合成生物学相关文章
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当前共找到 3490 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2025-08-07 |
Rhodotorula Yeasts as Potential Chassis for Sustainable Food Biotechnology
2025-Aug-06, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c05298
PMID:40699591
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综述 | 本文综述了红酵母作为可持续食品生物技术潜在底盘的研究进展 | 探讨了红酵母在多组学生物学、细胞工厂创建及合成生物学工具箱方面的最新进展 | 红酵母代谢工程仍面临多组学信息挖掘不足、遗传工具箱效率低下及独特代谢特征理解不充分等挑战 | 探索红酵母作为食品成分生产细胞工厂的潜力 | 红酵母(Rhodotorula spp.) | 食品生物技术 | NA | 多组学分析、合成生物学、代谢工程 | NA | NA | NA |
| 2 | 2025-08-07 |
Mining UDP-Glucosyltransferases to Develop High-Efficiency Production Strategies for Emodin Glucosides
2025-Aug-06, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c03575
PMID:40705854
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研究论文 | 本研究利用合成生物学方法全面研究了丝状真菌中大黄素葡萄糖苷的生物合成，并开发了一种高效生产策略 | 评估了十种高效的大黄素UDP-葡萄糖基转移酶（EUGTs），并开发了一种全细胞催化系统，实现了78.9%的高转化率 | 植物源蛋白在丝状真菌中表达的挑战阻碍了进一步优化 | 开发大黄素葡萄糖苷的高效生产策略 | 大黄素-6-β-d-葡萄糖苷（E6G）和大黄素-8-β-d-葡萄糖苷（E8G） | 合成生物学 | NA | 合成生物学方法，全细胞催化系统 | NA | NA | 十种大黄素UDP-葡萄糖基转移酶（EUGTs） |
| 3 | 2025-08-07 |
Plant prenyltransferases: Diversity, catalytic activities, mechanisms, and application in heterologous production of prenylated natural products
2025-Aug-06, Journal of integrative plant biology
IF:9.3Q1
DOI:10.1111/jipb.70004
PMID:40765501
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review | 本文综述了植物异戊二烯基转移酶（PTs）的多样性、催化活性、机制及其在异源生产异戊二烯化天然产物（PNPs）中的应用 | 系统总结了160多种已报道的植物UbiA型PTs和代表性异戊二烯二磷酸合成酶（IDSs），并探讨了它们的分类、功能、催化机制及酶工程策略 | 植物PTs的功能多样性仍未得到充分理解 | 推进PTs的表征和应用，为基于PNPs的药物开发奠定基础 | 植物异戊二烯基转移酶（PTs）和异戊二烯化天然产物（PNPs） | 合成生物学 | NA | 基因组学和合成生物学 | NA | NA | 超过160种植物UbiA型PTs和代表性IDSs |
| 4 | 2025-08-07 |
Therapeutic engineering of the gut microbiome using synthetic biology and metabolic tools: a comprehensive review with E. coli Nissle 1917 as a model case study
2025-Aug-06, Archives of microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00203-025-04417-w
PMID:40767874
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综述 | 本文综述了利用合成生物学和代谢工具对肠道微生物组进行工程化改造的进展，特别以大肠杆菌Nissle 1917为例进行研究 | 探讨了基因可调控肠道细菌在靶向治疗中的应用，特别是在过去五年中的进展，以及如何通过工程化改造微生物来生产特定代谢产物 | 传统方法如粪便微生物移植(FMT)和益生菌给药在疗效和安全性方面存在局限性 | 开发基于微生物组的干预措施，用于治疗肠道相关疾病 | 肠道微生物组，特别是大肠杆菌Nissle 1917 | 合成生物学 | 炎症性肠病、代谢功能障碍、结直肠癌、苯丙酮尿症(PKU) | 生物催化、代谢工程、酶工程 | NA | NA | NA |
| 5 | 2025-08-07 |
Molecular circuits for genomic recording of cellular events
2025-Aug, Trends in genetics : TIG
IF:13.6Q1
DOI:10.1016/j.tig.2025.04.004
PMID:40335327
