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当前共找到 172 篇文献,本页显示第 1 - 20 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 工程工具 宿主生物 回路设计 应用领域
1 2026-10-31
Regulatory cascade of NdpR and NdpR2 in controlling nicotine degradation operons in Sphingomonas melonis TY
2026-09-23, Applied and environmental microbiology IF:3.9Q2
研究论文 该文阐明了Sphingomonas melonis TY中NdpR和NdpR2协同调控尼古丁降解操纵子的级联调控机制,并基于此构建了可编程的多因子基因回路 揭示了NdpR和NdpR2在重叠靶启动子上的多层級联调控网络,提出了转录和蛋白质水平协同作用的双锁调控机制,并开发了响应尼古丁、2,5-DHP和IPTG的双向可逆多因子基因回路 研究主要基于结构模拟和突变分析,缺乏体内动态实时监测数据;异源宿主应用仅在假单胞菌JY-Q中验证,普适性有待进一步评估 解析NdpR和NdpR2调控尼古丁降解操纵子的层级关系和分子机制,并开发可编程调控工具 Sphingomonas melonis TY中的TetR家族调控蛋白NdpR和AraC家族调控蛋白NdpR2及其靶启动子 合成生物学 NA 结构分析、定点突变、分子模拟 NA 文本、结构数据 NA NA Sphingomonas melonis TY, Pseudomonas sp. JY-Q 多因子基因回路(双向可逆响应尼古丁、2,5-DHP和IPTG) 环境, 工业生物技术
2 2026-10-30
EXPERT: A practical and forward-looking guide to capturing protein expression and purification metadata to develop machine learning models
2026-Sep-29, The Journal of biological chemistry IF:4.0Q2
研究论文 本文提出了EXPERT框架,用于标准化蛋白质表达与纯化实验数据的记录,以支持机器学习模型的开发 首次提出社区统一的蛋白质表达与纯化实验报告模板EXPERT,整合学术界和工业界专家意见,定义结构化数据记录标准 本文为指南性框架,尚未在实际大规模数据集中验证其有效性,且参数集可能需随领域发展迭代 建立一致、完整、标准化的蛋白质表达与纯化实验报告框架,提高实验室间可重复性并支持下游机器学习应用 蛋白质表达与纯化实验工作流及其实验数据记录 机器学习 NA NA NA 文本 NA NA NA NA 医学,工业生物技术
3 2026-10-30
Proanthocyanidins: structure, biosynthesis, regulation, and structure-activity relationships
2026-Sep, aBIOTECH IF:4.6Q1
综述 本文综述了原花青素的结构多样性、生物合成途径、调控网络及构效关系的研究进展 系统整合了原花青素结构、生物合成、调控及构效关系的最新研究进展,并提出了未来精准生物制造的研究方向 聚合位点、决定聚合物结构的机制以及精确的构效关系等关键知识缺口尚未阐明 梳理原花青素研究的最新进展,明确未来研究方向以推动精准生物制造 原花青素(黄烷-3-醇单体的寡聚体或聚合物) 植物次生代谢与合成生物学 NA NA NA 文本 NA 基因编辑,合成生物学 植物 NA 医药,食品,动物营养
4 2026-10-28
Identifying paths to ammonium production in Vibrio natriegens by characterizing nitrogenase regulation
2026-Sep-25, Metabolic engineering IF:6.8Q1
研究论文 该文通过功能基因组学、靶向突变和报告基因实验,表征了需钠弧菌固氮酶的调控蛋白,揭示了NtrBC、NifA、GlnB和GlnK在氮源响应中的作用,并发现GlnB/GlnK对NtrBC的冗余抑制导致铵分泌 首次系统鉴定了需钠弧菌固氮酶的调控层级,发现NifA足以激活固氮酶基因表达而NtrBC仅影响表达时序,并揭示GlnB和GlnK对NtrBC的冗余抑制更类似于非固氮大肠杆菌而非其他固氮γ-变形菌 研究仅基于实验室条件下的表征,未在工业或环境条件下验证;未涉及其他调控因子或全局调控网络;铵分泌水平未定量优化 表征需钠弧菌固氮酶的调控机制,为利用廉价氮气生产铵提供改造框架 需钠弧菌(Vibrio natriegens)的固氮酶调控系统 合成生物学 NA 功能基因组学、靶向突变、报告基因实验 NA 实验数据(基因表达、生长表型、铵分泌) NA NA 需钠弧菌(Vibrio natriegens) NA 工业生物技术、农业
5 2026-10-28
Genomics of the Genus Rhodiola: From Genome Assembly to High-Altitude Adaptation and Bioactive Compound Biosynthesis
2026-Sep-22, Genes IF:2.8Q2
综述 该文综述了红景天属植物的基因组学进展,包括叶绿体与核基因组组装、比较基因组学及多组学整合,以理解其高海拔适应性和活性化合物生物合成机制 系统整合了过去十年的基因组学研究,全面阐明了红景天苷生物合成途径,鉴定了 rosavin 生物合成的候选基因,预测了转录调控因子,并提出了植物-微生物组对特殊代谢的贡献 转座子爆发和谱系特异性基因家族动态与适应性之间的因果关系尚未建立;rosavin 生物合成途径仅鉴定到候选基因,尚未完全阐明 理解基因组机制如何同时贡献于环境适应和活性化合物生物合成,并探讨红景天属作为高海拔适应与药用化合物生物合成研究模型的潜力 红景天属(Rhodiola)高山药用植物 基因组学, 比较基因组学, 多组学整合 NA 叶绿体基因组组装, 核基因组组装, 比较基因组学, 转座子分析, 基因家族分析, 多组学整合, 转录组学, 代谢组学 NA 基因组序列, 多组学数据 NA NA NA NA 医药, 合成生物学, 分子育种
6 2026-10-28
Flaxseed gum-reinforced sodium alginate semi-interpenetrating polymer network W1/O/W2 emulgels for targeted co-delivery of prebiotics and engineered "living factory": a novel next-generation synbiotic system for anoxia-triggered synergistic inulin metabolism
2026-Sep, International journal of biological macromolecules IF:7.7Q1
研究论文 该文报道了一种由亚麻籽胶增强的海藻酸钠半互穿聚合物网络W1/O/W2乳液凝胶,用于益生元和工程化“活工厂”的靶向共递送,构建了新一代合生元系统以实现缺氧触发的菊粉协同代谢 将合成生物学与生物大分子组装相结合,构建了缺氧响应型工程化大肠杆菌Nissle1917作为“活工厂”,并设计亚麻籽胶增强的海藻酸钠半互穿聚合物网络W/O/W乳液凝胶实现益生元与工程菌的同步共递送,实现不依赖宿主微生物异质性的确定性菊粉代谢 仅在体外模拟胃肠条件下验证,缺乏体内动物实验或临床试验数据;菊粉水解率在4小时仅为20.0%,效率有待提高;未评估工程菌的长期安全性和生态影响 解决宿主微生物代谢异质性限制菊粉类益生元健康效益的问题,开发不依赖宿主异质性的新一代工程化合生元递送平台 工程化大肠杆菌Nissle1917、菊粉、W/O/W乳液凝胶递送系统 合成生物学、微生物组工程、药物递送 NA 合成生物学、W/O/W乳液凝胶制备、钙交联凝胶化、半互穿聚合物网络构建 NA 实验数据(流变学、质构、体外释放与水解数据) NA NA 大肠杆菌Nissle1917 缺氧响应型菊粉酶分泌系统(双酶系统) 医学、食品、工业生物技术
7 2026-10-27
The Role of Zinc and Junctional Adhesion Molecule A Protein in Platelet Plug Formation
2026-Sep-29, Medicines (Basel, Switzerland)
研究论文 研究锌离子通过靶向JAM-A蛋白激活血小板聚集和血小板栓形成的机制 首次发现锌离子通过靶向JAM-A蛋白激活其细胞粘附和细胞骨架动力学功能,促进血小板聚集;并设计合成生物学小肽淬灭锌效应 未明确说明样本量,机制研究主要在体外进行,需进一步体内验证 探索锌离子在血小板栓形成中的靶点及分子机制,扩展参与血小板栓形成的蛋白谱 血小板、JAM-A蛋白、锌离子、ADP 机器学习 心血管疾病 尺寸排阻色谱、表面等离子共振、透射电子显微镜、血小板聚集实验 NA 实验数据 NA 合成生物学小肽 NA NA 医学
8 2026-10-26
Programmable Enhancement of IRES-Mediated Translation via RNA-Guided eIF4G Recruitment
2026-Sep-15, Biochemistry IF:2.9Q3
研究论文 本文提出了一种通过RNA引导的eIF4G招募来可编程增强IRES介导翻译的策略 利用工程化的RNA结合蛋白融合体招募截短的eIF4G支架,选择性增强EMCV IRES介导的翻译而不影响帽依赖表达,最高实现7.7倍增强,并可通过效应物剂量和连接子设计在宽动态范围内调节翻译输出 未明确说明 开发一种可编程策略来增强IRES依赖的翻译,扩展合成生物学中转录后基因调控的工具箱 IRES元件(特别是EMCV IRES)、eIF4G蛋白、λN融合蛋白、哺乳动物细胞系 合成生物学 NA RNA引导的翻译调控、蛋白质工程 计算模型 文本 多种哺乳动物细胞系及三顺反子构建体 NA 哺乳动物细胞 三顺反子构建体用于多顺反子表达的协调调控 医学, 工业生物技术
9 2026-10-25
Mechanisms and Application Prospects of Nicotine from Plant Defense to the Frontiers of Bioengineering
2026-Sep-30, Journal of agricultural and food chemistry IF:5.7Q1
综述 系统综述了尼古丁的生物合成、调控网络、生态功能及应用潜力,并提出连接核心代谢途径、生态系统相互作用与合成生物学发展的整合框架 提出将尼古丁研究从以减害为主导的范式转变为主动设计新功能并开发高价值实用应用的整合框架,强调连接代谢途径、生态相互作用与合成生物学 对转运途径的理解尚不完整,尼古丁在代谢、应激反应和生物活性潜力中的复杂作用仍未充分探索 系统多维概述尼古丁研究,推动尼古丁研究范式转变 尼古丁及其生物合成、调控网络、生态功能和应用潜力 合成生物学 NA NA NA 文本 NA NA NA NA 医学,工业生物技术
10 2026-10-25
Recent Advances in the Production and Biosynthesis of Oleanane-Type Pentacyclic Triterpenoids
2026-Sep-30, Journal of agricultural and food chemistry IF:5.7Q1
综述 本文综述了齐墩果烷型五环三萜的分类、生物合成途径以及在植物体外培养和微生物细胞工厂中的生产进展,并讨论了提高三萜产量的工程策略 系统总结了齐墩果烷型五环三萜生物合成的最新进展,并归纳了包括增加前体供应、减少竞争途径、酶工程、辅因子工程、亚细胞区室化、增强转运和优化发酵条件等多种工程策略 作为综述文章,未提供原始实验数据;文中指出的现有生物合成挑战尚未完全解决 总结齐墩果烷型五环三萜的生产与生物合成研究进展,并探讨提高产量的工程策略 齐墩果烷型五环三萜类化合物及其生物合成途径 合成生物学 NA 合成生物学, 代谢工程 NA 文本 NA NA 植物, 微生物 三萜生物合成途径 医药, 工业生物技术
11 2026-10-25
Reprogramming RNA Degraders as Intracellular Molecule Sensors for Tumor Cell Sensing and Manipulation
