合成生物学相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
1	2025-09-26	Dynamic membranization results in core-shell coacervates that selectively localize particles and small molecules 2025-Sep-25, Chemical communications (Cambridge, England) DOI:10.1039/d5cc02423d PMID:40905114	研究论文	开发了一种动态多相凝聚系统，模拟细胞区室化实现选择性分子分配	通过动态膜化形成核壳结构凝聚物，实现基于极性的选择性分子定位	NA	构建仿生化学系统用于催化反应和合成生物学应用	多相凝聚物系统及其分子分配行为	合成生物学	NA	pH响应平台技术	NA	实验数据	NA
2	2025-09-26	[Advances in yeast biosynthesis of triterpenoids for cosmetic applications] 2025-Sep-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology DOI:10.13345/j.cjb.250116 PMID:40994325	综述	本文综述了酵母合成三萜类化合物在化妆品领域的研究进展，重点分析了两大合成途径及其在不同微生物宿主中的应用	系统比较甲羟戊酸途径和甲基赤藓糖醇磷酸途径在不同微生物宿主中合成三萜类化合物的优劣，并提出提高产量的策略	未涉及具体实验数据验证不同合成策略的实际效果	促进三萜类化合物在化妆品领域的应用发展	三萜类化合物及其衍生物	合成生物学	NA	代谢工程、合成生物学	NA	文献资料	NA
3	2025-09-26	[Progress in the heterologous synthesis of sesquiterpenes by Yarrowia lipolytica] 2025-Sep-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology DOI:10.13345/j.cjb.240845 PMID:40994326	综述	本文综述了利用解脂耶氏酵母异源合成倍半萜类化合物的研究进展	系统总结了通过合成生物学策略在解脂耶氏酵母中高效合成倍半萜的创新方法	NA	探讨通过代谢工程和合成生物学技术提高倍半萜产量的工程策略	解脂耶氏酵母和倍半萜类化合物	合成生物学	NA	代谢工程、合成生物学	NA	文献资料	NA
4	2025-09-26	Bioactive compounds from deep-sea extremophiles: emerging potential in cosmeceuticals and nutraceuticals 2025-Sep-25, FEMS microbiology letters IF:2.2Q3 DOI:10.1093/femsle/fnaf102 PMID:40996452	综述	本文系统探讨深海极端微生物生物活性化合物在化妆品和营养保健品领域的应用潜力	聚焦深海极端微生物这一未充分开发的生物资源，阐明其活性成分在抗衰老和健康促进方面的独特作用机制	存在规模化生物加工的技术瓶颈和法规合规性挑战	评估深海极端微生物的生物技术潜力及其在健康产业的应用前景	深海极端微生物产生的酶、肽类、次级代谢产物等生物活性分子	生物技术	NA	宏基因组学、高通量筛选、合成生物学、发酵优化	NA	NA	NA
5	2025-09-26	Coacervate Vesicles as Adaptive Platforms for Synthetic Biology and Smart Materials 2025-Sep-24, Chemistry (Weinheim an der Bergstrasse, Germany) DOI:10.1002/chem.202502268 PMID:40827771	综述	介绍凝聚体囊泡作为合成生物学和智能材料平台的基本特性、分类方法及应用前景	提出基于形成机制和能量景观的凝聚体囊泡分类体系，揭示不同形成路径与原始细胞特性的关联	该领域仍处于发展初期，实际应用尚未成熟	探讨凝聚体囊泡在合成生物学和智能材料领域的应用潜力	凝聚体囊泡（原始细胞模型）	合成生物学	NA	NA	NA	NA	NA
6	2025-09-26	A Deep Dive into Plant Metabolomics: Milestones, Technologies, and Translational Impact 2025-Sep-24, Plant physiology IF:6.5Q1 DOI:10.1093/plphys/kiaf408 PMID:40991682	综述	本文系统回顾植物代谢组学领域的发展历程、技术应用及其在农业和生物技术中的转化影响	汇总500余种开源计算工具，涵盖代谢组学数据分析全流程，并展望成像质谱、单细胞代谢组学等新兴技术	NA	全面评估代谢组学在植物功能基因组学中的贡献及其转化应用	植物代谢组学技术、分析工具及在作物改良中的应用	代谢组学	NA	代谢组学、成像质谱、单细胞代谢组学、mGWAS、mQTL分析	AI辅助代谢物鉴定	代谢组学数据、转录组数据	NA
7	2025-09-26	Cultivation and sequencing of microbiota members unveil the functional potential of yak gut microbiota 2025-Sep-23, mSystems IF:5.0Q1 DOI:10.1128/msystems.00367-25 PMID:40815469	研究论文	本研究通过培养和测序构建了牦牛粪便细菌基因组参考库，揭示了其肠道微生物的功能潜力	建立了首个牦牛粪便细菌基因组参考库，包含548个高质量基因组，其中216株为新分类单元，将反刍动物肠道培养细菌物种比例提高了19.39%	NA	揭示牦牛肠道微生物的功能潜力及其在极端环境适应中的作用	牦牛肠道微生物	微生物组学	NA	好氧和厌氧培养、基因组测序	NA	基因组数据	548个高质量基因组（包含216个新分类单元）
