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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-09-19 |
Discovery of D-peptides that allosterically enhance SARS-CoV-2 3CLpro activity by stabilizing its monomeric state
2026-10, Protein science : a publication of the Protein Society
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/pro.70788
PMID:42742342
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研究论文 | 该研究基于从头设计的D-肽抑制剂,改造出能够结合SARS-CoV-2 3CLpro单体并变构激活其催化功能的D-肽,其中LY11表现出高亲和力和强激活效力 | 首次发现D-肽可通过稳定3CLpro单体状态并变构重塑结构域间连接区来激活其催化功能,而非传统的抑制策略 | 摘要中未明确提及该研究的局限性 | 探究SARS-CoV-2 3CLpro单体如何从多聚蛋白上自剪切,以及开发靶向3CLpro单体状态的变构调节工具 | SARS-CoV-2 3CLpro(主蛋白酶)及其单体状态 | 机器学习 | 肺癌 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学, 工业生物技术 |
| 2 | 2026-09-19 |
Human cardiovascular organoids: Biomedical applications and ethical challenges
2026-Oct, American heart journal plus : cardiology research and practice
DOI:10.1016/j.ahjo.2026.100882
PMID:42751175
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综述 | 本综述系统总结了人心血管类器官的研究进展,涵盖三维心脏组织模型的构建、疾病建模、药物发现应用以及伦理与监管挑战 | 综合整合了心血管类器官的最新研究进展,涵盖单细胞与空间多组学、CRISPR基因编辑、合成生物学回路和人工智能驱动表型组学等前沿技术,并首次系统性地提出了该领域伦理框架的批判性视角 | 未涉及具体实验数据,批间变异性、血管化不足、代谢不成熟和免疫系统不完整等问题仍制约生理保真度,临床适用性仍在研究中 | 综合梳理当前心血管类器官研究现状,突出新兴生物医学应用,并提供推进该领域负责任发展所需的伦理框架批判性视角 | 人心血管类器官及工程化心脏平台 | 数字病理学, 机器学习 | 心血管疾病 | 人类多能干细胞技术, 三维组织工程, 微生理系统, 单细胞多组学, 空间多组学, CRISPR基因组编辑, 合成生物学回路, 人工智能表型组学 | NA | 文本 | NA | CRISPR-Cas9 | 人类多能干细胞 | 合成生物学回路 | 医学, 药物发现, 再生医学 |
| 3 | 2026-09-18 |
Bacterial Laccase: Recent Advances in Production, Engineering Strategies, and Diagnostic Applications
2026-Oct, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.70272
PMID:42312546
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综述 | 本文综述了细菌漆酶在近十年的生产、蛋白质工程策略及诊断应用方面的研究进展 | 整合了超过120篇同行评审论文,系统评估了细菌漆酶从实验室研究到环境监测、工业加工和医学诊断实际生物催化剂的转变 | 文章仅指出了剩余挑战和未来研究方向,未明确列出自身综述的局限性 | 综述细菌漆酶的生产技术、蛋白质工程策略和诊断应用的最新进展 | 细菌漆酶 | 合成生物学 | NA | 定向进化、理性设计、翻译后修饰、计算建模 | NA | 文本 | 超过120篇同行评审论文 | NA | 大肠杆菌, 枯草芽孢杆菌 | NA | 医学, 环境, 工业生物技术 |
| 4 | 2026-09-18 |
Challenges and Future Directives of Synthetic Biology in Engineering Plant-Microbe Partnerships for Sustainable Agriculture
2026-Oct, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.70291
PMID:42437522
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综述 | 本文综述了合成生物学在工程化植物-微生物伙伴关系中以促进可持续农业所面临的挑战及未来研究方向 | 系统性地整合了生态、生物、技术和监管四个维度的障碍,并提出了向系统级方法转变的路径,包括多组学分析、预测建模和框架响应型遗传设计 | 作为综述文章,未提供原始实验数据,对具体技术方案的可行性缺乏实证验证 | 审视限制合成生物学应用于工程化植物-微生物伙伴关系的挑战,并指出未来研究方向 | 植物-微生物伙伴关系、合成生物学工程化应用 | 合成生物学 | NA | 多组学分析、预测建模、遗传设计 | NA | 文本 | NA | NA | 植物, 微生物 | NA | 农业 |
| 5 | 2026-09-18 |
