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当前共找到 37 篇文献,本页显示第 1 - 20 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 工程工具 宿主生物 回路设计 应用领域
1 2026-11-04
Engineering CAR-T cell therapies for digestive tract cancer: advances, challenges, and strategies to overcome tumor heterogeneity and immunosuppressive barriers
2026-Dec, Neoplasia (New York, N.Y.)
综述 系统总结CAR-T细胞疗法在消化道肿瘤中面临的抗原异质性、免疫抑制微环境等瓶颈及应对策略 采用挑战-解决方案范式,整合前沿临床数据,提出未来转化开发的系统性优化路线图 抗原丢失、生产可扩展性和临床反应不一致等未解决问题仍需依赖γδT平台、合成生物学和通用CAR设计来攻克 综述CAR-T细胞疗法在消化道肿瘤中的进展、挑战及克服肿瘤异质性和免疫抑制屏障的策略 消化道肿瘤(胃癌、结直肠癌、食管癌)及CAR-T细胞疗法 肿瘤免疫治疗 消化道肿瘤 CAR-T细胞疗法 NA 文本 NA NA NA 双靶点CAR、细胞因子表达构建体、逻辑门控受体 医学
2 2026-10-26
Unveiling the Molecular Secrets of Seaweeds: A Comprehensive Review of Bioinformatics Applications in Algal Research
2026-Dec, Omics : a journal of integrative biology IF:2.2Q3
综述 综述海藻研究中生物信息学应用,涵盖基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学、微生物组和功能基因组学及多组学整合、基因编辑、人工智能和合成生物学等新兴策略 系统整合海藻多组学与生物信息学工具数据库,并聚焦人工智能、机器学习、基因编辑和合成生物学等新兴策略对海藻研究的重塑作用 基因组资源不完整、数据标准化不足,且计算预测缺乏实验验证 概述生物信息学在海藻研究中的应用,推动海藻生物学的系统层面理解及其向可持续生物技术和海洋生物经济应用的转化 海藻 生物信息学 NA 高通量测序, 生物信息学, 多组学, 基因组编辑, 人工智能, 机器学习, 合成生物学 NA 组学数据, 文本 NA 基因编辑 海藻 NA 医学, 农业, 能源, 食品, 工业生物技术
3 2026-10-25
CEM 2.0: Co-evolution-guided mining of superior extremophilic proteins via a curated proteome database and protein language model
2026-Dec, Engineering microbiology
研究论文 提出CEM 2.0框架,通过整合极端微生物蛋白质组数据库、基于ProteinBERT的多维评估器和交互式挖掘流程,实现不依赖模板的极端微生物蛋白质挖掘 不依赖预定义模板和领域知识,利用共进化引导和蛋白质语言模型实现全蛋白质宇宙的极端微生物蛋白质挖掘 仅通过湿实验和已发表研究的计算验证,未进行大规模实验筛选;数据库覆盖六种极端特征可能不全面 开发不依赖现有模板的极端微生物蛋白质挖掘方法,全面探索全蛋白质宇宙中的功能性极端微生物蛋白质 极端微生物蛋白质 机器学习 NA 蛋白质语言模型、共进化分析 ProteinBERT 蛋白质序列 NA NA NA NA 医学, 工业生物技术, 合成生物学
4 2026-10-25
Microbial shaping of fermented dairy product quality: formation mechanisms and regulatory strategies for texture, flavor, and functionality
2026-Dec-01, Food research international (Ottawa, Ont.)
综述 本文综述了微生物如何调控发酵乳制品(酸奶、奶酪、酸奶油)的质构、风味和功能特性的形成机制,并探讨了基于基因编辑、合成生物学和AI驱动过程控制的调控策略 通过跨产品比较微生物作用机制,提出从经验实践向可预测、设计导向的发酵乳制品制造转型的框架 作为综述性文章,未提供原始实验数据验证所提出的调控策略 阐明微生物调控发酵乳制品质构、风味和功能代谢物合成的机制,并讨论合理设计微生物功能和精准发酵管理的新兴策略 发酵乳制品(酸奶、奶酪、酸奶油)及其微生物代谢活动 食品微生物学 NA NA NA 文本 NA 基因编辑, 合成生物学 NA NA 食品, 医学
5 2026-10-25
From bioreactor to table: reinventing future protein supply through cellular agriculture
2026-Dec-01, Food research international (Ottawa, Ont.)
综述 系统综述细胞培养肉和精密发酵两条细胞农业核心路径的技术进展、产业化挑战与未来前景 将细胞培养肉与精密发酵两条路径纳入统一分析框架,并强调智能化与自动化作为从菌株筛选到生物工艺优化的关键催化剂,同时深入考察感官特征、消费者心理与监管框架等市场社会因素 作为综述文章未提供原始实验数据,成本、技术与公众认知方面的挑战仍然存在,细胞农业目前定位为传统蛋白质系统的补充而非替代 系统审视细胞农业中细胞培养肉与精密发酵的技术进步、产业化瓶颈及未来发展方向 细胞培养肉、精密发酵及其生产的肉类、乳制品和蛋类等替代蛋白产品 细胞农业、食品生物技术、合成生物学 NA 细胞培养、精密发酵、合成生物学工程化细胞工厂 NA 文献 NA 合成生物学 NA 高效细胞工厂(代谢工程改造的微生物细胞工厂) 食品、工业生物技术
6 2026-10-25
Lactic acid bacteria bacteriocins: From antimicrobial mechanisms to next-generation applications in the food industry
2026-Dec-01, Food research international (Ottawa, Ont.)
综述 系统综述乳酸菌细菌素的分类、作用机制及其在食品工业中的应用,并探讨基因组学、合成生物学和计算设计驱动的新一代发展方向 整合基因组挖掘工具(如antiSMASH)、CRISPR代谢工程、机器学习活性预测、生成式AI从头设计肽以及刺激响应材料等前沿技术,提出从发现到生产、设计到应用的完整发展路径 乳酸菌细菌素面临产量低、纯化成本高、抗菌谱窄以及在复杂食品基质中不稳定等商业化挑战 为乳酸菌细菌素从有前景的天然产物发展为多功能新一代食品保鲜工具提供指导 乳酸菌细菌素(核糖体合成的抗菌肽) 合成生物学, 食品科学, 计算生物学 NA 基因组挖掘, CRISPR, 机器学习, 生成式人工智能, 计算设计 机器学习, 生成式AI 文本 NA CRISPR-Cas9, antiSMASH 乳酸菌 NA 食品, 医药
7 2026-10-11
Rhizosphere engineering 2.0: Predictive microbiome design for climate-resilient agriculture, sustainable food production, and global food security
2026-Dec, Plant science : an international journal of experimental plant biology IF:4.2Q1
综述 本文提出根际工程2.0(RE 2.0)框架,整合系统生物学、多组学、生态网络分析、合成生物学、人工智能和精准农业,以预测和设计根际微生物组的组成与功能,从而提升作物生产力、气候韧性和全球粮食安全 提出根际工程2.0(RE 2.0)这一预测性、系统级框架,强调在田间部署前预测和设计微生物组组成与功能,而非传统的试错法筛选接种剂;整合了多组学、生态网络分析、合成生物学、AI和数字孪生等前沿技术 生态复杂性、引入微生物在田间的持久性差、植物-微生物组信号传导机制理解不完整,以及生物安全和监管限制等转化挑战 提出并评估根际工程2.0框架,通过预测性微生物组设计推动可持续农业集约化、气候韧性、土壤修复和全球粮食安全 植物根际、土壤微生物组、植物-土壤-微生物组全息生物体 机器学习, 合成生物学, 精准农业 NA 多组学, 生态网络分析, 合成生物学, 人工智能, 数字孪生, CRISPR NA 多组学数据, 生态网络数据 NA CRISPR-Cas9 植物, 微生物 合成微生物群落(SynComs), 根系分泌物工程, 代谢通路设计 农业, 环境
8 2026-10-06
Evaluating Malat1-derived 3'end sequences for functional transgene expression in human cells using synthetic mRNA delivery
2026-12, RNA biology IF:3.6Q2
研究论文 本文评估了基于Malat1衍生的3'端序列元件替代poly(A)尾的策略,通过合成mRNA递送在人类细胞中实现功能性转基因表达 首次系统比较Malat1衍生的3'端基序与经典poly(A)尾在合成报告RNA中的翻译效率,并探索三螺旋结构作为poly(A)替代方案的可行性 测试的Malat1衍生基序虽然能支持报告mRNA的翻译,但其效率始终低于经典poly(A)尾;未来需要优化三螺旋序列和折叠、测试更多三螺旋结构并探索小分子调控含三螺旋RNA的稳定性和翻译 评估基于Malat1衍生3'端序列替代poly(A)尾的策略,以探索其在合成生物学和RNA治疗中的应用潜力 编码绿色荧光蛋白的合成报告RNA,包含Malat1衍生的3'端基序或经典poly(A)尾 合成生物学 NA 合成mRNA递送 NA NA NA NA 人类细胞 NA 医学,合成生物学
9 2026-10-04
Gram-scale production of forskolin in yeast through biosynthetic network elucidation and pathway optimization
2026-Dec, Bioresource technology IF:9.7Q1
研究论文 本研究阐明了佛司可林的生物合成网络,并在酵母中重建了高效合成途径,通过多维工程策略实现了克级生产 阐明了涉及三个P450介导多位点氧化的佛司可林生物合成网络,并通过多维工程策略在酵母中实现了迄今为止最高产量的佛司可林(2.7 g/L) 下游途径中细胞色素P450的低催化活性以及复杂代谢网络的调控仍是挑战 在酵母中实现佛司可林的可持续、高效生产 佛司可林生物合成途径及酿酒酵母生产菌株 合成生物学 骨质疏松、心血管疾病、代谢综合征 合成生物学、代谢工程、发酵优化 NA NA NA NA 酿酒酵母 佛司可林生物合成途径 医药、营养保健品
10 2026-10-04
Engineering programmable floating wetlands: synthetic biology, sensing, and AI control for water quality
2026-Dec, Bioresource technology IF:9.7Q1
综述 本文综述了漂浮处理湿地(FTWs)的生物强化证据,并提出了通过合成生物学、传感和人工智能控制实现可编程漂浮湿地以改善水质的转化路线图 提出了可编程漂浮湿地的概念,整合合成生物学、传感和AI控制,强调近期决策支持而非全自动控制,并提出了报告和治理指标 对于某些化合物(如PFAS),破坏性转化很少被证实;存在冲刷、群落逆转、抑制性中间产物和不确定的长期生态效应等失败模式 综合FTWs及相关湿地中营养物质、金属、碳氢化合物、药物、抗生素、微塑料和新兴污染物(如PFAS)的生物强化证据,并规划可编程FTWs的转化路线图 漂浮处理湿地(FTWs)及相关湿地,包括植物-微生物伙伴关系、根际工程和生物膜 环境生物技术 NA 多组学、合成生物学、传感、AI控制、电化学增强(如湿地微生物燃料电池、电氧化、电混凝) NA 文本 NA NA NA NA 环境, 医学
11 2026-10-04
Engineering Naematelia aurantialba as a Robust Synthetic Biology Chassis: Stable Episomal Vector Construction and Metabolic Optimization for Enhanced Polysaccharide Synthesis
2026-Dec, Bioresource technology IF:9.7Q1
研究论文 本研究为金黄银耳(Naematelia aurantialba)建立了稳定的附加体遗传平台,通过鉴定微小点着丝粒核心元件实现自主附加体复制,并结合密码子优化和VHb异源表达提升多糖产量 首次在金耳中鉴定了一个475 bp的微小点着丝粒核心元件,实现了稳定的自主附加体复制,解决了转化子遗传嵌合和荧光异质性问题;同时完成了全基因组密码子偏好性分析并进行密码子优化 研究主要基于单一菌株NX-20,该附加体系统在其他金耳菌株或其他非模式担子菌中的通用性尚需进一步验证 为金黄银耳建立高效的遗传操作平台,解决缺乏遗传工具的问题,并通过代谢工程提升多糖产量 金黄银耳(Naematelia aurantialba)NX-20菌株 合成生物学 NA 原生质体转化、全基因组密码子偏好性分析、附加体载体构建、搅拌罐生物反应器发酵 NA 基因组序列、发酵产量数据 NA NA 金黄银耳(Naematelia aurantialba) 含475 bp微小点着丝粒核心元件的附加体型表达载体,用于VHb异源表达 工业生物技术、医药
12 2026-10-01
Filamentous bacteriophage M13: Structure, biology, and biotechnological applications
2026-Dec, Biotechnology advances IF:12.1Q1
综述 该综述系统总结了丝状噬菌体M13的结构生物学、感染动态以及其在纳米技术、合成生物学和临床医学中的工程化应用 将基础病毒学与应用材料科学相桥接,整合了M13的物理和遗传结构、生产纯化方法以及化学-遗传工具箱,并指出了临床和工业转化的瓶颈及未来路线图 作为综述,未提供原始实验数据,主要基于已有文献的总结和分析 全面阐述M13噬菌体平台的结构、生物学特性及其生物技术应用,识别当前转化瓶颈并提供下一代基于M13的生物技术路线图 丝状噬菌体M13 合成生物学, 纳米技术 NA 噬菌体展示 NA 文本 NA NA NA NA 医学, 能源, 材料
13 2026-10-01
Advances and challenges in building microbial cell factories for phytohormone biomanufacturing toward sustainable agriculture
2026-Dec, Biotechnology advances IF:12.1Q1
综述 该综述系统总结了主要植物激素的分类、生物功能和生物合成途径,重点介绍了利用微生物细胞工厂生产植物激素的合成生物学策略,并探讨了自动化、机器学习和人工智能在加速微生物细胞工厂开发中的应用 系统整合了植物激素微生物细胞工厂构建的多维度合成生物学策略(包括启动子工程、辅因子工程、转运蛋白工程、动态调控、细胞色素P450工程、亚细胞区室化、蛋白质工程及自动化和人工智能工程),并从高效产物回收、先进合成生物学工具开发和AI赋能生物制造三个视角提出了未来方向 异源表达的细胞色素P450活性低,亚细胞区室化复杂,植物激素微生物生产的工业化仍面临挑战 探讨利用微生物细胞工厂进行植物激素生物制造的进展与挑战,推动可持续农业发展 主要植物激素(脱落酸、赤霉素、茉莉酸、水杨酸、生长素等)及其微生物细胞工厂 合成生物学 NA 合成生物学 机器学习, 人工智能 文本 NA NA 微生物 代谢途径, 启动子工程, 辅因子工程, 转运蛋白工程, 动态调控, 细胞色素P450工程, 亚细胞区室化 农业, 工业生物技术
14 2026-09-26
Beyond direct pathway engineering: reprogramming Fusarium fujikuroi from a GA3 producer into a GA4+7 factory
2026-Dec, Bioresource technology IF:9.7Q1
研究论文 本研究提出了一种双干预范式,通过引入拟南芥来源的转运蛋白和过表达Ppt1实现转录后沉默,将藤仓镰刀菌从GA3生产者重编程为GA4+7工厂 提出了一种非传统的间接代谢重编程策略,不通过直接改造代谢途径,而是靶向膜转运瓶颈并利用假定的转录后沉默机制,实现了GA4+7的专一性生产 文中未明确提及研究局限性 将工业真菌藤仓镰刀菌从默认的GA3生产者重编程为高价值赤霉素GA4+7的专一性工厂 藤仓镰刀菌(Fusarium fujikuroi) 合成生物学 NA 代谢工程、发酵优化 NA NA NA NA 藤仓镰刀菌 通过引入拟南芥来源转运蛋白(Npfs和Sweets)构建热力学汇以消耗胞内GA3/GA4+7池,同时过表达Sfp型4'-磷酸泛酰巯基乙胺基转移酶Ppt1触发P450-3 mRNA的转录后沉默 工业生物技术、医药
15 2026-09-26
State-of-the-art lignin depolymerization and its routes to microbial valorization
2026-Dec, Bioresource technology IF:9.7Q1
综述 系统评估木质素解聚的最新技术(物理、化学、生物方法),并强调通过代谢工程、合成生物学和系统代谢工程将木质素衍生芳香化合物微生物升级为高附加值产品的集成策略 提出从解聚到增值的集成设计概念,强调将分子水平的解聚机制与代谢途径设计相连接,并重点关注构建稳健的微生物细胞工厂以提高碳汇聚效率和实现选择性产物生物合成 生物解聚在反应速率、底物异质性和可扩展性方面仍面临挑战,各解聚技术均有其固有局限性,集成策略尚处于起步阶段 评估木质素解聚的最新技术进展,并探讨解聚路线与下游生物转化的衔接,为构建经济可行、可扩展和可持续的木质素生物精炼厂提供理论基础 木质素(木质纤维素生物质的主要成分)及其解聚产物(酚类单体和低聚物),以及用于微生物增值的工程微生物细胞工厂 合成生物学, 代谢工程, 生物催化 NA 物理解聚, 化学催化解聚(催化、氧化、还原、溶剂解), 生物酶解聚, 代谢工程, 合成生物学, 系统代谢工程 NA 文本 NA NA NA 代谢途径工程(木质素衍生芳香化合物代谢途径), 碳汇聚途径 生物能源, 生物基材料, 工业生物技术, 环境
16 2026-09-26
Metabolic fermentation pathways of microalgae for the synthesis of high-value chemical products
2026-Dec, Bioresource technology IF:9.7Q1
综述 本文综述了微藻通过发酵途径(如酒精发酵、暗发酵和丙酮-丁醇-乙醇发酵)将碳水化合物和蛋白质转化为高价值有机代谢物(包括醇类、有机酸、醛、酮、酯和萜类/类异戊二烯)的生化多样性和酶学机制,并探讨了代谢工程优化微生物菌株(如酿酒酵母和梭菌)以提高产量的最新进展 系统整合了微藻生物质通过多种发酵途径转化为高价值化合物的生化机制,特别指出了富含类胡萝卜素的微藻(如杜氏藻和雨生红球藻)用于萜类/类异戊二烯发酵生产仍是科学空白,并提出了合成生物学和实时生物传感器在更稳健、灵活和工业化过程中的应用前景 富含类胡萝卜素的微藻(如杜氏藻和雨生红球藻)专门用于萜类/类异戊二烯生产的发酵研究仍存在空白,相关研究尚不充分 探讨微藻通过代谢发酵途径合成高价值化学产品的生化多样性和酶学机制,并综述代谢工程优化菌株以提高产量的研究进展 微藻生物质(小球藻、节旋藻、微拟球藻、栅藻、绿球藻、杜氏藻、雨生红球藻)及发酵微生物(酿酒酵母、梭菌) 合成生物学 NA 发酵工程、代谢工程、合成生物学 NA 文本 NA NA 酿酒酵母, 梭菌, 微藻 代谢途径(酒精发酵、暗发酵、丙酮-丁醇-乙醇发酵途径) 能源, 材料, 工业生物技术, 食品
17 2026-09-22
Menaquinone biosynthesis in Lactococcus lactis: Recent advances and future prospects
2026-Dec, Engineering microbiology
综述 本文综述了乳酸乳球菌中甲萘醌(维生素K2)生物合成途径、生理功能及其调控机制,并探讨了提高MK产量的策略 系统总结了乳酸乳球菌中MK生物合成途径及调控机制,并讨论了在乳酸乳球菌和大肠杆菌中实现MK高产方案 作为综述文章,未提供原创实验数据,且对乳酸乳球菌MK高产的代谢工程策略仍需进一步实验验证 总结乳酸乳球菌中甲萘醌生物合成的研究进展,并为开发乳酸乳球菌作为MK生产细胞工厂提供思路 乳酸乳球菌(Lactococcus lactis)及甲萘醌(维生素K2)生物合成途径 合成生物学 心血管疾病 NA NA 文本 NA NA 乳酸乳球菌, 大肠杆菌 甲萘醌生物合成代谢途径 医药, 食品
18 2026-09-08
Advances in combinatorial CRISPRi screening and applications: Decoding higher-order interactions for next-generation microbial cell factories in synthetic biology
2026-Dec, Microbiological research IF:6.1Q1
综述 本文综述了组合式CRISPR干扰筛选的最新进展及其在合成生物学中解码微生物细胞工厂复杂表型和高阶相互作用的应用 系统阐述了成对和高阶组合CRISPRi筛选策略,涵盖多重gRNA阵列设计、正交系统及高维数据处理算法,并强调其在解码遗传冗余和缓冲机制中的独特优势 当前面临系统噪声和文库构建挑战,限制了筛选的准确性和规模 为解码复杂性状和推动下一代微生物细胞工厂的理性设计提供指导 微生物细胞工厂,涉及碳通量优化和抗环境胁迫的多基因网络 合成生物学,系统生物学 NA CRISPR干扰(CRISPRi),多重引导RNA阵列,组合筛选 NA 高维筛选数据,遗传互作数据 NA CRISPR-Cas9 微生物(如细菌、酵母等) 组合CRISPRi系统,多重gRNA阵列,正交调控系统 工业生物技术,合成生物学
19 2026-09-08
Synthetic biology strategies for engineering microbial therapeutics in metabolic diseases and cancer
2026-Dec, Microbiological research IF:6.1Q1
综述 本文综述了合成生物学在代谢疾病和癌症中工程化微生物治疗策略的最新进展,包括底盘选择、电路架构、应用及挑战。 系统性地总结了合成生物学在微生物治疗中的应用,强调从被动载体到可编程活体治疗剂的转变,并讨论了代谢疾病和癌症中的具体案例。 临床转化仍受限于体内存活和功能活性变异、定植不一致、代谢和遗传不稳定性、生物封控需求、制造复杂性和剂量控制不确定。 探讨合成生物学在工程化微生物治疗剂中的应用,以治疗代谢疾病和癌症。 工程化微生物(如大肠杆菌和其他微生物平台)用于代谢疾病和癌症治疗。 合成生物学 代谢疾病、癌症 合成生物学 NA NA NA NA 大肠杆菌(E. coli),其他微生物平台 合成基因电路,用于感知、计算和响应宿主环境,如降解有毒代谢物、表达治疗蛋白。 医学
20 2026-09-08
Rational design of next-generation bioinoculants: Integrating molecular engineering of plant-microbe interactions with advanced formulation strategies
2026-Dec, Microbiological research IF:6.1Q1
综述 本文提出将下一代生物接种剂重新概念化为工程化生物系统,通过整合植物-微生物相互作用的分子工程与先进制剂策略,以实现可预测、高性能的农业应用 提出了一个统一框架,将制剂视为生态和生理界面,通过桥接合成生物学、材料科学和根际生态学,实现生物接种剂的理性设计 未具体说明局限性,可能涉及当前技术整合的挑战和实际应用中的不确定性 为下一代生物接种剂的理性设计提供集成框架,以提高农业可持续性和气候韧性 植物相关微生物及其相互作用,以及制剂技术 合成生物学 NA 合成基因电路、压力耐受工程、代谢重编程 NA 文本 NA NA 植物相关微生物 合成基因电路、信号响应调控通路 农业
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