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当前共找到 162 篇文献,本页显示第 101 - 120 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 工程工具 宿主生物 回路设计 应用领域
101 2026-10-09
Bidirectional photoriboswitch for translational regulation in mammalian cells
2026-Oct-16, iScience IF:4.6Q1
研究论文 该研究开发了一种双向光核糖开关平台,通过光诱导蛋白质二聚化和内含肽介导的拆分蛋白重组,实现对多种mRNA翻译的正交上调和下调调控 首次构建了双向光核糖开关平台,能够模拟正交RNA结合蛋白介导的多mRNA上/下调调控;创新性地利用光二聚化阻断内含肽重组构建Light-OFF系统,并与Light-ON系统正交组合,实现双向翻译调控;功能模块可灵活替换以适应不同需求 摘要中未明确提及该研究的局限性 开发一种能够在哺乳动物细胞中实现双向翻译调控的光核糖开关平台,为合成生物学提供精确、按需的翻译控制工具 哺乳动物细胞中的mRNA翻译过程 合成生物学 NA 光遗传学、内含肽介导的拆分蛋白重组、光诱导蛋白质二聚化 NA NA NA NA 哺乳动物细胞 双向光核糖开关:Light-OFF系统(光二聚化阻断内含肽重组)与Light-ON系统(光诱导不同拆分内含肽对重组)正交组合,通过光感应正交重组RNA结合蛋白来调控各自靶mRNA的翻译 医学、工业生物技术
102 2026-10-09
Semi-Rational Design of CpNampt Mutants for Enhanced Nicotinamide Mononucleotide (NMN) Synthesis in Saccharomyces cerevisiae
2026-Oct-07, Microbial physiology IF:2.9Q3
研究论文 通过对酿酒酵母中NMN消耗途径基因进行双敲除,并结合AI辅助设计突变CpNampt酶,构建高效生产NMN的微生物细胞工厂 结合代谢工程与AI辅助酶设计,对来源于Chitinophaga pinensis的CpNampt进行半理性设计,获得高效突变体I229A,显著提高NMN产量 未提及 提高酿酒酵母中NMN的合成效率,构建绿色高效的NMN生产菌株 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)及CpNampt酶 合成生物学 衰老相关疾病 代谢工程、AI辅助酶设计、基因敲除 NA NA NA CRISPR-Cas9 酿酒酵母 NMN合成代谢途径 医药、工业生物技术
103 2026-10-09
Retention and biosynthesis of diverse nitroarenes in Escherichia coli after combinatorial nitroreductase gene deletions
2026-Oct-07, Nature chemistry IF:19.2Q1
研究论文 本文通过构建含有多达15个硝基还原酶基因敲除的大肠杆菌菌株,全面分析细菌硝基还原酶活性,并评估20多种外源硝基芳烃化合物的稳定性,进而改进或实现硝基芳烃化合物的生物合成 构建了含有多达15个已知和候选硝基还原酶基因敲除的大肠杆菌菌株,系统评估了20多种外源硝基芳烃化合物的稳定性,并利用这些工具实现了硝基芳烃化合物的生物合成、生物催化转化以及半合成和位点特异性掺入 摘要中未明确提及研究局限性 系统研究细菌硝基还原酶活性对硝基芳烃化合物稳定性的影响,并利用工程化菌株改进或实现硝基芳烃化合物的生物合成 大肠杆菌菌株和20多种外源硝基芳烃化合物 合成生物学, 代谢工程 NA 基因敲除 NA NA 构建了含有多达15个硝基还原酶基因敲除的大肠杆菌菌株,评估了20多种硝基芳烃化合物 NA 大肠杆菌 NA 医学, 工业生物技术
104 2026-10-09
