合成生物学相关文章
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当前共找到 15 篇文献。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-06-23 |
Metabolic engineering of Vibrio natriegens for the efficient biosynthesis of ergothioneine from sucrose using non-sterile fed-batch fermentation
2026-Dec, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2026.04.041
PMID:42325659
|
研究论文 | 通过代谢工程改造快速生长的Vibrio natriegens，从蔗糖高效合成麦角硫因并采用非无菌补料分批发酵 | 首次成功在Vibrio natriegens中构建麦角硫因生物合成途径，并利用低蔗糖成本、高盐度非无菌条件实现高效生产 | Vibrio natriegens的转化效率低、基因编辑方法有限以及发酵成本高仍是主要挑战 | 建立基于Vibrio natriegens的高效经济平台，用于麦角硫因及其他高价值化合物的生物合成 | 快速生长的Vibrio natriegens菌株 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9基因编辑、电穿孔转化、补料分批发酵 | NA | NA | 2-L生物反应器中的补料分批发酵 | CRISPR-Cas9 | Vibrio natriegens | 麦角硫因生物合成途径（包括超强P启动子与弱RBS7组合，以及副产物和ATP降解基因的敲除、SAM循环和ATP合成基因的过表达） | 工业生物技术、医药 |
| 2 | 2026-06-23 |
Streptomyces: boost chassis strains for production of invaluable natural products
2026-Dec, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2026.05.005
PMID:42325658
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综述 | 综述2020-2025年间链霉菌底盘工程的前沿进展，探讨其成为高效天然产物生产平台的策略与未来方向 | 提出5M策略（机制-模型-操控-测量-制造），将底盘工程重构为基于工程原理的迭代系统级过程，并融合AI设计工具、多重基因组编辑等新兴技术 | NA | 系统总结链霉菌底盘工程关键策略（如基因组精简、前体重分配、调控电路重编程等），为天然产物高产提供结构化路线图 | 链霉菌底盘菌株 | 合成生物学 | NA | 基因组编辑技术 | NA | NA | 约150个案例（2020-2025年文献） | CRISPR-Cas9, TALEN | 链霉菌 | 代谢通路重编程，逻辑门 | 生物技术，工业生物技术 |
| 3 | 2026-06-16 |
Engineered bacteria in disease diagnosis and therapy: A synthetic biology perspective
2026-Dec, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2026.04.028
PMID:42293685
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综述 | 这篇综述从合成生物学角度总结了工程菌在疾病诊断和治疗中的应用进展 | 系统梳理了合成生物学技术（如CRISPR/Cas9、DNA组装、定向进化及人工智能集成）如何赋能工程菌作为“活体传感器”和定制化治疗载体，并讨论了提升安全性和有效性的工程策略 | 工程菌的临床转化仍面临稳定定植、免疫原性控制、大规模生产标准化及监管伦理框架等挑战 | 优化细菌功能以拓展其在诊断和精准医学中的潜力 | 工程菌 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9, DNA组装, 定向进化, 人工智能 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 细菌 | 生物传感器, 靶向药物递送, 免疫调控, 微生物组调节 | 医学 |
| 4 | 2026-06-13 |
Growth factor applications and clinical translation: advances and challenges
2026-12, Annals of medicine
IF:4.9Q1
DOI:10.1080/07853890.2026.2642893
PMID:41837883
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综述 | 系统梳理生长因子在再生医学、肿瘤学及代谢调控领域的应用进展与临床转化挑战 | 综合分析了生长因子临床转化的多重瓶颈（药代动力学缺陷、脱靶效应、安全性问题），并系统总结了蛋白工程优化、智能响应递送系统（如细胞外囊泡平台）及多因子时序释放技术等解决方案 | 高通量大规模生产工艺成本高、体内微环境复杂性限制转化广度，未来需聚焦可扩展递送平台开发及合成生物学降本 | 为加速下一代生长因子疗法开发提供路线图和技术参考 | 生长因子在神经退行性疾病、骨再生、代谢紊乱中的临床应用案例 | 数字病理学 | 神经退行性疾病, 骨再生, 代谢紊乱 | 蛋白工程, 化学修饰, 智能响应递送系统, 细胞外囊泡平台, 多因子时序释放技术 | NA | 文献数据 | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 5 | 2026-06-09 |
Leveraging the bacteria for enhanced cancer immunotherapy: from a perspective of synthetic biology
2026-Dec-31, Cancer biology & therapy
IF:4.4Q2
DOI:10.1080/15384047.2026.2683171
PMID:42240055
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review | 综述了合成生物学在细菌介导的癌症免疫治疗中的最新进展，重点介绍工程细菌如何激活免疫系统及实现肿瘤靶向的策略 | 系统总结了利用合成生物学改造细菌以表达免疫治疗剂、增强肿瘤靶向性及直接递送治疗载荷的创新策略，并探讨了缺氧响应启动子、细菌群集运动和细胞外囊泡等前沿技术 | 未提及该领域的未来挑战或当前研究的局限性 | 回顾合成生物学在细菌癌症免疫治疗中的研究进展，聚焦免疫激活机制与工程策略 | 工程化细菌作为癌症免疫治疗剂 | 合成生物学 | 癌症 | NA | NA | NA | NA | NA | 细菌 | 表达免疫治疗剂的合成回路、缺氧响应启动子、细菌群集运动工程 | 医学 |
| 6 | 2026-06-06 |
Autoinducer 2 as a universal language in microbial consortia: decoding molecular mechanisms, ecological impacts, and application
2026-Dec-31, Gut microbes
IF:12.2Q1
DOI:10.1080/19490976.2026.2615494
PMID:41574816
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综述 | 系统综述AI-2的双重结构动态、受体多样性及其在菌群互作中的调控机制 | 首次系统整合AI-2双重结构动态（S-THMF-硼酸盐/R-THMF互变）及其在细菌间通讯中的环境依赖性角色，并梳理受体多样性（如LuxP与LsrB）及信号传导机制 | 未深入探讨空间异质性对AI-2介导通讯的影响及多群体感应系统协调的机制 | 解码AI-2作为通用语言在菌群通讯中的作用，并绘制其在化学工程与环境可持续性中的应用路线 | AI-2信号分子及其介导的微生物群落互作 | 微生物组学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 健康, 农业, 工业, 环境生态 |
| 7 | 2026-06-06 |
Melatonin-enabled omics: understanding plant responses to single and combined abiotic stresses for climate-smart agriculture
2026-Dec, GM crops & food
DOI:10.1080/21645698.2026.2614130
PMID:41589633
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综述 | 本文综述了褪黑素在基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学等多组学层面调控植物应对单一和复合非生物胁迫的机制，并探讨了多组学整合（泛组学）方法及遗传工程和合成生物学在气候变化智慧农业中的应用潜力 | 首次系统整合褪黑素在多组学层面（基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学、miRNA组学、表观基因组学、表型组学、离子组学、微生物组学）调控植物非生物胁迫耐受性的机制，并强调多组学交叉和泛组学方法的应用 | 作为综述，未提供新的实验数据，且各研究间方法、物种和胁迫条件差异较大，限制了结论的直接可比性 | 阐明褪黑素通过多组学调控植物应对单一和复合非生物胁迫的机制，并为培育气候智慧型作物提供策略 | 植物在单一和复合非生物胁迫下的多组学响应 | 机器学习 | NA | 多组学技术（基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学、miRNA组学、表观基因组学、表型组学、离子组学、微生物组学） | NA | 多组学数据 | NA | 遗传工程、合成生物学 | 植物 | NA | 农业 |
| 8 | 2026-06-02 |
Eukaryotic cell-free protein synthesis: Chassis diversification, system engineering, and emerging applications
2026-Dec, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2026.04.022
PMID:42221684
