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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2026-10-19 |
Smart carrier-engineered microbial consortia for precision nutrient delivery in next- generation biofertilizers
2026-Oct-17, Folia microbiologica
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s12223-026-01613-z
PMID:42891916
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综述 | 本文综述了工程化微生物联合体与智能载体系统在下一代生物肥料中的最新进展,重点讨论封装技术和控释系统以提高养分利用效率 | 将合成生物学工程化的微生物联合体与先进智能载体技术(如生物聚合物水凝胶、纳米材料、响应性封装基质)相结合,实现微生物的保护、控释和土壤持久性 | 传统微生物接种剂田间表现不稳定,微生物在田间条件下存活率有限,环境因素影响大,养分释放控制不佳 | 探讨工程化微生物联合体、先进封装技术和控释系统在提高下一代生物肥料养分利用效率方面的应用 | 工程化微生物联合体、智能载体系统、生物肥料 | 合成生物学, 农业生物技术 | NA | 合成生物学, 微生物工程, 生物材料, 封装技术(喷雾干燥、离子凝胶化、挤出、微流控封装) | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 农业 |
| 82 | 2026-10-18 |
Targeted immune modulation through smart biomaterials and programmable biopharmaceuticals: A review
2026-Oct-16, Journal of biomaterials applications
IF:2.3Q4
DOI:10.1177/08853282261483961
PMID:42886884
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综述 | 本文综述了通过智能生物材料和可编程生物制药实现靶向免疫调节的最新进展,包括混合生物材料-生物制剂系统 | 系统总结了能响应疾病微环境信号(如pH变化、缺氧、氧化应激和炎症酶)的智能生物材料,以及通过工程化生物机制指导免疫细胞行为和分子信号的可编程生物制药,并强调了混合平台将环境响应性与生物治疗效力相结合的优势 | 存在生物复杂性、制造可扩展性、长期安全性评估和监管转化等挑战 | 探讨通过智能生物材料、可编程生物制药及混合系统实现靶向免疫调节,推动从传统全身免疫调节向自适应和位点特异性免疫控制转变 | 免疫介导疾病相关的免疫调节疗法、智能生物材料、可编程生物制药及混合生物材料-生物制剂系统 | 免疫工程 | 免疫介导疾病 | NA | NA | 文本 | 2022年至2026年间发表的同行评议研究 | NA | NA | NA | 医学 |
| 83 | 2026-10-18 |
Intratumoral microbiota in cancer immunotherapy: metabolic-epigenetic crosstalk and engineered bacterial therapeutics
2026-Oct-16, Experimental hematology & oncology
IF:9.4Q1
DOI:10.1186/s40164-026-00840-x
PMID:42888465
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综述 | 文章综述了肿瘤内微生物群通过代谢-表观遗传互作影响免疫治疗疗效的机制,以及工程化细菌作为可编程活体疗法在癌症免疫治疗中的应用 | 系统整合了肿瘤内微生物群代谢产物(短链脂肪酸、次级胆汁酸、氧化三甲胺、色氨酸衍生物)通过DNA甲基化、组蛋白修饰和非编码RNA重塑宿主表观遗传并调控抗肿瘤免疫的机制;同时总结了合成生物学工程菌实现肿瘤特异性定植、可控药物释放及多模式功能(细胞因子分泌、免疫检查点阻断、STING通路激活、代谢重编程)的治疗策略 | 存在异质性、抗载体免疫和制造复杂性等临床转化挑战 | 阐明肿瘤内微生物群在癌症免疫治疗中的代谢-表观遗传串扰机制,并探讨靶向肿瘤内微生物群的工程化细菌治疗策略 | 肿瘤内微生物群、微生物代谢产物、宿主免疫微环境、表观遗传景观、工程化细菌 | 肿瘤免疫学, 微生物组学, 合成生物学 | 癌症 | NA | NA | 文本 | NA | NA | 工程化细菌 | 工程化细菌活体治疗系统(肿瘤特异性定植、可控药物释放、细胞因子分泌、免疫检查点阻断、STING通路激活、代谢重编程) | 医学 |
