合成生物学相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价5元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 3143 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2025-05-21 |
Microbial secondary metabolites: advancements to accelerate discovery towards application
2025-Jun, Nature reviews. Microbiology
DOI:10.1038/s41579-024-01141-y
PMID:39824928
|
review | 本文综述了微生物次级代谢产物的研究进展及其在人类健康和农业等领域的应用潜力 | 探讨了基因组测序技术揭示的次级代谢产物生物合成能力的新领域，以及预测工具和分子生物学技术在发现新代谢物和理解生物合成酶学中的应用 | NA | 加速发现微生物次级代谢产物的新生物化学、功能和应用 | 微生物次级代谢产物及其生物合成基因簇（BGCs） | 生物技术 | NA | 基因组测序、生物合成基因簇预测工具、分子生物学和合成生物学工具 | NA | 基因组数据、代谢物数据 | NA |
| 2 | 2025-05-21 |
Integrated metabolome and transcriptome analyses revealed key cytochrome P450 genes involved in the biosynthesis of oleanane-type saponins in Hedera helix L
2025-Jun, Plant physiology and biochemistry : PPB
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.plaphy.2025.109818
PMID:40147328
|
研究论文 | 本研究通过整合代谢组和转录组分析，揭示了常春藤中参与齐墩果烷型皂苷生物合成的关键细胞色素P450基因 | 首次鉴定了常春藤中参与齐墩果烷型三萜骨架修饰的CYP450基因，并验证了其功能 | 研究仅聚焦于CYP450基因在齐墩果烷型三萜生物合成中的功能，未涉及其他代谢途径 | 解析常春藤中齐墩果烷型皂苷的生物合成途径 | 常春藤(Hedera helix L.)及其代谢产物 | 植物代谢工程 | NA | 转录组测序、代谢组分析、RT-qPCR、体外和体内功能验证 | NA | 基因表达数据、代谢物数据 | NA |
| 3 | 2025-05-21 |
Mapping the Edges of Mass Spectral Prediction: Evaluation of Machine Learning EIMS Prediction for Xeno Amino Acids
2025-May-20, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.5c00286
PMID:40329886
|
research paper | 评估NEIMS质谱预测算法在单取代α-氨基酸上的准确性 | 评估了NEIMS算法在训练数据之外的氨基酸上的预测准确性，并发现其不准确性无法通过物理化学差异或氨基酸的衍生化状态解释 | 预测光谱对于算法训练数据之外的氨基酸不准确 | 评估机器学习质谱预测算法的准确性，以支持未知生物分子的检测 | 单取代α-氨基酸 | machine learning | NA | mass spectrometry | NEIMS | spectral data | NA |
| 4 | 2025-05-21 |
Perturbation-response analysis of in silico metabolic dynamics revealed hard-coded responsiveness in the cofactors and network sparsity
2025-May-20, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.98800
PMID:40390360
|
研究论文 | 通过计算机模拟分析细菌代谢对外部扰动的响应，揭示了代谢网络中辅因子和网络稀疏性对动态响应的影响 | 发现三种不同的动力学模型在非线性状态下对扰动表现出一致的强烈响应，并识别出腺苷辅因子和网络结构是影响代谢系统响应性的关键因素 | 研究基于计算机模拟，可能需要实验验证 | 理解生化系统在扰动下的动态特性，为定量研究稳态理论提供基础 | 细菌中心碳代谢的动力学模型 | 系统生物学 | NA | 动力学建模和数值模拟 | 非线性动力学模型 | 计算机模拟数据 | 三种不同的动力学模型 |
| 5 | 2025-05-21 |
Nuclear Assembly in Giant Unilamellar Vesicles Encapsulating Xenopus Egg Extract
2025-May-20, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202412126
PMID:40390663
|
