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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2026-08-09 |
Engineered diazotrophs with host-inducible nitrogen supply systems: Transforming rice farming through innovative nitrogen biofertilizers
2026-Aug, Journal of integrative plant biology
IF:9.3Q1
DOI:10.1111/jipb.70320
PMID:42367143
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综述 | 本文综述了通过合成生物学改造固氮菌,使其具备宿主诱导的氮供应系统,以作为水稻创新氮生物肥料的潜力,并探讨了减少工业氮肥依赖、推动可持续农业的路径 | 强调结合野生稻中丰富的固氮菌群与现代合成生物学手段,开发可输出氮的工程化固氮菌及合成微生物群落,并针对水稻品种的响应性进行定制化研究 | 未提及具体实验数据或技术限制,主要基于文献综述和展望 | 旨在通过工程化固氮菌提供可持续的氮肥替代方案,补充水稻氮营养,促进可持续农业 | 固氮菌、水稻品种、合成微生物群落 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、宏基因组学 | NA | 文献数据、微生物组数据 | 未明确,涉及野生稻和栽培稻的微生物组研究 | CRISPR-Cas9、TALEN、ZFN | 固氮菌(如共生固氮菌) | 氮输出生物传感器或代谢通路 | 农业、环境 |
| 102 | 2026-08-08 |
S-layer (Glyco)protein lattices: Biophysical principles of antifouling at prokaryotic interfaces
2026-Aug-07, Quarterly reviews of biophysics
IF:7.2Q1
DOI:10.1017/S0033583526100213
PMID:42563455
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综述 | 该综述整合历史超微结构观察与现代原子分辨率结构数据和生物物理原理,论证抗污性是所有细菌和古菌S层的基本和普遍功能,并探讨其在生物技术和材料科学中的仿生应用。 | 首次将S层抗污性置于低雷诺数物理框架下,强调晶格动力学、晶体纳米形貌、静电马赛克、碎片化疏水性、结构化水合壳和聚糖介导的空间排斥的协同作用。 | 主要基于理论综合,缺乏直接实验验证抗污性机制在不同环境下的定量比较。 | 阐明S层(糖)蛋白晶格在低雷诺数环境中的抗污生物物理机制,并突出其作为可调界面的潜力。 | 细菌和古菌的表面层(S层)蛋白和糖蛋白晶格。 | 生物物理学 | NA | NA | NA | 文献数据 | NA | NA | 细菌和古菌 | NA | 生物技术、合成生物学、材料科学 |
| 103 | 2026-08-08 |
Microbial lipases: advances in metagenomics and artificial intelligence for enzyme discovery and engineering
2026-Aug-07, Archives of microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00203-026-05074-3
PMID:42565866
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综述 | 本文综述了宏基因组学和人工智能技术在微生物脂肪酶发现与工程中的最新进展,并简要概述了脂肪酶的来源、结构特征、理化性质及工业应用 | 强调了宏基因组学与人工智能技术的协同作用,用于酶的识别和理性设计,整合大规模序列数据库与预测性计算建模工具,并展望了蛋白质语言模型、生成式人工智能、合成生物学和多组学整合的未来发展 | 存在异源表达水平低、缺乏高质量信息以及工业规模验证有限等挑战 | 探讨宏基因组学和人工智能技术在微生物脂肪酶发现与工程中的应用,以推动高效经济的酶开发和可持续生物技术应用 | 微生物脂肪酶 | 宏基因组学、人工智能 | NA | 宏基因组学、人工智能 | 蛋白质语言模型、生成式人工智能 | 序列数据 | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 104 | 2026-08-08 |
Regulation of Escherichia coli fermentation processes: from molecular mechanisms to smart industrial practice
2026-Aug-07, Archives of microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00203-026-05131-x
PMID:42565891
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综述 | 本文系统综述了大肠杆菌发酵调控从分子机制到智能工业实践的范式转变,涵盖跨尺度关联、先进缓解策略、多尺度建模与数字孪生等前沿方向 | 提出从经验性过程调整向跨尺度、深度耦合的智能控制框架转变,整合模型预测控制与动态合成生物学电路,并强调数字孪生作为工业发酵透明化的工具 | 未提及具体实验数据或案例验证,主要基于文献综述,缺乏实际工业应用的量化评估 | 阐明大肠杆菌发酵调控的现代范式,从分子机制到智能工业实践,推动绿色生物制造 | 大肠杆菌发酵过程 | 工业生物技术 | NA | 多尺度建模、计算流体动力学、基因组规模代谢模型、数字孪生、合成生物学电路 | 模型预测控制、数字孪生、基因组规模代谢模型 | 文献数据 | NA | 合成生物学电路 | 大肠杆菌 | 基于群体感应的生长-生产解耦、代谢物响应反馈回路、光遗传开关 | 工业生物技术、绿色生物制造 |
| 105 | 2026-08-08 |
Integrative framework for selecting gene delivery technologies in microalgae for synthetic biology
2026-Aug-07, Molecular biology reports
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s11033-026-12553-9
PMID:42565914
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研究论文 | 本研究对微藻合成生物学中使用的基因递送技术进行了比较分析,并提出了一个实用的方法选择框架 | 提出了一个基于工程目标和物种特异性细胞特征来组织基因递送方法的选择框架,该框架强调了递送平台需兼容多样化货物、受体物种和工程应用 | 新兴技术如细胞穿透肽和金属有机框架的实用性需要更广泛的物种级验证 | 为微藻合成生物学中的基因递送技术选择提供指导框架 | 微藻基因递送技术,包括常规技术和新兴技术 | 合成生物学 | NA | 基因递送技术(包括 agitation、微粒轰击、电穿孔、农杆菌介导转化、细胞穿透肽、金属有机框架) | NA | 文献数据 | NA | NA | 微藻 | NA | 工业生物技术 |
| 106 | 2026-08-08 |
Phage as a prospective arsenal against superbugs
2026-Aug-04, Molecular biology reports
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s11033-026-12537-9
PMID:42550335
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综述 | 本文全面评述了噬菌体疗法作为抗超级细菌武器库的现状,涵盖其现代分类、治疗优势、生物技术应用、临床转化流程及面临的挑战 | 系统整合了基于基因组的噬菌体分类、基因工程改造、噬菌体衍生蛋白及噬菌体-抗生素协同作用等前沿应用,并展望了合成生物学和人工智能在克服科学、监管和商业障碍中的潜力 | 尽管有同情使用和临床试验的有力证据,仍存在显著的科学、监管和商业障碍,且论文未提供具体临床效果数据 | 探讨噬菌体疗法作为抗生素替代品的潜力,并分析其从实验室到临床应用的转化路径及未来发展方向 | 噬菌体及其衍生蛋白在抗菌治疗中的应用 | 微生物学 | 抗菌素耐药性相关感染 | 基因组测序、基因工程 | NA | 文献资料 | NA | 基因工程(未指定具体工具) | 细菌(未指定具体菌种) | NA | 医学 |
| 107 | 2026-08-08 |
Engineering Naematelia aurantialba as a Robust Synthetic Biology Chassis: Stable Episomal Vector Construction and Metabolic Optimization for Enhanced Polysaccharide Synthesis
2026-Aug-04, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2026.135564
PMID:42551605
