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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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1 | 2025-06-07 |
A review on the expanding biotechnological frontier of Pedobacter
2025-Sep, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108588
PMID:40294724
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review | 本文综述了Pedobacter属细菌的生物技术应用及其潜在的自然产物 | 强调了通过合成生物学方法解锁Pedobacter属细菌隐藏潜力的前景 | 目前仅对少数Pedobacter物种及其自然产物进行了表征 | 探讨Pedobacter属细菌的生物技术应用及其潜在的自然产物 | Pedobacter属细菌及其衍生的自然产物 | 生物技术 | NA | 合成生物学、基因组分析 | NA | 基因组数据 | NA |
2 | 2025-06-07 |
Myxobacteria: Versatile cell factories of novel commercial enzymes for bio-manufacturing
2025-Sep, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108594
PMID:40345460
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review | 本文综述了粘细菌作为新型商业酶多功能细胞工厂在生物制造中的应用及其潜力 | 强调粘细菌作为未充分开发的工业资源,在生物技术和生物制造中的新兴应用 | 粘细菌在基因工程、生长速度慢以及代谢重塑和表达策略方面的限制 | 探索粘细菌及其酶在农业和工业中的潜在应用 | 粘细菌及其产生的酶 | 生物技术 | NA | 生物勘探和计算方法 | NA | NA | NA |
3 | 2025-06-07 |
Protease engineering: Approaches, tools, and emerging trends
2025-Sep, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108602
PMID:40368116
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综述 | 本文综述了蛋白酶工程的方法、工具和新兴趋势,重点介绍了定向进化和高通量策略在工程化蛋白酶底物特异性中的应用 | 讨论了新兴的蛋白酶工程策略,如抗体-蛋白酶融合实现邻近催化,以及通过外源蛋白-蛋白相互作用驱动的蛋白酶底物特异性转换 | NA | 探讨蛋白酶工程的最新进展,重点介绍能够精确控制蛋白酶活性和特异性的方法和策略 | 蛋白酶 | 合成生物学 | NA | 定向进化、高通量筛选 | NA | NA | NA |
4 | 2025-06-07 |
Exploring oxidosqualene cyclases and cytochrome P450s from Aralia elata for the synthesis of diverse pentacyclic triterpene sapogenins in Nicotiana benthamiana
2025-Sep, Plant physiology and biochemistry : PPB
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.plaphy.2025.110047
PMID:40435688
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研究论文 | 本研究从辽东楤木中挖掘并功能表征了氧化角鲨烯环化酶(OSCs)和细胞色素P450(CYPs),用于在烟草中合成多样的五环三萜皂苷元(PTSs) | 通过组合生物合成策略,成功合成了19种不同的PTSs,其中14种是首次在辽东楤木中发现 | 辽东楤木中PTSs的积累有限且生物合成复杂,限制了其大规模生产 | 探索辽东楤木中OSCs和CYPs的功能,以合成多样化的PTSs | 辽东楤木中的OSCs和CYPs | 合成生物学 | NA | 代谢组学和转录组学分析,农杆菌介导的异源表达 | NA | NA | NA |
5 | 2025-06-07 |
Synergistic potential of halophytes and halophilic/halotolerant plant growth-promoting bacteria in saline soil remediation: Adaptive mechanisms, challenges, and sustainable solutions
2025-Sep, Microbiological research
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.micres.2025.128227
PMID:40440870
