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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-06-16 |
Xeno nucleic acids (XNAs): advances in synthesis, diagnostics, and therapeutics
2026-Sep-05, Bioorganic chemistry
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.bioorg.2026.110000
PMID:42160832
|
综述 | 全面综述异源核酸(XNA)的合成、表征及其在诊断和治疗中的应用 | 系统性地概述了多种异源核酸变体的合成方法、结构特性及临床转化潜力,强调其在分子诊断和精准医学中的变革性作用 | 当前面临可规模化合成、有效递送系统及全面结构-功能理解的挑战 | 总结异源核酸(XNA)的化学修饰、合成方法、表征技术及生物医学应用 | 锁核酸、肽核酸、己糖醇核酸、氟阿拉伯糖核酸、吗啉代寡聚体等异源核酸变体 | 分子生物学、生物技术 | NA | 磷酰胺化学法、工程聚合酶酶促合成法、热熔融分析、圆二色光谱、核磁共振、质谱、测序方法 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学(精准医学、分子诊断、治疗)、生物技术 |
| 2 | 2026-06-14 |
Tailoring polyhydroxybutyrate by molecular weight regulation: Green synthesis, food-grade performance and innovative ketogenic applications
2026-Sep-01, Food research international (Ottawa, Ont.)
DOI:10.1016/j.foodres.2026.119525
PMID:42270240
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review | 本文系统综述了通过分子量调控定制聚羟基丁酸酯(PHB)的技术,包括绿色合成、食品安全性能及创新生酮应用 | 创新点在于系统比较了生物合成调控、化学/酶修饰调控和AI辅助合成生物学修饰三种核心技术,并建立了从技术比较到应用瓶颈、解决方案及未来趋势的综合逻辑框架 | 文中未提及具体实验数据验证,缺乏定量分析或案例研究支持,且对AI辅助方法的实际应用效果探讨有限 | 探讨PHB分子量精确调控技术在食品工业中的高价值应用,推动标准化和规模化应用,促进绿色可持续发展 | 聚羟基丁酸酯(PHB)及其与聚乳酸(PLA)、聚丁二酸丁二醇酯(PBS)等主流生物降解材料的比较 | machine learning | NA | NA | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick | E. coli, S. cerevisiae, B. subtilis, 哺乳动物细胞, 植物 | 遗传开关、振荡器、逻辑门、生物传感器、代谢途径 | 食品, 工业生物技术, 环境 |
| 3 | 2026-06-11 |
Recombinant human serum albumin-A paradigm shift: From laboratory development to industrial-scale production, and clinical translation
2026-Sep, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108914
PMID:42086096
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综述 | 本文综述了重组人血清白蛋白从实验室开发到工业规模生产和临床转化的路径 | 强调重组人血清白蛋白的生产平台选择不仅基于产量,还综合考虑了可扩展性、成本效益、监管可行性和与下一代纯化策略的兼容性,并展望了其作为多功能生物治疗平台的潜力 | 实现其全部潜力取决于克服生产规模化的经济挑战、确保产品一致性以及利用合成生物学和智能制造 | 总结重组人血清白蛋白的工业化路径并探讨其未来应用价值 | 重组人血清白蛋白的生产平台(酵母和转基因水稻)及临床证据 | NA | NA | 重组蛋白表达、综合多模式纯化技术 | NA | NA | NA | 合成生物学, 智能制造 | 酵母(Komagataella phaffii), 转基因水稻 | NA | 医学, 药物递送, 先进疗法 |
| 4 | 2026-06-10 |
Closing the loop: AI-driven integration of multi-omics and phenomics for systematic resilient crop engineering
2026-Sep, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108908
