合成生物学相关文章

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当前共找到 162 篇文献,本页显示第 1 - 20 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 工程工具 宿主生物 回路设计 应用领域
1 2026-11-05
Characterization of a salt-responsive promoter from the moss Physcomitrium patens
2026-Oct-29, Plant physiology and biochemistry : PPB IF:6.1Q1
研究论文 该论文表征了小立碗藓(Physcomitrium patens)中一个盐响应启动子Pp3c20_8210,并分析了其顺式调控元件在盐诱导基因表达中的作用 鉴定了一个盐诱导型启动子Pp3c20_8210,并通过构建缩短的工程化版本和定点删除关键转录因子结合位点(Homeodomain、MYB、GATA、Dof),发现Homeodomain和GATA结合位点是启动子活性的主要驱动因素 在实验条件下删除MYB和Dof转录因子结合位点对启动子响应性无统计学显著影响,可能由于其他调控元件的补偿机制;未在植物体内进行更长期或田间验证 表征小立碗藓中渗透和盐胁迫响应启动子,鉴定盐诱导型启动子并解析其顺式调控元件,为植物合成基因调控提供工具 小立碗藓(Physcomitrium patens)的天然启动子Pp3c20_8210及其工程化缩短版本 合成生物学 NA 启动子表征、定点缺失突变、荧光报告基因(Venus)表达监测 NA 荧光表达数据 NA 定点缺失突变 小立碗藓(Physcomitrium patens) 盐响应启动子及其工程化变体 农业, 合成生物学
2 2026-11-05
Tutorial: biomembranes in hybrid living bioelectronics
2026-Oct, Nature protocols IF:13.1Q1
综述 本文是一篇教程综述,探讨了基于聚合物半导体和微纳加工方法将生物膜模型与芯片器件集成,形成混合活体生物电子界面,并讨论其在药物发现、诊断和神经形态计算中的应用 系统整合材料科学、纳米技术和合成生物学技术,通过结构功能化、化学或生物表面修饰增强细胞粘附和细胞与工程表面的相互作用,利用聚合物半导体和微纳加工方法将生物相关细胞膜模型与芯片器件集成,提升细胞-器件耦合 现有技术依赖简化的合成模型,缺乏生物复杂性 研究生物膜与电子器件的集成界面,增强细胞-器件耦合,并用于研究膜水平相互作用 生物相关细胞膜模型、聚合物半导体、芯片器件 生物电子学 NA 电阻抗测量、微纳加工、表面功能化修饰 NA NA NA NA NA NA 医学
3 2026-11-04
Engineering Methylobacterium as a C1 biomanufacturing platform: Metabolic architecture, regulatory networks, and synthetic biology strategies
2026-Oct-29, Biotechnology advances IF:12.1Q1
综述 本文系统综述了甲基杆菌作为C1生物制造平台的代谢架构、调控网络及合成生物学策略,涵盖甲醇氧化、甲醛缓冲、丝氨酸循环与EMC途径的耦合,以及高值化学品生产和菌株工程优化 提出了产物-底盘匹配框架,系统评估甲基杆菌底盘优劣及工程瓶颈,并整合全球转录调控、代谢阀门控制和光-甲基营养配置等先进工程策略 当前在滴度、产率和规模化方面仍存在局限,调控控制、通量协调和鲁棒性增强等方面有待突破 总结甲基杆菌从甲基营养模式生物向可编程C1合成生物学底盘转变的研究进展,并展望未来发展方向 甲基杆菌属(Methylobacterium)及其代谢网络与调控系统 合成生物学 NA NA NA 文本 NA NA 甲基杆菌 NA 医学, 农业, 工业生物技术, 食品, 材料
4 2026-11-04
Organoids and organs-on-a-chip as new approach methodologies at the convergence of cell biology and bioengineering
2026-Oct-28, Cell stem cell IF:19.8Q1