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综述 | 本文综述了盐生植物和嗜盐/耐盐植物生长促进细菌在盐渍土壤修复中的协同潜力及其适应机制、挑战和可持续解决方案 | 探讨了盐生植物与嗜盐/耐盐植物生长促进细菌的协同相互作用及其在盐渍土壤修复中的创新应用 | 对盐生植物与嗜盐/耐盐植物生长促进细菌的协同相互作用及特定盐适应策略的理解仍有限 | 研究盐胁迫耐受机制及其在可持续农业中的应用 | 盐生植物和嗜盐/耐盐植物生长促进细菌 | 可持续农业 | NA | 多组学方法、基因工程、机器学习辅助生物信息学、化学计量学和合成生物学 | NA | NA | NA |
6 | 2025-06-07 |
Synthetic Phosphorylation Networks with Fluorescence and Luminescence Expansion
2025-Jun-06, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00814
PMID:40476587
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research paper | 介绍了一种名为SPN-FLUX的全翻译后平台,该平台整合了合成磷酸化网络与分裂荧光或发光蛋白,用于快速可调地报告细胞过程 | SPN-FLUX是一种不依赖转录介导的报告过程,能够在1小时内响应细胞外刺激,为合成生物学和生物传感提供了新的工具 | NA | 开发一种快速、实时动态的细胞信号事件报告平台 | 哺乳动物细胞 | 合成生物学 | NA | 合成磷酸化网络与分裂荧光或发光蛋白整合技术 | NA | 细胞信号数据 | NA |
7 | 2025-06-07 |
Standardized Quorum Sensing Tools for Gram-Negative Bacteria
2025-Jun-06, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00036
PMID:40476774
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研究论文 | 开发了一套标准化的群体感应(QS)工具,用于革兰氏阴性细菌之间的通信 | 使用SEVA质粒集合构建了三个QS系统,提高了质粒特征的互换性,并提供了数学模型和速率参数以支持设计工作 | 当前QS工具箱在模型物种以外的细菌中缺乏标准化实现 | 开发标准化的群体感应工具,以促进细菌间的通信和合成联盟的工程化 | 革兰氏阴性细菌 | 合成生物学 | NA | 群体感应(QS)系统 | 数学模型 | NA | NA |
8 | 2025-06-07 |
Transformative protein scaffold designs for dual-modality cancer applications: Advances in therapeutic delivery and molecular imaging of tumor microenvironments
2025-Jun-03, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.144881
PMID:40473172
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综述 | 本文全面分析了基于支架的递送系统在癌症免疫治疗中的创新应用,重点介绍了工程化蛋白质支架作为多功能平台的设计原则、合成方法和治疗应用 | 整合AI驱动的生成模型和强化学习算法革新支架设计,同时利用无细胞蛋白质合成系统和正交翻译机制实现复杂结构的按需生产 | 将这一有前景的平台转化为临床实践仍面临挑战 | 开发能够同时解决癌症免疫治疗中系统性毒性、肿瘤穿透不足和免疫抑制性肿瘤微环境疗效不足等问题的平台 | 工程化蛋白质支架 | 合成生物学 | 癌症 | AI驱动的生成模型、强化学习算法、无细胞蛋白质合成系统、正交翻译机制 | NA | NA | NA |
9 | 2025-06-07 |
Current AI technologies in cancer diagnostics and treatment
2025-Jun-02, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-025-02369-9
PMID:40457408
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综述 | 本文系统回顾了当前人工智能技术在癌症诊断和治疗中的应用现状 | 强调了深度学习在早期癌症检测中的日益重要作用,并探讨了AI在基因组学、生物标志物发现、液体活检和非侵入性诊断中的应用 | 讨论了数据隐私、可解释性和监管问题等重要挑战 | 评估人工智能在癌症诊疗领域的应用潜力 | 癌症诊断和治疗技术 | 数字病理学 | 癌症 | 深度学习 | NA | 多模态医学影像(CT、MRI、PET、超声)和数字病理数据 | NA |
10 | 2025-06-07 |
A systems view of cellular heterogeneity: Unlocking the "wheel of fate"
2025-Jun-02, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2025.101300
PMID:40472847
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review | 本文通过系统生物学的视角探讨细胞异质性的问题,并提出了一个从细胞角度概念化异质性的框架 | 提出了一个从细胞角度概念化异质性的框架,并应用该框架研究了人类多能干细胞培养和β细胞分化中的异质性 | 未提及具体的技术或数据限制 | 探讨细胞异质性的生物学意义及其在干细胞研究中的应用 | 人类多能干细胞(hPSC)培养和β细胞分化 | 系统生物学 | NA | 单细胞技术 | NA | NA | NA |
