合成生物学相关文章
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当前共找到 3404 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2025-07-17 |
The secret life of RNA and lipids
2025-Dec, RNA biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1080/15476286.2025.2526903
PMID:40613519
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综述 | 本文探讨了RNA与脂质之间的相互作用及其在合成生物学、RNA世界和现代细胞生物学中的意义 | 提出了RNA与脂质相互作用的新视角，探索了RNA选择性结合脂质膜的序列依赖性及其在合成系统中的潜在应用 | NA | 探索RNA与脂质相互作用的化学基础及其在工程化生命和合成生物学中的应用 | RNA与脂质 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2 | 2025-07-17 |
Combining synthetic biology with synthetic electrochemistry to expand the chemical space of the indolocarbazole family
2025-Jul-16, Organic & biomolecular chemistry
IF:2.9Q1
DOI:10.1039/d5ob00766f
PMID:40576641
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研究论文 | 本研究通过结合合成生物学与合成电化学，开发了一种环境友好的方法来合成吲哚咔唑类化合物，并扩展了其化学空间 | 首次将合成生物学与合成电化学结合，实现了吲哚咔唑类化合物的绿色合成，并发现了N-N同源二聚化的新结构 | 未明确提及实验规模或工业化应用的可行性 | 开发绿色合成方法以扩展吲哚咔唑类化合物的化学多样性 | 吲哚咔唑类化合物及其衍生物 | 合成化学 | NA | 合成生物学、合成电化学、酶促糖基化 | NA | 化学合成数据 | 17种化合物在20种人类肿瘤细胞系中测试 |
| 3 | 2025-07-17 |
Application of the Pipeline Metabolic Model in Food Synthetic Biology
2025-Jul-16, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c04173
PMID:40600973
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研究论文 | 本文提出了一种名为管道代谢模型的概念和操作框架，旨在通过将代谢抽象为管道和阀门的网络，简化食品合成生物学中的设计和工程过程 | 提出了管道代谢模型，将代谢网络抽象为管道和阀门，分离酶水平控制和途径水平优化，简化设计逻辑 | 模型的实际应用效果和广泛适用性尚未经过大规模验证 | 降低合成生物学研究的障碍，促进可持续食品生产的创新 | 功能性食品分子（如碳水化合物、蛋白质和脂肪）的生产 | 合成生物学 | NA | 代谢工程 | 管道代谢模型 | NA | NA |
| 4 | 2025-07-17 |
Membrane-Anchored Polyproline Provides Controlled Microdomain Formation and Permeability in Lipid Vesicles
2025-Jul-16, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.5c06134
PMID:40605254
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研究论文 | 本研究介绍了一种由l-脯氨酸单体单元和磷脂引发剂组成的新型脂质聚合物的合成 | 通过将聚脯氨酸链锚定在膜上，实现了可逆的相分离，高温形成簇，冷却后分散，动态控制局部膜组成 | NA | 探索新型脂质聚合物在膜微区形成和渗透性控制方面的应用 | 由l-脯氨酸单体单元和磷脂引发剂组成的脂质聚合物 | 合成生物学 | NA | 共聚焦显微镜和FRAP分析 | NA | NA | NA |
| 5 | 2025-07-17 |
Structurally Tunable Cell-Free System: to Expand the Synthetic Biology Toolkit for Studies on Extracellular Polysaccharide
2025-Jul-16, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c04053
PMID:40611812
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研究论文 | 本研究开发了一种灵活的无细胞（膜）蛋白质合成系统（CF(M)PS），用于研究与膜蛋白相关的糖生物学，并成功应用于糖缀合物的生产 | 开发了结合纳米脂质体作为膜模拟物的CF(M)PS系统，用于膜蛋白的转录翻译耦合和溶解，成功表达了膜结合的磷酸糖基转移酶并启动了EPS合成 | 研究未提及该系统在大规模生产中的效率或成本效益 | 扩展合成生物学工具包，研究细胞外多糖的合成途径 | 微生物细胞外多糖（EPS）及其合成途径中的关键酶和膜相关生化反应 | 合成生物学 | NA | 无细胞蛋白质合成系统（CF(M)PS），纳米脂质体膜模拟物 | NA | 生化反应数据 | 未明确提及具体样本数量，但使用了CGMCC 2876的膜结合磷酸糖基转移酶 |
| 6 | 2025-07-17 |
Metabolic engineering of Saccharomyces cerevisiae for de novo biosynthesis of hydroxytyrosol and salidroside
2025-Jul-16, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.00712-25
PMID:40668011
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研究论文 | 通过代谢工程改造酿酒酵母，实现羟基酪醇和红景天苷的从头生物合成 | 优化了酿酒酵母菌株，实现了羟基酪醇和红景天苷的高效生物合成，并通过增强UDP-葡萄糖供应显著提高了红景天苷的产量 | 研究中未提及菌株的长期稳定性或大规模生产中的潜在问题 | 开发高效生物合成羟基酪醇和红景天苷的方法，以解决其自然提取产量低和化学合成复杂的问题 | 酿酒酵母菌株及其代谢途径 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、发酵技术 | NA | NA | 使用了优化的酿酒酵母菌株（ZYT1、ZYHT1、ZYSAL1、ZYSAL9+3），并在摇瓶和15 L生物反应器中进行发酵 |
| 7 | 2025-07-17 |
Structural modification strategies for ferritin nanoparticles and their applications in biomedicine: a narrative review
2025-Jul-16, Nanoscale
IF:5.8Q1
DOI:10.1039/d5nr01369k
PMID:40668604
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综述 | 本文综述了铁蛋白纳米颗粒的结构修饰策略及其在生物医学中的应用 | 系统总结了铁蛋白纳米颗粒的结构修饰策略及其多功能应用，特别是在精准医学、神经退行性疾病治疗和生物催化中的潜力 | 面临生物安全性、规模化制备和临床转化等挑战 | 探讨铁蛋白纳米颗粒的结构修饰策略及其在生物医学领域的应用 | 铁蛋白纳米颗粒 | 生物医学 | 神经退行性疾病 | 化学修饰、基因工程、仿生矿化 | NA | NA | NA |
| 8 | 2025-07-17 |
A digital plating platform for robust and versatile microbial detection and analysis
2025-Jul-13, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-11525-6
PMID:40653544
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research paper | 介绍了一种数字平板（DP）平台，该平台结合了传统平板培养和数字生物检测技术，用于微生物的快速分离、定量和表型特征分析 | 提出了一个结合传统平板培养和数字生物检测技术的数字平板平台，实现了微生物的快速检测和分析，显著缩短了检测时间并提高了单细胞分辨率 | 未提及具体的技术限制或潜在问题 | 开发一种快速、高效的微生物检测和分析平台 | 微生物（如大肠杆菌）及其在混合微生物群落中的行为 | microbiology | NA | digital bioassay technology, high-density picoliter microwell array chip | NA | microbial data | 未提及具体样本数量，但涉及多种微生物实验（如大肠杆菌） |
| 9 | 2025-07-17 |
Synthetic biology for space exploration
2025-Jul-12, NPJ microgravity
IF:4.4Q1
DOI:10.1038/s41526-025-00488-7
PMID:40651964
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research paper | 本文探讨了合成生物学在太空探索中的潜在应用，包括资源利用、生命支持系统、辐射防护和人类健康等关键主题 | 提出合成生物学作为推动人类太空和行星探索的有力工具，并为短期、中期和长期发展提供建议 | NA | 探索合成生物学在解决太空探索挑战中的应用 | 太空探索中的资源利用、生命支持系统、辐射防护和人类健康 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 10 | 2025-07-17 |
Yeast as C1 cell factory: Transforming methanol and Formate into high-value compounds
2025-Jul-09, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108641
PMID:40645511
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综述 | 本文综述了酵母作为C1细胞工厂，将甲醇和甲酸盐转化为高价值化合物的研究进展、挑战及未来展望 | 探讨了合成甲基营养在非甲基营养酵母中的应用，以及通过非理性基因组工程和理性设计揭示C1途径和底物耐受机制 | C1气体生物转化技术尚未解决的技术限制仍阻碍其工业应用 | 研究如何利用酵母将温室气体转化为高价值生化产品，以实现可持续的工业脱碳 | 工业酵母及其对甲醇和甲酸盐的耐受和同化能力 | 合成生物学 | NA | 合成甲基营养、非理性基因组工程、理性设计、模块化共培养工程、过氧化物酶体耦合 | NA | NA | NA |
| 11 | 2025-07-17 |
The XNA alphabet
2025-Jul-08, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf635
PMID:40650979
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综述 | 本文综述了50年来化学家设计和合成的糖修饰核酸（XNA）系统，探讨了其在生物技术和合成生物学中的应用 | 系统总结了XNA的构象行为及其与天然核酸的正交性，为XNA复制和进化提供了更理性的方法 | 未提及具体实验数据或样本量，主要为基础性综述 | 探讨糖修饰核酸（XNA）的构象特性及其在合成生物学等领域的应用潜力 | 糖修饰核酸（XNA）系统 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 12 | 2025-07-17 |
Expanding genetic engineering capabilities in Vibrio natriegens with the Vnat Collection
2025-Jul-08, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf580
PMID:40650977
|
研究论文 | 本文介绍了Vnat Collection，一个专为Vibrio natriegens设计的模块化工具包，旨在克服其遗传工程工具的不足 | 通过优化的Golden Gate克隆策略和改进的连接序列，实现了组装效率的300倍提升，并引入了新型操作子连接器和精确的基因调控系统 | NA | 扩展Vibrio natriegens的遗传工程能力，以充分发挥其在合成生物学中的潜力 | Vibrio natriegens | 合成生物学 | NA | Golden Gate克隆策略、NT-CRISPR方法 | NA | NA | 超过220个经过严格验证的模块化组件 |
| 13 | 2025-07-17 |
Analysis of Poly-3-Hydroxybutyrate Production with Different Microorganisms Using the Dynamic Simulations for Evaluation of Economic Potential Approach
2025-Jul-08, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.4c11178
PMID:40657095
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研究论文 | 本文提出了一种名为DySEEP的方法，用于评估工业生物产品的生产潜力，并以PHB生产为例进行了分析 | 提出了一种结合动态通量平衡分析和经济指标的DySEEP方法，用于评估生物产品的生产潜力，并提出了提高PHB产量的基因改造目标 | 由于DFBA模拟的性质，无法预测某些关键聚合物特性 | 优化生物塑料PHB的生产过程，降低生产成本 | 重组微生物的PHB生产潜力 | 生物工程 | NA | 动态通量平衡分析(DFBA) | NA | 模拟数据 | NA |
| 14 | 2025-07-17 |
A Pipeline for Screening Small Molecule-Enhanced Protein Stability in A Bacterial Orphan Receptor
2025-Jul-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.07.03.663076
PMID:40631274
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研究论文 | 本研究开发了一种筛选小分子增强蛋白质稳定性的流程，并以细菌孤儿受体CU228为模型系统 | 利用生物信息学、结构分析和多种生物物理技术（如差示扫描荧光法、微流控调制光谱法和饱和转移差示NMR）鉴定并验证了三种能显著提高CU228热稳定性的小分子配体 | 研究仅使用了约760种化合物的片段库，可能未涵盖所有潜在配体 | 探索细菌孤儿受体PAS结构域的小分子配体及其对蛋白质稳定性的影响 | 细菌孤儿受体CU228（一种PAS-HTH转录因子） | 合成生物学与生物技术 | NA | 差示扫描荧光法（DSF）、微流控调制光谱法（MMS）、饱和转移差示NMR（STD-NMR） | NA | 生物物理数据、结构数据 | 约760种化合物的片段库，鉴定出3种有效配体 |
| 15 | 2025-07-17 |
Deciphering plasmid replication dynamics: a computational approach to predict ColE1-like plasmid copy number
2025-Jul, Journal of the Royal Society, Interface
DOI:10.1098/rsif.2024.0783
PMID:40664234
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research paper | 开发了一种新型软件工具，通过计算模型预测ColE1样质粒的拷贝数，旨在简化质粒拷贝数设计 | 首次提出了一个能够从复制起点(ORI)序列计算预测质粒拷贝数的机器学习模型，强调了启动子强度和RNA折叠动力学的重要性 | NA | 开发计算工具预测质粒拷贝数，优化合成生物学中的质粒工程工作流程 | ColE1样质粒的复制起点(ORI)序列 | synthetic biology | NA | machine learning | machine learning model | sequence data | NA |
| 16 | 2025-07-17 |
Pattern recognition in living cells through the lens of machine learning
2025-Jul, Open biology
IF:4.5Q1
DOI:10.1098/rsob.240377
PMID:40664239
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research paper | 本文探讨了机器学习概念在生物框架中的应用，以探索人工神经网络、信号通路和基因调控网络之间的结构和功能相似性（及差异） | 将机器学习概念应用于生物系统，探索人工神经网络与生物信号通路、基因调控网络的相似性，并提出适合生物分类任务的神经网络架构 | 研究尚处于初步阶段，未涉及具体实验验证 | 探索生物系统中信号通路和基因调控网络的固有计算能力 | 细胞内的信号通路和基因调控网络 | machine learning | NA | NA | artificial neural networks | NA | NA |
| 17 | 2025-07-17 |
Light-orchestrated multi-step solid-phase picodroplet reactors
2025-Jun-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.23.660884
PMID:40666841
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研究论文 | 介绍了一种光控固相皮升液滴反应器，用于实现复杂的多步生化反应 | 利用光电子镊子操控单个皮升液滴和微珠，实现了八步点击化学为基础的DNA连接合成循环，并实时原位荧光检测反应产物 | 当前皮升液滴微流控技术缺乏试剂交换和洗涤能力，无法执行多步过程 | 开发一种能够执行复杂多步生化反应的皮升液滴反应器平台 | 皮升液滴反应器和微珠 | 合成生物学 | NA | 光电子镊子、荧光检测 | NA | 荧光信号 | NA |
| 18 | 2025-07-17 |
Pepper RNA variants reveal decoupling of HBC530 binding thermodynamics and fluorescence activation
2025-Jun-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.24.660466
PMID:40667133
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研究论文 | 本文通过生成Pepper RNA变体库，定量评估了单个核苷酸对HBC530结合亲和力、镁结合亲和力和荧光强度的贡献，揭示了配体识别与荧光强度之间的解耦现象 | 发现了HBC530结合亲和力与荧光强度之间的相关性较弱，并识别出多个结合亲和力与野生型Pepper相似但荧光强度显著降低的变体 | 研究仅针对Pepper RNA变体，未扩展到其他荧光RNA适体 | 探究荧光RNA适体的配体识别和荧光激活机制，为下一代荧光RNA适体的理性设计提供框架 | Pepper RNA变体及其与HBC530和镁离子的相互作用 | 合成生物学 | NA | RNA变体库生成与定量评估 | NA | RNA序列与荧光强度数据 | 53个Pepper变体 |
| 19 | 2025-07-17 |
Temporal gene regulation enables controlled expression of gas vesicles and preserves bacterial viability
2025-Jun-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.20.660610
PMID:40667317
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研究论文 | 本文报道了一种双诱导转录调控系统，用于控制气体囊泡（GVs）的时序表达，以保持细菌的活力 | 开发了一种双诱导转录调控系统，通过时序控制GV组装因子和外壳蛋白的表达，解决了GV异源表达导致的细胞生长受损问题 | 研究仅针对特定细菌宿主，未验证在其他宿主中的适用性 | 优化气体囊泡（GVs）在非原生宿主中的表达，以促进其在生物医学工程和合成生物学中的应用 | 气体囊泡（GVs）及其在细菌中的表达 | 合成生物学 | NA | 双诱导转录调控系统 | NA | NA | NA |
| 20 | 2025-07-17 |
Expression of Fluorescence Reporters and Natural Products in Native Gut Escherichia coli
2025-05-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00835
PMID:40138712
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研究论文 | 本研究利用CRAGE技术对肠道内源性大肠杆菌进行基因工程改造，成功表达了多种异源基因并优化了荧光蛋白的表达条件 | 首次在原生肠道大肠杆菌中成功表达生物发光操纵子、GFP和氧不依赖性荧光蛋白IFP2.0，并优化了其表达条件 | 仅测试了两种大肠杆菌菌株，可能无法代表所有肠道菌株的特性 | 开发基于原生肠道细菌的合成生物学平台 | 肠道内源性大肠杆菌EcAZ-1和益生菌株Nissle 1917(EcN) | 合成生物学 | NA | CRAGE(底盘独立重组酶辅助基因组工程技术) | NA | NA | 两种大肠杆菌菌株(EcAZ-1和EcN) |