综述 该文综述了类器官和器官芯片等新方法学在细胞生物学与生物工程学交叉领域的发展,探讨其在转化医学中的应用、挑战与前景 强调细胞生物学家与生物工程师之间的跨学科对话,提出将合成生物学、多组学、机器学习和基因工程融合,使NAMs成为加速治疗发现和规模化个性化医疗的基础平台 仍存在可重复性、验证和监管接受度方面的差距与挑战 综合类器官、器官芯片及其他生物工程技术在转化医学中的进展,识别剩余差距并展望新兴机遇 类器官、器官芯片及其他生物工程化人类组织模型 细胞生物学, 生物工程学, 转化医学 NA 类器官培养, 器官芯片, 合成生物学, 多组学, 机器学习, 基因工程 NA NA NA NA 人类细胞 NA 医学, 药物开发
5 2026-11-03
Strain engineering of Aspergillus species for industrial enzymes bioproduction: a comprehensive review
2026-Oct-30, Advanced biotechnology
综述 本文全面综述了曲霉属菌株工程用于工业酶生物生产的经典与现代技术及其规模化应用 系统整合了从经典诱变到CRISPR基因编辑、合成生物学和系统代谢工程的全谱系菌株改良方法,并强调了ARTP诱变等非转基因进化工具与微滴超高通量筛选结合的最新进展 文章为综述性总结,未提供原始实验数据;对丝状生长相关挑战的解决方案讨论可能不够深入 总结曲霉属菌株改良方法的最新进展,以推动工业酶生产和未来生物制造发展 曲霉属真菌(如米曲霉及相关物种) 工业生物技术 NA 经典诱变、原生质体融合、基因组重排、适应性实验室进化、CRISPR基因编辑、合成生物学、系统代谢工程、ARTP诱变、微滴超高通量筛选 NA 文本 NA CRISPR-Cas9 曲霉属真菌(米曲霉等) NA 工业生物技术,食品,医药
6 2026-11-02
Arbitrium crosstalk enables shared signaling among phages
2026-Oct-31, Cell reports IF:7.5Q1
综述 本文综合论述了噬菌体arbitrium信号系统的分子基础、肽-受体特异性的结构决定因素,以及噬菌体间通讯的生态与进化后果 系统整合了非 cognate arbitrium 肽与异源受体相互作用的最新证据,提出 arbitrium 串扰可介导噬菌体间的竞争与合作,并拓展了病毒通讯超越谱系特异性的概念 arbitrium 串扰的生态意义和实际应用尚未确立,现有证据仍有限 总结 arbitrium 信号的分子机制与结构基础,探讨噬菌体间通讯的生态、进化影响及工程应用潜力 温和噬菌体及其 arbitrium 肽信号系统和受体 合成生物学 NA NA NA 文本 NA NA NA arbitrium 肽通讯系统(溶原-裂解决策信号通路) 医学, 工业生物技术
7 2026-11-02
Engineering an Enzymatically Active Granular Matrix for On-Chip Modeling of Bone-Like Mineralization
2026-Oct-31, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
研究论文 该研究通过将碱性磷酸酶共价偶联到PEG微凝胶上,构建了酶活性颗粒基质,用于在微流控芯片上模拟骨样矿化过程。 从自下而上的合成生物学角度出发,设计了一种酶活性的颗粒基质,能够在可灌注的3D微环境中独立控制酶负载和底物递送,实现空间定位的矿化,且不依赖细胞。 系统仅模拟了早期骨矿化的关键特征,形成的是缺钙、结晶度差的磷灰石样相,且未包含细胞介导的基质重塑和旁分泌信号等生物学复杂性。 在微流控芯片上实现空间可控的三维矿化,并研究碱性磷酸酶驱动的矿化机制。 酶活性的PEG微凝胶基质及矿化过程。 合成生物学, 组织工程, 微流控 骨相关疾病 硫醇-烯光化学偶联, 微流控制造 颗粒基质模型 实验数据, 图像 NA 硫醇-烯光化学 NA 酶偶联的颗粒基质组装成可灌注的3D支架 医学, 生物医学工程
8 2026-11-02
A dual-targeting lipid nanoparticle delivery system for precision phage therapy against multidrug-resistant Gram-negative bacteria
2026-Oct-30, Science advances IF:11.7Q1
研究论文 该研究开发了一种双靶向脂质纳米颗粒-嵌合噬菌体递送系统(AbLCP),用于精准治疗多重耐药革兰阴性菌感染 将展示抗脂多糖抗体的基因修饰M13噬菌体与多粘菌素B偶联,并封装在抗LPS抗体功能化的脂质纳米颗粒中,实现了双靶向、高效细胞内化和内体逃逸,克服了传统噬菌体疗法的根本局限 摘要未明确说明该系统的长期安全性、免疫原性以及大规模生产的可行性 开发一种新型纳米噬菌体平台,结合合成生物学与纳米医学,以对抗多重耐药革兰阴性菌感染 多重耐药革兰阴性菌、M13噬菌体、脂质纳米颗粒、小鼠感染模型 纳米医学、合成生物学、抗菌治疗 多重耐药细菌感染 噬菌体展示、抗体偶联、脂质纳米颗粒封装、多粘菌素B偶联 小鼠感染模型 实验数据 NA 基因修饰M13噬菌体、抗体功能化脂质纳米颗粒 M13噬菌体、小鼠 NA 医学
9 2026-11-02
From ecosystem engineering to living computers: integrating dual-paradigm bacterial therapeutics for solid tumor microenvironment reprogramming
2026-Oct-23, International journal of pharmaceutics IF:5.3Q1
综述 本文综述了工程化细菌疗法与生态系统编辑相结合的双范式框架,用于实体瘤微环境重编程 提出双范式框架,整合工程化细菌疗法与肿瘤相关微生物生态系统编辑,并讨论二者在生态位形成、细菌定植、免疫代谢重塑及微生物-宿主反馈中的机制相互作用 缺乏前瞻性临床验证,临床经验因菌株、减毒方式、给药途径、肿瘤生物学、治疗背景和患者特征差异而异 构建结构化框架,探索细菌疗法作为精准肿瘤学组成部分的潜力 实体瘤微环境、肿瘤相关微生物群落、工程化细菌 合成生物学、肿瘤微生物学、精准肿瘤学 实体瘤 NA NA 文本 NA NA 细菌 环境传感器、遗传逻辑电路、治疗性载荷 医学
10 2026-11-01
ΔNAzyme: A Foundational QM/MM Δ-Machine Learning Potential for Nucleic Acid Enzyme Catalysis
2026-Oct-27, Journal of chemical theory and computation IF:5.7Q1
研究论文 本文开发了ΔNAzyme,一种用于核酸酶催化的基础QM/MM Δ-机器学习势,通过训练集和模型架构实现高精度预测 构建了覆盖多种核酸酶类的QM/MM训练集,并采用MACE架构实现可迁移的ΔMLP,能够以DFTB3成本获得PBE0质量结果 摘要中未明确提及局限性 开发高效准确的机器学习势以用于核酸酶的计算设计和高通量工作流 核酸酶,包括核酶、DNA酶和XNA酶 计算生物化学, 机器学习 NA QM/MM模拟, 机器学习势 Deep Potential, MACE 模拟数据(能量和力) 摘要中未明确说明样本数量 NA NA NA 生物技术, 合成生物学, 医学
11 2026-11-01
Small genomes, big lessons: What viruses teach us about structure-based riboregulation
2026-Oct-26, Molecular cell IF:14.5Q1
综述 综述探讨RNA病毒如何利用RNA结构实现基因调控,并与真核生物转录组中的结构介导调控进行类比 将RNA病毒作为研究核糖调控基本构件的模型系统,系统性地把病毒RNA结构调控与真核转录组结构介导的基因控制联系起来 作为综述文章,未提供新的实验数据,对RNA结构调控机制的功能和机制理解仍处于早期阶段 总结不同病毒家族中基于RNA结构的调控机制,并阐明RNA结构作为基因表达核心调控层的普遍原理 RNA病毒基因组及真核生物转录组中的结构化RNA元件 RNA生物学 病毒感染性疾病 NA NA 文本 NA NA NA NA 医学, 合成生物学
12 2026-11-01
Establishment of a genome editing system and expression of heterologous proteins in the nonconventional yeast Pichia kudriavzevii
2026-Oct, mLife IF:4.5Q1
研究论文 该文章建立了非传统酵母Pichia kudriavzevii的高效CRISPR/Cas9基因组编辑系统,并实现了异源蛋白的表达 在二倍体非传统酵母Pichia kudriavzevii中建立了高效的CRISPR/Cas9基因组编辑系统,编辑效率高达88%,可实现无标记编辑和常规生成纯合突变体,并结合位点感知表达策略成功表达分泌型mCherry和人IgG1 Fc片段 摘要中未明确提及研究限制 建立非传统酵母Pichia kudriavzevii的合成生物学框架,使其成为可编程的生产宿主 非传统酵母Pichia kudriavzevii 合成生物学 NA CRISPR/Cas9基因组编辑 NA NA NA CRISPR-Cas9 Pichia kudriavzevii NA 工业生物技术, 医药
13 2026-10-31
Yeast-Based Platforms for Next-Generation Human Health Applications
2026-Oct-30, FEMS yeast research IF:2.4Q3
综述 系统综述了酵母平台在人类健康应用中的转化演进,涵盖合成生物学工具包、糖基工程、人工智能辅助设计以及疫苗、治疗酶和活体生物治疗产品等临床应用 将传统及非常规酵母重新定义为可扩展的生物制造工厂和先进的活体治疗产品,并强调人工智能驱动的基因表达预测和菌株设计等数据驱动范式 作为综述文章,未提供原始实验数据,且对具体技术细节和临床转化中的挑战讨论有限 探讨酵母平台在下一代人类健康应用中的转化演进和未来方向 酿酒酵母、Komagataella phaffii、布拉氏酵母、解脂耶氏酵母等传统及非常规酵母 合成生物学 NA CRISPR介导的多重编辑、模块化克隆框架、高通量分泌筛选、糖基工程、人工智能预测 NA 文本 NA CRISPR-Cas9 酿酒酵母, Komagataella phaffii, 布拉氏酵母, 解脂耶氏酵母 NA 医学, 工业生物技术
14 2026-10-31
Natural and engineered bacteriophages against multidrug-resistant ESKAPE pathogens: current landscape and clinical translation
2026-Oct-29, Future microbiology IF:2.5Q3
综述 本文综述了天然和工程化噬菌体对抗多重耐药ESKAPE病原体的研究进展、工程改造策略及临床转化面临的挑战 系统总结了尾纤维修饰、解聚酶和内溶素增强、CRISPR基因组编辑及计算设计噬菌体鸡尾酒等合成生物学改造策略,并批判性分析了临床转化的科学和监管障碍 缺乏临床试验数据,监管框架不明确,缺少GMP级生产,药代动力学变异大 探讨工程化噬菌体对抗ESKAPE病原体的改造方法,识别限制临床应用的障碍,并概述广泛采用所需的关键步骤 多重耐药ESKAPE病原体及针对其的天然和工程化噬菌体 合成生物学、医学微生物学 医院获得性感染 CRISPR基因组编辑、尾纤维修饰、解聚酶工程、内溶素增强、计算设计 NA 文本 NA CRISPR-Cas 噬菌体、细菌 噬菌体鸡尾酒、工程化噬菌体 医学
15 2026-10-31
Bacterial R-bodies with common morphologies and unrolling dynamics are phylogenetically scattered, indicating extensive lateral gene transfer and wide application potential
2026-10-21, Applied and environmental microbiology IF:3.9Q2
研究论文 该文研究了来自六种假单胞菌门的R体,比较其形态、遗传数据和展开动力学,发现R体在系统发育上分散且存在广泛横向基因转移,并首次将其分为快速爆发和慢速两类 首次基于高帧率光镜视频记录将R体分为快速爆发和慢速酸性诱导伸展两类动力学,并提出该标准可能最适合选择生物技术应用的R体工具 文章未明确说明每种R体的具体样品数量,且仅研究了六种假单胞菌门的R体,横向基因转移使得基于遗传数据的统一框架受到干扰 整合R体的遗传学、形态学和展开动力学,为建立R体生物技术工具箱提供依据 来自六种假单胞菌门的R体,包括系统发育多样的内共生菌和非内共生菌 合成生物学 NA 电子显微镜、高帧率光镜视频记录 NA 图像、视频、遗传数据 六种假单胞菌门的R体 NA 假单胞菌门细菌 NA 医学、工业生物技术
16 2026-10-31
Elucidating the effect of spatial localization on metabolic systems
2026-Oct-07, Journal of the Royal Society, Interface
研究论文 该研究结合自下而上的基本构建块研究和自上而下的具体案例研究,探讨空间定位/区室化对代谢系统的影响 揭示了空间定位对代谢基序的结构不变量和多种非直观效应,引入并分析了空间控制系数,发现了定位在代谢网络工程中的多种权衡 未明确提及具体局限性 理解空间组织对细胞内生物分子网络的影响,特别是代谢系统中空间定位/区室化的效应 代谢系统及代谢网络 系统生物学 NA 系统生物学建模、空间成像、数据处理 NA NA NA NA NA NA 医学, 工业生物技术