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综述 | 从系统工程角度全面综述和分析真核无细胞蛋白质合成系统的最新进展，涵盖底盘多样化、系统设计和新兴应用 | 从系统工程视角综合分析底盘多样化、核心反应组件理性设计，并探讨人工智能和合成生物学工具在突破标准化和成本瓶颈中的应用潜力 | 当前标准化和成本瓶颈仍阻碍工业化进程，需通过人工智能和合成生物学工具进一步优化 | 为构建经济、高通量的真核无细胞生物制造平台提供理论参考和实践指导 | 真核无细胞蛋白质合成系统 | NA | NA | 无细胞蛋白质合成 | NA | NA | NA | NA | 真核生物底盘 | NA | 人工细胞构建、生物电子接口开发、微阵列芯片设计 |
| 9 | 2026-05-31 |
Unconditional de novo generation and functional validation of synthetic promoters with a diffusion model
2026-Dec, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2026.04.023
PMID:42212299
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研究论文 | 提出一种名为DiPro的无条件扩散模型，用于从头生成合成启动子序列，并通过实验验证其功能 | 首次将无条件扩散模型应用于启动子设计，无需条件输入即可生成新序列，结合inpainting引导生成相位特异性启动子，实现了高结构保真度和功能验证 | 研究仅聚焦于50-bp核心启动子区域，未探索更长的调控区域；实验验证仅基于大肠杆菌，通用性需进一步验证 | 开发一种生成式框架，用于创建具有可编程时序动力学的功能性细菌启动子 | 细菌启动子序列（合成启动子） | 机器学习 | 不适用 | 扩散模型 | Transformer | 序列 | 5000个候选启动子序列，其中81个经实验验证 | 不适用 | 大肠杆菌 | 相位特异性启动子驱动的裂解蛋白回路 | 合成生物学, 代谢工程 |
| 10 | 2026-05-31 |
Defense-associated reverse transcriptases define an emerging class of noncanonical DNA-writing systems
2026-Dec, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2026.05.001
PMID:42212300
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综述 | 防御相关逆转录酶定义了新兴的非经典DNA写入系统类别 | 揭示DRT不仅仅是RNA到DNA的复制蛋白，而是作为DNA构建模块，能够生成多种非经典DNA产物，包括从头基因组装cDNA、随机单链DNA、DNA同聚物、富含poly(A)的cDNA和蛋白模板化二核苷酸重复DNA，并展示了RNA模板化与蛋白模板化合成在单一防御途径中的结合机制 | 具体局限性未在摘要中提及，可能包括对DRT酶新型反应机制的全面理解仍处于早期阶段，以及其生物学功能和生态意义尚未完全阐明 | 阐明防御相关逆转录酶作为DNA写入系统的机制，探索其在合成生物学和核酸工程中的潜在应用 | 细菌的防御相关逆转录酶（DRTs），特别关注DRT3的合成途径 | 机器学 | NA | 逆转录技术、DNA合成 | NA | NA | NA | NA | 细菌 | 非经典DNA写入系统（包括从头基因组装、随机单链DNA生成、DNA同聚物合成等） | 合成生物学，核酸工程 |
| 11 | 2026-05-26 |
Development of an efficient genome editing system using recombinase-mediated cassette exchange in E. coli Nissle 1917 for large gene cluster integration and heterologous astaxanthin production
2026-Dec, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2026.04.020
PMID:42182969
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研究论文 | 通过优化电转和重组酶介导的盒式交换，在Nissle 1917中建立了高效基因编辑系统，用于大基因簇整合和异源虾青素生产 | 首次在EcN中系统优化电转条件和RMCE系统，实现了大片段（29 kb）基因簇的高效整合，并成功用于异源虾青素生产 | 未详细评估RMCE系统在长期培养中的稳定性及对宿主细胞生长的影响 | 建立高效的EcN基因编辑系统以促进异源天然产物合成 | 大肠杆菌Nissle 1917（EcN） | 合成生物学 | NA | 重组酶介导的盒式交换（RMCE）、电穿孔 | NA | DNA | NA | CRISPR-Cas9（未明确提及，但RMCE依赖重组酶） | 大肠杆菌Nissle 1917（EcN） | 虾青素生物合成操纵子 | 工业生物技术、医学 |
| 12 | 2026-05-16 |
Evaluating Malat1-derived 3'end sequences for functional transgene expression in human cells using synthetic mRNA delivery
2026-Dec, RNA biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1080/15476286.2026.2670832
PMID:42093635
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研究论文 | 评估利用长链非编码RNA MALAT1来源的3'端序列替代poly(A)尾实现人类细胞中转基因表达的功能 | 首次系统比较了MALAT1来源的三螺旋结构与经典poly(A)尾在合成mRNA表达中的功能差异 | MALAT1来源序列的表达效率始终低于经典poly(A)尾，需优化三螺旋序列和折叠以增强翻译能力 | 探索poly(A)尾的替代策略，用于合成生物学和RNA治疗中的功能性转基因表达 | MALAT1来源的3'端序列基序与经典poly(A)尾 | 分子生物学 | NA | 合成mRNA递送 | NA | NA | NA | NA | 人细胞 | NA | 合成生物学, RNA治疗 |
| 13 | 2026-04-23 |
iFLinkC-EZ: A scalable and automatable method for the assembly of complex fusion proteins and multi-gene expression constructs based on the iFLinkC framework
2026-Dec, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2026.03.008
PMID:42006855
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研究论文 | 本文介绍了一种基于iFLinkC框架的可扩展且可自动化的方法iFLinkC-EZ，用于组装复杂融合蛋白和多基因表达构建体 | iFLinkC-EZ通过遗传手段纯化DNA组装产物，简化了组装过程并使其兼容机器人自动化，克服了传统方法需要物理纯化DNA片段的限制 | NA | 开发一种标准化框架，用于组装任意大小和复杂度的蛋白质编码序列和多基因表达构建体 | 融合蛋白和多基因表达构建体，包括单色和多色多荧光融合蛋白以及多顺反子表达构建体 | 合成生物学 | NA | 迭代功能性连接子克隆（iFLinkC） | NA | NA | NA | Golden Gate Assembly | 酵母 | 合成蛋白开关、传感器、多酶复合物以及由此组成的遗传电路和代谢途径 | 生物技术 |
| 14 | 2026-04-21 |
Functional identification of key enzymes in calycosin biosynthesis in Astragalus membranaceus and establishment of heterologous expression system
2026-Dec, Pharmaceutical science advances
DOI:10.1016/j.pscia.2026.100118
PMID:42005051
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研究论文 | 本研究鉴定了黄芪中毛蕊异黄酮生物合成的三个关键酶，并成功在酵母和烟草中建立了异源表达系统 | 揭示了毛蕊异黄酮的新型合成途径，发现AmOMT2的多功能性拓宽了AmIFS的底物范围 | NA | 阐明黄芪中毛蕊异黄酮的生物合成途径并建立异源生产系统 | 黄芪（Astragalus membranaceus）及其关键生物合成酶 | 合成生物学 | NA | 异源表达、组织特异性表达分析 | NA | NA | NA | 异源表达系统 | 酵母, 烟草 | 毛蕊异黄酮生物合成途径（涉及AmIFS、AmOMT2、AmI3'H三个关键酶） | 医药 |
| 15 | 2026-01-05 |
The role of gut microbiome in aging-associated diseases: where do we stand now and how technology will transform the future
2026-Dec-31, Gut microbes
IF:12.2Q1
DOI:10.1080/19490976.2025.2607076
PMID:41454672
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综述 | 本文综述了肠道微生物组在衰老相关疾病中的作用，并探讨了新兴技术如何推动该领域的研究和干预措施开发 | 提出了整合微生物组科学、衰老生物学和新兴技术的PRIME框架，为推进精准医学和促进健康老龄化提供了全面蓝图 | NA | 探讨肠道微生物组在衰老相关疾病中的作用，以及如何利用技术推动相关研究和临床干预 | 肠道微生物组及其与衰老相关疾病的关联 | NA | 衰老相关疾病（包括感染性疾病、自身免疫病、神经退行性疾病、精神疾病、癌症、代谢性疾病、肾脏疾病、心血管疾病、骨骼和肌肉疾病等） | 功能多组学、合成生物学、人工智能驱动分析、生物样本库、自体粪便微生物群移植 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |