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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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1 | 2025-05-12 |
Be a GEM: Biocontained, environmentally applied, genetically engineered microbes
2025-Jun, Advanced drug delivery reviews
IF:15.2Q1
DOI:10.1016/j.addr.2025.115578
PMID:40222715
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perspective | 本文讨论了基因工程微生物(GEMs)的生物控制技术及其环境、监管和公众接受度问题 | 探讨了GEMs在生物控制方面的技术进展及其潜在应用 | 未涉及具体实验数据或案例研究 | 探讨GEMs的生物控制技术及其潜在应用 | 基因工程微生物(GEMs) | 合成生物学 | NA | 基因工程技术 | NA | NA | NA |
2 | 2025-05-12 |
Designing live bacterial therapeutics for cancer
2025-Jun, Advanced drug delivery reviews
IF:15.2Q1
DOI:10.1016/j.addr.2025.115579
PMID:40228606
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review | 该综述全面探讨了利用细菌进行癌症治疗的策略 | 提出了利用合成生物学编程细菌生产治疗药物的新方法,并探讨了细菌在肿瘤微环境中的选择性定植能力 | 讨论了细菌癌症疗法面临的挑战和未来发展方向,但未提及具体实验数据或样本量 | 探索细菌在癌症治疗中的应用潜力 | 肿瘤微环境中的细菌及其工程化应用 | 合成生物学 | 癌症 | 合成生物学技术 | NA | NA | NA |
3 | 2025-05-12 |
Paving the way for bacteria-based drug delivery: biohybrid microrobots emerging from microrobotics and synthetic biology
2025-Jun, Advanced drug delivery reviews
IF:15.2Q1
DOI:10.1016/j.addr.2025.115577
PMID:40250568
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综述 | 本文探讨了微机器人学和合成生物学的融合如何促进生物混合细菌微机器人的发展,用于药物递送 | 结合微机器人学和合成生物学的优势,开发出生物混合细菌微机器人,通过外部控制方式(如光、超声波和磁场)提高靶向治疗的精确性和有效性 | 需要解决生物与合成组件之间的兼容性、规模化制造工艺以及针对活体治疗剂的监管路径等关键挑战 | 探索微机器人学和合成生物学在药物递送领域的创新应用 | 细菌作为治疗系统的基础 | 合成生物学 | NA | 光、超声波和磁场控制 | NA | NA | NA |
4 | 2025-05-12 |
Myxobacteria: Versatile cell factories of novel commercial enzymes for bio-manufacturing
2025-May-08, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108594
PMID:40345460
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综述 | 本文综述了粘细菌作为新型商业酶多功能细胞工厂在生物制造中的应用 | 强调了粘细菌在生物技术应用中的潜力,特别是在新型酶和生物质转化资源发现方面的最新进展 | 遗传工程挑战、生长缓慢以及代谢重塑和表达策略的限制阻碍了粘细菌细胞工厂的构建 | 探索粘细菌及其酶在农业和工业中的潜在应用 | 粘细菌及其产生的酶 | 生物技术 | NA | 生物勘探和计算方法 | NA | NA | NA |
5 | 2025-05-12 |
A novel interpretability framework for enzyme turnover number prediction boosted by pre-trained enzyme embeddings and adaptive gate network
2025-May, Methods (San Diego, Calif.)