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综述 | 本文综述了基因组记录领域的最新进展，特别是CRISPR技术在细胞事件记录中的应用 | 探讨了构建多样化传感器的新策略，并探索新兴合成生物学工具如何帮助构建用于记录多样化细胞事件的分子电路 | 直接记录和重建过去细胞事件的方法仍然有限，其在揭示细胞命运决定新见解方面的潜力尚未实现 | 开发新的传感模块和遗传电路架构，将过去的细胞状态忠实编码到基因组DNA记录中 | 细胞事件和细胞状态 | 合成生物学 | NA | CRISPR-based genome editing | NA | 基因组数据 | NA |
| 6 | 2025-08-07 |
Iterative recombinase technologies for efficient and precise genome engineering across kilobase to megabase scales
2025-Aug-01, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2025.07.011
PMID:40763736
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研究论文 | 介绍两种可编程染色体编辑系统PCE和RePCE，实现植物和人类细胞中无疤痕的千碱基到兆碱基DNA操作 | 开发了Lox位点的高通量工程和AI辅助重组酶工程方法(AiCE)，显著提高了重组效率和编辑精度 | 未提及在更复杂生物体中的应用效果 | 扩大基因组编辑在分子育种、治疗开发和合成生物学中的应用范围 | 植物和人类细胞 | 合成生物学 | NA | AI辅助重组酶工程(AiCE)、Re-pegRNA介导的无疤痕策略 | NA | DNA序列数据 | 未明确提及具体样本数量，但包括水稻和人类细胞 |
| 7 | 2025-08-07 |
A framework for complex signal processing via synthetic biological operational amplifiers
2025-Jul-31, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-62464-9
PMID:40745425
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研究论文 | 本研究提出了一种通过合成生物操作放大器处理复杂生物信号的框架 | 整合正交操作放大器到标准化生物过程中，实现高效信号分解和放大，并通过工程σ/anti-σ对、改变RBS强度以及使用开环和闭环配置设计可扩展的操作放大器 | NA | 提高遗传电路的精确性、适应性和信噪比，实现复杂生物网络中的信号处理 | 合成生物操作放大器、遗传电路、全细胞生物传感器 | 合成生物学 | NA | σ/anti-σ对工程、RBS强度调整、开环和闭环配置 | NA | 生物信号 | NA |
| 8 | 2025-08-07 |
Codon usage and antibiotic resistance: A hidden evolutionary mechanism
2025-Jul-31, Biochimie
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.biochi.2025.07.027
PMID:40752602
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综述 | 本文探讨了密码子使用与抗生素耐药性之间的隐藏进化机制 | 揭示了密码子优化在增强病原体耐药性决定因素合成中的关键作用，并提出了新的诊断生物标志物和治疗策略的潜在途径 | 未具体提及研究的局限性 | 解析密码子使用与抗生素耐药性之间的复杂相互作用，为减轻多重耐药病原体的影响提供信息 | 病原体如鲍曼不动杆菌、淋病奈瑟菌和肺炎克雷伯菌 | 生物信息学 | 抗生素耐药性 | 比较基因组分析、生物信息学和机器学习方法 | NA | 基因组数据 | NA |
| 9 | 2025-08-07 |
Engineering a Self-Assembled Protein Cage for Targeted Dual Functionalization
2024-07-31, Nano letters
IF:9.6Q1
DOI:10.1021/acs.nanolett.4c01693
PMID:39017718
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research paper | 该研究设计了一种自组装蛋白笼Mi3，能够独立招募两种不同的目标蛋白，用于合成生物学和医学应用 | 利用SpyCatcher/SpyTag和DogCatcher/DogTag化学方法，实现了单个蛋白笼上两种不同目标蛋白的特异性附着，减少了组装间的变异性 | NA | 开发一种多功能蛋白笼平台，用于生物和生物医学应用 | 自组装蛋白笼Mi3及其与目标蛋白的相互作用 | 合成生物学 | NA | SpyCatcher/SpyTag和DogCatcher/DogTag化学方法 | NA | NA | NA |
| 10 | 2025-08-07 |
Unpaired cysteine insertions favor transmembrane dimerization and induce ligand-independent constitutive cytokine receptor signaling
2024-07-26, Biological chemistry
IF:2.9Q3
DOI:10.1515/hsz-2023-0344
PMID:38695485
|
research paper | 研究通过插入突变的PPCL序列到细胞因子受体跨膜区，实现配体非依赖性的受体二聚化和组成性激活 | 发现PPCL插入突变可普遍适用于多种细胞因子受体，实现配体非依赖性的组成性激活 | 研究仅在Ba/F3前B细胞系中进行验证，未在更广泛的细胞类型或体内模型中测试 | 探索细胞因子受体跨膜区突变导致配体非依赖性激活的机制及其应用潜力 | IL-7Rα及其跨膜区PPCL插入突变体，以及IL-6、IL-12和干扰素家族的细胞因子受体 | 分子生物学 | 急性淋巴细胞白血病 | 细胞信号转导分析、STAT5和ERK磷酸化检测 | NA | 实验数据 | 使用Ba/F3前B细胞系进行实验 |
| 11 | 2025-08-06 |
Engineering DNA nanopores: from structural evolution to sensing and transport
2025-Oct, Materials today. Bio
DOI:10.1016/j.mtbio.2025.102137
PMID:40761509
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review | 本文回顾了DNA纳米孔的结构演变，并探讨了其在分子传感和跨膜运输中的应用潜力 | 整合了DNA纳米孔的结构演变与关键局限性分析，同时突出了单分子传感和受控跨膜运输的突破 | 稳定性、可扩展性和噪声等问题 | 探讨DNA纳米孔在合成生物学和纳米医学中的优化策略 | DNA纳米孔 | DNA纳米技术 | NA | DNA origami | NA | NA | NA |
| 12 | 2025-08-06 |
Cancer stem cells: landscape, challenges and emerging therapeutic innovations
2025-Aug-05, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-025-02360-2
PMID:40759634
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综述 | 本文综述了癌症干细胞（CSCs）的特性、挑战及新兴治疗策略 | 总结了单细胞测序、空间转录组学和多组学整合等最新技术在CSC研究中的应用，并探讨了双代谢抑制、合成生物学干预和免疫疗法等新兴策略 | 缺乏普遍可靠的CSC生物标志物，且难以在不影响正常干细胞的情况下靶向CSC | 探讨癌症干细胞的生物学特性及其在肿瘤治疗中的挑战和创新策略 | 癌症干细胞（CSCs） | 肿瘤生物学 | 癌症 | 单细胞测序、空间转录组学、多组学整合、3D类器官模型、CRISPR功能筛选、AI驱动的多组学分析 | NA | NA | NA |
| 13 | 2025-08-06 |
Bioluminescence-Driven Optimization of Geminivirus-Based Vectors as Tools for Plant Biotechnology
2025-Aug-04, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00164
PMID:40758859
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研究论文 | 本研究通过生物发光技术优化基于双生病毒的载体，用于植物生物技术中的合成生物学应用 | 利用自生物发光作为敏感、实时的报告系统来表征基因表达，优化了三种双生病毒载体的性能 | 研究中BCTV载体表现出较差的表达水平和控制能力 | 优化基于双生病毒的载体，以增强其在植物合成生物学中的应用 | 基于豆黄花叶病毒(BeYDV)、番茄黄曲叶病毒(TYLCV)和甜菜曲顶病毒(BCTV)的合成复制子 | 植物生物技术 | NA | 生物发光技术 | NA | NA | NA |
| 14 | 2025-08-06 |
Pathway engineering for the biosynthesis of psychedelics
2025-Aug, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2025.103314
PMID:40381450
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研究论文 | 本文综述了迷幻药物生物合成的最新进展，重点关注了在真核和原核生产宿主中合成吲哚胺、麦角胺和苯乙胺类化合物的生物合成成就 | 总结了迷幻药物生物合成的最新进展，并整理了一系列在异源表达中具有活性的相关生物合成酶 | NA | 开发迷幻药物的替代生产途径 | 迷幻药物（如psilocybin、DMT、5-MeO-DMT、bufotenine、lysergic acid和mescaline） | 合成生物学 | NA | 生物合成 | NA | NA | NA |
| 15 | 2025-08-06 |
Microbial food waste valorization: advances, challenges, and perspectives
2025-Aug, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2025.103323
PMID:40554099
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综述 | 本文综述了微生物发酵作为食物垃圾可持续解决方案的进展、挑战和前景 | 强调了合成生物学和代谢工程在提高微生物效率、优化底物利用和扩大工业应用方面的作用 | 讨论了底物异质性、可扩展性和经济可行性等关键挑战 | 探讨微生物发酵在食物垃圾资源化利用中的潜力 | 食物垃圾及其微生物转化 | 生物技术 | NA | 微生物发酵、合成生物学、代谢工程 | NA | NA | NA |
| 16 | 2025-08-06 |
Biotechnological advances in algae-based foods: applications in nutrition and microbiome health
2025-Aug, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2025.103335
PMID:40628054
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review | 本文综述了藻类在食品生物技术中的进展，特别是在营养和微生物组健康方面的应用 | 探讨了藻类作为可持续、营养丰富的资源在功能性食品开发中的潜力，以及合成生物学和发酵技术在藻类营养增强和新应用中的作用 | 未提及具体藻类种类或应用中的具体技术限制 | 研究藻类在食品生物技术中的应用，特别是在营养和微生物组健康方面的潜力 | 藻类及其衍生物 | 食品生物技术 | NA | 合成生物学、发酵技术、酶解 | NA | NA | NA |
| 17 | 2025-08-06 |
Ingestible optoelectronic capsules enable bidirectional communication with engineered microbes for controllable therapeutic interventions
2025-Aug, Nature microbiology
IF:20.5Q1
DOI:10.1038/s41564-025-02057-w
PMID:40721535
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研究论文 | 本文提出了一种结合工程微生物、可摄入光电胶囊和无线智能手机的双向通信系统，用于可控的治疗干预 | 通过结合工程微生物和光电技术，实现了体内微生物的实时监测和远程控制 | 研究仅在猪模型中进行验证，尚未进行人体试验 | 开发一种用于疾病诊断和治疗的可控生物电子系统 | 工程化大肠杆菌Nissle 1917和猪模型 | 合成生物学与光电技术 | 结肠炎 | 光遗传学工程、无线通信技术 | NA | 生物发光信号、无线电信号 | 猪模型 |
| 18 | 2025-08-06 |
Cholesterol modulates membrane elasticity via unified biophysical laws
2025-Jul-31, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-62106-0
PMID:40745155
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research paper | 该研究揭示了胆固醇和脂质不饱和度如何通过统一的生物物理规律调节膜弹性 | 研究发现脂质膜在介观尺度上表现出统一的弹性行为，不受胆固醇含量、脂质不饱和度或温度的影响 | 研究主要基于核自旋技术和计算分析，可能需要在更多实验条件下验证 | 探究胆固醇和脂质不饱和度对膜弹性的影响机制 | 脂质膜的弹性行为 | 生物物理学 | NA | 核自旋技术、计算分析 | NA | 实验数据 | NA |
| 19 | 2025-08-06 |
When good guides go bad: empirical evaluation of all unique Cas9 protospacers in E. coli reveal widespread functionality and rules for gRNA design
2025-Jul-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.23.651106
PMID:40475487
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研究论文 | 本文通过评估大肠杆菌K12 MG1655基因组中近50万种独特gRNA的活性，揭示了Cas9核酸酶在合成生物学中的广泛应用及其gRNA设计的规则 | 研究发现绝大多数（至少93%）独特gRNA具有功能，仅0.3%无功能，并提出了排除或修复这些无功能gRNA的简单设计规则 | 研究仅限于大肠杆菌K12 MG1655基因组，未在其他细菌或更广泛的生物系统中验证 | 评估Cas9核酸酶在合成生物学中的特异性及gRNA设计的有效性 | 大肠杆菌K12 MG1655基因组中的近50万种独特gRNA | 合成生物学 | NA | Cas9核酸酶技术 | NA | 基因组数据 | 近50万种独特gRNA |
| 20 | 2025-08-06 |
Purification of post-transcriptionally modified tRNAs for enhanced cell-free translation systems
2025-Jun-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.10.658963
PMID:40661628
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研究论文 | 本文开发了一种纯化方法，用于生产具有天然转录后修饰的tRNA，以提高无细胞翻译系统的效率和保真度 | 开发了一种结合tRNA过表达和DNA杂交纯化的新方法，能够高产高纯度地生产具有天然转录后修饰的tRNA | NA | 解决传统转录方法生产的tRNA缺乏关键转录后修饰的问题，提高翻译产量和保真度 | tRNA及其转录后修饰 | RNA生物化学 | NA | DNA杂交纯化 | NA | NA | NA |