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当前共找到 19 篇文献。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-09-21 |
Harnessing bacterial biology and components for next-generation vaccine development
2026-Nov, Microbial pathogenesis
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.micpath.2026.108823
PMID:42705503
|
综述 | 本文综述了利用细菌生物学及其组分（如类毒素、多糖、外膜囊泡、鞭毛蛋白、细菌影和乳酸菌等）作为下一代疫苗设计与递送平台的潜力 | 系统整合细菌组分作为抗原与内在佐剂的双重功能，并结合合成生物学实现针对新发病原体的多价疫苗设计策略 | 部分细菌疫苗平台仍处于研发阶段，尚未成熟；文中未涉及具体临床数据或大规模验证结果 | 探讨细菌生物学和组分在下一代疫苗开发中的应用，推动灵活、可扩展和多价疫苗平台的构建 | 细菌组分（类毒素、多糖、外膜囊泡、鞭毛蛋白、细菌影）及乳酸菌 | 免疫学 | 传染病 | NA | NA | 文本 | NA | NA | 乳酸菌, 细菌 | NA | 医学 |
| 2 | 2026-09-16 |
Machine learning-guided discovery of poly(ethylene terephthalate)-binding modules to enhance durable whole-cell degradation
2026-Nov, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2026.135279
PMID:42385911
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研究论文 | 该研究开发了机器学习辅助流程，从天然蛋白质结构中挖掘PET结合模块，以增强全细胞对PET的降解能力 | 将基于profile HMM的同源搜索与监督式PET水解酶机器学习模型（PETML）相结合，发现家族13的CBM可作为PET结合模块，并通过双锚定系统共展示实现全细胞催化剂的增强降解和可回收性 | 未明确说明机器学习模型的泛化能力、双锚定系统在其他宿主中的适用性以及大规模应用的经济可行性 | 发现新型PET结合模块，提高PET水解酶在疏水表面的吸附和降解效率，构建可重复使用的全细胞生物催化剂 | PET塑料、PET水解酶、碳水化合物结合模块（CBMs）、大肠杆菌全细胞催化剂 | 机器学习, 合成生物学 | NA | 机器学习辅助挖掘, 同源搜索, 高通量对接, 分子动力学模拟, 蛋白质融合, 全细胞表面展示 | PETML（监督式机器学习模型） | 蛋白质序列, 分子结构数据, 实验吸附和降解数据 | 197个非冗余候选结合模块 | NA | 大肠杆菌 | 双锚定系统（OmpA和EhaA）共展示tCBM13-1与FAST-PETase | 环境, 材料, 工业生物技术 |
| 3 | 2026-09-16 |
De novo synthesis of large-scale metabolic pathways for natural products and their optimization strategies
2026-Nov, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2026.135370
PMID:42431421