11 | 2025-06-07 |
CRISPR-Cas: a game-changer in vaccine development and the fight against viral infections
2025-Jun, Trends in microbiology
IF:14.0Q1
DOI:10.1016/j.tim.2025.02.006
PMID:40069074
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review | 本文综述了CRISPR-Cas系统在病毒-宿主相互作用研究、抗病毒治疗及疫苗开发中的最新进展 | 探讨了CRISPR-Cas系统在识别病毒关键受体和宿主因子以及作为抗病毒策略和疫苗开发工具的创新应用 | 未具体提及CRISPR-Cas技术在临床应用中的潜在限制或挑战 | 推进对病毒-宿主相互作用的理解并开发有效的抗病毒策略 | 病毒-宿主相互作用、抗病毒治疗及疫苗开发 | synthetic biology | viral infections | CRISPR-Cas | NA | NA | NA |
12 | 2025-06-07 |
SubtiToolKit: a bioengineering kit for Bacillus subtilis and Gram-positive bacteria
2025-Jun, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.02.004
PMID:40074634
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research paper | 介绍SubtiToolKit(STK),一种针对枯草芽孢杆菌和革兰氏阳性菌的高效克隆工具包 | 填补了革兰氏阳性菌在合成生物学工具包领域的空白,提供模块化标准DNA部件库,支持转录单元、操纵子及基因敲入/敲除应用 | 未提及具体实验验证数据或与其他工具包的性能对比 | 开发适用于革兰氏阳性菌的标准化DNA构建工具,推动合成生物学研究 | 枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)及其他革兰氏阳性菌(如Geobacillus和Parageobacillus工业菌株) | 合成生物学 | NA | Golden Gate(GG)克隆方法 | NA | DNA序列 | 未明确说明具体菌株数量,但包含多类标准化DNA部件(启动子、RBS、荧光蛋白等) |
13 | 2025-06-07 |
From academia to real-life biotech: 'It takes a village'
2025-Jun, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.02.014
PMID:40089442
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research paper | 本文描述了一个分析合成生物学在学术界与产业界交界处应用的研讨会 | 探讨了如何将学术研究成功转化为生物技术企业,并讨论了支持这一转化的基础设施 | NA | 分析学术研究向生物技术企业转化的过程及所需支持 | 合成生物学在学术界与产业界的交界处 | 生物技术 | NA | NA | NA | NA | NA |
14 | 2025-06-07 |
When good guides go bad: empirical evaluation of all unique cas9 targets in E. coli reveal widespread functionality and rules for gRNA biological design
2025-May-31, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.23.651106
PMID:40475487
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研究论文 | 本文评估了近50万个独特gRNA在E. coli K12 MG1655基因组中的活性,揭示了大多数gRNA具有功能,并提出了细菌gRNA设计的简单规则 | 研究发现绝大多数独特gRNA具有功能(至少93%),而仅有0.3%无功能,并提出了基于间隔区自相互作用的gRNA设计规则 | 研究仅针对E. coli K12 MG1655基因组,未涵盖其他细菌或更复杂的生物系统 | 评估Cas9 nuclease在E. coli中的gRNA活性,解决关于gRNA特异性的争议 | E. coli K12 MG1655基因组中的近50万个独特gRNA | 合成生物学 | NA | Cas9 nuclease和gRNA设计 | NA | 基因组数据 | 近50万个独特gRNA |
15 | 2025-06-07 |
Iterative deep learning design of human enhancers exploits condensed sequence grammar to achieve cell-type specificity
2025-May-30, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2025.101302
PMID:40472848
