合成生物学相关文章
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当前共找到 22 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-09-21 |
Menaquinone biosynthesis in Lactococcus lactis: Recent advances and future prospects
2026-Dec, Engineering microbiology
DOI:10.1016/j.engmic.2026.100304
PMID:42761602
|
综述 | 本文综述了乳酸乳球菌中甲萘醌（维生素K2）的生物合成途径、生理功能及其调控机制，并探讨了通过代谢工程提高甲萘醌产量的策略 | 系统总结了乳酸乳球菌中甲萘醌生物合成的最新研究进展，并提出了将乳酸乳球菌开发为甲萘醌生产细胞工厂的高产方案 | 作为综述文章，未提供原始实验数据，主要基于已有文献的归纳总结 | 总结乳酸乳球菌中甲萘醌生物合成的研究进展，并为开发高效甲萘醌生产细胞工厂提供参考 | 乳酸乳球菌（Lactococcus lactis）及甲萘醌（维生素K2）生物合成途径 | 合成生物学 | 心血管疾病 | 代谢工程、发酵优化 | NA | 文本 | NA | NA | 乳酸乳球菌 | 甲萘醌生物合成途径 | 食品、医药 |
| 2 | 2026-09-08 |
Advances in combinatorial CRISPRi screening and applications: Decoding higher-order interactions for next-generation microbial cell factories in synthetic biology
2026-Dec, Microbiological research
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.micres.2026.128663
PMID:42574952
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综述 | 本文综述了组合式CRISPR干扰筛选的最新进展及其在合成生物学中解码微生物细胞工厂复杂表型和高阶相互作用的应用 | 系统阐述了成对和高阶组合CRISPRi筛选策略，涵盖多重gRNA阵列设计、正交系统及高维数据处理算法，并强调其在解码遗传冗余和缓冲机制中的独特优势 | 当前面临系统噪声和文库构建挑战，限制了筛选的准确性和规模 | 为解码复杂性状和推动下一代微生物细胞工厂的理性设计提供指导 | 微生物细胞工厂，涉及碳通量优化和抗环境胁迫的多基因网络 | 合成生物学，系统生物学 | NA | CRISPR干扰（CRISPRi），多重引导RNA阵列，组合筛选 | NA | 高维筛选数据，遗传互作数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 微生物（如细菌、酵母等） | 组合CRISPRi系统，多重gRNA阵列，正交调控系统 | 工业生物技术，合成生物学 |
| 3 | 2026-09-08 |
Synthetic biology strategies for engineering microbial therapeutics in metabolic diseases and cancer
2026-Dec, Microbiological research
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.micres.2026.128682
PMID:42612398
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综述 | 本文综述了合成生物学在代谢疾病和癌症中工程化微生物治疗策略的最新进展，包括底盘选择、电路架构、应用及挑战。 | 系统性地总结了合成生物学在微生物治疗中的应用，强调从被动载体到可编程活体治疗剂的转变，并讨论了代谢疾病和癌症中的具体案例。 | 临床转化仍受限于体内存活和功能活性变异、定植不一致、代谢和遗传不稳定性、生物封控需求、制造复杂性和剂量控制不确定。 | 探讨合成生物学在工程化微生物治疗剂中的应用，以治疗代谢疾病和癌症。 | 工程化微生物（如大肠杆菌和其他微生物平台）用于代谢疾病和癌症治疗。 | 合成生物学 | 代谢疾病、癌症 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 大肠杆菌（E. coli），其他微生物平台 | 合成基因电路，用于感知、计算和响应宿主环境，如降解有毒代谢物、表达治疗蛋白。 | 医学 |
| 4 | 2026-09-08 |
Rational design of next-generation bioinoculants: Integrating molecular engineering of plant-microbe interactions with advanced formulation strategies
2026-Dec, Microbiological research
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.micres.2026.128693
PMID:42632390
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综述 | 本文提出将下一代生物接种剂重新概念化为工程化生物系统，通过整合植物-微生物相互作用的分子工程与先进制剂策略，以实现可预测、高性能的农业应用 | 提出了一个统一框架，将制剂视为生态和生理界面，通过桥接合成生物学、材料科学和根际生态学，实现生物接种剂的理性设计 | 未具体说明局限性，可能涉及当前技术整合的挑战和实际应用中的不确定性 | 为下一代生物接种剂的理性设计提供集成框架，以提高农业可持续性和气候韧性 | 植物相关微生物及其相互作用，以及制剂技术 | 合成生物学 | NA | 合成基因电路、压力耐受工程、代谢重编程 | NA | 文本 | NA | NA | 植物相关微生物 | 合成基因电路、信号响应调控通路 | 农业 |
| 5 | 2026-09-03 |
Growth factor applications and clinical translation: advances and challenges
2026-12, Annals of medicine
IF:4.9Q1
DOI:10.1080/07853890.2026.2642893
PMID:41837883
|
综述 | 本文系统综述了生长因子（GFs）的分类、基础研究进展及其在神经退行性疾病、骨再生和代谢紊乱等领域的应用，分析了临床转化中的主要挑战及相应解决方案 | 总结了通过蛋白质工程、化学修饰、智能响应递送系统及多因子序贯释放技术等创新策略，以克服生长因子临床转化瓶颈的进展 | 高成本、复杂的大规模生产过程及体内微环境的复杂性限制了生长因子的临床转化范围 | 为加速下一代生长因子疗法的开发提供全面路线图和技术参考，推动其在再生医学、肿瘤学和代谢调节等领域的应用 | 生长因子（GFs）及其在神经退行性疾病、骨再生和代谢紊乱等疾病中的应用 | 再生医学 | 神经退行性疾病, 骨再生, 代谢紊乱 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 6 | 2026-09-02 |
Engineered bacterial therapeutics from synthetic biology to clinical translation: A multi-database scientometric analysis, 2000-2026
2026-Dec, Human vaccines & immunotherapeutics
IF:4.1Q2
DOI:10.1080/21645515.2026.2720162
PMID:42641146
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研究论文 | 通过多数据库文献计量分析，描绘了工程细菌疗法从合成生物学到临床转化的知识结构、合作模式和转化方向 | 首次采用多数据库（Web of Science、Scopus、PubMed）结合多种文献计量工具（CiteSpace、VOSviewer、bibliometrix）综合分析工程细菌疗法领域2000至2026年的研究趋势和主题演变 | 仅包含英文文献，且2026年数据不完整；依赖数据库索引，可能遗漏未收录的相关研究 | 绘制工程细菌疗法领域的知识结构、合作模式和转化方向，以指导未来研究和临床转化 | 工程细菌疗法相关的出版物，包括研究论文和综述 | 合成生物学、文献计量学 | 癌症、肠道疾病（涉及） | 文献计量分析 | NA | 文献数据 | 1,730篇英文文章和综述 | NA | 细菌 | 生物电路设计（用于感应、递送、免疫调节等功能） | 医学、工业生物技术 |
| 7 | 2026-08-31 |
iFLinkC-EZ: A scalable and automatable method for the assembly of complex fusion proteins and multi-gene expression constructs based on the iFLinkC framework
2026-Dec, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2026.03.008
PMID:42006855
|
研究论文 | 本文介绍了iFLinkC-EZ，一种基于iFLinkC框架的可扩展且自动化的方法，用于组装复杂融合蛋白和多基因表达构建体 | 通过遗传手段纯化DNA组装产物，简化了组装过程并使其兼容机器人自动化 | 未明确提及具体局限性 | 开发一种简化且自动化的DNA组装方法，用于复杂融合蛋白和多基因表达构建体的高效构建 | 多色荧光融合蛋白、多顺反子表达构建体、酵母表面展示重组结合蛋白 | 合成生物学 | NA | iFLinkC克隆技术 | NA | DNA序列 | 未明确说明样本数量，但涉及超过80代的稳定性实验 | iFLinkC-EZ | 酵母 | 多顺反子表达构建体、融合蛋白表达构建体 | 生物技术、基础研究 |
| 8 | 2026-08-30 |
Autoinducer 2 as a universal language in microbial consortia: decoding molecular mechanisms, ecological impacts, and application
2026-12-31, Gut microbes
IF:12.2Q1
DOI:10.1080/19490976.2026.2615494
PMID:41574816
|
综述 | 本文系统综述了自诱导物2（AI-2）在微生物群落中的分子机制、生态影响及应用，涵盖其结构动态、受体多样性、信号转导、代谢调控和多种应用领域 | 首次系统整合AI-2的双重结构动态（S-THMF-硼酸/R-THMF互变）及其环境依赖角色，并详细探讨了影响AI-2产生的内外部因素，为微生物通信在化学工程和环境可持续性中的应用提供了路线图 | 文章指出了AI-2介导的空间异质性和多群体感应系统协调方面的知识空白，未提供实验验证 | 解码AI-2在微生物群落中的分子机制、生态影响及应用，为利用微生物通信提供指导 | 自诱导物2（AI-2）及其介导的微生物群落交互 | 微生物学，合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 宿主健康，农业，工业，环境生态 |
| 9 | 2026-08-29 |
The role of gut microbiome in aging-associated diseases: where do we stand now and how technology will transform the future
2026-12-31, Gut microbes
IF:12.2Q1
DOI:10.1080/19490976.2025.2607076
PMID:41454672
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综述 | 本文综述了肠道微生物组在衰老相关疾病中的作用，并探讨了多组学、合成生物学和人工智能等技术如何推动该领域的未来发展和临床转化 | 提出了一个名为PRIME的五阶段路线图，整合了功能多组学、合成生物学、人工智能分析、生物样本库和自体粪便微生物移植等前沿技术，以促进精准医学和健康老龄化 | 未明确提及具体局限性 | 总结肠道微生物组与衰老相关疾病的关联，并探讨新兴技术如何改变研究格局和干预设计，最终促进精准医学和健康老龄化 | 肠道微生物组及其与衰老相关疾病（如感染性疾病、自身免疫病、神经退行性疾病、癌症、代谢性疾病等）的关联 | 微生物组学、合成生物学、人工智能 | 衰老相关疾病 | 多组学、合成生物学、人工智能分析、生物样本库、自体粪便微生物移植 | NA | 文本和概念性数据 | NA | 合成生物学 | 人类肠道微生物组 | NA | 医学 |
| 10 | 2026-07-27 |
X-ray crystal structures of the cannabinoid synthases CBCAS, CBDAS and THCAS
2026-Dec, Current research in structural biology
IF:2.7Q3
DOI:10.1016/j.crstbi.2026.100197
PMID:42502799
|
研究论文 | 解析了大麻素合酶CBCAS、CBDAS和THCAS的X射线晶体结构，揭示了它们活性位点的差异 | 首次报道了CBCAS和CBDAS的晶体结构，并获得了比已知结构更高分辨率的THCAS结构，揭示了决定底物特异性的活性位点差异 | 未提供 | 解析大麻素合酶的结构基础，为合理工程化改造这些酶的化学选择性提供平台 | 大麻素合酶CBCAS、CBDAS和THCAS | 结构生物学 | NA | X射线晶体学 | NA | 结构数据 | 三种酶的晶体结构 | NA | NA | NA | 药物合成、合成生物学 |
| 11 | 2026-06-25 |
Synthetic biology of oncolytic bacteria: Comparative microbial chassis and precise killing strategies
2026-Dec, Toxicology reports
DOI:10.1016/j.toxrep.2026.102292
PMID:42339179
|
综述 | 综述利用合成生物学工程改造溶瘤细菌的最新进展，包括不同微生物底盘及精确杀灭策略 | 系统比较了多种微生物底盘（沙门氏菌、李斯特菌、大肠杆菌、梭菌、双歧杆菌、酵母等）在癌症治疗中的应用，并总结了CRISPR/Cas9基因编辑、遗传逻辑电路和自杀开关等合成生物学技术增强安全性和特异性的方法 | NA | 为开发具有精确靶向能力和增强治疗稳定性的溶瘤细菌提供合成生物学视角 | 溶瘤细菌及其微生物底盘 | 合成生物学 | 癌症 | CRISPR/Cas9基因编辑 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 沙门氏菌, 李斯特菌, 大肠杆菌, 梭菌, 双歧杆菌, 酵母 | 遗传逻辑电路, 自杀开关 | 医学 |
| 12 | 2026-06-24 |
Evaluating Malat1-derived 3'end sequences for functional transgene expression in human cells using synthetic mRNA delivery
2026-Dec, RNA biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1080/15476286.2026.2670832
PMID:42093635
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研究论文 | 评估基于Malat1衍生3'末端序列在人类细胞中通过合成mRNA递送实现功能性转基因表达的效果 | 首次系统比较了长链非编码RNA Malat1衍生的3'端基序（包含保守三螺旋结构）与经典poly(A)尾在合成报告RNA中的表达效能 | 测试的Malat1衍生基序表达效率持续低于经典poly(A)尾，且未优化三螺旋序列折叠 | 探索poly(A)尾替代策略在合成mRNA表达中的应用潜力 | Malat1衍生的3'端基序与经典poly(A)尾在编码绿色荧光蛋白的合成报告RNA中的表达比较 | 分子生物学 | NA | 合成mRNA递送 | NA | NA | NA | NA | 人类细胞 | NA | 合成生物学,RNA治疗 |
| 13 | 2026-06-23 |
Metabolic engineering of Vibrio natriegens for the efficient biosynthesis of ergothioneine from sucrose using non-sterile fed-batch fermentation
2026-Dec, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2026.04.041
PMID:42325659
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研究论文 | 通过代谢工程改造快速生长的Vibrio natriegens，从蔗糖高效合成麦角硫因并采用非无菌补料分批发酵 | 首次成功在Vibrio natriegens中构建麦角硫因生物合成途径，并利用低蔗糖成本、高盐度非无菌条件实现高效生产 | Vibrio natriegens的转化效率低、基因编辑方法有限以及发酵成本高仍是主要挑战 | 建立基于Vibrio natriegens的高效经济平台，用于麦角硫因及其他高价值化合物的生物合成 | 快速生长的Vibrio natriegens菌株 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9基因编辑、电穿孔转化、补料分批发酵 | NA | NA | 2-L生物反应器中的补料分批发酵 | CRISPR-Cas9 | Vibrio natriegens | 麦角硫因生物合成途径（包括超强P启动子与弱RBS7组合，以及副产物和ATP降解基因的敲除、SAM循环和ATP合成基因的过表达） | 工业生物技术、医药 |
| 14 | 2026-06-23 |
Streptomyces: boost chassis strains for production of invaluable natural products
2026-Dec, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2026.05.005
PMID:42325658
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综述 | 综述2020-2025年间链霉菌底盘工程的前沿进展，探讨其成为高效天然产物生产平台的策略与未来方向 | 提出5M策略（机制-模型-操控-测量-制造），将底盘工程重构为基于工程原理的迭代系统级过程，并融合AI设计工具、多重基因组编辑等新兴技术 | NA | 系统总结链霉菌底盘工程关键策略（如基因组精简、前体重分配、调控电路重编程等），为天然产物高产提供结构化路线图 | 链霉菌底盘菌株 | 合成生物学 | NA | 基因组编辑技术 | NA | NA | 约150个案例（2020-2025年文献） | CRISPR-Cas9, TALEN | 链霉菌 | 代谢通路重编程，逻辑门 | 生物技术，工业生物技术 |
| 15 | 2026-06-16 |
Engineered bacteria in disease diagnosis and therapy: A synthetic biology perspective
2026-Dec, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2026.04.028
PMID:42293685
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综述 | 这篇综述从合成生物学角度总结了工程菌在疾病诊断和治疗中的应用进展 | 系统梳理了合成生物学技术（如CRISPR/Cas9、DNA组装、定向进化及人工智能集成）如何赋能工程菌作为“活体传感器”和定制化治疗载体，并讨论了提升安全性和有效性的工程策略 | 工程菌的临床转化仍面临稳定定植、免疫原性控制、大规模生产标准化及监管伦理框架等挑战 | 优化细菌功能以拓展其在诊断和精准医学中的潜力 | 工程菌 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9, DNA组装, 定向进化, 人工智能 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 细菌 | 生物传感器, 靶向药物递送, 免疫调控, 微生物组调节 | 医学 |
| 16 | 2026-06-09 |
Leveraging the bacteria for enhanced cancer immunotherapy: from a perspective of synthetic biology
2026-Dec-31, Cancer biology & therapy
IF:4.4Q2
DOI:10.1080/15384047.2026.2683171
PMID:42240055
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review | 综述了合成生物学在细菌介导的癌症免疫治疗中的最新进展，重点介绍工程细菌如何激活免疫系统及实现肿瘤靶向的策略 | 系统总结了利用合成生物学改造细菌以表达免疫治疗剂、增强肿瘤靶向性及直接递送治疗载荷的创新策略，并探讨了缺氧响应启动子、细菌群集运动和细胞外囊泡等前沿技术 | 未提及该领域的未来挑战或当前研究的局限性 | 回顾合成生物学在细菌癌症免疫治疗中的研究进展，聚焦免疫激活机制与工程策略 | 工程化细菌作为癌症免疫治疗剂 | 合成生物学 | 癌症 | NA | NA | NA | NA | NA | 细菌 | 表达免疫治疗剂的合成回路、缺氧响应启动子、细菌群集运动工程 | 医学 |
| 17 | 2026-06-06 |
Melatonin-enabled omics: understanding plant responses to single and combined abiotic stresses for climate-smart agriculture
2026-Dec, GM crops & food
DOI:10.1080/21645698.2026.2614130
PMID:41589633
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综述 | 本文综述了褪黑素在基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学等多组学层面调控植物应对单一和复合非生物胁迫的机制，并探讨了多组学整合（泛组学）方法及遗传工程和合成生物学在气候变化智慧农业中的应用潜力 | 首次系统整合褪黑素在多组学层面（基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学、miRNA组学、表观基因组学、表型组学、离子组学、微生物组学）调控植物非生物胁迫耐受性的机制，并强调多组学交叉和泛组学方法的应用 | 作为综述，未提供新的实验数据，且各研究间方法、物种和胁迫条件差异较大，限制了结论的直接可比性 | 阐明褪黑素通过多组学调控植物应对单一和复合非生物胁迫的机制，并为培育气候智慧型作物提供策略 | 植物在单一和复合非生物胁迫下的多组学响应 | 机器学习 | NA | 多组学技术（基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学、miRNA组学、表观基因组学、表型组学、离子组学、微生物组学） | NA | 多组学数据 | NA | 遗传工程、合成生物学 | 植物 | NA | 农业 |
| 18 | 2026-06-02 |
Eukaryotic cell-free protein synthesis: Chassis diversification, system engineering, and emerging applications
2026-Dec, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2026.04.022
PMID:42221684
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综述 | 从系统工程角度全面综述和分析真核无细胞蛋白质合成系统的最新进展，涵盖底盘多样化、系统设计和新兴应用 | 从系统工程视角综合分析底盘多样化、核心反应组件理性设计，并探讨人工智能和合成生物学工具在突破标准化和成本瓶颈中的应用潜力 | 当前标准化和成本瓶颈仍阻碍工业化进程，需通过人工智能和合成生物学工具进一步优化 | 为构建经济、高通量的真核无细胞生物制造平台提供理论参考和实践指导 | 真核无细胞蛋白质合成系统 | NA | NA | 无细胞蛋白质合成 | NA | NA | NA | NA | 真核生物底盘 | NA | 人工细胞构建、生物电子接口开发、微阵列芯片设计 |
| 19 | 2026-05-31 |
Unconditional de novo generation and functional validation of synthetic promoters with a diffusion model
2026-Dec, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2026.04.023
PMID:42212299
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研究论文 | 提出一种名为DiPro的无条件扩散模型，用于从头生成合成启动子序列，并通过实验验证其功能 | 首次将无条件扩散模型应用于启动子设计，无需条件输入即可生成新序列，结合inpainting引导生成相位特异性启动子，实现了高结构保真度和功能验证 | 研究仅聚焦于50-bp核心启动子区域，未探索更长的调控区域；实验验证仅基于大肠杆菌，通用性需进一步验证 | 开发一种生成式框架，用于创建具有可编程时序动力学的功能性细菌启动子 | 细菌启动子序列（合成启动子） | 机器学习 | 不适用 | 扩散模型 | Transformer | 序列 | 5000个候选启动子序列，其中81个经实验验证 | 不适用 | 大肠杆菌 | 相位特异性启动子驱动的裂解蛋白回路 | 合成生物学, 代谢工程 |
| 20 | 2026-05-31 |
Defense-associated reverse transcriptases define an emerging class of noncanonical DNA-writing systems
2026-Dec, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2026.05.001
PMID:42212300
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综述 | 防御相关逆转录酶定义了新兴的非经典DNA写入系统类别 | 揭示DRT不仅仅是RNA到DNA的复制蛋白，而是作为DNA构建模块，能够生成多种非经典DNA产物，包括从头基因组装cDNA、随机单链DNA、DNA同聚物、富含poly(A)的cDNA和蛋白模板化二核苷酸重复DNA，并展示了RNA模板化与蛋白模板化合成在单一防御途径中的结合机制 | 具体局限性未在摘要中提及，可能包括对DRT酶新型反应机制的全面理解仍处于早期阶段，以及其生物学功能和生态意义尚未完全阐明 | 阐明防御相关逆转录酶作为DNA写入系统的机制，探索其在合成生物学和核酸工程中的潜在应用 | 细菌的防御相关逆转录酶（DRTs），特别关注DRT3的合成途径 | 机器学 | NA | 逆转录技术、DNA合成 | NA | NA | NA | NA | 细菌 | 非经典DNA写入系统（包括从头基因组装、随机单链DNA生成、DNA同聚物合成等） | 合成生物学，核酸工程 |