合成生物学相关文章
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当前共找到 3729 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2025-10-04 |
AI-directed gene fusing prolongs the evolutionary half-life of synthetic gene circuits
2025-Oct-03, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adx0796
PMID:41032600
|
研究论文 | 提出一种名为STABLES的基因融合策略，通过机器学习优化基因对选择和连接设计，显著提高合成基因电路的进化稳定性 | 开发了结合机器学习预测的基因融合策略，通过将目的基因与必需内源基因连接并在中间插入“渗漏”终止密码子，同时实现选择压力和高表达 | NA | 解决合成生物学中基因电路进化不稳定的问题，延长异源基因表达的持续时间 | 荧光蛋白和人类胰岛素原等异源基因 | 合成生物学 | NA | 基因融合、机器学习、生物信息学分析 | 机器学习框架 | 生物信息学和生物物理特征数据 | NA |
| 2 | 2025-10-04 |
Harnessing transposable elements for plant functional genomics and genome engineering
2025-Oct, Trends in plant science
IF:17.3Q1
DOI:10.1016/j.tplants.2025.03.007
PMID:40240259
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综述 | 本文全面综述了植物转座元件的功能机制及其在功能基因组学和基因组工程中的前沿应用 | 系统整合了转座元件的基础发现、作用机制与前沿生物技术应用，提出了未来在作物育种和合成生物学中的应用前景 | NA | 探讨转座元件在植物功能基因组学和基因组工程中的应用潜力 | 植物转座元件 | 功能基因组学 | NA | 基因组工程技术 | NA | 基因组数据 | NA |
| 3 | 2025-10-04 |
Gene expression and protein abundance: Just how associated are these molecular traits?
2025-Sep-30, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108720
PMID:41038299
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综述 | 本文系统回顾了基因表达与蛋白质丰度关联性的研究进展，重点关注不同实验场景下的相关性测量方法及影响因素 | 整合单细胞分析最新数据，系统分类不同实验环境下的关联性研究，并探讨蛋白质约束代谢模型与机器学习模型的结合应用 | 主要基于相关性分析方法，缺乏对因果关系的深入探讨 | 探讨基因表达与蛋白质丰度的关联性及其在生物技术中的应用潜力 | 基因表达与蛋白质丰度的关联性研究 | 生物信息学 | NA | 转录组学、蛋白质组学、单细胞分析、统计建模 | 统计模型、机制模型、机器学习、深度学习 | 组学数据 | NA |
| 4 | 2025-10-04 |
Metabolic engineering of microorganisms for tailor-made biopolymer production: A review
2025-Sep-30, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.147922
PMID:41038478
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综述 | 本文综述了通过微生物代谢工程生产定制生物聚合物的最新进展 | 系统比较天然与工程化微生物平台的优劣，强调代谢工程在开发下一代生物聚合物中的关键作用 | NA | 改善生物聚合物的产量、质量和功能，支持工业创新和全球可持续发展目标 | 微生物生产的生物聚合物（如细菌纤维素、透明质酸、聚羟基脂肪酸酯、聚-γ-谷氨酸） | 代谢工程 | NA | 基因修饰（基因过表达、基因敲除、CRISPR-Cas9）、系统生物学工具（蛋白质组学、基因组学、合成生物学） | NA | NA | NA |
| 5 | 2025-10-04 |
Synthetic Whole-Cell Bioelectronic Chemical Sensing with In Situ Genetic Computing
2025-Sep-25, Chem & bio engineering
DOI:10.1021/cbe.5c00015
PMID:41031321
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研究论文 | 本研究通过合成生物学方法构建了结合全细胞细菌生物传感器与电化学检测技术的模块化生物电子传感器 | 首次将全细胞生物传感器的多功能性与电化学检测灵敏度相结合，开发了具有遗传计算能力的模块化传感器设计 | NA | 开发可编程、模块化的生物电子化学传感平台 | 汞污染物检测、双输入逻辑计算、多通道电化学信号输出 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、电化学传感、遗传电路设计 | T7 RNAP信号放大器、布尔逻辑计算 | 电化学信号 | NA |
