合成生物学相关文章
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当前共找到 4965 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-05-17 |
Modular Assembly of Higher-Order DNA Nanotube Tile Nanostructures Using DNA Annular Scaffolds
2026-May-15, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.6c04434
PMID:42139459
|
研究论文 | 提出一种基于DNA环形支架的模块化组装策略，用于构建高阶DNA纳米管瓦片纳米结构 | 通过DNA环形支架与短DNA基序互连，实现稳定且可编程的高阶DNA纳米管瓦片组装，具有超过99%的组装产率，并展示了布尔逻辑门和电路的构建 | 目前尚未提及在高阶结构组装中可能存在的长程有序性限制或体内应用可行性 | 开发一种整合DNA瓦片和DNA折纸优点的模块化组装策略，以克服高阶结构制造的当前限制 | DNA纳米管瓦片和DNA环形支架 | DNA纳米技术 | NA | DNA纳米技术, DNA瓦片, DNA折纸, 模块化组装 | 布尔逻辑门电路 | NA | NA | DNA环形支架, DNA基序 | NA | 布尔逻辑门和电路 | 纳米技术, 合成生物学 |
| 2 | 2026-05-17 |
PromoterAtlas: decoding regulatory sequences across Gammaproteobacteria using a transformer model
2026-May-15, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-72837-3
PMID:42140912
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研究论文 | 提出基于Transformer的模型PromoterAtlas，从3371种γ-变形菌的900万调控序列中学习，实现全基因组启动子注释 | 首次使用大规模跨物种调控序列训练Transformer模型，实现启动子序列的跨物种进化关系聚类与转录/翻译水平预测 | 模型训练数据仅限于γ-变形菌，可能无法直接推广到其他细菌类群 | 开发能识别多种调控元件并预测转录/翻译水平的通用启动子注释工具 | γ-变形菌的调控序列 | 机器学习 | NA | Transformer深度学习模型 | Transformer | 基因组序列 | 3371种细菌的900万条调控序列 | NA | NA | NA | 合成生物学, 比较基因组学 |
| 3 | 2026-05-17 |
A synthetic cell microreactor with two types of interacting dynamic DNA-based pores
2026-May-15, Nature chemistry
IF:19.2Q1
DOI:10.1038/s41557-026-02124-7
PMID:42141071
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研究论文 | 构建了一个含有两种动态DNA基孔的双颈合成细胞微反应器，用于模拟和扩展天然细胞系统的功能复杂性 | 创新地利用巨型单层囊泡膜动力学介导的信号通路，协调光响应小孔与自组装可密封大孔之间的相互作用，实现具有高时空精度的按需顺序递送分子反应物 | NA | 在合成生物学中重建细胞复杂性，通过动态DNA基孔实现膜渗透性的可控调节 | 巨型单层囊泡膜上的动态DNA基孔系统 | 合成生物学 | NA | DNA纳米技术 | NA | 图像 | NA | DNA折纸 | NA | 光响应小孔和自组装可密封大孔的信号通路，以及酶联反应、细胞骨架模拟和细胞外无细胞系统 | 生物技术, 纳米技术 |
| 4 | 2026-05-17 |
Micropeptides in Cancer and Immunity: Diagnostic, Therapeutic, and Synthetic Biology Frontiers
2026-May-14, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2026.150217
PMID:42140456
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综述 | 微肽在癌症与免疫中作为诊断、治疗及合成生物学前沿的新兴角色 | 重新定义编码与非编码基因组区域的长期区分，揭示微肽在癌症中的双重作用和作为新型治疗靶点的潜力 | 未明确讨论，但可能包括微肽功能验证的挑战和体内转化效率问题 | 探讨微肽在癌症免疫、诊断和治疗中的应用前景及合成生物学工程前沿 | 微肽（如SMIM30、circPDHK1-241aa、PDL1P41、HOXB-AS3、CIP2A-BP等）及其在癌症和免疫中的作用 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞蛋白基因组学、Ribo-seq、质谱、深度学习结构推断 | 深度学习 | 基因组数据、蛋白质组数据、结构数据 | 未指定 | CRISPR-Cas9 | NA | mRNA编码肽、CRISPR激活肽回路、靶向肽嵌合物 | 医学 |
| 5 | 2026-05-17 |
Toward predictable and programmable genetic circuits in plants
2026-May-14, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108924
PMID:42140530
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综述 | 探讨植物基因回路可预测和可编程设计的挑战与进展 | 从定量工程框架角度系统分析基因组和表观遗传背景等环境因素对基因回路行为的影响，并提出超越定性开关的定量传感与信息处理策略 | 未涉及实验验证或具体案例研究，仅基于文献综述提供理论框架 | 推动植物合成生物学从经验优化向可预测定量工程转变 | 植物基因回路及其调控机制 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 植物 | 基因回路 | 农业、环境 |
