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当前共找到 172 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2026-10-24 |
Engineering organoids toward implantable living therapeutics
2026-Sep, hLife
DOI:10.1016/j.hlife.2026.06.002
PMID:42903585
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综述 | 综述了通过水凝胶工程、微流控芯片、三维生物打印和合成生物学等技术改造类器官以实现可植入活体治疗的最新进展 | 系统整合了多种生物工程策略（水凝胶工程、微流控芯片、3D生物打印、合成生物学）来克服类器官临床转化的关键障碍，并提出了AI与智能活体设备融合的未来方向 | 在质量控制标准化、可规模化制造、监管协调和长期安全性评估方面仍存在重大挑战 | 总结工程化类器官作为可植入活体治疗的最新进展，探讨克服临床转化障碍的策略及未来发展方向 | 干细胞来源的类器官 | 再生医学 | 代谢性疾病, 骨缺损, 皮肤损伤, 结肠上皮损伤 | 水凝胶工程, 微流控芯片, 三维生物打印, 合成生物学 | NA | 文本 | NA | NA | NA | 可编程细胞功能 | 医学 |
| 22 | 2026-10-21 |
A Review of Nuclear-Organellar Communication in Response to Heat Stress
2026-Sep-30, Plants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/plants15192995
PMID:42884859
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综述 | 本文综述了植物在热胁迫下细胞核与各细胞器之间通过次级信使、蛋白质和逆行信号进行通讯协调的机制 | 系统整合了从质膜/胞质热信号感知到核转录重编程及细胞器逆行反馈的核-细胞器通讯网络，并提出了不同细胞器中候选热感受蛋白及膜接触位点等尚未解决的关键问题 | 文章为综述性总结，未提供新的实验数据，且对叶绿体和线粒体内在热感受能力、细胞器间次级信使动态协调及膜接触位点的生物学功能等关键机制仍缺乏深入解析 | 总结植物通过核-细胞器通讯维持细胞稳态以响应热胁迫的机制，并指出未来研究方向以助力耐热作物育种 | 植物（热胁迫响应下的细胞核、内质网、叶绿体和线粒体） | 植物分子生物学、细胞信号传导 | NA | NA | NA | 文本 | NA | NA | 植物 | NA | 农业 |
| 23 | 2026-10-21 |
Microbially Induced Carbonate Precipitation (MICP) as a Sustainable Technology, Mechanism and Application: A Review
2026-Sep-22, Materials (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/ma19194051
PMID:42882553
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综述 | 系统综述微生物诱导碳酸盐沉淀（MICP）的生化机制、关键影响因素及近期工程应用进展 | 对比MICP与传统化学方法的成本与可持续性，识别当前技术瓶颈并提出合成生物学优化菌株和人工智能辅助设计等未来研究方向 | 当前存在反应效率低和材料脆性等技术瓶颈 | 为MICP的基础研究提供理论框架，推动其在可持续技术领域的创新和规模化应用 | 微生物诱导碳酸盐沉淀（MICP）技术及其生化机制、影响因素和工程应用 | 环境生物技术, 岩土工程, 材料科学 | NA | 微生物诱导碳酸盐沉淀（MICP），涉及脲酶和碳酸酐酶（CA）驱动的代谢途径 | NA | 文献资料 | NA | NA | NA | NA | 环境修复, 岩土工程, 材料科学, 医学（重金属和放射性核素固定）, 建筑, 土壤稳定, 二氧化碳封存, 生物材料 |
| 24 | 2026-10-21 |
Programmable plant chassis for sustainable biomanufacturing of high-value natural products
2026-Sep-14, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.109044
PMID:42735758
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综述 | 本文综述了可编程植物底盘在可持续生物制造高价值天然产物方面的最新进展，包括遗传元件、生物合成途径解析与优化以及未来挑战 | 系统整合了植物底盘开发所需的天然与合成遗传元件，并重点总结了生物碱、萜类和苯丙素类化合物生物合成途径的解析、重建与优化策略，强调提高生产率的途径工程方法 | 未涉及具体实验验证数据，主要基于文献综述，缺乏对植物底盘大规模工业应用瓶颈的定量分析 | 总结植物底盘在可持续生物制造高价值天然产物方面的最新进展，并为推动植物底盘从实验室研究走向可持续工业应用提供概念指导和实践见解 | 植物底盘（植物系统）及其用于生产的天然产物，包括生物碱、萜类和苯丙素类化合物 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、途径工程、遗传元件工程 | NA | 文本 | NA | NA | 植物 | 生物合成途径（生物碱、萜类、苯丙素类代谢途径） | 医药，工业生物技术 |
| 25 | 2026-10-18 |
Evolutionary chemical learning in dimerization networks
2026-Sep, Physical review. E
DOI:10.1103/bszq-gftl
PMID:42888651
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研究论文 | 本文提出了基于竞争性二聚化网络（CDN）的化学学习框架，通过定向进化在体外训练网络，实现多类分类等学习任务 | 利用分子物种间的可逆二聚化作为可调突触权重，通过定向进化（突变、选择、扩增）在无数字硬件和无需预知所有微观结合常数的情况下训练网络完成学习任务，并引入对比增强损失函数提升性能 | 研究基于数值模拟，尚未进行实际体外实验验证；依赖定向进化过程可能耗时且受实验条件限制 | 探索竞争性二聚化网络作为化学学习平台的可行性，实现模拟物理计算并连接合成生物学与机器学习 | 竞争性二聚化网络（CDN），由蛋白质或DNA-RNA寡聚体等分子物种组成 | 机器学习, 合成生物学 | NA | 定向进化, 数值模拟 | 竞争性二聚化网络（CDN） | 数值模拟数据, 分子结合亲和力数据 | NA | 定向进化, 突变, 选择, 扩增 | NA | 竞争性二聚化网络（CDN），分子物种类似神经元，结合亲和力作为可调突触权重 | 医学, 工业生物技术 |
| 26 | 2026-10-16 |
Nanoparticles and the gut-microbiome: a dual strategy for oral brain delivery
2026-Sep-30, International journal of pharmaceutics
IF:5.3Q1
DOI:10.1016/j.ijpharm.2026.127477
PMID:42815656
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综述 | 本文综述了口服脑部递送策略，提出将血脑屏障视为肠-微生物-脑轴动态系统的一部分，并重点探讨纳米颗粒和细菌胞外囊泡在克服肠道和血脑屏障中的作用 | 提出将血脑屏障视为受肠-微生物-脑轴影响的连续动态系统的一部分，并强调微生物组组成和代谢功能的个体差异对口服脑部递送的影响，倡导精准微生物组药理学 | 未涉及具体原始实验数据，主要基于现有文献的批判性评价和概念框架的提出 | 探讨口服脑部递送中纳米颗粒和肠道微生物组的双重策略，以克服血脑屏障和上游肠道屏障 | 口服脑部递送平台、纳米颗粒、细菌胞外囊泡、肠道微生物组 | 机器学习和其它 | 神经退行性疾病和精神疾病 | NA | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 27 | 2026-10-16 |
Biocatalytic and synthetic biology strategies for S-type lignin valorization
2026-Sep-15, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2026.154513
PMID:42744263
|
综述 | 本文综述了S型木质素单体生物转化为高价值产品的生物催化与合成生物学策略，重点分析了O-去甲基化和开环反应的代谢瓶颈及相关关键酶 | 系统聚焦于S型木质素单体（3,5-二甲氧基取代）的微生物代谢瓶颈，突出Rieske非血红素铁单加氧酶、四氢叶酸依赖型O-去甲基酶和细胞色素P450过氧化酶在去甲基化中的关键作用，并整合代谢工程策略解决辅因子失衡和中间体毒性问题 | 现有O-去甲基酶底物谱较窄，宿主对木质素衍生流股的耐受性不足，缺乏真实木质素衍生流股的验证，工业转化尚不成熟 | 总结木质素解聚、生物漏斗和合成生物学驱动的S型木质素单体转化路径设计的最新进展，提出未来研究方向以推动可持续生物经济和工业转化 | 木质素衍生的S型（紫丁香基）单体及其微生物生物转化途径 | 合成生物学，代谢工程 | NA | 生物催化，代谢工程，合成生物学，酶工程 | NA | 文本 | NA | NA | NA | 木质素解聚途径，生物漏斗途径，O-去甲基化代谢途径，合成生物学驱动的代谢通路 | 能源，材料，工业生物技术，环境 |
| 28 | 2026-10-10 |
Innovations and applications in synthetic biology: a PhD researcher's perspective
2026-Sep-22, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2026.09.015
PMID:42850182
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 29 | 2026-10-10 |
De novo genes in plants: Origins, mechanisms, and functional implications
2026-Sep-10, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2026.102098
PMID:42723285
|
综述 | 本文综述了植物新基因的起源、进化机制、功能以及鉴定方法，并探讨了其在作物改良和合成生物学中的应用前景 | 系统整合了植物新基因的转录优先、开放阅读框优先和并发模型等主要诞生路径，并提出了全基因组共线性比对、多组学证据和机器学习相结合的新基因鉴定改进策略 | 快速序列进化、基因组注释质量、多倍化和转座元件等因素给当前新基因鉴定方法带来了挑战，每种方法均存在重要局限性，且新基因的功能验证仍然不足 | 总结植物新基因研究的最新进展，阐明其起源与进化机制、功能意义，并探讨改进鉴定方法和未来研究方向 | 植物新基因（de novo genes） | 机器学习, 基因组学, 进化生物学 | NA | 全基因组共线性比对, 多组学分析, 机器学习 | 机器学习 | 文本, 基因组序列, 多组学数据 | NA | NA | 植物 | NA | 农业, 医学, 合成生物学 |
| 30 | 2026-10-10 |
Advances in large DNA fragment assembly for microbial cell factory engineering
2026-Sep, Quantitative biology (Beijing, China)
DOI:10.1002/qub2.70039
PMID:42845956
|
综述 | 该综述总结了用于微生物细胞工厂工程的大DNA片段组装方法的最新进展，涵盖体外和体内多重基因组装及基因组规模技术 | 系统比较了大规模DNA片段组装方法在组装原理、容量和效率方面的关键特征，并强调了其在异源途径构建、宿主代谢重编程和扩展复杂生物合成网络中的应用 | 未涉及具体实验验证，主要基于文献总结，且可能未涵盖所有最新技术 | 为工程化高性能微生物细胞工厂提供理论和技术框架，推动工业生物制造的发展 | 大DNA片段组装方法及微生物细胞工厂 | 合成生物学 | NA | DNA组装技术 | NA | 文本 | NA | NA | 微生物 | 代谢途径、合成基因组、新染色体 | 工业生物技术、医学 |
| 31 | 2026-10-07 |
Engineering defensins: Heterologous expression strategies from genetic engineering to synthetic biology
2026-Sep-29, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.109055
PMID:42810457
|
综述 | 本文从整合工程学的角度综述了防御素的生产，强调表达调控、宿主生理与分子设计之间的相互作用，并建立了一个整合基因工程、合成生物学和AI驱动设计的多维工程框架 | 建立了一个整合基因工程、合成生物学和AI驱动设计策略的多维工程框架，将防御素工程从经验优化推向理性和定量化设计，并扩展优化范围超越天然序列空间 | 天然可用性有限，异源生产存在产量低、宿主毒性、折叠效率低和生物活性丧失等问题 | 改善防御素的生产、功能稳定性和可制造性，并指导可规模化生产策略的开发 | 防御素（Defensins），一类结构多样的宿主防御肽 | 合成生物学 | NA | 基因工程, 合成生物学, 人工智能驱动设计 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学, 工业生物技术 |
| 32 | 2026-10-07 |
Engineered platforms for melanogenesis research: Bridging synthetic biology, bioengineering, and biomimetics
2026-Sep, Bioengineering & translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1002/btm2.70159
PMID:42630831
|
综述 | 该综述整合合成生物学、生物工程和仿生技术在黑色素生成研究中的应用，提出统一框架以研究色素沉着生物学并实现黑色素及黑色素基生物材料的可扩展生产 | 提出将合成生物学作为研究黑色素生成的多功能工具包的统一框架，整合分子工程、微生物生物系统和仿生技术，强调非传统系统在基础色素研究及皮肤科和生物技术转化应用中的变革潜力 | 作为综述文章，未提供原始实验数据；现有合成生物学平台在生理相关性、伦理约束、高维护成本和有限可扩展性方面仍存在局限 | 整合合成生物学平台在研究和操控色素沉着生物学方面的进展，提出统一框架以推动黑色素生成的基础研究和转化应用 | 黑色素生成过程、色素沉着生物学、黑色素合成通路、患者来源色素沉着模型 | 合成生物学 | 色素紊乱 | 基因工程、异源表达系统、仿生构建体、无细胞检测 | NA | 文本 | NA | NA | NA | 黑色素合成通路 | 医学、生物技术、材料 |
| 33 | 2026-10-06 |
Research progress of Rumen microbes utilizing lignocellulose for high-value chemical production
2026-Sep, Biodesign research
DOI:10.1016/j.bidere.2026.100107
PMID:42828144
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综述 | 系统总结了瘤胃微生物降解木质纤维素及其代谢途径用于高值化学品生产的机制、策略与瓶颈 | 聚焦瘤胃微生物组作为木质纤维素转化平台，整合过程、群落与遗传层面策略，并提出多组学与合成生物学提升群落稳定性与代谢可控性 | 未涉及具体实验验证，瘤胃微生物群落不稳定、代谢通量难控制及工艺放大困难等瓶颈仍待解决 | 为基于瘤胃微生物的可持续木质纤维素高值化转化工艺提供理论与技术指导 | 瘤胃微生物及其木质纤维素降解与化学品合成代谢网络 | 合成生物学 | NA | 多组学分析，合成生物学 | NA | 文本 | NA | NA | 瘤胃微生物 | NA | 工业生物技术，能源，材料 |
| 34 | 2026-10-04 |
EMBED: Ensemble MATCONT-Based Detection and Classification of Bifurcations in Dual Phosphorylation-Dephosphorylation Reaction Networks
2026-Sep-29, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.6c05467
PMID:42824635
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研究论文 | 本文提出了EMBED，一种基于MATCONT的集成方法，用于对双磷酸化-去磷酸化反应网络进行大规模分岔分析，以弥合合成生物学中的设计-构建-测试-学习（DBTL）差距 | 将MATCONT与大规模参数采样和自动延拓相结合，实现了高通量和可重复的集成分岔分析，将MATCONT从局部分析工具转变为全局动力学映射的可扩展平台 | 研究主要基于双磷酸化-去磷酸化系统的理论建模和计算分析，实验验证有限，且未涉及其他类型的反应网络 | 从机制性的动力系统视角解决合成生物学中持续存在的DBTL差距，通过全局分岔分析识别既功能可取又实验可实现的参数区域 | 双磷酸化-去磷酸化反应网络 | 机器学习, 系统生物学, 合成生物学 | NA | 大规模参数采样, 自动延拓, 分岔分析 | 集成模型, 动力系统模型 | 数值模拟数据 | NA | NA | NA | NA | 医学, 工业生物技术 |
