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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2026-08-07 |
Fungal biodiversity and oxidative enzymes: nature-based solutions for lignin degradation and circular economy applications
2026-Aug-06, Preparative biochemistry & biotechnology
IF:2.0Q3
DOI:10.1080/10826068.2026.2690415
PMID:42557892
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综述 | 本文系统综述了真菌氧化酶在木质素降解中的应用,涵盖酶结构、催化机制、协同作用及工业转化前景。 | 整合了真菌木质素降解系统的多样性、酶工程和合成生物学进展,并建立与循环生物经济的直接联系。 | 未提及具体实验数据或量化比较,依赖已有文献,缺乏实际工业案例的深度分析。 | 探讨真菌氧化酶用于木质素降解和生物质转化的可持续工业生物技术解决方案。 | 真菌氧化酶,包括木质素过氧化物酶、锰过氧化物酶、多功能过氧化物酶、漆酶及辅助氧化酶。 | 工业生物技术 | NA | 蛋白质工程、定向进化、异源表达、固定化酶系统、合成生物学、人工智能辅助酶优化 | NA | 文献综述 | NA | CRISPR-Cas9, 定向进化, 异源表达 | 真菌 | 木质素降解途径 | 工业生物技术, 环境, 能源, 材料 |
| 102 | 2026-08-07 |
Programmable short peptide condensates with intrinsic enzyme-like activity
2026-Aug-05, Journal of materials chemistry. B
DOI:10.1039/d6tb00685j
PMID:42478940
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研究论文 | 本研究通过短肽共组装构建具有内在酶样催化活性的可编程肽基凝聚物,实现选择性富集底物并促进水解反应 | 首次通过短肽共组装策略将催化功能直接编码到凝聚物形成单元中,赋予凝聚物内在酶样活性,无需外部酶或模拟物封装 | 尚未明确催化活性对局部环境(如pH、温度)的敏感性和长期稳定性,且应用范围有待进一步验证 | 开发一种生物启发的策略来构建具有内在催化功能的可编程肽基凝聚物,模拟天然催化性生物分子凝聚物 | 短肽共组装形成的液态凝聚物(组氨酸标记短肽与三苯丙氨酸基肽) | 合成生物学 | NA | 液相-液相相分离 | NA | 实验数据(包括相分离观察、催化活性测定) | NA | NA | NA | 用于催化水解反应的肽基凝聚物作为生物传感器或仿生反应器 | 合成生物学 |
| 103 | 2026-08-07 |
Harnessing human tumor organoids for cancer modeling and precision therapy
2026-Aug-01, Protein & cell
IF:13.6Q1
DOI:10.1093/procel/pwag007
PMID:41698840
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综述 | 本文综述了人类肿瘤类器官在癌症建模和精准治疗中的应用,涵盖类器官的生成、技术进展、临床应用及未来发展方向。 | 强调了类器官作为动态“活体生物传感器”的潜力,并整合了合成生物学、功能基因组学和机器学习等前沿技术。 | 完全模拟肿瘤微环境仍然困难,尤其是在复制血管复杂性和全身免疫反应方面。 | 探讨人类肿瘤类器官作为功能性精准医学工具,架起基础研究与临床转化之间的桥梁。 | 人类肿瘤类器官,包括患者来源的类器官、基因工程平台以及共培养系统。 | 生物医学 | 癌症 | 类器官培养、共培养系统、类器官芯片、三维生物打印、人工智能分析、合成生物学、功能基因组学 | 类器官模型 | 基因、图像、药物反应数据 | 不适用(综述文章) | CRISPR-Cas9(基因工程) | 人类 | 不适用(主要通过基因工程平台构建类器官,未详细描述特定电路) | 医学 |
| 104 | 2026-08-07 |
