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当前共找到 5201 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-06-21 |
SARGE: Serine Integrase-Assisted Rapid Genome Integration through Cassette Exchange in Escherichia coli
2026-Jun-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00334
PMID:42319839
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research paper | 报道了一种名为SARGE的丝氨酸整合酶辅助快速基因组整合平台，通过盒交换实现大肠杆菌中大型DNA片段的迭代插入 | 结合正交丝氨酸整合酶PhiC31和Bxb1与理性供体质粒设计，支持快速可编程整合循环，无需抗性标记切除；引入双荧光报告系统和绿红筛选策略，实现裸眼菌落直接选择 | 未明确说明，可能涉及宿主范围限制或对非常大型DNA片段效率的潜在下降 | 开发一种简单、可扩展的基因组整合平台，用于大肠杆菌及潜在其他微生物宿主的基因组工程和合成生物学 | 大肠杆菌基因组整合盒交换过程 | synthetic biology | NA | 丝氨酸整合酶辅助盒交换 | NA | NA | 实验中测试的菌落数量未具体说明 | PhiC31整合酶, Bxb1整合酶 | E. coli | 双荧光报告系统（sfGFP和mKate）用于筛选，正交整合酶PhiC31和Bxb1介导的盒交换 | synthetic biology, genome engineering |
| 2 | 2026-06-21 |
Tardigrade-Derived Strategy for Low-Cost Storage of Cell-Free Expression Lysates
2026-Jun-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00281
PMID:42319881
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研究论文 | 提出一种利用缓步纲衍生蛋白保护无细胞表达系统在室温干燥条件下保存活性的策略 | 首次利用缓步纲来源的CAHS蛋白作为保护剂，实现无细胞表达系统在低成本室温干燥条件下的稳定储存，无需额外添加剂 | 未详细阐述CAHS蛋白保护机制及长期储存稳定性，且仅验证了单一来源的保护蛋白 | 开发低成本、便携式无细胞表达系统储存方法 | 无细胞表达系统及其生物合成机制 | 合成生物学 | NA | 无细胞表达系统 | NA | 实验数据 | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术、医学 |
| 3 | 2026-06-21 |
The Big Kinship of Proline: Counting Saturated and Unsaturated Secondary Amino Acids of Different Ring Size
2026-Jun-19, Biochimie
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.biochi.2026.06.010
PMID:42320729
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研究论文 | 本文对脯氨酸及其他环状二级氨基酸进行数学枚举，统计不同环大小的饱和与不饱和同系物数量 | 提出一种数学枚举程序，用于计算所有可能的环状二级α-氨基酸和亚氨基酸，并给出递推公式和显式公式，结果生成修正的卢卡斯序列 | 仅关注理论枚举，未深入探讨具体化合物的合成可行性或实际应用效果 | 通过数学和计算方法提供环状二级氨基酸的系统性分类和计数，辅助虚拟化合物库构建和化学合成计算机辅助设计 | 不同环大小的饱和与不饱和环状二级α-氨基酸和亚氨基酸 | NA | NA | 数学枚举 | 修正卢卡斯序列 | NA | NA | NA | NA | NA | 生物技术、合成生物学、药理学 |
| 4 | 2026-06-21 |
The critical patch size problem on networks
2026-Jun-19, Mathematical biosciences
IF:1.9Q3
DOI:10.1016/j.mbs.2026.109749
PMID:42320745
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研究论文 | 研究强异质网络环境中种群存活的临界斑块大小问题 | 首次在一般图结构中系统研究临界斑块大小问题，推导出谱图参数界以确保线性化算子的主特征值为正 | 主要依赖理论分析和数值模拟，缺乏实际生态数据的验证 | 探究图拓扑结构和汇点分布对种群存活阈值的影响 | 离散格子、多链接格子以及随机网络上的种群动态 | 机器学习 | NA | 图拉普拉斯算子分析 | 非线性动态系统模型 | 图结构数据 | NA | NA | NA | NA | 生态网络、合成生物学、神经退行性疾病传播建模 |
| 5 | 2026-06-21 |
Efficient site-specific gene addition using R2 retrotransposons in tobacco and rice
