本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['synthetic biology']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价9.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-03-08 |
Macrophages: Redefining extracellular matrix architecture through phenotypic switches as therapeutic targets
2026-Jul, Biomaterials
IF:12.8Q1
|
综述 | 本文综述了巨噬细胞在组织稳态中的核心作用,重点关注其表型转换如何重塑细胞外基质结构,并探讨了靶向巨噬细胞的治疗策略及其挑战 | 强调了巨噬细胞表型转换在细胞外基质重构中的关键作用,并提出了整合多组学、合成生物学和AI辅助生物材料开发'智能'疗法的未来方向 | 在实现时空精准调控和平衡促修复与促纤维化结果方面仍面临挑战 | 探讨巨噬细胞生物学及其作为治疗靶点在恢复组织稳态和解决难治性疾病中的潜力 | 巨噬细胞,包括其发育起源、表型异质性以及在细胞外基质重塑、免疫监视和器官稳态中的多面角色 | NA | NA | 多组学分析、合成生物学、AI辅助生物材料 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 2 | 2026-03-08 |
Natural products as modulators of ferroptosis: Therapeutic implications and molecular mechanisms in disease treatment
2026-May, The Journal of nutritional biochemistry
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.jnutbio.2026.110259
PMID:41490559
|
综述 | 本文综述了天然产物作为铁死亡调节剂在疾病治疗中的分子机制与治疗潜力 | 系统性地基于结构类别和作用机制对天然产物进行分类,并强调纳米递送系统和合成生物学作为克服其应用限制的前沿策略 | 天然产物的应用受到来源受限、成分复杂和药代动力学不稳定的限制 | 探讨天然产物作为铁死亡调节剂在疾病治疗中的治疗意义和分子机制 | 天然产物(如萜类、黄酮类、生物碱、皂苷和多酚)及其对铁死亡的调节作用 | NA | 癌症、神经退行性疾病、糖尿病、心血管疾病 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 3 | 2026-03-08 |
Modulation of Clostridioides difficile virulence by metabolites derived from probiotic consortia and genetically edited strains
2026 May-Jun, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108818
PMID:41638450
|
综述 | 本文综述了通过代谢物调节艰难梭菌毒力的策略,重点探讨了恢复次级胆汁酸代谢、增加短链脂肪酸产量和破坏群体感应系统如何协同抑制毒素表达、生物膜形成和孢子萌发 | 提出了一种协同多靶点(胆汁酸代谢、短链脂肪酸、群体感应)抑制艰难梭菌毒力的策略,并展望了合成生物学和代谢工程在开发下一代工程益生菌和活体生物治疗产品中的应用 | NA | 探讨通过调节肠道代谢网络来抑制艰难梭菌毒力、控制感染复发的策略 | 艰难梭菌及其毒力因子(毒素、生物膜、孢子) | 合成生物学 | 艰难梭菌感染 | 多组学(基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学)、计算建模 | NA | 多组学数据 | NA | 代谢工程 | 益生菌、工程微生物群落 | 具有可编程群体淬灭能力和优化代谢输出的活体生物治疗产品 | 医学 |
| 4 | 2026-03-08 |
Genetic toolbox development for engineering Bacteroides and other bacterial species
2026-Apr, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2026.102709
PMID:41643388
|
综述 | 本文综述了为非模型细菌菌株开发合成生物学工具箱的策略,以 Bacteroides 属为例,探讨如何建立分子生物学框架 | 强调为非模型共生和益生菌菌株开发定制化遗传工具,以支持原位工程化活体治疗或诊断机器的构建 | NA | 开发合成生物学工具箱,以促进非模型细菌菌株的遗传和代谢操作 | Bacteroides 属及其他非模型细菌物种 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | Bacteroides, E. coli | 逻辑门、生物传感器、代谢途径 | 医学 |
| 5 | 2026-03-08 |
Sea buckthorn for future foods: bioactive mechanisms, synthetic biology, and precision delivery systems
2026-Apr-01, Food research international (Ottawa, Ont.)