PMID:42035969
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综述 | 综述了人工智能驱动的多组学与表型组学整合闭环框架,用于系统性的抗逆作物工程 | 提出从边缘到云的闭环框架,融合多组学、实时表型组学和合成生物学,利用Transformer和图神经网络解码基因型-环境-管理互作的非线性动力学,并从被动预测转向主动设计,通过生成式AI加速设计-构建-测试-学习循环 | 未明确讨论具体实施中的计算资源需求、数据整合标准缺失以及实地验证的潜在挑战 | 系统性地将作物改良转变为可预测的工程学科,以应对气候变化下的粮食安全挑战 | 作物基因型、表型及环境互作系统 | 机器学习 | NA | NA | Transformer架构、图神经网络、生成式AI、基础模型 | 多组学数据、表型组学数据 | NA | 合成生物学、基因电路设计 | 作物 | 抗逆蛋白和基因电路 | 农业 |
| 5 | 2026-06-09 |
Bacterial conjugation and its deployment for diverse biotechnology applications
2026-Sep, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108894
PMID:41956307
|
review | 综述细菌接合在合成生物学中的应用,包括基因回路传递、代谢工程、微生物底盘识别和生物修复等 | 系统阐述了接合机制在合成生物学中的重新利用,以及结合多种合成生物学策略扩展研究空间的新方法 | 未讨论接合传递的效率限制及潜在的生物安全问题 | 总结细菌接合在合成生物学中的最新进展,并为研究人员提供利用接合传递的实用指南 | 细菌接合系统及其在合成生物学中的应用 | 合成生物学 | NA | 细菌接合 | NA | NA | NA | 接合系统 | 多种微生物(供体菌和靶标菌) | 遗传回路、代谢通路 | 生物技术, 环境修复, 微生物工程 |
| 6 | 2026-06-09 |
Random mutagenesis platform for accelerated genome evolution (RAMPAGE) of Pichia pastoris
2026-Sep, Engineering microbiology
DOI:10.1016/j.engmic.2026.100269
PMID:42256413
|
研究论文 | 开发了一种用于毕赤酵母的随机诱变加速基因组进化平台RAMPAGE | 首次建立适用于毕赤酵母的连续全基因组进化平台,实现高效表型进化并揭示耐受性相关基因 | NA | 开发加速毕赤酵母基因组进化的随机诱变平台,提升其在极端工业条件下的适应性 | 毕赤酵母菌株 | 合成生物学 | NA | 全基因组重测序 | NA | 基因组序列 | 经进化筛选的毕赤酵母菌株 | 随机诱变 | 毕赤酵母 | 连续基因组进化系统 | 工业生物技术 |
| 7 | 2026-06-08 |
Recent advances and challenges in the biomanufacturing of L-homoserine as a versatile C4 platform chemical
2026-Sep, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108880
PMID:41921584
|
综述 | 综述L-高丝氨酸作为通用C4平台化学品在生物制造中的最新进展与挑战 | 系统整合了L-高丝氨酸细胞工厂的代谢工程策略,并总结了其高价值衍生物的生物合成途径,强调L-高丝氨酸多功能化平台的应用潜力 | 目前缺乏涵盖整合代谢工程策略的系统性综述 | 总结构建高效L-高丝氨酸细胞工厂的进展,讨论技术障碍与新兴机遇,为开发稳健的微生物制造平台提供战略路线图 | L-高丝氨酸及其下游衍生物 | 合成生物学 | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA | NA | 大肠杆菌, 谷氨酸棒杆菌 | L-高丝氨酸生物合成途径 | 工业生物技术 |
| 8 | 2026-06-08 |
From modular engineering to practical applications: Advances in GPCR-based yeast biosensors
2026-Sep, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108909
PMID:42035967
|
综述 | 系统梳理了基于GPCR的酵母生物传感器从模块化工程到实际应用的研究进展 | 通过模块化框架分析传感、转导和输出核心模块的工程策略,并强调人工智能与合成生物学整合的未来方向 | 未明确讨论当前传感器在复杂环境中的稳定性和可重复性限制 | 总结GPCR酵母生物传感器的工程优化方法及应用扩展 | 基于GPCR的酵母生物传感器 | 合成生物学 | 不适用 | GPCR信号转导 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 酿酒酵母 | 模块化传感器电路(传感模块-GPCRs、转导模块-酵母信号网络、输出模块-报告系统) | 医学、环境、农业、工业生物技术 |
| 9 | 2026-06-08 |
Biological valorization of non-food feedstocks: A critical review
2026-Sep, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108918
PMID:42128207
|
综述 | 全面评述非食物原料的生物转化,涵盖原料特性、转化路径、废物升级及技术经济评估 | 系统梳理非食物原料特性与生物转化途径间的机制联系,并整合合成生物学和多组学驱动的前沿转化技术与废物升级策略 | 未详细讨论不同转化路线在工业放大中的具体工程障碍 | 阐明非食物原料生物转化的挑战与进展,为可持续生物炼制提供战略指导 | 非食物原料(如木质纤维素、有机废弃物等)及其生物转化系统 | 工业生物技术 | NA | 厌氧消化、堆肥、合成生物学驱动发酵、多组学分析 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick | E. coli, S. cerevisiae, B. subtilis, 哺乳动物细胞, 植物 | 代谢途径工程、逻辑门、生物传感器 | 环境, 能源, 材料, 食品, 工业生物技术 |
| 10 | 2026-06-07 |
Dynamic, autonomous gene expression system for self-adaptation and self-regulation in microbial production
2026-Sep, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108889
PMID:41942052
|
综述 | 综述了微生物生产中用于自适应和自调节的动态自主基因表达系统的最新进展 | 系统总结了单细胞和群体水平上的自主调控策略,包括代谢物响应和细胞负担响应系统,并强调了反馈和前馈控制架构在实现稳定性、响应性和预测性适应中的不同机制 | NA | 为构建能够在动态生物加工条件下自主优化性能的下一代细胞工厂提供设计原理、代表性应用和未来展望 | 微生物细胞工厂中的自主基因调控系统 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 微生物细胞工厂 | 动态自主基因表达系统,包括代谢物响应系统、细胞负担响应系统、群体感应响应系统和pH响应系统 | 工业生物技术, 医药, 农业, 环境, 能源, 材料, 食品 |
| 11 | 2026-06-04 |
Synthetic biology development of microbial strains for liquid biofuel production
2026-Sep, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108891
PMID:41950978
|
综述 | 综述了利用合成生物学开发液体生物燃料生产微生物菌株的最新进展 | 从底盘菌株选择、合成生物学工具开发和代谢调控工具三个角度系统总结了合成生物学在菌株工程中的应用进展,并通过重要生物燃料的菌株开发案例展示了其巨大潜力 | 未提及当前合成生物学方法在工业化应用中面临的具体挑战或局限性 | 总结合成生物学在开发液体生物燃料生产菌株方面的最新进展,为生物燃料技术发展提供参考 | 液体生物燃料生产菌株 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | 代谢途径优化 | 能源 |
| 12 | 2026-06-07 |
Unveiling the mechanistic principles and engineered exploitation of bacteria and derivatives in precision drug delivery
2026-Sep, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108902
PMID:42019701
|
综述 | 系统探索了四种前沿细菌衍生递送系统的工程策略与应用潜力,包括活体生物治疗产品、细菌分泌系统、细胞外收缩注射系统和细菌细胞外囊泡 | 系统比较了四种细菌衍生递送平台(LBPs、T1SS-T7SS、eCISs、bEVs)的递送机制、载荷特性、工程灵活性及临床转化挑战 | 临床转化挑战包括安全性控制、工程稳定性及免疫原性问题 | 探索细菌及其衍生物在精准药物递送中的工程化应用原理与机制 | 四种细菌衍生递送系统:活体生物治疗产品、细菌分泌系统、细胞外收缩注射系统、细菌细胞外囊泡 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、纳米技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 细菌 | 遗传电路、细菌分泌系统、细胞外收缩注射系统、细菌细胞外囊泡 | 医学 |
