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当前共找到 154 篇文献，本页显示第 61 - 80 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2026-08-24 |
Heterologous Expression of an Abandoned Termite Mound Fungus Gene Cluster Reveals a Protective Aldehyde-Alcohol Cycle and a Candidate Termiticidal Metabolite
2026-Aug-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00101
PMID:42402854
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研究论文 | 通过异源表达废弃白蚁巢真菌基因簇，揭示了保护性醛-醇循环和候选杀白蚁代谢物 | 采用合成生物学驱动的方法，结合宏基因组和转录组挖掘，在米曲霉中异源重构了保守的生物合成基因簇，并阐明了一个空间分离的醛-醇循环系统，该系统涉及胞外氧化酶和胞内还原酶的协同作用 | 未提及 | 探索药用真菌乌灵参在白蚁巢中生态适应的分子基础，并揭示其隐秘的生态代谢途径 | 废弃白蚁巢中的药用真菌乌灵参（多种炭角菌属物种）及其中的生物合成基因簇 | 合成生物学、功能基因组学 | NA | 宏基因组、转录组测序、异源表达 | NA | 基因组序列、转录组序列、代谢物数据 | NA | NA | 米曲霉 | 醛-醇循环系统（胞外氧化酶WlsA催化醇前体转化为反应性醛，胞内还原酶WlsE催化逆反应） | 农业、生态学 |
| 62 | 2026-08-24 |
Engineering 2,4-Diacetylphloroglucinol-Hyper-Tolerant Escherichia coli via Adaptive Evolution for Efficient Biosynthesis and an Organic Solvent-Free Downstream Process
2026-Aug-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00194
PMID:42429219
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研究论文 | 本研究通过适应性实验室进化工程化DAPG超耐受性大肠杆菌，实现了高效生物合成和无有机溶剂的下游处理过程 | 首次通过适应性进化获得DAPG超耐受性菌株，并开发了一种无有机溶剂的下游提取方法，同时鉴定并验证了关键突变位点 | 未明确提及，但从上下文推断可能涉及生产滴度仍需提高或工业化放大挑战 | 解决DAPG生物合成中的宿主毒性和低效下游处理瓶颈，提高产量并简化提取过程 | 大肠杆菌菌株，特别是进化后的突变株Bdt03和构建的Bb03 | 合成生物学 | NA | 适应性实验室进化、基因组重测序 | NA | 基因组序列数据、发酵数据 | 涉及多个大肠杆菌菌株，具体数量未明确 | NA | 大肠杆菌 | DAPG响应型遗传电路 | 农业 |
| 63 | 2026-08-24 |
A Programmable mRNA Platform for miRNA Detection via miRNA-mRNA2 Triplex-Mediated Ribosomal Frameshifting
2026-Aug-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00883
PMID:42464604
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研究论文 | 本文介绍了一种可编程的mRNA平台，通过miRNA-mRNA三链体介导的核糖体移码来检测特定的成熟miRNA，将其转化为可量化的蛋白质输出 | 利用三链体形成触发核糖体移码作为miRNA开关 | 仅限于富含嘌呤的miRNA，未进行体内验证 | 开发可编程mRNA平台用于miRNA检测 | 特定的成熟miRNA和设计的mRNA平台 | 合成生物学 | 多种疾病相关miRNA（未特定） | 生物层干涉测量法、荧光结合研究、无细胞双荧光素酶翻译系统 | NA | 生物化学数据 | NA | NA | 无细胞系统（大肠杆菌提取物） | 三链体形成mRNA（TF-mRNA）平台，作为miRNA依赖性分子开关 | 医学、生物技术 |
| 64 | 2026-08-24 |
Biosensor-Based Detection and Quantification of Arsenic in Drinking Water
2026-Aug-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00308
PMID:42469591
