合成生物学相关文章
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当前共找到 3250 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2025-06-15 |
From reactants to products: computational methods for biosynthetic pathway design
2025-Sep, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2025.05.005
PMID:40510533
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review | 该文章回顾了生物合成途径设计中的关键计算工具 | 整合了生物大数据、逆合成方法和酶工程三个关键组件，显著提高了生物合成途径设计的效率和准确性 | NA | 提高生物合成途径设计的效率和准确性 | 生物合成途径设计中的计算工具 | 合成生物学 | NA | 数据挖掘、逆合成方法 | NA | 生物大数据（包括化合物、反应/途径和酶） | NA |
| 2 | 2025-06-15 |
Advances in engineered models of peri-gastrulation
2025-Jun-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.112659
PMID:40510116
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research paper | 本文讨论了利用干细胞技术和工程工具整合的工程模型在研究人类发育早期阶段中的应用 | 整合了工程技术和合成生物学工具，提高了模型的精确度，为人类早期发育阶段的研究提供了新视角 | NA | 研究人类发育早期阶段的细胞分化和组织形成 | 人类早期发育阶段的细胞和组织 | synthetic biology | NA | stem cell technology, micropatterned substrates, microfluidic systems, synthetic biology tools | blastoids, 2D micropatterned systems, 3D gastruloid constructs, somitoids | NA | NA |
| 3 | 2025-06-15 |
DNA-programmed responsive microorganism assembly with controlled patterns and behaviors
2025-Jun-13, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.ads8651
PMID:40512851
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研究论文 | 该研究展示了利用功能性DNA作为可编程表面受体来调控微生物群落的模式和行为 | 使用功能性DNA作为可编程表面受体，实现了对微生物群落模式和行为的精确调控，包括双组分和三组分微生物组装的空间控制及刺激响应性聚集 | 需要外源性信号分子（如寡核苷酸或小分子）来触发响应性聚集，可能限制了其在某些应用中的自主性 | 开发一种新的方法来编程微生物粘附，以工程化多细胞微生物群落 | 各种微生物，包括革兰氏阳性菌、革兰氏阴性菌和休眠孢子 | 合成生物学 | NA | 代谢标记和疏水插入 | NA | NA | 多种微生物（具体数量未明确说明） |
| 4 | 2025-06-15 |
Establishing Halomonas as a chassis for industrial biotechnology: advances in synthetic biology tool development and metabolic engineering strategies
2025-Jun-12, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-025-02757-2
PMID:40506695
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综述 | 本文综述了Halomonas作为工业生物技术底盘生物的潜力，重点介绍了合成生物学工具的发展和代谢工程策略 | 探讨了Halomonas在高盐条件下生长的独特优势，以及其在合成生物学工具和代谢工程中的应用 | 转化困难等挑战限制了部分合成生物学工具的应用 | 评估Halomonas作为工业生物技术底盘生物的潜力 | Halomonas菌种及其代谢产物 | 工业生物技术 | NA | 合成生物学工具、代谢工程 | NA | NA | NA |
| 5 | 2025-06-15 |
Unraveling the regulatory dynamics of bidirectional promoters for modulating gene co-expression and metabolic flux in Saccharomyces cerevisiae
2025-Jun-06, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf511
PMID:40503683
