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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2026-09-30 |
Probiotics and Extracellular Vesicles as Redox Modulators in Wound Healing: From Microbial Therapeutics to Engineered Nanotherapeutic Strategies
2026-Sep-15, Antioxidants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/antiox15091172
PMID:42792211
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综述 | 本文综述了益生菌及其细胞外囊泡通过调节氧化还原平衡促进伤口愈合的机制,并探讨了工程化益生菌囊泡作为可编程氧化还原纳米疗法的前景 | 系统整合了益生菌来源细胞外囊泡在伤口愈合中调节氧化还原信号的证据,并提出了基于合成生物学和生物材料辅助递送的工程化益生菌囊泡作为可编程氧化还原纳米疗法的概念 | 多数机制关联来自通路标志物或间接实验,缺乏直接临床证据;细胞外囊泡的标准化、生物安全性、生物分布、药代动力学和临床验证等问题尚未解决 | 综合评估益生菌、细胞外囊泡及益生菌来源工程化囊泡在伤口愈合中作为氧化还原调节剂的应用潜力 | 益生菌、益生菌来源细胞外囊泡、工程化益生菌囊泡 | 再生医学 | 慢性伤口 | 结构化文献检索与证据筛选 | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 42 | 2026-09-30 |
Biobased Compounds and the Circular Economy: A Bibliometric Review of Waste Valorization and Environmental Sustainability
2026-Sep-15, Molecules (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/molecules31183262
PMID:42796550
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综述 | 通过文献计量学和系统性综述方法,绘制了生物基化合物与循环经济研究的知识结构,分析了废物价值化与环境可持续性的研究趋势和差距 | 综合运用RStudio/bibliometrix、VOSviewer和Plotly Studio多种文献计量工具,系统识别了十个过渡性研究缺口,并首次提出合成生物学和生物累积具有最高优先级指数(122.16) | 理论基础薄弱和研究持续时间有限是最常见的障碍,机械性能和可再加工性面临额外的跨学科复杂性 | 绘制生物基化合物与循环经济研究的知识结构,识别研究优先事项、工业可扩展性差距及过渡性研究缺口 | Scopus数据库中1306篇经同行评审的生物基化合物与循环经济相关文献 | 文献计量学 | NA | 文献计量分析、PRISMA系统综述 | NA | 文本 | 1306篇同行评审文献(初始检索1350篇,经PRISMA筛选后纳入1306篇) | NA | NA | NA | 环境, 材料, 工业生物技术 |
| 43 | 2026-09-30 |
Fungal Biotechnology for Sustainable Biocomposites: From Mycelium Growth to Material Translation
2026-Sep-15, Molecules (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/molecules31183272
PMID:42796559
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综述 | 本文综述了基于菌丝体的生物复合材料(MBCs),重点关注真菌生物合成、底物转化、加工策略与材料性能之间的关系,并探讨其在包装、建筑、隔热、环境修复等领域的应用及可持续性 | 从真菌生物合成到材料转化的全链条视角系统整合了合成生物学、先进材料化学与数字生物制造,强调多学科交叉以实现可规模化、高性能、多功能MBCs | 作为综述文章,未提供原始实验数据,对具体工艺参数的定量比较和标准化评估体系仍有待完善 | 系统评估菌丝体基生物复合材料的生物合成机制、底物转化过程、加工优化策略及材料性能调控,并展望其可持续应用前景 | 菌丝体基生物复合材料(MBCs)、真菌、聚合物底物 | 材料科学 | NA | NA | NA | 文本 | NA | NA | 真菌 | NA | 材料, 环境, 工业生物技术, 建筑, 食品 |
| 44 | 2026-09-29 |
A generalizable framework for genetic code expansion in bacterial systems beyond E. coli
2026-Sep-28, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.01273-26
PMID:42803582
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研究论文 | 本文提出了一种基于宿主无关丝氨酸重组酶辅助基因组工程工具包的模块化、可扩展平台,用于在系统发育多样化的细菌中实现和优化遗传密码扩展 | 开发了一种通用、可扩展的染色体整合框架,首次在五种非大肠杆菌细菌中实现遗传密码扩展,并证明了在远缘物种间的可转移性 | 摘要中未明确提及研究的具体局限性 | 解决遗传密码扩展技术在大肠杆菌以外的细菌中缺乏通用高效方法和优化策略的问题 | 五种系统发育多样化的细菌物种 | 合成生物学 | NA | 遗传密码扩展、丝氨酸重组酶辅助基因组工程 | NA | NA | 五种细菌物种 | 丝氨酸重组酶辅助基因组工程工具包 | 五种细菌物种(非大肠杆菌) | 基于宿主无关丝氨酸重组酶辅助基因组工程的遗传密码扩展平台 | 医学、工业生物技术、环境、合成生物学 |
| 45 | 2026-09-29 |
Sclareol Production Driven by Advanced Synthetic Biology Strategies
2026-Sep-22, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.6c07601
PMID:42798971
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综述 | 该综述系统总结了利用合成生物学和代谢工程策略在微生物底盘细胞中生产香紫苏醇的研究进展 | 重点关注AI辅助预测、多组学分析、高通量筛选和智能发酵技术等新兴方法在香紫苏醇生物合成中的应用 | 微生物香紫苏醇生物合成仍面临产量低、成本高等挑战,距工业化应用尚有差距 | 系统梳理合成生物学驱动的香紫苏醇产量提升策略,为高价值植物源萜类化合物的可持续生物制造提供参考 | 香紫苏醇及其微生物底盘细胞生物合成体系 | 合成生物学 | NA | 合成生物学, 代谢工程, 酶工程, 多组学分析, 高通量筛选, AI辅助预测, 智能发酵 | NA | 文本 | NA | NA | 微生物底盘细胞 | 香紫苏醇生物合成代谢途径 | 医药, 农业, 工业生物技术 |
| 46 | 2026-09-29 |
Biosynthetic Diversity of Marine-Derived Streptomyces Natural Products: Integrating Genome Mining, Multi-Omics, and Translational Drug Discovery Strategies
2026-Sep-17, Marine drugs
IF:4.9Q1
DOI:10.3390/md24090324
PMID:42783917
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综述 | 该综述总结了海洋来源链霉菌天然产物的生物合成多样性,并探讨了整合基因组挖掘、多组学和转化药物发现策略的最新进展 | 提出了整合多组学技术、途径工程和人工智能辅助优先级排序的新兴转化方法,为海洋天然产物研究从描述性组学探索向实验验证和临床相关药物发现提供了路线图 | 存在沉默生物合成途径、培养效率低、已知化合物重复发现、代谢产物产量不稳定、去重复化瓶颈以及生态解释有限等挑战,这些限制阻碍了生物合成潜力向药物应用的转化 | 总结海洋天然产物发现的当前策略,并强调整合多组学技术、途径工程和AI引导优先级排序的新兴转化方法 | 海洋来源链霉菌及其产生的天然产物,包括聚酮、非核糖体肽、核糖体合成和翻译后修饰肽、萜类、生物碱和杂合化合物 | 天然产物药物发现、基因组挖掘、合成生物学 | 癌症、感染性疾病、炎症性疾病 | 基因组测序、生物信息学、基因组挖掘、代谢组学、合成生物学、人工智能 | NA | 基因组数据、代谢组数据、文本 | NA | NA | 链霉菌 | NA | 医学、工业生物技术 |
| 47 | 2026-09-28 |
Alkaliphilic microbial cellulases: sources, structural insights, and bioengineering approaches for industrial applications
2026-Sep-26, Archives of microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00203-026-05227-4
PMID:42799763
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综述 | 本文综述了嗜碱性微生物纤维素酶的微生物来源、结构特征、作用机制及其在工业生物加工中的应用与生物工程改造策略 | 系统整合了嗜碱性纤维素酶的来源、结构与作用机制,并综述了酶工程、合成生物学和设计型纤维素体在提升其催化性能、稳定性和底物特异性方面的最新进展 | 嗜碱性纤维素酶的长期稳定性不足、与传统发酵系统不兼容,且缺乏标准化的酶活性测定方法,限制了其大规模工业应用 | 为嗜碱性纤维素酶的微生物来源、结构特征、作用机制及工业应用提供最新综述,并探讨其生物工程改造策略 | 嗜碱性纤维素酶及其产生微生物 | 工业生物技术 | NA | 酶工程, 合成生物学, 设计型纤维素体 | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 能源, 工业生物技术, 环境, 材料 |
| 48 | 2026-09-27 |
Designing gene expression with MPRA and AI: A new paradigm for synthetic and therapeutic regulation
2026-Sep-22, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.109049
PMID:42772476
|
综述 | 本文综述了条形码MPRA技术与深度学习模型相结合用于cis调控元件理性设计与基因表达调控的新范式 | 将条形码MPRA技术与AI驱动建模框架融合,实现数据高效且跨情境可泛化的CRE设计与预测 | 存在当前技术和概念上的局限,尚未完全实现安全、可编程且临床相关的调控控制系统 | 综合MPRA平台与AI建模在CRE理性工程中的最新进展,展望下一代cis调控工程与基因治疗路线图 | cis调控元件、合成调控元件、基因表达调控系统 | 机器学习 | NA | MPRA、深度学习建模、条形码技术 | 深度学习模型 | 序列数据 | NA | NA | 微生物、哺乳动物细胞 | cis调控元件、合成调控元件 | 医学、工业生物技术 |
| 49 | 2026-09-27 |
Predictive design of tissue-specific mammalian enhancers that function in the mouse embryo
2026-Sep, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-026-02729-1
PMID:42642514
|
研究论文 | 该研究提出了一种设计组织特异性哺乳动物增强子的通用策略,通过深度学习模型预测设计的合成增强子在小鼠胚胎中可靠地驱动目标组织表达 | 首次证明仅从DNA序列即可可靠推断哺乳动物增强子功能,并在体内复杂调控环境中实现组织特异性合成增强子的从头设计 | 训练数据集规模有限,仅针对心脏、肢体和中枢神经系统设计并验证了15个合成增强子,未涵盖更多组织类型和其他哺乳动物物种 | 开发一种能够在哺乳动物体内可靠工作的组织特异性增强子预测设计框架 | 小鼠胚胎中的心脏、肢体和中枢神经系统组织特异性增强子 | 机器学习 | NA | 染色质可及性测序 | CNN | 序列 | 15个合成增强子,基于人类和小鼠的验证增强子数据训练 | NA | 小鼠 | NA | 医学, 工业生物技术 |
| 50 | 2026-09-26 |
From cells to sales: Advancing the commercialization of industrial biotech innovations
2026-Sep-23, New biotechnology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.nbt.2026.09.006
PMID:42777946
|
研究论文 | 基于对生物技术投资者、基金经理和创始人的访谈及案例研究,分析工业生物技术创业公司成功商业化的关键因素,并提炼出十条具体建议。 | 从投资者和创始人视角系统识别出被忽视的关键失败因素,如里程碑定义不清、股权结构设计不当等,并强调商业关键决策需尽早做出。 | 样本量较小(n=12),仅基于访谈和过往案例,可能缺乏大规模定量验证。 | 探讨工业生物技术创业公司如何成功跨越商业化门槛,识别关键成功因素并提出建议。 | 工业生物技术领域的创业公司、投资者、基金经理和创始人。 | 机器学习 | NA | NA | NA | 文本 | 12名访谈对象(投资者、基金经理和创始人) | NA | NA | NA | 工业生物技术, 医学 |
| 51 | 2026-09-26 |
Exploration of multifunctional characteristics and regulatory mechanism of promoter G-quadruplexes
2026-Sep, Pharmacological reviews
IF:19.3Q1
DOI:10.1016/j.pharmr.2026.100151
PMID:42462488
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综述 | 本文系统综述了启动子区G-四链体的多功能特征、调控机制、表征方法及应用方向 | 首次提出启动子区G4的8大主要特征:广泛分布、位置特异性、结构多样性、精确调控、遗传可修饰性、动态可逆性、信号响应性和协同调控,并系统分类了G4调控因子 | 作为综述文章,未提供原始实验数据,对具体调控机制的分子细节探讨有限 | 探索启动子区G-四链体的多功能特征及其调控机制,总结表征方法和应用前景 | 启动子区G-四链体(G4s)及其调控因子(天然产物、转录因子、结合蛋白、小分子配体和核酸) | 分子生物学 | NA | NA | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 医学, 合成生物学 |
| 52 | 2026-09-25 |
Plasmid copy number control offers a versatile tool in synthetic biology applications
2026-Sep-23, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2026.07.005
PMID:42778487
