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当前共找到 172 篇文献，本页显示第 61 - 80 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2026-09-24 |
[Construction of an anti-phage network system based on synergistic mechanisms and its applications in synthetic biology]
2026-Sep-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.260142
PMID:42773658
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研究论文 | 该研究通过整合受体工程与协同防御机制，构建了一个高效、广谱、低毒的噬菌体防御网络系统，并应用于工业发酵菌株以抵抗噬菌体污染。 | 首次发现Shedu与Septu之间的协同抗噬菌体机制，并结合受体工程构建了抗噬菌体网络系统，显著提高了对多种噬菌体的广谱抗性。 | 未明确提及该系统在更广泛工业环境中的长期稳定性及对未知噬菌体的防御效果。 | 解决单一抗噬菌体策略易被噬菌体自发突变逃逸、保护效果有限且适用性差的问题，提高工业发酵过程的稳定性。 | 工业发酵菌株（如核黄素和L-亮氨酸生产菌株）及多种噬菌体（T4、λ、P251、P255、T1、T7）。 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 工业发酵菌株（如核黄素和L-亮氨酸生产菌株） | 抗噬菌体网络系统（整合Shedu和Septu协同防御机制及受体工程） | 工业生物技术 |
| 62 | 2026-09-24 |
Inhibitors of nutrient pathways: nature's overlooked antibiotic arsenal
2026-Sep-23, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d6np00036c
PMID:42387997
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综述 | 本文综述了靶向细菌营养代谢途径的天然产物抗生素，将其分为生物合成抑制剂、抗代谢物、前抗代谢物和核糖开关抑制剂四类。 | 系统整合了73类被忽视的靶向营养代谢的天然产物抗生素，提出了四类机制分类，并指出了营养丰富筛选培养基导致此类活性被掩盖的方法学偏见。 | 作为综述文章，未提供原始实验数据；所述化合物的体内疗效和临床转化潜力仍需进一步验证。 | 呼吁将营养途径抑制剂重新纳入抗生素发现管线，以拓展抗菌靶点空间并应对耐药性挑战。 | 靶向细菌营养生物合成和利用途径的天然产物抗生素 | 药物发现 | 细菌感染 | NA | NA | 文本 | 73类化合物 | NA | NA | NA | 医学 |
| 63 | 2026-09-24 |
Protein turnover in plants-cost of synthesis, repair, and crop engineering opportunities
2026-Sep-01, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiag481
PMID:42418770
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综述 | 该综述探讨了植物中蛋白质周转的碳成本，包括合成、修复和降解，并讨论了通过合成生物学改善作物性能的机会 | 强调化学损伤导致的蛋白质周转在植物生物学中研究不足，并系统量化了其能量成本，提出了合成生物学策略来利用修复机制而非再合成 | 作为综述，未提供原始实验数据，且对具体修复机制的分子细节和工程化应用的可行性分析有限 | 理解蛋白质损伤的原因、能量后果和修复机制，以指导作物改良策略 | 植物中的蛋白质，特别是受化学损伤和逆境胁迫影响的蛋白质 | 植物生物学 | NA | NA | NA | 文本 | NA | NA | 植物 | NA | 农业 |
| 64 | 2026-09-24 |
Devising a divisome for synthetic cells
2026-09, Nature reviews. Chemistry
DOI:10.1038/s41570-026-00848-1
PMID:42443379
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综述 | 本文综述了在体外部分重构细胞分裂蛋白机器以构建合成细胞分裂体（divisome）的当前策略，涵盖对称性破缺、膜变形和最终离断等关键阶段 | 系统性地评述了模拟细胞分裂关键阶段（对称性破缺定义分裂位点、膜变形驱动缢缩和最终离断）的现有策略，并讨论了整合多个模块以实现合成细胞最小功能性分裂系统的可能性 | 目前仅实现了细胞分裂蛋白机器的部分体外重构，各策略均存在各自的局限性，尚未能实现完整的合成细胞分裂功能 | 综述在自下而上合成生物学中构建合成细胞分裂体（divisome）的当前策略，评估其成功与不足，并探讨整合多模块实现最小功能性分裂系统的途径 | 合成细胞（人工构建的功能性细胞）及其分裂系统 | 合成生物学 | NA | 体外蛋白质机器重构 | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 医学, 工业生物技术 |
| 65 | 2026-09-24 |
Identification and catalytic optimization of pinene oxidases in paeoniflorin biosynthetic pathway