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综述 | 本文综述了基于合成生物学的砷生物传感器从早期大肠杆菌传感器到现代全细胞和无细胞平台的演变，重点介绍信号放大策略、固定化格式、微流控架构及转导机制，并讨论生物设计自动化、AI工具和生物安全监管考虑。 | 强调信号放大策略与保质期、生物安全和监管简洁性的交叉，并首次将生物设计自动化、高通量DBTL工作流和AI工具（如监督学习和贝叶斯优化）引入砷响应基因电路的优化，提出将砷生物传感器集成到分布式水质监测网络的愿景。 | 综述指出，虽然现代平台在受控条件下接近WHO检测限，但现场部署的稳健性、保质期、生物安全性和监管简洁性仍面临挑战，且尚未在发展中国家实际应用。 | 系统评估砷生物传感器的工程原理、技术进展和部署障碍，以促进其在低成本现场监测中的应用。 | 砷响应基因电路（源自ars操纵子）、全细胞与无细胞生物传感器平台、固定化格式和微流控设备。 | 合成生物学 | 砷中毒 | 无细胞表达系统、比色/荧光/生物发光/电化学检测、微流控 | 监督学习、贝叶斯优化 | 传感器输出信号（如光学、电化学数据） | NA | 生物设计自动化、Design-Build-Test-Learn工作流 | E. coli | 基于ars操纵子的砷响应基因电路，包含检测、处理和宿主工程层 | 环境监测、公共卫生 |
| 65 | 2026-08-23 |
Applications of synthetic biology in biomedicine
2026-Aug-19, Molecular biomedicine
IF:6.3Q1
DOI:10.1186/s43556-026-00545-x
PMID:42616280
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综述 | 本文系统综述了合成生物学在生物医学领域中的应用，涵盖基础工具、关键技术、临床转化进展以及挑战和未来方向 | 系统总结了合成生物学在生物医学诊断和治疗中的创新策略，包括人工智能辅助组件设计、闭环智能调控、通用细胞和多模态诊疗平台，并深入比较了不同底盘细胞、递送载体和调控回路 | 当前合成生物学系统仍面临体内靶向和编辑精度不足、基因回路功能稳定性差、免疫原性风险高、制造成本高以及伦理和监管框架滞后等关键瓶颈 | 提供从技术原理到临床转化的系统框架，为开发下一代基于合成生物学的诊断和治疗策略提供理论支持和技术指导 | 合成生物学在生物医学中的应用，包括病原体和肿瘤早期筛查、可编程细胞免疫治疗、智能活体治疗和医用生物材料制造 | 合成生物学、生物医学 | 肿瘤、传染病 | DNA合成与组装、计算建模、基因编辑、RNA调控、蛋白质工程 | NA | NA | NA | 基因编辑、DNA合成与组装 | NA | 人工遗传回路、生物传感器、细胞疗法、活体治疗、智能生物材料 | 医学 |
| 66 | 2026-08-23 |
Filamentous bacteriophage M13: Structure, biology, and biotechnological applications
2026-Aug-07, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.109003
PMID:42567428
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综述 | 本文综述了丝状噬菌体M13的结构、生物学特性及其在纳米技术、合成生物学和临床医学中的生物技术应用 | 将基础病毒学与材料科学相结合，全面评估M13平台的结构、感染动态和表面功能化工具箱，并指出临床和工业转化的瓶颈 | 未提供具体实验数据，可能缺乏对特定应用领域的深入分析 | 总结M13噬菌体作为可编程生物支架的现状，并规划下一代生物技术的发展路线 | 丝状噬菌体M13 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 文献数据 | NA | NA | NA | NA | 纳米技术、临床医学、材料科学 |
| 67 | 2026-08-22 |
Advanced gene editing technologies for oncology mechanisms, applications, and clinical implementation
2026-Aug-20, Cancer gene therapy
IF:4.8Q1
DOI:10.1038/s41417-026-01070-3
PMID:42624898
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综述 | 本文全面综述了先进基因编辑技术在肿瘤学中的机制、应用及临床实施情况 | 系统梳理了包括碱基编辑、先导编辑、PASTE系统以及ARCUS、MegaTALs等混合平台在内的最新进展，并结合人工智能、生物传感器和合成生物学概念 | 未明确提及具体局限性，但可能涉及递送优化、脱靶效应和伦理问题等挑战 | 探讨基因编辑技术在癌症治疗中的精确分子疗法及其临床转化前景 | 多种癌症类型，包括肺癌、乳腺癌、结直肠癌、血液癌、肝癌、胰腺癌、头颈癌、食管癌、前列腺癌、胃癌和脑癌 | 合成生物学 | 癌症 | ZFN、TALEN、CRISPR/Cas系统（Cas9、Cas12、Cas13）、碱基编辑、先导编辑、PASTE系统、ARCUS、MegaTALs、重组酶 | NA | 文本 | NA | ZFN、TALEN、CRISPR-Cas9、CRISPR-Cas12、CRISPR-Cas13、碱基编辑、先导编辑、PASTE系统、ARCUS、MegaTALs、重组酶 | 哺乳动物细胞 | CAR-T细胞工程、免疫检查点调控 | 医学 |
| 68 | 2026-08-22 |
Metabolic engineering of Komagataella phaffii for enhanced production of heterologous proteins and small molecules: key strategies and future directions
2026-Aug-19, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.00110-26
PMID:42461011
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综述 | 本文综述了Komagataella phaffii代谢工程在提高异源蛋白和小分子产量方面的进展，涵盖表达系统发展、核心优化策略及未来方向 | 系统总结了代谢流控制、动态调控、系统建模、底盘细胞优化等综合策略，并为工业应用提供方向性指导 | 未提供具体实验数据，对挑战的讨论较为宏观 | 概述Komagataella phaffii代谢工程的最新进展，并探讨未来发展方向 | Komagataella phaffii的代谢工程及异源蛋白和小分子生产 | 代谢工程、合成生物学 | NA | 代谢工程、系统建模 | NA | NA | NA | NA | Komagataella phaffii | 代谢通路调控策略，如代谢流控制、动态调控 | 工业生物技术 |
| 69 | 2026-08-22 |
PlantGFM: A Genomic Foundation Model for Discovery and Creation of Plant Genes
2026-Aug, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.75772
PMID:42160034
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研究论文 | 本文介绍了PlantGFM，一种基于Hyena算子的植物基因组基础模型，通过预训练和微调实现了长上下文预测和从头基因设计，并在植物中验证了其转录和蛋白表达活性 | 首次展示了大型语言模型生成的序列在植物中实现DNA-RNA-蛋白质表达的可行性，并通过AI-人类知识融合筛选管道验证了从头设计基因的功能 | 未提及具体局限性，可能包括对长上下文预测的准确性或生成基因在复杂植物环境中的稳定性等未充分验证的问题 | 开发一种植物基因组基础模型，以实现植物基因的发现和从头设计，推动植物合成生物学和AI辅助育种的发展 | 12种植物物种的基因组序列，以及用于微调的10个已注释植物基因组 | 机器学习 | NA | 基因组预训练，序列生成 | 基于Hyena算子的基础模型 | 基因组序列 | 10.84亿个核苷酸来自12种植物，7个候选基因在烟草中验证 | NA | 本塞姆氏烟草 | NA | 农业，合成生物学 |
| 70 | 2026-08-21 |
Discovering what is possible: How synthetic biology illuminates development
2026-Aug-19, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2026.101619
PMID:42242210
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观点文章 | 本文探讨了合成生物学如何通过自下而上的方法揭示多细胞组织的发育原理和因果机制，并展望了这些工程化系统在理解自然发育过程中的潜力。 | 强调合成系统作为简化平台，用于测试发育潜力的极限，理清因果关系，并预测模型，提供了一种新的研究路径。 | 文中未明确提及局限性，但可能隐含合成系统与自然系统的差异可能导致结论外推受限。 | 探讨合成生物学在阐明多细胞组织发育的一般原理和因果机制中的作用。 | 胚胎发育过程，多细胞组织的自组织性。 | 合成生物学、发育生物学 | NA | 基因组工程、成像、计算建模 | 预测模型 | 文本 | NA | 基因组工程 | NA | NA | 医学 |
| 71 | 2026-08-21 |
Rare functional groups and unique scaffolds in Streptomyces natural products
2026-Aug-19, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d6np00012f
PMID:42300430
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综述 | 该综述总结了链霉菌天然产物中稀有官能团、独特骨架和非典型修饰的结构特征，并探讨其酶促机制与合成生物学应用 | 系统性地将链霉菌天然产物的独特结构与其生物合成酶机制联系起来，为细胞工厂设计和药物分子优化提供新思路 | 未提供具体实验数据，缺乏对各类天然产物覆盖深度的详细说明 | 通过分析链霉菌天然产物的结构多样性和生物合成酶，促进合成生物学在高效细胞工厂设计和新药研发中的应用 | 链霉菌天然产物及其稀有结构特征 | 天然产物化学、合成生物学 | NA | NA | NA | 文献数据 | NA | NA | 链霉菌 | NA | 医学、工业生物技术 |
| 72 | 2026-08-21 |
Fuel-Driven Coacervates: Design Principles, Dissipative Dynamics, and Life-like Functions
2026-Aug-19, Nano letters
IF:9.6Q1
DOI:10.1021/acs.nanolett.6c02653
PMID:42504573
