统总结了合成生物学在生物医学诊断和治疗中的创新策略，包括人工智能辅助组件设计、闭环智能调控、通用细胞和多模态诊疗平台，并深入比较了不同底盘细胞、递送载体和调控回路 | 当前合成生物学系统仍面临体内靶向和编辑精度不足、基因回路功能稳定性差、免疫原性风险高、制造成本高以及伦理和监管框架滞后等关键瓶颈 | 提供从技术原理到临床转化的系统框架，为开发下一代基于合成生物学的诊断和治疗策略提供理论支持和技术指导 | 合成生物学在生物医学中的应用，包括病原体和肿瘤早期筛查、可编程细胞免疫治疗、智能活体治疗和医用生物材料制造 | 合成生物学、生物医学 | 肿瘤、传染病 | DNA合成与组装、计算建模、基因编辑、RNA调控、蛋白质工程 | NA | NA | NA | 基因编辑、DNA合成与组装 | NA | 人工遗传回路、生物传感器、细胞疗法、活体治疗、智能生物材料 | 医学 |
| 73 | 2026-08-22 |
PlantGFM: A Genomic Foundation Model for Discovery and Creation of Plant Genes
2026-Aug, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.75772
PMID:42160034
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研究论文 | 本文介绍了PlantGFM，一种基于Hyena算子的植物基因组基础模型，通过预训练和微调实现了长上下文预测和从头基因设计，并在植物中验证了其转录和蛋白表达活性 | 首次展示了大型语言模型生成的序列在植物中实现DNA-RNA-蛋白质表达的可行性，并通过AI-人类知识融合筛选管道验证了从头设计基因的功能 | 未提及具体局限性，可能包括对长上下文预测的准确性或生成基因在复杂植物环境中的稳定性等未充分验证的问题 | 开发一种植物基因组基础模型，以实现植物基因的发现和从头设计，推动植物合成生物学和AI辅助育种的发展 | 12种植物物种的基因组序列，以及用于微调的10个已注释植物基因组 | 机器学习 | NA | 基因组预训练，序列生成 | 基于Hyena算子的基础模型 | 基因组序列 | 10.84亿个核苷酸来自12种植物，7个候选基因在烟草中验证 | NA | 本塞姆氏烟草 | NA | 农业，合成生物学 |
| 74 | 2026-08-21 |
Discovering what is possible: How synthetic biology illuminates development
2026-Aug-19, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2026.101619
PMID:42242210
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观点文章 | 本文探讨了合成生物学如何通过自下而上的方法揭示多细胞组织的发育原理和因果机制，并展望了这些工程化系统在理解自然发育过程中的潜力。 | 强调合成系统作为简化平台，用于测试发育潜力的极限，理清因果关系，并预测模型，提供了一种新的研究路径。 | 文中未明确提及局限性，但可能隐含合成系统与自然系统的差异可能导致结论外推受限。 | 探讨合成生物学在阐明多细胞组织发育的一般原理和因果机制中的作用。 | 胚胎发育过程，多细胞组织的自组织性。 | 合成生物学、发育生物学 | NA | 基因组工程、成像、计算建模 | 预测模型 | 文本 | NA | 基因组工程 | NA | NA | 医学 |
| 75 | 2026-08-21 |
Rare functional groups and unique scaffolds in Streptomyces natural products
2026-Aug-19, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d6np00012f
PMID:42300430
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综述 | 该综述总结了链霉菌天然产物中稀有官能团、独特骨架和非典型修饰的结构特征，并探讨其酶促机制与合成生物学应用 | 系统性地将链霉菌天然产物的独特结构与其生物合成酶机制联系起来，为细胞工厂设计和药物分子优化提供新思路 | 未提供具体实验数据，缺乏对各类天然产物覆盖深度的详细说明 | 通过分析链霉菌天然产物的结构多样性和生物合成酶，促进合成生物学在高效细胞工厂设计和新药研发中的应用 | 链霉菌天然产物及其稀有结构特征 | 天然产物化学、合成生物学 | NA | NA | NA | 文献数据 | NA | NA | 链霉菌 | NA | 医学、工业生物技术 |
| 76 | 2026-08-21 |
Fuel-Driven Coacervates: Design Principles, Dissipative Dynamics, and Life-like Functions
2026-Aug-19, Nano letters
IF:9.6Q1
DOI:10.1021/acs.nanolett.6c02653
PMID:42504573
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综述 | 本文综述了燃料驱动的凝聚体系统，重点关注不同燃料类别如何调控其形成、演化和解组装，以及耗散瞬态性质如何产生类生命功能 | 系统性地总结了燃料驱动凝聚体的设计原则和耗散动力学，强调了其在模拟生命系统中的前沿进展 | 综述文章，未提供新的实验数据，可能限制于现有研究的范围 | 探讨燃料调节的凝聚体系统及其在模拟无膜细胞器动态组织中的应用 | 燃料驱动的凝聚体（无膜细胞器模型） | 合成生物学 | NA | 自组装 | NA | 文献综述 | NA | NA | NA | 燃料驱动的凝聚体系统，涉及形成、演化、解组装的动态过程 | 医学、工业生物技术 |