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研究论文 | 本研究为金耳(Naematelia aurantialba)构建了稳定的遗传平台,包括优化原生质体再生、鉴定微型着丝粒元件以实现稳定的附加体复制,并通过表达透明颤菌血红蛋白增强细胞呼吸,最终使金耳多糖产量提高44.8% | 首次在金耳中鉴定出475-bp微型着丝粒核心元件,并利用其构建稳定的自主复制附加体载体,解决了转化子遗传嵌合和荧光异质性问题,为金耳代谢工程提供了高效工具 | 摘要未提及研究的局限性,可能包括对非模式真菌的适用性有限、微型着丝粒元件的普适性待验证等 | 建立金耳作为稳健合成生物学底盘,通过遗传工具开发和代谢优化提高金耳多糖产量 | 金耳(Naematelia aurantialba)菌株NX-20,及其工程改造菌株 | 合成生物学 | NA | 原生质体再生、基因组分析、密码子偏好分析、异源表达 | NA | 基因组序列、生化数据、发酵数据 | 金耳菌株NX-20,具体样本数量未明确 | NA | 金耳(Naematelia aurantialba) | 携带微型着丝粒元件的附加体表达载体,整合透明颤菌血红蛋白(VHb)基因 | 工业生物技术 |
| 108 | 2026-08-08 |
Functional diversity, evolution, and translational potential of isoprenoids in eukaryotic membranes
2026-Aug, Trends in biochemical sciences
IF:11.6Q1
DOI:10.1016/j.tibs.2026.04.014
PMID:42161681
|
综述 | 本文综述了类异戊二烯在真核生物膜中的功能多样性、进化及其翻译潜力,重点关注它们作为膜成分如何调节膜性质,并讨论了合成生物学在生产相关类异戊二烯方面的进展与局限 | 系统性地整合了类异戊二烯的结构多样性与膜功能关系,并深入探讨了其在合成生物学生产中的调控和储存机制 | 未提供具体实验数据,可能缺乏对某些细节机制的深入验证 | 阐明类异戊二烯在真核膜中的作用及其合成生物学生产的潜力与挑战 | 类异戊二烯及其衍生化合物在植物、真菌和动物细胞膜中的结构与功能 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | 文献数据 | NA | NA | NA | NA | 生物技术, 医药 |
| 109 | 2026-08-08 |
TolC Is Required for a Mixed-Linkage β-Glucan (MLG) Biosynthesis: Engineering Bacteria for MLG Overproduction
2026-Aug, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.70424
PMID:42552791
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研究论文 | 该研究揭示了TolC蛋白在苜蓿中华根瘤菌混合连接β-葡聚糖生物合成中的关键作用,并通过共过表达策略实现了MLG的高效生产 | 首次发现外膜蛋白TolC作为MLG生物合成机器的一部分,与BgsA和BgsB形成三聚复合体,并通过共过表达tolC、bgsBA和组成型活性二鸟苷酸环化酶(pleD*)实现8倍的MLG产量提升 | TolC与BgsA和BgsB复合体的具体分子机制尚未完全阐明,且生产优化仅在特定条件下验证 | 探究MLG生物合成所需的关键组分并开发增强MLG生产的方法 | 苜蓿中华根瘤菌及中生根瘤菌等根瘤菌宿主 | 合成生物学 | NA | 基因敲除、互补表达、共过表达、生物反应器发酵 | NA | 基因序列、生物量、MLG产量数据 | 涉及多种根瘤菌菌株,具体样本数量未明确 | 基因敲除、遗传互补、共过表达(非指定工程工具) | 苜蓿中华根瘤菌、中生根瘤菌 | 通过共过表达tolC和bgsBA以及pleD*来增强MLG生物合成的基因回路 | 工业生物技术、材料科学 |
| 110 | 2026-08-07 |
Fungal biodiversity and oxidative enzymes: nature-based solutions for lignin degradation and circular economy applications
2026-Aug-06, Preparative biochemistry & biotechnology
IF:2.0Q3
DOI:10.1080/10826068.2026.2690415
PMID:42557892