DOI:10.1016/j.ymeth.2025.02.010
PMID:40021034
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research paper | 提出了一种新的可解释性框架GELKcat,用于预测酶转换数(kcat),结合了预训练的酶嵌入和自适应门网络 | 利用图变换器进行底物分子编码和CNN进行酶word2vec嵌入,通过自适应门网络整合底物和酶特征,提高了kcat预测的准确性和可解释性 | 性能仍依赖于酶和底物特征提取的有效性以及这两种特征的最优融合 | 改进酶转换数(kcat)的预测方法,为药物发现和合成生物学提供指导 | 酶和底物分子 | machine learning | NA | graph transformers, CNNs, word2vec | GELKcat (结合graph transformers和CNNs) | 分子结构数据 | 多物种酶-底物对转换数数据 |
6 | 2025-05-12 |
Advances in engineering substrate scope of Pseudomonas cell factories
2025-Apr, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2025.103270
PMID:39978295
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research paper | 探讨如何通过代谢工程、合成生物学和实验室进化增强假单胞菌的底物范围,以利用多样化的废物衍生底物 | 提出利用假单胞菌作为新一代工业生物技术宿主,并通过工程手段扩展其底物范围,以利用废物衍生底物 | 自然分离的假单胞菌可能不适合高要求的生物技术应用 | 扩展和维持生物工艺,探索新的微生物宿主和废物衍生底物 | 假单胞菌及其代谢工程 | 工业生物技术 | NA | 代谢工程、合成生物学、实验室进化 | NA | NA | NA |
7 | 2025-05-12 |
Improving Bacillus subtilis as Biological Chassis Performance by the CRISPR Genetic Toolkit
2025-Mar-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00844
PMID:40040244
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review | 本文讨论了CRISPR基因工具包在提高枯草芽孢杆菌作为生物底盘性能中的应用 | 介绍了CRISPR技术在枯草芽孢杆菌中的最新进展,包括基因编辑、转录调控和酶调节 | 未提及具体实验数据或样本量,可能缺乏实证支持 | 提高枯草芽孢杆菌作为工业底盘菌的性能,使其能与传统工业微生物如大肠杆菌和酵母相媲美 | 枯草芽孢杆菌 | 合成生物学 | NA | CRISPR | NA | NA | NA |
8 | 2025-05-12 |
Bacteria-Mediated Intracellular Radical Polymerizations
2025-Mar-19, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.4c17257
PMID:40036043
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研究论文 | 本文展示了细菌细胞通过天然生物分子触发的原子转移自由基反应,在细胞内引发多种丙烯酰胺、丙烯酸和甲基丙烯酸单体的聚合 | 揭示了细菌细胞作为活体催化剂用于聚合物生产的未开发潜力,并展示了基于原子转移自由基聚合引发剂的细胞内聚合作为一种生物正交工具用于细胞工程和合成生物学 | NA | 探索细菌细胞内自由基聚合的机制及其在细胞工程和合成生物学中的应用 | 细菌细胞和多种丙烯酰胺、丙烯酸及甲基丙烯酸单体 | 合成生物学 | NA | 原子转移自由基聚合 | NA | NA | NA |
9 | 2025-05-12 |
A long road ahead to reliable and complete medicinal plant genomes
2025-Mar-04, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-57448-8
PMID:40032878
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research paper | 本文探讨了药用植物基因组测序的现状与挑战,并提出了提高基因组组装质量的策略 | 提出了在药用植物基因组研究中应用前沿基因组学技术,并借鉴作物基因组学研究的经验 | 目前仅有11个无间隙的端粒到端粒基因组组装,许多基因组仍存在组装和注释缺陷 | 提高药用植物基因组的组装质量和完整性,以促进功能基因组学和合成生物学应用 | 药用植物基因组 | 基因组学 | NA | 长读长DNA测序 | NA | 基因组数据 | 超过400个来自203种植物的基因组 |
10 | 2025-05-12 |
Advancements in Escherichia coli secretion systems for enhanced recombinant protein production
2025-Mar-03, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-025-04302-0
PMID:40025370
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综述 | 本文综述了大肠杆菌分泌系统在增强重组蛋白生产方面的进展 | 探讨了天然和工程化分泌系统,以及基因工程、诱变和合成生物学方法的最新进展 | 大肠杆菌的细胞能力有限,且存在蛋白质聚集问题 | 提高重组蛋白的产量、折叠和分泌效率 | 大肠杆菌及其分泌系统 | 微生物学 | NA | 基因工程、诱变、合成生物学 | NA | NA | NA |
11 | 2025-05-12 |
Harnessing oleaginous protist Schizochytrium for docosahexaenoic acid: Current technologies in sustainable production and food applications
2025-Mar, Food research international (Ottawa, Ont.)