2026-Sep-25, ACS sensors IF:8.2Q1
研究论文 本文介绍了一个名为TRADER的模块化平台,通过重编程RNA降解器来响应细胞内分子(如miRNA、ATP和蛋白酶)从而激活转基因表达,并展示了其在肿瘤细胞传感和清除中的应用 利用 proximity-dependent RNA降解器系统(dCas6-barnase)在转录后水平实现转基因激活,通过miRNA靶位点或蛋白酶切割连接子解除抑制,并引入正反馈回路实现信号放大 文中未明确说明局限性,可能包括需要进一步优化体内递送效率和特异性 开发一种灵活可扩展的工具,用于细胞状态特异性的转基因表达控制,应用于合成生物学、细胞诊断和精准治疗 肿瘤细胞、细胞内分子(miRNA、ATP、cathepsin B蛋白酶) 合成生物学 肿瘤 RNA降解器系统、dCas6-barnase融合、miRNA靶位点、蛋白酶切割连接子、正反馈回路 NA NA NA dCas6-barnase 哺乳动物细胞 proximity-dependent RNA降解器系统、正反馈回路 医学、合成生物学
12 2026-10-25
Advances in Metabolic Engineering for Biosynthesis of 5-Aminolevulinic Acid
2026-Sep-23, Journal of agricultural and food chemistry IF:5.7Q1
综述 本文综述了代谢工程和合成生物学在微生物细胞工厂生产5-氨基乙酰丙酸(5-ALA)方面的生物合成途径与工程策略进展 系统梳理了5-ALA生物合成途径及酶工程、途径优化和细胞工程等代谢工程策略的最新进展,并提出了可持续生产的挑战与展望 作为综述文章,未提供原始实验数据,主要基于已有文献进行归纳总结 总结增强5-ALA生产的生物合成途径和代谢工程策略的最新进展,为微生物平台的合理设计与优化提供指导 5-氨基乙酰丙酸(5-ALA)及其微生物细胞工厂 合成生物学, 代谢工程 NA 代谢工程, 合成生物学 NA 文本 NA NA 微生物细胞 5-ALA生物合成途径 农业, 医学
13 2026-10-25
Engineering DNA-Targeting CRISPR and CRISPR-Like Effectors: Advances from Rational Design and High-Throughput Screening to AI-Driven Development
2026-Sep-18, ACS synthetic biology IF:3.7Q1
综述 本文系统综述了靶向DNA的CRISPR及类CRISPR效应蛋白的工程化改造进展,涵盖结构导向理性设计、定向进化与高通量筛选、生物信息学与进化指导的挖掘以及人工智能辅助开发 提出将天然效应蛋白发现、结构导向假设生成、高通量功能筛选、机器学习模型构建和迭代重设计整合为合成生物学工程连续体,并强调DBTL启发的工作流程 作为综述文章,未提供原始实验数据验证;讨论的策略整合仍处于概念框架阶段,实际工程化应用仍面临递送、PAM限制和脱靶等挑战 总结DNA靶向CRISPR和类CRISPR效应蛋白在筛选、优化和功能工程方面的进展,推动基因组编辑向更高效率、安全性和可编程性发展 靶向DNA的CRISPR-Cas效应蛋白及类CRISPR效应蛋白 合成生物学, 基因组编辑 NA 宏基因组挖掘, 高通量功能筛选, 定向进化, 机器学习, 结构导向理性设计 NA 序列数据, 结构数据, 功能筛选数据 NA CRISPR-Cas NA NA 医学, 合成生物学
14 2026-10-25
AI-Guided Engineering of Tunable CcdB Variants for Flexible Selection in Escherichia coli
2026-Sep-18, ACS synthetic biology IF:3.7Q1
