合成生物学相关文章

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当前共找到 172 篇文献,本页显示第 81 - 100 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 工程工具 宿主生物 回路设计 应用领域
81 2026-09-16
The multifaceted significance of phosphoinositides in endocytic trafficking
2026-Sep, FEBS letters IF:3.0Q3
综述 本文综述了磷酸肌醇在內吞运输中的多样化作用,包括内吞作用、内体分选、降解和循环,以及小窝蛋白介导的内吞等特殊机制 系统整合了磷酸肌醇在內吞运输各环节中的功能,并探讨了荧光生物传感器、超分辨率显微镜、光遗传学和合成生物学等新技术对阐明磷酸肌醇动态的推动作用 作为综述文章,未提供原始实验数据,且对磷酸肌醇时空调控、组织特异性代谢及其与其他脂质的协同效应等问题的探讨仍处于展望阶段 阐明磷酸肌醇作为脂质编码在內吞运输中的多重功能及其与人类疾病的关联,探索潜在治疗靶点 磷酸肌醇及其代谢相关激酶和磷酸酶 细胞生物学 癌症,神经退行性疾病 荧光生物传感器,超分辨率显微镜,光遗传学,合成生物学 NA 文本 NA NA NA NA 医学
82 2026-09-15
Engineering a genetic construct to express soluble proteins tethered to the cell membrane
2026-Sep-16, Bioscience reports IF:3.8Q2
研究论文 通过计算模拟与实验验证相结合,设计了一种可将可溶性蛋白锚定在细胞膜上的遗传构建体,并用绿色荧光蛋白验证了其成功锚定及纯化 开发了一种通用、模块化的遗传构建体,能够将可溶性蛋白锚定在细胞膜上,并证明了锚定后的蛋白可被整合到聚合物脂质纳米盘中并通过组氨酸标签纯化 目前仅使用绿色荧光蛋白作为模型蛋白进行了验证,尚未在其他目标蛋白中测试其通用性和功能影响 设计并验证一种能够将可溶性蛋白锚定在细胞膜上的遗传构建体,以填补该领域缺乏通用模块化工具的空白 可溶性蛋白(以绿色荧光蛋白为模型)及细胞膜 合成生物学 NA 计算模拟、实验验证、聚合物脂质纳米盘、组氨酸标签纯化 计算模拟 NA NA NA NA 将可溶性蛋白锚定在细胞膜上的遗传构建体 医学、工业生物技术
83 2026-09-15
GAPEK: A General Framework for Multiparameter Enzyme Kinetic Prediction with Adaptive Learning
2026-Sep-14, Journal of chemical information and modeling IF:5.6Q1
研究论文 该文章构建了大规模酶动力学数据集Kinetic-DB,并提出了GAPEK及GAPEK+框架,用于多参数酶动力学预测,通过自适应数据增强、双信息探索模块和自适应密度加权损失函数提升预测性能 1. 构建了大规模、格式统一的Kinetic-DB数据集;2. 提出自适应数据增强模块丰富酶和底物序列多样性;3. 设计双信息探索模块解耦模态特异性和跨模态信息;4. 引入自适应密度加权损失函数处理数据不平衡;5. 提出GAPEK+整合SERA函数重新配置学习目标,校准模型对极端值的敏感性 未在摘要中明确说明 解决酶动力学参数预测中数据集有限且不一致、多模态信息利用不充分、以及动力学参数分布不均匀导致极端值预测精度低等问题 酶-底物对及其动力学参数(转化数、米氏常数和抑制常数) 机器学习 NA NA 预训练模型(ESM-2、Mole-BERT)、深度学习 序列数据(酶序列和底物序列)、文本 Kinetic-DB大规模数据集,具体样本量未在摘要中说明 NA NA NA 医学, 工业生物技术
84 2026-09-14
Sulfated polysaccharides and their utilization mechanisms by microorganisms: A review
2026-Sep-10, International journal of biological macromolecules IF:7.7Q1
综述 本文综述了硫酸化多糖(SPS)的来源、结构、生物活性以及微生物对其的降解机制,重点探讨了肠道微生物(特别是拟杆菌门、乳酸菌和微球菌)降解SPS的策略和相关酶的作用 系统比较了不同微生物对硫酸化多糖的降解策略,并强调了微生物自身合成的SPS在其生存发展中的作用 摘要中未明确提及 总结硫酸化多糖的研究进展,探讨其微生物降解机制及应用潜力 硫酸化多糖(肝素、硫酸软骨素、岩藻多糖、磺达肝癸钠)及降解它们的微生物(拟杆菌门、乳酸菌、微球菌等) 合成生物学, 代谢工程 NA NA NA 文本 NA NA NA NA 医学, 合成生物学, 代谢工程, 医疗保健