2026-Jun-19, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-026-03181-6
PMID:42321491
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研究论文 | 本文介绍了一种利用R2逆转录转座子在烟草和水稻中进行高效位点特异性基因添加的方法 | 首次在植物中重建非长末端重复R2逆转录转座子活性，实现无双链断裂的RNA模板化多位点基因整合，效率高达75% | 仅针对rDNA位点进行整合，可能存在位置效应，且转化效率在愈伤组织中最高仅为17% | 开发一种高效、精确的植物基因整合技术，用于作物改良和合成生物学 | 烟草（Nicotiana benthamiana）和水稻（Oryza sativa） | 合成生物学 | NA | R2逆转录转座子、重组RNA病毒介导的供体递送 | NA | NA | 烟草和水稻细胞及愈伤组织，具体数量未明确 | R2逆转录转座子 | 烟草（Nicotiana benthamiana），水稻（Oryza sativa） | 位点特异性基因整合系统（含R2逆转录转座酶和重组酶兼容着陆垫） | 农业, 合成生物学 |
| 6 | 2026-06-21 |
Synergistic dual ring-cleavage pathways enable efficient degradation of chlorobenzenes by Pseudomonas putida BS-1 in groundwater
2026-Jun-15, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2026.142676
PMID:42320103
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研究论文 | 发现恶臭假单胞菌BS-1中一种新型协同双环裂解途径，可有效降解地下水中的氯苯类污染物 | 首次揭示一种由质粒携带的tod-clc基因簇介导的邻位和间位裂解途径协同作用机制，能够快速解毒中间代谢产物氯代儿茶酚 | 研究主要基于单一菌株和实验室条件，未评估长期现场应用中的稳定性和生态影响 | 阐明氯苯类化合物生物降解过程中氯代儿茶酚解毒的新机制，并提供用于地下水修复的微生物资源 | 恶臭假单胞菌BS-1菌株及其降解对二氯苯、氯苯和苯的代谢途径 | 环境微生物学 | NA | 基因敲除、异源表达、代谢产物分析 | NA | 实验数据 | 单一菌株BS-1，以及实际受污染地下水样本（含p-DCB 6.83 mg·L⁻¹和o-DCB 13.31 mg·L⁻¹） | NA | 恶臭假单胞菌 | 由tod-clc基因簇编码的邻位和间位双环裂解途径 | 环境修复 |
| 7 | 2026-06-21 |
Recent advances in bioengineering and functional applications of microbial biocomposites: integrating bacterial cellulose, fungal mycelium and synthetic biology
2026-May-19, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-026-05021-w
PMID:42154349
|
综述 | 该综述综合了2020-2026年微生物生物复合材料在制备、修饰及功能应用方面的最新进展，重点涉及细菌纤维素和真菌菌丝体 | 将微生物生物复合材料与合成生物学、3D打印和矿物功能化等新兴方法相结合，突出了跨学科协同创新的潜力 | 讨论了当前工业规模化、功能稳定性和批次间标准化方面的监管和技术挑战 | 为应用微生物学、材料科学和工业生物技术领域的研究人员和专业人士提供关键且全面的视角，强调微生物生物复合材料作为可持续性、功能创新和仿生设计交汇平台的潜力 | 微生物生物复合材料，重点包括细菌纤维素和真菌菌丝体 | 材料科学，应用微生物学 | NA | 3D打印，合成生物学，矿物功能化 | NA | NA | NA | NA | Komagataeibacter spp., Ganoderma spp. | NA | 医药，环境，工业生物技术 |
| 8 | 2026-06-21 |
Elucidating the regulatory role of the Shine-Dalgarno sequence in structural gene expression of the malolactic enzyme operon using a GFP/mCherry model
2026-May-08, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-026-04999-7
PMID:42101569
|
研究论文 | 通过GFP/mCherry模型揭示苹果酸乳酸酶操纵子中Shine-Dalgarno序列对结构基因表达的调控作用 | 首次通过构建平行报告系统，结合定点突变和计算预测，揭示翻译耦合系统中SD2序列的非线性、结构特异性调控机制，并在不同宿主中验证其保守性 | 研究主要在大肠杆菌和乳酸乳球菌中进行，未在天然宿主酒酒球菌中验证，且GFP/mCherry模型可能无法完全模拟天然操纵子环境 | 阐明原核操纵子中翻译耦合的转录后调控机制，为酒酒球菌的工程化改造和合成生物学多基因系统设计提供预测框架 | 苹果酸乳酸酶操纵子中的mleA和mleP基因及其间SD2序列 | 合成生物学 | NA | 定点突变、计算预测（16S rRNA杂交能量和mRNA二级结构最小自由能）、荧光报告系统 | NA | 荧光比值数据 | 多个SD2序列变异体（具体数目未明确说明） | NA | 大肠杆菌、乳酸乳球菌 | 翻译耦合和非耦合结构的GFP/mCherry双报告基因系统 | 工业生物技术（葡萄酒酿造）、合成生物学 |