Microbial fermentation-mediated starch modification: Structural evolution, mechanistic insights, traditional application and future perspectives
2026-Oct-03, Food chemistry IF:8.5Q1
综述 该综述系统总结了微生物发酵介导的淀粉改性,重点关注淀粉功能性质、多尺度结构演变及其机制,并讨论了传统应用和未来发展方向 不同于以往主要总结发酵介导质量变化的综述,本文整合了主要微生物、发酵策略和传统食品应用,核心聚焦于淀粉功能性质,将多尺度结构、理化性质、回生行为和消化性的变化与微生物种类、底物来源和发酵参数相关联,并基于基因工程和合成生物学探讨了未来方向 现有文献中存在不一致的研究发现,且发酵从经验实践向可控精准技术领域的转变仍面临挑战 探讨微生物发酵介导的淀粉改性机制,包括结构演变、理化性质变化、回生行为和消化性调控,并展望未来发展方向 天然淀粉及发酵改性后的淀粉 食品科学 NA 微生物发酵、基因工程、合成生物学 NA 文本 NA NA NA NA 食品
105 2026-10-08
Molecular Biosensors for Screening and Regulating Hyper-Producing Cell Factory
2026-Oct-07, Advances in biochemical engineering/biotechnology
综述 本文介绍了代谢物相关分子生物传感器的基本机制和设计原理,并总结了用于筛选和调控高产细胞工厂的经典应用案例 系统总结了分子生物传感器在创建高产细胞工厂中的筛选和调控应用,并探讨了人工智能和合成生物学方法为该领域带来的新可能性 文章未具体说明,但指出该领域仍面临挑战 介绍代谢物相关分子生物传感器的基本机制和设计原理,总结其在筛选和调控高产细胞工厂中的应用 微生物细胞工厂、代谢物相关分子生物传感器 合成生物学 NA 分子生物传感器 NA 文本 NA NA 微生物 代谢物响应型生物传感器 工业生物技术, 医学
106 2026-10-08
Prophage Activation Triggers Extracellular Synthesis of DNA in Bacterial Biofilms via Rolling Circle Replication
2026-Oct-05, Angewandte Chemie (International ed. in English)
研究论文 该研究展示了通过激活原噬菌体,利用滚环复制在细菌生物膜中合成可编程的胞外DNA超结构,并赋予其电化学和催化功能 首次揭示了原噬菌体通过滚环复制控制胞外DNA合成、结构和功能的机制,并建立了在活细菌群落中工程化功能DNA材料的新型生物技术平台 研究主要局限于两种环境细菌(Shewanella oneidensis和Bacillus subtilis),未在其他细菌或复杂微生物群落中验证,且未充分评估该系统的长期稳定性和生态安全性 探究原噬菌体在控制胞外DNA合成、结构和活性中的作用,并开发在活细菌生物膜中工程化功能DNA超结构的技术平台 Shewanella oneidensis和Bacillus subtilis细菌及其生物膜中的原噬菌体和胞外DNA 合成生物学 NA 滚环复制、荧光报告菌株实时监测、G-四链体DNA酶形成 NA 图像、文本 NA NA Shewanella oneidensis, Bacillus subtilis 定制环状模板引导的滚环复制,产生G-四链体多联体,自组装成球状和线状超结构 医学、环境、材料、工业生物技术
107 2026-10-08
Engineering quorum sensing: new directions for antimicrobial therapy
2026-Oct, Trends in microbiology IF:14.0Q1
综述 本文综述了如何利用群体感应(QS)及其干扰机制进行QS电路工程,并将其转化为治疗性微生物等应用。 系统性地将QS研究从基础微生物学转向转化生物技术,强调了QS电路工程在抗微生物治疗中的新方向。 作为综述文章,未提供原始实验数据,可能缺乏对具体技术细节的深入验证。 探讨如何利用QS和QS干扰进行QS电路工程,并转化为抗微生物治疗应用。 细菌的群体感应系统及基于QS的合成生物学电路。 合成生物学 感染性疾病 群体感应(QS)电路工程 NA 文本 NA NA NA 基于群体感应的合成生物学电路 医学
108 2026-10-08
Emerging classes of copper enzymes
2026-Oct-01, Current opinion in chemical biology IF:6.9Q1
综述 本文综述了两种新兴的双核2型铜酶家族:植物BURP结构域肽环化酶和真菌DUF3328双铜氧化酶,比较了它们的生物功能、活性位点结构、双氧还原/活化策略及催化机制 首次将植物BpCs和真菌DDOEs统一为双核2型铜酶框架,系统比较其催化机制并提出了DDOE命名规范,突出了基因组挖掘和结构预测在发现新铜酶中的作用 许多铜辅因子缺乏独特的光谱特征或动力学不稳定,限制了对其的发现和机制表征;本文为综述,未提供新的实验数据 总结和比较新发现的双核2型铜酶家族,建立统一的分类和机制框架,并探讨其在生物催化、生物工程和合成生物学中的应用潜力 植物特异性BURP结构域肽环化酶(BpCs)和真菌DUF3328双铜氧化酶(DDOEs) 合成生物学 NA 基因组挖掘, 异源表达, 蛋白质结构预测 NA 文本 NA NA NA NA 医学, 工业生物技术
109 2026-10-07
Deep learning architectures achieve state-of-the-art (SOTA) accuracy in protein secondary structure prediction
2026-Oct, Molecular diversity IF:3.9Q2
综述 本文综述了深度学习架构在蛋白质二级结构预测中的最新进展,涵盖混合模型设计、基准数据集和评估指标,并讨论了当前方法学局限及未来方向 系统总结了从早期机器学习到卷积神经网络、循环神经网络及Transformer架构(如AlphaFold2)在蛋白质二级结构预测中的演进,并提出了跨物种验证、不确定性感知建模及整合异质生物数据等未来方向 存在数据依赖性和数据集偏差,方法学仍有局限 概述蛋白质二级结构预测领域的最新进展,包括混合模型设计、基准数据集和评估指标,并讨论当前局限和未来方向 蛋白质二级结构预测的计算方法 机器学习 NA NA CNN, RNN, Transformer, AlphaFold2 序列数据 NA NA NA NA 医学, 合成生物学, 药物开发
110 2026-10-06
The grammar of the pangenome: terms, concepts, methods, and emerging patterns-a general framework for comparative genomics and genome biology
2026-Oct-05, Microbiology and molecular biology reviews : MMBR IF:8.0Q1
综述 本文综述了泛基因组研究的基本概念、术语、方法和新兴模式,并提出了比较基因组学和基因组生物学的通用框架 提出了修订的泛基因组标准、标准操作流程以及提高分析可重复性的进一步目标,并基于249个分类群和17,858个基因组序列的分析展示了主要模式 泛基因组分析采用多种不同流程,不可避免地引入了可重复性挑战 综述泛基因组研究的基本概念,比较计算平台和算法,提出提高可重复性的标准操作流程和框架 泛基因组研究的概念、方法、计算平台、算法以及249个分类群的基因组序列 比较基因组学 NA 泛基因组分析 NA 基因组序列 249个分类群,17,858个基因组序列 NA NA NA 医学,合成生物学,生物技术
111 2026-10-05
Replicon engineering-driven modular synthetic biology toolkit for efficiently iterative genome editing in Fusarium venenatum
2026-Oct-01, Metabolic engineering IF:6.8Q1