| 6 | 2025-10-04 |
Engineering Spatial Control of Bacterial Organelles
2025-Sep-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.09.22.677801
PMID:41040230
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研究论文 | 本研究开发了一种可编程调控细菌细胞器空间定位的双蛋白系统 | 首次实现对所有已知类型细菌细胞器的可编程空间组织控制 | NA | 探索细菌细胞器的空间组织机制并开发工程化控制方法 | 细菌细胞器（包括羧酶体、包裹蛋白、生物分子凝聚体和膜结合细胞器） | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程、异源表达 | NA | 实验数据 | 多种类型细菌细胞器 |
| 7 | 2025-10-04 |
Secure biosystems design in Saccharomyces cerevisiae establishes effective biocontainment strategies and mechanisms of escape
2025-Sep-17, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.00741-25
PMID:40801494
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研究论文 | 本研究在酿酒酵母中开发了高分辨率分析平台，评估杀灭开关系统的生物防护效果及逃逸机制 | 建立了首个在实验室和工业酵母菌株中系统评估杀灭开关逃逸机制的高分辨率分析平台，揭示了樟脑调控的RelE毒素系统的结构-功能关系 | 多拷贝整合杀灭开关系统虽能大幅减少逃逸但仍无法实现持续生物防护 | 建立有效的生物防护策略并解析其逃逸机制 | 酿酒酵母实验室菌株和工业菌株 | 合成生物学 | NA | CRISPR基因编辑、基因组重测序、遗传工程 | NA | 基因组测序数据、表型数据 | 实验室和工业酵母菌株的多组比较实验 |
| 8 | 2025-10-04 |
SpyRing-Mediated Cyclization of TEV Protease, Guided by AlphaFold, Improves Thermostability
2025-Aug-05, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.5c05386
PMID:40787351
|
研究论文 | 本研究通过SpyRing系统介导的环化策略，结合AlphaFold结构预测，成功提高了TEV蛋白酶的稳定性 | 利用AlphaFold结构预测指导SpyTag/SpyCatcher介导的蛋白质环化设计，克服了N端和C端距离较远的结构限制 | NA | 开发提高蛋白质热稳定性的环化策略 | 烟草蚀纹病毒蛋白酶(TEVp) | 蛋白质工程 | NA | SpyTag/SpyCatcher介导的异肽键形成，AlphaFold结构预测 | AlphaFold | 蛋白质结构数据 | NA |
| 9 | 2025-10-04 |
Unveiling the Frontiers of Synthetic Biology in Brazil: Pioneering the National Synthetic Biology Network
2025-Aug-05, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.5c03077
PMID:40787363
|
综述 | 本文探讨巴西合成生物学网络的发展现状及其在推动国家生物技术能力方面的作用 | 首次系统阐述巴西合成生物学网络的建立及其在利用国家生物多样性优势推动可持续发展中的独特作用 | 巴西的科学和监管环境在国际社会中认知度较低，且存在基础设施和关键材料供应等方面的限制 | 分析巴西合成生物学生态系统的发展现状和面临的挑战 | 巴西合成生物学网络及其研究群体 | 合成生物学 | NA | 合成生物学技术 | NA | NA | NA |
| 10 | 2025-10-04 |
Comparative transcriptome analyses of different orthosiphon aristatus tissues reveal differentially expressed genes associated with flavonoid biosynthesis
2025-01-07, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-85266-x
PMID:39775135
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研究论文 | 通过比较分析猫须草不同组织的转录组，揭示与黄酮类化合物生物合成相关的差异表达基因 | 首次对猫须草所有组织进行黄酮类化合物的比较转录组分析，发现根部黄酮含量最高并鉴定出212个与根部黄酮积累强相关的差异表达基因 | 未明确说明样本重复数量和统计分析细节 | 探究猫须草各组织中黄酮类化合物的生物合成机制 | 猫须草（Orthosiphon aristatus）的根、茎、叶等不同组织 | 植物分子生物学 | 肾脏疾病 | 高效液相色谱（HPLC）、转录组分析、实时定量PCR（qRT-PCR） | NA | 转录组数据、代谢物含量数据 | 涉及猫须草不同组织样本，鉴定出138,294个Unigenes和5,154个差异表达基因 |
| 11 | 2025-10-04 |
Sustainable production of microalgal nanoparticles through green synthesis towards cancer treatment
2025, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2025.1621876
PMID:41040414
|
综述 | 本文综述了微藻纳米颗粒的绿色合成方法及其在癌症治疗中的应用机制 | 提出了利用基因工程微藻和合成生物学技术增强微藻纳米颗粒可持续生产的创新方向 | NA | 探讨微藻纳米颗粒的绿色合成方法及其在癌症治疗中的应用前景 | 微藻纳米颗粒 | 生物纳米技术 | 癌症 | 绿色合成、合成生物学、基因工程 | NA | 文献资料 | NA |
| 12 | 2025-10-04 |
Immunomodulatory role of gut microbial metabolites: mechanistic insights and therapeutic frontiers
2025, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2025.1675065
PMID:41040871
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综述 | 本文系统阐述肠道微生物代谢物通过多种分子机制调节宿主免疫功能的机理及治疗前景 | 整合空间代谢组学、合成生物学和纳米医学技术，提出靶向微生物-免疫轴的新型治疗策略 | 实现个性化微生物组-免疫调控仍面临挑战，需多组学与AI预测模型的进一步整合 | 探讨肠道微生物代谢物的免疫调节机制及治疗应用前景 | 肠道微生物代谢物（短链脂肪酸、次级胆汁酸、色氨酸衍生物等）及其免疫调节功能 | 微生物免疫学 | 炎症性与自身免疫性疾病 | 空间代谢组学、合成生物学、纳米医学、多组学分析 | AI驱动预测模型 | NA | NA |
| 13 | 2025-10-04 |
Structural and functional insights into cellulosomes: masters of plant cell wall degradation
2025, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2025.1638551
PMID:41040872
|
综述 | 本文系统探讨了纤维素小体的结构和功能机制及其在植物细胞壁降解中的应用潜力 | 综合评述了纤维素小体模块化架构、动态组装机制的最新发现，以及合成生物学重新设计其在生物技术应用中的潜力 | NA | 深入理解纤维素小体的结构和功能机制，拓展其在工业植物生物质降解和增值中的应用 | 厌氧细菌和真菌中的纤维素小体系统 | 生物技术 | NA | 结构生物学、合成生物学 | NA | 文献资料 | NA |
| 14 | 2025-10-04 |
The role of Food Science and Foodomics in the implementation of One-Health
2025, Frontiers in nutrition
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fnut.2025.1662767
PMID:41041135
|
综述 | 探讨食品科学与食品组学在实现'同一健康'理念中的潜在应用 | 首次系统讨论食品科学与食品组学在推动'同一健康'发展中的多种可能性，并探索合成生物学在食品科学中的新兴潜力 | NA | 推动'同一健康'理念的发展，应对当前地球面临的挑战 | 食品科学、食品组学、合成生物学在健康领域的应用 | NA | NA | 食品组学、合成生物学 | NA | NA | NA |
| 15 | 2025-10-04 |
Digital switching in a biosensor circuit via programmable timing of gene availability
2014-Dec, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/nchembio.1680
PMID:25306443
|
研究论文 | 本研究通过编程控制基因可用性时间，利用位点特异性重组酶改善合成基因电路的性能 | 首次使用位点特异性重组酶通过可编程的基因可用性时间控制来纠正多基因电路的不良效应 | NA | 开发通过时间控制基因可用性来改善合成基因电路性能的新方法 | 内源性microRNA的比例传感器和细胞类型分类 | 合成生物学 | NA | 位点特异性重组酶技术 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 16 | 2025-10-03 |
