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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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1 | 2025-05-15 |
Metabolic engineering for microbial production of sugar acids
2025-May-13, BMC biotechnology
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12896-025-00973-7
PMID:40361067
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综述 | 本文综述了微生物生产糖酸的代谢工程方法及其应用 | 强调了代谢工程和合成生物学工具(如CRISPR-Cas和动态调控回路)在优化微生物菌株生产糖酸中的应用 | 未提及具体实验数据或生产效能的定量分析 | 探讨微生物生产糖酸的代谢工程策略及其工业应用 | C5和C6糖酸 | 生物技术 | NA | 代谢工程、CRISPR-Cas、动态调控回路 | NA | NA | NA |
2 | 2025-05-15 |
Extracellular Bacterial Production of DNA Hydrogels-Toward Engineered Living Materials
2025-May, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202502199
PMID:40143682
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研究论文 | 该研究通过合成生物学与人工材料的结合,首次实现了基于DNA水凝胶的工程化活材料(ELMs)的生产 | 首次利用外生电细菌Shewanella oneidensis生产DNA水凝胶,开发了可诱导细胞表面锚定技术,实现了活细菌背景下DNA水凝胶的原位生产 | 研究尚处于初步阶段,仅展示了在生物电化学系统表面生成稳定生物混合生物膜的能力 | 开发具有导电性和代谢活性的动态生物混合材料系统 | 外生电细菌Shewanella oneidensis和DNA水凝胶 | 合成生物学 | NA | SpyCatcher/SpyTag (SC/ST)技术 | NA | NA | NA |
3 | 2025-05-15 |
A pectin acetyl-transferase facilitates secondary plasmodesmata formation and RNA silencing movement between plant cells
2025-May, The Plant journal : for cell and molecular biology
DOI:10.1111/tpj.70194
PMID:40353833
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研究论文 | 本文研究了植物细胞间RNA沉默移动的机制,特别是通过果胶乙酰转移酶调控次级胞间连丝形成的过程 | 首次发现果胶乙酰转移酶突变会减少次级胞间连丝数量,从而影响小RNA和蛋白质的细胞间移动 | 研究主要局限于拟南芥叶片组织,根部细胞间移动机制可能不同 | 阐明植物细胞间小RNA移动的分子机制及其调控因素 | 拟南芥中的小RNA(miRNA和siRNA)和胞间连丝 | 植物分子生物学 | NA | 正向遗传筛选、原子力显微镜、抗体标记技术 | NA | 遗传数据、显微图像数据 | 拟南芥突变体 |
4 | 2025-05-15 |
Machine learning-led semi-automated medium optimization reveals salt as key for flaviolin production in Pseudomonas putida
2025-Apr-18, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-08039-2
PMID:40251395
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研究论文 | 本文介绍了一种基于机器学习的半自动化培养基优化方法,用于提高假单胞菌中黄酮醇的产量 | 提出了一种分子和宿主无关的主动学习过程,通过半自动化流程快速优化培养基,显著提高了黄酮醇的产量 | 高盐浓度接近假单胞菌的耐受极限,可能限制其广泛应用 | 优化培养基以提高合成生物学中化学品的产量 | 假单胞菌KT2440中的黄酮醇生产 | 合成生物学 | NA | 机器学习,主动学习 | NA | 实验数据 | 三个不同的黄酮醇生产实验 |
5 | 2025-05-15 |
Examining interactions of animal cells with chloroplasts and their light-induced responses in in vitro cell culture systems
2025-Apr-12, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2025.151622
PMID:40117974
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研究论文 | 本研究探讨了动物细胞与叶绿体在体外培养系统中的相互作用及其光诱导反应 | 揭示了三种不同的动物细胞与叶绿体相互作用模式,并强调了光诱导ROS生成在细胞毒性中的重要性 | 缺乏完善的体外实验系统来研究叶绿体与动物细胞的相互作用 | 研究叶绿体与动物细胞的相互作用及其光诱导反应 | 人宫颈癌HeLa细胞、小鼠巨噬细胞样J774.1细胞以及从Elysia marginata分离的细胞 | 合成生物学 | 宫颈癌 | 体外细胞培养 | NA | 细胞行为观察数据 | HeLa细胞、J774.1细胞和Elysia marginata细胞 |
