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当前共找到 121 篇文献,本页显示第 61 - 80 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 工程工具 宿主生物 回路设计 应用领域
61 2026-09-05
TALEs, TALENs, and TALE Base Editors: From Plant Pathology to Biotechnology
2026-Sep, Annual review of phytopathology IF:9.1Q1
综述 本文综述了TALEs、TALENs和TALE碱基编辑器的研究进展,从植物病理学中的病原-宿主相互作用到它们在基因组编辑和合成生物学中的应用。 综述了TALEs从天然效应子到基因组编辑工具的演化,特别强调了TALE碱基编辑器在编辑叶绿体和线粒体基因组中的最新应用。 未提及具体局限性。 总结自然发生的TALEs的现状,并强调它们在基因组编辑和合成生物学中的当前角色。 TALEs、TALENs和TALE碱基编辑器。 生物技术 NA 基因组编辑、碱基编辑 NA 基因组数据 NA TALEN, TALE碱基编辑器 植物 NA 农业, 工业生物技术
62 2026-09-05
Polyhydroxybutyrate (PHB) production from halophiles: a comprehensive review
2026-Sep-01, Bioresources and bioprocessing IF:4.3Q1
综述 本文全面综述了嗜盐菌生产聚羟基丁酸酯(PHB)的研究进展,涵盖生理适应、代谢途径、底物利用、发酵技术、生物反应器优化及下游处理等方面 强调利用农业工业残余物和废料作为可持续碳源,并批判性评价了绿色提取技术、代谢工程、CRISPR基因编辑及合成生物学在提高PHB产量中的应用,同时整合循环生物经济理念 面临工艺经济性、含盐废水处理、聚合物脆性及大规模商业化等挑战 探讨嗜盐菌生产PHB的可持续策略,以替代石油基塑料并促进循环生物经济发展 嗜盐细菌及其PHB生产过程 生物技术 NA 代谢工程, CRISPR基因编辑, 合成生物学, 绿色提取技术 NA 文本 NA CRISPR-Cas9 嗜盐菌 代谢通路(PHB合成途径) 包装, 农业, 生物医学工程, 环境
63 2026-09-04
Sustainable Biocatalytic Cascades: A Versatile Tool in the Synthesis of Natural Products With Therapeutic Potential
2026-Sep-14, Chembiochem : a European journal of chemical biology IF:2.6Q3
综述 本文综述了生物催化级联反应在合成具有治疗潜力的天然产物中的应用,强调其在可持续化学和药物发现中的重要性 系统总结了生物催化级联反应在复杂天然产物和药物合成中的最新进展,展示了蛋白质工程和合成生物学如何扩展其应用范围 未具体讨论级联反应的工业化挑战或经济可行性限制 探讨生物催化级联反应作为可持续合成工具在药物发现和化学制造中的潜力 生物催化级联反应及其在合成多酮化合物、生物碱、药物活性成分和杂环化合物中的应用 合成生物学 不适用 蛋白质工程、定向进化、计算酶设计、合成生物学 不适用 文献数据 不适用 不适用 不适用 不适用 药物、工业生物技术
64 2026-09-04
Bioengineering microbial cellulose synthesis pathways as biofactory for industrial-scale cellulose production: a review on current advances
2026-Sep-02, World journal of microbiology & biotechnology IF:4.0Q2
综述 本文批判性审查了微生物纤维素生物合成途径,重点关注细菌作为最具潜力的生物工厂,探讨通过代谢工程、基因组编辑和合成生物学提升工业规模纤维素生产力,并指出研究优先事项和未来方向。 该综述系统整合了代谢工程、基因组编辑和合成生物学的最新进展,提出优化前体途径、抑制副产物、工程化cyclic-di-GMP调控网络及提高氧利用效率等策略,并强调菌株-工艺整合工程。 综述指出生产中的低生产力、高成本、菌株遗传不稳定性和对生物合成途径与理化性质关系标准化不足等现有挑战。 评估微生物纤维素生物合成途径的工程化潜力,突破工业规模生产障碍,促进可持续生物材料的经济可行生产。 细菌、藻类和卵菌的微生物纤维素生物合成途径。 系统与合成生物学、代谢工程 不适用 不适用 不适用 不适用 不适用 不适用 细菌 微生物纤维素生物合成途径 工业生物技术、材料科学、环境科学
65 2026-09-04
Recruiting orthogonal biological systems for engineering microorganisms
2026-Sep, Trends in biotechnology IF:14.3Q1
综述 本文综述了正交策略在微生物合成生物学中的应用,包括正交遗传系统、代谢途径、能量系统和调控系统的构建,并探讨了未来研究方向。 系统性地总结了正交策略在微生物合成生物学中的最新进展和应用,涵盖多个层面的正交系统,并展望了未来研究趋势。 由于是综述,未涉及具体的实验验证,可能缺乏对实际应用中挑战的深入分析。 总结正交策略在微生物合成生物学中的应用进展,探讨减少代谢系统复杂性和不可预测性的方法,为未来研究提供参考。 微生物细胞及其合成生物学工程系统 合成生物学 NA NA NA 文献数据 NA NA 微生物 正交遗传系统、正交代谢途径、正交能量系统、正交调控系统 工业生物技术
66 2026-09-03
A standardized SBML/PRISM benchmark library for stochastic model checking in synthetic biology
2026-Sep-02, Journal of integrative bioinformatics IF:1.5Q3
研究论文 本文介绍了一个标准化的SBML/PRISM基准库,用于合成生物学中的随机模型检验,以支持软件开发、比较和可重复性 提供了首个经整理的基准库,包含生物学启发的无限状态空间随机模型,并以SBML和PRISM两种格式提供,以增强互操作性和社区贡献 未明确说明局限性,但可能受限于有限案例数量和状态空间增长的扩展性 支持随机模型检验软件在合成生物学中的开发,提高可重复性、工具比较和基础设施稳健性 合成生物学中的随机模型,包括化学反应网络 合成生物学 NA 随机模型检验 随机过程模型 模型文件(SBML和PRISM格式) 多个案例研究,具体数量未说明 NA NA NA 合成生物学
67 2026-09-03
Light governed plant-microbe interactions: the role of light in biotic stress resilience
2026-Sep, Physiology and molecular biology of plants : an international journal of functional plant biology IF:3.4Q1
综述 本文综述了光在植物-微生物相互作用中对生物胁迫抗性的调控作用,探讨了光如何影响植物免疫、次生代谢及微生物群落行为,并提出了整合光生物学与微生物组研究以开发抗病和气候智能作物的策略 将光生物学与微生物组研究相结合,提出利用光响应途径开发抗病和气候智能作物的新思路 未提供具体实验数据,仅基于现有研究进行综述,缺乏实证支持 探讨光作为调控信号在植物-微生物相互作用中的作用,并评估其在生物胁迫抗性中的潜在应用 植物、植物相关微生物组、病原体 植物科学、微生物学、光生物学 植物病害(由病原体引起的生物胁迫) 未明确提及 未明确提及 文献资料 不适用(综述文章) 未明确提及 植物 未涉及合成生物电路设计 农业
68 2026-09-03
Enzymatic depolymerization of laboratory waste DNA to a dGMP-containing pool and analytical assessment of dGTP in a crude-lysate guanylate kinase system