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综述 | 系统分析了在微生物细胞工厂中从头合成大规模代谢途径（≥10个酶促步骤）以生产天然产物的核心策略与前沿技术，并探讨了系统生物学建模与机器学习在其中的新兴作用 | 整合了理性设计、动态控制与模块化共培养策略以应对代谢负担、途径失衡和宿主毒性等挑战，并强调了智能算法与多学科工具结合在复杂天然产物生物制造中的潜力 | 作为综述文章，未提供原始实验数据，所讨论的策略和技术在实际应用中的可行性和通用性仍需进一步验证 | 系统分析在微生物细胞工厂中重构大规模代谢途径以高效可持续生产高价值天然产物的核心策略与前沿技术 | 大规模代谢途径（≥10个酶促步骤）、天然产物、微生物细胞工厂 | 合成生物学 | NA | 先进克隆方法、模块化途径设计、自组装方法（蛋白质/DNA支架和代谢通道）、共培养系统中的分工优化、动态调控机制（启动子工程、核糖开关、基于生物传感器的反馈控制）、系统生物学建模、机器学习 | NA | 文本 | NA | NA | 微生物细胞 | 模块化代谢途径、自组装支架、代谢通道、动态调控回路（启动子工程、核糖开关、生物传感器反馈控制） | 医药、工业生物技术 |
| 4 | 2026-09-08 |
Efficient rDNA-mediated multi-copy integration of gene clusters in Aureobasidium melanogenum
2026-Nov, Journal of biotechnology
IF:4.1Q2
DOI:10.1016/j.jbiotec.2026.07.010
PMID:42532222
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研究论文 | 本研究开发了一种基于核糖体DNA（rDNA）介导的多拷贝基因簇整合策略，成功在出芽短梗霉菌（Aureobasidium melanogenum）中高效整合大片段基因并提升黑色素产量。 | 首次在非传统酵母底盘出芽短梗霉中利用高度重复的rDNA序列作为同源重组位点，实现大片段基因簇（11.0kb）的多拷贝稳定整合，并显著提高表达水平及代谢产物产量。 | 摘要中未提及本研究的具体局限性，可能包括对整合位点特异性及长期遗传稳定性的进一步评估需求等。 | 旨在解决Aureobasidium melanogenum中缺乏大片段基因簇重组技术的问题，通过rDNA介导的多拷贝整合促进该宿主的代谢工程改造。 | 研究对象为Aureobasidium melanogenum菌株，以及插入的gfp基因、pks基因和由pks、npg1、scd构成的黑色素合成基因簇。 | 合成生物学 | NA | 同源重组（rDNA介导） | NA | 基因序列数据 | 本研究中使用了不同rDNA区域（rDNA1、rDNA2、rDNA3）进行整合，并测试了gfp（0.7kb）、pks（7.0kb）及11.0kb基因簇，但样本具体数量未在摘要中说明。 | NA | Aureobasidium melanogenum | rDNA介导的多拷贝基因整合（使用RNA聚合酶I启动子区域、部分26S rDNA区域、RNA聚合酶I终止子区域作为同源重组位点） | 工业生物技术 |
| 5 | 2026-09-08 |
The molecular mechanisms and therapeutic targeting of microtubule glutamylation in mitosis and cancer
2026-Nov, Pharmacology & therapeutics
IF:12.0Q1
DOI:10.1016/j.pharmthera.2026.109100
PMID:42624259
|
综述 | 本文综述了微管谷氨酰化在细胞分裂和癌症中的分子机制，并探讨了针对该过程的治疗策略 | 将微管谷氨酰化定位为癌症治疗的多面靶点，并探讨了从代谢干预到靶向蛋白降解和合成生物学等前沿治疗手段 | 未提供具体实验数据或候选药物的临床验证结果 | 阐明微管谷氨酰化在细胞分裂和肿瘤发生中的机制，并评估其作为癌症治疗靶点的潜力 | 微管谷氨酰化相关酶（如TTLL11、TTLL4、TTLL6、TTLL12）及其在细胞分裂和癌症中的作用 | 分子生物学 | 癌症 | NA | NA | 文献数据 | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 6 | 2026-09-05 |
From ultra-processed to biointelligent foods: The role of food biotechnology in the transition toward functional and health-oriented nutrition
2026-Nov-01, Food research international (Ottawa, Ont.)