DOI:10.1016/j.foodres.2025.115996
PMID:40032480
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综述 | 本文综述了利用产油原生生物裂殖壶菌生产二十二碳六烯酸(DHA)的当前生物技术及其在食品中的应用 | 系统总结了裂殖壶菌DHA生产的当前生物技术,并提出了改进菌株、优化发酵过程、提高DHA产品氧化稳定性、掩盖DHA气味缺陷及利用合成生物学开发DHA潜在功能的建议 | 未提及具体实验数据或案例研究,主要基于文献综述 | 探索裂殖壶菌DHA的生产技术及其在食品和健康领域的应用发展 | 裂殖壶菌及其DHA产品 | 生物技术 | NA | 发酵优化、纳米颗粒包装技术、合成生物学 | NA | 文献数据 | NA |
12 | 2025-05-12 |
SHIP identifies genomic safe harbors in eukaryotic organisms using genomic general feature annotation
2025-Feb-28, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-91249-9
PMID:40021804
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research paper | 该研究提出了一种名为SHIP的算法,用于系统性地识别真核生物中的基因组安全港(GSHs) | SHIP算法通过基因组通用特征注释系统性地识别GSHs,而非依赖经验方法,解决了现有GSHs多位于高基因密度区域导致表达不稳定的问题 | 研究仅在酿酒酵母中进行了实验验证,尚未在其他真核生物中广泛测试 | 开发一种系统性识别真核生物基因组安全港的工具,以支持合成生物学中多基因模块的研究 | 真核生物基因组中的基因组安全港(GSHs) | 合成生物学 | NA | DNA测序、流式细胞术、qPCR、电子显微镜、RT-qPCR、RNA-Seq | 算法(SHIP) | 基因组数据 | 在酿酒酵母中实验验证了5个GSHs |
13 | 2025-05-12 |
Remodeling of lipid-foam prototissues by network-wide tension fluctuations induced by active particles
2025-Feb-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-57178-x
PMID:40016255
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研究论文 | 本文介绍了一种基于脂质的组织模拟物,即毫米大小的'脂质泡沫',它由微米大小的隔室组成,通过脂质双层结合,并展示了其自修复能力和在包含细菌时的网络张力波动 | 开发了一种易于制备和功能化的脂质泡沫组织模拟物,具有自修复能力和由游泳细菌驱动的网络张力波动,促进了原组织的流动和重组 | 目前的研究尚未探讨脂质泡沫组织模拟物在更复杂生物环境中的应用效果 | 开发并表征一种新型的脂质泡沫组织模拟物,以模拟和了解生物组织的特性 | 脂质泡沫组织模拟物及其在包含细菌时的行为 | 合成生物学 | NA | 脂质双层技术 | NA | NA | NA |
14 | 2025-05-12 |
Dsembler - DNA Assembly Designer: A Tool for Facilitating Assembly of Oligomers
2025-Feb-25, Journal of microbiology and biotechnology
IF:2.5Q3
DOI:10.4014/jmb.2412.12046
PMID:40016135
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research paper | 介绍了一个名为Dsembler的基于网络的软件工具,旨在优化长DNA序列的组装 | 开发了一个新工具Dsembler,用于优化寡核苷酸的设计,提高DNA组装的准确性 | 未提及工具在实际应用中的性能测试或用户反馈 | 解决合成生物学中寡核苷酸组装面临的挑战 | 长DNA序列的组装 | 合成生物学 | NA | DNA组装 | NA | DNA序列 | NA |
15 | 2025-05-12 |
Digital switching in a biosensor circuit via programmable timing of gene availability
2014-Dec, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/nchembio.1680
PMID:25306443
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研究论文 | 该研究展示了通过可编程的基因可用性时序控制,利用位点特异性重组酶纠正多基因电路中的不良效应,显著提高了生物传感器的性能 | 利用位点特异性重组酶实现基因可用性的可编程时序控制,显著降低生物传感器的基底泄漏并提高动态范围 | 研究未涉及长期稳定性或体内应用的效果验证 | 提高合成生物学中基因电路的稳健性和性能 | 内源性microRNA的比例传感器和多基因电路 | 合成生物学 | NA | 位点特异性重组酶技术 | NA | 基因表达数据 | NA |
16 | 2025-05-11 |
Synthetic biology routes to new and extinct natural products
2025-May-08, RSC chemical biology
IF:4.2Q2
DOI:10.1039/d5cb00047e
PMID:40171247
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research paper | 该文章探讨了通过合成生物学方法生产新型和已灭绝的天然产物 | 利用基因敲除和基因交换技术,生产了多种新的代谢产物,并优化了某些抗生素的生产 | 研究主要集中在细菌和真菌中的生物合成途径,可能不适用于其他生物系统 | 探索和优化天然产物的生物合成途径 | 细菌和真菌中的生物合成途径及其代谢产物 | 合成生物学 | NA | 基因敲除、基因交换、异源表达 | NA | 基因组数据 | 多种细菌和真菌菌株 |
17 | 2025-05-11 |
Cell-Penetrating Peptide-Based Triple Nanocomplex Enables Efficient Nuclear Gene Delivery in Chlamydomonas reinhardtii
2025-May-08, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.29019
PMID:40342143
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研究论文 | 开发了一种基于细胞穿透肽的三重纳米复合系统,用于在莱茵衣藻中实现高效的核基因递送 | 整合了细胞穿透肽(CPPs)、核定位信号(NLS)肽和质粒DNA的新型三重纳米复合系统,显著提高了基因递送效率 | 仅在莱茵衣藻中进行了测试,尚未在其他微藻中验证效果 | 开发高效的基因递送系统以促进微藻合成生物学发展 | 莱茵衣藻(Chlamydomonas reinhardtii)细胞 | 合成生物学 | NA | 细胞穿透肽(CPPs)技术、核定位信号(NLS)技术 | NA | 实验数据 | 野生型莱茵衣藻细胞 |
18 | 2025-05-11 |
Living Biotherapeutics Using Nanoparticles-Armed Cyanobacteria for Boosting Photodynamic-Immunotherapy of Cancer
2025-May-08, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202502746
PMID:40344505
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研究论文 | 开发了一种结合蓝藻与多功能前药纳米颗粒的活体生物治疗平台,用于增强光动力免疫治疗癌症 | 结合合成生物学与材料科学,开发了一种新型的活体纳米治疗剂,能够自供应氧气和纳米颗粒,并协同增强抗癌效果 | 未提及临床试验结果或体内实验的具体数据 | 开发新型癌症治疗方法,结合光动力疗法与免疫疗法 | 癌症治疗 | 纳米医学 | 癌症 | 光动力疗法、静电吸附 | NA | NA | NA |
19 | 2025-05-11 |
Functional investigation of Zur in metal ion homeostasis, motility and multiple stresses resistance in cyanobacteria Synechocystis sp. PCC 6803
2025-May-07, Stress biology
DOI:10.1007/s44154-025-00224-x
PMID:40332629
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研究论文 | 本研究通过转录组分析探讨了Zur在蓝藻Synechocystis sp. PCC 6803中金属离子稳态、运动性和多重胁迫抗性中的多功能作用 | 揭示了Zur不仅调控锌离子稳态,还影响铁平衡、细菌运动性及对抗盐、氧化和抗生素胁迫的能力 | 研究仅基于转录组分析,缺乏蛋白质水平和具体调控机制的深入验证 | 探究Zur转录调控因子在蓝藻Synechocystis sp. PCC 6803中的多功能调控作用 | 蓝藻Synechocystis sp. PCC 6803的Δzur突变体和野生型菌株 | 合成生物学 | NA | 转录组分析 | NA | 基因表达数据 | Δzur突变体和野生型Synechocystis sp. PCC 6803菌株 |
20 | 2025-05-11 |
Sustainable production of porphyrins through synthetic biology
2025-May, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2024.09.009
PMID:39341742
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评论 | 本文聚焦于通过合成生物学促进卟啉的可持续生产 | 讨论了卟啉生物合成在不同物种中的最新突破 | NA | 促进卟啉的可持续生产 | 卟啉化合物 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |