合成生物学相关文章
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当前共找到 3 篇文献。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-11-04 |
Development of a high-throughput proteome sample preparation workflow based on efficient protein extraction to empower rational design of yeast cell factories
2027-Mar-01, Talanta
IF:5.6Q1
DOI:10.1016/j.talanta.2026.130738
PMID:42874363
|
研究论文 | 本文开发了一种基于离子液体、盐酸胍和乙酸锂组合加热处理（IGL-H）的高效酵母蛋白提取方法，并结合磁固相烷基化（mSPA）材料实现高通量蛋白质组样品制备，用于酵母细胞工厂的理性设计 | 提出IGL-H溶剂组合加热提取策略，实现快速、高蛋白产量和更广蛋白质组覆盖的酵母蛋白提取，且可兼容液体处理工作站进行高通量样品制备，总时间少于1.5小时，Pearson相关系数超过0.97 | 摘要中未明确说明该方法的局限性 | 解决酵母细胞壁结构坚固和菌株文库规模快速扩大带来的高效蛋白提取和高通量蛋白质组分析难题，以支持酵母细胞工厂的理性设计 | 酵母细胞（包括不同生长阶段和不同物种的酵母，以及产朊假丝酵母Candida utilis） | 合成生物学，蛋白质组学 | NA | 质谱蛋白质组学，磁固相烷基化（mSPA） | NA | 蛋白质组数据 | NA | NA | 酵母（包括产朊假丝酵母Candida utilis） | NA | 工业生物技术，医学，能源 |
| 2 | 2026-10-31 |
Reprogramming the therapeutic fate of living biotherapeutic products for intestinal diseases via biomaterials
2027-Mar, Biomaterials
IF:12.8Q1
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综述 | 系统总结了利用脂质涂层、水凝胶、有机-无机杂化材料、抗体或功能蛋白以及细胞膜等生物材料修饰细菌表面的策略，并阐明其增强细菌性能的机制 | 聚焦于生物材料修饰细菌这一新兴领域，系统梳理多种表面修饰策略及其增强机制，并提出基于高通量平台、合成生物学和人工智能设计下一代生物材料修饰细菌的展望 | 作为综述文章，未提供原始实验数据，对各类修饰策略的定量比较和长期安全性评估有限 | 总结生物材料修饰细菌的策略与机制，为肠道疾病治疗中活体生物治疗产品的理性设计提供参考 | 活体生物治疗产品（LBP）及生物材料修饰细菌（BMB） | 生物医学工程 | 炎症性肠病, 结直肠癌 | NA | NA | 文本 | NA | NA | 细菌 | NA | 医学 |
| 3 | 2026-08-25 |
Deep learning-driven de novo design of ribosome binding sites in Paracoccus denitrificans
2027-Mar, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2026.07.013
PMID:42630760
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研究论文 | 本研究通过整合转录组和蛋白质组分析，系统表征了副球菌中1335个天然核糖体结合位点，并开发了基于深度学习的RBS设计平台，实现精确的翻译调控 | 首次为副球菌建立深度学习驱动的RBS设计平台，整合多组学数据揭示嘌呤丰富的SD序列特征，并通过CNN和WGAN-GP实现新RBS序列的生成与预测 | 摘要未提及具体局限性，可能包括预测准确率仍有提升空间或仅针对单一菌株 | 开发精确的翻译水平调控工具，以支持副球菌在环境合成生物学中的应用 | 副球菌中的核糖体结合位点序列及其调控功能 | 机器学习 | NA | RNA-seq、蛋白质组学分析 | CNN、BiLSTM、Transformer、WGAN-GP | 序列数据、转录组数据、蛋白质组数据 | 1335个天然RBS序列 | NA | 副球菌 | 核糖体结合位点设计，涉及SD序列和辅助元件 | 环境生物技术 |