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research paper | 该研究应用迭代深度学习设计具有人类细胞系特异性活性的合成增强子 | 通过迭代深度学习优化模型,设计出在两种人类细胞系中具有强差异活性的合成增强子,并展示了短至50 bp的增强子仍能保持特异性 | 研究仅针对两种人类细胞系进行验证,未扩展到更多细胞类型或体内环境 | 解决合成生物学中如何实现细胞类型特异性基因表达的问题 | 人类细胞系中的合成增强子 | synthetic biology | NA | iterative deep learning | deep learning | enhancer activity and chromatin accessibility data | two human cell lines |
16 | 2025-06-07 |
Highly flexible cell membranes are the key to efficient production of lipophilic compounds
2024-08, Journal of lipid research
IF:5.0Q1
DOI:10.1016/j.jlr.2024.100597
PMID:39029799
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综述 | 本文综述了利用膜工程技术构建高柔性细胞膜以高效生产脂溶性化合物的策略 | 总结了两种主要的细胞膜修饰方法:构建脂溶性化合物的人工储存区室和改造细胞膜结构以促进产物外流 | 未提及具体实验数据或案例研究 | 实现脂溶性化合物的高效生产 | 微生物细胞工厂 | 合成生物学 | NA | 膜工程技术 | NA | NA | NA |
17 | 2025-06-07 |
Accelerating Diverse Cell-Based Therapies Through Scalable Design
2024-Jul, Annual review of chemical and biomolecular engineering
IF:7.6Q1
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综述 | 本文综述了通过基因工程改造原代细胞和干细胞以加速多样化细胞治疗的进展 | 整合合成生物学工具和先进基因组编写技术,提出加速创新细胞治疗转化的愿景 | 未提及具体临床试验数据或治疗效果验证 | 探讨规模化设计加速多样化细胞治疗的潜力 | 原代细胞和干细胞 | 合成生物学 | NA | 转基因方法、基因组编写技术 | NA | NA | NA |
18 | 2025-06-07 |
Advancing pathogen detection for airborne diseases
2023-Jul, Fundamental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.fmre.2022.10.011
PMID:40477737
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review | 本文综述了当前用于检测空气传播病原体的先进方法,并讨论了关键挑战 | 强调了受益于微加工、纳米技术和合成生物学多学科进展的下一代技术趋势 | NA | 开发新型生物测定方法,用于早期诊断和大规模筛查 | 空气传播病原体,如SARS、禽流感和COVID-19 | 生物技术 | COVID-19, SARS, 禽流感 | 微加工、纳米技术、合成生物学 | NA | NA | NA |
19 | 2025-06-06 |
Rewiring heme biosynthesis for improved pollutant degradation by Shewanella oneidensis
2025-Aug-15, Environmental research
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.envres.2025.121777
PMID:40324620
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research paper | 该研究通过合成生物学方法改造Shewanella oneidensis的血红素合成途径,提高了其胞外电子传递效率,从而增强了有机污染物的降解能力 | 采用模块化合成生物学方法设计了四个功能模块,重新定向代谢途径以提高血红素合成和组装,显著提升了胞外电子传递效率和污染物降解能力 | NA | 提高Shewanella oneidensis的胞外电子传递效率以增强其在生物电化学系统中的应用 | Shewanella oneidensis | 合成生物学 | NA | 模块化合成生物学方法 | NA | NA | NA |
20 | 2025-06-06 |
Magnetically driven lipid vesicles for directed motion and light-triggered cargo release
2025-Jun-05, Nanoscale
IF:5.8Q1
DOI:10.1039/d5nr00942a
PMID:40396421
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研究论文 | 本研究探讨了磁性驱动的脂质囊泡在定向运动和光触发货物释放中的应用 | 开发了一种结合磁性驱动和光诱导不对称氧化的脂质囊泡系统,实现了定向运动和按需释放 | 研究仍处于概念验证阶段,尚未进行体内实验验证 | 开发具有导航控制和按需释放能力的脂质基药物递送载体 | 磁性颗粒包裹的巨型单层囊泡(magGUVs) | 合成生物学 | NA | 微流控技术、光诱导不对称氧化 | 晶格玻尔兹曼模拟框架 | 实验测量数据 | NA |