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研究论文 | 本文揭示了质粒拷贝数控制在合成生物学中的关键作用,不仅在大肠杆菌中,还在新一代细菌底盘——需钠弧菌中。研究表明,抗生素选择标记影响PCN,从而影响生长和蛋白生产;细胞可共转化多个相同质粒变体并同步控制其PCN;PCN控制可用于调节水平基因转移,并扩展了MoClo模块化克隆框架以快速原型设计和增强复杂生物电路性能 | 揭示了PCN控制在合成生物学中的多功能性,包括在需钠弧菌中的应用;发现抗生素选择标记影响PCN;实现了多质粒变体的共转化及同步PCN控制;通过添加复制起点减轻质粒丢失;利用PCN控制调节水平基因转移;扩展MoClo框架实现可诱导PCN控制 | 未明确提及 | 探究质粒拷贝数控制在合成生物学中的应用潜力,扩展其作为通用工具的能力 | 质粒拷贝数控制、大肠杆菌、需钠弧菌、水平基因转移、生物电路 | 合成生物学 | NA | 分子克隆、MoClo模块化克隆、接合转移 | NA | NA | NA | MoClo模块化克隆 | 大肠杆菌, 需钠弧菌 | 可诱导PCN控制的生物电路 | 医学, 工业生物技术 |
| 53 | 2026-09-25 |
Advances in the HAK/KUP/KT potassium transporter family in regulating Na+/K+ homeostasis and salt tolerance in plants
2026-Sep-22, Annals of botany
IF:3.6Q1
DOI:10.1093/aob/mcag193
PMID:42384214
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综述 | 本文系统综述了植物HAK/KUP/KT钾转运蛋白家族在调控Na+/K+稳态和耐盐性中的分类、进化、功能分化及多层次调控网络 | 系统整合了HAK/KUP/KT家族在Na+/K+平衡中的多层次调控网络,包括CBL-CIPK钙信号、转录因子和表观遗传调控以及翻译后修饰,并揭示了盐生植物与甜土植物间转运蛋白功能分化的悖论现象 | 作为综述文章,未提供原始实验数据,对基因编辑、合成启动子和合成生物学等未来策略的应用尚处于展望阶段 | 系统阐述HAK/KUP/KT钾转运蛋白家族在植物响应钾缺乏和盐胁迫中的作用及其调控机制,为耐盐高产作物遗传改良提供理论依据 | 植物HAK/KUP/KT钾转运蛋白家族,涵盖多种植物物种包括作物和木本植物以及盐生植物 | 植物科学 | NA | NA | NA | 文本 | NA | 基因编辑 | 植物 | NA | 农业 |
| 54 | 2026-09-25 |
Bioinspired organic materials for seamless neurohybrid interfaces: from material design to living electronics
2026-Sep-22, Materials horizons
IF:12.2Q1
DOI:10.1039/d6mh00280c
PMID:42468887
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综述 | 本文讨论了仿生有机材料在实现无缝神经混合接口中的应用,涵盖从材料设计到活体电子学的进展 | 提出了利用有机混合离子-电子导体、先进聚合物化学和可调软材料实现神经组织无缝集成的新方法,并探索了聚合和合成生物学在活体神经电子学中的潜力 | 未明确提及具体局限性,可能包括当前技术尚未完全实现活体神经电子学的临床转化 | 探讨如何通过仿生有机材料实现神经混合接口的无缝集成,以理解和治疗神经系统疾病 | 神经混合接口、有机材料、神经元 | 生物医学工程 | 神经系统疾病 | 有机混合离子-电子导体、聚合物化学、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学, 生物工程, 临床医学 |
| 55 | 2026-09-25 |
The iModulon framework: how x-AI reveals microbial regulatory logic
2026-Sep-22, mSystems
IF:5.0Q1
DOI:10.1128/msystems.00228-26
PMID:42584158
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综述 | 该文章综述了基于独立成分分析(ICA)的iModulon框架,用于从大规模原核转录组数据中分解出独立调控的基因集,并介绍了iModulonDB 3.0数据库及其跨物种比较应用 | 提出了iModulonDB 3.0,包含53个物种、71个ICA分解和33,062个RNA-seq样本,并首次系统性地进行跨物种iModulon结构比较,发现了13个保守的调控模块 | 文章讨论了iModulon重建和计算的设计原则与局限性,但未具体说明 | 综述基于ICA的转录组分解的数据科学原理、计算工作流程及iModulonDB基础设施,并展示跨物种比较的应用 | 原核生物转录组数据,包括53个物种的33,062个RNA-seq样本 | 机器学习 | NA | RNA-seq | ICA | 文本 | 33,062个RNA-seq样本,涵盖53个物种 | NA | NA | NA | 医学, 工业生物技术 |
| 56 | 2026-09-25 |
Microbial partnerships and molecular mechanisms in plant stress physiology for climate-resilient and sustainable farming
2026-Sep-08, Planta
IF:3.6Q1
DOI:10.1007/s00425-026-05140-6
PMID:42709227
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综述 | 本文综述了植物-微生物伙伴关系及其分子机制在提高作物养分获取和胁迫耐受性中的作用,并探讨了多组学、人工智能和合成生物学在设计微生物接种剂和合成微生物群落中的应用 | 将生态学、生理学和分子视角相整合,提出利用人工智能和大数据分析优化基于微生物组的策略,以应对气候变化的可持续农业新前沿 | 未涉及具体的实验验证数据,主要基于现有文献的综述分析 | 探讨植物-微生物相互作用及其分子机制在植物胁迫生理中的作用,为气候适应型和可持续农业提供理论依据 | 植物、植物相关微生物群落、作物 | 机器学习 | NA | 多组学,包括基因组学、转录组学、代谢组学、宏基因组学 | NA | 文本 | NA | NA | 植物 | NA | 农业,环境 |
| 57 | 2026-09-24 |
[Research progress in synthesis of cordycepin by microorganisms]
2026-Sep-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.260120
PMID:42773651
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综述 | 系统综述了虫草素生产从传统发酵到合成生物学制造的发展历程,重点分析了微生物细胞工厂构建和虫草素合成的突破性进展 | 从合成生物学视角系统梳理虫草素生物制造的发展轨迹,提出利用酶工程和合成生物学构建高效、环保、智能化虫草素生物制造技术的展望 | 作为综述文章,未提供原始实验数据,主要基于现有文献分析,缺乏对具体技术路线的实验验证 | 综述虫草素生物合成的研究进展,为构建高产虫草素菌株提供理论支持和技术参考,促进虫草素产业化 | 虫草素及其微生物生产体系 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、酶工程、发酵工程 | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 医药、工业生物技术 |
| 58 | 2026-09-24 |
[Recent progress in algal-bacterial symbiotic and mutualistic systems]
2026-Sep-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.260133
PMID:42773652
|
综述 | 该综述系统总结了藻菌共生和互惠系统的基本互作类型、调控机制、使能技术及其在环境修复和生物制造中的应用 | 聚焦于工程化互惠菌群的理性重构使能技术,整合了单细胞动态监测、人工智能驱动设计平台以及自上而下与自下而上相结合的合成群落工程策略 | 目前在机制理解、物种特异性、长期系统稳定性和生态风险评估方面仍存在研究挑战 | 为推进合成生物学驱动的资源利用和绿色生物制造提供理论指导和技术支撑 | 藻菌共生和互惠系统 | 合成生物学 | NA | 单细胞动态监测、多组学分析、计算建模 | 人工智能驱动设计平台 | NA | NA | NA | 藻类,细菌 | 合成菌群工程(互惠菌群的理性重构) | 环境,能源,工业生物技术 |
| 59 | 2026-09-24 |
[Research progress and prospects of cyanobacterial cell factories for ethylene production]
2026-Sep-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.260210
PMID:42773649
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综述 | 系统总结了利用光合蓝细菌细胞工厂实现太阳能驱动CO2直接转化为乙烯的研究进展,涵盖EFE催化机制、关键遗传元件筛选优化、代谢工程策略及培养工艺优化 | 全面整合了蓝细菌乙烯合成领域的最新进展,从EFE核心催化机制到代谢工程策略(基因拷贝数扩增、前体供给增强、碳通量重定向、副产物抑制缓解)及培养工艺优化,并系统提出未来发展方向 | 蓝细菌乙烯产量和效率低、遗传稳定性不足、大规模培养存在瓶颈 | 为建立稳健高效的蓝细菌乙烯生产细胞工厂提供理论基础,推动其实际应用 | 光合蓝细菌细胞工厂 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、合成生物学 | NA | 文本 | NA | NA | 蓝细菌 | 乙烯合成代谢途径 | 工业生物技术、能源 |
| 60 | 2026-09-24 |
[Microenvironmental regulation strategies and applications of yeast surface display systems]
2026-Sep-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.260250
PMID:42773648
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综述 | 系统阐述酵母表面展示(YSD)微环境的组成、调控策略及其在工业生产、生物医学和环境修复中的应用 | 从细胞壁、胞内环境和胞外区室三层微环境协同调控的角度系统总结YSD性能优化策略 | 当前微环境调控在精准性、兼容性和稳定性方面仍面临挑战 | 总结YSD微环境的核心组成与靶向调控策略,推动其性能优化和工业转化 | 酵母表面展示系统及其三层微环境(细胞壁、胞内环境、胞外区室) | 合成生物学 | NA | NA | NA | 文本 | NA | NA | 酵母 | 多酶共展示的空间排列 | 工业生物技术, 医学, 环境 |