Peptide-Ligand Cooperative Interplay Drives Gold Nanoparticle Encapsulation by Protein Cages
2026-Aug, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.73690
PMID:42093323
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研究论文 | 本研究结合实验与分子动力学模拟,揭示了金纳米颗粒被 encapsulin 蛋白笼封装过程中肽-配体协同作用对封装效率和盐浓度依赖性的分子机制 | 首次从分子层面阐明了配体与肽段在金纳米颗粒封装中的协同效应,通过自由能景观分析解释了不同盐浓度下的封装行为差异 | 研究主要聚焦于初始结合阶段,未涵盖封装后续步骤及体内应用验证 | 理解并指导生物启发的纳米笼用于选择性递送和模板合成 | encapsulin 蛋白笼与金纳米颗粒的相互作用 | 合成生物学 | NA | 分子动力学模拟 | NA | 实验数据及模拟数据 | 未明确样本数量,涉及不同盐浓度和配体功能化条件 | NA | NA | NA | 医学, 工业生物技术 |
| 105 | 2026-08-07 |
From design-build-test-learn cycles to AI-driven digital twins for bioprocess scale-up in the Genesis Mission era
2026-Aug, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2026.103516
PMID:42190350
|
评论 | 本文讨论了Genesis Mission倡议下,将合成生物学与人工智能结合以加速生物生产,并指出了AI驱动生物技术发展中的挑战与机遇 | 提出将AI驱动的数字孪生技术与设计-构建-测试-学习循环相结合,以解决生物过程放大中的不确定性 | 未提供具体的实验数据或案例研究,仅从概念层面进行探讨 | 探讨如何利用AI和数字孪生技术优化生物制造过程,促进工业规模的应用 | 微生物菌株、生物反应器操作和生物制造过程 | 机器学习 | NA | NA | 迁移学习、强化学习、贝叶斯优化 | 实时数据、文献数据 | NA | NA | 微生物 | NA | 工业生物技术 |
| 106 | 2026-08-07 |
Emergent bioengineering
2026-Aug, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2026.103520
PMID:42235106
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研究论文 | 本文探讨了利用合成生物学改造现有生态系统,以增强其恢复力并防止突变,提出从经典工程向涌现工程设计的范式转变 | 提出了一种从经典工程到涌现工程的设计哲学转变,强调适应、反馈和多尺度复杂性作为生态系统设计的基础 | 未提供具体的实验结果或案例研究,主要基于理论探讨 | 探讨合成生物学在生态系统工程中的应用,以及如何实现可控且可持续的生态干预 | 现有生态系统及其中的生物群落 | 合成生物学 | 不适用 | 合成生物学 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 生态系统工程中的合成生物电路设计 | 环境 |
| 107 | 2026-08-07 |
Bioinspired Artificial Bioenergetic Organelles: Design Principles, Nanofabrication and Therapeutic Translation
2026-Aug, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.73889
PMID:42377939
|
综述 | 本文综述了仿生人工生物能量细胞器的设计原理、纳米制造方法及其在疾病治疗中的应用,重点关注其通过恢复细胞能量稳态来重塑病理微环境的潜力。 | 创新点在于将线粒体和类囊体工程化的生物能量细胞器作为自主代谢模块,不仅作为递送载体,而是主动整合代谢恢复与多靶点治疗作用,以重塑病理微环境。 | 面临靶向递送、免疫兼容性、功能持久性、生物安全性以及长期代谢命运等关键转化挑战。 | 概述人工生物能量细胞器的设计原理、机制基础及疾病特异性应用,并探讨其临床转化的挑战与前景。 | 人工生物能量细胞器,由线粒体和类囊体工程化而来,用于治疗多种疾病。 | 合成生物学 | 肿瘤、心血管疾病、神经退行性疾病、炎症性疾病 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 108 | 2026-08-05 |