| 13 | 2026-06-07 |
Astaxanthin biomanufacturing under hierarchical constraints: Integrating synthetic biology and artificial intelligence for scalable production
2026-Sep, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108915
PMID:42105954
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综述 | 重新概念化虾青素生物合成过程为分层约束管理问题,并提出与层级对齐、AI辅助的框架 | 将虾青素生物合成重新构想为分层约束管理问题,并提出层级对齐的AI辅助框架,使人工智能在分子、途径和系统层面分别利用蛋白质语言模型、图学习模型及卷积神经网络等进行结构化优化 | 属于概念框架,未在实际系统中进行实验验证或比较传统方法的效果 | 解决虾青素规模化生物制造中由生物学复杂性导致的生产性能瓶颈 | 虾青素(高价值酮类胡萝卜素)的生物合成过程 | 合成生物学 | NA | 蛋白质语言模型、序列-结构感知方法、图学习模型、卷积神经网络、多模态学习、大型语言模型 | 蛋白质语言模型、图学习模型、卷积神经网络、多模态模型、大语言模型 | 文本、序列、结构数据、多组学数据 | NA | NA | 未指定宿主,但适用于多种微生物或细胞系统 | 虾青素生物合成途径 | 工业生物技术, 医药, 食品 |
| 14 | 2026-06-07 |
Toward predictable and programmable genetic circuits in plants
2026-Sep, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108924
PMID:42140530
|
综述 | 探讨植物基因线路的定量预测设计方法,构建可预测和可编程的基因线路 | 提出将植物合成生物学中的预测性设计作为跨基因、生理和环境尺度的系统工程挑战,并系统整理新兴的定量工程框架 | 主要基于文献综述,缺乏实际实验验证;未解决具体植物物种间的生理差异性对预测性能的影响 | 实现植物基因线路的可预测性和可编程设计,推动从定性开关向定量传感和信息处理转变 | 植物基因线路的定量工程框架及其影响因素 | 合成生物学 | NA | 量化表征、标准化测量、多尺度建模 | NA | NA | NA | NA | 模式植物、农作物 | 基因线路(包括定量传感、信息处理、模型指导设计) | 农业 |
| 15 | 2026-06-05 |
Unlocking non-model organisms with CRISPR-Cas: A roadmap for sustainable biotechnology
2026-Sep, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108890
PMID:42000334
|
综述 | 该综述系统评估了将CRISPR-Cas基因组编辑应用于非模式生物所面临的挑战与机遇,并提出了一个框架以解决宿主特异性障碍、启用技术解决方案和实际应用 | 提出了一个系统框架,整合了宿主特异性障碍分析、创新技术解决方案(如Cas变体工程、宿主适应性递送系统、无DSB编辑方法)以及合成生物学与机器学习优化,旨在解锁非模式生物在可持续生物技术中的潜力 | 未具体说明局限性,但综述本身依赖于现有文献,可能存在数据覆盖不全的问题 | 评估并推动CRISPR-Cas编辑在非模式生物中的应用,以促进可持续生物技术(如低能耗生物制造、环境生物修复和碳捕获)的发展 | 非模式生物(非传统宿主) | 机器学习 | NA | CRISPR-Cas, 碱基编辑, 先导编辑, CRISPR相关转座酶, 重组酶辅助工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, CRISPR-Cas12, CRISPR-Cas13 | 非模式生物(泛指,如细菌、酵母、植物等,未具体指定) | NA | 农业, 生物制造, 环境修复 |
| 16 | 2026-06-05 |
Sustainable insect pest management using bioactive compounds derived from marine macroalgae: A comprehensive review
2026-Sep, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2026.134672
PMID:42035956
|
综述 | 综述了从海洋大型藻类中提取的生物活性化合物在可持续害虫管理中的应用潜力 | 系统总结了绿藻、棕藻和红藻中多种生物活性化合物的杀虫、驱避、拒食和生长调节特性,并强调了其在综合害虫管理中的作用及未来生物技术升级方向 | 实践应用受限于代谢物含量的季节性和区域变异性、大规模生产与提取成本高、田间验证不足及监管问题 | 评估海洋大型藻类生物活性化合物作为可持续害虫管理替代方案的潜力 | 海洋大型藻类(绿藻、棕藻、红藻)及其衍生的生物活性化合物 | 机器学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 农业 |