2026-Sep-01, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiag669
PMID:42740699
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研究论文 | 该文章确认芍药苷的生物合成起源于α-蒎烯，并鉴定出三种新型细胞色素P450酶催化蒎烯氧化，通过定点突变优化CYP71AN126的催化特异性 | 首次确认芍药苷生物合成起源于α-蒎烯，鉴定出三种新型CYP450酶（CYP71AN126和CYP76A225/226）催化蒎烯氧化，并发现L493是调控CYP71AN126催化位点特异性和底物特异性的关键残基 | 芍药苷完整生物合成途径尚未完全解析，仅确定了C4氧化为关键限速步骤，下游途径仍有待阐明 | 解析芍药苷生物合成途径中蒎烯氧化步骤，鉴定关键酶并优化其催化性能 | 芍药属植物中芍药苷生物合成途径的蒎烯氧化酶（CYP71AN126和CYP76A225/226） | 合成生物学 | NA | 病毒诱导基因沉默（VIGS）、蛋白结构预测、定点突变 | NA | 序列数据、结构数据 | NA | 定点突变 | NA | NA | 医药 |
| 66 | 2026-09-24 |
AlloPool is a deep learning framework that infers protein allostery from molecular dynamics simulations
2026-Sep, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.3004002
PMID:42766632
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研究论文 | 该文章提出了AlloPool，一个基于图神经网络的深度学习框架，通过迭代剪枝残基-残基相互作用，从分子动力学模拟中推断蛋白质变构通信网络和构象动态 | 首次将时间注意力机制与图聚合相结合，从平衡和非平衡分子动力学模拟中学习演化交互图，能够推断控制蛋白质构象动态的最小时间分辨交互网络，并在动态轨迹重建方面优于现有机器学习方法 | 依赖于分子动力学模拟数据，而高分辨率实验数据稀缺可能限制模型的训练和验证；未明确讨论计算成本及在大规模蛋白质系统上的可扩展性 | 开发一个通用框架，从分子动力学模拟中解释蛋白质动态并推断变构通信通路 | 多种动态蛋白质系统，包括结合结构域、机械传感器、信号受体和酶 | 机器学习 | NA | 分子动力学模拟 | GNN, 时间注意力机制 | 分子动力学模拟数据 | NA | NA | NA | NA | 医学, 合成生物学 |
| 67 | 2026-09-23 |
Advances in erythritol production through synthetic biology and systems metabolic engineering
2026-Sep-21, Archives of microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00203-026-05219-4
PMID:42766016
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综述 | 本文综述了通过合成生物学与系统代谢工程提升赤藓糖醇产量的研究进展，提出了一个贯穿胞内代谢到工业规模的分层约束框架 | 提出分层约束级联框架，将赤藓糖醇生物制造从天然菌株优化、合成生物学通路重构、辅因子平衡、模块化设计到AI整合的DBTL循环统一为跨尺度分析体系，并指出AI应用需与机理模型耦合而非仅做统计拟合 | 当前AI应用多为统计拟合而非机理驱动的跨尺度建模，实时传感与自适应通量调控尚未闭环，实验室设计与工业操作之间因混合和原料的尺度依赖性异质性仍存在较大差距 | 系统诊断赤藓糖醇生物合成中的系统性瓶颈，并勾勒糖醇类智能生物制造的原则与路径 | 赤藓糖醇生物合成途径及相关稀有糖（阿洛酮糖、塔格糖） | 合成生物学, 代谢工程 | NA | 合成生物学, 系统代谢工程, 代谢建模, 自动化DBTL循环, 无细胞系统, 实时传感 | AI整合设计-构建-测试-学习（DBTL）模型, 机理跨尺度模型 | 文本 | NA | NA | NA | 赤藓糖醇合成代谢通路, 辅因子（NADPH）平衡模块, 模块化通路设计 | 工业生物技术, 食品, 医药 |
| 68 | 2026-09-23 |
Marine Microalgal Genes: Unlocking a New Era of Sustainable High Value PUFA Production for Neuroprotective Applications
2026-Sep-21, Cell biochemistry and biophysics
IF:1.8Q4
DOI:10.1007/s12013-026-02013-3
PMID:42766103
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综述 | 本文综述了海洋微藻作为高价值多不饱和脂肪酸（PUFA）生物合成基因来源的遗传与生化潜力，并探讨了通过合成生物学和代谢工程提升PUFA积累的策略 | 系统整合了海洋微藻PUFA生物合成通路中关键去饱和酶和延长酶的功能研究，并结合组学分析、合成生物学与代谢工程，提出了在陆生油料作物和微生物宿主中异源表达微藻基因的新思路 | PUFA通路调控机制复杂，菌株优化困难，且从实验室到产业化的转化可行性仍面临挑战 | 探讨海洋微藻PUFA生物合成基因在可持续、高值化PUFA生产及神经保护应用中的潜力与策略 | 海洋微藻及其PUFA生物合成基因（去饱和酶和延长酶） | 合成生物学, 代谢工程 | 神经保护 | 组学分析, 合成生物学, 代谢工程, 异源表达 | NA | 文本 | NA | NA | 陆生油料作物, 微生物宿主 | PUFA生物合成通路 | 医学, 食品, 工业生物技术 |
| 69 | 2026-09-23 |
Technical limitations of CRISPR-Cas9 genome editing in bacteria: challenges and future directions
2026-Sep-21, Archives of microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00203-026-05182-0
PMID:42766154
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综述 | 本文综述了CRISPR-Cas9在细菌基因组编辑中的技术局限性，包括脱靶效应、DNA修复限制、Cas核酸酶细胞毒性及宿主特异性限制修饰屏障，并讨论了当前应对策略和未来方向 | 系统性总结了细菌中CRISPR-Cas9编辑的主要技术障碍，并评估了改进guide RNA设计、替代Cas变体、优化递送策略和宿主适应性工程等新兴解决方案 | 作为综述文章，未提供原始实验数据，对各项挑战的讨论主要基于现有文献，缺乏对具体解决方案效率的定量比较 | 探讨CRISPR-Cas9在细菌基因组编辑中的主要技术障碍，评估现有应对策略，并展望提高编辑效率、可靠性和精确度的新兴方法 | 细菌中的CRISPR-Cas9基因组编辑技术 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9基因组编辑 | NA | 文本 | NA | CRISPR-Cas9 | 细菌 | NA | 医学, 工业生物技术, 合成生物学 |
| 70 | 2026-09-23 |
Developing cumate-inducible gene expression systems for application in Pseudomonas putida KT2440
2026-Sep-02, Journal of applied microbiology
IF:3.2Q2
DOI:10.1093/jambio/lxag105
PMID:42770803
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研究论文 | 本研究开发了两种基于cumate诱导的基因表达系统，用于恶臭假单胞菌KT2440，并应用于柠檬烯生物转化为紫苏醇 | 开发了两种新型cumate诱导表达系统，分别基于CuO1和CuO2操纵子，通过启动子优化和操纵子结构优化实现了高性能表达，并首次应用于紫苏醇生物合成 | 未提及 | 开发高效基因表达工具以实现恶臭假单胞菌KT2440的精准代谢调控 | 恶臭假单胞菌KT2440 | 合成生物学 | NA | 基因工程、启动子优化、操纵子工程、异源表达、荧光报告检测 | NA | 荧光强度数据、产物滴度数据 | NA | NA | 恶臭假单胞菌KT2440 | cumate诱导表达系统（基于CuO1和CuO2操纵子），异源细胞色素P450催化柠檬烯转化 | 工业生物技术、医药 |
| 71 | 2026-09-22 |
In vitro enzymatic synthesis of long-acting therapeutic proteins and peptides
2026-Sep-18, Bioorganic chemistry
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.bioorg.2026.110521
PMID:42764007
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综述 | 本文综述了通过酶催化糖基化、脂化、PEG化和大环化四种绿色修饰策略合成长效治疗性蛋白和多肽的生物催化进展 | 系统总结了四种高效绿色酶催化修饰策略的催化机制、底物特异性和酶结构工程，并提出了AI驱动的生成式酶设计和合成生物学将拓宽生物催化方法范围的展望 | 当前生物催化存在瓶颈，如非天然聚合物的底物范围受限 | 综述治疗性蛋白和多肽的位点特异性功能化生物催化合成方法 | 治疗性蛋白和多肽 | 合成生物学 | NA | 酶催化生物偶联 | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 医学, 工业生物技术 |
| 72 | 2026-09-22 |
Artificial Intelligence in the Discovery of Bioactive Natural Products
2026-Sep-16, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
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综述 | 本文综述了人工智能在生物活性天然产物发现中的应用，涵盖基因组挖掘、代谢组学、生物活性预测和虚拟筛选等AI驱动方法 | 系统整合了AI就绪数据库、BGC预测机器学习工具、代谢组学平台、NMR和MS光谱解析及转化开发，提出了AI作为整合性决策支持框架而非替代实验化学和药理学专业知识的观点 | 数据质量、可重复性、可解释性和伦理问题等关键挑战尚未完全解决 | 全面概述AI驱动的生物活性天然产物发现方法，探讨其与多组学技术、合成生物学和自动化实验的融合 | 生物活性天然产物、生物合成基因簇（BGC）、代谢组学数据、NMR和MS光谱数据 | 机器学习 | NA | 基因组挖掘, 代谢组学, 虚拟筛选, NMR光谱解析, MS光谱解析 | NA | 文本, 光谱数据, 组学数据 | NA | NA | NA | NA | 医学, 工业生物技术 |
