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当前共找到 44 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-08-01 |
Development, optimization, and application of an episomal plasmid system for Rhodotorula toruloides
2026-Sep, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2026.102489
PMID:42288134
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研究论文 | 本文首次为红冬孢酵母（Rhodotorula toruloides）开发了功能性附加体质粒系统，并优化了转化效率，实现了多基因途径表达和CRISPR基因组编辑。 | 首次构建了R. toruloides的附加体质粒系统，通过筛选多种来源的自主复制序列（ARS）鉴定出功能元件C63F4，并开发了Cre-loxP介导的体内再环化策略以提高转化效率，同时建立了简化的CRISPR无缝基因组编辑工具。 | 文中未提及明确的局限性，但可能包括质粒稳定性和拷贝数仍有提升空间，以及系统对其他菌株的适用性未知。 | 开发并优化红冬孢酵母的附加体质粒系统，以加速代谢工程、合成生物学和基础研究。 | 红冬孢酵母（Rhodotorula toruloides）菌株CBS14及其工程改造。 | 合成生物学 | NA | NGS（用于筛选ARS）、CRISPR-Cas9 | NA | 基因序列、质粒稳定性数据、基因表达数据 | 筛选了多种来源的候选ARS，具体样本数未提及 | CRISPR-Cas9、Cre-loxP系统 | 红冬孢酵母（Rhodotorula toruloides） | 附加体质粒系统pC63F4，包含自主复制序列（ARS）C63F4、GFP报告基因、多基因代谢途径（用于三乙酸内酯、脂肪醇和柠檬烯生产）、以及基于CRISPR的基因组编辑工具 | 工业生物技术、代谢工程 |
| 2 | 2026-08-01 |
A plug-and-play cytochrome P450 system enables de novo biosynthesis of 2-phenylethanol derivatives
2026-Sep, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2026.102493
PMID:42314827
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研究论文 | 开发了一种基于细胞色素P450的即插即用系统，通过定向进化和代谢工程，在解脂耶氏酵母中实现了2-苯乙醇衍生物的从头生物合成 | 通过结构引导的酶工程实现了P450BM3的区域发散性羟基化，具有高区域选择性和对映选择性；在5升生物反应器中实现了最高产量；意外发现糖基转移酶的混杂活性，促进了红景天苷和2-苯乙基-β-D-吡喃葡萄糖苷的创纪录生产 | 摘要中未提及明确的局限性 | 开发可扩展和适应性强的即插即用氧化生物催化系统，用于可持续生产高价值芳香族化合物 | 2-苯乙醇衍生物，包括(R)-1-苯基乙二醇、酪醇、红景天苷和2-苯乙基-β-D-吡喃葡萄糖苷 | 合成生物学 | NA | 定向酶进化、结构引导的蛋白质工程、代谢工程 | NA | 文本、实验数据 | 不适用 | CRISPR-Cas9 | 解脂耶氏酵母 | 细胞色素P450驱动的羟基化途径 | 工业生物技术 |
| 3 | 2026-08-01 |
Evolution-guided high yield production of potent Gαq/11-signalling inhibitors FR900359 and YM-254890
2026-Sep, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2026.102497
PMID:42373013
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研究论文 | 本文通过进化引导的合成生物学策略，开发了稳健的异源微生物系统，用于高产生产Gαq/11信号抑制剂FR900359和YM-254890 | 首次采用进化引导策略，利用未培养微生物来源和链霉菌强启动子，实现了FR900359和YM-254890在异源宿主中的高产生产，并开发了双拷贝BGC宿主以进一步提高产量 | 未明确提及，但可能涉及异源宿主的生产稳定性或BGC组装复杂性 | 开发高产、成本效益高的微生物生产系统，用于生产Gαq/11信号抑制剂FR900359和YM-254890，以促进其生物技术应用和药物开发 | FR900359和YM-254890的生物合成基因簇，以及异源宿主Burkholderia gladioli Δgbn::attB和Δgbn::2attB | 合成生物学 | Gα突变肿瘤 | 异源表达、基因簇组装、启动子工程 | NA | 序列数据、产量数据 | 多个BGC构建体和两种异源宿主菌株 | CRISPR-Cas9 | Burkholderia gladioli | 生物合成基因簇的异源表达和双重拷贝 | 医学、工业生物技术 |
| 4 | 2026-07-15 |
Recent advances in the biosynthesis of bacterial hybrid polyketide-non ribosomal peptide natural products