| 77 | 2026-08-21 |
Enzyme Engineering: From Classical Strategies to AI-Driven Biocatalyst Design
2026-Aug-19, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.6c04272
PMID:42616438
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综述 | 本文综述了酶工程从经典策略到AI驱动生物催化剂设计的演变过程，涵盖传统方法、人工智能辅助设计及未来趋势 | 整合了蛋白质语言模型、生成式AI和DBTL自动化闭环工作流在酶工程中的应用，强调自主实验室和可持续生物催化的新兴方向 | 未提供具体实验数据或案例验证，主要基于文献分析 | 总结酶工程从经典方法到AI辅助生物催化剂设计的进展、挑战和未来趋势 | 酶工程中的生物催化剂、蛋白质序列、结构和功能关系 | 机器学习 | NA | 高通量测序、蛋白质语言模型、深度学习、生成式AI | 蛋白质语言模型、深度学习模型、生成式AI模型 | 序列数据、结构数据、功能注释数据 | NA | 合成生物学工具 | NA | 设计-构建-测试-学习（DBTL）闭环工作流 | 工业生物技术, 可持续生物催化 |
| 78 | 2026-08-21 |
High-throughput synthesis of DNA fragments by molecular self-assembly of overlapping oligonucleotides
2026-Aug-19, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-026-03266-2
PMID:42618804
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研究论文 | 本文介绍了一种名为分子自组装诱导克隆的高通量基因合成方法，通过寡核苷酸的重叠互补自组装和宿主细胞内的DNA修复机制，实现大规模基因片段的并行合成 | 该方法利用正交自组装克服了分子串扰和寡核苷酸错位问题，结合微芯片寡核苷酸合成，实现了超过1000个不同基因片段的一锅法并行合成，且错位率接近零 | 寡核苷酸合成错误仍维持在恒定但可控水平，未完全消除合成错误 | 开发一种高通量的基因合成方法，以解决合成生物学中DNA合成技术的瓶颈 | 基因片段、PETase酶的变体文库 | 合成生物学 | NA | 微芯片寡核苷酸合成、分子自组装、宿主细胞DNA修复 | NA | 基因序列数据 | 超过1000个基因片段 | NA | 宿主细胞（未具体指明） | NA | 工业生物技术 |
| 79 | 2026-08-21 |
Spatially Encoded Protocell Network for Non-Cascaded Parallel Biocomputation
2026-Aug-18, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.77019
PMID:42610528
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研究论文 | 本文提出了一种基于空间编码和梯度响应的原始细胞群落非级联并行生物计算架构，用于实现半加器和全加器逻辑运算 | 利用三维水凝胶基质中空间编码的梯度响应原始细胞群落，通过反应-扩散动力学实现非级联的并行多阈值计算，避免了传统分子级联中的信号衰减和串扰问题 | 未在摘要中明确说明局限性 | 开发一种低复杂度、稳健、非级联的分子计算系统，用于并行生物计算 | 空间编码的原始细胞群落 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 基于空间编码的梯度响应原始细胞群落，实现半加器和全加器逻辑运算 | 合成生物学, 计算科学 |
| 80 | 2026-08-20 |
Photodictated Programmed Orthogonal DNA Microdroplets Enable Molecular Communication between Transient Self-Sorting Membraneless Artificial Cells
2026-Aug-18, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.6c05486
PMID:42611219
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研究论文 | 本文报道了一种光引导策略，用于编程两种正交DNA液滴群体的液-液相分离，并实现瞬态融合、分子通信和自分类，基于此构建了多读自重写分子消息加密平台 | 首次通过光引导策略选择性编程两种正交DNA液滴群体的相分离，并实现瞬态融合与耗散性分子通信，展示了内在自分类能力，以及多读和自重写的分子消息加密应用 | 未明确提及局限性，可能限于体外人工细胞模型，尚未在活细胞中验证 | 构建能够展现动态分子通信、空间自分类和耗散信号传导的人工细胞模拟系统 | 两种正交DNA液滴群体，由DNA Y-motif组装而成 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 正交DNA液滴群体通过光引导液-液相分离，瞬态融合后实现分子交换和自分类 | 分子通信、信息加密 |