85 2026-09-14
Engineering Bacillus Subtilis for Efficient Biosynthesis of Riboflavin: Current Knowledge and Future Perspectives
2026-Sep, Applied biochemistry and biotechnology IF:3.1Q2
综述 本综述全面总结了近年来通过代谢工程策略增强枯草芽孢杆菌核黄素生物合成的研究进展,并展望了未来发展方向 系统整合了合成生物学工具(如核糖开关工程、调控元件设计、高通量筛选)与多组学数据和机器学习驱动预测建模,提出了构建智能枯草芽孢杆菌细胞工厂的前瞻性框架 精确调控控制、多基因表达优化和基因组整合效率仍面临挑战;过量生产的代谢负担和缺乏可跨工业规模预测菌株性能的通用调控模型限制了实际应用 总结增强枯草芽孢杆菌核黄素生物合成的代谢工程策略,并探讨未来发展方向 枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)核黄素生物合成途径 合成生物学, 代谢工程 NA 代谢工程, 适应性实验室进化, 组学分析, 13C代谢通量分析, 核糖开关工程, 高通量筛选 机器学习预测模型 多组学数据 NA NA 枯草芽孢杆菌 核黄素生物合成途径, 核糖开关调控元件 医药, 食品, 工业生物技术
86 2026-09-13
Research progress on metabolic engineering for efficient squalene synthesis in yeast cell factories
2026-Sep-11, Biotechnology letters IF:2.0Q3
综述 本文综述了酵母细胞工厂中角鲨烯生物合成途径及代谢工程策略,重点介绍了多细胞器协同工程和证据来源区分。 系统总结了通过增强甲羟戊酸途径、调控竞争代谢途径、亚细胞区室化工程、优化辅因子平衡和产物外排策略等提高角鲨烯产量的方法,并强调了多细胞器协同工程的重要性,特别是解脂耶氏酵母和酿酒酵母中的细胞器工程。 本文为综述,未进行原始实验研究,可能受限于现有文献的覆盖范围和证据质量。 综述酵母中角鲨烯的生物合成途径和代谢工程策略,为未来提高角鲨烯产量和促进相关萜类化合物合成提供基础。 酵母细胞工厂,特别是解脂耶氏酵母和酿酒酵母。 合成生物学 NA NA NA 文本 NA NA 解脂耶氏酵母, 酿酒酵母 角鲨烯生物合成途径 食品, 医药, 疫苗佐剂
87 2026-09-13
Evolving conservation: The role of unconventional approaches to restore contemporary vertebrate populations and genomic biodiversity
2026-Sep-03, The Journal of heredity IF:3.0Q2
综述 本文探讨了非常规生物技术手段(如基因救援、合成生物学和基因编辑)在恢复当代脊椎动物种群和基因组生物多样性中的作用,并分析了其机遇、伦理争议与监管挑战 提出将生物技术与保护生物学和恢复生态学进行审慎、透明整合的观点,强调在生态学知识和利益相关者参与的基础上协调保护与恢复目标 生物技术整合面临生态不可预测性和公众对野生种群基因干预的抵制等伦理、生态和监管问题 审视生物技术在保护和恢复中的应用现状,探讨如何通过生物技术手段应对生物多样性丧失的挑战 脊椎动物种群、基因组生物多样性、濒危物种、入侵物种 保护生物学、恢复生态学 NA 基因救援、合成生物学、基因编辑 NA NA NA 基因编辑 NA NA 环境、农业
88 2026-09-13
From Circuits to Symphonies: A Systems-Engineering Blueprint for Multimicrobial Synthetic Biology
2026-Sep, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
综述 本文提出一个受交响乐启发的系统工程框架,用于多微生物合成生物学,将联合体设计组织为通信、时间调控、生态构建和预测建模四个协调层,并提供模块化工程蓝图以指导合成微生物群落的构建、稳定和优化 首次提出受交响乐启发的系统工程框架,将多微生物合成生物学从孤立遗传控制重新定位为协调系统设计问题;提出四个应用依赖的协调层(通信、时间调控、生态构建、预测建模)和模块化工程蓝图 框架是模块化而非规定性的,未提供具体实验验证;涉及代谢物运输、种群漂移、参数不确定性和过程规模实施等约束 为多微生物合成生物学提供一个结构化的系统工程基础,指导合成微生物群落在工业、环境和治疗应用中的开发 合成微生物联合体(多物种微生物群落) 合成生物学 NA NA NA 文本 NA NA NA 多微生物联合体协调层设计(通信、时间调控、生态构建、预测建模) 工业生物技术, 环境, 医学