2026-Sep-15, Bioorganic chemistry
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.bioorg.2026.110227
PMID:42442297
|
综述 | 综述了细菌杂合聚酮合酶-非核糖体肽合成酶天然产物的生物合成研究进展 | 首次系统总结了近十年（2015-2025）细菌来源的杂合PKS-NRPS天然产物，涵盖其结构、生物活性、基因簇及域组织多样性 | 仅聚焦于细菌来源的杂合系统，未涵盖真菌等其他来源 | 全面概述细菌杂合PKS-NRPS天然产物生物合成的复杂性及其潜在的治疗/生物技术应用 | 细菌来源的杂合聚酮合酶-非核糖体肽合成酶天然产物及其生物合成基因簇 | 合成生物学 | NA | 基因组挖掘、生物信息学、酶学表征 | NA | 序列数据 | NA | NA | 细菌 | 杂合PKS-NRPS生物合成通路 | 医学, 工业生物技术 |
| 5 | 2026-07-25 |
CRISPRing through time: How cutting-edge technology is revolutionizing life sciences and medicine
2026-Sep-08, Molecular therapy. Nucleic acids
DOI:10.1016/j.omtn.2026.103003
PMID:42494498
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6 | 2026-06-08 |
A deep learning multi-attention Bi-GRU framework for kcat prediction with segmentation-based insights
2026-Sep, Enzyme and microbial technology
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.enzmictec.2026.110915
PMID:42250496
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研究论文 | 提出一种基于深度学习多注意力机制的双向门控循环单元框架KcatNeuroCortex，用于预测酶的催化效率kcat值 | 通过分割策略捕捉局部功能基序，并结合多注意力机制整合长程相互作用，实现可解释性和预测精度的提升，相比DLKcat将R²提高57% | 未明确提及模型的泛化能力验证或对极端序列条件的测试 | 开发可解释且准确的酶催化效率预测工具，支持代谢工程和合成生物学研究 | 酶的催化效率预测 | 机器学习 | NA | 深度学习 | 双向门控循环单元（Bi-GRU）结合多注意力机制 | 酶序列数据 | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术, 代谢工程, 合成生物学 |
| 7 | 2026-07-25 |
SynBioGPT2: A dynamic reasoning framework enables high-fidelity design of microbial cell factories
2026-Sep, Biodesign research
DOI:10.1016/j.bidere.2026.100093
PMID:42491263
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 8 | 2026-07-19 |
Genome position does not impact transgene expression efficiency in the ancient red alga Cyanidioschyzon merolae
2026-Sep-25, New biotechnology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.nbt.2026.05.004
PMID:42107704
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研究论文 | 研究了古红藻Cyanidioschyzon merolae中基因组位置对转基因表达效率的影响 | 首次在C. merolae中建立并验证了一组中性整合位点，发现基因组位置对转基因表达无显著影响 | 仅针对单一宿主和特定转基因进行分析，可能不适用于其他基因或物种 | 探究基因组位置对转基因表达的影响并建立可重复的核基因组工程框架 | Cyanidioschyzon merolae的40个基因间位点 | 合成生物学 | NA | 同源重组, 自动化转化, 报告基因分析 | NA | 基因表达数据, 代谢物产量数据 | 38个经验证的整合位点，涵盖16条染色体 | 同源重组, 机器人辅助转化 | Cyanidioschyzon merolae | 异源异戊二烯合酶表达回路 | 工业生物技术 |
| 9 | 2026-07-19 |
Evaluation of Ogataea polymorpha DUR31 TPP riboswitch as a tool to downregulate gene expression in the yeast Komagataella phaffii