Abiotic stress sensing in plants: Biochemical and biophysical basis
2026-Aug-03, Molecular plant
IF:17.1Q1
DOI:10.1016/j.molp.2026.05.007
PMID:42141723
|
综述 | 本文综述了植物非生物胁迫感知的生化和生物物理基础,探讨了温度、干旱、盐碱、淹水和土壤压实等胁迫的感知机制,以及钙离子和活性氧等通用信使的整合作用,并展望了未来研究方向。 | 系统整合了植物非生物胁迫感知的生化和生物物理机制,强调了物理与化学环境变化编码和转化为生物信号的分子逻辑,并提出了结合AI建模、单细胞技术、合成生物学和基因组编辑等新兴方法。 | 主要识别了尚未解决的关键问题,如主要胁迫相关线索的鉴定、感知的空间组织、复合胁迫的感知,但未提供具体实验数据。 | 阐明植物非生物胁迫感知的生化和生物物理基础,并指出未来研究方向和新兴工具。 | 植物非生物胁迫感知机制,包括温度、干旱、盐碱、淹水和土壤压实等胁迫。 | 植物生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | 基因组编辑 | 植物 | NA | 农业 |
| 109 | 2026-08-05 |
A minimal four-enzyme suite enables biosynthesis of the C20 diterpenoid alkaloid atisinium
2026-Aug-03, Molecular plant
IF:17.1Q1
DOI:10.1016/j.molp.2026.07.004
PMID:42421322
|
研究论文 | 本研究定义了一个由四种酶组成的最小酶套件,可将ent-atiserene转化为C20二萜生物碱atisinium,并揭示了其在乌头属中的生物合成途径。 | 首次阐明了二萜生物碱核心骨架组装的最小四酶套件,包括多功能细胞色素P450和功能新化的短链脱氢酶/还原酶,并实现了异源重构。 | 未提及具体局限性,但可能受限于体内验证的复杂性及异源表达的效率。 | 阐明二萜生物碱核心骨架的生物合成分子机制,并实现其在异源宿主中的重构。 | 露蕊乌头中的二萜生物碱生物合成酶(CYP701A216, CYP71FH3, CYP729G3, AgDAS)及底物ent-atiserene。 | 合成生物学 | NA | 病毒诱导基因沉默、异源表达(烟草和酵母)、细胞色素P450和脱氢酶/还原酶活性分析 | NA | 基因序列、蛋白结构、代谢物谱 | 露蕊乌头植物样本以及烟草和酵母异源表达体系 | 病毒诱导基因沉默 | 烟草、酵母 | 合成途径:四酶级联反应,涉及氧化、自发缩合和还原步骤 | 医药、工业生物技术 |
| 110 | 2026-08-05 |
Graduate Student Literature Review: Methodologies and tools for synthetic biology for the production of next-generation dairy foods
2026-Aug-03, Journal of dairy science
IF:3.7Q2
DOI:10.3168/jds.2026-28550
PMID:42547020
|
综述 | 本文综述了合成生物学在乳制品行业中的应用,重点探讨了蛋白质工程、基因修饰和异源表达技术在下一代乳制品生产中的方法与工具。 | 系统性地总结了利用合成生物学平台工业化生产高附加值乳制品成分(如生物活性蛋白和功能性代谢物)的技术框架。 | 未详细讨论具体的技术挑战、经济成本和监管问题。 | 为研究人员和行业利益相关者提供一个技术框架,以加速合成生物学在下一代乳制品开发中的整合。 | 高价值的乳制品成分(如生物活性蛋白和功能性代谢物)以及非天然宿主中的异源表达系统。 | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程、基因修饰、异源表达 | NA | NA | NA | NA | 非天然宿主(具体不详) | NA | 食品工业 |
| 111 | 2026-08-04 |
Can Cells Be Fully Programmed and Engineered?
2026-Aug-02, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.70331
PMID:42543882
|
观点文章 | 本文从视角角度探讨了合成生物学中细胞编程和工程化的范式,提出应利用生物复杂性而非强制模拟硅基芯片,并展望了生物物理混合实体与生物安全措施的发展 | 提出将细胞视为动态计算资源而非刚性硅基芯片,倡导利用生物物理混合实体(如细胞-半导体壳、硅纳米线、聚合物水凝胶)增强细胞功能,并强调生物安全的重要性 | 作为观点文章,缺乏实验数据支持,主要基于理论论证和已有案例总结 | 探讨合成生物学中细胞编程和工程化的合理范式,主张顺应生物复杂性而非强制模拟数字计算 | 合成生物学中的细胞编程与工程化,包括生物物理混合实体(如细胞与半导体、硅纳米线、聚合物水凝胶的整合) | 合成生物学 | 癌症(提及癌症摧毁电路) | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 细胞电路(如癌症摧毁电路、爆炸物检测、炎症记录型益生菌电路) | 医学、环境、工业生物技术 |
| 112 | 2026-08-02 |
Applying the design-build-test-learn framework to precision fermentation for sustainable food ingredients
2026-Aug, Food science and biotechnology
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s10068-026-02116-w
PMID:42534763
|
综述 | 本文综述了设计-构建-测试-学习(DBTL)框架在精准发酵中的应用,用于可持续食品成分的合成,重点关注食品级微生物平台的开发。 | 系统性地将DBTL框架应用于食品级精准发酵,强调安全、法规和消费者接受度对菌株选择及工程策略的影响,并整合计算设计、自动化构建、高通量测试和数据驱动学习。 | 未提及具体局限性,可能缺乏对工业规模化挑战或法规细节的深入讨论。 | 探讨DBTL框架作为系统性迭代方法,用于开发食品级微生物细胞工厂,生产可持续的食品成分,如替代蛋白、风味化合物和功能性碳水化合物。 | 食品级微生物菌株,用于精准发酵生产可持续食品成分。 | 合成生物学 | NA | 精准发酵 | NA | 文献数据 | NA | NA | 微生物 | DBTL循环(设计-构建-测试-学习) | 食品工业 |
| 113 | 2026-08-01 |
Genetic code expansion: Bridging synthetic biology precision and cellular complexity to decipher molecular mechanisms of diseases
2026-Aug, Current opinion in chemical biology
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.cbpa.2026.102690
PMID:42085977
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综述 | 本文综述了遗传密码扩展技术在疾病生物学研究中的最新进展,重点介绍其如何通过定点引入非天然氨基酸来解析动态蛋白互作、翻译后修饰和信号事件,并讨论该技术面临的挑战及未来发展方向 | 强调遗传密码扩展技术作为合成生物学平台,在生理相关环境中以高时空精度剖析疾病分子机制的独特优势,并展望新兴方法学 | 遗传密码扩展技术在更广泛应用中仍面临关键挑战,如效率、特异性和体内适用性等限制 | 探讨遗传密码扩展技术在疾病机制研究中的应用潜力和局限,提出其作为转化性合成生物学平台的愿景 | 疾病相关的分子通路、蛋白质相互作用、翻译后修饰和信号事件 | 合成生物学 | 多种疾病(未具体指明) | 遗传密码扩展 | NA | NA | NA | 非天然氨基酸定点掺入 | 活体系统(如细胞) | 遗传密码扩展系统 | 医学 |
| 114 | 2026-08-01 |
Discovery and engineering of polymerases and ligases for the synthesis of modified nucleic acids
2026-Aug, Current opinion in chemical biology
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.cbpa.2026.102697
PMID:42143538
|
综述 | 本文综述了利用工程化聚合酶和连接酶合成含非天然构建块的寡核苷酸的最新进展,并提供了一个简化生物催化剂家族脚手架发现的网络应用。 | 重点关注计算工具加速核酸修饰酶的发现与工程化,并提供了一个公开的网络应用以辅助生物催化剂家族探索。 | 未提及明确局限性。 | 综述酶促寡核苷酸合成中工程化聚合酶和连接酶的最新方法,并推动该领域的工具化应用。 | 寡核苷酸、聚合酶、连接酶、非天然构建块 | 合成生物学 | NA | 酶促合成 | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 医疗、诊断、合成生物学 |
| 115 | 2026-08-01 |
Synthetic DNA circuits for programming cell functions
2026-Aug, Current opinion in chemical biology
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.cbpa.2026.102701
PMID:42214130
|
综述 | 本文综述了合成DNA电路在细胞功能编程中的最新进展,重点介绍了DNA逻辑网络与细胞环境的整合,以实现对细胞功能的逻辑门控控制。 | 强调从体外演示向体内功能实施的范式转变,并探讨了将DNA电路与内源通路接口的策略。 | 未明确提及具体局限性。 | 探讨利用合成DNA电路编程细胞功能的方法,以推动精准治疗和自主生物制造的发展。 | 合成DNA电路及其在细胞环境中的集成。 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 链置换、逻辑门、放大器、神经形态架构 | 医学、工业生物技术 |