17 2026-10-31
Multi-omics dissection of transcriptional and post-transcriptional responses in cyanobacterial high-light adaptation
2026-Oct-06, Plant physiology IF:6.5Q1
研究论文 该研究通过整合转录组和蛋白质组分析,揭示了蓝细菌耐高光菌株中少量点突变介导高光耐受性的协调网络机制 结合多组学手段系统解析了NdhF1F124L和EF-G2R461C两个关键点突变如何通过协调转录和转录后调控网络赋予蓝细菌高光耐受性,并发现磷酸盐代谢调控在高光适应中的重要作用 未在摘要中明确说明研究局限性 阐明少量点突变介导蓝细菌高光耐受性的分子机制,为合成生物学底盘开发提供理论基础 蓝细菌Synechocystis sp. PCC 6803的实验室型菌株和高光耐受型菌株 合成生物学、微生物学 NA 转录组学、蛋白质组学、多组学整合分析 NA 转录组数据、蛋白质组数据 NA NA Synechocystis sp. PCC 6803 NA 合成生物学、工业生物技术
18 2026-10-31
Biomedical applications of antimicrobial peptides: Multifunctional mechanisms, engineering strategies, and therapeutic development
2026-Oct-03, International journal of antimicrobial agents IF:4.9Q1
综述 本文综述了抗菌肽的来源、结构特征、主要抗菌机制、细菌耐药机制、设计优化策略及其在生物医学领域的应用前景与挑战 系统整合了抗菌肽的多功能机制、工程化设计策略(自组装纳米结构、联合疗法、靶向修饰)以及人工智能驱动设计、纳米技术和合成生物学等前沿发展方向 抗菌肽的临床应用仍面临稳定性有限、潜在毒性和制造成本高等障碍 全面概述抗菌肽的多功能机制、工程策略和治疗开发,为未来抗感染治疗提供参考 抗菌肽(AMPs) 生物医学 感染性疾病 NA NA 文本 NA NA NA NA 医学, 材料
19 2026-10-31
Endophytes for climate-resilient agriculture: Mechanisms and systems-level insights
2026-Oct, Plant physiology and biochemistry : PPB IF:6.1Q1
综述 系统综述内生菌通过多种机制增强作物气候适应性的研究进展,并强调多组学和系统级方法的应用 从系统级视角整合多组学、微生物组工程、合成生物学和精准农业,提出开发稳健内生菌技术和微生物联合体的路径 田间表现不稳定、环境适应性有限、制剂和递送困难、宿主微生物兼容性问题、生态互作复杂、生物安全及监管要求等制约农业转化 综述内生菌在气候韧性农业中的作用机制,并探讨其农业应用的限制与系统级解决方案 植物内生细菌和真菌及其与作物的互作关系 农业微生物组学 NA 多组学、微生物组工程、合成生物学、精准农业 NA 文献 NA NA 植物 NA 农业、环境
20 2026-10-30
Artificial Cells and Biomimetic Cells: Intelligent Systems Driving a Paradigm Shift in Drug Discovery and Delivery
2026-Oct-28, Advanced healthcare materials IF:10.0Q1
综述 本文综述了人工细胞和仿生细胞作为连接基础生物学发现与临床转化的框架,涵盖五条关键技术路径,用于药物发现和递送 提出将人工细胞与仿生细胞作为统一框架连接基础发现与临床转化,系统梳理五条技术路径,并强调闭环学习、可解释模型与先进生物制造在其中的作用 在可规模化制造、长期稳定性以及监管适应性方面仍存在挑战 评估人工细胞和仿生细胞在药物发现与递送范式转变中的作用 人工细胞、仿生细胞、无膜细胞器系统、多区室人工细胞、原细胞通信网络、虚拟细胞 合成生物学, 材料科学, 人工智能 NA 合成生物学, 材料科学, 人工智能 虚拟细胞, 可解释模型, 闭环学习 NA NA NA NA 逻辑门控细胞间通讯, 微环境触发释放, 原细胞通讯网络 医学, 制药
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