| 6 | 2026-05-17 |
Abiotic Stress Sensing in Plants: Biochemical and Biophysical Basis
2026-May-14, Molecular plant
IF:17.1Q1
DOI:10.1016/j.molp.2026.05.007
PMID:42141723
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综述 | 综述植物感知非生物胁迫的生化和生物物理机制，并讨论主要未解决问题和新兴研究方法 | 系统整合温度、干旱、盐碱、洪涝及土壤压实等多种胁迫的感知机制，强调生物物理过程与化学信号编码的逻辑，并引入AI建模、单细胞技术等前沿方法 | 未明确定量描述各感知机制的相对贡献，缺乏在单细胞或全株水平上空间组织的实验证据 | 阐明植物将环境胁迫从物理化学信号转化为生物信号的分子逻辑 | 植物（模式植物及农作物）中感知多种非生物胁迫的分子机制 | 植物生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, 合成生物学 | 植物 | NA | 农业 |
| 7 | 2026-05-17 |
TargetGAN: A generative AI framework for the design of plant core promoters with targeted activity
2026-May-11, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2026.101851
PMID:41981910
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研究论文 | 提出TargetGAN，一个基于生成对抗网络和预训练活性预测器的深度学习框架，用于设计具有目标活性的植物核心启动子 | 首次将GAN与活性预测器结合，实现用户自定义活性的植物核心启动子从头设计，并发现合成启动子可超越天然启动子的活性上限 | 预测活性与实验活性仅为中等相关性，且STARR-seq验证后只有约55%的合成启动子成功表征 | 开发一个能够设计具有目标活性的植物核心启动子的通用框架 | 植物核心启动子的设计和功能验证 | 机器学习 | NA | STARR-seq，荧光素酶报告基因检测，深度测序 | 生成对抗网络 (GAN) 和预训练活性预测器 | DNA序列 | 训练集包含76,851个天然启动子；生成了55,296个合成启动子，其中5,250个用于高通量功能验证，2,909个成功表征 | NA | 植物（拟南芥原生质体用于STARR-seq验证） | 植物核心启动子设计（包含激活基序的精确排列） | 农业，合成生物学 |
| 8 | 2026-05-17 |
A Linear Mixed Effects Model for Evaluating Synthetic Gene Circuits
2026-May-11, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00171
PMID:42112575
|
研究论文 | 提出一种线性混合效应模型来评估合成基因电路的布尔逻辑门性能 | 首次将线性混合效应模型应用于合成基因电路统计评估，并推荐样本量标准 | 模型对非线性逻辑（如XOR）可能不适用且依赖高质量实验数据 | 标准化合成基因电路布尔逻辑门的统计评估方法 | 144个已发表的布尔逻辑门及模拟数据 | NA | NA | NA | 线性混合效应模型、k-means聚类 | 基因表达数据 | 144个布尔逻辑门（实际数据）及模拟数据 | NA | NA | 布尔逻辑门（OR、AND等） | 合成生物学、生物计算、生物传感、人类健康 |
| 9 | 2026-05-17 |
Growth versus decline: root aging and plant performance
2026-May-05, The Plant cell
DOI:10.1093/plcell/koag115
PMID:41990352
|
综述 | 综述根老化对植物生长的影响及延迟根老化的潜在策略 | 首次从概念上桥接根系生长调节与根老化过程，并提出利用遗传学和合成生物学方法延迟根老化以提升作物生产力 | 由于技术挑战，对老根采样和分析的研究有限 | 探讨根老化机制及其对植物生长的影响，并评估延迟根老化的策略在提高作物产量和应对气候变化中的潜力 | 根系 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学方法 | 植物 | 延迟根老化或再激活老根生长的遗传和合成生物学回路 | 农业, 环境 |
| 10 | 2026-05-17 |
RNA Aptamers and Epitranscriptomics: Charting Unexplored Territories in RNA Biology
2026-May, Molecular diagnosis & therapy
IF:4.1Q1
DOI:10.1007/s40291-026-00841-w
PMID:41838348
|
评论文章 | 探讨RNA适配体与表观转录组学在RNA生物学中的交叉领域及其潜在应用 | 首次系统性地提出RNA适配体与表观转录组学之间的相互作用，包括RNA修饰如何影响适配体折叠或结合，以及适配体如何用于检测或调节表观转录组状态 | 这两个领域之间的直接调控联系尚未完全阐明，内容主要基于概念性探讨而非实验验证 | 激发RNA适配体和表观转录组学领域之间的跨学科讨论，并吸引对这些交叉领域进行未来研究 | RNA适配体和表观转录组学修饰（如N6-甲基腺苷、假尿苷和5-甲基胞嘧啶） | 分子生物学, 合成生物学 | NA | SELEX | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学, 诊断, 合成生物学 |
| 11 | 2026-05-17 |
Plant-derived indole alkaloids in chronic inflammatory diseases: molecular mechanisms, therapeutic potential and translational challenges
2026-May, Inflammopharmacology
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s10787-026-02244-z
PMID:42009998
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综述 | 整合植物来源吲哚生物碱在慢性炎症性疾病中的化学、来源、机制通路及治疗潜力证据 | 系统总结了单萜和色氨酸衍生吲哚生物碱通过整合AhR与NF-κB/STAT3通路实现器官选择性治疗的前景 | 主要基于临床前证据，转化医学面临合成生物学、代谢组学和合理杂合设计等挑战 | 评估植物来源吲哚生物碱在慢性炎症性疾病中的分子机制、治疗潜力及转化障碍 | 植物来源吲哚生物碱及其在慢性炎症性疾病中的作用 | 机器学习 | 慢性炎症性疾病 | NA | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 12 | 2026-05-17 |
Engineering ligands for theophylline riboswitches expands its regulatory dynamic range in prokaryotic and eukaryotic systems
2026-Mar-23, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-70870-w
PMID:41872214
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研究论文 | 通过结构设计合成4-喹唑啉酮衍生物，显著提升茶碱核糖开关在原核和真核系统中的调控动态范围 | 首次通过结构导向方法设计合成4-喹唑啉酮衍生物，使茶碱适配体结合亲和力提升30倍，基因表达动态范围在细菌中达到380倍 | 未说明 | 提升茶碱核糖开关的调控动态范围，以增强生物技术应用中基因调控的精确性 | 茶碱核糖开关及其在细菌、分枝杆菌和真核系统中的调控性能 | 合成生物学 | 未适用 | 结构导向配体设计、核糖开关调控 | 未适用 | 未适用 | 未适用 | CRISPR-Cas9 | 细菌、分枝杆菌、真核细胞 | 核糖开关介导的条件性基因表达 | 生物医学工程 |
| 13 | 2026-05-17 |
Reprogramming the SARS-CoV-1 Neutralizing Antibody S230 to SARS-CoV-2 via Directed Evolution and Molecular Docking-Based Binding Mode Analysis
2025-12-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00425
PMID:41236374
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研究论文 | 结合定向进化和分子对接分析，将SARS-CoV-1中和抗体S230重新编程为靶向SARS-CoV-2的抗体 | 通过少量协同突变即可在进化上分化但结构保守的靶标间重建抗原识别，建立了基于合成生物学原理的模块化可进化抗体重编程平台 | 未提及抗体在体内的稳定性和免疫原性评估 | 将SARS-CoV-1中和抗体S230的抗原特异性重编程至SARS-CoV-2 | SARS-CoV-1中和抗体S230及其突变体 | 合成生物学 | COVID-19 | 定向进化、分子对接、细菌展示 | NA | 蛋白质序列和结构数据 | 一个突变文库和少数筛选出的克隆 | NA | 大肠杆菌 | NA | 医学 |
| 14 | 2026-05-17 |
CTRL Enables Gene-Specific RNA Regulation Using CRISPR-Cas7-11
2025-11-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00658
PMID:41202215
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研究论文 | 利用CRISPR-Cas7-11效应器开发了一种名为CTRL的基因特异性RNA调控工具，实现对mRNA和蛋白质表达的高效、可调抑制 | 首次利用CRISPR-Cas7-11的直接重复序列加工活性开发基因抑制工具，实现可调控的基因特异性RNA调控，并在多种模式系统中展示广泛适用性 | NA | 开发一种新型基因表达调控工具以实现精确的RNA靶向抑制 | 合成mRNA分子及Cas7-11效应器的多种变异体 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas7-11 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas7-11 | 多种模式系统 | CRISPR-Cas转基因可抑制元件，用于靶向合成mRNA | 医学, 生物技术 |
| 15 | 2026-05-17 |
Harnessing Fungal Secretion Systems for Precision Fermentation of Food Proteins
2025-11-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00521
PMID:41220338
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综述 | 探讨利用真菌分泌系统进行食品蛋白质精密发酵的策略与挑战 | 系统阐述了酵母和丝状真菌分泌途径在精密发酵生产食品蛋白质中的作用，并强调数据驱动的分泌效率工程是从小规模生产向工业化制造的关键 | 未提供具体实验数据支持，仅基于现有研究提出观点和未来方向 | 分析如何通过修饰分泌途径提高蛋白质分泌效率，以实现精密发酵食品蛋白质的成本效益和规模化生产 | 酵母和丝状真菌等微生物宿主及其蛋白质分泌途径 | 合成生物学, 蛋白质工程, 生物加工优化 | NA | 精密发酵, 蛋白质分泌工程 | NA | NA | NA | NA | 酵母, 丝状真菌 | 蛋白质分泌途径修饰 | 食品工业, 替代蛋白质生产 |
| 16 | 2026-05-17 |
Advanced Large DNA Manipulation Technologies for Constructing Microbial Cell Factories
2025-11-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00539
PMID:41105858
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综述 | 系统总结大DNA操作技术四类核心原理及其在构建微生物细胞工厂中的应用进展 | 首次从克隆、组装、递送和重排四类技术角度系统归纳大DNA操作技术，并探讨其在复杂生物合成基因簇获取、多基因途径构建及代谢网络优化中的关键作用 | 未提及具体技术细节的比较或局限性分析 | 为构建高性能微生物细胞工厂提供大DNA操作技术参考 | 微生物细胞工厂 | 合成生物学 | NA | 大DNA操作技术 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | NA | 生物制造 |
| 17 | 2026-05-17 |
Application of Rational and Irrational Strategies in the Construction of Prokaryotic Cell Factories for the Bioproduction of Aromatic Amino Acid-Derived Chemicals
2025-11-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00711
PMID:41137187
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综述 | 综述了利用合理与非理性策略构建原核细胞工厂生产芳香族氨基酸衍生物的研究进展 | 重点总结了合理与非理性策略在构建原核细胞工厂中的应用，并探讨了未来发展方向 | 未具体提及研究局限，但可能涉及当前发酵生产面临的高滴度和产率挑战 | 为生产芳香族氨基酸衍生物的原核细胞工厂的构建和优化提供见解和指导 | 原核细胞工厂 | 代谢工程与合成生物学 | NA | 代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 原核生物 | NA | 工业生物技术 |
| 18 | 2026-05-17 |
Programmable Biointerfaces and Adaptive Functionality in Next-Generation Green Nanomaterials
2025-10-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00620
PMID:40999683
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综述 | 探讨合成生物学、DNA纳米技术、人工智能和先进制造等融合创新如何为开发具有环境响应功能的可编程纳米材料创造机遇 | 提出生物相容性从静态特性向动态可编程特性的根本性重新概念化，实现纳米材料像复杂生物实体而非传统治疗剂运行 | 在稳定性、灵敏度和制造可扩展性方面仍存在显著挑战 | 综述下一代绿色纳米材料中可编程生物界面与自适应功能性的研究进展 | 绿色纳米材料 | 纳米技术 | NA | DNA纳米技术, 4D生物打印 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, 合成生物学 | 工程微生物系统 | 基因电路驱动的响应系统, DNA刺激响应结构, 分子逻辑门 | 医学 |
| 19 | 2026-05-17 |
A Decade of SBOL Visual: Growing Adoption of a Diagram Standard for Engineering Biology
2025-10-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00417
PMID:41016059
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综述 | 回顾SBOL Visual标准过去十年的发展历程，从最初的21个图形符号演变为全面的生物设计图解语言，并分析其采纳情况与未来展望 | 系统梳理了SBOL Visual标准从1.0到3.0版本的演变过程，并首次评估了其在科学出版物、可视化工具开发及遗传设计信息交流中的采纳趋势 | 尽管采纳率稳步增长，但实现完全合规和最佳实践的广泛应用仍需额外努力 | 回顾SBOL Visual标准十年发展并评估其采纳情况，为合成生物学图形标准优化提供参考 | SBOL Visual标准及其在合成生物学领域的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 文本和图形数据 | NA | SBOL Visual, SBOL | NA | 遗传设计图解语言 | 工业生物技术 |
| 20 | 2026-05-17 |
Automated Strain Construction for Biosynthetic Pathway Screening in Yeast
2025-10-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00554
PMID:41063332
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研究论文 | 本文提出了一个自动化菌株构建工作流程，用于在酵母中筛选生物合成途径 | 通过Hamilton Microlab VANTAGE机器人集成离线硬件，实现了构建步骤的自动化，提高了通量至每周2000次转化，并开发了用户界面支持参数定制 | 未提及，但从技术说明性质看，可能缺乏大规模验证或通用性测试 | 自动化合成生物学中的菌株构建流程，加速途径发现与优化 | 工程酵母菌株中生产维拉嗪（一种甾体生物碱生物合成关键中间体）的基因库 | 合成生物学 | NA | 自动化菌株构建、基因库筛选 | NA | 基因序列数据 | 每周2000次转化（通量数据） | NA | 酿酒酵母 | 生物合成途径（维拉嗪生产） | 工业生物技术、医药 |