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综述 | 本文综述了燃料驱动的凝聚体系统，重点关注不同燃料类别如何调控其形成、演化和解组装，以及耗散瞬态性质如何产生类生命功能 | 系统性地总结了燃料驱动凝聚体的设计原则和耗散动力学，强调了其在模拟生命系统中的前沿进展 | 综述文章，未提供新的实验数据，可能限制于现有研究的范围 | 探讨燃料调节的凝聚体系统及其在模拟无膜细胞器动态组织中的应用 | 燃料驱动的凝聚体（无膜细胞器模型） | 合成生物学 | NA | 自组装 | NA | 文献综述 | NA | NA | NA | 燃料驱动的凝聚体系统，涉及形成、演化、解组装的动态过程 | 医学、工业生物技术 |
| 73 | 2026-08-21 |
Enzyme Engineering: From Classical Strategies to AI-Driven Biocatalyst Design
2026-Aug-19, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.6c04272
PMID:42616438
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综述 | 本文综述了酶工程从经典策略到AI驱动生物催化剂设计的演变过程，涵盖传统方法、人工智能辅助设计及未来趋势 | 整合了蛋白质语言模型、生成式AI和DBTL自动化闭环工作流在酶工程中的应用，强调自主实验室和可持续生物催化的新兴方向 | 未提供具体实验数据或案例验证，主要基于文献分析 | 总结酶工程从经典方法到AI辅助生物催化剂设计的进展、挑战和未来趋势 | 酶工程中的生物催化剂、蛋白质序列、结构和功能关系 | 机器学习 | NA | 高通量测序、蛋白质语言模型、深度学习、生成式AI | 蛋白质语言模型、深度学习模型、生成式AI模型 | 序列数据、结构数据、功能注释数据 | NA | 合成生物学工具 | NA | 设计-构建-测试-学习（DBTL）闭环工作流 | 工业生物技术, 可持续生物催化 |
| 74 | 2026-08-21 |
Decoding Bistability and Drivers of Phenotypic Variation in Bacteria
2026-Aug-19, Annual review of microbiology
IF:8.5Q1
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综述 | 本文综述了细菌表型异质性及其在基因调控网络中的双稳态机制，并探讨合成生物学在理解抗生素耐药性和持续性方面的应用 | 聚焦合成生物学方法研究细菌基因调控网络，并讨论整合性接合元件的双稳态特性 | 未提供具体实验数据或定量分析 | 探讨细菌表型异质性的功能重要性及其在适应性策略中的作用 | 细菌基因调控网络、双稳态机制、整合性接合元件 | 合成生物学 | 抗生素耐药性 | NA | NA | NA | NA | NA | 细菌 | 双稳态基因调控网络 | 医学 |
| 75 | 2026-08-21 |
High-throughput synthesis of DNA fragments by molecular self-assembly of overlapping oligonucleotides
2026-Aug-19, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-026-03266-2
PMID:42618804
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研究论文 | 本文介绍了一种名为分子自组装诱导克隆的高通量基因合成方法，通过寡核苷酸的重叠互补自组装和宿主细胞内的DNA修复机制，实现大规模基因片段的并行合成 | 该方法利用正交自组装克服了分子串扰和寡核苷酸错位问题，结合微芯片寡核苷酸合成，实现了超过1000个不同基因片段的一锅法并行合成，且错位率接近零 | 寡核苷酸合成错误仍维持在恒定但可控水平，未完全消除合成错误 | 开发一种高通量的基因合成方法，以解决合成生物学中DNA合成技术的瓶颈 | 基因片段、PETase酶的变体文库 | 合成生物学 | NA | 微芯片寡核苷酸合成、分子自组装、宿主细胞DNA修复 | NA | 基因序列数据 | 超过1000个基因片段 | NA | 宿主细胞（未具体指明） | NA | 工业生物技术 |
| 76 | 2026-08-21 |
Spatially Encoded Protocell Network for Non-Cascaded Parallel Biocomputation
2026-Aug-18, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.77019
PMID:42610528
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研究论文 | 本文提出了一种基于空间编码和梯度响应的原始细胞群落非级联并行生物计算架构，用于实现半加器和全加器逻辑运算 | 利用三维水凝胶基质中空间编码的梯度响应原始细胞群落，通过反应-扩散动力学实现非级联的并行多阈值计算，避免了传统分子级联中的信号衰减和串扰问题 | 未在摘要中明确说明局限性 | 开发一种低复杂度、稳健、非级联的分子计算系统，用于并行生物计算 | 空间编码的原始细胞群落 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 基于空间编码的梯度响应原始细胞群落，实现半加器和全加器逻辑运算 | 合成生物学, 计算科学 |
| 77 | 2026-08-20 |
Photodictated Programmed Orthogonal DNA Microdroplets Enable Molecular Communication between Transient Self-Sorting Membraneless Artificial Cells
2026-Aug-18, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.6c05486
PMID:42611219
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研究论文 | 本文报道了一种光引导策略，用于编程两种正交DNA液滴群体的液-液相分离，并实现瞬态融合、分子通信和自分类，基于此构建了多读自重写分子消息加密平台 | 首次通过光引导策略选择性编程两种正交DNA液滴群体的相分离，并实现瞬态融合与耗散性分子通信，展示了内在自分类能力，以及多读和自重写的分子消息加密应用 | 未明确提及局限性，可能限于体外人工细胞模型，尚未在活细胞中验证 | 构建能够展现动态分子通信、空间自分类和耗散信号传导的人工细胞模拟系统 | 两种正交DNA液滴群体，由DNA Y-motif组装而成 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 正交DNA液滴群体通过光引导液-液相分离，瞬态融合后实现分子交换和自分类 | 分子通信、信息加密 |
| 78 | 2026-08-20 |
Harnessing natural variation for photosynthetic improvement in next-generation crop breeding
2026-Aug, Journal of integrative plant biology
IF:9.3Q1
DOI:10.1111/jipb.70317
PMID:42290551
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综述 | 本文综述了光合作用自然变异的研究进展，探讨了如何利用自然遗传多样性和现代生物技术来优化光合作用，提高作物产量潜力，并增强作物对未来气候的适应性 | 系统整合了从生理、发育到冠层尺度的光合作用自然变异，并探讨了合成生物学与光合遗传工程在作物育种中的互补途径 | 未明确提及具体局限性 | 为利用自然遗传多样性和生物技术改造光合作用，提升作物生产力和气候适应性提供战略框架 | 作物光合性状及其自然遗传变异 | 植物科学、作物育种 | NA | NA | NA | 文献数据 | NA | 合成生物学 | 植物 | 增强光合能力的代谢通路或调控网络设计 | 农业 |
| 79 | 2026-08-19 |
SBOL converter: enabling backward compatibility for biological designs
2026-Aug-18, Journal of integrative bioinformatics
IF:1.5Q3
DOI:10.1515/jib-2026-0005
PMID:42608859
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研究论文 | 本文介绍了SBOL转换器，一种支持生物设计向后兼容的工具，可将旧版设计更新至最新SBOL版本，并支持转换为旧版本以兼容传统工具，同时整合现有SBOL工具提供统一的验证和合规检查接口。 | 首次提供SBOL不同版本间的双向转换功能，支持向后兼容及向前兼容，并集成了现有SBOL工具和多种生物格式处理能力，作为轻量级工具加速工程生物学设计工作流。 | 未提及具体限制，但可能受限于SBOL版本间特性差异和工具集成复杂度。 | 旨在促进SBOL标准的采用，通过提供转换工具，实现生物设计在不同版本间的互操作性，提高设计的可重用性和可重复性。 | 生物设计数据，包括SBOL格式（各版本）及其他格式如GenBank和FASTA。 | 合成生物学 | NA | 软件工具开发 | NA | 文本（生物设计数据） | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 80 | 2026-08-19 |
Automated synthetic cell-based screening for designed proteins with emergent functions
2026-Aug-15, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-76787-8
PMID:42603823
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研究论文 | 本文介绍了PUREdrop，一种自动化微流控平台，用于在合成细胞中封装和表达蛋白质库，以筛选具有涌现功能的工程蛋白质 | PUREdrop平台结合了微流控技术和高通量筛选，能够在数千个皮升级合成细胞中并行评估蛋白质表达动力学和复杂功能，弥补了传统筛选方法在时空分辨率和细胞样限制方面的不足 | 摘要中未明确提及局限性 | 通过设计-构建-测试-学习循环，加速功能性蛋白质的工程化筛选，特别是针对具有涌现功能如时空自组织的蛋白质 | 细菌细胞分裂蛋白FtsZ及其变体，以及FtsZ的一般蛋白调节因子 | 合成生物学 | NA | 微流控技术、时间延迟成像、计算蛋白质设计 | NA | 图像（时间延迟成像） | 数千个皮升级合成细胞，每个构建体重复多次（具体数量未在摘要中说明） | NA | 无细胞系统（体外合成细胞） | NA（针对蛋白质筛选，而非基因电路设计） | 工业生物技术、医学 |