| 73 | 2026-09-21 |
Beyond gene editing: the age of chromosome-scale genome engineering
2026-Sep-19, Trends in genetics : TIG
IF:13.6Q1
DOI:10.1016/j.tig.2026.08.010
PMID:42763238
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综述 | 这篇综述探讨了染色体尺度基因组工程的技术工具，包括染色体转移和靶向染色体消除，以及它们如何整合到染色体移植流程中 | 将染色体尺度操作确立为可操作的实验框架，并强调其在理解、构建和修复基因组方面的潜力 | 常规实施仍受限于分析需求和技术障碍 | 综述高等真核生物中染色体尺度操作的工具包，并讨论其在基因组工程中的应用前景 | 高等真核生物的染色体和大规模基因组区域 | 基因组工程 | NA | 染色体转移, 靶向染色体消除, 染色体移植, 大规模DNA组装, 合成生物学, 全基因组验证 | NA | 文本 | NA | NA | 高等真核生物 | NA | 医学, 工业生物技术 |
| 74 | 2026-09-20 |
Balance Between Order and Disorder: Quantum-Epigenetic Pathways for the Emergence and Continuous Evolution of Life
2026-Sep-16, Acta biotheoretica
IF:1.4Q4
DOI:10.1007/s10441-026-09541-8
PMID:42747622
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综述 | 该综述从量子-表观遗传视角出发，整合物理、化学与生物学，探讨生命的起源、演化与再造，以及合成生物学在极端和地外环境中的应用潜力 | 提出量子-表观遗传路径作为生命涌现与持续演化的统一框架，将量子效应（相干与隧穿）、表观遗传和倍性变异与合成生物学相结合，强调无序与有序平衡是演化的驱动力 | 作为综述文章，主要基于文献整合与理论推演，缺乏原始实验数据或系统性定量验证，所提量子-表观遗传机制仍需实验证实 | 整合物理、化学与生物学，探索生命的起源、演化与再造，并提出通过量子-表观遗传视角理解与操纵生命 | 生命起源与前生命化学、原细胞、表观遗传与倍性变异、再生医学、衰老、癌症、极端环境与地外生命 | 机器学习 | 肺癌 | NA | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 医学, 农业, 环境, 工业生物技术 |
| 75 | 2026-09-20 |
Advances in CRISPR-based genetic engineering of Bifidobacterium
2026-Sep-12, Biochimie
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.biochi.2026.09.003
PMID:42731613
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综述 | 本文综述了基于CRISPR的基因工程在双歧杆菌中的应用进展，涵盖从传统同源重组到CRISPR/Cas技术的演变及其在临床前和食品生物技术中的应用 | 系统总结了CRISPR/Cas技术（包括内源和外源系统、CRISPRi/a和碱基编辑）在双歧杆菌基因工程中的应用，并提出了将CRISPR技术与合成生物学整合以开发下一代工程化双歧杆菌平台的展望 | 菌株特异性变异、限制-修饰屏障和生物安全等问题仍然存在 | 综述双歧杆菌基因工程中CRISPR技术的发展与应用，探讨工程化菌株作为靶向递送载体和功能性益生菌的潜力 | 双歧杆菌 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas、CRISPRi/a、碱基编辑、同源重组 | NA | 文本 | NA | CRISPR-Cas9 | 双歧杆菌 | NA | 医学, 食品 |
| 76 | 2026-09-19 |
Efficient scarless gene editing in Pichia pastoris via survival stress-based intramolecular homologous recombination
2026-Sep-16, Microbiological research
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.micres.2026.128736
PMID:42753619
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研究论文 | 开发了一种基于生存压力诱导的分子内同源重组的无痕基因编辑系统，用于毕赤酵母的高效基因敲除和整合 | 提出了一种不依赖外源重组酶或可编程核酸酶（如Cas9）的新型pop-in/pop-out编辑系统，通过双MazF反向筛选实现无缝编辑，避免了核酸酶引起的双链断裂和脱靶突变，同时避免了疤痕序列导致的基因组不稳定 | 系统的整体编辑效率本质上依赖于单交换重组介导的整合效率，可能受限于特定基因组位点的重组效率差异 | 克服当前基因组编辑方法中DNA切割导致的低效率和基因组不稳定问题，开发一种高效、无痕的毕赤酵母基因编辑工具 | 毕赤酵母（Pichia pastoris） | 合成生物学 | NA | 分子内同源重组、pop-in/pop-out基因编辑、MazF反向筛选 | NA | NA | NA | NA | 毕赤酵母 | 基于生存压力诱导的分子内同源重组编辑系统，包含双MazF反向筛选标记 | 工业生物技术、合成生物学 |
