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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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1 | 2025-08-03 |
Direct high-throughput deconvolution of non-canonical bases via nanopore sequencing and bootstrapped learning
2025-Jul-30, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-62347-z
PMID:40739090
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研究论文 | 本文展示了使用纳米孔测序和自举学习技术高通量解卷积非经典碱基的方法 | 首次实现了非经典碱基的高通量测序,并开发了能够高准确度解卷积含非经典碱基序列的AI模型 | 需要合成高纯度的含非经典碱基寡核苷酸作为训练数据 | 开发能够高通量测序和解卷积非经典碱基的技术 | 非经典碱基和合成异源核酸 | 基因组学 | NA | 纳米孔测序,自举学习 | AI模型 | DNA测序数据 | 1,024种含非经典碱基的寡核苷酸 |
2 | 2025-08-03 |
The path to biotechnological singularity: Current breakthroughs and outlook
2025-Jul-29, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108667
PMID:40744238
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综述 | 本文探讨了生物技术快速发展的当前突破和未来展望,特别是基因编辑、合成生物学、人工智能、再生医学和脑机接口等领域的进展 | 综合分析了生物技术各领域的突破性进展及其潜在的变革性影响,并提出了生物技术奇点的概念 | 未具体讨论各技术在实际应用中可能遇到的技术障碍或失败案例 | 探讨生物技术快速发展的现状和未来趋势,以及其对社会的影响 | 基因编辑、合成生物学、人工智能、再生医学和脑机接口等生物技术领域 | 生物技术 | NA | CRISPR基因编辑、合成生物学、深度学习、干细胞研究、脑机接口 | 深度学习模型 | NA | NA |
3 | 2025-08-03 |
Development of a DNA endonuclease I-SceI-based scarless genome editing system for Cupriavidus necator
2025-Jul-26, Journal of biotechnology
IF:4.1Q2
DOI:10.1016/j.jbiotec.2025.07.020
PMID:40721107
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research paper | 开发了一种基于DNA内切酶I-SceI的无疤痕基因组编辑系统,用于Cupriavidus necator | 开发了一种新型的两质粒I-SceI HR系统,简化了C. necator的基因组工程,减少了时间框架并促进了其在合成生物学中的应用 | NA | 开发一种高效的基因删除和插入方法,用于C. necator的基因组编辑 | Cupriavidus necator | synthetic biology | NA | DNA endonuclease I-SceI-mediated HR system | NA | NA | NA |
4 | 2025-08-03 |
Bioengineering Outer-Membrane Vesicles for Vaccine Development: Strategies, Advances, and Perspectives
2025-Jul-20, Vaccines
IF:5.2Q1
DOI:10.3390/vaccines13070767
PMID:40733744
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综述 | 本文探讨了外膜囊泡(OMVs)作为下一代疫苗开发平台的潜力及其工程策略 | 综述了OMVs在疫苗开发中的最新工程策略,包括遗传工程、表面共轭、糖工程等,并探讨了合成OMVs和纳米机器人等前沿技术 | NA | 探讨OMVs作为疫苗开发平台的潜力及其工程策略 | 外膜囊泡(OMVs)及其工程化应用 | 生物工程 | 传染病和癌症 | 遗传工程、表面共轭、糖工程、纳米技术 | NA | NA | NA |
5 | 2025-08-03 |
Soilless Cultivation: Precise Nutrient Provision and Growth Environment Regulation Under Different Substrates
2025-Jul-16, Plants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/plants14142203
PMID:40733440
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review | 本文系统综述了无土栽培技术体系、营养液管理策略、根际微生物相互作用机制及未来发展方向,旨在揭示其技术优势和创新潜力 | 揭示了无土栽培在资源利用效率、产量提升方面的技术优势,并探讨了智能管理和微生物工程等创新方向 | 有机系统中根际微生物群落结构和功能稳定性易失衡,需通过合成生物学方法进行针对性优化 | 揭示无土栽培技术的优势和创新潜力,促进其在粮食安全、生态保护和资源循环中的大规模应用 | 无土栽培技术体系、营养液管理、根际微生物 | 现代农业技术 | NA | 无土栽培技术、合成生物学方法 | NA | NA | NA |
6 | 2025-08-03 |
Integrated Approach for Improving Lutein Production of Chlorella sp. via Adaptive Evolution and Casein Acid Hydrolysate
2025-Jul, Applied biochemistry and biotechnology
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s12010-025-05279-0
PMID:40358910
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研究论文 | 本研究开发了一种综合方法,通过适应性进化和代谢调控提高微藻中叶黄素的产量 | 结合适应性进化和代谢调控(如添加酪蛋白酸水解物)来提高叶黄素产量,并发现特定浓度的NaCl和酪蛋白酸水解物能显著促进叶黄素合成 | 未探讨该方法在其他微藻物种中的适用性,且未进行大规模生产验证 | 提高微藻中叶黄素的产量 | Chlorella sp.微藻及其适应性进化菌株P30 | 代谢工程 | NA | 适应性进化、代谢调控 | NA | 实验数据 | 微藻菌株(起始菌株及进化菌株P30) |
7 | 2025-08-03 |
Regulatory helix plays a key role in genetic ON-OFF switching for the 2'-deoxyguanosine-sensing mRNA element
2025-Jul, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2025.110282
PMID:40412519
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研究论文 | 研究2'-脱氧鸟苷感应mRNA元素的遗传开关调控机制 | 揭示了2'-脱氧鸟苷感应核糖开关在转录中间体阶段通过形成或破坏抗终止螺旋来实现转录调控的新机制 | 研究主要关注特定核糖开关的调控机制,可能不适用于其他类型的核糖开关 | 探究2'-脱氧鸟苷感应核糖开关的转录调控机制 | 2'-脱氧鸟苷感应核糖开关(dGsw)及其转录中间体(dGsw-int) | 分子生物学 | NA | 化学探测技术、荧光淬灭实验 | NA | NA | NA |
8 | 2025-08-03 |
How many plasmids can bacteria carry? A synthetic biology perspective
2025-Jul, Open biology
IF:4.5Q1
DOI:10.1098/rsob.240378
PMID:40730232
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research paper | 探讨细菌中可携带的质粒数量及其在合成生物学中的应用 | 从理论和实践角度分析细菌维持多个独特质粒的能力,并探讨多质粒系统在代谢工程和合成生物学中的新应用 | 未明确提及具体细菌种类或实验数据支持的最大质粒数量 | 研究细菌中可携带的质粒数量及其在生物技术中的应用 | 细菌及其携带的质粒 | synthetic biology | NA | NA | NA | NA | NA |
9 | 2025-08-03 |
Understanding carboxysomes to enhance carbon fixation in crops
2025-Jun-30, Biochemical Society transactions
IF:3.8Q2
DOI:10.1042/BST20253072
PMID:40570186
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research paper | 探讨羧酶体在增强作物碳固定中的作用及其在合成生物学中的应用 | 深入理解羧酶体的生物发生、Rubisco的组织及外壳功能,并探讨其在植物叶绿体中的功能整合 | 外壳的精确机械作用尚未完全阐明,且需要找到合适的碳酸氢盐转运体并优化表达水平 | 提高作物的光合效率 | 羧酶体及碳酸氢盐转运体 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
10 | 2025-08-03 |
Armed Phages: A New Weapon in the Battle Against Antimicrobial Resistance
2025-Jun-27, Viruses
DOI:10.3390/v17070911
PMID:40733529
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综述 | 本文探讨了噬菌体疗法在对抗多重耐药细菌感染中的潜力,并重点介绍了通过合成生物学手段增强噬菌体效力的新策略 | 提出了'武装噬菌体'概念,通过基因工程改造噬菌体以规避细菌免疫系统,并整合抗菌肽、CRISPR基因编辑工具等增强功能 | 目前临床数据仍有限,仅有两个工程化噬菌体进入临床试验阶段 | 探索应对抗生素耐药性危机的创新治疗方案 | 多重耐药细菌及其防御系统 | 合成生物学 | 细菌感染 | 噬菌体生物工程、CRISPR基因编辑 | NA | NA | 提及SNIPR001的I期临床试验(健康志愿者)和LBP-EC01的II期临床试验(耐药性尿路感染患者) |
11 | 2025-08-03 |
Advances in engineered models of peri-gastrulation
2025-Jun-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.112659
PMID:40510116
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review | 本文讨论了利用干细胞技术和工程工具构建的围原肠胚形成模型,以研究人类早期发育中的细胞分化和组织形成 | 整合了工程技术和合成生物学工具,提高了模型的精确度,为人类早期发育研究提供了新视角 | 未提及具体实验数据或样本量的限制 | 研究人类早期发育中的细胞谱系特化和形态发生事件 | 围原肠胚形成阶段的干细胞模型 | 合成生物学 | NA | 干细胞技术、微流控系统、合成生物学工具 | blastoids、2D micropatterned systems、3D gastruloid constructs、somitoids | NA | NA |
12 | 2025-08-03 |
The gut-bone axis in osteoporosis: a multifaceted interaction with implications for bone health
2025, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2025.1569152
PMID:40741168
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综述 | 本文系统总结了肠道-骨骼轴的相互作用及其在骨质疏松症中的潜在干预策略 | 创新性地提出了肠道-骨骼轴加X的概念框架,并探讨了多学科整合在抗骨质疏松症中的前景 | 未提及具体研究样本量或实验数据支持 | 探讨肠道-骨骼轴在骨质疏松症中的作用及其干预策略 | 骨质疏松症及其与肠道微生态的相互作用 | 骨科与微生物组学 | 骨质疏松症 | 粪便微生物移植、益生菌和益生元补充、饮食模式调整 | NA | NA | NA |
13 | 2025-08-03 |
Pleiotropy, a feature or a bug? Toward co-ordinating plant growth, development, and environmental responses through engineering plant hormone signaling
2024-Aug, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2024.103151
PMID:38823314
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综述 | 探讨系统生物学和单细胞测序技术在识别协调植物生长和发育候选基因中的应用 | 结合系统生物学和单细胞测序技术,探索合成生物学在测试假设和定义基因型-表型关系中的潜力 | 基因网络的复杂性和多效性增加了确定特定基因和通路功能的难度 | 通过工程化植物激素信号传导,协调植物生长、发育和环境响应 | 植物基因网络和通路 | 系统生物学 | NA | CRISPR, 单细胞测序 | NA | 基因序列数据 | NA |
14 | 2025-08-03 |
Biocatalytic enantioselective C(sp3)-H fluorination enabled by directed evolution of non-haem iron enzymes
2024-Aug, Nature synthesis
DOI:10.1038/s44160-024-00536-2
PMID:39925872
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研究论文 | 通过定向进化非血红素铁酶,实现了生物催化的对映选择性C(sp3)-H氟化反应 | 首次将植物来源的非血红素酶1-氨基环丙烷-1-羧酸氧化酶(ACCO)重新用于催化非自然的对映选择性C(sp)-H氟化反应,并通过定向进化显著提高了其活性和选择性 | 虽然实现了对映选择性C-H氟化,但该方法的底物范围和应用潜力仍需进一步验证 | 开发新的生物催化氟化反应,解决催化不对称C(sp)-H氟化这一合成化学难题 | 非血红素铁酶1-氨基环丙烷-1-羧酸氧化酶(ACCO)及其突变体 | 生物催化 | NA | 定向进化、计算研究 | NA | NA | NA |
15 | 2025-08-02 |
Engineering Plant Holobionts for Climate-Resilient Agriculture
2025-Aug-01, The ISME journal
DOI:10.1093/ismejo/wraf158
PMID:40748243
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综述 | 本文提出了一种整合微生物生态学、合成生物学和计算模型的框架,用于设计合成微生物群落(SynComs)以增强农业的气候韧性 | 引入了可编程全息生物(programmable holobiont)的概念,这是一种能够动态反馈、跨界信号传递和生态记忆的工程植物-微生物伙伴关系 | NA | 通过工程化植物全息生物(plant holobionts)来发展气候韧性农业 | 植物全息生物(植物及其微生物组的整合单元) | 合成生物学 | NA | CRISPR干扰、生物传感器电路、群体感应模块、基因组尺度代谢模型、动态通量平衡分析、机器学习 | 机器学习 | NA | NA |
16 | 2025-08-02 |
Thermodynamically consistent, reduced models of gene regulatory networks
2025-Jul, Royal Society open science
IF:2.9Q1
DOI:10.1098/rsos.241725
PMID:40746961
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研究论文 | 本研究开发了一种适用于细胞群体建模的基因表达动力学模型,该模型既计算高效又符合物理定律 | 通过应用模型简化方案和键合图建模方法,开发了热力学一致且计算高效的基因表达模型,并将其应用于细胞群体行为的工程化设计 | 模型在应用于大规模细胞群体时可能需要进一步的验证和优化 | 为合成生物学工程化设计细胞群体行为提供数学模型支持 | 基因调控网络和细胞群体 | 合成生物学 | NA | 键合图建模 | 动力学模型 | 数学模型 | NA |
17 | 2025-08-01 |
Optimization of Malonyl Coenzyme A Biosensors in a Reconstituted Cell-Free System for Detecting Acetyl-CoA Carboxylase Activity
2025-Jul-31, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00361
PMID:40742616
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研究论文 | 本文优化了一种用于检测乙酰辅酶A羧化酶(ACC)活性的丙二酰辅酶A生物传感器,在重构的无细胞蛋白质合成系统中实现了高灵敏度和精确量化 | 通过工程化T7启动子与FapO操作子之间的间隔序列,开发了具有宽检测范围(50-1500 μM)的体外丙二酰辅酶A生物传感器系统,动态范围最高提升至95.3倍(1500 μM时),并筛选了对低浓度丙二酰辅酶A敏感的FapR/FapO同源对 | NA | 优化ACC活性的检测方法,以促进代谢工程和合成生物学的发展 | 丙二酰辅酶A生物传感器和乙酰辅酶A羧化酶(ACC) | 合成生物学 | NA | 无细胞蛋白质合成系统 | NA | 生化数据 | NA |
18 | 2025-07-31 |
Development of precise genome editing and multi-copy integration tools in Hansenula polymorpha DL-1
2025-Dec, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2025.06.009
PMID:40735059
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研究论文 | 本研究开发了一种优化的合成生物学工具包,用于提高Hansenula polymorpha DL-1的基因编辑和多拷贝整合效率 | 开发了高效的CRISPR-Cas9基因组编辑系统,部分抑制NHEJ通路以提高同源重组率,并鉴定了36个中性位点用于稳定的单拷贝基因整合 | 未提及具体局限性 | 提高Hansenula polymorpha DL-1的基因编辑和多拷贝整合效率,以增强其作为微生物细胞工厂的潜力 | Hansenula polymorpha DL-1酵母 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9基因组编辑 | NA | NA | NA |
19 | 2025-07-30 |
CRISPR-Cas10-Assisted Structural Modification of Staphylococcal Kayvirus for Imaging and Biosensing Applications
2025-Jul-28, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00387
PMID:40720830
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研究论文 | 该研究利用CRISPR-Cas10辅助技术对葡萄球菌噬菌体Kayvirus进行结构修饰,用于成像和生物传感应用 | 首次报道了对葡萄球菌噬菌体结构蛋白的修饰,通过插入多组氨酸标签实现 | 未提及该方法在其他噬菌体系统中的普适性 | 开发噬菌体工程新方法,拓展其在医学和生物技术中的应用 | 葡萄球菌噬菌体812h1 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas10基因编辑、荧光显微镜、生物层干涉仪生物传感、ELISA、流式细胞术 | NA | NA | NA |
20 | 2025-07-30 |
Ingestible optoelectronic capsules enable bidirectional communication with engineered microbes for controllable therapeutic interventions
2025-Jul-28, Nature microbiology
IF:20.5Q1
DOI:10.1038/s41564-025-02057-w
PMID:40721535
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研究论文 | 本文介绍了一种可摄入的光电胶囊,结合工程化微生物和智能手机无线技术,实现了体内生物分子的双向通信和可控治疗干预 | 创新性地将合成生物学与光电子技术结合,建立了生物-光学-电子信号处理链,实现了对体内工程化微生物的实时监测和远程控制 | 研究仅在猪模型中进行验证,尚未进行人体试验 | 开发一种用于数字健康监测和可控治疗干预的新技术 | 工程化大肠杆菌Nissle 1917和猪模型 | 合成生物学与数字健康 | 结肠炎 | 光遗传学工程、光电胶囊技术、无线通信 | 工程化微生物系统 | 生物发光信号、无线电子信号 | 猪模型 |