DOI:10.1016/j.foodres.2026.120321
PMID:42692715
|
综述 | 本文综述了食品生物技术在从超加工食品向功能性和健康导向营养转型中的作用，提出了“生物智能食品”框架，整合发酵、酶解、下一代益生菌等多技术以支持代谢和肠道稳态。 | 提出将超加工食品转型为“生物智能食品”的新概念框架，融合合成生物学、AI辅助营养设计和地中海饮食2.0等新兴方法，强调食品基质的生物工程化以靶向生物互动。 | 基于综述性质，缺乏实证数据验证该框架的实际可行性和临床效果，且具体机制和应用细节尚需深入研究。 | 探讨食品生物技术如何克服超加工食品引起的不良影响，并将现代营养学推向功能性、预防性和精准化方向。 | 超加工食品、生物技术（发酵、酶转化）、肠道微生物、功能性食品基质，以及AI、纳米技术和合成生物学工具。 | 生物技术、营养科学、合成生物学 | 慢性非传染性疾病（如代谢紊乱和炎症相关疾病） | 多重组学技术、代谢工程、合成生物学、人工智辅助设计 | NA | NA；文献综述和概念性框架 | NA；无实验样本，基于文献证据 | CRISPR-Cas9、TALEN、ZFN、Gibson Assembly、Golden Gate Assembly（推测用于代谢工程，但具体未详述） | NA；基于文献综述，涉及微生物（如益生菌）但未指定具体物种 | 生物智能食品框架相关的发酵过程、代谢活动、稳态调控和生物合成途径 | 医学、食品工业、健康营养、精准营养 |
| 7 | 2026-09-03 |
Metabolic engineering of Candida yeasts for biotechnological applications
2026-Nov, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2026.102522
PMID:42580625
|
综述 | 本文系统综述了假丝酵母菌属代谢工程用于生物技术应用的最新进展，重点涵盖遗传工具扩展、非常规碳源利用及高价值化合物合成，并提出基于生物安全的分类框架以支持其安全工业应用 | 提出了生物安全导向的假丝酵母菌分类框架，并强调了合成生物学与人工智能驱动设计相结合以解锁其生物技术潜力 | 存在机会性致病性担忧和历史遗传操作工具缺乏等障碍，导致代谢潜力与实际应用之间存在显著差距 | 总结假丝酵母菌代谢工程进展并探讨其在可持续生产化学品、燃料和蛋白质方面的潜力 | 假丝酵母菌属物种 | 合成生物学 | NA | 功能基因组学、基因组编辑、系统代谢工程 | NA | NA | NA | 基因组编辑工具 | 假丝酵母菌属 | 微生物细胞工厂 | 工业生物技术, 可持续化学品生产 |
| 8 | 2026-09-03 |
A dual-dimensional CRISPR toolkit enables one-step high-efficiency multiplex genome editing in Komagataella phaffii
2026-Nov, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2026.102525
PMID:42595042
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研究论文 | 本研究开发了一种基于CRISPR的双维度工具包EMGES 3.0，用于在Komagataella phaffii中实现一步高效的多重基因组编辑和大片段整合 | 首次实现超长片段（>16 kb）的一步整合，效率达14.8%，并通过底盘工程和载体优化的协同作用大幅提升了编辑效率 | 未明确说明局限性，但超长片段整合效率相对较低（14.8%） | 解决K. phaffii中多重基因编辑和精确大片段整合效率低、流程繁琐的问题，推动C1生物经济工业化 | 甲醇利用型酵母Komagataella phaffii（及其工程改造菌株） | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9基因编辑 | NA | 基因组编辑效率数据、代谢产物产量数据（如游离脂肪酸、白藜芦醇） | 具体样本数未明确，涉及多个工程菌株（如Y09）的编辑效率和产物产量测试 | CRISPR-Cas9 | Komagataella phaffii（库德里阿兹威氏毕赤酵母） | 双锤头核酶-单链导向RNA-丁型肝炎病毒核酶（dHgH）介导的引导RNA表达系统 | 工业生物技术 |
| 9 | 2026-08-22 |
Recent advances in protein engineering and synthetic applications of amino acid oxidases
2026-Nov, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2026.135229
PMID:42336113
|
综述 | 本文综述了氨基酸氧化酶（AAOs）的催化机制、活性测定方法，并重点介绍了蛋白质工程策略（如定向进化、理性/半理性及AI引导方法）及其在化学酶级联反应和多酶级联消旋化等合成应用中的最新进展。 | 全面分析D-和L-型AAOs的催化机制，并强调AI引导的蛋白质工程策略和化学酶级联等新兴合成应用。 | 未详细讨论AAOs的底物特异性和稳定性在实际工业应用中的具体限制。 | 总结AAOs的蛋白质工程和合成应用进展，以推动其在现代生物催化和合成生物学中的应用。 | 氨基酸氧化酶（AAOs） | 机器学习 | NA | 蛋白质工程、定向进化、理性设计、AI引导设计 | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 医药、农业化学、工业生物技术 |
| 10 | 2026-08-22 |
Bioorthogonal chemistry-driven multi-enzyme strategy for efficient terpenoid biosynthesis
2026-Nov, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2026.135232
PMID:42341954
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研究论文 | 本文开发了一种基于生物正交化学的多酶级联策略，通过构建有序交联酶复合物实现萜类化合物的高效体外合成 | 利用生物正交蛋白配对技术将六种缩短的甲羟戊酸途径酶组装成有序交联酶复合物，实现酶的空间有序排列，并通过多层荧光标记技术验证排列，该策略具有模块化和通用性 | 摘要中未提及明显局限性，可能包括体外系统稳定性或成本等问题 | 开发一种稳健、通用且可重复使用的体外多酶级联平台，用于高效合成高价值萜类化合物，推动体外合成生物学发展 | 来自缩短甲羟戊酸途径的六种酶，以及β-法尼烯合酶和紫杉二烯合酶 | 合成生物学 | NA | 生物正交化学、多层荧光标记技术、体外酶级联 | NA | 实验数据（产物浓度、酶活性） | β-法尼烯生产实验：包含有序交联酶复合物、野生型游离酶混合物和随机交联酶复合物三种系统 | 生物正交蛋白配对 | 体外系统（无宿主生物） | 有序交联酶复合物（O-CLEs）用于甲羟戊酸途径的级联反应 | 工业生物技术 |
| 11 | 2026-08-21 |
Technology-driven revolution in CO2 fixation: From natural pathways to programmable Biosystems
2026-Nov, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108964
PMID:42392238
|
综述 | 本文综述了技术驱动的CO2固定领域的最新进展，聚焦于微生物转化系统，从自然途径的优化到人工生物系统的构建。 | 系统性地整合了从天然途径（如CBB循环）到人工设计途径（如rGly、CETCH、THETA循环）的进展，并强调了CRISPR-Cas系统、微生物电合成和半人工光合系统等跨学科方法的融合。 | 未详细讨论各种技术的实际应用案例和规模化挑战。 | 探讨通过代谢工程、合成生物学、电化学和纳米材料等技术的整合，实现高效、碳负性的CO2固定，以支持可持续碳负性生物制造。 | 微生物转化系统，包括碳固定微生物、异养底盘细胞和生物混合系统。 | 合成生物学、代谢工程 | NA | CRISPR-Cas系统、微生物电合成、半人工光合系统 | NA | 文献综述 | NA | CRISPR-Cas9 | 微生物 | CO2固定途径（如rGly、CETCH、THETA循环）及代谢网络重组 | 环境、工业生物技术 |
| 12 | 2026-08-21 |
Advancing synthetic biology with engineered chemically inducible gene regulatory systems
2026-Nov, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108963
PMID:42392239
