本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新,已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!
除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价5元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 | 2025-06-25 |
Review on Advancement of AI in Cell Engineering and Molecular Biology
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4690-8_10
PMID:40553333
|
review | 本文综述了人工智能在细胞工程和分子生物学领域的进展及其应用 | 探讨了AI如何通过自动化和编程方式发现组织层面的模式和设计原则,为组织工程研究提供新范式 | NA | 展示AI在分子生物学和细胞工程中的基本潜力及其应用 | 分子生物学和细胞工程领域的研究和应用 | machine learning | NA | AI和机器学习工具 | NA | 分子数据和生物医学图像 | NA |
2 | 2025-06-25 |
Artificial Intelligence in CRISPR-Cas Systems: A Review of Tool Applications
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4690-8_14
PMID:40553337
|
综述 | 本文综述了人工智能在CRISPR-Cas系统工具应用中的研究进展 | 整合CRISPR-Cas系统与人工智能,为基因工程研究提供新视角 | 未提及具体实验验证或应用案例 | 探索人工智能在基因编辑领域的应用潜力 | CRISPR-Cas系统及其基因编辑应用 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9, 深度学习和机器学习 | NA | 基因序列数据 | NA |
3 | 2025-06-25 |
Review on Advancement of AI in Synthetic Biology
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4690-8_26
PMID:40553349
|
review | 本文综述了人工智能在合成生物学中的进展及其在基因组编辑、代谢途径优化和生物电路设计等方面的应用 | 探讨了AI如何通过深度学习和机器学习技术提高CRISPR-cas9、从头蛋白质设计和基因电路开发的精确性 | 存在高质量生物数据集整理和计算与实验科学家之间跨学科协作的挑战 | 探索人工智能在合成生物学中的应用及其潜力 | 合成生物学中的基因组编辑、代谢途径优化和生物电路设计 | synthetic biology | NA | deep learning, machine learning | NA | biological datasets | NA |
4 | 2025-06-24 |
Design and construction of light-regulated gene transcription and protein translation systems in yeast P. Pastoris
2025-Jul, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2024.08.008
PMID:39117107
|
研究论文 | 研究旨在设计和构建在酵母P. Pastoris中光调控的基因转录和蛋白质翻译系统 | 构建了具有优异表达能力和光敏感性的光调控基因转录和蛋白质翻译系统,包括光诱导或抑制启动子及光抑制翻译系统的设计 | 未提及系统在其他宿主中的适用性或长期稳定性 | 解决传统诱导启动子在发酵安全性和表达能力上的缺陷,优化P. pastoris在生物技术和合成生物学中的应用 | 酵母P. Pastoris | 合成生物学 | NA | 光调控系统设计、稀有密码子刹车设计 | NA | NA | 以GFP为报告基因进行测试 |
5 | 2025-06-24 |
Multi-activity of Nanozyme Liposome Regulates the Homeostasis of Biochemical Microenvironment
2025-Jun-22, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202501918
PMID:40545445
|
research paper | 该研究开发了一种具有多酶活性的仿生脂质体,用于调节外源性植入物诱导的促炎因子 | 通过自组装人工膜在CeO2纳米颗粒上构建仿生脂质体,模拟内皮细胞膜的负电荷表面,减少血液成分的粘附和聚集,同时CeO2纳米酶水解ATP/ADP为AMP,调节生化微环境稳态 | NA | 开发能够调节生化微环境稳态的仿生脂质体,促进组织再生 | 仿生脂质体和CeO2纳米颗粒 | 合成生物学与组织工程 | NA | 自组装技术 | NA | NA | NA |
6 | 2025-06-24 |
Harnessing biotechnology for bee pollinator health
2025-Jun-21, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.05.027
PMID:40545407
|
research paper | 探讨如何利用生物技术改善蜜蜂授粉健康 | 提出利用人工智能引导的组学工具、分子和生物基治疗以及合成生物学等创新方法,以增强蜜蜂种群健康 | 未提及具体实验数据或样本量,可能缺乏实证支持 | 保护蜜蜂授粉服务并确保养蜂业的未来 | 蜜蜂种群及其健康 | 生物技术 | NA | 组学工具、分子治疗、合成生物学 | 人工智能 | NA | NA |
7 | 2025-06-24 |
Switchable RNA motifs for dynamic transcriptional control of RNA condensates
2025-Jun-20, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf497
PMID:40539511
|
research paper | 该研究展示了如何通过设计包含额外线性或分支环域的RNA纳米星结构,动态控制RNA凝聚体的形成与溶解 | 通过引入RNA'入侵者'和'抗入侵者'链,实现了RNA凝聚体的可逆动态调控,为合成生物学提供了新的工具 | 研究仅在体外实验中验证,尚未在体内系统中测试其效果 | 开发可动态调控的RNA凝聚体系统 | RNA纳米星结构及其形成的凝聚体 | synthetic biology | NA | in vitro transcription | NA | NA | NA |
8 | 2025-06-24 |
Metabolic engineering for microbial production of sugar acids
2025-May-13, BMC biotechnology
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12896-025-00973-7
PMID:40361067
|
综述 | 本文综述了微生物生产糖酸的代谢工程方法及其应用 | 强调了代谢工程和合成生物学工具在优化微生物菌株高效生产糖酸中的关键作用 | 未提及具体实验数据或案例研究 | 探讨微生物生产糖酸的代谢工程策略及其工业应用 | C5和C6糖酸 | 微生物生物技术 | NA | 代谢工程、CRISPR-Cas、动态调控回路 | NA | NA | NA |
9 | 2025-06-24 |
Logical regulation of endogenous gene expression using programmable, multi-input processing CRISPR guide RNAs
2024-Aug-12, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae549
PMID:38943344
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于CRISPR-Cas系统的条件性gRNA调控方法,用于精确控制内源基因表达 | 设计了可编程的多输入逻辑处理gRNA,实现了高达130倍的动态范围调控,并成功应用于代谢基因和细胞骨架基因的调控 | 目前仅在Escherichia coli中验证,在其他宿主生物中的兼容性需要进一步验证 | 开发一种精确调控内源基因表达的方法 | Escherichia coli的内源基因(lacZ, malT, poxB, ftsZ, mreB) | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas系统,RNA合成生物学 | dCas9调节器 | NA | NA |
10 | 2025-06-24 |
A systematic review on the implementation of advanced and evolutionary biotechnological tools for efficient bioremediation of organophosphorus pesticides
2023-Feb, Chemosphere
IF:8.1Q1
|
综述 | 本文系统回顾了利用先进和进化生物技术工具高效生物修复有机磷农药(OPP)的实施情况 | 介绍了合成生物学在OPP生物修复中的应用,包括基因操作与编辑、全细胞和酶基生物传感器系统的实施 | 未提及具体实验数据或案例研究的详细分析 | 探讨OPP生物修复的前景与挑战,比较各种生物修复技术 | 微生物、微生物酶、植物及其在OPP生物修复中的应用 | 生物技术 | NA | 合成生物学、系统生物学、生物信息学工具、结构生物学 | NA | NA | NA |
11 | 2025-06-23 |
Pollutant degradation in saline wastewater using synthetic biology
2025-Jun-21, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.06.012
PMID:40544014
|
research paper | 该研究利用合成生物学技术开发了一种工程化Vibrio natriegens菌株,用于高效降解高盐环境中的复杂有机污染物 | 通过合成生物学赋予微生物新能力,开发出能在高盐环境中降解复杂有机污染物的工程菌株 | NA | 解决全球性环境挑战,如石化废水排放和海洋石油泄漏 | 高盐环境中的复杂有机污染物 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
12 | 2025-06-23 |
Three cytochrome P450 88A subfamily enzymes, CYP88A108, CYP88A164, and CYP88A222, act as β-amyrin 11-oxidases involved in triterpenoid biosynthesis in Melia azedarach L
2025-Jun-18, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.145362
PMID:40541870
|
research paper | 该研究鉴定了Melia azedarach L中三个CYP88A亚家族细胞色素P450基因作为β-香树脂醇11-氧化酶参与三萜类生物合成 | 发现CYP88A亚家族酶具有双重功能,既能参与五环三萜生产也能参与柠檬苦素类生物合成,展示了植物CYP88A P450s独特的催化多功能性 | NA | 阐明Melia azedarach L中五环三萜生物合成的酶学机制 | Melia azedarach L中的三个CYP88A亚家族细胞色素P450基因(MaCYP88A108、MaCYP88A164和MaCYP88A222) | 植物生物化学 | NA | 转录组挖掘、烟草瞬时表达系统、酵母微粒体功能表征 | NA | 基因序列、酶活性数据 | NA |
13 | 2025-06-23 |
Methanol metabolism in synthetic methylotrophic microorganisms
2025-Jun-09, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108623
PMID:40499848
|
review | 本文探讨了甲醇在合成甲基营养微生物中的代谢途径及其在代谢工程中的最新进展 | 重点介绍了人工甲基营养中创新的C1同化途径 | NA | 增强对甲醇代谢的理解并释放合成甲基营养菌的工业潜力 | 合成甲基营养微生物 | 合成生物学 | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA |
14 | 2025-06-23 |
Structural prediction of potent non-coding RNAs
2025, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2025.05.002
PMID:40543912
|
review | 本文综述了非编码RNA(ncRNA)的结构预测及其在基因表达、细胞信号传导和多种生物过程中的作用 | 强调了ncRNA结构预测的重要性及其在治疗策略开发中的应用,并探讨了计算方法和实验技术的进展 | 在准确建模复杂RNA结构及理解RNA折叠动态性方面仍存在挑战 | 探索ncRNA的结构特征及其功能意义,以促进其在生物医学研究中的应用 | 非编码RNA(包括microRNA、小干扰RNA和长链非编码RNA) | 生物医学研究 | NA | 计算方法和实验技术 | NA | NA | NA |
15 | 2025-06-23 |
Digital switching in a biosensor circuit via programmable timing of gene availability
2014-Dec, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/nchembio.1680
PMID:25306443
|
研究论文 | 该研究展示了通过编程控制基因可用性时间,利用位点特异性重组酶来纠正多基因电路中的不良影响,显著提高了内源性microRNA比例传感器的性能 | 首次提出通过编程控制基因可用性时间来优化基因电路性能,显著提高了传感器的动态范围和特异性 | 研究仅在小规模实验中验证,尚未在复杂生物系统中进行大规模应用测试 | 优化合成生物学中基因电路的设计和性能 | 基因电路和microRNA比例传感器 | 合成生物学 | NA | 位点特异性重组酶技术 | NA | 基因表达数据 | 未明确说明具体样本数量,但涉及多种细胞类型的测试 |
16 | 2025-06-22 |
Integrase enables synthetic intercellular logic via bacterial conjugation
2025-Jun-18, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2025.101268
PMID:40300599
|
研究论文 | 本文介绍了一种通过细菌接合设计、构建和测试基于整合酶的细胞间DNA信息传递的通用策略 | 提出了基于整合酶的细胞间DNA信息传递及其通过水平基因转移调控的新方法 | NA | 推进细胞间DNA信息传递、分层信号处理以及整合酶在系统和合成生物学中的应用 | 细菌接合过程中的整合酶和DNA信息传递 | 合成生物学 | NA | 细菌接合 | NA | DNA | NA |
17 | 2025-06-22 |
A systems view of cellular heterogeneity: Unlocking the "wheel of fate"
2025-Jun-18, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2025.101300
PMID:40472847
|
综述 | 本文通过系统生物学的视角,探讨细胞异质性的概念及其在干细胞研究和再生医学中的应用 | 提出一个从细胞角度概念化异质性的框架,并总结了用于捕捉异质性的系统和合成生物学工具 | 未提及具体的技术或数据限制 | 探讨细胞异质性的生物学意义及其在干细胞研究和再生医学中的应用 | 人类多能干细胞(hPSC)培养和β细胞分化 | 系统生物学 | NA | 单细胞技术 | NA | NA | NA |
18 | 2025-06-22 |
BTG13-related metalloenzymes: Atypical non-heme iron-dependent dioxygenases with unusual coordination patterns and catalytic mechanisms
2025-Mar, Engineering microbiology
DOI:10.1016/j.engmic.2024.100188
PMID:40538716
|
research paper | 本文介绍了一种新型非血红素铁依赖性双加氧酶BTG13,其具有独特的配位中心和催化机制 | 发现了一种新型非血红素铁依赖性双加氧酶BTG13,具有由四个组氨酸和一个羧化赖氨酸(Kcx)组成的独特配位中心,并通过分子动力学模拟和量子化学计算揭示了其催化蒽醌C-C键断裂的非传统步骤 | NA | 研究非血红素铁依赖性双加氧酶的多样性和催化机制 | BTG13相关金属酶及其催化机制 | 生物化学 | NA | 分子动力学模拟, 量子化学计算, 系统发育分析 | NA | 生化数据 | NA |
19 | 2025-06-22 |
Parsing patterns: Emerging roles of tissue self-organization in health and disease
2024-Jun-20, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2024.05.016
PMID:38906093
|
review | 探讨生物组织中自组织模式在健康和疾病中的作用 | 综述了胚胎和成体组织中自组织模式的原理和机制,并探讨其在稳态、修复和病理状态中的作用 | NA | 理解自组织模式在生物组织中的普遍性和应用 | 胚胎和成体组织 | 生物学 | 炎症性皮肤病、肿瘤 | NA | NA | NA | NA |
20 | 2025-06-21 |
Construction of a synthetic biology toolkit for the genetic manipulation in the cellulose-producing strain Kosakonia oryzendophytica
2025-Sep, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2025.05.012
PMID:40529626
|
research paper | 开发了一个合成生物学工具包,用于在纤维素生产菌株Kosakonia oryzendophytica中进行遗传操作 | 构建了一个可调表达模块和精确基因组编辑能力的综合工具包,用于重编程菌株以生产具有定制特性的下一代纤维素基功能材料 | NA | 开发合成生物学平台以工程化高产细菌纤维素合成菌株 | Kosakonia oryzendophytica菌株 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9介导的无疤痕基因组编辑系统 | NA | NA | NA |