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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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1 | 2025-05-04 |
Living therapeutics: Precision diagnosis and therapy with engineered bacteria
2025-Oct, Biomaterials
IF:12.8Q1
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综述 | 本文综述了工程化细菌在癌症治疗中的最新进展,包括其理论基础、优势、基因工程和化学修饰技术的应用,以及面临的挑战和未来前景 | 总结了合成生物学和化学工程在开发可控性增强、靶向递送和毒性降低的工程化细菌平台方面的最新进展 | 未提及具体临床试验数据或样本量,主要基于理论和技术层面的讨论 | 探讨工程化细菌在精准肿瘤学中的诊断和治疗潜力 | 工程化细菌及其在癌症治疗中的应用 | 合成生物学 | 癌症 | 基因工程和化学修饰技术 | NA | NA | NA |
2 | 2025-05-04 |
Synthetic biology of Fusarium for the sustainable production of valuable bioproducts
2025 Jul-Aug, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108579
PMID:40222460
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综述 | 本文综述了利用合成生物学优化镰刀菌属作为可持续生产多种生物制品的高效平台 | 介绍了CRISPR/Cas9、RNA干扰和合成启动子等先进工程技术的应用,以及下一代测序和组学技术对镰刀菌代谢网络理解的扩展 | 代谢瓶颈、监管复杂性和菌株稳定性仍然是工业规模应用的主要障碍 | 优化镰刀菌属作为可持续生产生物制品的平台 | 镰刀菌属 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9, RNA干扰, 合成启动子, 下一代测序, 组学技术 | NA | NA | NA |
3 | 2025-05-04 |
Construction of P450 scaffold biocatalysts for the biodegradation of five chloroanilines
2025-May-05, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2025.137305
PMID:39854990
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研究论文 | 本研究通过工程化改造P450BM3单加氧酶的活性位点,开发出新型人工生物催化剂,用于高效降解五种氯苯胺类环境污染物 | 通过将P450BM3中高度保守的苏氨酸268替换为天冬氨酸,成功诱导了过氧化物酶活性,显著提升了催化效率 | NA | 开发无需NAD(P)H或双功能小分子辅助的高效生物催化剂,用于环境污染物降解 | 五种氯苯胺类化合物(4-氯苯胺、2-氯苯胺、2,4-二氯苯胺、3,4-二氯苯胺和3,5-二氯苯胺) | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程、UPLC-MS分析 | NA | 化学分析数据 | 五种氯苯胺类化合物 |
4 | 2025-05-04 |
Semantical and geometrical protein encoding toward enhanced bioactivity and thermostability
2025-May-02, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.98033
PMID:40314227
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research paper | 提出了一种新的预训练框架,整合了蛋白质一级和三级结构的序列和几何编码器,以提高蛋白质工程中的功能预测和热稳定性评估 | 引入了整合序列和几何编码器的预训练框架,模拟自然选择指导突变方向,并在三个基准测试中展示了卓越性能 | 缺乏对开发方法在预测蛋白质热稳定性方面的基本评估,尽管这是一个关键的物理性质 | 提高蛋白质工程中功能预测和热稳定性评估的准确性和全面性 | 蛋白质序列和结构 | synthetic biology | NA | deep learning | pre-training framework with sequential and geometric encoders | protein sequence and structure data | over 300 deep mutational scanning assays |
5 | 2025-05-04 |
Developing a multi-modular assembled prime editing (mPE) system improved precise multi-base insertion efficiency in dicots
2025-May, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2024.06.021
PMID:38942381