研究论文 本文通过复制子工程建立了一套模块化合成生物学工具包,实现了在Fusarium venenatum中的高效迭代基因组编辑和基因表达精细调控。 首次在F. venenatum中鉴定并表征了线粒体DNA来源的稳定和可治愈复制子;利用可治愈复制子MT07将CRISPR/Cas9系统的质粒治愈时间从22天缩短至8天;鉴定出6个中性基因组整合位点;利用稳定复制子MT071建立了稳定游离表达系统,并表征了大量模块化转录和翻译调控元件,实现了662.9倍的基因表达动态范围;成功构建了HMB生物合成途径,实现了微生物蛋白和HMB的高效共生产。 摘要中未明确提及研究限制。 建立基于复制子工程的模块化合成生物学工具包,以促进F. venenatum的迭代基因组编辑和基因表达调控,用于可持续食品生物制造。 Fusarium venenatum(丝状真菌) 合成生物学 NA CRISPR/Cas9基因组编辑、复制子工程、模块化转录和翻译调控元件表征、2A肽介导的多顺反子表达 NA NA NA CRISPR-Cas9 Fusarium venenatum 3-羟基-3-甲基丁酸(HMB)生物合成途径 食品、工业生物技术
112 2026-10-04
Engineering phage therapeutics with intrinsic biocontainment
2026-Oct-02, Trends in biotechnology IF:14.3Q1
综述 本文综述了工程化噬菌体疗法的基因组工程方法、监管框架以及生物防护策略,并提出了评估生物防护严格性、进化稳健性、治疗效果和转化可行性之间权衡的框架。 提出了一个评估生物防护严格性、对逃逸突变体的进化稳健性、治疗效果和转化可行性之间权衡的框架。 未提及 综述工程化噬菌体疗法的现状,评估生物防护策略,并提出评估权衡的框架。 工程化噬菌体疗法 合成生物学 细菌感染 噬菌体基因组工程 NA 文本 NA NA 噬菌体 NA 医学
113 2026-10-03
Exploration of diverse glycosyltransferases in Dracocephalum moldavica and engineering the production of bioactive flavonoid glycosides
2026-Oct, Journal of integrative plant biology IF:9.3Q1
研究论文 本研究鉴定了香青兰中五种UDP-糖基转移酶,阐明了其糖基化机制,并通过工程化大肠杆菌实现了生物活性黄酮糖苷的体内生产 首次系统鉴定了香青兰中参与黄酮糖苷生物合成的五种UGT,发现DmUGT1具有宽泛的底物杂泛性,并鉴定了决定糖供体特异性的关键氨基酸Ser127和Tyr373,同时通过增强UDP-葡萄糖醛酸和UDP-葡萄糖供应实现了目标糖苷的高效生产 尚未完全解析所有UGT的晶体结构,体内生产产量仍有提升空间,未对其他潜在UGT进行功能验证 系统阐明香青兰中黄酮糖基化机制,挖掘参与生物活性黄酮糖苷生物合成的候选基因,并建立合成生物学生产方法 香青兰(Dracocephalum moldavica)中的UDP-糖基转移酶及黄酮糖苷化合物 合成生物学 心血管疾病 基因克隆与表达、同源建模、定点突变、代谢工程、合成生物学 同源建模 序列、质谱、酶活数据 NA NA 大肠杆菌 增强UDP-葡萄糖醛酸和UDP-葡萄糖胞内供应的质粒与UGT表达质粒共表达系统 医药
114 2026-10-03
Synthetic biology unlocks programmable control of complex plant glycan metabolism
2026-Oct-01, Current opinion in plant biology IF:8.3Q1
综述 该文章综述了合成生物学工具如何实现对植物复杂糖代谢的可编程控制,重点关注细胞壁生物合成和代谢物糖基化途径 系统性地将新兴的可编程工具(包括合成、组织特异性和诱导型启动子设计,RNA、蛋白质和通路水平的调控开关,以及基于CRISPR的系统)应用于植物糖代谢工程,并提出了从静态修饰向自我调节的精确代谢控制转变的新范式 文章为综述性质,未提供原始实验数据验证所提出的可编程控制策略在植物糖代谢工程中的实际效果 探讨合成生物学工具在植物复杂糖代谢(细胞壁生物合成和代谢物糖基化)中的可编程控制应用潜力,并分析如何克服相关工程障碍 植物细胞壁生物合成途径和代谢物糖基化途径 合成生物学 NA CRISPR、RNA调控、启动子工程、诱导型表达系统 NA 文本 NA CRISPR-Cas9 植物 组织特异性启动子、诱导型启动子、RNA调控开关、蛋白质调控开关、通路水平调控开关 医学, 农业, 工业生物技术
115 2026-09-30
Advanced gene editing technologies for oncology mechanisms, applications, and clinical implementation
2026-Oct, Cancer gene therapy IF:4.8Q1
综述 本文系统综述了先进基因编辑技术在肿瘤学中的机制、应用和临床转化,涵盖ZFN、TALEN、CRISPR/Cas等多种技术及其在癌症治疗中的应用 系统整合了从传统基因编辑工具到碱基编辑器、先导编辑器、PASTE系统及ARCUS、MegaTALs等混合平台的最新进展,并探讨了其与人工智能、生物传感器和合成生物学的融合 未涉及具体实验数据验证,主要基于文献综述;基因编辑技术的递送优化、脱靶效应、免疫原性及伦理问题仍待解决 全面阐述先进基因编辑技术在肿瘤学中的机制、应用和临床实施,推动更精准、有效和个性化的癌症治疗策略 多种癌症类型,包括肺癌、乳腺癌、结直肠癌、血液系统恶性肿瘤、肝癌、胰腺癌、头颈癌、食管癌、前列腺癌、胃癌和脑癌 基因编辑 肺癌, 乳腺癌, 结直肠癌, 血液系统恶性肿瘤, 肝癌, 胰腺癌, 头颈癌, 食管癌, 前列腺癌, 胃癌, 脑癌 CRISPR-Cas9, CRISPR-Cas12, CRISPR-Cas13, 碱基编辑, 先导编辑, PASTE系统, ZFN, TALEN, ARCUS, MegaTALs, 重组酶 NA 文本 NA CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN NA NA 医学
116 2026-09-30
Controlling viscoelastic behavior and microstructural organization in engineered living materials using synthetic adhesins and rheometry
2026-Oct, Acta biomaterialia IF:9.4Q1
研究论文 利用合成细胞黏附素和流变学手段,系统调控工程活材料(ELMs)的黏弹行为与微观结构组织 首次通过合成黏附素强度、黏附逻辑、细胞尺寸和形状等参数,系统调控细菌ELMs的黏弹性;发现非生命材料颗粒悬浮液的理论可延伸至ELMs;证明流变学可主动塑造ELMs微观结构,实现细胞聚集和颗粒重排的精确控制 未明确提及具体局限性,可能受限于细菌ELMs体系,对真核细胞ELMs的普适性尚待验证,且未涉及长期稳定性或规模化生产问题 从第一性原理出发,实现ELMs力学性能的理性调控,并探索流变学在塑造其微观结构中的作用 由活细菌构建的多细胞工程活材料(ELMs) 合成生物学与材料科学交叉 NA 合成黏附素工程、流变学测量 NA 流变学数据、微观结构图像 NA 合成黏附素 细菌 黏附逻辑(adhesion logic)控制的细胞间黏附系统 生物打印、微生物群落设计、生物医学应用
117 2026-09-30
Bacterial Degradation of Persistent Organic Pollutants: From Molecular Mechanisms to Synthetic Biology
2026-Oct, Environmental microbiology IF:4.3Q2
综述 该文章综述了细菌降解持久性有机污染物的分子机制及合成生物学应用,整合了好氧氧化、厌氧还原和共代谢途径在分子、基因组、调控、代谢和多组学层面的研究进展 揭示了POP降解由高度模块化和进化动态网络调控,包括分解代谢操纵子、可移动遗传元件和调控层级;强调了芳香环羟基化双加氧酶和还原性脱卤酶的酶混杂性、替代途径架构和互养微生物相互作用对降解效率的增强作用;提出了合成生物学工具如途径重构、酶工程、设计菌群和智能生物传感器在扩展底物范围、改善途径控制和实时监测方面的新机遇 存在遗传稳定性、生物安全性和现场鲁棒性等挑战;缺乏原位多组学验证;环境条件下 bioremediation 的稳健性不足 综合细菌降解POP的分子机制和合成生物学进展,推动从分子到系统水平的整合生物修复策略发展 持久性有机污染物(POPs)和降解这些污染物的细菌 合成生物学 NA 多组学,基因组学,代谢组学 NA 文本 NA NA 细菌 NA 环境