| 17 | 2026-06-05 |
Probiotics: From natural to artificial
2026-Sep, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108916
PMID:42092720
|
综述 | 系统总结了从天然益生菌到人工益生菌的技术进展与应用前景 | 综合了人工智能、高通量筛选、定向进化、基因编辑等核心技术,首次系统阐述人工益生菌的理性设计与构建策略 | 讨论了生物安全评估、监管政策、体内适应性和剂量调控等主要挑战 | 为下一代人工益生菌的研究、临床转化和工业应用提供理论路线图 | 人工益生菌 | 机器学习 | NA | 高通量筛选、定向进化、基因编辑 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 益生菌 | NA | 医学, 环境, 食品 |
| 18 | 2026-06-04 |
Semi-rational engineering of terminal deoxynucleotidyl transferase for high-efficiency enzymatic de novo DNA synthesis
2026-Sep, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2026.03.009
PMID:41938127
|
研究论文 | 通过半理性工程改造末端脱氧核苷酸转移酶(TdT),实现了高效、可扩展的酶促DNA从头合成 | 通过UniProt数据库挖掘发现BtTdT并对其功能进行特性表征,结合AlphaFold3预测结构进行结构域截短和理性突变,获得显著提升3'-ONH-dNTP掺入活性的五重突变体M5 | 论文未说明该方法在长链DNA合成中的实际保真度和序列长度限制,也缺乏与现有磷酰胺酯方法的全面对比 | 开发高效、环保的酶促DNA合成技术,实现工业级DNA制造 | 末端脱氧核苷酸转移酶(TdT)及其突变体 | 生物技术 | NA | 酶促DNA合成, NGS(间接通过数据库挖掘), 计算机模拟(AlphaFold3) | AlphaFold3 | 序列数据(蛋白质序列) | 多种突变体评估(具体样本量未明确报告) | NA | NA | NA | 合成生物学, 工业生物技术 |
| 19 | 2026-06-04 |
Filamentous fungal synthetic biology: Current applications and ongoing developments
2026-Sep, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108912
PMID:42069191
|
综述 | 综述丝状真菌合成生物学在当前应用与未来发展 | 探讨丝状真菌在食品、医药、材料科学和生物修复等领域的新兴应用,并结合基因测序和计算技术促进合成生物学标准化 | 指出研究领域中的挑战和研究空白,如标准化语言创新不足 | 促进丝状真菌合成生物学在多种工程和应用领域的理解与标准化 | 丝状真菌 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 丝状真菌 | NA | 食品, 医药, 材料科学, 生物修复 |
| 20 | 2026-05-26 |
Combination of adaptive laboratory evolution and metabolic engineering on Vibrio natriegens for efficient production of 3-hydroxypropionic acid from ethanol
2026-Sep, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2026.134757
PMID:42067166
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研究论文 | 通过适应性实验室进化和代谢工程改造Vibrio natriegens,实现从乙醇高效生产3-羟基丙酸 | 首次利用适应性实验室进化筛选出能利用乙醇的Vibrio natriegens菌株,并通过启动子优化、背景菌株理性设计和添加浅蓝菌素显著提升3-羟基丙酸产量 | 未提及乙醇利用效率低和耐受性差的具体机制,以及工业化规模放大的可行性 | 开发一种高效从乙醇生产3-羟基丙酸的Vibrio natriegens工程菌株 | Vibrio natriegens菌株及3-羟基丙酸生物合成途径 | NA | NA | 适应性实验室进化、代谢工程 | NA | NA | NA | NA | Vibrio natriegens | 3-羟基丙酸生物合成途径 | 工业生物技术 |