KDBI-RP: Kinetic Data of RNA-Protein Interactions Database
2025-Nov-01, Journal of molecular biology
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.jmb.2025.169357
PMID:40716733
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研究论文 | 介绍专门针对RNA-蛋白质相互作用动力学的数据库KDBI-RP | 首个专注于RNA-蛋白质相互作用动力学的专用数据库，提供全面的动力学常数和注释信息 | 未提及具体的数据覆盖范围限制或数据质量限制 | 建立RNA-蛋白质相互作用动力学数据库以满足RNA中心动力学研究需求 | RNA-蛋白质相互作用及其动力学数据 | 生物信息学 | NA | 数据库构建与数据整合 | NA | 动力学数据、序列数据、结构数据 | 包含3657个结合速率常数条目、3761个解离速率常数条目和175,932个平衡解离常数条目 |
| 17 | 2025-10-03 |
How hard is it to encapsulate life? The general constraints on encapsulation
2025-Oct-02, Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences
DOI:10.1098/rstb.2024.0297
PMID:41035324
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研究论文 | 本文探讨生命系统封装面临的一般性约束条件，通过分析现有生物化学系统和通用自催化系统揭示封装挑战 | 首次系统量化分析生命封装的基本限制条件，揭示核糖体速率与细胞大小的关键关系 | 基于地球现有生物系统进行分析，可能不适用于所有可能的生命形式 | 研究生命系统封装过程中面临的一般性约束条件 | 地球现有生物化学系统、通用自催化系统、信息与功能分子分离系统 | 生命起源研究 | NA | 理论建模、数学分析 | 理论模型 | 理论参数 | NA |
| 18 | 2025-10-03 |
Before LUCA: unearthing the chemical roots of metabolism
2025-Oct-02, Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences
DOI:10.1098/rstb.2024.0292
PMID:41035332
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研究论文 | 探讨从地球化学到生物化学的转变过程，通过计算方法和系统化学研究原始生化系统的演化 | 提出将LUCA代谢反应规则映射到前生物反应的创新方法，建立非生物化学与早期生命之间的可能联系 | 连接原始地球化学与LUCA复杂代谢能力仍存在挑战 | 探索生命起源过程中代谢系统的化学根源和演化机制 | 原始生化系统、前生物反应、最后普遍共同祖先(LUCA) | 计算生物学 | NA | 生成模型、系统化学、计算建模 | 生成模型 | 化学反应数据、热力学数据 | NA |
| 19 | 2025-10-03 |
Towards origins of virtual artificial life: an overview
2025-Oct-02, Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences
DOI:10.1098/rstb.2024.0298
PMID:41035322
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综述 | 本文概述了人工生命领域特别是虚拟生命在定义、检测和起源机制方面的研究现状 | 提出了以工程化视角定义生命的框架，包括抽象需求、通用设计和具体实现机制 | 目前尚未展示出完全满足所有工程要求的虚拟人工生命系统 | 探讨人工生命的定义、检测方法和起源机制 | 人工生命系统，特别是虚拟生命形式 | 人工生命 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 20 | 2025-10-03 |
Origins of life: the possible and the actual
2025-Oct-02, Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences
DOI:10.1098/rstb.2024.0281
PMID:41035333
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综述 | 本文综述了生命起源研究的关键理论框架和实验方法，探讨生命形成的可能性与多样性 | 整合多学科视角探讨原始细胞系统的形成与演化，强调能量、物质和信息共同演化的研究框架 | NA | 探索生命起源的基本原理、限制条件和可能的替代生物化学途径 | 原始细胞系统、化学系统到信息承载可进化实体的转变过程 | 生命起源研究 | NA | 地球化学、统计物理学、系统生物学、合成生物学、信息理论等多学科方法 | NA | 理论框架和实验数据 | NA |