research paper | 该研究提出了一种在巨型单层脂质体（GUVs）中组装细胞核的方法，利用非洲爪蟾的卵提取物诱导核重构 | 通过改进的倒置乳液法提高GUV形成效率，并在GUVs中成功组装具有功能核输入特性的类核结构 | NA | 构建更接近真核细胞的人工细胞系统 | 巨型单层脂质体（GUVs）和非洲爪蟾卵提取物 | 合成生物学 | NA | 倒置乳液法，免疫染色 | NA | 显微图像 | NA |
| 6 | 2025-05-21 |
Targeted high-level production of chuangxinmycin and its halogenated derivatives with antitubercular activity
2025-May-19, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-025-02740-x
PMID:40390016
|
研究论文 | 本文通过合成生物学技术实现了创新霉素及其卤化衍生物的高效定向生产，并评估了其抗结核活性 | 首次通过生物合成而非化学合成获得创新霉素衍生物，并首次报道了卤化去甲创新霉素衍生物 | 研究仅针对实验室水平的生产优化，尚未进行临床前或临床试验 | 开发新型抗结核药物候选分子 | 创新霉素及其衍生物 | 合成生物学 | 结核病 | 异源表达、激活剂过表达、启动子优化、发酵培养基筛选、HR-MS、HR-MS/MS、NMR | NA | 化学分析数据、生物活性数据 | 多种创新霉素衍生物（包括6种纯化鉴定的卤化衍生物） |
| 7 | 2025-05-21 |
A generalizable approach for programming protease-responsive conformationally inhibited artificial transcriptional factors
2025-May-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-59828-6
PMID:40382329
|
research paper | 本文提出了一种蛋白酶响应性构象抑制系统（PRCIS），用于设计可编程的人工转录因子（ATF）以构建正交和可组合的转录调控工具 | 通过分子内连接将ATF的自由DNA结合域与受限二聚化区域相连，实现转录结合的构象失活，并在蛋白酶切割连接后恢复DNA结合功能 | NA | 开发一种通用的蛋白酶响应性构象抑制系统，用于合成生物学中的基因调控 | 人工转录因子（ATF）和蛋白酶 | 合成生物学 | NA | 蛋白酶响应性构象抑制系统（PRCIS） | NA | NA | NA |
| 8 | 2025-05-21 |
From molecular mechanisms to clinical translation: Silk fibroin-based biomaterials for next-generation wound healing
2025-May-15, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.144266
PMID:40381758
|
综述 | 本文系统总结了丝素蛋白及其复合材料在伤口愈合中的制备策略、功能修饰和多维应用机制 | 整合了丝素蛋白分子机制和材料设计的最新进展，并强调了其在精准医学中的潜力，如开发基因工程丝素蛋白用于定制免疫调节网络 | 当前丝素蛋白材料开发面临的挑战包括机械稳定性、降解可控性以及大规模生产的标准化 | 开发高效、多功能且可临床转化的丝素蛋白基材料用于伤口愈合 | 丝素蛋白及其复合材料 | 生物材料 | 伤口愈合 | 3D生物打印和合成生物学技术 | NA | NA | NA |
| 9 | 2025-05-21 |
Bioremediation of complex organic pollutants by engineered Vibrio natriegens
2025-May-07, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-08947-7
PMID:40335686
|
研究论文 | 本研究利用合成生物学技术改造Vibrio natriegens，使其能够在含盐废水和土壤中生物修复复杂的有机污染物 | 通过合成生物学方法改造Vibrio natriegens，使其能够降解多种有机污染物，包括单环和多环化合物 | 研究仅针对五种有机污染物进行了测试，未涉及其他可能的污染物 | 开发一种能够在含盐环境中生物修复复杂有机污染物的微生物 | 工业废水、石油污染和塑料污染 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、基因组工程 | NA | NA | 来自氯碱厂和石油精炼厂的工业废水样品 |
| 10 | 2025-05-21 |
Active learning of enhancers and silencers in the developing neural retina
2025-Jan-15, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2024.12.004
PMID:39778579
|