| 116 | 2026-07-30 |
Learning from nature's plant engineers: Hijacking metabolism and development beyond genetics
2026-Aug, Current opinion in plant biology
IF:8.3Q1
DOI:10.1016/j.pbi.2026.102905
PMID:42250525
|
综述 | 本文探讨了除基因工程外,利用自然界中细菌、真菌和昆虫等生物劫持植物代谢和发育的机制,为合成生物学提供新思路 | 提出超越传统基因工程视角,从物种间相互作用中学习植物代谢重编程的新策略 | NA | 研究自然界生物劫持植物代谢的机制,扩展合成生物学的概念边界 | 植物代谢网络及其与细菌、真菌、昆虫的相互作用 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 植物 | NA | 农业, 工业生物技术, 材料 |
| 117 | 2026-07-30 |
Living sensors: Engineering plants to sense and report on their environments
2026-Aug, Current opinion in plant biology
IF:8.3Q1
DOI:10.1016/j.pbi.2026.102923
PMID:42391913
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综述 | 综述了利用合成生物学改造植物作为活体传感器,以感知和报告环境胁迫的研究进展 | 总结了三类主要策略:利用天然启动子系统、工程化蛋白基生物传感器以及构建植物-微生物跨界信号网络,并结合光学报告系统实现远程检测 | 未明确讨论现有传感器植物在田间部署中的稳定性、可扩展性及环境安全评估等具体限制 | 设计可部署于田间的工程植物传感器,用于实时环境监测和土地管理 | 工程改造的传感器植物(包括植感器或哨兵植物) | 合成生物学 | NA | 合成生物学, 基因工程 | NA | 光学信号(荧光、生物发光、色素信号等) | NA | NA | 植物 | 感知-响应模块(包括天然启动子系统、蛋白基生物传感器、植物-微生物跨界信号网络) | 环境监测, 农业 |
| 118 | 2026-07-29 |
Global research trends and hotspots of plant physiologically active substances: quantitative visualization analysis based on CiteSpace
2026-Aug, Plant biology (Stuttgart, Germany)
DOI:10.1111/plb.70219
PMID:42287740
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综述 | 利用CiteSpace对植物生理活性物质领域2000-2024年间8096篇文献进行文献计量与可视化分析 | 首次系统揭示植物生理活性物质研究从基础化合物分离向机制研究、功能食品和纳米递送系统转变的趋势 | 仅基于Web of Science核心合集数据,可能遗漏其他重要数据库来源 | 分析植物生理活性物质全球研究趋势与热点演变 | 2000-2024年间植物生理活性物质相关研究文献 | 文献计量学 | NA | 文献计量分析、可视化分析 | NA | 文本 | 8096篇文献 | NA | NA | NA | 健康、营养、工业 |
| 119 | 2026-06-21 |
Synergistic dual ring-cleavage pathways enable efficient degradation of chlorobenzenes by Pseudomonas putida BS-1 in groundwater
2026-Aug-01, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2026.142676
PMID:42320103
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研究论文 | 发现恶臭假单胞菌BS-1中一种新型协同双环裂解途径,可有效降解地下水中的氯苯类污染物 | 首次揭示一种由质粒携带的tod-clc基因簇介导的邻位和间位裂解途径协同作用机制,能够快速解毒中间代谢产物氯代儿茶酚 | 研究主要基于单一菌株和实验室条件,未评估长期现场应用中的稳定性和生态影响 | 阐明氯苯类化合物生物降解过程中氯代儿茶酚解毒的新机制,并提供用于地下水修复的微生物资源 | 恶臭假单胞菌BS-1菌株及其降解对二氯苯、氯苯和苯的代谢途径 | 环境微生物学 | NA | 基因敲除、异源表达、代谢产物分析 | NA | 实验数据 | 单一菌株BS-1,以及实际受污染地下水样本(含p-DCB 6.83 mg·L⁻¹和o-DCB 13.31 mg·L⁻¹) | NA | 恶臭假单胞菌 | 由tod-clc基因簇编码的邻位和间位双环裂解途径 | 环境修复 |
| 120 | 2026-07-26 |
Quo vadis reconstituted cell surfaces? Purpose and future perspectives for minimal systems of the cell plasma membrane
2026-Aug, Current opinion in cell biology
IF:6.0Q1
DOI:10.1016/j.ceb.2026.102667
PMID:42349351
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |