合成生物学相关文章
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当前共找到 3150 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2025-05-22 |
Transcriptomic functional characterization of recombinant adeno-associated virus producing cell line adapted to suspension-growth
2025-May-21, Biotechnology progress
IF:2.5Q3
DOI:10.1002/btpr.70042
PMID:40396307
|
研究论文 | 本文通过合成生物学方法生成适应悬浮生长的HEK293细胞系，用于重组腺相关病毒(rAAV)的可扩展生产 | 开发了能够在无血清悬浮培养基中生长的GX6Bs细胞系，并研究了其转录组变化对rAAV产量的影响 | 悬浮培养的GX6Bs细胞病毒滴度显著降低，即使恢复贴壁培养条件，产量也只能恢复到GX6B的25%-50% | 开发可扩展的rAAV生产技术 | 重组腺相关病毒(rAAV)生产细胞系 | 合成生物学 | NA | 转录组分析 | NA | 转录组数据 | GX6B和GX6Bs细胞系 |
| 2 | 2025-05-22 |
Magnetically driven lipid vesicles for directed motion and light-triggered cargo release
2025-May-21, Nanoscale
IF:5.8Q1
DOI:10.1039/d5nr00942a
PMID:40396421
|
研究论文 | 本研究探讨了磁性驱动的脂质体在定向运动和光触发货物释放中的应用 | 开发了一种结合磁性驱动和光诱导不对称氧化的脂质体药物递送系统，实现了定向运动和按需释放 | 研究仍处于概念验证阶段，尚未进行体内实验验证 | 开发具有导航控制和按需释放能力的脂质体药物递送载体 | 封装磁性颗粒的巨型单层囊泡（magGUVs） | 合成生物学与微流控 | NA | 晶格玻尔兹曼模拟框架、光诱导不对称氧化 | NA | 实验数据与模拟数据 | NA |
| 3 | 2025-05-22 |
Machine Learning Empowering Microbial Cell Factory: A Comprehensive Review
2025-May-21, Applied biochemistry and biotechnology
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s12010-025-05260-x
PMID:40397295
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综述 | 本文综述了机器学习与合成生物学在微生物细胞工厂升级中的协同作用及其在生物技术中的应用 | 探讨了机器学习与合成生物学结合在化学生产、人类健康和环境修复中的具体应用，为未来研究提供了指导 | NA | 研究机器学习与合成生物学在生物制造中的协同作用及其潜在价值 | 微生物细胞工厂及其在化学生产、人类健康和环境修复中的应用 | 合成生物学 | NA | 机器学习 | NA | NA | NA |
| 4 | 2025-05-22 |
Perturbation-response analysis of in silico metabolic dynamics revealed hard-coded responsiveness in the cofactors and network sparsity
2025-May-20, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.98800
PMID:40390360
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研究论文 | 通过计算机模拟分析细菌代谢动力学对外部扰动的响应，揭示了辅因子和网络稀疏性对代谢动态的硬编码响应 | 发现三种不同的动力学模型在非线性状态下对扰动表现出一致的强烈响应，并识别出腺苷辅因子和网络结构对代谢系统响应性的关键影响 | 研究基于计算机模拟，可能无法完全反映真实生物系统的复杂性 | 理解生化系统在扰动下的动态特性，为定量研究稳态理论提供基础 | 细菌中心碳代谢的动力学模型 | 计算生物学 | NA | 动力学建模、数值模拟 | 非线性动力学模型 | 模拟数据 | 三种不同的动力学模型 |
| 5 | 2025-05-22 |
Remodeling of ribosomally synthesized peptide backbones based on posttranslational modifications
2025-May-20, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d5np00018a
PMID:40392103
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research paper | 本文综述了2013年至2024年间核糖体合成并经翻译后修饰的肽（RiPP）天然产物的研究进展，重点介绍了通过翻译后修饰（PTMs）重塑肽骨架的酶及其催化机制 | 揭示了通过翻译后修饰重塑肽骨架的酶及其催化机制，为功能性肽类药物的理性设计和生产提供了新的生物学工具 | NA | 加深对RiPP生物合成的理解，并增强利用合成生物学策略理性设计、开发和生产功能性肽类药物的能力 | 核糖体合成并经翻译后修饰的肽（RiPP）天然产物 | 合成生物学 | NA | 基因组挖掘 | NA | NA | NA |
| 6 | 2025-05-22 |
Innovations, Challenges and Future Directions of T7RNA Polymerase in Microbial Cell Factories
2025-May-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00139
PMID:40209062
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综述 | 本文全面探讨了T7RNA聚合酶在微生物细胞工厂中的创新应用、挑战及未来发展方向 | 拓宽了T7RNA聚合酶的研究范围，不仅涵盖其分子结构和功能动态，还强调了其在合成生物学应用中的多功能变体使用指南，以及增强特异性和可控性的最新工程进展 | 讨论了调控复杂性的关键挑战，但未提出具体解决方案 | 优化微生物细胞工厂中的转录系统，提高其性能 | T7RNA聚合酶及其变体 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 7 | 2025-05-22 |