6 | 2025-05-15 |
Phase Separation-Mediated Multienzyme Assembly In Vivo
2025-Apr-02, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.4c09585
PMID:40107849
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research paper | 研究通过相分离蛋白RGGRGG与ReverseTag/ReverseCatcher标记系统的整合,探索其在多酶复合物形成中的潜力 | 首次将相分离蛋白RGGRGG与ReverseTag/ReverseCatcher系统结合,用于多酶复合物的自组装,显著提高了番茄红素的产量 | 研究主要集中于番茄红素生物合成途径中的六种酶,未广泛验证其他酶系统的适用性 | 探索相分离介导的多酶组装在合成生物学中的应用 | 相分离蛋白RGGRGG、ReverseTag/ReverseCatcher标记系统及番茄红素生物合成途径中的六种酶 | synthetic biology | NA | coarse-grained simulations, enzyme immobilization | NA | simulation data, experimental data | 六种番茄红素生物合成途径中的酶 |
7 | 2025-05-15 |
Engineering scutellarin biosynthesis in Artemisia annua
2025-Mar-21, Plant cell reports
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s00299-025-03471-4
PMID:40116969
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研究论文 | 通过补充缺失的酶和优化黄酮6羟化酶,成功在青蒿中实现了异源合成灯盏花素 | 在野生型青蒿植物中鉴定出灯盏花素的两种关键前体,并通过共表达来自原宿主短葶飞蓬的三个关键基因,成功实现了灯盏花素的异源合成 | NA | 通过合成生物学手段在青蒿中生产稀缺药物 | 青蒿植物及其代谢产物 | 合成生物学 | 脑血管疾病和心血管疾病 | 基因工程和酶优化 | NA | NA | NA |
8 | 2025-05-15 |
A mediator-free sonogenetic switch for therapeutic protein expression in mammalian cells
2025-Mar-20, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf191
PMID:40114374
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研究论文 | 介绍了一种名为SUPER的新型基因开关,能够通过超声波无创、直接调控哺乳动物细胞中的蛋白质表达 | SUPER系统无需介质,利用哺乳动物ROS感应系统,通过低强度超声波激活KEAP1/NRF2通路,实现目标基因的受控表达 | 当前系统尚未在更复杂的组织或临床环境中验证其长期安全性和有效性 | 开发一种无创、时空精确的基因表达调控工具,用于细胞和基因治疗 | 哺乳动物细胞,包括人类间充质干细胞衍生系(hMSC-TERT) | 合成生物学 | 糖尿病 | 超声波刺激,ROS感应系统 | KEAP1/NRF2通路调控系统 | 细胞实验数据 | 1型糖尿病小鼠模型中的皮下植入工程细胞 |
9 | 2025-05-15 |
AI-driven high-throughput droplet screening of cell-free gene expression
2025-Mar-19, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-58139-0
PMID:40108186
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研究论文 | 介绍了一种名为DropAI的基于液滴和AI的高通量筛选策略,用于优化无细胞基因表达系统 | 结合微流控技术和机器学习模型,实现了对无细胞基因表达系统的高通量、低成本优化 | 未提及该方法在其他生物系统或更复杂蛋白质表达中的适用性 | 优化无细胞基因表达系统的组成,降低成本并提高产量 | 大肠杆菌和枯草芽孢杆菌的无细胞基因表达系统 | 合成生物学 | NA | 微流控技术、荧光颜色编码系统、机器学习 | 机器学习模型 | 荧光信号数据 | 12种不同蛋白质的验证 |
10 | 2025-05-15 |
Exploring the potential of plant astrobiology: adapting flora for extra-terrestrial habitats: a review
2025-Mar, Biologia futura
IF:1.8Q3
DOI:10.1007/s42977-024-00245-z
PMID:39302628
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综述 | 探讨植物天体生物学的潜力,即如何使地球植物适应外太空和其他天体的恶劣环境 | 将植物学与天体生物学相结合,研究植物在外太空环境中的适应机制及其在长期太空任务中的潜在应用 | 未提及具体实验数据或样本量,主要基于理论探讨和现有研究综述 | 探索植物在外太空环境中的适应性和潜在应用,以支持未来长期太空任务 | 地球植物及其在外太空环境中的适应机制 | 天体生物学 | NA | 基因修饰和合成生物学技术 | NA | NA | NA |
11 | 2025-05-15 |
Cell-based immunotherapies for solid tumors: advances, challenges, and future directions
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1551583
PMID:40356763
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review | 本文综述了基于细胞的免疫疗法在实体瘤治疗中的进展、挑战及未来方向 | 讨论了CAR-T、CAR-NK和TCR-T等细胞疗法在实体瘤治疗中的创新应用及面临的独特挑战 | 面临抗原异质性、免疫抑制性肿瘤微环境、细胞浸润受限、脱靶毒性及生产可扩展性等挑战 | 探讨基于细胞的免疫疗法在实体瘤治疗中的潜力与限制 | CAR-T、CAR-NK、TCR-T、TIL、NK和CIK细胞疗法 | 免疫疗法 | 实体瘤 | 基因编辑、多抗原靶向、合成生物学 | NA | NA | NA |
12 | 2025-05-15 |
A versatile genetic toolkit for engineering Wickerhamomyces ciferrii for tetraacetyl phytosphingosine production
2025, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2025.1586218
PMID:40357330
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research paper | 该研究开发了一个模块化遗传系统,用于工程化Wickerhamomyces ciferrii以提高四乙酰基植物鞘氨醇(TAPS)的产量 | 开发了一个包含多种可选择标记、复制起点和荧光报告基因的模块化遗传工具包,并首次在Wickerhamomyces ciferrii中实现了乙酰辅酶A羧化酶突变体的过表达,显著提高了TAPS产量 | 研究中测试的某些抗生素抗性标记(如潮霉素B)和复制起点(如panARS)在Wickerhamomyces ciferrii中无效 | 为Wickerhamomyces ciferrii开发一套全面的遗传工具包,以促进其工业应用 | Wickerhamomyces ciferrii酵母 | 合成生物学与代谢工程 | NA | 基因工程、荧光蛋白表达分析、启动子表征 | NA | 基因表达数据 | 测试了四种抗生素抗性标记、三种复制起点和六种荧光蛋白 |
13 | 2025-05-14 |
Remediation of wastewater by using CdS-based biohybrids: Challenges and enhancement strategies
2025-Jun, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2025.132379
PMID:40064454
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综述 | 本文综述了基于硫化镉的光催化剂-微生物生物杂化系统在废水修复中的应用、机制及优化策略 | 整合了全细胞生物催化剂和半导体纳米材料的优势,实现了重金属离子回收、修复效率提升及复合污染物同步去除 | 未提及具体实验数据或案例研究 | 探讨生物杂化系统在废水污染物同步去除中的应用潜力 | 含重金属和有机化合物的废水 | 环境工程 | NA | 光催化-微生物耦合技术 | NA | NA | NA |
14 | 2025-05-14 |
Be a GEM: Biocontained, environmentally applied, genetically engineered microbes
2025-Jun, Advanced drug delivery reviews
IF:15.2Q1
DOI:10.1016/j.addr.2025.115578
PMID:40222715
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perspective | 本文讨论了基因工程微生物(GEMs)的生物控制技术及其环境影响、监管问题和公众认知 | 探讨了GEMs在生物控制方面的技术进展及其潜在应用 | 未涉及具体实验数据或案例研究 | 探讨基因工程微生物的生物控制技术及其潜在应用 | 基因工程微生物(GEMs) | 合成生物学 | NA | 基因工程技术 | NA | NA | NA |
15 | 2025-05-14 |
Designing live bacterial therapeutics for cancer
2025-Jun, Advanced drug delivery reviews
IF:15.2Q1
DOI:10.1016/j.addr.2025.115579
PMID:40228606
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综述 | 本文全面探讨了利用活细菌作为癌症治疗策略的潜力及其设计方法 | 提出利用肿瘤微环境选择性定植的细菌作为新型抗癌治疗载体,并结合合成生物学技术进行编程改造 | 需要解决细菌疗法的安全性、精准给药控制以及与宿主免疫系统的相互作用等挑战 | 探索细菌在癌症治疗中的应用潜力与方法 | 肿瘤微环境中的细菌及其工程化改造 | 合成生物学 | 癌症 | 合成生物学技术 | NA | NA | NA |
16 | 2025-05-14 |