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综述 | 本文系统综述了真菌氧化酶在木质素降解中的应用,涵盖酶结构、催化机制、协同作用及工业转化前景。 | 整合了真菌木质素降解系统的多样性、酶工程和合成生物学进展,并建立与循环生物经济的直接联系。 | 未提及具体实验数据或量化比较,依赖已有文献,缺乏实际工业案例的深度分析。 | 探讨真菌氧化酶用于木质素降解和生物质转化的可持续工业生物技术解决方案。 | 真菌氧化酶,包括木质素过氧化物酶、锰过氧化物酶、多功能过氧化物酶、漆酶及辅助氧化酶。 | 工业生物技术 | NA | 蛋白质工程、定向进化、异源表达、固定化酶系统、合成生物学、人工智能辅助酶优化 | NA | 文献综述 | NA | CRISPR-Cas9, 定向进化, 异源表达 | 真菌 | 木质素降解途径 | 工业生物技术, 环境, 能源, 材料 |
| 111 | 2026-08-07 |
Programmable short peptide condensates with intrinsic enzyme-like activity
2026-Aug-05, Journal of materials chemistry. B
DOI:10.1039/d6tb00685j
PMID:42478940
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研究论文 | 本研究通过短肽共组装构建具有内在酶样催化活性的可编程肽基凝聚物,实现选择性富集底物并促进水解反应 | 首次通过短肽共组装策略将催化功能直接编码到凝聚物形成单元中,赋予凝聚物内在酶样活性,无需外部酶或模拟物封装 | 尚未明确催化活性对局部环境(如pH、温度)的敏感性和长期稳定性,且应用范围有待进一步验证 | 开发一种生物启发的策略来构建具有内在催化功能的可编程肽基凝聚物,模拟天然催化性生物分子凝聚物 | 短肽共组装形成的液态凝聚物(组氨酸标记短肽与三苯丙氨酸基肽) | 合成生物学 | NA | 液相-液相相分离 | NA | 实验数据(包括相分离观察、催化活性测定) | NA | NA | NA | 用于催化水解反应的肽基凝聚物作为生物传感器或仿生反应器 | 合成生物学 |
| 112 | 2026-08-07 |
Engineering programmable floating wetlands: synthetic biology, sensing, and AI control for water quality
2026-Aug-03, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2026.135561
PMID:42546780
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综述 | 本文综述了浮动处理湿地的生物强化证据,探讨了通过合成生物学、传感和AI控制提升水质处理性能的途径,并提出了可编程浮动湿地的转化路线图 | 提出了将合成生物学、传感和AI控制集成到浮动处理湿地中的可测试转化路线图,并引入了报告和治理指标以确保负责任部署 | 未明确阐述,但指出了某些污染物的破坏性转化难以实现,以及翻译过程中存在菌群逆转、抑制性中间产物等失败模式 | 评估浮动处理湿地的性能限制,并提出通过生物强化、工程改造和智能控制实现可编程水处理的策略 | 浮动处理湿地及其相关湿地的植物-微生物联合体、生物膜、微生物燃料电池和电化学过程 | 环境工程、合成生物学 | NA | 多组学、生物强化、微生物燃料电池、电化学氧化、电絮凝 | NA | 综述文献数据 | NA | CRISPR-Cas9、合成生物学工具 | 植物、微生物联合体 | 生物传感器、逻辑门、代谢通路 | 环境、水处理 |
| 113 | 2026-08-07 |
Bacteriophage P22 Virus-Like Particles as Nanoscale Protein Scaffolds for Plant Synthetic Biology
2026-Aug-03, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70735
PMID:42547846
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研究论文 | 本文首次在真核生物中展示了肠杆菌噬菌体P22病毒样颗粒作为植物合成生物学纳米级蛋白质支架的可行性,通过在本氏烟草中瞬时表达验证了其组装、货物封装及外部蛋白展示功能 | 首次在植物中表达P22 VLP,并证明其能在真核生物中正确组装和封装重组蛋白,同时通过SpyTag/SpyCatcher系统实现货物封装与外部展示的同步编程 | 摘要未提及具体局限性,可能需要进一步研究P22 VLP在植物中长期表达的稳定性和效率 | 探索P22病毒样颗粒作为植物合成生物学的新型蛋白质工程支架,扩展植物中蛋白质工程工具的可用性 | 肠杆菌噬菌体P22病毒样颗粒、本氏烟草(Nicotiana benthamiana)、重组蛋白货物 | 合成生物学 | NA | 瞬时表达、蛋白质共封装、SpyTag/SpyCatcher介导的蛋白质缀合 | NA | 蛋白质数据 | 未明确说明样本量,涉及本氏烟草植物的瞬时表达实验 | NA | 本氏烟草(Nicotiana benthamiana) | P22病毒样颗粒支架,用于货物封装和外部蛋白展示 | 植物合成生物学 |