2026-Sep-01, Molecular biology reports IF:2.6Q3
研究论文 本研究探究了从实验室废弃DNA中通过酶促解聚和粗裂解液酶联反应生成dGTP的可行性,并进行了分析验证。 首次利用废弃DNA作为底物,通过简化粗裂解液酶级联反应实现dGMP的生成并确认dGTP的存在。 dGTP的DNA依赖性生成未能证实,且未进行定量分析,仅为概念验证。 探索将实验室废弃DNA转化为脱氧鸟苷三磷酸(dGTP)的酶促方法。 实验室废弃DNA、重组酿酒酵母鸟苷酸激酶(GUK1)、E. coli BL21(DE3)表达系统、S1核酸酶、粗裂解液。 合成生物学 NA S1核酸酶水解、重组蛋白表达(SDS-PAGE)、离子对HPLC、高分辨Q-TOF LC-MS/MS、酶联反应。 NA 色谱图、质谱数据 3个生物重复(用于比较重组GUK1和空载体对照)。 重组蛋白表达(异源表达) 大肠杆菌(E. coli BL21(DE3)) 粗裂解液酶级联反应(包括GUK1、内源NDPK和丙酮酸激酶/PEP ATP再生系统)。 工业生物技术
69 2026-08-30
Miniaturized CRISPR: Ultra Compact Systems for In Vivo Delivery and Portable Diagnostics
2026-Sep, Annals of biomedical engineering IF:3.0Q3
综述 本文总结了小型化CRISPR系统(如Cas12f、CasX和迷你Cas9)在体内递送和便携式诊断中的应用进展,并讨论了相关挑战与未来机遇。 强调了超紧凑CRISPR系统相比传统SpCas9在分子量小、结构简单方面的优势,并探讨了AI辅助蛋白设计和合成生物学在该领域的应用潜力。 综述性文章,未包含原始实验数据;讨论了脱靶效应、递送障碍和监管要求等未解决的挑战。 总结小型化CRISPR系统在治疗性基因编辑和便携式诊断平台中的应用进展及未来发展方向。 小型化CRISPR系统(Cas12f、CasX、迷你Cas9)及其在体内基因编辑和诊断中的应用。 合成生物学 NA CRISPR基因编辑 NA NA NA CRISPR-Cas9, CRISPR-Cas12f, CRISPR-CasX NA NA 医学, 诊断
70 2026-08-30
Advances in prime editing: Molecular innovations, Large-fragment engineering, and AI-driven design
2026-Sep, Biodesign research
综述 本文综述了引物编辑技术的最新进展,包括核心组件的分子创新、大片段编辑策略和人工智能驱动的设计工具,并探讨其在医学、农业和合成生物学中的广泛应用。 全面总结了引物编辑在Cas蛋白变体、逆转录酶工程和pegRNA设计上的迭代创新,并重点介绍了TwinPE、PASTE和PrimeRoot等大片段编辑平台以及AI驱动的设计工具对编辑效率和可预测性的提升。 未明确讨论引物编辑技术当前的局限性,如脱靶效应、递送挑战或临床应用中的障碍。 综述引物编辑技术的分子创新、大片段工程和AI设计方法,展示其作为可编程和可扩展基因组编辑平台的潜力。 引物编辑技术及其核心组件,包括Cas蛋白、逆转录酶、pegRNA和大片段编辑平台。 基因组编辑 NA 引物编辑 NA NA NA NA 多种生物系统 NA 医学, 农业, 合成生物学
71 2026-08-28
Systematic Categorization and Functional Diversity of Secondary Metabolites from Bacillus spp.: A Review
2026-Sep, Probiotics and antimicrobial proteins IF:4.4Q2
综述 系统分类并总结芽孢杆菌属(Bacillus spp.)产生的次生代谢产物,涵盖其化学多样性、作用机制、结构-功能关系及实际应用中的挑战与机遇 基于生物合成逻辑和化学骨架系统分类芽孢杆菌次生代谢产物,并整合了作用机制、结构-功能关系及基因组挖掘和合成生物学等新兴策略 未提供具体实验数据,且对代谢产物异质性、毒性等问题仅作定性讨论 为芽孢杆菌代谢产物的理性选择和应用提供框架,重点在农业、食品和医学领域 芽孢杆菌属的次生代谢产物,如脂肽、多肽、大环内酯、有机酸、聚酮和角鲨烯 微生物学 NA 基因组挖掘、代谢组学辅助去重复化、合成生物学 NA 文本和综述性资料 NA NA NA NA 农业, 食品, 医学