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研究论文 | 本研究通过全基因组筛选和表征酵母中的双向启动子（BDPs），揭示了其调控机制并应用于代谢通量的精细调控 | 利用DREAM-CNN AI预测模型识别BDPs中的保守激活剂结合热点，并通过实验验证这些热点对BDP功能的关键作用 | 研究仅针对酵母Saccharomyces cerevisiae，未在其他生物体中验证BDPs的普适性 | 探索双向启动子的调控机制并应用于合成生物学中的基因共表达和代谢通量调控 | 酵母Saccharomyces cerevisiae中的749个双向启动子候选者 | 合成生物学 | NA | 全基因组筛选、转录组分析、荧光报告分析、计算机模拟突变 | DREAM-CNN | 基因组数据、转录组数据、荧光报告数据 | 749个双向启动子候选者 |
| 6 | 2025-06-15 |
Prospects of Synthetic Biology-Based Approaches in the Enhanced Production of Pyocyanin in Pseudomonas aeruginosa MCCB 117 as the Drug of Choice in Aquaculture
2025-Jun-03, Current microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00284-025-04279-x
PMID:40459729
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综述 | 本文探讨了利用合成生物学方法提高铜绿假单胞菌MCCB 117中绿脓菌素产量的前景，以作为水产养殖中的首选药物 | 提出了利用合成生物学工具增强绿脓菌素生物合成的分子机制和基因水平操作的新方法 | 未提及具体实验数据或实施细节 | 研究如何通过合成生物学方法提高绿脓菌素的产量，以应用于可持续水产养殖生产系统 | 铜绿假单胞菌MCCB 117及其绿脓菌素生物合成途径 | 合成生物学 | 弧菌病 | 基因水平操作 | NA | NA | NA |
| 7 | 2025-06-15 |
Coli bond: A dual-function encryption system for secure information storage and transmission by microorganisms
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0325926
PMID:40498745
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研究论文 | 介绍了一种名为Coli Bond的双功能加密系统，利用微生物进行安全信息存储和传输 | 结合DNA存储的分子精确性与合成生物学的可控动态性，提供数据加密和存储的创新平台 | NA | 开发一种安全可控的信息存储和传输系统 | 利用合成生物学改造的大肠杆菌菌株 | 合成生物学 | NA | 合成生物学技术 | NA | DNA编码信息 | NA |
| 8 | 2025-06-15 |
Unlocking the potential of flavonoid biosynthesis through integrated metabolic engineering
2025, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2025.1597007
PMID:40510168
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综述 | 本文全面综述了类黄酮生物合成的代谢工程策略及其应用前景 | 整合植物细胞工厂、基因组编辑、环境优化和AI驱动的代谢工程，提出可持续高产类黄酮的新路线图 | 未提及具体实验验证数据或案例研究 | 探索提高类黄酮产量的综合代谢工程策略 | 植物类黄酮生物合成途径及其调控机制 | 合成生物学 | NA | 基因组编辑、空间代谢组学、AI驱动的代谢工程 | NA | 代谢组学数据 | NA |
| 9 | 2025-06-15 |
Open-endedness in synthetic biology: A route to continual innovation for biological design
2024-01-19, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adi3621
PMID:38241375
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research paper | 提出了一种开放式的合成生物学设计方法，强调设计的新颖性与实现目标同等重要 | 提出将新颖性作为生物设计的重要考量，而不仅仅是优化单一最佳设计，以突破工程生物学中性能提升的瓶颈 | 未具体说明开放式设计方法在实际应用中的具体操作步骤或验证案例 | 探索合成生物学中更具创造性的设计方法，以克服当前系统复杂性瓶颈和实验室到实际应用的转化难题 | 合成生物学设计方法 | synthetic biology | NA | NA | NA | NA | NA |
| 10 | 2025-06-15 |
Digital switching in a biosensor circuit via programmable timing of gene availability
2014-Dec, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/nchembio.1680
PMID:25306443
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研究论文 | 本文介绍了一种通过编程控制基因可用时间来优化生物传感器电路的方法 | 利用位点特异性重组酶通过编程控制基因可用时间，显著减少传感器电路的基底泄漏并提高动态范围 | NA | 优化合成生物学中基因电路的部署，提高生物传感器的性能 | 多基因电路和生物传感器 | 合成生物学 | NA | 位点特异性重组酶技术 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 11 | 2025-06-14 |
Decoding the Minimal Translation System of the Plasmodium falciparum Apicoplast: Essential tRNA-modifying Enzymes and Their Roles in Organelle Maintenance
2025-Aug-15, Journal of molecular biology
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.jmb.2025.169156
PMID:40335414
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研究论文 | 本研究通过比较基因组学和预测工具，鉴定了疟原虫顶质体中16种tRNA修饰酶，并验证了其中14种的定位，揭示了6种对寄生虫生存至关重要的酶 | 首次系统鉴定了疟原虫顶质体中tRNA修饰酶的最小集合，并确定了其中6种对寄生虫生存和顶质体功能至关重要的酶 | 有2个基因无法被敲除，其中一个具有双重定位，可能在其他细胞器中具有必需功能，另一个可能具有无法通过代谢旁路绕过的关键作用 | 研究疟原虫顶质体中最小翻译系统所需的tRNA修饰酶及其功能 | 疟原虫顶质体中的tRNA修饰酶 | 分子生物学 | 疟疾 | 比较基因组学、蛋白质定位预测、基因敲除 | NA | 基因组数据、蛋白质定位数据 | 16种预测的tRNA修饰酶，其中14种被实验验证 |
| 12 | 2025-06-14 |
Effect of glycosylation on protein folding: From biological roles to chemical protein synthesis
2025-Jun-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.112605
PMID:40502693
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review | 探讨糖基化在蛋白质折叠中的双重作用及其在化学蛋白质合成中的应用 | 提出临时糖基化支架策略，为化学蛋白质合成提供可逆的折叠引导方法 | 未提及具体实验数据或样本量，可能缺乏实证支持 | 研究糖基化对蛋白质折叠的影响及其在生物技术和合成生物学中的应用 | 蛋白质折叠及糖基化修饰 | 合成生物学 | NA | 化学蛋白质合成 | NA | NA | NA |
| 13 | 2025-06-14 |
Characterization of a consensus-designed trans-cinnamic acid decarboxylase for styrene biosynthesis
2025-Jun-11, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.00714-25
PMID:40407334
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research paper | 该研究描述了一种共识设计的反式肉桂酸脱羧酶PSC1，用于微生物生物合成苯乙烯 | 设计了一种新型的共识蛋白PSC1，能够在微生物中高效催化反式肉桂酸脱羧生成苯乙烯，并解析了其晶体结构 | NA | 开发更环保的苯乙烯生物合成方法以替代传统石化工艺 | 反式肉桂酸脱羧酶PSC1及其在苯乙烯生物合成中的应用 | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程、X射线晶体学 | NA | 蛋白质结构数据 | NA |
| 14 | 2025-06-14 |
Fungal bioconversion of lignin-derived aromatics: Pathways, enzymes, and biotechnological potential
2025-Jun-10, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108624
PMID:40505753
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综述 | 本文综述了真菌对木质素衍生芳香化合物的生物转化途径、相关酶及其生物技术潜力 | 系统整合了芳香族分解代谢途径的最新进展，强调了真菌转运系统在芳香化合物摄取和排出中的关键作用 | 对真菌木质素降解系统的研究仍存在知识缺口，需要进一步整合合成生物学、计算建模和系统生物学方法 | 推动基于真菌的平台开发，实现可再生芳香族化合物的可持续生产 | 木质素衍生芳香化合物（如肉桂酸、没食子酸、阿魏酸和香草醛） | 生物技术 | NA | 合成生物学、计算建模、系统生物学 | NA | NA | NA |
| 15 | 2025-06-14 |
Expressing exogenous gene in Chlamydomonas reinhardtii chloroplast with viral replication elements
2025-Jun-07, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2025.132784
PMID:40490158
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研究论文 | 本研究开发了一种基于病毒复制元件的表达平台，用于在莱茵衣藻叶绿体中高效表达外源基因 | 利用甜菜卷顶病毒的复制机制构建表达平台，相比传统同源重组方法提高了表达水平（2-4倍），并能稳定表达转基因长达12个月 | NA | 解决莱茵衣藻叶绿体作为合成生物学底盘时产物产量低的问题 | 莱茵衣藻叶绿体 | 合成生物学 | NA | 病毒复制元件表达平台 | NA | NA | NA |
| 16 | 2025-06-14 |
Rosmarinic Acid as Bioactive Compound: Molecular and Physiological Aspects of Biosynthesis with Future Perspectives
2025-Jun-05, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells14110850
PMID:40498026
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综述 | 本文综述了迷迭香酸（RA）的生物合成、分子机制、生理功能及其在生物技术中的应用 | 探讨了合成生物学和代谢工程技术在提高RA工业生产中的应用 | NA | 研究迷迭香酸的生物合成、功能及其生产方法 | 迷迭香酸及其在植物中的生物合成 | 植物生物技术 | NA | 植物细胞组织培养、合成生物学、代谢工程 | NA | NA | NA |
| 17 | 2025-06-14 |
Complexity Meets Risk-The Next Generation of Genome-Edited Plants Challenges Established Concepts for Environmental Risk Assessment in the EU
2025-Jun-05, Plants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/plants14111723
PMID:40508397
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研究论文 | 本文探讨了新一代基因组编辑植物对欧盟环境风险评估(ERA)现有概念的挑战 | 提出了针对复杂转基因植物应用的假设驱动评估方法，补充现有比较评估方法的不足 | 研究主要基于案例分析，可能缺乏大规模实证数据支持 | 评估欧盟现行转基因植物环境风险评估方法的适用性 | 复杂代谢途径修饰的转基因植物 | 生物技术 | NA | 基因组编辑技术 | NA | 案例分析数据 | 未明确说明具体样本数量 |
| 18 | 2025-06-14 |
Synthetic Biology in Natural Product Biosynthesis
2025-Apr-09, Chemical reviews
IF:51.4Q1
DOI:10.1021/acs.chemrev.4c00567
PMID:40116601
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综述 | 本文综述了合成生物学在天然产物生物合成中的最新进展 | 总结了合成生物学在天然产物发现和工程中的多学科工具整合与应用 | NA | 探讨合成生物学在天然产物生物合成中的作用 | 天然产物及其生物合成基因簇 | 合成生物学 | NA | 生物信息学、异源表达、组合生物合成 | NA | NA | NA |
| 19 | 2025-06-14 |
Cell-free expression and SMA copolymer encapsulation of a functional receptor tyrosine kinase disease variant, FGFR3-TACC3
2025-01-23, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-86194-6
PMID:39848978
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研究论文 | 该研究通过无细胞蛋白表达系统成功表达了功能性的FGFR3-TACC3融合蛋白，并利用SMA共聚物进行重构 | 首次使用无细胞蛋白表达系统在48小时内成功表达功能性FGFR3-TACC3融合蛋白，并实现高产量重构 | 尚未获得全长受体酪氨酸激酶的高分辨率结构 | 解决跨膜蛋白特别是受体酪氨酸激酶融合蛋白表达困难的问题 | FGFR3-TACC3融合蛋白 | 合成生物学 | 癌症 | 无细胞蛋白表达(CFPE), SMA共聚物重构 | NA | 蛋白功能数据 | NA |
| 20 | 2025-06-14 |
Optimal network sizes for most robust Turing patterns
2025-01-23, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-86854-7
PMID:39849094
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research paper | 该研究通过随机矩阵理论分析较大网络的Jacobian矩阵，探讨了图灵模式在生物系统中的形成机制及其最优网络大小 | 揭示了图灵模式比以往认为的更可能偶然发生，并发现最稳健的图灵网络具有一个最优大小，仅由少数分子物种组成，从而显著提高了其在生物系统中的可识别性 | 研究主要基于理论分析，需要进一步的实验验证以确认在真实生物系统中的适用性 | 探讨图灵模式在复杂生物基因调控网络中的形成机制及其稳健性 | 基因调控网络及其Jacobian矩阵 | systems biology | NA | random matrix theory | NA | theoretical analysis | NA |