Highly Efficient Enzymatic Catalytic Transformation for the Synthesis of Rare Ginsenoside Compound K (CK) and Its Bioactivity Study
2026-Oct, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.70277
PMID:42478317
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研究论文 | 本研究通过合成生物学方法,在大肠杆菌中表达β-糖苷酶,高效催化人参皂苷Rb1转化为稀有皂苷CK,并初步研究了CK的抗衰老生物活性 | 实现了β-糖苷酶的高效重组表达(摇瓶2.1 g/L,5L发酵罐10.1 g/L),并证明粗酶液可在4小时内将95%的Rb1(10 g/L)转化为CK,同时首次系统评价了CK的抗氧化、促胶原合成和抗衰老活性 | 仅在体外细胞水平验证了CK的抗衰老活性,缺乏体内动物实验和临床验证;未对β-糖苷酶进行纯化和酶学性质深入研究 | 建立稀有皂苷CK的高效酶催化合成方法,并探究其抗衰老生物活性,为CK的规模化生物制造和抗皱化妆品应用提供依据 | 人参皂苷Rb1、稀有皂苷CK、重组β-糖苷酶、大肠杆菌BL21(DE3)工程菌 | 合成生物学 | NA | 重组蛋白表达、酶催化生物转化、体外细胞实验 | NA | NA | NA | NA | 大肠杆菌 | β-糖苷酶表达通路 | 医药、化妆品 |
| 6 | 2026-09-18 |
Application and progress of synthetic biology technology in amino acid production
2026-Oct, Bioprocess and biosystems engineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1007/s00449-026-03389-5
PMID:42663654
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综述 | 本文综述了合成生物学技术在氨基酸生产中的应用与进展,涵盖代谢途径设计、基因线路与动态调控、高通量筛选平台及多种氨基酸的生产策略 | 系统整合并批判性评述了合成生物学在氨基酸生物合成中的最新进展,包括代谢途径重构、遗传线路与动态调控技术、高通量筛选平台的建立,以及对天然氨基酸、支链氨基酸和非经典氨基酸生产策略的全面阐述 | 讨论了宿主细胞适应性进化和代谢通量平衡等主要瓶颈,但作为综述未提供新的实验数据 | 探讨新的研发策略以推进生物合成氨基酸的生产 | 氨基酸生物合成途径及生产菌株 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、代谢工程、基因线路、动态调控、高通量筛选 | NA | 文本 | NA | NA | NA | 遗传线路与动态调控技术 | 食品、饲料、医药、化妆品、工业生物技术 |
| 7 | 2026-09-12 |
The big kinship of proline: Counting saturated and unsaturated secondary amino acids of different ring size
2026-Oct, Biochimie
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.biochi.2026.06.010
PMID:42320729
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研究论文 | 本文提出了一种数学枚举方法,用于系统计数不同环大小的饱和与不饱和环状仲α-氨基酸和亚氨基酸,并给出了递推公式(修正的Lucas序列)及显式计数公式 | 首次针对所有可能的环状仲α-氨基酸和亚氨基酸,按环中原子数和饱和/不饱和类型进行系统数学枚举,推导出修正Lucas序列的递推公式及显式计数公式,为该类化合物的虚拟数据库构建和计算机辅助合成设计提供了数学基础 | 研究主要基于数学枚举和理论推导,缺乏实验验证;对已表征结构的综述可能不够全面;未涉及立体化学异构体的详细计数 | 建立环状仲α-氨基酸和亚氨基酸的数学枚举方法,统计不同环大小下饱和与不饱和化合物的数量,并为虚拟化合物数据库构建和化学合成计算辅助设计提供理论工具 | 环状仲α-氨基酸和亚氨基酸(包括脯氨酸及其非蛋白质源性同系物和衍生物) | 计算生物学 | NA | 数学枚举、递推公式推导、组合数学 | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 医学, 工业生物技术 |
| 8 | 2026-09-12 |
Bacterial surface layer - Properties, role, applications and challenges - A review of the next-generation nanotechnological tool
2026-Oct, Journal of microbiological methods
IF:1.7Q4
DOI:10.1016/j.mimet.2026.107648
PMID:42542137
|
综述 | 本文综述了细菌表面层(S层)蛋白的结构特性、自组装机制及其在纳米生物技术、疫苗开发、生物传感、药物递送和超滤等领域的应用,并讨论了商业化面临的挑战与解决方案 | 首次将S层生物学机制与工程化制造、蛋白质设计工作流程及商业化路线图进行整合,提供了先前综述未涵盖的可操作方案和基准 | 高纯度蛋白生产的可扩展性、重组表达的成本效益、严苛工业条件下的稳定性以及生物衍生纳米材料的监管路径尚未解决;合成替代品也带来实际和经济竞争 | 系统总结S层蛋白的特性、功能与应用,分析其从理论潜力向功能原型转化的工程化与商业化瓶颈,并展望其在医学、工业与环境领域的变革前景 | 细菌和古菌的表面层(S层)蛋白及其自组装形成的二维晶体阵列 | 纳米生物技术 | NA | NA | NA | 文本 | NA | NA | 细菌, 古菌 | NA | 医学, 工业生物技术, 环境 |