DOI:10.1016/j.foodres.2026.118364
PMID:41763752
|
综述 | 本文综述了沙棘作为未来食品的潜力,重点探讨了其生物活性机制、合成生物学应用及精准递送系统 | 整合了合成生物学(如CRISPR/Cas9代谢工程)与纳米技术递送系统,为沙棘在功能性食品中的规模化应用提供了前瞻性框架 | NA | 探讨沙棘在功能性及个性化食品开发中的应用潜力与实现路径 | 沙棘(Hippophae rhamnoides)及其生物活性成分(类黄酮、类胡萝卜素、脂肪酸、维生素、多糖) | NA | NA | CRISPR/Cas9介导的代谢工程、精准发酵、纳米技术递送系统 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | NA | 代谢工程 | 食品, 农业 |
| 6 | 2026-03-08 |
Adenosine Triphosphate-Producing Artificial Cells: Biomimetic Construction Strategies and Applications
2026-Mar-13, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.202500934
PMID:41773731
|
综述 | 本文综述了近年来ATP合成人工细胞的仿生构建策略及其应用进展 | 系统整合了三种ATP合成人工细胞的构建策略(模型膜-质子泵-ATPase协同集成、直接封装完整细胞器、构建非经典系统),并探讨了其在CO2固定和代谢调控等仿生应用中的催化效能与大分子封装能力 | NA | 推动ATP合成人工细胞领域从基础研究向实际应用转化 | ATP合成人工细胞(能量自主人工细胞) | 合成生物学 | NA | 自下而上构建模型(脂质体、聚合物体、融合液滴、油包水胶束、金属有机框架等) | NA | NA | NA | NA | NA | 模拟氧化/光合磷酸化途径的ATP合成系统,包括质子泵与ATPase的级联能量转换、精氨酸降解途径等非经典系统 | 合成生物学、靶向药物递送、再生疗法、生物混合能量转换装置 |
| 7 | 2026-03-08 |
Metabolic Engineering and Synthetic Biology-Driven Strategies to Harness Microbial Production of Adipic Acid: Current Status and Future Direction
2026-Mar-06, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00869
PMID:41790735
|
综述 | 本文综述了利用代谢工程和合成生物学策略驱动微生物生产己二酸的当前进展与未来方向 | 批判性地讨论了生物合成路径、先进的代谢工程策略和工具,以构建高转化效率的细胞工厂,并全面回顾了发酵过程和下游分离技术的基本原理 | 工业上可行的己二酸生物合成技术仍面临原料利用不完全、菌株转化效率低、发酵过程复杂和下游分离成本高等挑战 | 开发可持续的生物合成技术以生产己二酸,满足市场需求并解决环境问题 | 己二酸(AA)作为尼龙-6,6的前体 | NA | NA | 代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | E. coli, S. cerevisiae, B. subtilis | 生物传感器、代谢途径 | 工业生物技术、材料 |
| 8 | 2026-03-08 |
Seizing the key nodes in glabridin biosynthesis network: identification of enzymes for producing licorice hairy roots with high levels of glabridin
2026-Mar-05, Molecular horticulture
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s43897-025-00202-x
PMID:41782076
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析和体外酶活验证,阐明了光甘草定生物合成的两条关键途径,并利用转基因毛状根体系实现了光甘草定的高效生产 | 首次系统解析了光甘草定生物合成网络中的关键酶与两条互作途径,并建立了44倍产量提升的转基因毛状根生产平台 | 未在田间或大规模发酵体系中验证生产平台的稳定性与经济效益 | 解析光甘草定生物合成途径并建立高效生物生产体系 | 甘草(Glycyrrhiza glabra)及其光甘草定生物合成相关酶 | 合成生物学 | NA | 多组学分析、体外酶活测定、农杆菌介导的遗传转化 | NA | 组学数据、酶活数据、代谢物含量数据 | 转基因毛状根系及4年生野生根对照 | 农杆菌介导转化 | 甘草毛状根 | 光甘草定生物合成途径(OMT/ODMT依赖与非依赖双途径) | 医药、化妆品 |
| 9 | 2026-03-08 |
Green Biosynthesis of Terpenoid-Derived Flavor and Fragrance Compounds: Advances and Strategic Perspectives
2026-Mar-04, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c08719
PMID:41718042
|
综述 | 本文系统综述了利用合成生物学策略绿色生物合成萜类香料化合物的最新进展与未来展望 | 从低成本底物利用、宿主菌株兼容性选择、酶修饰、动态途径调控、细胞区室化和毒性耐受性增强等多角度,系统总结了萜类生物合成的关键工程策略,并探讨了多策略与先进技术整合的未来方向 | NA | 为萜类化合物的可持续生产提供关键见解和指导 | 萜类及其衍生物 | 合成生物学 | NA | 生物合成 | NA | NA | NA | NA | 微生物细胞工厂 | 代谢途径 | 食品, 工业生物技术 |
| 10 | 2026-03-08 |
Combining model-based and data-driven models: an application to synthetic biology resource competition
2026-Mar-04, Mathematical biosciences
IF:1.9Q3
DOI:10.1016/j.mbs.2026.109649
PMID:41791590
|
研究论文 | 本文提出了一种结合机理模型与机器学习的方法(ePINNs),用于解决合成生物学中基因电路因资源竞争而产生的意外行为问题 | 提出了部分不确定模型结构(PUMS)的概念和嵌入式物理信息神经网络(ePINNs),通过两个共享损失的神经网络无缝融合机理模型与数据驱动模型 | NA | 探索机器学习与机理模型的集成方法,以增强模型预测鲁棒性、系统洞察力和对稀疏/噪声数据的处理能力 | 合成生物学中的基因网络模型(受资源竞争影响) | 机器学习 | NA | 机器学习,物理信息神经网络 | 嵌入式物理信息神经网络(ePINNs) | NA | NA | NA | 活细胞 | 基因电路(受资源竞争影响) | 合成生物学 |
| 11 | 2026-03-08 |
Engineering microbial cell factories for succinic acid biomanufacturing: Challenges and perspectives
2026-Mar-04, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108861
PMID:41791685
|
综述 | 本文系统评述了用于琥珀酸生物制造的微生物细胞工厂的工程化策略、挑战与未来展望 | 提供了关于菌株开发和生物过程整合的多学科视角,为设计高效微生物细胞工厂和加速生物基琥珀酸的商业化提供了战略框架 | NA | 评述微生物细胞工厂用于琥珀酸生物制造的工程化策略,以推动其商业化进程 | 用于琥珀酸生产的微生物平台,包括某些细菌和酵母 | 合成生物学 | NA | 系统生物学、代谢建模、过程工程、合成生物学工具 | NA | NA | NA | NA | 细菌, 酵母 | 天然和异源生物合成途径的理性设计 | 工业生物技术 |
| 12 | 2026-03-08 |
An Easy-To-Use and Field-Deployable Cell-Free Bioreporter for Environmental Detection of Tetracyclines and Macrolides
2026-Mar-03, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.5c04800
PMID:41693084
|
研究论文 | 本文开发了一种基于合成生物学的无细胞生物报告系统,用于环境中四环素和大环内酯类抗生素的检测 | 该系统整合了抗生素响应转录因子、RNA聚合酶和工程化DNA转录模板,通过体外转录反应产生可见荧光信号,无需生物安全防护,可冻干保存并适用于现场部署 | NA | 开发一种便携、快速且无需复杂仪器的环境抗生素检测方法 | 四环素和大环内酯类抗生素在环境水样中的检测 | 合成生物学 | NA | 体外转录反应 | NA | 荧光信号 | 真实水样 | 合成生物学 | 无细胞系统 | 抗生素响应生物传感器 | 环境 |
| 13 | 2026-03-08 |
BOTany methods: accessible automation for plant synthetic biology
2026-Mar-02, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiag066
PMID:41715940
|
研究论文 | 本文开发了一套模块化的BOTany方法,利用Opentrons OT-2机器人自动化植物合成生物学中的常见分子生物学实验流程 | 通过提供无需编码经验的模块化自动化协议,降低了植物合成生物学实验的自动化门槛,增强了实验的可重复性和通量 | 方法依赖于特定机器人平台(Opentrons OT-2),且可能受限于3D打印设备的性能 | 提高植物合成生物学实验的自动化可及性,以加速设计-构建-测试-学习循环 | 植物合成生物学中的分子生物学实验流程,如PCR设置、植物模块化克隆和细菌转化 | 合成生物学 | NA | 自动化液体处理、植物模块化克隆(MoClo)、PCR、细菌转化、质粒提取 | NA | 实验协议和表格输入数据 | NA | Opentrons OT-2机器人、3D打印技术 | 植物、细菌 | 植物模块化克隆(MoClo)系统 | 农业、工业生物技术 |
| 14 | 2026-03-08 |
Genomic perplexity and the evolution of context-dependent function
2026-Mar-02, Molecular biology and evolution
IF:11.0Q1
DOI:10.1093/molbev/msag041
PMID:41739546
|
研究论文 | 本文提出基因组像大型语言模型一样不编码固定功能,而是编码功能和表型结果的概率分布,并引入“基因组困惑度”概念来量化基因流动的适应度成本 | 将基因组功能与大型语言模型进行概念类比,提出基因组编码概率分布而非固定功能的新框架,并首次引入“基因组困惑度”作为量化基因流动适应度成本的信息论度量 | 提出的框架目前主要是概念性的,需要更多实证研究来验证其预测能力,且对基因组复杂性的简化可能忽略某些生物学细节 | 探讨基因组功能的上下文依赖性及其进化意义,为理解基因流动和合成生物学提供新框架 | 基因组功能、基因流动(水平基因转移和基因渗入)、表型结果 | 计算生物学 | NA | 泛基因组学、合成生物学、全基因组关联研究(GWAS) | Transformer、大型语言模型(LLM) | 基因组数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学、进化建模 |
| 15 | 2026-03-08 |
Self-assembled cell-scale containers made from DNA origami membranes
2026-Mar, Nature materials
IF:37.2Q1
DOI:10.1038/s41563-025-02418-0
PMID:41315785
|
研究论文 | 本文报道了一种受脂质结构启发的DNA折纸单层膜自组装方法,可形成囊泡或中空管状结构 | 首次利用DNA折纸技术构建细胞尺度的动态膜结构,突破了传统蛋白质/脂质膜的限制 | 未明确说明结构的长期稳定性及在复杂生物环境中的功能表现 | 开发新型仿生隔室化技术用于合成生物学和细胞尺度软机器人 | DNA折纸膜自组装结构(囊泡/中空管) | 合成生物学 | NA | DNA折纸技术 | NA | 结构成像数据 | NA | DNA折纸 | NA | 仿脂质结构的径向对称DNA折纸亚基自组装膜 | 生物技术, 软体机器人 |
| 16 | 2026-03-08 |
Glassy Dynamics as a Predictive Framework for Lipid Exchange Across Membranes
2026-Mar, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202512844
PMID:41562888
|
研究论文 | 本文提出了一种受玻璃态动力学启发的热力学-动力学框架,用于预测跨膜脂质交换的活化能和转移时间尺度 | 利用脂质囊泡的热膨胀系数这一单一实验可测参数,应用集体小位移模型进行无调整参数的预测,将脂质交换过程与无定形材料中的协同分子事件联系起来 | NA | 建立脂质跨膜交换的定量预测框架 | 脂质囊泡和跨膜脂质交换过程 | 软物质物理 | NA | 无标记石英晶体微天平实验 | 集体小位移模型 | 实验数据 | 多个脂质系统 | NA | NA | NA | 药物递送、生物仿生材料设计、纳米生物技术 |
| 17 | 2026-03-08 |
Mistletoe- and Mussel-Inspired Fabrication of Hierarchically Structured Protein-Cellulose Scaffolds From Biomolecular Condensates
2026-Mar, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202520827
PMID:41603494
|
研究论文 | 本研究受槲寄生和贻贝启发,利用生物分子凝聚相开发了一种可调控层次结构的蛋白质-纤维素复合支架的制备方法 | 首次结合贻贝足蛋白-1(rMfp-1)与表面功能化阴离子纤维素纳米棒,通过多组分相分离形成具有核壳形态的凝聚相,并以此制备可调控多孔结构的组织工程支架 | 未明确说明支架在体内组织工程应用中的具体生物相容性、降解性能及长期稳定性数据 | 开发一种受自然启发的生物可再生、水基的层次结构材料制备方法,用于组织工程支架 | 重组贻贝足蛋白-1(rMfp-1)与表面功能化阴离子纤维素纳米棒形成的生物分子凝聚相 | 生物材料 | NA | 冷冻干燥、光谱学与成像技术(多种模态) | NA | 光谱数据、成像数据 | NA | NA | NA | NA | 医学(组织工程) |
| 18 | 2026-03-08 |
Enhanced Heterologous Production of Tylosin Through Pathway Reconstruction and Integrated Optimization in Streptomyces
2026-Mar, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.70203
PMID:41761947
|
研究论文 | 本研究通过克隆泰乐菌素生物合成基因簇,在链霉菌宿主中实现异源表达,并通过培养基优化、启动子替换和调控基因敲除等策略,显著提高了泰乐菌素的产量 | 采用ExoCET技术克隆大型GC-rich基因簇,通过两步组装策略在三种链霉菌宿主中实现异源表达,并综合运用培养基优化、启动子工程和调控基因敲除进行系统优化 | 未提及泰乐菌素类似物的开发或规模化生产的验证 | 提高泰乐菌素的异源生物合成效率 | 泰乐菌素生物合成基因簇及其在链霉菌中的异源表达 | 合成生物学 | NA | ExoCET技术、基因克隆、启动子替换、基因敲除 | NA | NA | 三种链霉菌宿主(包括S. albus J1074) | ExoCET, 基因敲除 | Streptomyces fradiae QL100, Streptomyces albus J1074, 链霉菌宿主 | 泰乐菌素生物合成途径重构,包括启动子替换(tylGI和tylI)和调控基因(tylQ)敲除 | 医药 |
| 19 | 2026-03-08 |
Versatile 2-Oxoglutarate-Dependent Dioxygenases Catalyze Radical-Mediated Multifunctional Skeleton Reconstructions and Oxidation Modifications of Taxoids
2026-Feb-26, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.6c01169
PMID:41746272
|
研究论文 | 本文鉴定并表征了两种新型的2-氧戊二酸依赖性双加氧酶TcOGD1和TcOGD2,揭示了它们通过自由基介导的机制催化紫杉烷类化合物骨架重构和氧化修饰的多种功能 | 首次报道了具有广泛催化多功能性的2-氧戊二酸依赖性双加氧酶,能够催化紫杉烷从6/8/6骨架向5/7/6、-5/7/6和6/12等多种骨架的重构,以及多个位点的氧化修饰 | NA | 探索5/7/6骨架紫杉烷类化合物的化学多样性和生物合成途径 | 紫杉烷二萜类化合物及其生物合成酶 | 合成生物学 | NA | 酶促反应放大、核磁共振波谱 | NA | NA | NA | 酶工程 | NA | NA | 医药 |
| 20 | 2026-03-08 |
DNA Framework-Encoded Digital Recorder for Bacterial Discrimination
2026-Feb-25, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.6c01091
PMID:41738382
|
研究论文 | 本文开发了一种基于DNA框架的位置编码系统(DFDR),用于同时区分多个核酸序列,并应用于细菌鉴别 | DFDR系统通过三角形DNA框架实现位点特异性功能化,单单元可同时解析18个核酸靶标,比传统DNA自组装系统提高6倍多重检测能力,支持时序控制和可重写记录 | NA | 开发一种高分辨率追踪多重分子信息的系统,用于细菌鉴别和诊断 | 核酸序列(包括16S rRNA混合物)和临床相关呼吸道病原体 | 合成生物学 | 呼吸道感染 | DNA框架自组装 | NA | 核酸序列数据 | 医院环境和自然河水样本 | NA | NA | 位置编码系统(DFDR),基于三角形DNA框架设计 | 医学诊断、环境监测 |