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综述 | 本文系统综述了工程化化学诱导基因调控系统的最新进展，重点探讨以启动子为中心的设计原则及其在合成生物学中的应用 | 聚焦启动子中心设计，提出五个核心设计原则，并强调新兴策略如AI驱动的启动子预测、G-四链体直接作用DNA开关及工程化受体通路 | 面临诱导剂渗透性、串扰和可扩展性等挑战，未来需开发无痕诱导剂和AI辅助正交系统设计 | 总结和展望化学诱导基因调控系统在合成生物学中的设计进展和应用前景 | 化学诱导基因调控系统及其核心调控元件（诱导型启动子） | 合成生物学 | NA | 启动子重塑、转录因子工程、计算设计、高通量筛选、直接作用启动子筛选 | NA | NA | NA | NA | NA | 化学诱导启动子系统、G-四链体开关、工程化受体通路、可编程合成电路 | 生物制造、医药、生物传感器、合成电路 |
| 13 | 2026-08-21 |
Rewiring cellular immunotherapy: From CAR evolution to circuit innovations across diseases
2026-Nov, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108980
PMID:42425236
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综述 | 本文综述了CAR免疫疗法从线性受体设计向可编程免疫电路发展的历程，涵盖多种免疫细胞类型、基因递送策略及电路化设计原理。 | 将CAR免疫治疗概念化为生物信号处理系统，系统梳理从线性CAR架构到可编程免疫电路的转变，并比较不同细胞类型和递送平台。 | 未提及具体局限性。 | 总结CAR工程在多种免疫细胞和基因递送平台中的进展，并探讨电路化设计在不同疾病中的应用原则。 | CAR-T、CAR-NK、CAR-巨噬细胞等工程免疫细胞。 | 合成生物学 | 肿瘤 | 基因递送 | NA | 文献 | NA | 非病毒递送平台 | T细胞，自然杀伤细胞，巨噬细胞 | 可编程免疫电路，多输入整合，逻辑运算，上下文依赖输出 | 医学 |
| 14 | 2026-08-21 |
Plant-derived antioxidants: Biosynthesis, refining and applications
2026-Nov, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108989
PMID:42503343
|
综述 | 本文综述了植物源抗氧化剂的分类、来源、抗氧化机制、生物合成与调控、提取精炼及其在食品和医药领域的应用进展 | 整合合成生物学、绿色纯化与纳米递送策略，提出克服植物源抗氧化剂工业挑战的新见解，并强调通过多靶点调控氧化应激通路来预防慢性疾病 | 未详细说明具体实验验证或量化数据，主要基于文献综述而非原始研究 | 总结植物源抗氧化剂的最新研究进展，并探讨其在食品和医药领域的应用前景及面临的挑战 | 植物源抗氧化剂，包括多酚类、萜类、维生素、生物碱和皂苷等 | 合成生物学 | 神经退行性疾病, 病毒性疾病, 心血管疾病, 糖尿病, 癌症 | NA | NA | 文献数据 | NA | NA | NA | NA | 食品工业, 医药 |
| 15 | 2026-08-21 |
Synthetic biomanufacturing of triterpenoids: From laboratory to industry
2026-Nov, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108992
PMID:42503341
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综述 | 该综述总结了三萜类化合物的分类、生物活性、微生物合成策略及从实验室到工业规模的放大挑战 | 系统性地整合了代谢工程和合成生物学策略，包括酶优化、途径优化、区室化工程和系统生物学方法，并讨论了从实验室到工业规模放大过程中的技术经济可行性和产业前景 | 现有三萜类化合物微生物合成方法受限于生产效率、环境负担和产品多样性，且工业规模的发酵和下游处理仍需优化 | 探讨利用代谢工程和合成生物学实现三萜类化合物高效、可持续的异源生物合成，并推动其从实验室研究走向工业应用 | 三萜类化合物及其微生物合成宿主和生物合成途径 | 合成生物学、代谢工程 | NA | 代谢工程、合成生物学 | NA | 文献综述 | NA | NA | 微生物宿主（具体未指定） | 三萜类化合物的异源生物合成途径 | 医药、化妆品、食品、工业生物技术 |
| 16 | 2026-08-21 |
Converging quality by design, artificial intelligence, and biofoundry automation: A new paradigm for scalable circular biomanufacturing
2026-Nov, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.109001