| 9 | 2026-09-11 |
Multi-Omics Analyses Reveal the Red and Far-Red Light Combination Enhancing Heterologous Protein and Metabolite Production in Nicotiana benthamiana
2026-Oct, Plant, cell & environment
DOI:10.1111/pce.15573
PMID:40269597
|
研究论文 | 该研究通过多组学分析揭示红光与远红光组合(LED-red)可通过抑制植物防御通路、促进农杆菌增殖,从而提高本氏烟草中异源蛋白和代谢物的瞬时报导表达效率 | 首次系统探究光质(尤其是红光与远红光组合)对农杆菌介导的本氏烟草瞬时表达效率的影响,并结合转录组、蛋白质组和代谢组多组学手段阐明其分子机制 | 研究仅在本氏烟草中验证,未在其他植物宿主中测试;光质影响机制的多组学关联仍需进一步功能验证;田间或规模化应用可行性尚未评估 | 探究不同光质对本氏烟草生长及农杆菌介导的瞬时表达效率的影响,并阐明其分子机制,以提升异源蛋白和代谢物的生产效率 | 本氏烟草(Nicotiana benthamiana)植株、农杆菌(Agrobacterium)、绿色荧光蛋白(GFP)、紫杉二烯(taxadiene) | 合成生物学、植物生物技术 | NA | 农杆菌介导的瞬时转化(agroinfiltration)、转录组测序、蛋白质组学、代谢组学 | NA | 转录组数据、蛋白质组数据、代谢组数据、荧光蛋白表达定量数据 | NA | 农杆菌介导的瞬时转化(agroinfiltration) | 本氏烟草(Nicotiana benthamiana) | NA | 医药、工业生物技术 |
| 10 | 2026-09-11 |
Mitochondria as programmable redox rheostats: Advancing from transplantation to bioengineered organelle therapeutics
2026-Oct, Redox biology
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.redox.2026.104338
PMID:42567043
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综述 | 本文综述了线粒体移植向线粒体工程转变的趋势,将线粒体视为可编程的治疗单元,并评估了表面功能化、遗传调控和先进递送平台等策略 | 提出了将线粒体从静态移植载荷转变为可编程氧化还原变阻器的概念,强调了合成生物学、纳米医学和生物材料的整合应用 | 线粒体移植面临靶向特异性差、递送动力学低和分离后功能衰退等转化障碍 | 探讨线粒体工程作为精准、可扩展临床治疗手段的发展方向和转化挑战 | 线粒体及其在缺血再灌注损伤、神经退行性疾病和代谢综合征等病理中的作用 | 合成生物学、纳米医学、生物材料 | 缺血再灌注损伤、神经退行性疾病、代谢综合征 | 线粒体移植、线粒体工程、表面功能化、遗传调控、纳米医学递送 | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 11 | 2026-09-11 |
Artificial metalloenzymes in whole-cell catalysis: Toward hybrid metabolic systems
2026-Oct, Current opinion in chemical biology
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.cbpa.2026.102751
PMID:42628383
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综述 | 本文综述了人工金属酶(ArMs)在全细胞催化中的最新进展,并探讨了将其整合到合成生物学和代谢工程中所面临的挑战与潜在策略 | 系统性地总结了全细胞ArMs催化领域的最新进展,并首次提出了从简单全细胞生物转化向含ArMs的代谢工程过渡时所面临的额外复杂性,同时讨论了实现ArMs与生物合成途径高效整合的潜在策略 | 全细胞ArMs催化仍处于基础研究阶段,将ArMs整合到混合代谢系统中的设想尚未在规模化层面实现 | 总结全细胞ArMs催化的最新进展,概述体内ArMs整合所面临的挑战,并探讨将ArMs有效整合到生物合成途径中的潜在策略 | 人工金属酶(ArMs)及全细胞催化系统 | 合成生物学 | NA | 全细胞催化, 人工金属酶, 代谢工程 | NA | 文本 | NA | NA | NA | 混合代谢系统 | 工业生物技术 |
| 12 | 2026-09-11 |
Recent discovery of new enzymes in plant natural product biosynthesis
2026-Oct, Current opinion in chemical biology
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.cbpa.2026.102752
PMID:42673660