89 2026-09-12
Biosynthesis and Biotransformation of Plant Triterpenoids: Current Advances and Future Perspectives
2026-Sep-11, Advances in biochemical engineering/biotechnology
综述 本文综述了植物三萜类化合物的生物合成与生物转化,重点介绍了合成生物学和人工智能在微生物细胞工厂生产三萜类化合物中的应用。 首次系统总结了人工智能在加速植物三萜类化合物途径解析、异源酶和微生物底盘工程化以及工艺优化中的应用前景。 未涉及具体实验数据,主要基于现有文献的归纳总结。 综述植物三萜类化合物的生物合成途径、关键酶家族、结构多样性和生物活性,并探讨提高微生物细胞工厂生产效率的策略及未来方向。 植物三萜类化合物(包括四环和五环三萜皂苷)及其微生物细胞工厂(尤其是酿酒酵母)。 合成生物学 癌症, 炎症性疾病, 肝脏疾病, 免疫性疾病 合成生物学, 代谢工程, 人工智能 NA 文本 NA NA 酿酒酵母 代谢途径(涉及OSCs、P450s、UGTs等酶) 医药, 食品
90 2026-09-12
Systematic mapping of insertion-tolerant regions enables capsid engineering of an infectious RNA phage
2026-Sep-09, mBio IF:5.1Q1
研究论文 该研究结合MuA转座酶介导的插入突变与反向遗传学系统,系统鉴定了RNA噬菌体MS2和PP7中耐插入区域(ITRs),并在此基础上实现了感染性RNA噬菌体的衣壳工程改造 首次系统绘制了RNA噬菌体MS2和PP7的耐插入区域图谱;首次在感染性RNA噬菌体中实现衣壳蛋白工程改造,成功在PP7衣壳蛋白中插入Arg-Gly-Asp基序并保持感染性 研究仅针对MS2和PP7两种RNA噬菌体,耐插入区域图谱可能不适用于其他RNA噬菌体;工程化噬菌体的稳定性与野生型相当,未显著提升;仅在模型中验证了清除效果,尚未进行体内实验验证 系统鉴定RNA噬菌体MS2和PP7基因组中的耐插入区域,并利用这些信息实现感染性RNA噬菌体的衣壳工程改造,为RNA噬菌体作为合成生物学平台奠定基础 RNA噬菌体MS2和PP7 合成生物学 NA MuA转座酶介导的插入突变、反向遗传学系统、cDNA克隆技术 NA 序列数据、结构数据 筛选了4555个MS2和2228个PP7随机插入克隆,分别鉴定出29个和26个非冗余耐插入区域 MuA转座酶 NA NA 医学、工业生物技术
91 2026-09-12
Engineering extracellular vesicles for targeted siRNA delivery: Advances, therapeutic applications, and clinical translation
2026-Sep-05, Nanomedicine : nanotechnology, biology, and medicine IF:4.7Q2
综述 本文综述了工程化细胞外囊泡用于靶向siRNA递送的研究进展、治疗应用及临床转化前景 系统整合了EV工程化策略(如电穿孔、超声、挤出、亲本细胞工程、微流控等货物装载方法及肽、抗体、适配体、杂合纳米平台等表面功能化修饰),并全面总结了工程化EV介导的siRNA递送在多种疾病中的治疗应用,同时探讨了合成生物学、基因组工程、人工智能和多功 能杂合囊泡等新兴技术的整合 在大规模制造、货物装载效率、标准化、质量控制、监管审批和临床转化方面仍面临挑战 探讨工程化细胞外囊泡作为靶向siRNA递送平台的生物学特性、工程化策略、治疗应用及临床转化前景 细胞外囊泡(EVs)、siRNA、RNA干扰机制及相关疾病模型 机器学习 肺癌 NA NA 文本 NA NA NA NA 医学
92 2026-09-12
Engineering post-transcriptional regulation via synthetic membraneless organelles
2026-Sep-03, Metabolic engineering IF:6.8Q1
研究论文 该研究通过工程化合成无膜细胞器,在大肠杆菌中实现了靶向mRNA的隔离和可编程的转录后调控 将合成无膜细胞器的应用从翻译后调控扩展到转录后调控,通过正交RNA结合蛋白-适配体相互作用实现靶向mRNA隔离,并展示了在细胞分裂拯救和母乳寡糖生产中的应用 研究仅在大肠杆菌中验证,未在其他宿主中测试,且未详细评估系统的脱靶效应和长期稳定性 扩展合成无膜细胞器的功能范围,使其能够进行RNA中心调控,实现可编程的转录后控制 大肠杆菌中的mRNA和合成无膜细胞器 合成生物学 NA 合成生物学、RNA结合蛋白-适配体相互作用 NA NA NA NA 大肠杆菌 合成无膜细胞器(凝聚体)作为模块化枢纽,整合翻译机制或隔离靶转录本 医学、工业生物技术
93 2026-09-12
Synthetic biology
2026-Sep, Nature biotechnology IF:33.1Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
94 2026-09-11
Harnessing Probiotic LAB and Bacteriocins for Clean-Label Food Processing and Biopreservation: Omics, Molecular Innovations and Industrial Applications
2026-Sep-09, Probiotics and antimicrobial proteins IF:4.4Q2
综述 本综述总结了利用益生乳酸菌及其细菌素抑制食品中持久性腐败微生物、生物膜形成病原菌和产芽孢菌的最新研究进展,涵盖分离鉴定、作用机制、组学解析及工业应用 系统整合了组学与分子方法在细菌素生物合成、基因调控及宿主-微生物互作解析中的应用,并探讨了细菌素与包埋、纳米生物技术等栅栏技术的协同作用,以及合成生物学和预测建模在拓展细菌素应用潜力中的前景 更广泛的转化仍受限于监管要求、生产与配方成本、在复杂食品基质中功效不稳定,以及许多候选细菌素缺乏实验室和模型食品系统之外的验证 探讨乳酸菌和细菌素在清洁标签食品加工与生物保鲜中的应用潜力,包括其抑菌机制、分子创新及工业化面临的挑战 乳酸菌(LAB)、细菌素、食品中持久性微生物腐败污染物、生物膜形成病原菌及产芽孢菌(如芽孢杆菌属、李斯特菌属、葡萄球菌属、梭菌属、大肠杆菌等) 食品科学与生物保鲜 食源性疾病 组学技术( genomics、转录组学等)、分子生物学方法、纳米生物技术、包埋技术 NA 文本 NA NA 乳酸菌 NA 食品, 医学
95 2026-09-11
Microbial Extracellular Polymeric Substance: A Pioneer in Ensuring Soil Health and Sustainable Development of Agriculture
2026-Sep-09, Journal of agricultural and food chemistry IF:5.7Q1
综述 本文综述了微生物胞外聚合物(EPS)在细胞保护、土壤改良和污染修复三个层面的作用机制及其在保障土壤健康和农业可持续发展中的应用前景。 从细胞保护、土壤改良和污染修复三个层次系统阐明EPS的作用机制,将EPS的功能从细胞保护拓展至环境修复,并提出合成生物学与材料科学推动未来绿色应用的方向。 成本降低和机制阐明仍是挑战。 阐明微生物胞外聚合物在土壤生态系统中的多重功能机制,并探讨其在保障土壤健康和农业可持续发展中的应用前景。 微生物胞外聚合物(EPS),由微生物分泌的多糖、蛋白质和核酸组成的复合物。 农业微生物学、环境生物技术 NA NA NA 文本 NA NA NA NA 农业, 环境
96 2026-09-11
A simplified and highly efficient cell-free protein synthesis system for prokaryotes
2026-Sep-08, eLife IF:6.4Q1
研究论文 本文优化了一种简化的高效大肠杆菌无细胞蛋白合成系统,将核心反应组分从35种减少到7种,并简化了细胞提取物制备流程 将无细胞蛋白合成系统的核心反应组分从35种精简至7种,同时开发了无需传统流加和透析步骤的快速裂解物制备方法,显著提高了系统的简便性和高效性 摘要中未明确提及该系统的具体局限性 开发一种简化且高效的原核生物无细胞蛋白合成系统,降低系统复杂度并提高可及性 大肠杆菌无细胞蛋白合成系统及其反应组分 合成生物学 NA 无细胞蛋白合成 NA NA NA NA 大肠杆菌 NA 医学, 工业生物技术
97 2026-09-11
Modular synthetic cross-kingdom promoters enable coordinated expression in Escherichia coli and Saccharomyces cerevisiae