Integrated Approach for Improving Lutein Production of Chlorella sp. via Adaptive Evolution and Casein Acid Hydrolysate
2025-May-13, Applied biochemistry and biotechnology
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s12010-025-05279-0
PMID:40358910
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研究论文 | 本研究开发了一种结合适应性进化和代谢调控的综合方法,以提高微藻中叶黄素的产量 | 通过适应性进化和代谢调控相结合的方法,显著提高了微藻中叶黄素的产量,特别是在添加酪蛋白酸水解物(CAH)的条件下 | 研究未探讨CAH促进叶黄素生物合成的具体分子机制,且实验条件可能限制了结果的广泛适用性 | 提高微藻中叶黄素的产量 | Chlorella sp. 微藻 | 生物技术 | NA | 适应性进化、代谢调控 | NA | 实验数据 | 经过30轮适应性进化获得的P30菌株 |
17 | 2025-05-14 |
Self-Driven CuAAC Reaction Catalyzed by Photosensitive Biohybrids Energized by Lactate for Boosting Cancer Immunotherapy
2025-May-12, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202425018
PMID:39973575
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研究论文 | 本文构建了一种光辅助靶向电活性细菌装备的生物正交催化剂系统,用于增强癌症免疫治疗 | 通过细菌呼吸将肿瘤代谢与CuAAC反应联系起来,提供了一种不使用化学还原剂的高效CuAAC反应方法 | NA | 开发一种不依赖化学还原剂的高效CuAAC反应系统,用于癌症免疫治疗 | 光辅助靶向电活性细菌装备的生物正交催化剂系统 | 合成生物学 | 癌症 | CuAAC反应、光辅助催化 | NA | NA | NA |
18 | 2025-05-14 |
Direct and quantitative analysis of tRNA acylation using intact tRNA liquid chromatography-mass spectrometry
2025-May, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-024-01086-9
PMID:39762443
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研究论文 | 本文描述了一种使用完整tRNA液相色谱-质谱法直接定量分析tRNA酰化的方法 | 开发了一种直接检测aaRS活性的液相色谱-质谱分析方法,能够检测低至0.23%的反应产率,并能检测标准技术无法检测的flexizyme酰化tRNA产物 | 该方法需要分子生物学、液相色谱-质谱和无RNase技术的基本专业知识,且完成时间至少需要5小时 | 开发一种直接监测aaRS活性的分析方法 | tRNA的酰化反应 | 生物化学 | NA | 液相色谱-质谱(LC-MS)、离子对反相色谱、高分辨率飞行时间质谱 | NA | 质谱数据 | NA |
19 | 2025-05-14 |
Synthetic biology approaches to improve Rubisco carboxylation efficiency in C3 Plants: Direct and Indirect Strategies
2025-Apr, Journal of plant physiology
IF:4.0Q1
DOI:10.1016/j.jplph.2025.154470
PMID:40056853
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review | 本文综述了合成生物学在提高C3植物中Rubisco羧化效率方面的最新策略和技术 | 介绍了通过直接和间接策略优化Rubisco羧化效率的最新合成生物学和基因转化技术 | NA | 提高C3植物中Rubisco的羧化效率以改善光合作用性能 | C3植物中的Rubisco酶及其相关蛋白 | 合成生物学 | NA | 基因转化技术 | NA | NA | NA |
20 | 2025-05-14 |
Orthogonal Host-Guest Interactions Enable Programming of Protocell Membranes for Cellular High-Order Assembly and Enhanced Immunogenicity
2025-Mar-26, ACS applied materials & interfaces
IF:8.3Q1
DOI:10.1021/acsami.4c20476
PMID:40067075
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研究论文 | 本文提出了一种通过正交宿主-客体相互作用编程原生细胞膜的方法,用于细胞高阶组装和增强免疫原性 | 利用β-环糊精(β-CD)与金刚烷连接的分子之间的宿主-客体相互作用,实现了微胶囊膜的功能化编程,为合成生物学和生物工程提供了新的平台 | 未提及该方法在大规模生产中的可行性和成本效益 | 开发一种可编程的原生细胞膜构建方法,以模拟真实的细胞间相互作用 | 多糖基微胶囊(P-somes)和巨噬细胞 | 合成生物学 | NA | 宿主-客体相互作用 | NA | NA | 未明确提及样本数量 |