| 84 | 2026-10-18 |
The Potential of Self-Maintainable Living Materials
2026-Oct-14, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.78082
PMID:42873924
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综述 | 本文综述了工程活体材料(ELMs)的设计原理、当前挑战及转化路径,探讨其作为自维持自主系统的潜力 | 将自主性定位为下一代活体材料的定义性能力,系统整合合成生物学中的可编程基因电路、群体感应通信和代谢工程,实现闭环决策与最小外部输入下的功能维持 | 在进化稳定性、生物防护、长期存活性和可规模化制造方面仍存在关键挑战 | 考察自维持自主活体材料的设计原理、当前挑战和转化路径,以实现其在真实环境中的持续运行 | 工程活体材料(ELMs),包括整合了微生物、真菌、藻类和哺乳动物细胞的結構支架系统 | 合成生物学 | NA | 可编程基因电路,群体感应通信,代谢工程 | NA | NA | NA | NA | 微生物,真菌,藻类,哺乳动物细胞 | 可编程基因电路,群体感应通信,闭环决策系统 | 建筑,农业,环境修复,生物能源,生物医学 |
| 85 | 2026-10-18 |
Synthetic Approaches as Empirical Tools for Testing Evolutionary Theory
2026-Oct-01, Genome biology and evolution
IF:3.2Q2
DOI:10.1093/gbe/evag245
PMID:42817818
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综述 | 综述合成方法(如深度突变扫描、祖先序列重建、受控进化和合成生物学)如何作为实证工具检验进化理论的基本问题 | 系统梳理高通量图谱、重建实验、受控进化和合成生物学等方法在检验突变效应分布、适应度地形、可进化性、发育约束、历史偶然性等进化理论问题中的新发现 | 作为综述,未提供原始实验数据,且合成方法在模拟自然进化复杂性方面仍存在局限 | 探讨合成方法如何重塑和扩展进化生物学的基础理论问题 | 进化理论中的核心问题,包括突变效应分布、适应度地形结构、可进化性、发育约束、历史偶然性和进化系统工程 | 进化生物学 | NA | 深度突变扫描、祖先序列重建、受控进化、合成生物学 | NA | 序列、表型 | NA | NA | NA | NA | 基础研究 |
| 86 | 2026-10-17 |
DNA Nanotechnology-Based Robotic Devices for Frontier Applications in Healthcare
2026-Oct-16, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.76227
PMID:42885354
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综述 | 本文综述了基于DNA纳米技术的机器人设备(DNRDs)在医疗保健领域的发展、设计原理、机制基础及前沿应用 | 系统总结了DNA折纸、DNA步行器和分子逻辑电路驱动的动态刺激响应系统,涵盖逻辑门控纳米药丸、精准生物传感器和自主治疗剂等新兴应用,并提出了提升安全性、稳健性和临床可转化性的新兴策略 | 在复杂生理环境中的结构稳定性难以维持,可扩展且低成本的制造困难,以及免疫原性、毒性、脱靶活性、意外激活、生物分布和长期生物命运等监管与安全问题限制临床转化 | 全面讨论DNRDs的演化、设计原则和机制基础,评估其在诊断、治疗和合成生物学中的作用,并探讨转化局限与未来发展方向 | 基于DNA纳米技术的机器人设备(DNRDs),包括DNA折纸、DNA步行器和分子逻辑电路 | 合成生物学 | NA | DNA折纸,DNA步行器,分子逻辑电路 | NA | 文本 | NA | DNA折纸,DNA步行器,分子逻辑电路 | NA | 分子逻辑电路,逻辑门控纳米药丸,生物传感器 | 医学,合成生物学 |
| 87 | 2026-10-17 |
Engineering root development with high precision
2026-Oct-16, The New phytologist
DOI:10.1111/nph.71583
PMID:42885824
|
综述 | 该文章讨论了如何利用单细胞技术、空间转录组学和合成生物学整合谱系追踪、发育历史遗传记录、细胞类型特异性工程和可编程遗传回路,以理解和控制植物根系结构 | 提出整合谱系追踪、发育历史遗传记录、细胞类型特异性工程和可编程遗传回路来理解和控制根系结构,并强调工程化自适应和情境依赖发育行为的新兴策略,包括历史依赖和可逆响应程序以及重连根系-环境相互作用 | 未提及 | 探讨如何整合多种前沿技术来理解和精确工程化植物根系发育 | 植物根系发育 | 合成生物学 | NA | 单细胞技术、空间转录组学、合成生物学 | NA | NA | NA | 可编程遗传回路 | 植物 | 可编程遗传回路、历史依赖和可逆响应程序 | 农业 |
| 88 | 2026-10-16 |
CLEAN Database: providing enzyme function coverage for over 55 million sequences
2026-Oct-15, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag1003
PMID:42876371
|
研究论文 | 该文章介绍了一个名为CLEAN Database的综合数据库,包含超过5500万条酶功能注释,覆盖1,098,305个菌株,由CLEAN AI模型预测,并提供网页界面和突变效应预测功能 | 利用AI模型CLEAN对超过5500万条序列进行酶功能注释,覆盖超过100万个菌株,并基于蛋白质语言模型提供突变效应预测的交互式可视化 | 酶功能注释基于AI预测而非实验验证,可能包含预测错误 | 提供全面的酶功能注释资源,促进酶发现及其在合成生物学、代谢工程等领域的应用 | 酶蛋白序列 | 机器学习 | NA | 蛋白质语言模型 | CLEAN AI模型 | 文本 | 55,000,000条酶功能注释,来自1,098,305个菌株 | NA | NA | NA | 医学, 工业生物技术 |
| 89 | 2026-10-16 |
Elucidating the molecular mechanism of tryptophan-derived indole metabolite biosynthesis in Lactiplantibacillus plantarum DPUL-S164
2026-Oct-14, Journal of the science of food and agriculture
IF:3.3Q2
DOI:10.1002/jsfa.71143
PMID:42875994
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研究论文 | 该研究通过基因组功能注释、生物信息学分析、高效液相色谱和实时荧光定量PCR,系统阐明了植物乳杆菌DPUL-S164代谢色氨酸产生吲哚-3-乳酸、吲哚-3-乙酸的分子调控机制 | 首次鉴定gene0696和gene0697作为植物乳杆菌DPUL-S164中参与色氨酸代谢生产吲哚-3-乳酸途径的功能代谢基因簇,并系统揭示了多基因模块协同调控色氨酸代谢的分子机制 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 系统阐明植物乳杆菌DPUL-S164代谢色氨酸产生吲哚-3-乳酸、吲哚-3-羧醛和吲哚-3-乙酸的分子调控机制 | 植物乳杆菌DPUL-S164及其色氨酸代谢产物吲哚-3-乳酸、吲哚-3-乙酸和吲哚-3-羧醛 | 微生物学, 代谢组学, 合成生物学 | NA | 全基因组功能注释, 生物信息学分析, 高效液相色谱, 实时荧光定量PCR | NA | 基因序列, 代谢物定量数据, 基因表达数据 | NA | NA | 植物乳杆菌DPUL-S164 | 色氨酸代谢途径(涉及芳香族氨基酸转氨酶、乳酸脱氢酶和醛脱氢酶的多基因模块协同调控) | 医学, 食品, 工业生物技术 |
| 90 | 2026-10-16 |
Engineering microbial platforms for diversified biosynthesis of antidepressant tryptophan-derived neuroactive compounds
2026-Oct-09, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.109071
PMID:42855022
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综述 | 本文综述了通过合成生物学、代谢工程和酶工程构建微生物细胞工厂,用于高效生物合成色氨酸衍生的抗抑郁神经活性化合物(如血清素、褪黑素、5-HTP、裸盖菇素等)的最新进展 | 聚焦于细菌血红素依赖型色氨酸羟化酶的新兴作用,以及AI辅助的酶和通路工程在扩展生物合成工具箱中的应用,并提出了将智能菌株设计与先进生物过程工程相结合的前瞻性思路 | 当前生产仍受限于低可持续性、选择性差和制造成本高;综述本身未提供原始实验数据,主要基于现有文献总结 | 总结和展望微生物平台合成色氨酸衍生抗抑郁神经活性化合物的研究进展,包括色氨酸过量生产、羟基化生物催化剂、下游生物合成途径和辅因子工程 | 色氨酸衍生的神经活性化合物,包括血清素、褪黑素、5-羟色氨酸(5-HTP)、裸盖菇素及相关吲哚衍生物 | 合成生物学,代谢工程 | 抑郁症,神经精神疾病 | 合成生物学,代谢工程,酶工程,AI辅助酶和通路工程 | NA | 文本 | NA | NA | 微生物(具体宿主未明确) | 色氨酸过量生产、羟基化生物催化、下游生物合成途径、辅因子工程等代谢通路 | 医学,工业生物技术 |
| 91 | 2026-10-15 |
Evolution, structural diversity and functional plasticity of plant derived multifunctional proteases and α-amylases inhibitors
2026-Oct-13, Plant molecular biology
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s11103-026-01767-x
PMID:42867572
|
综述 | 本文综述了植物来源多功能蛋白酶和α-淀粉酶抑制剂的进化、结构多样性和功能可塑性,涵盖其结构组织、抑制机制、进化多样化、计算结构生物学进展以及农业和生物技术应用 | 提出了扩展的多功能抑制剂定义,将作用于同一底物途径的抑制剂(如α-淀粉酶/α-葡萄糖苷酶和胰蛋白酶/胰凝乳蛋白酶系统)纳入范畴,并系统整合了AlphaFold等计算结构生物学新进展与结构导向工程改造策略 | 结构和体内验证方面仍存在空白,昆虫适应性、抗性进化、生物安全性和生态影响等挑战尚未充分解决,多功能抑制剂向可持续农业和生物技术应用的转化仍需进一步研究 | 综述植物来源多功能蛋白酶和α-淀粉酶抑制剂的结构、功能、进化及应用,提出扩展定义并探讨其向可持续农业和生物技术应用转化的前景与挑战 | 植物来源多功能抑制剂(MFIs),包括Bowman-Birk家族、Kunitz型家族和谷物胰蛋白酶/α-淀粉酶抑制剂 | 结构生物学 | NA | 分子对接,分子动力学模拟,基于AlphaFold的蛋白质结构预测,蛋白质工程,重组表达,合成生物学,基因组编辑 | AlphaFold | 文本 | NA | CRISPR-Cas9 | NA | NA | 农业,食品,工业生物技术 |
| 92 | 2026-10-15 |
Engineering of bacterial outer membrane vesicles for biotechnological applications
2026-Oct-13, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.109073
PMID:42869258
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综述 | 本文综述了细菌外膜囊泡(OMVs)的底盘工程和功能多样化,从合成生物学角度探讨其作为模块化可编程系统的应用 | 提出了五种诱导超囊泡化的策略和两种构建合成囊泡的框架,并展望了刺激响应型囊泡、自组装结构和混合生物合成材料等未来创新方向 | OMVs存在产量低、组成异质性和货物装载随机性等固有挑战 | 总结OMV底盘工程和功能多样化的最新进展,为其在生物技术领域的应用提供合成生物学视角 | 革兰氏阴性菌分泌的外膜囊泡(OMVs) | 合成生物学 | NA | NA | NA | 文本 | NA | NA | 革兰氏阴性菌 | NA | 医学, 环境修复, 先进材料科学 |
| 93 | 2026-10-14 |
Expanding global access to synthetic biology
2026-Oct, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-026-03338-3
PMID:42864486
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 94 | 2026-10-13 |
The ferroptosis-cuproptosis crosstalk in hematological malignancies: multi-omics insights into gene-regulated cell death and emerging therapeutic opportunities