8	2025-09-26	The marine diatom Phaeodactylum tricornutum as a versatile bioproduction chassis: Current progress, challenges and perspectives 2025-Sep-23, Plant communications IF:9.4Q1 DOI:10.1016/j.xplc.2025.101519 PMID:40994005	综述	本文综述了海洋硅藻三角褐指藻作为多功能生物生产底盘的研究进展、挑战与前景	系统整合了基因工具开发、底盘优化及产业化策略，提出从模式生物向规模化生物制造平台的转型路径	存在产物产量不足、生物量限制和生产成本过高等产业化障碍	探讨三角褐指藻作为可持续生物生产平台的潜力与优化策略	海洋硅藻三角褐指藻（Phaeodactylum tricornutum）	合成生物学	NA	CRISPR/Cas基因组编辑、转基因元件优化、高效转化系统	NA	文献数据	NA
9	2025-09-26	RNA Polymerase III Promoters Compatible with CRISPR Gene Regulation in Saccharomyces cerevisiae 2025-Sep-19, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.5c00122 PMID:40824237	研究论文	本研究鉴定并表征了20个RNA聚合酶III启动子在酿酒酵母中用于CRISPR基因调控的适用性	首次系统评估跨物种来源的Pol III启动子在酵母CRISPR系统中的功能，发现支架介导的效应子招募可挽救部分启动子功能	研究仅限于酿酒酵母模型，未在其他真核生物中验证启动子兼容性	开发适用于酵母CRISPR系统的多样化Pol III启动子工具	酿酒酵母基因调控系统	合成生物学	NA	CRISPR-Cas9基因编辑技术	NA	基因表达数据	20个来自不同物种的RNA Pol III启动子
10	2025-09-26	Strong Translation Elongation Factor 1-Alpha (tef1α) Promoter Reporter Systems for Aspergillus niger 2025-Sep-19, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.5c00368 PMID:40844977	研究论文	本研究在构巢曲霉中开发了基于翻译延伸因子1-α基因启动子的高效报告系统	发现了目前构巢曲霉中最强的启动子，其活性比常用启动子高20倍以上，并开发了多功能共表达系统	NA	开发适用于真菌合成生物学的高性能遗传工具	构巢曲霉（Aspergillus niger）	合成生物学	NA	甲基伞形酮报告基因检测、荧光蛋白标记、GUS染色、P2A肽共表达系统	NA	分子生物学实验数据	NA
11	2025-09-26	Catalytic Residue Reprogramming Enhances Enzyme Activity at Alkaline pH via Phenolate-Mediated Proton Transfer 2025-Sep-19, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.5c00379 PMID:40891340	研究论文	提出一种通过催化残基重编程实现碱性pH下高效酶催化的蛋白质工程策略	将保守的催化残基替换为更高pKa的可电离残基，实现从羧酸盐介导向酚盐介导的质子转移机制转变	NA	扩展酶在极端pH条件下的催化效率和应用范围	TEM β-内酰胺酶及其工程变体	合成生物学	NA	理性设计、定向进化、稳态动力学分析、分子动力学模拟	NA	酶动力学数据、分子模拟数据	YR5-2变体及其亲本变体
12	2025-09-26	Engineering Nicotinamide Adenine Dinucleotide Oxidase for Regeneration of Oxidized Non-natural Cofactor 2025-Sep-12, Chembiochem : a European journal of chemical biology IF:2.6Q3 DOI:10.1002/cbic.202500254 PMID:40400447	研究论文	本研究通过工程化改造NADH氧化酶，实现了非天然辅因子NCDH向NCD的高效转化	首次开发出能够特异性氧化非天然辅因子NCDH的突变酶，催化效率和选择性分别提高14倍和107倍	NA	开发用于氧化反应的非天然辅因子再生工具	NADH氧化酶（EfNOX）及其突变体	合成生物学	NA	酶工程、分子对接分析	NA	酶学实验数据	NA
13	2025-09-26	Regulatory roles of RNA modifications in plant development and fruit ripening 2025-Sep, aBIOTECH IF:4.6Q1 DOI:10.1007/s42994-025-00240-5 PMID:40994446	综述	本文综述了RNA修饰在植物发育和果实成熟中的调控作用，重点关注m6A介导的调控网络	提出了结合CRISPR编辑、单细胞空间表观转录组学和合成生物学的创新路线图，用于精准农业应用	对RNA修饰（尤其是m6A以外的修饰）的分子机制理解仍然有限	解析植物表观转录组的调控机制并开发精准农业应用	植物发育过程和果实成熟机制	植物分子生物学	NA	表观转录组测序、CRISPR基因编辑、单细胞空间转录组	NA	表观转录组数据	被子植物物种间的比较研究
14	2025-09-26	SpyRing-Mediated Cyclization of TEV Protease, Guided by AlphaFold, Improves Thermostability 2025-Aug-05, ACS omega IF:3.7Q2 DOI:10.1021/acsomega.5c05386 PMID:40787351	研究论文	本研究通过SpyRing系统实现TEV蛋白酶环化，结合AlphaFold结构预测优化设计，显著提升了酶的热稳定性	首次将SpyTag/SpyCatcher介导的环化系统与AlphaFold结构预测相结合，成功实现了天然状态下N/C末端相距约40Å的TEV蛋白酶的有效环化	研究仅针对特定TEVp变体（L56V/S135G/S219V/Δ238-242）进行验证，未测试其他蛋白酶或更广泛的应用场景	开发一种计算指导的蛋白质环化策略，提高TEV蛋白酶的热稳定性	烟草蚀纹病毒蛋白酶（TEVp）及其环化变体（cTEVp）	蛋白质工程	NA	SpyTag/SpyCatcher环化系统、AlphaFold结构预测、蛋白质热稳定性测试	AlphaFold	蛋白质结构数据、酶活性数据	特定TEVp变体及其环化版本的热稳定性对比实验
15	2025-09-26	Unveiling the Frontiers of Synthetic Biology in Brazil: Pioneering the National Synthetic Biology Network 2025-Aug-05, ACS omega IF:3.7Q2 DOI:10.1021/acsomega.5c03077 PMID:40787363	综述	本文回顾了巴西合成生物学领域的发展现状，重点介绍了巴西合成生物学网络的建立及其对国家生物技术能力的推动作用	首次系统梳理巴西合成生物学生态系统，揭示该国利用丰富生物多样性发展可持续解决方案的独特潜力	国际社会对巴西的科学和监管环境了解不足，且国内存在基础设施和关键材料供应等发展障碍	分析巴西合成生物学生态系统的发展现状与挑战	巴西合成生物学研究群体和国家创新网络	合成生物学	NA	合成生物学技术	NA	NA	NA
16	2025-09-26	Recent Advances in Heterologous Protein Expression and Natural Product Synthesis by Aspergillus 2025-Jul-17, Journal of fungi (Basel, Switzerland) DOI:10.3390/jof11070534 PMID:40985424	综述	全面总结曲霉属真菌作为异源表达底盘在异源蛋白表达和天然产物合成领域的最新研究进展	重点探讨CRISPR-Cas9技术在曲霉遗传改造中的应用及在萜类化合物异源生物合成中的创新应用	NA	开发曲霉表达系统及其在天然产物生物合成中的应用潜力	曲霉属真菌（包括米曲霉、黑曲霉等）	合成生物学	NA	CRISPR-Cas9基因编辑技术	NA	NA	NA
17	2025-09-26	Metagenomic analysis of metal(loid)s resistance genes and its environmental applications 2025, Advances in applied microbiology DOI:10.1016/bs.aambs.2025.08.001 PMID:40992856	综述	本文通过宏基因组学方法探讨重金属环境中的微生物金属抗性基因及其环境应用	NA	未涉及具体实验数据验证，主要基于现有文献的理论分析	阐明金属抗性基因的宏基因组特征及其在环境修复中的应用前景	微生物群落及其金属抗性基因	环境微生物学	NA	宏基因组分析	NA	宏基因组序列数据	NA
18	2025-09-26	Vibrational imaging of metabolites for improved microbial cell strains 2024-06, Journal of biomedical optics IF:3.0Q2 DOI:10.1117/1.JBO.29.S2.S22711 PMID:38952688	综述	本文概述了代谢物振动成像技术在微生物细胞株开发中的应用前景	引入无标记振动光谱显微镜作为工业细胞株开发的新型对比机制	NA	改善微生物细胞株代谢物筛选技术以促进可持续生物制造	微生物细胞代谢物	生物成像技术	NA	拉曼散射成像、红外吸收成像、振动光谱显微镜	NA	化学成像数据	NA
19	2025-09-26	Illuminating protein space with a programmable generative model 2023-11, Nature IF:50.5Q1 DOI:10.1038/s41586-023-06728-8 PMID:37968394	研究论文	介绍了一种名为Chroma的可编程生成模型，用于直接采样新颖蛋白质结构和序列	提出首个能够通过自然语言提示等外部约束条件进行蛋白质设计的生成扩散模型	NA	探索蛋白质空间的潜在多样性并加速蛋白质编程	蛋白质分子和蛋白质复合物	机器学习	NA	扩散模型、低温采样算法	生成模型（扩散模型）	蛋白质结构和序列数据	310个蛋白质的实验表征及2个设计蛋白质的晶体结构验证
20	2025-09-25	Bacterial exopolysaccharides and live biotherapeutics: Orchestrating immune modulation and therapeutic potential in the gut microbiome era 2025-Oct, Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie DOI:10.1016/j.biopha.2025.118510 PMID:40902409	综述	探讨肠道微生物胞外多糖的免疫调节功能及其作为活生物治疗剂的治疗潜力	系统阐述EPS结构多样性如何通过特定受体介导精准免疫调节，并提出工程化活生物治疗剂的原位生产策略	存在结构功能认知缺口及规模化生产挑战	解析微生物胞外多糖的免疫调节机制并开发靶向肠道生态系统的免疫疗法	肠道共生菌和益生菌产生的免疫调节性胞外多糖	微生物免疫学	肠道免疫相关疾病	合成生物学、理性工程设计	NA	文献综述数据	NA