118 2026-09-26
Mitochondria as programmable redox rheostats: Advancing from transplantation to bioengineered organelle therapeutics
2026-Oct, Redox biology IF:10.7Q1
综述 该综述讨论了线粒体从移植疗法向可编程生物工程细胞器疗法转变的最新进展,重点介绍了通过合成生物学、纳米医学和生物材料对线粒体进行改造以增强其ROS清除能力、稳定性和靶向递送。 提出将线粒体视为可编程治疗单元而非静态移植物的理念,并系统总结了表面功能化、基因调控及融合胶囊、光热纳米刀等先进递送平台等新兴改造策略。 线粒体移植面临靶向特异性差、递送动力学低、分离后功能衰退等转化障碍,线粒体工程化疗法距离临床精准、可规模化应用仍有距离。 探讨线粒体作为可编程氧化还原变阻器的治疗潜力,评估从线粒体移植到生物工程细胞器疗法的转变,分析提高疗效的关键策略与转化瓶颈。 线粒体、线粒体移植疗法、生物工程化线粒体。 合成生物学 缺血再灌注损伤、神经退行性疾病、代谢综合征、肺癌、前列腺癌、心血管疾病、老年疾病 NA NA 文本 NA NA NA NA 医学
119 2026-09-26
Engineering a protein homodimer from a heterodimer: A chimeric DBHS protein
2026-10, Protein science : a publication of the Protein Society IF:4.5Q1
研究论文 本研究设计并表征了一种嵌合DBHS蛋白,使其能够形成同源二聚体,模拟DBHS异源二聚体的界面 首次成功将偏好异源二聚化的DBHS蛋白工程化为稳定的同源二聚体,并证明其在高浓度天然DBHS蛋白存在下仍保持同源二聚体状态 研究未深入探讨该工程化同源二聚体在细胞内环境中的稳定性和功能,且对DBHS蛋白偏好性的分子决定因素仅提出了可能的机制 设计并表征一种嵌合同源二聚体DBHS蛋白,以理解DBHS蛋白二聚化偏好的分子基础 DBHS蛋白家族(包括SFPQ、NONO、PSPC1)及其嵌合体 结构生物学 NA X射线晶体学,生物化学表征 NA 结构数据,生化数据 NA NA NA NA 医学,合成生物学
120 2026-09-26
Electroactive Microbiomes: Electron Transfer Mechanisms and Environmental Biotechnology Applications
2026-Oct, Environmental microbiology reports IF:3.6Q2
综述 本文综述了电活性微生物组中的胞外电子传递机制及其在环境生物技术中的应用,并提出了机制-界面-功能-成熟度的分析框架 提出了连接胞外电子传递、生物膜生态学、微生物组-电极组织、环境过程性能与转化成熟度的机制-界面-功能-成熟度框架,并将直接传递、介体传递和种间电子传递视为系统依赖性路径而非普适排序机制 长期稳定性不足、混合菌群中机制归因困难、标准化缺乏、放大困难、能量与质量平衡不清、生物安全性、技术经济可行性及法规兼容性等问题 建立机制-界面-功能-成熟度框架,将胞外电子传递与生物膜生态学、微生物组-电极组织、环境过程性能和转化成熟度相连接,并评估多组学、代谢建模、合成生物学、先进材料和人工智能在电活性系统中的直接证据强度 电活性微生物组(与胞外矿物、氧化还原活性化合物、电极或伙伴生物交换电子的混合微生物群落) 环境生物技术, 合成生物学, 微生物组学 NA 多组学, 代谢建模, 合成生物学, 先进材料, 人工智能 NA 文本 NA NA NA NA 环境, 能源, 工业生物技术
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