2026-Sep-07, Nucleic acids research IF:16.6Q1
研究论文 该研究设计了一组模块化混合启动子,能够在Escherichia coli和Saccharomyces cerevisiae中实现可调控且定量一致的基因表达,并应用于prodeoxyviolacein生物合成途径 首次将细菌的-10/-35基序和Shine-Dalgarno序列与酵母的TATA盒和Kozak序列整合,构建出跨物种兼容的模块化混合启动子,实现跨界的可调控和定量一致表达 启动子组仅涵盖弱、中、强三个表达水平,未涉及更精细的梯度调控;仅验证了单一代谢途径,通用性有待更多途径和宿主验证 开发可跨物种使用的通用表达平台,解决不同物种间启动子结构和转录逻辑差异带来的瓶颈 大肠杆菌和酿酒酵母中的基因表达系统及prodeoxyviolacein生物合成途径 合成生物学 NA 合成生物学启动子工程 NA NA NA NA E. coli, S. cerevisiae 模块化混合启动子库,整合细菌-10/-35基序、Shine-Dalgarno序列与酵母TATA盒、Kozak序列 医学, 工业生物技术
98 2026-09-11
Application of emerging technologies in the antiviral field
2026-Sep-05, Antiviral research IF:4.5Q1
综述 该综述探讨了类器官模型、基因编辑、人工智能驱动的分子设计和合成生物学四项前沿技术在抗病毒研究中的应用与协同作用 系统性地将类器官、基因编辑、AI分子设计和合成生物学四大技术前沿整合为一个协同工作流程,涵盖疾病建模、靶点发现、分子设计、构建、测试和迭代优化的完整管线,推动抗病毒开发从传统经验方法向精准智能化策略转变 技术在整合和规模化方面仍面临挑战,高质量生物数据集不足,跨学科协作有待加强 探讨四项前沿技术在抗病毒研究中的贡献,为人类和动物健康的抗病毒策略智能化发展提供框架 病毒感染与抗病毒策略 机器学习 NA 类器官技术, CRISPR基因编辑, AlphaFold结构预测, 从头蛋白质设计, 合成生物学 AlphaFold NA NA CRISPR-Cas9 NA 设计-构建-测试-学习循环 医学, 农业
99 2026-09-10
Rewiring lactobacilli: challenges, opportunities, and the translational path to therapeutics
2026-Sep-08, Current opinion in microbiology IF:5.9Q1
综述 本文讨论了将乳杆菌工程化用于治疗应用的研究现状,重点关注处于临床评估阶段的候选菌株,并概述了关键的技术障碍及潜在解决方案。 系统性地聚焦于乳杆菌工程化的治疗应用,特别强调了临床评估中的候选菌株,并指出了实现其临床转化所需克服的技术挑战。 原文未提供明确局限性信息,但从讨论内容推断,可能包括乳杆菌工程化的遗传工具包有限、物种和菌株依赖性差异,以及工程菌株稳定性和安全性的不确定性。 探讨乳杆菌工程化用于治疗应用的现状、挑战与机遇,并提出加速其临床转化的潜在解决方案。 乳杆菌属的益生菌菌株,特别是正在进行临床评估的工程菌株。 合成生物学 NA 合成生物学 NA NA NA NA 乳杆菌 治疗性产物生产电路 医学
100 2026-09-10
Beyond the salt barrier: CRISPR-mediated DNA reprogramming to uncouple yield from tolerance in Rice: A review
2026-Sep-01, International journal of biological macromolecules IF:7.7Q1
综述 本文综述了通过CRISPR介导的DNA重编程,超越传统钠离子排斥策略,实现水稻耐盐性与产量解耦的多层级系统干预方法 提出五层级系统级干预策略,包括去除负调控因子、增强细胞骨架运输、导入盐生植物设计原理、调整ROS-光合作用轴以及多模块聚合,以解决耐盐性与产量之间的权衡问题 提出的五层级中,盐生植物来源的结构性状、细胞骨架增强和全多模块聚合尚未在水稻中得到验证,目标仍是设想而非实证结果 旨在开发持久且产量稳定的耐盐水稻品种,通过多模块聚合实现超过70%的产量稳定性,在8-10 dS m盐度条件下 水稻(Oryza sativa L.) 合成生物学 不适用 CRISPR/Cas9、标记辅助回交、快速育种、基因组选择 不适用 综述文献 不适用 CRISPR-Cas9 水稻 多模块聚合的“耐盐盾牌水稻”基因型设计 农业
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