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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2026-09-03 |
A dual-dimensional CRISPR toolkit enables one-step high-efficiency multiplex genome editing in Komagataella phaffii
2026-Nov, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2026.102525
PMID:42595042
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研究论文 | 本研究开发了一种基于CRISPR的双维度工具包EMGES 3.0,用于在Komagataella phaffii中实现一步高效的多重基因组编辑和大片段整合 | 首次实现超长片段(>16 kb)的一步整合,效率达14.8%,并通过底盘工程和载体优化的协同作用大幅提升了编辑效率 | 未明确说明局限性,但超长片段整合效率相对较低(14.8%) | 解决K. phaffii中多重基因编辑和精确大片段整合效率低、流程繁琐的问题,推动C1生物经济工业化 | 甲醇利用型酵母Komagataella phaffii(及其工程改造菌株) | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9基因编辑 | NA | 基因组编辑效率数据、代谢产物产量数据(如游离脂肪酸、白藜芦醇) | 具体样本数未明确,涉及多个工程菌株(如Y09)的编辑效率和产物产量测试 | CRISPR-Cas9 | Komagataella phaffii(库德里阿兹威氏毕赤酵母) | 双锤头核酶-单链导向RNA-丁型肝炎病毒核酶(dHgH)介导的引导RNA表达系统 | 工业生物技术 |
| 42 | 2026-08-22 |
Recent advances in protein engineering and synthetic applications of amino acid oxidases
2026-Nov, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2026.135229
PMID:42336113
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综述 | 本文综述了氨基酸氧化酶(AAOs)的催化机制、活性测定方法,并重点介绍了蛋白质工程策略(如定向进化、理性/半理性及AI引导方法)及其在化学酶级联反应和多酶级联消旋化等合成应用中的最新进展。 | 全面分析D-和L-型AAOs的催化机制,并强调AI引导的蛋白质工程策略和化学酶级联等新兴合成应用。 | 未详细讨论AAOs的底物特异性和稳定性在实际工业应用中的具体限制。 | 总结AAOs的蛋白质工程和合成应用进展,以推动其在现代生物催化和合成生物学中的应用。 | 氨基酸氧化酶(AAOs) | 机器学习 | NA | 蛋白质工程、定向进化、理性设计、AI引导设计 | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 医药、农业化学、工业生物技术 |
| 43 | 2026-08-22 |
Bioorthogonal chemistry-driven multi-enzyme strategy for efficient terpenoid biosynthesis
2026-Nov, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2026.135232
PMID:42341954
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研究论文 | 本文开发了一种基于生物正交化学的多酶级联策略,通过构建有序交联酶复合物实现萜类化合物的高效体外合成 | 利用生物正交蛋白配对技术将六种缩短的甲羟戊酸途径酶组装成有序交联酶复合物,实现酶的空间有序排列,并通过多层荧光标记技术验证排列,该策略具有模块化和通用性 | 摘要中未提及明显局限性,可能包括体外系统稳定性或成本等问题 | 开发一种稳健、通用且可重复使用的体外多酶级联平台,用于高效合成高价值萜类化合物,推动体外合成生物学发展 | 来自缩短甲羟戊酸途径的六种酶,以及β-法尼烯合酶和紫杉二烯合酶 | 合成生物学 | NA | 生物正交化学、多层荧光标记技术、体外酶级联 | NA | 实验数据(产物浓度、酶活性) | β-法尼烯生产实验:包含有序交联酶复合物、野生型游离酶混合物和随机交联酶复合物三种系统 | 生物正交蛋白配对 | 体外系统(无宿主生物) | 有序交联酶复合物(O-CLEs)用于甲羟戊酸途径的级联反应 | 工业生物技术 |
| 44 | 2026-08-21 |
Technology-driven revolution in CO2 fixation: From natural pathways to programmable Biosystems
2026-Nov, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108964
PMID:42392238
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综述 | 本文综述了技术驱动的CO2固定领域的最新进展,聚焦于微生物转化系统,从自然途径的优化到人工生物系统的构建。 | 系统性地整合了从天然途径(如CBB循环)到人工设计途径(如rGly、CETCH、THETA循环)的进展,并强调了CRISPR-Cas系统、微生物电合成和半人工光合系统等跨学科方法的融合。 | 未详细讨论各种技术的实际应用案例和规模化挑战。 | 探讨通过代谢工程、合成生物学、电化学和纳米材料等技术的整合,实现高效、碳负性的CO2固定,以支持可持续碳负性生物制造。 | 微生物转化系统,包括碳固定微生物、异养底盘细胞和生物混合系统。 | 合成生物学、代谢工程 | NA | CRISPR-Cas系统、微生物电合成、半人工光合系统 | NA | 文献综述 | NA | CRISPR-Cas9 | 微生物 | CO2固定途径(如rGly、CETCH、THETA循环)及代谢网络重组 | 环境、工业生物技术 |
| 45 | 2026-08-21 |
Advancing synthetic biology with engineered chemically inducible gene regulatory systems
2026-Nov, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108963
PMID:42392239
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综述 | 本文系统综述了工程化化学诱导基因调控系统的最新进展,重点探讨以启动子为中心的设计原则及其在合成生物学中的应用 | 聚焦启动子中心设计,提出五个核心设计原则,并强调新兴策略如AI驱动的启动子预测、G-四链体直接作用DNA开关及工程化受体通路 | 面临诱导剂渗透性、串扰和可扩展性等挑战,未来需开发无痕诱导剂和AI辅助正交系统设计 | 总结和展望化学诱导基因调控系统在合成生物学中的设计进展和应用前景 | 化学诱导基因调控系统及其核心调控元件(诱导型启动子) | 合成生物学 | NA | 启动子重塑、转录因子工程、计算设计、高通量筛选、直接作用启动子筛选 | NA | NA | NA | NA | NA | 化学诱导启动子系统、G-四链体开关、工程化受体通路、可编程合成电路 | 生物制造、医药、生物传感器、合成电路 |
| 46 | 2026-08-21 |
Rewiring cellular immunotherapy: From CAR evolution to circuit innovations across diseases
2026-Nov, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108980
PMID:42425236
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综述 | 本文综述了CAR免疫疗法从线性受体设计向可编程免疫电路发展的历程,涵盖多种免疫细胞类型、基因递送策略及电路化设计原理。 | 将CAR免疫治疗概念化为生物信号处理系统,系统梳理从线性CAR架构到可编程免疫电路的转变,并比较不同细胞类型和递送平台。 | 未提及具体局限性。 | 总结CAR工程在多种免疫细胞和基因递送平台中的进展,并探讨电路化设计在不同疾病中的应用原则。 | CAR-T、CAR-NK、CAR-巨噬细胞等工程免疫细胞。 | 合成生物学 | 肿瘤 | 基因递送 | NA | 文献 | NA | 非病毒递送平台 | T细胞,自然杀伤细胞,巨噬细胞 | 可编程免疫电路,多输入整合,逻辑运算,上下文依赖输出 | 医学 |
| 47 | 2026-08-21 |
Plant-derived antioxidants: Biosynthesis, refining and applications
2026-Nov, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108989
PMID:42503343
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综述 | 本文综述了植物源抗氧化剂的分类、来源、抗氧化机制、生物合成与调控、提取精炼及其在食品和医药领域的应用进展 | 整合合成生物学、绿色纯化与纳米递送策略,提出克服植物源抗氧化剂工业挑战的新见解,并强调通过多靶点调控氧化应激通路来预防慢性疾病 | 未详细说明具体实验验证或量化数据,主要基于文献综述而非原始研究 | 总结植物源抗氧化剂的最新研究进展,并探讨其在食品和医药领域的应用前景及面临的挑战 | 植物源抗氧化剂,包括多酚类、萜类、维生素、生物碱和皂苷等 | 合成生物学 | 神经退行性疾病, 病毒性疾病, 心血管疾病, 糖尿病, 癌症 | NA | NA | 文献数据 | NA | NA | NA | NA | 食品工业, 医药 |
| 48 | 2026-08-21 |
Synthetic biomanufacturing of triterpenoids: From laboratory to industry
2026-Nov, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108992
PMID:42503341
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综述 | 该综述总结了三萜类化合物的分类、生物活性、微生物合成策略及从实验室到工业规模的放大挑战 | 系统性地整合了代谢工程和合成生物学策略,包括酶优化、途径优化、区室化工程和系统生物学方法,并讨论了从实验室到工业规模放大过程中的技术经济可行性和产业前景 | 现有三萜类化合物微生物合成方法受限于生产效率、环境负担和产品多样性,且工业规模的发酵和下游处理仍需优化 | 探讨利用代谢工程和合成生物学实现三萜类化合物高效、可持续的异源生物合成,并推动其从实验室研究走向工业应用 | 三萜类化合物及其微生物合成宿主和生物合成途径 | 合成生物学、代谢工程 | NA | 代谢工程、合成生物学 | NA | 文献综述 | NA | NA | 微生物宿主(具体未指定) | 三萜类化合物的异源生物合成途径 | 医药、化妆品、食品、工业生物技术 |
| 49 | 2026-08-21 |
Converging quality by design, artificial intelligence, and biofoundry automation: A new paradigm for scalable circular biomanufacturing
2026-Nov, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.109001
PMID:42532294
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综述 | 本文综述了质量设计、人工智能和生物铸造自动化三者融合如何推动合成生物学从实验室创新走向工业化规模的循环生物制造。 | 提出将QbD、AI辅助设计和生物铸造自动化三者融合是当前阶段特征,而非单一技术,并系统分析了DBTL循环从研究工具转变为工业开发框架的过程。 | 依赖现有技术经济数据和生命周期数据,对于新兴产品可能缺乏充分对比;对监管差异的讨论主要聚焦于欧盟和美国,未能覆盖全球其他地区。 | 探讨合成生物学从实验室到工业规模循环生物制造的路径,识别未来十年需满足的条件以支持循环生物经济。 | 合成生物学产品、DBTL循环、微生物、植物和动物系统,以及欧盟和美国监管框架。 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 微生物、植物、动物细胞 | NA | 工业生物技术、环境、医药、农业 |
| 50 | 2026-08-21 |
Site-specific recombinases and their essential role in synthetic biology
2026-Nov, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.109005
PMID:42570711
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综述 | 本文系统总结了位点特异性重组酶在合成生物学中的类别、结构机制、关键特性、重组模型、工程策略及多种功能应用 | 全面整合位点特异性重组酶的基础概念与最新进展,涵盖酶分类、结构机制和工程策略的多个层面,为合成生物学工具箱提供系统性参考 | 未详细讨论位点特异性重组酶在特定应用中的潜在局限或挑战,如脱靶效应和递送效率等 | 提供位点特异性重组酶在合成生物学中的系统性综述,以推动其发现、表征和工程化应用 | 位点特异性重组酶 | 合成生物学 | NA | 重组酶介导的DNA重组 | NA | 文献数据 | NA | 位点特异性重组酶(如Cre、Flp等),用于基因组工程和基因线路设计 | 未明确指定,涉及多种宿主 | 遗传开关、DNA组装和计算设计相关的基因线路 | 工业生物技术、医学 |
| 51 | 2026-08-13 |
ROS-responsive bio-hybrid probiotics for synergistic acute lung injury therapy
2026-Nov, Colloids and surfaces. B, Biointerfaces
DOI:10.1016/j.colsurfb.2026.115903
PMID:42314510
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研究论文 | 本文报道了一种双功能工程化副干酪乳杆菌,通过合成生物学分泌白介素-4并结合材料表面修饰以清除活性氧,用于急性肺损伤的协同治疗。 | 将合成生物学与响应性材料工程相结合,构建了兼具细胞因子免疫调节和微环境响应抗氧化功能的双功能工程益生菌,实现了在炎症肺组织中的靶向递送和疗效累积。 | 摘要未提及具体局限性。 | 开发一种工程化益生菌平台,通过免疫调节和抗氧化应激协同作用,实现对急性肺损伤的有效治疗。 | 工程化副干酪乳杆菌、LPS和铜绿假单胞菌诱导的急性肺损伤小鼠模型。 | 合成生物学 | 急性肺损伤 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 副干酪乳杆菌 | 分泌白介素-4的基因回路,耦合材料表面修饰的活性氧清除功能。 | 医学 |
| 52 | 2026-06-07 |
Stimulus-responsive engineered oncolytic bacteria
2026-Nov, Biomaterials
IF:12.8Q1
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综述 | 本文综述了刺激响应性工程溶瘤细菌的最新进展,重点介绍了利用合成生物学构建的基因电路实现肿瘤特异性治疗基因表达的控制 | 系统总结了利用外源或内源性肿瘤相关信号调控细菌治疗基因表达的合成生物学策略,并探讨了程序化活体疗法在癌症治疗中的设计原理与性能权衡 | 未明确讨论临床转化中的安全性、免疫原性及长期调控稳定性等挑战 | 综述刺激响应性工程溶瘤细菌的研究进展,为开发可编程活体抗癌疗法提供设计框架 | 工程化溶瘤细菌及其基因电路系统 | 合成生物学 | 癌症 | 合成生物学基因回路 | NA | NA | NA | 合成生物学基因回路 | 细菌 | 刺激响应基因电路 | 医学 |