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综述 | 本文综述了近年来在植物天然产物生物合成中新酶发现的主要进展,重点关注新催化机制、途径解析策略及进化关系 | 系统总结了催化挑战性化学转化的植物来源酶,包括氧化碳-碳键重排、非典型环加成、自由基介导的偶联反应及迭代骨架重塑等 | 作为综述文章,未提供原始实验数据或新酶的具体验证结果 | 总结植物天然产物生物合成中酶发现的最新进展,并探讨其对合成生物学和代谢工程的意义 | 植物天然产物生物合成途径中的新酶 | 合成生物学 | NA | 基因组学、代谢组学、蛋白质结构预测、异源途径重构 | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 医药,工业生物技术 |
| 13 | 2026-09-11 |
Design of programmable molecular interfaces for synthetic biology and therapeutic applications
2026-Oct, Current opinion in chemical biology
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.cbpa.2026.102759
PMID:42673661
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综述 | 本文综述了从头蛋白质设计在合成生物学和治疗应用中的进展,重点关注生成建模、序列设计和结构预测方法如何实现可编程分子界面的设计 | 系统总结了从头蛋白质设计的最新方法学进展,包括生成建模、序列设计和结构预测,并强调了这些方法在创建紧凑稳定的结合蛋白、可编程相互作用模块和高级组装体方面的能力,减少了对天然解决方案和大量实验筛选的依赖 | 在复杂环境中预测蛋白质行为以及平衡多个设计目标方面仍存在挑战 | 探讨从头蛋白质设计如何重塑合成生物学指定和控制分子功能的方式,并推动治疗应用的发展 | 从头设计的蛋白质、结合蛋白、相互作用模块和高级组装体 | 合成生物学 | NA | 生成建模、序列设计、结构预测 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学、工业生物技术 |
| 14 | 2026-09-10 |
Antibiotic factories on the move: Synthetic bacteria survive drinking water treatment and continuously produce antibiotics
2026-Oct-15, Water research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.watres.2026.126462
PMID:42435597
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研究论文 | 该研究发现合成抗生素高产菌株S. lividans LJ1018在饮用水处理系统中存活并持续产生抗生素,促进抗生素抗性细菌出现和传播,对供水安全构成新的风险。 | 首次探索合成抗生素高产细菌在自然水体及全饮用水供应系统中的命运,揭示其作为“移动抗生素工厂”能够穿透处理屏障并持续产抗生素,驱动抗性基因传播,重新定义合成生物学微生物的生物安全风险。 | 尚需实地验证环境条件模拟的准确性,并评估多种合成菌株在不同供水系统中的普遍性影响。 | 评估合成抗生素高产细菌在饮用水供应系统中的命运及其对水质安全的影响。 | 合成抗生素高产菌株S. lividans LJ1018及其在源水、处理过程和供水系统中的行为。 | 环境生物技术 | NA | 模拟饮用水处理流程、氯消毒、基因工程菌株构建 | NA | 实验数据 | 未明确样本数量,涉及模拟源水和饮用水处理过程及供水系统。 | 基因工程 | S. lividans LJ1018 | 合成抗生素生产菌株(高产Act-D的基因改造) | 环境生物技术, 工业生物技术 |
| 15 | 2026-09-10 |
Predicting transcriptional regulators in plants in the era of artificial intelligence
2026-Oct, Current opinion in plant biology
IF:8.3Q1
DOI:10.1016/j.pbi.2026.102955
PMID:42648065
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综述 | 本文综述了人工智能时代下预测植物转录调控因子的方法进展,涵盖了多组学整合、机器学习和深度学习等前沿技术。 | 本文整合了多组学与人工智能(包括机器学习和基础模型)的最新进展,提出其对植物转录调控关系预测的变革性作用,并探讨了在作物改良和合成生物学中的应用前景。 | 文中未提及具体实验验证或定量比较不同方法的性能,侧重于方法综述和未来展望。 | 综述并展望利用多组学和人工智能预测植物转录调控因子的现状与未来方向。 | 植物中的转录因子及其靶基因,以及它们所处的调控网络。 | 人工智能,机器学习 | NA | 多组学(包括转录组学、表观基因组学等)、机器学习、深度学习 | 机器学习模型、深度学习模型、基础模型(如预训练模型) | 高通量测序数据、多组学数据 | NA | NA | 植物 | NA | 农业,合成生物学 |
| 16 | 2026-09-10 |
Morphogenesis of multicellular glandular trichomes in plants
2026-Oct, Current opinion in plant biology
IF:8.3Q1
DOI:10.1016/j.pbi.2026.102952
PMID:42648064