2026-Oct-03, Apoptosis : an international journal on programmed cell death
IF:6.1Q1
DOI:10.1007/s10495-026-02451-7
PMID:42829391
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综述 | 本文综述了血液系统恶性肿瘤中铁死亡与铜死亡之间的交叉调控网络,探讨了多组学整合、单细胞与空间分析以及新兴治疗策略 | 提出铁死亡-铜死亡单一轴的概念,即一个涵盖脂质过氧化、线粒体功能障碍和蛋白质毒性应激的金属-氧化还原网络,并倡导人工智能、合成生物学和类器官系统相结合的精准细胞死亡工程 | 生物标志物缺乏标准化、临床试验设计困难以及患者动态分层挑战 | 阐述铁死亡-铜死亡轴在血液系统恶性肿瘤中的作用,并探索基于多组学的治疗靶点和精准细胞死亡工程前景 | 血液系统恶性肿瘤 | 机器学习,数字病理学 | 血液系统恶性肿瘤 | 多组学(基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学、金属组学)、单细胞分析、空间分析 | NA | 文本,图像 | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 95 | 2026-10-13 |
Recent Progress in the Microbial Production and Applications of Indole Alkaloids
2026-Oct, Indian journal of microbiology
IF:2.1Q3
DOI:10.1007/s12088-026-01554-8
PMID:42861072
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综述 | 本文综述了吲哚生物碱的微生物来源(包括内生菌、细菌、蓝细菌和真菌)以及生物技术生产方法和应用的最新进展 | 系统总结了细菌、真菌、内生菌和蓝细菌等多种微生物作为吲哚生物碱可持续生产平台的潜力,并强调了代谢工程、合成生物学和优化发酵方法在提高产量和结构多样性方面的最新进展 | 摘要中未明确提及本综述的局限性 | 概述吲哚生物碱的微生物来源,探讨生物技术生产方法的最新进展,并强调其在医药和农业等领域的应用 | 吲哚生物碱及其微生物生产体系(包括内生菌、细菌、蓝细菌和真菌) | 合成生物学 | 癌症 | 代谢工程, 合成生物学, 优化发酵方法 | NA | 文本 | NA | NA | 细菌, 真菌, 内生菌, 蓝细菌 | NA | 医药, 农业 |
| 96 | 2026-10-11 |
Efficient Generation of Single- and Multigene CRISPR-Cas9 Knockout in Human Cells
2026-Oct-09, DNA and cell biology
IF:2.6Q2
DOI:10.1177/10445498261495808
PMID:42855940
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研究论文 | 本文提出了一种利用sgRNA DNA链和CRISPR-Cas9系统在HEK293T细胞中高效生成单基因和多基因敲除的改进方法 | 使用sgRNA DNA链实现更均匀和高效的编辑,设计针对外显子1起始密码子ATG附近的crRNA,使小缺失或插入导致提前终止密码子 | 未明确说明脱靶效应评估的详细情况,且仅在HEK293T细胞中验证,未在其他细胞类型或体内模型中测试 | 开发一种简单、快速、经济高效的多基因敲除克隆生成方法 | HEK293T细胞中参与凋亡通路的基因 | 基因组编辑 | NA | CRISPR-Cas9基因编辑、T7核酸内切酶I测定、深度测序 | NA | 序列数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 人类细胞(HEK293T) | NA | 医学、合成生物学 |
| 97 | 2026-10-10 |
Advances in Bioproduction of Feed Amino Acids in China
2026-Oct-09, Advances in biochemical engineering/biotechnology
DOI:10.1007/10_2026_337
PMID:42850321
|
综述 | 该章节综述了中国饲料氨基酸生物生产的发展,重点介绍了五种饲料小品种氨基酸(L-色氨酸、L-异亮氨酸、L-缬氨酸、L-组氨酸和L-精氨酸)高产菌株开发的技术与策略,并涵盖中国饲料氨基酸产业的生产策略、主要生产商、全球产能份额及未来增长前景 | 系统总结了合成生物学在饲料小品种氨基酸生产中的应用进展,包括基因编辑、代谢途径调控和AI辅助设计等技术,并聚焦中国饲料氨基酸产业的整体发展格局 | 作为综述章节,未提供原始实验数据;主要聚焦中国市场,对其他地区的覆盖有限 | 综述中国饲料氨基酸生物生产的技术与产业发展,特别是五种小品种氨基酸高产菌株的开发策略 | L-色氨酸、L-异亮氨酸、L-缬氨酸、L-组氨酸和L-精氨酸五种饲料小品种氨基酸及其生产菌株 | 合成生物学 | NA | 微生物发酵、基因编辑、代谢途径调控、AI辅助设计 | NA | 文本 | NA | 基因编辑 | NA | 代谢途径 | 医学, 工业生物技术 |
| 98 | 2026-10-10 |
Beyond methylation: (re)generation and application of SAM analogs
2026-Oct-08, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d6np00073h
PMID:42847546
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综述 | 本文综述了2021至2026年间SAM类似物的(再)生成与应用方面的进展,重点关注甲基转移酶催化的高选择性烷基化反应 | 总结了通过一步再生、仿生多酶途径和工程化全细胞系统从甲硫氨酸类似物、烷烃硫醇、卤代烷及相关烷基化试剂中(再)生成SAM类似物的最新进展,并涵盖辅因子在甲基单元、氨基酸部分和核碱基上的修饰以扩展反应范围、增强稳定性并在复杂反应体系中提供正交性 | NA | 综述SAM类似物生成与应用的最新进展,探讨如何克服SAM再生效率低和SAM类似物合成繁琐的障碍,推动转移酶化学超越甲基化 | SAM类似物、甲基转移酶(MTs)、甲硫氨酸类似物、烷烃硫醇、卤代烷及相关烷基化试剂 | 合成生物学 | NA | 酶促供应与再生、一步再生、仿生多酶途径、工程化全细胞系统 | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 生物催化, 药物发现, 合成方法开发, 合成生物学 |
| 99 | 2026-10-10 |
The chloroplast-mitochondria interaction under water extremes: Insights into metabolic tug-of-war
2026-Oct-08, Current opinion in plant biology
IF:8.3Q1
DOI:10.1016/j.pbi.2026.102976
PMID:42849088
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综述 | 本文综述了在水分极端条件下叶绿体与线粒体之间的代谢协调、逆行信号和能量感知网络,并探讨了通过工程化细胞器间通信提高作物抗逆性的策略 | 系统整合了叶绿体-线粒体在水分极端下的代谢协调、逆行信号与能量感知网络,并提出了基于新兴技术工程化细胞器间通信以提升作物抗逆性的新框架 | 作为综述文章,未提供原始实验数据,所提出的工程化策略仍处于概念阶段,缺乏实证验证 | 综述水分极端条件下叶绿体与线粒体代谢协调及逆行信号机制,并探讨工程化代谢互作以改良作物抗逆性的未来方向 | 植物叶绿体与线粒体在干旱和淹水条件下的代谢协调与信号网络 | 植物系统生物学 | NA | 细胞器特异性代谢组学、合成生物学 | NA | 文本 | NA | NA | 植物 | NA | 农业 |
| 100 | 2026-10-10 |
Constructing nucleoside deaminase-assisted orthogonal DNA replication system for continuous evolution in prokaryotes
2026-Oct-07, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2026.102563
PMID:42843617
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研究论文 | 本文开发了核苷脱氨酶辅助的正交DNA复制系统,用于在原核生物中实现连续进化 | 将核苷脱氨酶与正交DNA复制耦合,显著提高了突变率并调节突变偏好,实现了快速进化 | 未明确说明 | 构建一个高效的连续进化平台,用于加速调控元件、蛋白质功能和代谢途径的进化 | 工程化苏云金芽孢杆菌和合成大肠杆菌系统 | 合成生物学 | NA | 核苷脱氨酶辅助的正交DNA复制(NDAORep) | NA | NA | NA | NA | 苏云金芽孢杆菌, 大肠杆菌 | 正交DNA复制系统结合核苷脱氨酶 | 代谢工程, 合成生物学 |