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当前共找到 3992 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2025-12-06 |
Microbial-mycotoxin interactions in food: A review of ecotoxicological implications and omics approaches for understanding detoxification mechanisms
2026-Apr, Food microbiology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.fm.2025.104955
PMID:41344758
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综述 | 本文综述了食品中微生物与霉菌毒素的相互作用，重点关注其生态毒理学影响以及利用组学方法阐明微生物解毒机制 | 系统整合了微生物解毒机制（吸附与酶促降解）与多组学技术（宏基因组学、基因组学、转录组学）的应用，并展望了合成生物学、CRISPR基因编辑和机器学习辅助生物信息学等未来方向 | 微生物解毒效率存在可变性、作用机制尚不明确、面临监管障碍，以及在复杂食品基质中检测掩蔽型霉菌毒素存在挑战 | 探讨食品系统中微生物与霉菌毒素的相互作用，以开发可持续的解毒策略，保障食品安全并降低生态毒理学影响 | 霉菌毒素（如黄曲霉毒素、赭曲霉毒素A、伏马菌素、单端孢霉烯族毒素、玉米赤霉烯酮）及其与微生物的相互作用 | NA | NA | 宏基因组学、基因组学、转录组学、多组学整合分析 | NA | NA | NA | CRISPR基因编辑 | NA | NA | 食品、农业、环境 |
| 2 | 2025-12-06 |
Fusarium-responsive materials: A next-generation strategy for sensing, actuation, and sustainable crop protection
2026-Feb-01, Talanta
IF:5.6Q1
DOI:10.1016/j.talanta.2025.128967
PMID:41061457
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综述 | 本文探讨了融合纳米技术、化学传感和智能驱动技术，构建能够实时识别病原体并自主干预的镰刀菌响应材料，以应对全球农业中镰刀菌属病原体带来的威胁 | 提出了“镰刀菌响应材料”这一新范式，将病原体特异性生物传感与刺激响应型纳米载体递送系统相结合，并展望了与机器学习、自供能传感器及合成生物学融合的智能、精准、可持续作物保护框架 | 本文是一篇展望性综述，主要提出概念框架和研究方向，未报告具体的实验数据或验证结果 | 旨在为应对镰刀菌属病原体对全球农业、粮食安全和可持续性的威胁，探索一种集实时传感与自主干预于一体的下一代作物保护策略 | 镰刀菌属病原体及其相关的生化特征，如挥发性有机化合物、霉菌毒素和酶标记物 | NA | NA | 电化学传感、光学传感、等离子体传感、机器学习算法 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 农业 |
| 3 | 2025-12-06 |
Advancements in photosynthetic efficiency: Pathways, regulation, and biotechnological applications for enhancing crop productivity
2025-Dec-31, Plant signaling & behavior
IF:2.8Q2
DOI:10.1080/15592324.2025.2596483
PMID:41346023
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综述 | 本文综述了通过分子、生化和生物物理策略提高光合作用效率的最新进展，重点关注调控机制、生物技术创新及其在提升作物生产力方面的应用 | 系统整合了光合作用关键调控过程（如RuBisCO活性、ATP合成酶功能、光系统）的最新见解，并强调了利用CRISPR/Cas9基因组编辑、合成生物学和系统建模对光合途径进行理性重设计以改善碳同化和胁迫抗性的创新方法 | NA | 提高光合作用效率以克服作物生产力的内在限制，并开发气候适应型的高产作物 | 光合作用过程、关键酶与复合物（如RuBisCO、ATP合成酶、光系统）、C₃/C₄/CAM作物 | NA | NA | 基因组编辑（CRISPR/Cas9）、合成生物学、系统建模、高通量表型分析、多组学分析、计算建模 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 作物植物（C₃、C₄、CAM类型） | 光合作用途径的理性重设计，包括碳固定途径（如将C₄和CAM性状引入C₃作物）、光保护与光呼吸途径的修饰 | 农业 |
| 4 | 2025-12-06 |
Deciphering guanidine assimilation and riboswitch-based gene regulation in cyanobacteria for synthetic biology applications
2025-Dec-09, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2519335122
PMID:41343670
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研究论文 | 本文研究了蓝藻中胍的代谢途径及其基于核糖开关的基因调控机制，为合成生物学应用提供新工具 | 揭示了蓝藻中胍水解酶（GdmH）在胍同化中的作用，并验证了胍-I核糖开关在异源基因表达中的精确可控性 | 未完全阐明胍在高于1 mM浓度下的其他摄取机制，且研究主要基于蓝藻模型，在其他生物中的适用性有待验证 | 探索蓝藻中胍的代谢调控机制，并开发基于核糖开关的合成生物学工具 | 蓝藻（如sp. PCC 6803）及其胍代谢相关基因（GdmH、GimA、PrqA）和核糖开关 | 合成生物学 | NA | 基因表达调控分析、突变体构建、核糖开关验证 | NA | 基因序列、表达数据、生长实验数据 | 蓝藻菌株（如sp. PCC 6803）及相关突变体 | 核糖开关设计、启动子组合 | 蓝藻（cyanobacteria） | 基于胍-I核糖开关的基因表达调控系统，用于精确控制异源基因表达 | 工业生物技术 |
| 5 | 2025-12-06 |
Directed evolution-driven reprogramming of PD-L1 for compact and tunable checkpoint modulation
2025-Dec-05, Journal of biological engineering
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13036-025-00577-x
PMID:41345880
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研究论文 | 本研究通过酵母表面展示定向进化技术，开发了一种紧凑且可调控的PD-L1变体，用于增强免疫检查点抑制效果 | 利用定向进化技术改造PD-L1，获得高亲和力PD-1结合的双突变体（DM），其结合力比野生型提高173倍，同时保持低免疫原性，并揭示了结构机制 | 未在动物模型或临床试验中验证其体内疗效和安全性 | 开发一种紧凑、可调控的PD-L1变体，以克服传统IgG类检查点抑制剂的局限性，如分子尺寸大和Fc效应介导的T细胞耗竭 | PD-L1蛋白变体及其与PD-1的相互作用 | 合成生物学 | 癌症 | 酵母表面展示定向进化、计算机免疫原性分析、结构建模、功能测定 | NA | 蛋白质序列、结构模型、细胞分泌数据 | NA | 定向进化 | 酵母 | PD-L1变体作为检查点调节剂 | 医学 |
| 6 | 2025-12-06 |
Advances and Potential of Aspergillus niger in Industrial Biomanufacturing
2025-Dec-05, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c07467
PMID:41347444
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综述 | 本文综述了黑曲霉在工业生物制造中的进展与潜力，重点关注其作为高效细胞工厂的工程策略和应用 | 总结了利用基因编辑、基因组学和合成生物学的最新进展，特别是共培养诱导和沉默基因簇激活等新兴方法，以拓展黑曲霉的生物合成潜力 | NA | 概述黑曲霉在工业发酵中生产高价值代谢物的最新突破，并探讨其在可持续制造中的未来发展方向 | 黑曲霉及其作为细胞工厂的工程化应用 | 工业生物技术 | NA | 基因编辑、基因组学、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 黑曲霉 | NA | 食品、制药、可持续制造 |
| 7 | 2025-12-06 |
The Importance of Being Imperfect: Structure and Function of Bacterial Amyloid
2025-Dec-05, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202517090
PMID:41347620
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综述 | 本文综述了细菌功能性淀粉样蛋白（FuBAs）的结构、组装与功能，强调其作为进化中间体和生物材料工程平台的潜力 | 揭示了细菌淀粉样蛋白通过不完美重复序列形成β-螺线管折叠，具有高稳定性和低多态性，并扩展了其作为催化材料和可编程纳米材料的应用前景 | NA | 探讨细菌功能性淀粉样蛋白的结构与功能关系及其在生物材料工程中的应用 | 细菌功能性淀粉样蛋白，特别是大肠杆菌的curli（CsgA）和假单胞菌的FapC | NA | NA | 冷冻电镜（cryo-EM）、整合计算研究 | NA | 结构数据、序列数据 | NA | NA | 大肠杆菌（Escherichia coli）、假单胞菌（Pseudomonas） | NA | 催化、合成生物学、生物膜控制 |
| 8 | 2025-12-06 |
The evolving landscape of precise DNA insertion in plants
2025-Dec-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-66715-7
PMID:41330932
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综述 | 本文回顾了植物基因组中精确DNA插入技术的发展历程，从随机方法到基于CRISPR-Cas系统的工具，并分析了当前挑战与新兴解决方案 | 系统梳理了CRISPR-Cas系统在植物精确DNA插入中的应用演进，包括基因靶向、先导编辑及基于重组酶/转座酶的平台，并探讨了从理论到实践的转化路径 | 本文为综述性文章，未涉及原始实验数据，主要基于现有文献分析，可能未覆盖最新技术突破 | 探讨植物基因组精确DNA插入技术的演变、当前局限性与未来发展方向，以推动作物改良和合成生物学应用 | 植物基因组编辑技术，特别是CRISPR-Cas系统及相关工具 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas系统、基因靶向(GT)、先导编辑(PE)、重组酶/转座酶平台 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 植物 | NA | 农业, 工业生物技术 |
| 9 | 2025-12-06 |
Advances in trypsin research: sources, structural insights, applications and protein engineering for industrial use
2025-Dec, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.148996
PMID:41232883
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综述 | 本文综述了胰蛋白酶的研究进展，包括其来源、结构、应用以及为工业用途进行的蛋白质工程改造 | 系统总结了通过定点突变等蛋白质工程方法增强胰蛋白酶抗自降解能力和热稳定性的最新进展，并提出了整合AI驱动蛋白质设计与合成生物学工具的未来研究方向 | 在阐明动态酶-底物相互作用、利用天然序列多样性以及在工业规模条件下实现最佳产量方面仍存在挑战 | 综述胰蛋白酶的研究进展，并探讨通过蛋白质工程改进其工业应用性能 | 胰蛋白酶（一种丝氨酸蛋白酶） | NA | NA | 定点突变，蛋白质工程，重组蛋白表达 | NA | NA | NA | NA | 微生物重组表达系统 | NA | 工业生物技术 |
| 10 | 2025-12-06 |
Intracellular biosensors by functional nanomaterial-integrated CRISPR technologies for real-time molecular sensing
2025-Nov-24, Chemical communications (Cambridge, England)
DOI:10.1039/d5cc05016b
PMID:41277417
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综述 | 本文综述了基于CRISPR技术和纳米材料集成的细胞内生物传感器在实时分子传感方面的最新进展 | 将CRISPR系统的可编程性和靶向特异性与纳米材料（如金纳米颗粒、量子点）相结合，以增强细胞内递送效率、信号放大和传感器稳定性，实现复杂细胞环境中的多模态传感和单细胞分辨率分析 | 当前挑战包括精确递送、生物相容性和长期监测等问题 | 开发用于实时、动态监测细胞过程和分子事件的细胞内生物传感器 | 细胞内信号，包括核酸、非编码RNA和小分子代谢物 | 合成生物学 | NA | CRISPR技术（Cas9、Cas12、Cas13）与纳米技术（金纳米颗粒、量子点、DNA纳米结构、上转换纳米颗粒）集成 | NA | 分子传感信号 | NA | CRISPR-Cas9, CRISPR-Cas12, CRISPR-Cas13 | 哺乳动物细胞 | 生物传感器（用于检测核酸、非编码RNA、小分子代谢物） | 医学, 合成生物学 |
| 11 | 2025-12-06 |
Targeting and tracking mRNA lipid nanoparticles at the particle, transcript and protein level
2025-Oct, Nature biomedical engineering
IF:26.8Q1
DOI:10.1038/s41551-025-01511-8
PMID:41102346
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综述 | 本文综述了用于监测RNA负载脂质纳米颗粒体内行为的现有及新兴技术，并讨论了改善组织与细胞靶向的策略，以扩展该技术的应用范围 | 系统整合了脂质纳米颗粒化学修饰、生物工程及合成生物学方法（如利用microRNA靶位点）来调控mRNA递送与表达，并探讨了通过修饰编码蛋白来控制有效载荷的稳定性与亚细胞定位 | NA | 扩展RNA负载脂质纳米颗粒在非肝脏疾病治疗中的应用，并加速其临床转化 | RNA负载脂质纳米颗粒 | NA | NA | 脂质纳米颗粒技术、合成生物学方法、microRNA靶向技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 12 | 2025-12-06 |
The AML immune paradox: decoding escape pathways and pioneering checkpoint, vaccine, and combination strategies
2025-Jul-09, Clinical and experimental medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10238-025-01795-9
PMID:40634759
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综述 | 本文综述了急性髓系白血病（AML）免疫治疗的机制、挑战与未来方向，重点探讨了免疫检查点抑制剂和疫苗策略 | 系统解码AML的免疫逃逸途径，并整合检查点阻断、疫苗及联合策略等新兴免疫疗法，提出通过单细胞基因组学、人工智能和合成生物学识别新靶点及改善患者分层 | 面临肿瘤微环境异质性、耐药性白血病干细胞、治疗毒性（如贫血、细胞因子释放综合征）、克隆进化导致的复发以及缺乏预测性生物标志物等挑战 | 评估AML免疫治疗的机制、挑战与未来方向，旨在改善临床疗效 | 急性髓系白血病（AML）及其免疫抑制性肿瘤微环境 | NA | 急性髓系白血病 | 单细胞基因组学、人工智能、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 13 | 2025-12-06 |
Designing novel peptides with amyloid-β binding and clearance potential using BiLSTM and molecular dynamics
2025, Frontiers in artificial intelligence
IF:3.0Q2
DOI:10.3389/frai.2025.1709505
PMID:41346856
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研究论文 | 本研究开发了一种基于双向长短期记忆网络的两阶段生成式人工智能框架，用于设计靶向阿尔茨海默病关键病理因子Aβ42的新型功能肽 | 提出并验证了一种新颖的两阶段BiLSTM框架，该框架通过在具有特定基因本体注释的全长蛋白质上进行训练，并利用实验验证的肽片段进行微调，从而在全局蛋白质背景下捕获局部功能基序，成功生成了具有高预测结合亲和力的新型稳定肽序列 | 训练数据包含了与Aβ清除相关的蛋白质，但计算验证仅限于结合相互作用；清除潜力仍是一个有待未来实验验证的假设 | 开发一个可靠生成功能性和靶向特异性肽的人工智能驱动管道，用于治疗发现和合成生物学 | 靶向阿尔茨海默病关键病理因子Aβ42的短功能肽 | 自然语言处理 | 阿尔茨海默病 | 分子动力学模拟，结构建模，对接分析 | BiLSTM | 序列数据（蛋白质和肽序列） | 从1000个AI生成的序列中筛选出25个候选肽，最终优先考虑11个（ADNP1-ADNP11） | NA | NA | NA | 医学 |
| 14 | 2025-12-06 |
[Improvement of the Approval System for the Development and Experimentation of Living Modified Organisms in Synthetic Biology]
2023-Aug-17, Jugan geon-gang gwa jilbyeong
DOI:10.56786/PHWR.2023.16.32.3
PMID:41334470
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研究论文 | 本文探讨了合成生物学中活体修饰生物体（LMOs）的开发和实验审批系统的现状，并提出改进方案以平衡安全与科研活力 | 提出一个旨在确保LMO研究安全同时促进相关研究活力的国家审批系统改进计划 | NA | 探索合成生物学相关LMOs的法律法规现状，识别LMO开发和实验趋势，并提出审批系统改进方案 | 活体修饰生物体（LMOs）的开发和实验审批系统 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 15 | 2025-12-06 |
Engineering longevity-design of a synthetic gene oscillator to slow cellular aging
2023-04-28, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.add7631
PMID:37104589
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研究论文 | 本文设计了一种合成基因振荡器，通过重编程酵母细胞的内源性切换开关，创建了自主遗传时钟，以减缓细胞衰老过程 | 首次将合成生物学方法应用于工程化长寿，通过构建基因振荡器来延迟细胞衰老的承诺，连接了基因网络架构与细胞寿命 | 研究基于酵母细胞模型，尚未在更复杂生物体中验证；可能未全面考虑所有衰老相关因素 | 工程化细胞长寿，通过合成基因网络设计来减缓衰老过程 | 酵母细胞 | 合成生物学 | 衰老相关疾病 | 基因网络设计、合成生物学技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 酵母细胞 | 合成基因振荡器，基于内源性切换开关重编程，产生核仁与线粒体衰老过程之间的持续振荡 | 医学 |
| 16 | 2025-12-06 |
Digital switching in a biosensor circuit via programmable timing of gene availability
2014-Dec, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/nchembio.1680
PMID:25306443
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研究论文 | 本研究通过编程控制基因可用性时间，利用位点特异性重组酶优化合成生物学基因电路，以减少泄漏并提高传感器动态范围 | 首次使用位点特异性重组酶实现多基因电路中基因可用性的可编程时序控制，显著降低传感器本底泄漏并提升动态范围 | NA | 优化合成生物学中基因电路的稳健部署，通过时序控制改善电路性能 | 内源性microRNA（miRNA）的比例传感器和细胞类型分类 | 合成生物学 | NA | 位点特异性重组酶技术 | NA | 基因表达数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 哺乳动物细胞 | 比例传感器和逻辑门电路，用于miRNA检测和细胞分类 | 医学 |
| 17 | 2025-12-05 |
Marine-derived natural products as anti-osteoporosis agents
2026-Jan-15, European journal of medicinal chemistry
IF:6.0Q1
DOI:10.1016/j.ejmech.2025.118284
PMID:41138334
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综述 | 本文系统总结了152种具有抗骨质疏松活性的海洋天然产物，并探讨了其生物合成途径、全合成策略及临床转化挑战 | 首次系统梳理海洋来源（主要为海洋真菌）的抗骨质疏松天然产物，并整合基因组挖掘与合成生物学等新兴技术推动临床转化 | 未涉及具体临床实验数据，转化路径中的药效学与毒理学评估仍需深入 | 加速海洋天然产物在骨质疏松治疗领域的药物开发 | 海洋来源的天然产物（以聚酮类和萜类为主） | NA | 骨质疏松症 | 基因组挖掘、合成生物学 | NA | 文献数据、化合物结构信息 | 152种海洋天然产物 | NA | 海洋真菌 | NA | 医药 |
| 18 | 2025-12-05 |
Environmental Census: Modeling Synthetic Biology Ecological Risk with Metagenomic Enzymatic Data and High-Performance Computing
2025-Dec-03, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00618
PMID:41335476
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研究论文 | 本文介绍了一个名为Environmental Census的Python软件包，用于通过功能注释相似性预测工程微生物的环境范围，以评估其生态风险 | 开发了一种基于公开复合宏基因组数据和高效计算的预测工具，首次系统性地评估工程微生物在农业-水循环等环境中的定殖风险 | 工具依赖于公开宏基因组数据的代表性和准确性，可能无法覆盖所有潜在环境，且预测结果需实验验证 | 开发计算工具以评估工程微生物的生态风险，辅助合成生物学的安全部署 | 工程微生物，特别是细菌生物农药，以及农业-水循环环境中的微生物群落 | 计算生物学 | NA | 宏基因组学，高性能计算 | NA | 宏基因组数据，功能注释数据 | 基于公开复合宏基因组数据，具体样本数量未明确说明 | NA | 工程微生物（未指定具体宿主） | NA | 环境，农业 |
| 19 | 2025-12-05 |
Receptor dimerization enables ligand discrimination through tunable response heterogeneity
2025-Dec-03, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1013781
PMID:41336286
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研究论文 | 本文通过数学模型探讨了配体-受体相互作用如何通过群体水平的响应异质性实现配体识别 | 揭示了受体二聚化（尤其是异二聚化）在群体水平上通过生化参数调控响应异质性，从而编码配体身份的新机制 | 模型基于理论分析，可能未完全涵盖所有生物系统的复杂性，需要实验验证 | 研究细胞如何通过信号通路在群体水平上区分不同配体信号 | 配体-受体相互作用，特别是二聚化受体（包括异二聚体）在细胞群体中的信号传导 | NA | NA | 数学模型 | NA | 理论模型数据 | NA | NA | NA | NA | 免疫调节、组织发育、合成生物学 |
| 20 | 2025-12-05 |
Integrative Multi-Omics and Artificial Intelligence: A New Paradigm for Systems Biology
2025-Dec, Omics : a journal of integrative biology
IF:2.2Q3
DOI:10.1177/15578100251392371
PMID:41203247
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综述 | 本文综述了整合多组学与人工智能在系统生物学中的应用，强调其在癌症生物学、微生物工程和合成生物学中的原理、方法及案例 | 提出整合多组学与人工智能作为系统生物学的新范式，克服高维度、异质性和上下文限制的挑战 | 存在数据异质性和可解释性等当前限制 | 评估多组学整合的原理、方法及应用，以推动生物系统预测模型和生物技术应用 | 基因组、转录组、蛋白质组和代谢组等多组学数据 | 系统生物学 | 癌症 | 高通量组学技术、单细胞组学 | 机器学习 | 多组学数据 | NA | NA | NA | NA | 医学、工业生物技术 |