72 2026-08-26
Directed evolution of functional intrinsically disordered proteins
2026-Sep, Nature chemical biology IF:12.9Q1
研究论文 本文提出一种定向进化方法,用于在活细胞中进化功能性的合成内在无序蛋白(synIDPs),并展示其在蛋白质电路调控和抗生素耐药性逆转中的应用。 首次系统性地开发了定向进化方法,用于进化具有不同相行为和热响应特性的合成内在无序蛋白,并引入了反选择方法以筛选作为溶解度标签的蛋白。 摘要未提及具体局限性。 开发一种系统性的定向进化方法,以克服设计功能性合成内在无序蛋白的挑战,并扩展其在合成生物学和生物技术中的应用。 合成内在无序蛋白(synIDPs)及其在活细胞中的相行为、热响应和溶解度特性。 合成生物学 NA 定向进化、反选择 NA 蛋白序列和表型数据 NA NA 活细胞(具体未指明) 蛋白质电路 合成生物学, 生物技术
73 2026-08-22
Gene expression and metabolic regulation of carotenoid and withanolide biosynthetic pathways in Withania somnifera with emphasis on FPPS-mediated regulation
2026-Sep, Protoplasma IF:2.5Q2
研究论文 本文全面研究了印度人参(Withania somnifera)中类胡萝卜素和醉茄内酯生物合成途径的基因表达与代谢调控,重点探讨了法尼基焦磷酸合酶(FPPS)的调控作用 首次对22个相关基因进行转录谱分析,发现FPPS作为关键通量调控酶,并通过瞬时过表达WsFPPS2验证其在醉茄内酯合成中的上游调控作用 研究主要基于转录水平和瞬时表达实验,缺乏稳定的遗传转化和长期代谢流分析 阐明印度人参中类胡萝卜素和醉茄内酯生物合成途径的基因表达与代谢调控机制,特别是FPPS介导的调控,为代谢工程提供靶点 印度人参(Withania somnifera)的营养和生殖组织 植物代谢工程 NA 转录组分析、瞬时过表达、系统发育分析 NA 基因表达谱数据 22个基因,包含不同组织和过表达叶片样本 瞬时过表达(农杆菌介导) 印度人参(Withania somnifera) 醉茄内酯和类胡萝卜素生物合成途径中的FPPS过表达 医药
74 2026-08-22
Flaxseed gum-reinforced sodium alginate semi-interpenetrating polymer network W1/O/W2 emulgels for targeted co-delivery of prebiotics and engineered "living factory": a novel next-generation synbiotic system for anoxia-triggered synergistic inulin metabolism
2026-Sep, International journal of biological macromolecules IF:7.7Q1
研究论文 本研究开发了一种基于亚麻籽胶增强海藻酸钠半互穿聚合物网络的W1/O/W2乳凝胶系统,用于靶向共递送益生元(菊粉)和工程化“活工厂”大肠杆菌Nissle1917,实现缺氧触发的协同菊粉代谢 创新性地将合成生物学与生物大分子组装相结合,构建了下一代工程化合生元平台,通过缺氧响应性菊粉酶分泌系统实现不依赖宿主菌群异质性的精准微生物组调控 摘要中未提及研究的局限性 旨在开发一种新型工程化合生元系统,实现益生元和工程菌的同步递送,并利用缺氧触发机制实现菊粉的靶向代谢,从而克服宿主菌群异质性对益生元功效的限制 工程化大肠杆菌Nissle1917及其分泌的菊粉酶,以及亚麻籽胶-海藻酸钠乳凝胶系统 合成生物学 NA NA NA NA NA NA 大肠杆菌Nissle1917 缺氧响应性双酶系统,用于靶向菊粉酶分泌 医学, 食品
75 2026-08-18
Advances, challenges, and opportunities in engineering C5 and C6 sugar transporters in yeast for bio-based industrial biotechnology
2026-Sep, Critical reviews in biotechnology IF:8.1Q1
综述 本文综述了酵母中C5和C6糖转运蛋白工程化的进展、挑战和机遇,以推动生物基工业生物技术发展。 总结了C5糖转运的关键瓶颈,并重点介绍了理性蛋白工程、定向进化和机器学习等策略在扩展C5转运蛋白库和优化转运效率方面的最新突破。 未详细讨论C6糖转运的具体机制及全部工程化案例(根据摘要推断)。 促进酵母高效转化戊糖(D-木糖和L-阿拉伯糖),实现可持续的生物基生产。 酵母中的D-木糖和L-阿拉伯糖转运蛋白 合成生物学 NA NA NA NA NA NA 酵母 NA 工业生物技术
76 2026-08-14
An orthogonal mammalian gene circuit for selective sensing of taurine-conjugated bile acids
2026-Sep-17, Biochemical and biophysical research communications IF:2.5Q3
研究论文 本研究利用来自霍乱弧菌的胆汁酸诱导型二鸟苷酸环化酶VC1372,在哺乳动物细胞中构建了一种正交的牛磺酸结合胆汁酸响应基因回路,实现对Tau-BAs的选择性检测。 首次将细菌来源的VC1372酶改造为哺乳动物细胞中的正交代谢物传感器,实现对牛磺酸结合胆汁酸的选择性检测,避免了内源受体干扰。 该基因回路主要在体外细胞水平验证,尚未在体内模型中进行测试,且对低浓度Tau-BAs的敏感性和特异性有待进一步优化。 开发一种能够在哺乳动物细胞中正交且选择性响应牛磺酸结合胆汁酸的合成基因回路,为相关疾病的诊断和治疗提供模块化平台。 哺乳动物细胞中的合成基因回路,以及主要循环Tau-BAs(TCA、TDCA、TCDCA)。 合成生物学 慢性肝病、代谢性疾病、神经退行性疾病 定点突变、基因回路构建、细胞培养、荧光报告基因检测 NA 实验数据(基因表达响应数据) NA 定点突变 哺乳动物细胞 正交牛磺酸结合胆汁酸响应基因回路,包括VC1372酶促模块和BldD依赖性转录模块 医学
77 2026-08-10
Complete remediation of a mixture of 5 acetophenone derivatives by multi-modular engineered Escherichia coli: Avoiding intermediate toxicity from incomplete degradation
2026-Sep-01, Ecotoxicology and environmental safety IF:6.2Q1
研究论文 本文构建了多模块工程化大肠杆菌BL-all,通过整合14个结构优化的基因到4个分解代谢模块,实现了对5种苯乙酮衍生物的完全降解,避免了不完全降解产生的有毒中间体积累,并通过斑马鱼毒性测试和水样实验验证了其解毒能力和实际应用潜力。 首次采用多模块合成生物学方法构建工程菌株,完全降解5种苯乙酮衍生物混合物,解决不完全降解产生有毒中间体的问题,并通过同位素示踪和生态毒性测试全面验证其有效性和安全性。 具体局限性未在摘要中说明,可能包括对未测试底物的降解能力不确定,以及在实际复杂环境中的长期稳定性和效率需要进一步验证。 解决微生物不完全降解低毒化合物产生高毒中间体的问题,构建可完全降解苯乙酮衍生物混合物的工程菌,用于环境污染修复。 5种苯乙酮衍生物(苯乙酮、对羟基苯乙酮、对羟基苯丙酮、对羟基苯甲醛和邻羟基苯乙酮)及工程化大肠杆菌BL-all。 环境生物技术 NA 合成生物学、同位素示踪(C标记)、毒性测试(斑马鱼) NA 实验数据(降解效率、毒性测试结果) 5种苯乙酮衍生物,每种1 mM混合物,以及斑马鱼样品 合成生物学(多模块基因整合) 大肠杆菌 多模块分解代谢途径(4个模块,14个基因)用于完全降解苯乙酮衍生物 环境修复
78 2026-08-01
Development, optimization, and application of an episomal plasmid system for Rhodotorula toruloides
2026-Sep, Metabolic engineering IF:6.8Q1
研究论文 本文首次为红冬孢酵母(Rhodotorula toruloides)开发了功能性附加体质粒系统,并优化了转化效率,实现了多基因途径表达和CRISPR基因组编辑。 首次构建了R. toruloides的附加体质粒系统,通过筛选多种来源的自主复制序列(ARS)鉴定出功能元件C63F4,并开发了Cre-loxP介导的体内再环化策略以提高转化效率,同时建立了简化的CRISPR无缝基因组编辑工具。 文中未提及明确的局限性,但可能包括质粒稳定性和拷贝数仍有提升空间,以及系统对其他菌株的适用性未知。 开发并优化红冬孢酵母的附加体质粒系统,以加速代谢工程、合成生物学和基础研究。 红冬孢酵母(Rhodotorula toruloides)菌株CBS14及其工程改造。 合成生物学 NA NGS(用于筛选ARS)、CRISPR-Cas9 NA 基因序列、质粒稳定性数据、基因表达数据 筛选了多种来源的候选ARS,具体样本数未提及 CRISPR-Cas9、Cre-loxP系统 红冬孢酵母(Rhodotorula toruloides) 附加体质粒系统pC63F4,包含自主复制序列(ARS)C63F4、GFP报告基因、多基因代谢途径(用于三乙酸内酯、脂肪醇和柠檬烯生产)、以及基于CRISPR的基因组编辑工具 工业生物技术、代谢工程
79 2026-08-01
A plug-and-play cytochrome P450 system enables de novo biosynthesis of 2-phenylethanol derivatives
2026-Sep, Metabolic engineering IF:6.8Q1
研究论文 开发了一种基于细胞色素P450的即插即用系统,通过定向进化和代谢工程,在解脂耶氏酵母中实现了2-苯乙醇衍生物的从头生物合成 通过结构引导的酶工程实现了P450BM3的区域发散性羟基化,具有高区域选择性和对映选择性;在5升生物反应器中实现了最高产量;意外发现糖基转移酶的混杂活性,促进了红景天苷和2-苯乙基-β-D-吡喃葡萄糖苷的创纪录生产 摘要中未提及明确的局限性 开发可扩展和适应性强的即插即用氧化生物催化系统,用于可持续生产高价值芳香族化合物 2-苯乙醇衍生物,包括(R)-1-苯基乙二醇、酪醇、红景天苷和2-苯乙基-β-D-吡喃葡萄糖苷 合成生物学 NA 定向酶进化、结构引导的蛋白质工程、代谢工程 NA 文本、实验数据 不适用 CRISPR-Cas9 解脂耶氏酵母 细胞色素P450驱动的羟基化途径 工业生物技术
80 2026-08-01
Evolution-guided high yield production of potent Gαq/11-signalling inhibitors FR900359 and YM-254890
2026-Sep, Metabolic engineering IF:6.8Q1
研究论文 本文通过进化引导的合成生物学策略,开发了稳健的异源微生物系统,用于高产生产Gαq/11信号抑制剂FR900359和YM-254890 首次采用进化引导策略,利用未培养微生物来源和链霉菌强启动子,实现了FR900359和YM-254890在异源宿主中的高产生产,并开发了双拷贝BGC宿主以进一步提高产量 未明确提及,但可能涉及异源宿主的生产稳定性或BGC组装复杂性 开发高产、成本效益高的微生物生产系统,用于生产Gαq/11信号抑制剂FR900359和YM-254890,以促进其生物技术应用和药物开发 FR900359和YM-254890的生物合成基因簇,以及异源宿主Burkholderia gladioli Δgbn::attB和Δgbn::2attB 合成生物学 Gα突变肿瘤 异源表达、基因簇组装、启动子工程 NA 序列数据、产量数据 多个BGC构建体和两种异源宿主菌株 CRISPR-Cas9 Burkholderia gladioli 生物合成基因簇的异源表达和双重拷贝 医学、工业生物技术
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