research paper | 该研究开发了一种主动学习方法，用于训练能够区分由光感受器转录因子CRX结合位点组成的增强子和沉默子的模型 | 采用主动学习策略，结合合成生物学和不确定性采样，生成多轮信息性训练数据，以训练能够区分功能相反的相同序列CRX位点的模型 | 模型主要针对CRX结合位点，可能不适用于其他转录因子的调控元件 | 开发能够区分增强子和沉默子的深度学习模型，以更好地理解转录因子在不同上下文中的激活或抑制功能 | 光感受器转录因子CRX的结合位点 | machine learning | NA | active learning, massively parallel reporter assays | deep learning | genomic sequences | 几乎所有基因组中结合的CRX位点 |
| 11 | 2025-05-21 |
Transforming non-conventional yeasts into key players in biotechnology: advances in synthetic biology applications
2025, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2025.1600187
PMID:40384783
|
review | 本文综述了非传统酵母在合成生物学应用中的最新进展，重点关注新的遗传构建块、基因组编辑工具和代谢途径工程的发展 | 利用合成生物学技术开发新的遗传构建块、基因组编辑工具和代谢途径工程，以充分挖掘非传统酵母的生物技术潜力 | 非传统酵母的潜力尚未被充分探索，存在技术挑战和应用限制 | 探讨非传统酵母在生物技术中的应用潜力及其在可持续生物制造中的角色 | 非传统酵母 | 合成生物学 | NA | 基因组编辑、代谢途径工程 | NA | NA | NA |
| 12 | 2025-05-21 |
New-to-nature CO2-dependent acetyl-CoA assimilation enabled by an engineered B12-dependent acyl-CoA mutase
2024-11-26, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-53762-9
PMID:39592584
|
研究论文 | 本研究开发了一种新型的Lcm模块，实现了乙酰辅酶A到丙酮酸的高效转化，并在过程中固定CO2而非释放 | 开发了一种新型的Lcm模块，首次实现了乙酰辅酶A到丙酮酸的直接转化，并在过程中固定CO2，而非释放 | 目前仅进行了体外验证，尚未在体内大规模应用中验证其效果 | 开发一种新型的乙酰辅酶A同化途径，以提高碳利用效率 | 乙酰辅酶A和丙酮酸的代谢途径 | 合成生物学 | NA | 定向超突变和适应性进化 | NA | NA | NA |
| 13 | 2025-05-21 |
The de novo design and synthesis of yeast chromosome XIII facilitates investigations on aging
2024-11-22, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54130-3
PMID:39578428
|
research paper | 该研究通过设计和合成酵母染色体XIII，探索了其在衰老研究中的应用 | 成功构建了884 Kb的合成酵母染色体XIII，并利用SCRaMbLE系统获得20个寿命延长的菌株，揭示了rRNA相关转录因子RRN9上调对寿命的积极影响 | 研究主要基于酵母模型，结果在高等生物中的适用性尚待验证 | 研究酵母衰老的分子机制 | 酿酒酵母（Saccharomyces cerevisiae） | 合成生物学 | NA | SCRaMbLE系统 | NA | 基因组数据、转录组数据 | 20个SCRaMbLEd synXIII菌株 |
| 14 | 2025-05-21 |
Digital switching in a biosensor circuit via programmable timing of gene availability
2014-Dec, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/nchembio.1680
PMID:25306443
|
研究论文 | 该研究展示了通过可编程的基因可用性时序控制，利用位点特异性重组酶纠正多基因电路中的不良效应，显著提高了比例传感器的性能 | 通过可编程的基因可用性时序控制，显著减少了比例传感器的基底泄漏，并提高了动态范围和特异性 | 研究未涉及长期稳定性和在更复杂生物系统中的验证 | 提高合成生物学中基因电路的稳健性和性能 | 内源性microRNA (miRNA)的比例传感器 | 合成生物学 | NA | 位点特异性重组酶技术 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 15 | 2025-05-20 |
Genetic Toggle Switch in Plants
2025-May-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00777
PMID:40387045
|
研究论文 | 本文探讨了在植物中开发可编程遗传电路的方法，特别是通过定量表征的植物遗传元件和计算机模型来构建遗传开关 | 首次在植物中开发了基于定量表征遗传元件和计算机模型的遗传开关，并通过稳定工程植物验证了其功能 | 研究主要关注遗传开关的设计和验证，未全面评估植物特有属性（如环境敏感性、发育可塑性）对遗传电路预测性的影响 | 开发可预测和可编程的植物遗传设备 | 植物遗传元件和遗传电路 | 合成生物学 | NA | 定量表征、计算机建模、遗传工程 | 遗传开关模型 | 遗传数据 | NA |
| 16 | 2025-05-20 |
Systems and synthetic biology for plant natural product pathway elucidation
2025-May-17, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.115715
PMID:40382775
|
综述 | 本文总结了系统和合成生物学在植物代谢途径表征和工程中的应用进展 | 讨论了多种策略，包括共表达分析、基因簇识别、代谢物分析、深度学习方法、全基因组关联研究和蛋白质复合物识别，并通过案例研究展示了这些方法在解析复杂途径和提高重要天然产物产量中的应用 | NA | 阐明植物天然产物的生物合成途径，以充分发挥其在治疗应用中的潜力 | 植物代谢途径和天然产物 | 合成生物学 | NA | 共表达分析、基因簇识别、代谢物分析、深度学习方法、全基因组关联研究、蛋白质复合物识别 | 深度学习 | NA | NA |
| 17 | 2025-05-20 |
Ultrasound-responsive mammalian cell synthetic biology
2025-May-16, IEEE transactions on ultrasonics, ferroelectrics, and frequency control
DOI:10.1109/TUFFC.2025.3570813
PMID:40378033
|
综述 | 本文综述了超声遗传学在合成生物学中的最新进展及其作为非侵入性精确控制细胞和分子过程工具的潜力 | 结合超声波与基因工程效应器，克服了组织穿透性和侵入性的限制，扩展了超声在生物系统中的应用 | 参数标准化和基础机制理解方面的挑战 | 探讨超声遗传学在研究和治疗应用中的潜力 | 哺乳动物细胞和分子过程 | 合成生物学 | NA | 超声波、基因工程、声学造影剂（如微泡和气体囊泡） | NA | NA | NA |
| 18 | 2025-05-20 |
Self-authenticating genomic materials in Escherichia coli via advanced genome signatures
2025-May-16, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-08171-z
PMID:40379889
|
研究论文 | 介绍了一种名为'基因组签名'的生物化学稳定且防篡改的DNA标记系统，用于创建自我认证的基因组 | 利用Golomb-ruler衍生的Genome-Comb技术，显著提高了错误纠正和数据编码能力，能够在活体大肠杆菌中记录450万核苷酸的基因组 | NA | 提高合成基因组材料的真实性和完整性，以促进科学知识的进步和生物安全性的增强 | 大肠杆菌的基因组 | 合成生物学 | NA | Genome Signature技术 | NA | DNA序列数据 | 450万核苷酸的基因组 |
| 19 | 2025-05-20 |
Combinatorial metabolic engineering of Yarrowia lipolytica for high-level production of the plant-derived diterpenoid sclareol
2025-May-16, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-025-02744-7
PMID:40380140
|
研究论文 | 通过组合代谢工程改造Yarrowia lipolytica，实现植物源二萜醇sclareol的高效生产 | 通过整合LPPS和SCS基因、优化蛋白融合与多拷贝基因整合、增强GGPP前体供应及调控甲羟戊酸途径，显著提高了sclareol产量 | 研究仅在摇瓶条件下进行，未涉及大规模发酵验证 | 开发可持续的sclareol微生物合成方法 | Yarrowia lipolytica酵母菌株 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、基因整合与过表达 | NA | NA | NA |
| 20 | 2025-05-20 |
Pathway engineering for the biosynthesis of psychedelics
2025-May-16, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2025.103314
PMID:40381450
|
研究论文 | 本文综述了迷幻药物生物合成途径工程的最新进展 | 总结了在真核和原核生产宿主中合成迷幻化合物的最新生物合成成就，并整理了一系列相关的生物合成酶 | NA | 开发迷幻化合物的替代生产途径 | 迷幻化合物（如色胺类、麦角类和苯乙胺类） | 合成生物学 | NA | 生物合成途径工程 | NA | NA | NA |