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research paper | 本研究开发了一种多模块组装的prime editing (mPE)系统,显著提高了双子叶植物中多碱基插入的精确编辑效率 | 提出了一种新型的多模块组装mPE系统,相比原始PE2系统,在多个基因位点上实现了1.3至1288.5倍的编辑效率提升,特别在多碱基插入方面平均提高了197.9倍 | 研究主要局限于双子叶模式植物拟南芥和本氏烟草,尚未在其他植物或实际农作物中验证 | 解决prime editing在双子叶植物中编辑效率低下的问题,开发系统性优化方案 | 双子叶植物拟南芥(Arabidopsis thaliana)和本氏烟草(Nicotiana benthamiana) | 合成生物学 | NA | 农杆菌介导转化、深度扩增子测序(0.2-0.5 million clean total reads) | prime editing系统优化模型 | 基因组测序数据 | 大规模转化实验(具体数量未明确说明) |
6 | 2025-05-04 |
Microbially Derived P=S and P=Se Bond Formation
2025-Apr-28, JACS Au
IF:8.5Q1
DOI:10.1021/jacsau.5c00262
PMID:40313816
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研究论文 | 本文报道了多种细菌通过中心硫代谢和非酶化学形成P=S键(PhP到PhPS),并首次应用于微生物P=Se键(PhPSe)的形成 | 首次在微生物细胞中进行P=S键形成的生化和遗传研究,并首次将微生物代谢物用于化学合成中的P=Se键形成 | NA | 探索微生物代谢物在化学合成中的直接应用 | 细菌及其代谢物 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
7 | 2025-05-04 |
Carbon cycle of polyhydroxyalkanoates (CCP): Biosynthesis and biodegradation
2025-Mar-15, Environmental research
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.envres.2025.120904
PMID:39842755
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综述 | 本文综述了聚羟基脂肪酸酯(PHAs)的碳循环过程,包括其生物合成、降解途径以及在环境和生物医学中的应用 | 提出了聚羟基脂肪酸酯碳循环(CCP)的概念,并详细描述了芳香族单体的生物合成途径、碳转化过程以及在不同环境中的降解机制 | 在实现经济高效的PHA生产和降解产物再利用方面仍存在挑战,对PHA合成和降解中的碳途径理解有限 | 探讨PHAs作为生物材料的可持续利用价值,支持全球绿色低碳发展 | 聚羟基脂肪酸酯(PHAs) | 生物材料 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
8 | 2025-05-04 |
Rational multienzyme architecture design with iMARS
2025-Mar-06, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2024.12.029
PMID:39855196
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research paper | 开发了一种名为iMARS的标准化框架,用于快速设计最优的多酶结构,以提高催化效率 | iMARS框架整合了高通量活性测试和结构分析,能够预测性地设计多酶结构,显著提高催化效率 | 未明确提及框架的适用范围或潜在的生物学限制 | 提高多酶结构的催化效率,应用于绿色化学、合成生物学和生物制造 | 多酶结构及其在代谢途径中的应用 | 合成生物学 | NA | 高通量活性测试和结构分析 | iMARS框架 | NA | NA |
9 | 2025-05-04 |
Construction and characterization of a mutant library for the P23 constitutive promoter in lactic acid bacteria
2025-Mar, Journal of biotechnology
IF:4.1Q2
DOI:10.1016/j.jbiotec.2025.01.015
PMID:39848497
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研究论文 | 本研究构建并表征了乳酸菌中P23组成型启动子的突变体文库,用于丰富乳酸菌启动子库并定量表征其活性 | 首次提供了一组显著不同的P组成型启动子突变体元件,为乳酸菌的代谢工程和合成生物学应用奠定了基础 | 突变体文库的特异性仅限于乳酸菌,在大肠杆菌中表现出显著差异 | 丰富乳酸菌启动子库并定量表征启动子活性,以促进代谢工程和合成生物学应用 | 乳酸菌中的P23组成型启动子 | 合成生物学 | NA | 易错PCR和dNTP类似物诱导的随机突变 | NA | 荧光强度数据 | 247个P启动子突变体 |
10 | 2025-05-04 |
Advances in magnetic nanoparticles for molecular medicine
2025-Feb-13, Chemical communications (Cambridge, England)
DOI:10.1039/d4cc05167j
PMID:39846549
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综述 | 本文综述了磁性纳米粒子(MNPs)在分子医学中的最新进展及其多样化应用 | 探讨了MNPs在分子医学中的新兴应用,如基因组编辑、细胞疗法和神经科学,展示了其在细胞和分子水平上精确控制生物过程的独特能力 | NA | 总结MNPs在分子医学中的临床应用,并探索其在疾病治疗中的下一代平台开发 | 磁性纳米粒子(MNPs)及其在分子医学中的应用 | 分子医学 | NA | NA | NA | NA | NA |
11 | 2025-05-04 |
The Future of Microbiome Therapeutics
2025-Feb, Drugs
IF:13.0Q1
DOI:10.1007/s40265-024-02107-3
PMID:39843757
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综述 | 本文概述了当前处于后期开发阶段的最新技术,探讨了它们在微生物组治疗中的优势和局限性 | 探讨了从粪便衍生产品到活体生物治疗、噬菌体疗法和合成生物学等多种微生物组治疗技术的未来发展路径 | 现有商业微生物组导向产品往往效果不佳 | 探讨微生物组治疗的未来发展方向 | 人类微生物组及其治疗技术 | 微生物组学 | NA | 粪便衍生产品、活体生物治疗、噬菌体疗法、合成生物学 | NA | NA | NA |
12 | 2025-05-04 |
Towards microbial consortia in fermented foods for metabolic engineering and synthetic biology
2025-Feb, Food research international (Ottawa, Ont.)
DOI:10.1016/j.foodres.2025.115677
PMID:39849795
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综述 | 本文综述了发酵食品中微生物群落的相互作用机制及其功能,并探讨了利用新型发酵剂与本地微生物群落结合开发功能性发酵食品的未来发展方向 | 总结了发酵食品中微生物相互作用的当前机制(拮抗、竞争、共生和互惠),并探讨了将这些稳定的微生物群落应用于代谢工程和合成生物学的潜力 | 未提及具体实验数据或案例研究来支持微生物相互作用机制的具体应用 | 探讨发酵食品中微生物群落的相互作用机制及其在代谢工程和合成生物学中的应用 | 发酵食品中的微生物群落 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
13 | 2025-05-04 |
Engineering the future of medicine: Natural products, synthetic biology and artificial intelligence for next-generation therapeutics
2025-Feb, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70146
PMID:39856487
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research paper | 探讨利用天然产物、合成生物学和人工智能开发下一代治疗方法 | 结合eXchange Unit between Thiolation domains方法和AI工具如Synthetic Intelligence,革新非核糖体肽合成酶和聚酮合酶工程,创造新型生物活性化合物 | 未提及具体实验数据或临床验证结果 | 应对抗生素耐药性和癌症等关键挑战,开发精确且可扩展的治疗方案 | 非核糖体肽合成酶和聚酮合酶工程 | 合成生物学与人工智能 | 抗生素耐药性和癌症 | eXchange Unit between Thiolation domains方法,AI工具 | Synthetic Intelligence | NA | NA |
14 | 2025-05-04 |
[Research progress in the design and application of whole-cell biosensors for antibiotics]
2025-Jan-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.240400
PMID:39855682
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综述 | 本文综述了抗生素全细胞生物传感器的设计和应用研究进展 | 总结了已报道的抗生素全细胞生物传感器,并将其分为特异性和通用性两类,详细阐述了两类抗生素生物传感器的设计原理和应用 | NA | 为其他抗生素全细胞生物传感器的构建和应用提供参考 | 抗生素全细胞生物传感器 | 合成生物学 | NA | 全细胞生物传感器 | NA | NA | NA |
15 | 2025-05-04 |
[Effects of exogenous additives on growth and high-value bioproducts accumulation of microalgae]
2025-Jan-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.240335
PMID:39855687
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review | 综述了外源添加剂对微藻生长及高价值生物产物积累的影响 | 对外源添加剂的类型、应用、目标菌株及分子机制进行了分类和总结 | 对外源添加剂的分类和总结不够全面 | 提高微藻高价值生物产物的生产效率 | 微藻 | 合成生物学 | NA | 外源添加剂调控 | NA | NA | NA |
16 | 2025-05-04 |
[Regulatory roles of DGAT and PDAT genes in plant oil synthesis]
2025-Jan-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.240376
PMID:39855689
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综述 | 本文全面综述了DGAT和PDAT基因在植物油脂合成中的生物学功能、分子机制及其在合成生物学背景下的应用 | 深入探讨DGAT和PDAT基因在植物油脂合成中的调控机制及其在合成生物学中的应用前景 | 未提及具体实验数据或案例研究 | 深入理解植物油脂合成的分子机制并提高油料作物的质量和产量 | DGAT和PDAT基因 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
17 | 2025-05-04 |
[Enzymatic MBH reaction catalyzed by an artificial enzyme designed with the introduction of an unnatural tertiary amine cofactor]
2025-Jan-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.240223
PMID:39855701
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研究论文 | 本文报道了一种通过引入非天然辅因子构建的人工酶,成功催化了不对称Morita-Baylis-Hillman (MBH)反应 | 通过引入4-二甲氨基吡啶(DMAP)辅因子作为催化中心,构建了一种新型人工酶,并成功催化了非天然的MBH反应 | 未提及具体的局限性 | 开发新型人工酶,为合成生物学提供丰富的工具箱 | 人工酶及其催化性能 | 合成生物学 | NA | 点击化学策略 | NA | NA | NA |
18 | 2025-05-04 |
[An efficient assembly method for a viral genome based on T7 endonuclease Ⅰ-mediated error correction]
2025-Jan-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.240302
PMID:39855702
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研究论文 | 本研究开发了一种基于T7内切酶Ⅰ介导的纠错方法,用于高效组装约10 kb的病毒基因组 | 通过合理设计寡核苷酸序列、两步PCR和高保真聚合酶合成3.0 kb DNA片段,并利用T7内切酶Ⅰ进行纠错,显著降低了错误率并简化了合成步骤 | NA | 优化基因合成过程,降低错误率并简化病毒基因组的合成与组装步骤 | 约10 kb的病毒基因组 | 合成生物学 | NA | T7内切酶Ⅰ介导的纠错、两步PCR、高保真聚合酶 | NA | DNA序列 | 约10 kb的病毒基因组 |
19 | 2025-05-04 |
Recent advances in engineering non-native microorganisms for poly(3-hydroxybutyrate) production
2025-Jan-24, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-025-04261-6
PMID:39849243
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综述 | 本文综述了非天然微生物在聚(3-羟基丁酸酯)(PHB)生产中的工程化进展 | 总结了代谢工程和合成生物学在非天然微生物中生产PHB的最新策略,包括CRISPR/Cas9基因编辑技术的应用 | 需要进一步的基因工程方法使非天然微生物更适合大规模PHB生产 | 探讨非天然微生物作为PHB生产宿主的潜力和优化策略 | 非天然微生物,特别是大肠杆菌 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、CRISPR/Cas9 | NA | NA | NA |
20 | 2025-05-04 |
Cell-free expression and SMA copolymer encapsulation of a functional receptor tyrosine kinase disease variant, FGFR3-TACC3
2025-Jan-23, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-86194-6
PMID:39848978
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研究论文 | 本研究通过无细胞蛋白表达系统成功表达了功能性的FGFR3-TACC3融合蛋白,并利用SMA共聚物进行重构 | 首次使用无细胞蛋白表达系统在48小时内成功表达功能性FGFR3-TACC3融合蛋白,并证明其具有显著的激酶结构域磷酸化活性 | 目前尚未获得任何全长RTK的高分辨率结构 | 解决跨膜蛋白特别是受体酪氨酸激酶融合蛋白的表达难题 | FGFR3-TACC3融合蛋白 | 合成生物学 | 癌症 | 无细胞蛋白表达(CFPE), SMA共聚物重构 | NA | 蛋白功能数据 | 表达产量为300 µg/mL裂解液 |