| 35 | 2026-10-03 |
Firewalled synthetic commensal blocks horizontal gene transfer in the gut
2026-Sep-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.09.17.752456
PMID:42779942
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研究论文 | 该研究通过基因组设计和实验室进化，创建了一种高适应性的基因防火墙共生菌，能够在小鼠肠道中稳定定植并阻止水平基因转移 | 通过直接改变TCA和TCG丝氨酸密码子的氨基酸身份，无需未分配中间体，建立了稳定数千代的遗传防火墙，并利用实验室进化鉴定适应性突变，理性重设计基因组以提高适应性 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人体或复杂环境社区中验证；长期进化可能产生未知适应性突变 | 开发高适应性的基因防火墙共生菌，以防止合成遗传信息通过水平基因转移扩散，并用于安全活体治疗 | 基因工程共生菌（具体菌种未指定）和小鼠胃肠道微生物组 | 合成生物学 | NA | 基因组设计, 实验室进化 | NA | NA | NA | NA | 小鼠, 共生菌 | 遗传防火墙（通过密码子重分配） | 医学, 环境 |
| 36 | 2026-10-03 |
Bioengineering microbial cellulose synthesis pathways as biofactory for industrial-scale cellulose production: a review on current advances
2026-Sep-02, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-026-05233-0
PMID:42684591
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综述 | 本综述批判性地审视了细菌、藻类和卵菌中的微生物纤维素生物合成途径，重点关注细菌作为最先进的生物工厂，并探讨了代谢工程、基因组编辑和合成生物学在提高纤维素产量方面的最新进展 | 系统性地整合了代谢工程、基因组编辑和合成生物学工具包在微生物纤维素生产中的应用，强调了环二鸟苷酸调控网络工程、前体途径优化、副产物抑制和氧气利用效率等创新策略，并提出了整合菌株-工艺工程的概念 | 微生物纤维素从实验室规模向工业制造的过渡仍受限于低生产率、高生产成本、产纤维素菌株的遗传不稳定性、抑制性副产物的积累以及发酵过程中氧气供应不足等问题，此外工程化生物合成途径与纤维素理化性质之间的关系缺乏标准化 | 批判性地审视微生物纤维素生物合成途径，探讨通过代谢工程、基因组编辑和合成生物学手段提高工业规模纤维素生产力的策略，并确定关键研究优先方向 | 细菌、藻类和卵菌中的微生物纤维素生物合成途径，尤其是细菌作为最先进的微生物纤维素生物工厂 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、基因组编辑、合成生物学 | NA | 文本 | NA | CRISPR-Cas9 | 细菌、藻类、卵菌 | 环二鸟苷酸调控网络、前体途径优化、副产物抑制途径 | 材料、工业生物技术、医学 |
| 37 | 2026-10-01 |
The miRNA-ROS interactome: Orchestrating plant resilience to environmental fluxes
2026-Sep, Plant physiology and biochemistry : PPB
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.plaphy.2026.111748
PMID:42743829
|
综述 | 本文综述了植物中miRNA与活性氧（ROS）之间的双向调控网络，及其在植物抵抗环境胁迫中的作用 | 系统整合了miRNA与ROS在亚细胞区室（质外体、线粒体、叶绿体）中的相互作用，提出了miRNA-ROS互作组作为整合调控框架，并强调了其进化保守性、空间区室化及与激素、营养和钙信号网络的整合 | 在时空动态和细胞器间协调方面存在关键知识空白 | 阐明miRNA-ROS互作网络如何协调植物对环境胁迫的适应性，并提出未来研究方向以指导抗逆作物工程 | 植物 | 植物科学 | NA | NA | NA | 文本 | NA | NA | 植物 | NA | 农业 |
| 38 | 2026-09-30 |
Unveiling the Complete Biosynthetic Pathway of Azacitidine: A Rare 1,3,5-Triazine Nucleoside Derived From GTP
2026-Sep-29, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.1881662
PMID:42806946
|
研究论文 | 该文章鉴定了阿扎胞苷的生物合成基因簇并阐明了其完整的生物合成途径 | 发现双功能GTP环水解酶I AzaE生成三氨基嘧啶中间体，以及辅因子非依赖性cupin双加氧酶AzaA以O和HO为氧供体组装1,3,5-三嗪支架，此机制在核苷抗生素生物合成中前所未有 | 未明确提及该研究的局限性 | 解析阿扎胞苷的生物合成途径 | 阿扎胞苷生物合成基因簇及其编码的酶 | 合成生物学 | 骨髓增生异常综合征 | 抗性基因引导的比较基因组学、体内和体外研究 | NA | NA | NA | NA | Streptomyces mobaraensis IPIO2 | NA | 医学、工业生物技术 |
| 39 | 2026-09-30 |
Toward a minimal amino acid alphabet for protein design
2026-Sep-29, The FEBS journal
DOI:10.1111/febs.70751
PMID:42808650
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研究论文 | 本文通过生物信息学调查和计算蛋白质设计，探索使用精简氨基酸字母表设计蛋白质的可能性，并实验验证了一个由8种氨基酸组成的蛋白质。 | 首次系统性地计算设计了所有1013种由2-10种早期氨基酸组成的可能字母表的蛋白质，并实验验证了8种氨基酸组成的蛋白质能够折叠成β-折叠丰富的纤连蛋白III型结构域，同时展示了逆折叠模型ProteinMPNN在相同字母表内稳定设计蛋白质的能力。 | 尝试实验验证由6种和4种氨基酸组成的设计未能成功，表明更小的字母表可能难以形成稳定折叠的蛋白质。 | 探索蛋白质是否可以从显著减少的氨基酸字母表中形成，并设计具有有趣性质的蛋白质用于生物技术和合成生物学。 | 蛋白质，特别是由精简氨基酸字母表组成的蛋白质。 | 计算蛋白质设计 | NA | 生物信息学调查，计算蛋白质设计，逆折叠模型 | ProteinMPNN | 序列数据，结构数据 | 超过2.5亿条UniProt序列，计算设计所有1013种字母表的蛋白质，实验验证一个8氨基酸蛋白质。 | NA | NA | NA | 生物技术，合成生物学 |
| 40 | 2026-09-30 |
Engineered Rhizobacteria Exploit Bacterial Vesicles for Cross-Kingdom RNAi and Soilborne Disease Control
2026-Sep-29, Plant, cell & environment
DOI:10.1111/pce.70939
PMID:42808730
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研究论文 | 该研究通过工程化改造棉花根际细菌成团泛菌YC4，利用其外膜囊泡（OMVs）递送dsRNA至大丽轮枝菌，实现跨界RNAi并防治土传真菌病害 | 首次发现细菌外膜囊泡选择性富集内源性sRNA并作为跨界RNA递送的主要载体；通过启动子工程和OmpA-DRB4融合策略增强dsRNA生产和OMVs负载能力；构建了工程化根际共生菌平台用于原位RNAi递送 | 研究主要在温室条件下进行，未进行大规模田间试验验证；长期生态安全性和对非靶标生物的影响尚未评估 | 开发基于工程化根际细菌的dsRNA递送系统，解决dsRNA环境不稳定和细胞递送效率低的问题，实现土传真菌病害的可持续防控 | 棉花根际细菌成团泛菌YC4、大丽轮枝菌、棉花 | 合成生物学 | 土传真菌病害（棉花黄萎病） | 小RNA测序、合成生物学、启动子工程、OmpA-DRB4融合 | NA | 序列数据、图像数据 | NA | NA | 成团泛菌YC4、大肠杆菌（用于克隆）、棉花 | 启动子工程改造和OmpA-DRB4融合蛋白表达系统，增强dsRNA生产和外膜囊泡负载 | 农业 |