2026-Sep-25, New biotechnology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.nbt.2026.06.009
PMID:42372865
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研究论文 | 评估了Ogataea polymorpha DUR31 TPP核糖开关在Komagataella phaffii中作为基因表达下调工具的适用性 | 首次将来自多形汉逊酵母的TPP核糖开关应用于毕赤酵母Komagataella phaffii，补充了该宿主中有限的合成生物学调控工具 | 核糖开关存在显著的基础渗漏表达，不能作为严格的分子开关；剪接效率受局部序列上下文强烈影响 | 评估异源TPP核糖开关在K. phaffii中调控基因表达的可行性 | Komagataella phaffii酵母 | 工业生物技术 | NA | 流式细胞术、RT-PCR | NA | 荧光表达数据、转录本剪接数据 | NA | NA | Komagataella phaffii | TPP核糖开关，通过GAP启动子调控EGFP和UBIYΔkGFP*报告基因表达 | 工业生物技术 |
| 10 | 2026-07-18 |
From fermentation to pharmabiotics: engineering kefir-derived Lactobacillus for targeted intratumoral immunotherapy in colorectal Cancer
2026-Sep-15, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2026.117032
PMID:42289150
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综述 | 本文综述了从发酵到药物生物的流程，将开菲尔中的乳杆菌工程改造为用于结直肠癌靶向瘤内免疫治疗的活体生物治疗产品 | 提出了将开菲尔来源的乳杆菌通过合成生物学改造为肿瘤靶向活体药物，实现局部免疫微环境重塑和协同免疫检查点抑制剂治疗 | 面临生物遏制、生产放大和监管审批等转化挑战 | 开发基于工程化乳杆菌的活体生物治疗产品用于结直肠癌靶向免疫治疗 | 开菲尔中的乳杆菌菌株 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 合成生物学 | NA | 文本 | NA | CRISPR-Cas9 | 乳杆菌 | 肿瘤低氧区域靶向生物传感器、体内原位生物反应器、纳米抗体和细胞因子释放回路 | 医学 |
| 11 | 2026-07-13 |
In silico identification and characterisation of putative biphenyl degradation mechanism in gut-derived Pediococcus pentosaceus
2026-Sep-01, Environmental research
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.envres.2026.125000
PMID:42276346
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研究论文 | 本研究通过计算分析鉴定了从蟑螂肠道分离的片球菌QS-GN03_1中潜在的联苯降解机制 | 首次在肠道来源的片球菌中通过基因组分析发现一个可能通过水平基因转移获得的bphC基因，并揭示了其作为完整Bph操纵子退化遗存的可能性 | 预测的自由配体结合能显示PPBPHCIII与配体的结合亲和力弱于功能验证的1EIR复合物，且菌株缺乏独立的PCB矿化能力 | 探索利用益生微生物减少多氯联苯（PCBs）在牲畜肠道中吸收的策略 | 蟑螂（美洲大蠊）肠道来源的片球菌QS-GN03_1 | 计算生物学 | NA | 全基因组测序 | NA | 基因组序列 | 单一菌株QS-GN03_1 | CRISPR-Cas9, IS30家族插入序列 | 片球菌（Pediococcus pentosaceus） | 联苯降解通路（Bph操纵子） | 农业, 环境, 工业生物技术 |
| 12 | 2026-07-13 |
Targeting the phenolic A-ring unifies the toxicology and remediation of environmental estrogens in aquatic environments
2026-Sep-01, Environmental research
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.envres.2026.125044
PMID:42297271
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综述 | 综述了环境雌激素在水生环境中的毒理学机制及其修复策略，强调酚A环结构在毒性和修复中的核心作用 | 提出以酚A环结构为共同靶点统一环境雌激素的毒理学机制和修复策略，并探讨合成生物学在靶向生物降解中的潜力 | 主要基于现有文献综述，缺乏实际环境条件下修复技术的系统性实验验证，且针对复杂污染物混合物的挑战仅初步讨论 | 阐明环境雌激素基于酚A环结构的有害机制，并指导其在水生系统中的靶向消除策略 | 环境雌激素（包括类固醇和非类固醇类）及其在水生环境中的生态毒理效应 | 环境科学 | NA | 生物转化、化学转化、物理吸附、合成生物学 | NA | NA | NA | 合成生物学工具（如CRISPR-Cas9） | NA | 靶向生物降解途径 | 环境 |
| 13 | 2026-07-13 |
One-step selection of high-affinity COP1 aptamers
2026-Sep, aBIOTECH
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.abiote.2026.100060
PMID:42434511
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研究论文 | 开发了一种基于磁珠的一步式适体筛选方法（BOSS），成功筛选出高亲和力的AtCOP1适体 | 提出BOSS方法，将传统SELEX的多个步骤简化为一步，显著提高筛选效率并减少非特异性结合 | 研究仅验证了针对AtCOP1蛋白的可行性，未测试其他靶标；体内共定位实验未评估适体的功能调控效果 | 开发高效适体筛选平台以支持植物合成生物学应用 | 拟南芥组成型光形态建成蛋白1（AtCOP1）的N端RING结构域 | 合成生物学 | NA | BOSS方法、高通量测序 | NA | 核酸序列数据 | 随机ssDNA文库（未说明具体数量） | NA | 植物（拟南芥） | NA | 农业、合成生物学 |
| 14 | 2026-07-09 |
Gene expression in synthetic biology: Going with the light
2026-Sep, Journal of biotechnology
IF:4.1Q2
DOI:10.1016/j.jbiotec.2026.06.010
PMID:42276281
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综述 | 本文综述了利用光诱导基因表达在合成生物学中的应用，重点探讨了光遗传学方法与基因回路设计的结合 | 系统总结了光敏启动子、光调节转录因子和光笼诱导剂等光诱导基因表达元件，并首次将光作为二进制输入函数与逻辑门设计相结合，阐明了光遗传学与合成生物学之间的关联 | 主要聚焦于原核生物，对真核系统仅作简要比较，可能限制了在高等生物中的应用推广 | 综述光诱导基因表达在合成生物学中的关键元件和逻辑门设计，促进光遗传学与合成生物学的融合 | 原核生物为主，兼与真核基因表达系统比较 | 合成生物学 | NA | 光遗传学 | NA | NA | NA | NA | 原核生物, 真核生物 | 光诱导基因表达回路, 逻辑门 | 生物技术, 医学 |
| 15 | 2026-07-05 |
The critical patch size problem on networks
2026-Sep, Mathematical biosciences
IF:1.9Q3
DOI:10.1016/j.mbs.2026.109749
PMID:42320745
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研究论文 | 研究网络环境中人口持续存活的临界斑块大小问题 | 首次在图论框架内系统研究临界斑块大小，推导出随机网络中保证种群持久生存的谱图参数界限 | 分析依赖于线性化算子特征值条件，可能未完全捕捉非线性动态行为的复杂性 | 探讨强异质介质（网络）中种群动态的临界斑块大小及其影响因素 | 离散晶格、多连接晶格及随机网络上的种群动态 | 网络科学 | NA | NA | 图拉普拉斯算子 | 网络结构数据 | NA | NA | NA | NA | 生态网络、合成生物学、脑连接组神经退行性疾病传播建模 |
| 16 | 2026-06-16 |
Xeno nucleic acids (XNAs): advances in synthesis, diagnostics, and therapeutics
2026-Sep-05, Bioorganic chemistry
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.bioorg.2026.110000
PMID:42160832
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综述 | 全面综述异源核酸（XNA）的合成、表征及其在诊断和治疗中的应用 | 系统性地概述了多种异源核酸变体的合成方法、结构特性及临床转化潜力，强调其在分子诊断和精准医学中的变革性作用 | 当前面临可规模化合成、有效递送系统及全面结构-功能理解的挑战 | 总结异源核酸（XNA）的化学修饰、合成方法、表征技术及生物医学应用 | 锁核酸、肽核酸、己糖醇核酸、氟阿拉伯糖核酸、吗啉代寡聚体等异源核酸变体 | 分子生物学、生物技术 | NA | 磷酰胺化学法、工程聚合酶酶促合成法、热熔融分析、圆二色光谱、核磁共振、质谱、测序方法 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学（精准医学、分子诊断、治疗）、生物技术 |
| 17 | 2026-06-14 |
Tailoring polyhydroxybutyrate by molecular weight regulation: Green synthesis, food-grade performance and innovative ketogenic applications
2026-Sep-01, Food research international (Ottawa, Ont.)