| 9 | 2026-06-21 |
Engineering a high-efficiency expression system in Tremella fuciformis using novel promoters and optimized transformation conditions
2026-May-08, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-026-05004-x
PMID:42101779
|
研究论文 | 通过鉴定强效内源启动子和优化农杆菌介导的转化程序，在银耳中构建了高效表达系统 | 首次在银耳中鉴定出三个比组成型gpd启动子效率高1476.74%的新型内源启动子，并发现棕色氧化铝处理可增加转化效率2.25倍 | 未评估启动子在银耳不同生长阶段或非酵母样细胞中的表现，且系统仅在实验室条件下验证 | 开发适用于银耳分子育种和合成生物学的基因表达系统 | 银耳（Tremella fuciformis）的酵母样细胞 | 合成生物学 | NA | 农杆菌介导转化、扫描电子显微镜 | NA | 荧光强度数据、细胞密度数据 | 三个启动子（P4、P5、P7）在转化酵母样细胞中测试 | 农杆菌介导转化 | 银耳 | eGFP表达系统 | 农业、工业生物技术 |
| 10 | 2026-06-20 |
Bacterial mRNA Vaccines: Programming Immunity Against Antimicrobial Resistance
2026-Aug, Drug development research
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/ddr.70335
PMID:42318873
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综述 | 这篇综述概述了细菌mRNA疫苗在应对抗菌药物耐药性方面的最新进展，包括抗原设计、mRNA工程和递送平台优化 | 整合了人工智能引导的抗原发现、合成生物学和下一代递送系统以加速临床转化，强调克服现有障碍以建立mRNA疫苗作为对抗耐药感染的可行策略 | 细菌抗原结构的复杂性、实现有效黏膜和细胞递送的挑战、诱导平衡Th1/Th17主导免疫反应的困难以及免疫持久性问题 | 应对抗菌药物耐药性威胁，开发细菌mRNA疫苗 | 结核分枝杆菌、铜绿假单胞菌、肺炎链球菌等关键细菌病原体 | 合成生物学， 疫苗学 | 细菌感染性疾病， 抗菌药物耐药性 | mRNA工程， 脂质纳米颗粒递送， 人工智能引导的抗原发现， 合成生物学 | NA | NA | NA | 脂质纳米颗粒， 人工智能， 合成生物学 | NA | NA | 医学 |
| 11 | 2026-06-20 |
Repurposing the Diatom Periplastidial Compartment for Heterologous Terpenoid Production
2026-Jun-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00919
PMID:42101919
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研究论文 | 通过系统分析硅藻中不同细胞区室的萜类合成能力，提出周质体腔（PPC）作为可工程化的细胞内空间用于异源萜类生产 | 首次系统评估硅藻周质体腔（PPC）作为工程化细胞区室的萜类合成潜力，揭示其与MVA和MEP途径的代谢交换界面 | 未提及大规模生产或工业应用验证，需进一步优化工程策略 | 探索硅藻周质体腔（PPC）用于异源萜类生产的可行性与工程化潜力 | 硅藻周质体腔（PPC）、细胞质、叶绿体中的萜类合酶靶向表达 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 代谢物定量数据 | 未明确样本数量 | NA | 硅藻 | 萜类合成代谢途径（包括半萜、单萜、倍半萜和四萜的合酶靶向表达） | 工业生物技术 |
| 12 | 2026-06-20 |
A Linear Mixed Effects Model for Evaluating Synthetic Gene Circuits
2026-Jun-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00171
PMID:42112575
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research paper | 提出了一种用于评估合成基因电路性能的线性混合效应模型 | 首次应用线性混合效应模型来统计评估布尔逻辑门性能，并提供可量化的固定效应点估计β̂作为门行为的统一描述符 | 对多输入多输出逻辑的扩展验证尚需更多实验数据支撑 | 标准化合成基因电路统计评估方法 | 合成基因电路中的布尔逻辑门 | 合成生物学 | NA | 线性混合效应模型, 蒙特卡洛模拟, k-means聚类 | 线性混合效应模型, k-means | 模拟数据与实验数据 | 144个已发表布尔逻辑门 | NA | NA | 布尔逻辑门（OR、AND等） | 合成生物学应用（计算、生物传感、人类健康） |
| 13 | 2026-06-20 |
Temporal Programming of Cell-Free Transcription Using Orthogonal Enzyme-Responsive DNA Blockers
2026-Jun-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00147
PMID:42137991
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研究论文 | 设计正交的酶驱动DNA转录定时器，实现无细胞转录的时间延迟精确编程 | 利用正交酶响应性DNA阻断链，通过选择性酶切实现多个转录模板的独立时间控制，并展示下游Cas12a活性的时序调控 | 未明确提及，但可能涉及阻断链设计与酶特异性的进一步优化 | 建立无细胞合成生物学中时间分辨转录和基因表达的通用框架 | 正交酶响应性DNA阻断链、RNase H、尿嘧啶DNA糖基化酶(UDG)和甲酰胺嘧啶DNA糖基化酶(Fpg)等酶 | 合成生物学 | NA | 无细胞转录、酶切动力学调控 | NA | 转录时间曲线数据 | NA | DNA阻断链设计、酶驱动定时器 | 无细胞系统 | 基于DNA阻断链的转录定时器、Cas12a酶切活性调控回路 | 合成生物学、生物技术 |
| 14 | 2026-06-20 |
Streptomyces Autoregulator Biosensors from Natural Product Cluster-Situated Regulators
2026-Jun-19, ACS chemical biology
IF:3.5Q2
DOI:10.1021/acschembio.6c00061
PMID:42117380
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研究论文 | 开发了八种基于簇定位调节因子的自诱导物生物传感器，并探索其在合成生物学中的应用 | 首次将多个预测的群体感应自诱导物回路工程化为可诱导表达系统，并验证了生物传感器间的正交性和共培养能力 | 未提及 | 开发基于链霉菌自诱导物的生物传感器，用于天然产物调控机制研究和合成生物学应用 | 链霉菌中的簇定位调节因子及其自诱导物配体 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 八种生物传感器，多种配体浓度测试 | NA | 链霉菌属 | 群体感应调控回路、正交信号系统、多输入遗传电路 | 工业生物技术 |
| 15 | 2026-06-20 |
Bottom-Up Creation of Virus-like Particles via Post-Insertion of Protein-Lipid Conjugates
2026-Jun-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00172
PMID:42160665
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研究论文 | 提出一种通过后插入蛋白-脂质偶联物自下而上构建病毒样颗粒的方法 | 创新性地利用SNAP-tag/BG生物正交反应将蛋白质共价偶联到脂质上，实现无需去垢剂的脂质体膜插入，解耦了蛋白质设计与脂质体设计，便于快速系统优化VLP | 未提及具体限制，但可能涉及蛋白质-脂质偶联效率、颗粒稳定性及体内应用时的免疫原性问题 | 开发一种模块化、可优化的病毒样颗粒构建策略，用于疫苗、药物递送和合成生物学应用 | GFP蛋白和SARS-CoV-2 Spike蛋白 | 合成生物学 | 新型冠状病毒病 | SNAP-tag/BG反应、流式细胞术、负染色透射电子显微镜、酶联免疫吸附测定 | NA | 图像（电子显微镜）、荧光信号（流式细胞术） | 研究所用样本包括GFP蛋白和Spike蛋白修饰的脂质体，具体数量未提及 | SNAP-tag/BG反应 | Expi293F细胞 | 蛋白-脂质偶联物构建及后插入脂质体形成病毒样颗粒 | 医学, 合成生物学 |
| 16 | 2026-06-20 |
Systematic Reprogramming of Rhodobacter sphaeroides for Efficient Biosynthesis of Coenzyme Q10 and Porphyrins
2026-Jun-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00032
PMID:42186703
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综述 | 系统综述了通过代谢工程和合成生物学方法改造光合细菌Rhodobacter sphaeroides以高效合成辅酶Q10和卟啉类化合物的研究进展 | 首次全面总结了利用Rhodobacter sphaeroides作为底盘生物生产辅酶Q10和卟啉的工程策略，包括前体供应增强、代谢路径优化、氧化还原和能量平衡调控、全局调控系统操纵及发酵控制 | 未提及具体实验数据或定量比较不同工程策略的效果，主要基于文献综述 | 梳理Rhodobacter sphaeroides的代谢特性、天然调控网络和工程方法，突出其作为合成生物学底盘生产辅酶Q10和卟啉类化合物的潜力 | Rhodobacter sphaeroides紫色非硫光合细菌 | 合成生物学 | NA | 代谢工程, 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | Rhodobacter sphaeroides | 萜类和四吡咯生物合成途径的优化 | 工业生物技术, 医药 |
| 17 | 2026-06-20 |
Diterpene Synthases as Gatekeepers of Bioactive Diterpenoids: A Resource for Discovery and Engineering toward Efficient Synthesis
2026-Jun-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00190
PMID:42215860
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综述 | 该文章综述了二萜合酶在生物活性二萜类化合物合成中的关键作用，并建立了一个包含562个功能表征二萜合酶的数据库，为通过合成生物学和代谢工程高效生产二萜类化合物提供了资源 | 首次建立了一个包含562个功能表征二萜合酶的综合性功能数据库，并通过整合生物信息学分析阐明了不同功能类别二萜合酶的催化机制、产物多样性及系统发育分布，为二萜合酶作为合成生物学核心功能元件的开发提供了新方向 | 未提及具体局限性，但可能包括数据库的更新频率、部分二萜合酶功能验证的局限性以及实际工业生产中面临的产量和纯度挑战 | 总结代表性二萜类化合物的生物活性和应用，建立功能二萜合酶数据库，并探讨二萜合酶作为合成生物学核心功能元件的未来发展方向 | 二萜合酶和二萜类化合物 | 机器学习和数字病理学之外的合成生物学与代谢工程领域 | 不适用 | 合成生物学、代谢工程、生物信息学分析 | 不适用 | 序列和功能数据（562个功能表征的二萜合酶） | 562个功能表征的二萜合酶 | 不适用 | 微生物细胞工厂（具体未指定，如大肠杆菌、酿酒酵母等） | 二萜类化合物生物合成途径 | 医药、农业、化妆品、食品 |
| 18 | 2026-06-20 |
Evaluating DNA Function Understanding in Genomic Language Models Using Evolutionarily Implausible Sequences
2026-Jun-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00024
PMID:42260904
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研究论文 | 提出Nullsettes评估框架，测试基因组语言模型对合成表达盒中功能丧失突变的预测能力 | 通过进化上不可信的序列设计，区分模型对序列功能的理解与对天然基因组模式的记忆 | 未能检测到强功能丧失突变，预测准确性严重依赖进化模式匹配而非基因表达机制理解 | 评估基因组语言模型对DNA序列功能的理解程度 | 合成表达盒中的功能丧失突变序列 | 机器学习 | NA | 基因组语言模型 | Transformer | DNA序列 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 19 | 2026-06-20 |
Engineering Protein Stability with Small Molecules: A Review of the ecDHFR Destabilizing Domain System
2026-Jun-19, ACS chemical biology
IF:3.5Q2
DOI:10.1021/acschembio.6c00466
PMID:42262317
|
综述 | 综述了大肠杆菌二氢叶酸还原酶去稳定域系统通过配体诱导稳定化实现条件性蛋白控制的机制与应用 | 从翻译后调控层面系统总结了ecDHFR-DD系统的机制、性能及跨物种优化，并提出了在害虫及媒介控制等应用生物学中的新方向 | 未提及具体实验验证或定量比较与其他系统的性能差异 | 综合评估ecDHFR-DD系统在条件性蛋白调控中的优势与局限，并展望其跨学科应用潜力 | ecDHFR去稳定域系统及其在酵母、无脊椎动物模型和哺乳动物细胞中的应用 | 合成生物学 | NA | ecDHFR-DD系统 | NA | NA | NA | Trimethoprim， 大肠杆菌二氢叶酸还原酶去稳定域 | 酵母、无脊椎动物、哺乳动物细胞 | 配体诱导稳定化的去稳定域电路 | 功能基因组学、合成生物学、生物医学研究、害虫及媒介管理 |
| 20 | 2026-06-20 |
Engineered Probiotics Protect against Pseudomonas aeruginosa Post Antibiotic Exposure
2026-Jun-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00063
PMID:42267686
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研究论文 | 开发基于工程化大肠杆菌Nissle 1917的模块化可编程益生菌策略，整合代谢物补充与抗原特异性黏膜免疫，在抗生素暴露后预防铜绿假单胞菌感染 | 首次将代谢物补充（丁酸）与抗原特异性黏膜免疫模块整合于同一益生菌平台，实现独立模块的灵活组合与协同保护 | 仅在抗生素暴露后的小鼠模型中验证，尚未评估在无菌动物或人类中的效果 | 开发一种抗生素暴露后恢复微生物稳态并激发黏膜免疫的益生菌策略，用于预防铜绿假单胞菌感染 | 抗生素暴露后的小鼠模型 | 合成生物学 | 铜绿假单胞菌感染 | NA | NA | NA | 小鼠模型（具体数量未说明） | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌Nissle 1917 (EcN) | 丁酸过量生产模块、外膜囊泡展示PcrV或OprL抗原模块 | 医学 |