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综述 | 本文综述了植物多细胞腺毛形态发生的最新研究进展,探讨了其调控机制和未来方向。 | 聚焦于多细胞腺毛形态发生的调控机制,并讨论了合成生物学在利用腺毛生产高价值化合物方面的潜力。 | 文献中提到了该领域面临的主要挑战,但具体局限性未明确说明。 | 阐明腺毛发育的调控机制,以改善植物抗逆性并利用合成生物学生产高价值化合物。 | 植物多细胞腺毛。 | 植物生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 | 植物 | 腺毛代谢途径 | 农业, 工业生物技术 |
| 17 | 2026-09-08 |
Integrative quantum and systems biology of cancer: From molecular fluctuations to ecological outcomes
2026-Oct, Bio Systems
DOI:10.1016/j.biosystems.2026.105923
PMID:42586472
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综述 | 本文以多尺度适应性系统视角审视癌症,评估整合量子与系统生物学框架的预测能力,并区分各尺度上已证实与推测的内容,同时探讨其相对于体细胞突变理论的附加价值。 | 提出癌症作为多尺度适应性系统的整合框架,在各尺度上明确区分证据与推测,并设计可证伪性检验,挑战了随机突变和均匀适应性策略的传统观点。 | 作为专家叙述性综合而非系统性综述,可能引入作者偏见,且其结论的普遍性受限于现有证据。 | 评估整合量子与系统生物学框架在癌症研究中的预测能力和附加价值,并明确其在不同尺度上的可检验预测。 | 癌症多尺度系统,包括分子、细胞、组织和生态尺度。 | 系统生物学 | 癌症 | NA | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 18 | 2026-09-07 |
Photoperiod-dependent regulation of secondary growth by auxin flux: how it occurs and how to benefit from it
2026-Oct, Biological reviews of the Cambridge Philosophical Society
DOI:10.1002/brv.70175
PMID:42046427
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综述 | 本文综述了光周期通过生长素通量调控树木次生生长的机制,并探讨了利用该机制增强树木生长和抗旱性的合成生物学策略 | 提出光周期通过生长素通量独立于顶端生长调节次生生长的假说,并探讨利用合成生物学工程光周期不敏感的生长素生物合成来优化树木性能的新策略 | 关于FT/TFL1样和CCA1/LHY样因子在光周期调控生长素通量中的作用尚不明确,且缺乏直接实验证据 | 阐明光周期调控次生生长的机制,并探索通过合成生物学方法提高树木在气候变化下的生长和抗旱性 | 温带林木(特别是杨树)的次生生长期(木质部分化阶段) | 植物生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 | 杨树 | 光周期不敏感的生长素生物合成通路 | 农业, 环境 |
| 19 | 2026-09-07 |
Protein modification: convergence of artificial intelligence, synthetic biology, and nano-assembly
2026-Oct-01, Food chemistry
IF:8.5Q1
DOI:10.1016/j.foodchem.2026.150606
PMID:42546624
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综述 | 本文批判性审视了生物合成蛋白质功能增强的最新进展,重点介绍人工智能、合成生物学和纳米组装交叉融合的策略 | 强调计算设计、人工智能引导的蛋白质工程和遗传密码扩展的整合,以及化学、酶和物理场辅助修饰技术与多组分自组装和纳米制造等宏观方法的协同效应 | 未具体说明局限性 | 探讨通过跨学科合成方法提升生物合成蛋白质功能,以实现可持续高性能蛋白质配料 | 生物合成蛋白质 | 合成生物学、人工智能、纳米技术 | NA | 人工智能引导的蛋白质工程、遗传密码扩展、化学修饰、酶修饰、物理场辅助修饰、纳米制造 | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 食品、生物技术 |
| 20 | 2026-09-05 |
Engineering therapeutic super-competitor cells for educative cancer treatment and ecological replacement
2026-Oct-10, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2026.218765
PMID:42508749
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综述 | 提出治疗性超级竞争者细胞(TSCs)作为一种可编程、进化感知的教育性癌症治疗框架,强调通过生态竞争而非直接杀伤来控制肿瘤 | 将癌症生态学、进化生物学和合成生物学结合,提出以生态竞争替代最大细胞毒性杀伤的TSC概念,定义可测量的生态替代终点和安全机制 | TSC框架仍处于假说阶段,尚未有临床验证,且依赖推测性工程应用,缺乏实际数据支持 | 探索一种进化感知的癌症治疗新范式,通过生态竞争实现教育性治疗和生态替代 | 肿瘤相关微环境中的癌细胞及工程化TSC | 合成生物学 | 癌症 | NA | NA | NA | NA | NA | 哺乳动物细胞 | 生态竞争回路,包括感知恶性生态信号、获取竞争适应性、限制癌细胞资源获取、清除或良性分化机制 | 医学 |