PMID:42532294
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综述 | 本文综述了质量设计、人工智能和生物铸造自动化三者融合如何推动合成生物学从实验室创新走向工业化规模的循环生物制造。 | 提出将QbD、AI辅助设计和生物铸造自动化三者融合是当前阶段特征，而非单一技术，并系统分析了DBTL循环从研究工具转变为工业开发框架的过程。 | 依赖现有技术经济数据和生命周期数据，对于新兴产品可能缺乏充分对比；对监管差异的讨论主要聚焦于欧盟和美国，未能覆盖全球其他地区。 | 探讨合成生物学从实验室到工业规模循环生物制造的路径，识别未来十年需满足的条件以支持循环生物经济。 | 合成生物学产品、DBTL循环、微生物、植物和动物系统，以及欧盟和美国监管框架。 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 微生物、植物、动物细胞 | NA | 工业生物技术、环境、医药、农业 |
| 17 | 2026-08-21 |
Site-specific recombinases and their essential role in synthetic biology
2026-Nov, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.109005
PMID:42570711
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综述 | 本文系统总结了位点特异性重组酶在合成生物学中的类别、结构机制、关键特性、重组模型、工程策略及多种功能应用 | 全面整合位点特异性重组酶的基础概念与最新进展，涵盖酶分类、结构机制和工程策略的多个层面，为合成生物学工具箱提供系统性参考 | 未详细讨论位点特异性重组酶在特定应用中的潜在局限或挑战，如脱靶效应和递送效率等 | 提供位点特异性重组酶在合成生物学中的系统性综述，以推动其发现、表征和工程化应用 | 位点特异性重组酶 | 合成生物学 | NA | 重组酶介导的DNA重组 | NA | 文献数据 | NA | 位点特异性重组酶（如Cre、Flp等），用于基因组工程和基因线路设计 | 未明确指定，涉及多种宿主 | 遗传开关、DNA组装和计算设计相关的基因线路 | 工业生物技术、医学 |
| 18 | 2026-08-13 |
ROS-responsive bio-hybrid probiotics for synergistic acute lung injury therapy
2026-Nov, Colloids and surfaces. B, Biointerfaces
DOI:10.1016/j.colsurfb.2026.115903
PMID:42314510
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研究论文 | 本文报道了一种双功能工程化副干酪乳杆菌，通过合成生物学分泌白介素-4并结合材料表面修饰以清除活性氧，用于急性肺损伤的协同治疗。 | 将合成生物学与响应性材料工程相结合，构建了兼具细胞因子免疫调节和微环境响应抗氧化功能的双功能工程益生菌，实现了在炎症肺组织中的靶向递送和疗效累积。 | 摘要未提及具体局限性。 | 开发一种工程化益生菌平台，通过免疫调节和抗氧化应激协同作用，实现对急性肺损伤的有效治疗。 | 工程化副干酪乳杆菌、LPS和铜绿假单胞菌诱导的急性肺损伤小鼠模型。 | 合成生物学 | 急性肺损伤 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 副干酪乳杆菌 | 分泌白介素-4的基因回路，耦合材料表面修饰的活性氧清除功能。 | 医学 |
| 19 | 2026-06-07 |
Stimulus-responsive engineered oncolytic bacteria
2026-Nov, Biomaterials
IF:12.8Q1
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综述 | 本文综述了刺激响应性工程溶瘤细菌的最新进展，重点介绍了利用合成生物学构建的基因电路实现肿瘤特异性治疗基因表达的控制 | 系统总结了利用外源或内源性肿瘤相关信号调控细菌治疗基因表达的合成生物学策略，并探讨了程序化活体疗法在癌症治疗中的设计原理与性能权衡 | 未明确讨论临床转化中的安全性、免疫原性及长期调控稳定性等挑战 | 综述刺激响应性工程溶瘤细菌的研究进展，为开发可编程活体抗癌疗法提供设计框架 | 工程化溶瘤细菌及其基因电路系统 | 合成生物学 | 癌症 | 合成生物学基因回路 | NA | NA | NA | 合成生物学基因回路 | 细菌 | 刺激响应基因电路 | 医学 |