| 77 | 2026-09-19 |
De Novo Autogenic Engineered Living Functional Materials
2026-Sep, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.74312
PMID:42536049
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研究论文 | 本文通过蛋白质挖掘、计算建模和合成生物学，开发了一个多功能平台，用于从头设计自主发生的工程活材料（ELMs），实现了非模型细菌中类CsgA蛋白纳米纤维的生物合成，并展示了增强的机械性能和可编程功能 | 利用蛋白质挖掘和AlphaFold2分析33,564个类CsgA同源物，从非模型细菌中生物合成类CsgA ELMs，分子量提高9倍，β-折叠重复单元扩展，并展示了3D打印和选择性结合等可编程功能 | 摘要中未明确提及研究限制 | 开发一个从头设计自主发生功能性工程活材料的通用平台，以发现、设计和利用天然生物分子系统 | 类CsgA同源蛋白、大肠杆菌curli机制、非模型细菌、工程活材料 | 合成生物学 | NA | 蛋白质挖掘、AlphaFold2、分子动力学模拟、合成生物学 | AlphaFold2 | 蛋白质序列、结构数据 | 33,564个类CsgA同源物 | NA | 大肠杆菌、非模型细菌 | NA | 材料、医学 |
| 78 | 2026-09-18 |
Engineered living materials: integration of living and nonliving systems
2026-Sep-09, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2026.135788
PMID:42716398
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综述 | 该文章综述了工程化活体材料（ELMs）的设计、制造和应用进展，并讨论了其挑战与新兴策略 | 强调了底盘工程、智能基质、生物打印、原位生长等最新进展，以及多细胞联合体、遗传生物防护和AI引导逆向设计等新兴策略 | 机械稳健性与细胞活力之间的权衡、传质受限、长期功能不稳定、生物-非生物界面复杂性、生物安全风险和可扩展制造等关键挑战 | 概述ELM设计、制造和应用的最新进展，并探讨其转化潜力与新兴策略 | 工程化活体材料（ELMs），即整合活细胞与非活性基质的生物混合材料 | 合成生物学、材料科学 | NA | 生物打印、原位生长、合成生物学、人工智能引导逆向设计 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学、环境修复、生物制造 |
| 79 | 2026-09-16 |
Programmable crosslinking strategies for the rational design of engineered protein hydrogels
2026-Sep-08, Colloids and surfaces. B, Biointerfaces
DOI:10.1016/j.colsurfb.2026.116165
PMID:42735594
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综述 | 本文综述了工程化蛋白质水凝胶的设计原则、交联策略及其在组织工程和再生医学中的应用 | 系统总结了蛋白质结构模体、生物活性结构域和刺激响应元件在调控水凝胶组装与功能中的作用，并强调了物理与化学交联策略对网络结构、力学性能、降解行为和刺激响应性的影响，重点阐述了结构-性能-功能关系 | 作为综述文章，未提供原始实验数据，且未对现有交联策略的局限性进行深入批判性分析 | 总结工程化蛋白质水凝胶的设计原理，强调结构模体、生物活性结构域和刺激响应元件在调控水凝胶组装和功能中的作用，并综述物理和化学交联策略的最新进展 | 工程化蛋白质水凝胶 | 生物材料 | NA | 蛋白质工程、合成生物学、超分子化学、生物分子偶联 | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 医学、材料 |
| 80 | 2026-09-16 |
LLM-guided prediction of riboswitch-ligand binding affinity under data-limited conditions
2026-Sep-02, New biotechnology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.nbt.2026.08.008
PMID:42685970
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研究论文 | 本文提出一个神经符号框架，利用LLM嵌入编码核糖开关序列、二级结构和配体表示，并结合领域规则，在数据有限条件下预测核糖开关-配体结合亲和力 | 将LLM衍生嵌入与领域知识规则结合，构建神经符号框架，在标注数据有限的情况下实现核糖开关-配体结合亲和力的预测，并缓解亲和力系统性高估问题 | 摘要未明确说明具体局限性，但研究在数据有限条件下进行，可能受限于标注数据规模 | 在数据有限条件下准确预测核糖开关-配体结合亲和力，以支持核糖开关理性工程 | 核糖开关序列、二级结构及配体分子 | 机器学习 | NA | LLM嵌入、神经符号建模 | 神经符号框架、LLM | 序列、结构、分子表示 | NA | NA | NA | NA | 医学、工业生物技术 |