研究论文 本文利用AI引导的蛋白质工程改造CcdB毒素,获得低基础毒性和可诱导致死性的变体,用于大肠杆菌中的无抗生素筛选 采用结构感知的深度学习策略理性设计CcdB变体,首次获得CcdB_L96P变体,其基础毒性显著降低但保留诱导致死性,可在多种大肠杆菌菌株中实现无抗生素CRISPR gRNA质粒构建和正确克隆的高效富集 未明确说明深度学习模型的泛化能力及在其他毒素蛋白上的适用性,仅在大肠杆菌中验证 改造CcdB毒素蛋白以降低其泄漏表达导致的基础毒性,同时保留诱导致死性,实现灵活的大肠杆菌选择标记 CcdB毒素蛋白及其变体、大肠杆菌菌株、CRISPR gRNA质粒、产琥珀酸底盘细胞 合成生物学 NA 结构感知深度学习、定点突变、CRISPR质粒构建 深度学习 蛋白质结构数据、序列数据 NA CRISPR-Cas9 大肠杆菌 毒素-抗毒素系统(CcdB作为反向选择标记) 医学、工业生物技术
15 2026-10-25
Biofoundry Architect 1.0: A Robot-Assisted Module Configurator and Workflow Designer with Hub Interoperability and Throughput-Workflow Economic Evaluation
2026-Sep-18, ACS synthetic biology IF:3.7Q1
研究论文 本文提出了一个基于网络的开放平台Biofoundry Architect 1.0,用于设计、评估和比较使用机器人辅助模块的自动化工作流,并支持枢纽互操作性和吞吐量-工作流经济评估 开发了一个集成了机器人辅助模块配置、工作流设计、经济评估和社区共享功能的开放网络平台,填补了现有生物铸造厂软件工具在集成性和吞吐量-工作流经济评估方面的空白 文中未明确提及限制 为合成生物学中的生物铸造厂提供一个集成的软件工具,以设计、评估和比较自动化工作流,并优化其效率和成本 自动化工作流、机器人辅助模块、生物铸造厂 合成生物学, 实验室自动化 NA NA NA NA NA NA NA NA 医学, 工业生物技术
16 2026-10-25
Boosted Cell-Free Gene Expression for Robust Signal Readout from a Single-Copy DNA Template in Microdroplets
2026-Sep-18, ACS synthetic biology IF:3.7Q1
研究论文 本文识别并缓解了低DNA输入下体外转录翻译的产量限制瓶颈,开发了一种优化的无细胞基因表达体系,实现了从单拷贝DNA模板在微液滴中的稳健信号读出 发现了低DNA输入下mRNA稀缺和核糖体浓度过高是限制基因表达的关键瓶颈,提出了一种简单的优化配方(补充高活性T7 RNA聚合酶并降低核糖体浓度),使基因表达协同放大约10倍,并首次在皮升液滴中从单拷贝DNA模板实现约94 nM的蛋白质表达 研究主要基于商业化的重组IVTT试剂盒进行优化,未涉及其他无细胞体系的普适性验证;优化的配方可能对特定蛋白质或反应条件具有依赖性;未详细探讨长期稳定性和重复性 提高低DNA浓度下无细胞基因表达的蛋白质产量,实现从单拷贝DNA模板在微液滴中的稳健信号读出,为体外进化和合成细胞提供技术支撑 无细胞体外转录翻译体系(IVTT)、微液滴、单拷贝DNA模板、荧光蛋白和酶 合成生物学 NA 体外转录翻译(IVTT)、微流控液滴技术 NA 荧光信号、蛋白质表达量数据 多种商业IVTT试剂盒及多种荧光蛋白和酶,具体数量未明确 NA NA NA 生物技术、合成生物学
17 2026-10-25
A Two-step Gene Expression Method for In Vitro Evolution of Translational Proteins
2026-Sep-18, ACS synthetic biology IF:3.7Q1
研究论文 开发了一种两步体外进化方法,用于改善翻译蛋白,并在水包油液滴中进行了四种翻译因子的定向进化。 提出两步体外进化策略,顺序应用两种不同条件同时保持基因型-表型连锁,成功筛选出能适度增强翻译活性的突变。 筛选到的突变仅适度增强翻译活性;仅对四种翻译因子进行了进化;未进行多轮连续进化以进一步提高活性。 提高重构翻译系统的翻译效率,服务于自下而上的合成生物学。 翻译因子 IleRS、PheRS、EF-G 和 EF-Tu 合成生物学 NA 体外进化、水包油液滴微流控、基因型-表型连锁筛选 NA NA 四种翻译因子(IleRS、PheRS、EF-G 和 EF-Tu)的突变文库 NA 大肠杆菌 NA 合成生物学、医学
18 2026-10-25
Neutrophil-Inspired Programmable Bacteria for Pyroptosis-Driven Tumor Eradication
2026-Sep-16, Journal of the American Chemical Society IF:14.4Q1
研究论文 该研究利用合成生物学和分子工程改造非致病性大肠杆菌MG1655,构建中性粒细胞启发的可编程细菌系统,通过四阶段程序实现超声驱动的药物释放和焦亡介导的肿瘤清除 模仿中性粒细胞“归巢-爆破-杀伤”逻辑,设计时空可控的四阶段程序:缺氧肿瘤归巢、声动力驱动细菌破裂和载荷释放、肿瘤相关明胶酶响应激活颗粒酶B酶原、焦亡增强全身抗肿瘤免疫 研究仅在小鼠肿瘤模型中进行,尚未在人体临床试验中验证安全性和有效性 开发可编程活细菌平台,实现精准癌症免疫治疗 小鼠CT26、MC38和EMT6肿瘤模型以及非致病性大肠杆菌MG1655 合成生物学, 肿瘤免疫治疗 癌症(结直肠癌、乳腺癌) 合成生物学, 分子工程, 声动力治疗, 聚焦超声 NA NA 三种小鼠肿瘤模型(CT26、MC38、EMT6) NA 大肠杆菌 四阶段顺序程序:缺氧归巢、声动力驱动破裂释放、明胶酶响应激活颗粒酶B、焦亡诱导免疫 医学
19 2026-10-25
Decoding next-generation heavy metal bioremediation via species-specific Earthworm and its gut microbiome interactions: insights from molecular responses, multi-omics, synthetic biology, and artificial intelligence
2026-Sep-08, Biodegradation IF:3.1Q2
综述 整合物种特异性生理学、肠道微生物组功能、分子解毒通路、合成生物学、多组学和人工智能建模,构建下一代蚯蚓修复重金属的统一框架 详细阐明蚯蚓-微生物联合体在金属固定、转化和解毒中的协同贡献,从传统以生物体为中心转向生态工程化的宿主-共生系统 作为综述文章,未提供原始实验数据验证所提出的整合框架 推进蚯蚓修复从经验实践向可编程的系统生物技术平台发展,用于可持续重金属生物修复 蚯蚓及其肠道微生物组 环境生物技术, 合成生物学, 多组学, 人工智能 NA 多组学, 合成生物学, 人工智能建模, 富集动力学模型 AI模型 多组学数据, 分子响应数据 NA 基因编辑 蚯蚓, 肠道微生物 设计型共生微生物, 靶向金属结合通路 环境
20 2026-10-25
Co-evolutionary pathways of synthetic biology regulation: A comparative analysis of major countries and Korea's strategic legislation
2026-Sep, Journal of microbiology (Seoul, Korea)
研究论文 本文通过比较法律方法分析美国、英国、日本和韩国的合成生物学监管响应,提出四种协同演化路径,并重点探讨韩国先行立法的战略模式 首次应用协同演化理论和Law 1.0/2.0/3.0框架系统比较各国合成生物学监管路径;识别出各国监管变革触发因素的不同导致四种协同演化路径;指出韩国颁布全球首部独立合成生物学立法,实现自上而下的协同演化设计 研究主要基于法律文本和制度分析,缺乏对监管实施效果的实证数据;仅覆盖四个国家,结论的普适性有限;未深入探讨合成生物学技术成熟度与监管时机的定量关系 比较分析主要国家合成生物学监管的协同演化路径,评估韩国先行立法的战略模式及其有效条件,为各国应对监管滞后提供参考 美国、英国、日本和韩国的合成生物学监管法律法规与政策框架 合成生物学治理,科技政策与法律 NA 比较法律方法论,协同演化理论分析,Law 1.0/2.0/3.0框架 NA 文本 四个国家的监管法律与政策文件 NA NA NA 医学,农业,环境,能源,材料,食品,工业生物技术
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