DOI:10.1016/j.foodres.2026.119525
PMID:42270240
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review | 本文系统综述了通过分子量调控定制聚羟基丁酸酯（PHB）的技术，包括绿色合成、食品安全性能及创新生酮应用 | 创新点在于系统比较了生物合成调控、化学/酶修饰调控和AI辅助合成生物学修饰三种核心技术，并建立了从技术比较到应用瓶颈、解决方案及未来趋势的综合逻辑框架 | 文中未提及具体实验数据验证，缺乏定量分析或案例研究支持，且对AI辅助方法的实际应用效果探讨有限 | 探讨PHB分子量精确调控技术在食品工业中的高价值应用，推动标准化和规模化应用，促进绿色可持续发展 | 聚羟基丁酸酯（PHB）及其与聚乳酸（PLA）、聚丁二酸丁二醇酯（PBS）等主流生物降解材料的比较 | machine learning | NA | NA | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick | E. coli, S. cerevisiae, B. subtilis, 哺乳动物细胞, 植物 | 遗传开关、振荡器、逻辑门、生物传感器、代谢途径 | 食品, 工业生物技术, 环境 |
| 18 | 2026-06-11 |
Recombinant human serum albumin-A paradigm shift: From laboratory development to industrial-scale production, and clinical translation
2026-Sep, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108914
PMID:42086096
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综述 | 本文综述了重组人血清白蛋白从实验室开发到工业规模生产和临床转化的路径 | 强调重组人血清白蛋白的生产平台选择不仅基于产量，还综合考虑了可扩展性、成本效益、监管可行性和与下一代纯化策略的兼容性，并展望了其作为多功能生物治疗平台的潜力 | 实现其全部潜力取决于克服生产规模化的经济挑战、确保产品一致性以及利用合成生物学和智能制造 | 总结重组人血清白蛋白的工业化路径并探讨其未来应用价值 | 重组人血清白蛋白的生产平台（酵母和转基因水稻）及临床证据 | NA | NA | 重组蛋白表达、综合多模式纯化技术 | NA | NA | NA | 合成生物学, 智能制造 | 酵母（Komagataella phaffii）, 转基因水稻 | NA | 医学, 药物递送, 先进疗法 |
| 19 | 2026-06-10 |
Closing the loop: AI-driven integration of multi-omics and phenomics for systematic resilient crop engineering
2026-Sep, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108908
PMID:42035969
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综述 | 综述了人工智能驱动的多组学与表型组学整合闭环框架，用于系统性的抗逆作物工程 | 提出从边缘到云的闭环框架，融合多组学、实时表型组学和合成生物学，利用Transformer和图神经网络解码基因型-环境-管理互作的非线性动力学，并从被动预测转向主动设计，通过生成式AI加速设计-构建-测试-学习循环 | 未明确讨论具体实施中的计算资源需求、数据整合标准缺失以及实地验证的潜在挑战 | 系统性地将作物改良转变为可预测的工程学科，以应对气候变化下的粮食安全挑战 | 作物基因型、表型及环境互作系统 | 机器学习 | NA | NA | Transformer架构、图神经网络、生成式AI、基础模型 | 多组学数据、表型组学数据 | NA | 合成生物学、基因电路设计 | 作物 | 抗逆蛋白和基因电路 | 农业 |
| 20 | 2026-06-09 |
Bacterial conjugation and its deployment for diverse biotechnology applications
2026-Sep, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108894
PMID:41956307
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review | 综述细菌接合在合成生物学中的应用，包括基因回路传递、代谢工程、微生物底盘识别和生物修复等 | 系统阐述了接合机制在合成生物学中的重新利用，以及结合多种合成生物学策略扩展研究空间的新方法 | 未讨论接合传递的效率限制及潜在的生物安全问题 | 总结细菌接合在合成生物学中的最新进展，并为研究人员提供利用接合传递的实用指南 | 细菌接合系统及其在合成生物学中的应用 | 合成生物学 | NA | 细菌接合 | NA | NA | NA | 接合系统 | 多种微生物（供体菌和靶标菌） | 遗传回路、代谢通路 | 生物技术, 环境修复, 微生物工程 |