| 114 | 2026-08-07 |
Harnessing human tumor organoids for cancer modeling and precision therapy
2026-Aug-01, Protein & cell
IF:13.6Q1
DOI:10.1093/procel/pwag007
PMID:41698840
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综述 | 本文综述了人类肿瘤类器官在癌症建模和精准治疗中的应用,涵盖类器官的生成、技术进展、临床应用及未来发展方向。 | 强调了类器官作为动态“活体生物传感器”的潜力,并整合了合成生物学、功能基因组学和机器学习等前沿技术。 | 完全模拟肿瘤微环境仍然困难,尤其是在复制血管复杂性和全身免疫反应方面。 | 探讨人类肿瘤类器官作为功能性精准医学工具,架起基础研究与临床转化之间的桥梁。 | 人类肿瘤类器官,包括患者来源的类器官、基因工程平台以及共培养系统。 | 生物医学 | 癌症 | 类器官培养、共培养系统、类器官芯片、三维生物打印、人工智能分析、合成生物学、功能基因组学 | 类器官模型 | 基因、图像、药物反应数据 | 不适用(综述文章) | CRISPR-Cas9(基因工程) | 人类 | 不适用(主要通过基因工程平台构建类器官,未详细描述特定电路) | 医学 |
| 115 | 2026-08-07 |
Peptide-Ligand Cooperative Interplay Drives Gold Nanoparticle Encapsulation by Protein Cages
2026-Aug, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.73690
PMID:42093323
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研究论文 | 本研究结合实验与分子动力学模拟,揭示了金纳米颗粒被 encapsulin 蛋白笼封装过程中肽-配体协同作用对封装效率和盐浓度依赖性的分子机制 | 首次从分子层面阐明了配体与肽段在金纳米颗粒封装中的协同效应,通过自由能景观分析解释了不同盐浓度下的封装行为差异 | 研究主要聚焦于初始结合阶段,未涵盖封装后续步骤及体内应用验证 | 理解并指导生物启发的纳米笼用于选择性递送和模板合成 | encapsulin 蛋白笼与金纳米颗粒的相互作用 | 合成生物学 | NA | 分子动力学模拟 | NA | 实验数据及模拟数据 | 未明确样本数量,涉及不同盐浓度和配体功能化条件 | NA | NA | NA | 医学, 工业生物技术 |
| 116 | 2026-08-07 |
From design-build-test-learn cycles to AI-driven digital twins for bioprocess scale-up in the Genesis Mission era
2026-Aug, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2026.103516
PMID:42190350
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评论 | 本文讨论了Genesis Mission倡议下,将合成生物学与人工智能结合以加速生物生产,并指出了AI驱动生物技术发展中的挑战与机遇 | 提出将AI驱动的数字孪生技术与设计-构建-测试-学习循环相结合,以解决生物过程放大中的不确定性 | 未提供具体的实验数据或案例研究,仅从概念层面进行探讨 | 探讨如何利用AI和数字孪生技术优化生物制造过程,促进工业规模的应用 | 微生物菌株、生物反应器操作和生物制造过程 | 机器学习 | NA | NA | 迁移学习、强化学习、贝叶斯优化 | 实时数据、文献数据 | NA | NA | 微生物 | NA | 工业生物技术 |
| 117 | 2026-08-07 |
Emergent bioengineering
2026-Aug, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2026.103520
PMID:42235106
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研究论文 | 本文探讨了利用合成生物学改造现有生态系统,以增强其恢复力并防止突变,提出从经典工程向涌现工程设计的范式转变 | 提出了一种从经典工程到涌现工程的设计哲学转变,强调适应、反馈和多尺度复杂性作为生态系统设计的基础 | 未提供具体的实验结果或案例研究,主要基于理论探讨 | 探讨合成生物学在生态系统工程中的应用,以及如何实现可控且可持续的生态干预 | 现有生态系统及其中的生物群落 | 合成生物学 | 不适用 | 合成生物学 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 生态系统工程中的合成生物电路设计 | 环境 |
| 118 | 2026-08-07 |
Bioinspired Artificial Bioenergetic Organelles: Design Principles, Nanofabrication and Therapeutic Translation
2026-Aug, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.73889
PMID:42377939
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综述 | 本文综述了仿生人工生物能量细胞器的设计原理、纳米制造方法及其在疾病治疗中的应用,重点关注其通过恢复细胞能量稳态来重塑病理微环境的潜力。 | 创新点在于将线粒体和类囊体工程化的生物能量细胞器作为自主代谢模块,不仅作为递送载体,而是主动整合代谢恢复与多靶点治疗作用,以重塑病理微环境。 | 面临靶向递送、免疫兼容性、功能持久性、生物安全性以及长期代谢命运等关键转化挑战。 | 概述人工生物能量细胞器的设计原理、机制基础及疾病特异性应用,并探讨其临床转化的挑战与前景。 | 人工生物能量细胞器,由线粒体和类囊体工程化而来,用于治疗多种疾病。 | 合成生物学 | 肿瘤、心血管疾病、神经退行性疾病、炎症性疾病 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 119 | 2026-08-05 |
Abiotic stress sensing in plants: Biochemical and biophysical basis
2026-Aug-03, Molecular plant
IF:17.1Q1
DOI:10.1016/j.molp.2026.05.007
PMID:42141723
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综述 | 本文综述了植物非生物胁迫感知的生化和生物物理基础,探讨了温度、干旱、盐碱、淹水和土壤压实等胁迫的感知机制,以及钙离子和活性氧等通用信使的整合作用,并展望了未来研究方向。 | 系统整合了植物非生物胁迫感知的生化和生物物理机制,强调了物理与化学环境变化编码和转化为生物信号的分子逻辑,并提出了结合AI建模、单细胞技术、合成生物学和基因组编辑等新兴方法。 | 主要识别了尚未解决的关键问题,如主要胁迫相关线索的鉴定、感知的空间组织、复合胁迫的感知,但未提供具体实验数据。 | 阐明植物非生物胁迫感知的生化和生物物理基础,并指出未来研究方向和新兴工具。 | 植物非生物胁迫感知机制,包括温度、干旱、盐碱、淹水和土壤压实等胁迫。 | 植物生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | 基因组编辑 | 植物 | NA | 农业 |
| 120 | 2026-08-05 |
A minimal four-enzyme suite enables biosynthesis of the C20 diterpenoid alkaloid atisinium
2026-Aug-03, Molecular plant
IF:17.1Q1
DOI:10.1016/j.molp.2026.07.004
PMID:42421322
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研究论文 | 本研究定义了一个由四种酶组成的最小酶套件,可将ent-atiserene转化为C20二萜生物碱atisinium,并揭示了其在乌头属中的生物合成途径。 | 首次阐明了二萜生物碱核心骨架组装的最小四酶套件,包括多功能细胞色素P450和功能新化的短链脱氢酶/还原酶,并实现了异源重构。 | 未提及具体局限性,但可能受限于体内验证的复杂性及异源表达的效率。 | 阐明二萜生物碱核心骨架的生物合成分子机制,并实现其在异源宿主中的重构。 | 露蕊乌头中的二萜生物碱生物合成酶(CYP701A216, CYP71FH3, CYP729G3, AgDAS)及底物ent-atiserene。 | 合成生物学 | NA | 病毒诱导基因沉默、异源表达(烟草和酵母)、细胞色素P450和脱氢酶/还原酶活性分析 | NA | 基因序列、蛋白结构、代谢物谱 | 露蕊乌头植物样本以及烟草和酵母异源表达体系 | 病毒诱导基因沉默 | 烟草、酵母 | 合成途径:四酶级联反应,涉及氧化、自发缩合和还原步骤 | 医药、工业生物技术 |