A Portable Arsenic Sensor Integrating Bacillus megaterium with CMOS Technology
2025-May-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00895
PMID:40211918
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研究论文 | 本研究开发了一种便携式砷传感器，通过合成生物学改造巨大芽孢杆菌，并与CMOS技术集成，实现了对砷的实时检测 | 结合合成生物学和CMOS技术，开发了一种新型便携式砷传感器，能够在资源有限的环境中实现实时检测 | 巨大芽孢杆菌的合成生物学工具包尚不完善，且传感器性能需进一步优化以适应更广泛的应用场景 | 开发一种便携式砷传感器，用于实时检测环境中的砷含量 | 巨大芽孢杆菌及其孢子 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、CMOS技术 | NA | 生物传感器数据 | NA |
| 8 | 2025-05-22 |
Quantum-inspired logic for advanced Transcriptional Programming
2025-May-10, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf440
PMID:40396492
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研究论文 | 本研究提出了一种基于量子计算原理的新型合成生物学工具包，用于构建具有多输出基因控制的压缩遗传电路，以增强转录编程的生物计算能力 | 开发了受量子计算启发的合成双向启动子和转录因子，构建了1输入2输出的生物逻辑门（如QUBIT和PAULI-X门），并展示了更复杂的FEYNMAN和TOFFOLI门的设计能力 | 未明确提及实验验证的细胞类型范围或体内应用效果 | 在最小化底盘细胞代谢负担的前提下，突破标准布尔逻辑限制，实现更高复杂度的生物决策系统 | 合成遗传电路与量子启发生物逻辑门 | 合成生物学 | NA | 合成双向启动子工程、重组酶记忆操作 | 量子启发生物逻辑门（QUBIT/PAULI-X/FEYNMAN/TOFFOLI） | 遗传电路设计数据 | 未明确说明具体实验样本量 |
| 9 | 2025-05-22 |
The Advancement of Peptides Derived From Kitasatospora
2025-May, Chemistry & biodiversity
IF:2.3Q3
DOI:10.1002/cbdv.202402999
PMID:39737746
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综述 | 本文综述了Kitasatospora来源的肽类天然产物的研究进展，包括两种研究策略及其相关酶学和生物合成知识 | 提出了基于Kitasatospora的两种肽类天然产物研究策略，并总结了相关生物合成酶的最新发现 | 未提及具体实验数据或案例研究的局限性 | 探讨Kitasatospora来源的肽类天然产物的研究方法和生物合成机制 | Kitasatospora属放线菌及其产生的肽类天然产物 | 天然产物化学 | NA | 基因组分析、生物信息学工具、序列相似性网络构建 | NA | 基因组数据、酶学数据 | NA |
| 10 | 2025-05-22 |
Synthetic Biology-Based Engineering Cells for Drug Delivery
2025-Apr, Exploration (Beijing, China)
DOI:10.1002/EXP.20240095
PMID:40395752
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综述 | 本文综述了基于合成生物学的工程细胞在药物递送中的新兴应用 | 探讨了合成生物学与纳米技术在药物递送中的前沿融合，以及工程细胞的模块化、标准化和智能化发展方向 | 未提及具体实验数据或案例研究，主要集中于理论探讨和未来展望 | 探索基于合成生物学的工程细胞在构建先进药物递送系统中的应用 | 合成生物学工程细胞 | 合成生物学 | NA | 合成生物学策略与纳米技术 | NA | NA | NA |
| 11 | 2025-05-22 |
Engineered receptors for soluble cellular communication and disease sensing
2025-Feb, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-08366-0
PMID:39542025
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研究论文 | 本文介绍了一种名为SNIPR的合成受体平台，能够响应可溶性配体并激活定制细胞功能，应用于工程化治疗细胞的调控 | 开发了一种新型合成受体SNIPR，能够通过内吞和pH依赖性切割机制响应可溶性配体，具有低基线活性和高激活倍数 | NA | 开发模块化合成受体以调控工程化治疗细胞的活性 | 合成受体SNIPR及其在CAR T细胞中的应用 | 合成生物学 | 实体瘤 | 合成生物学技术 | SNIPR | NA | NA |
| 12 | 2025-05-22 |
Synthetic biology design principles enable efficient bioproduction of Heparosan with low molecular weight and low polydispersion index for the biomedical industry
2025, Synthetic biology (Oxford, England)
DOI:10.1093/synbio/ysaf006
PMID:40396182
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研究论文 | 本文提出了一种利用合成生物学原理精确控制细菌中肝素糖生物合成的新方法，旨在生产低分子量和低分散指数的肝素糖 | 采用合成生物学设计生物分子控制器，通过生物传感器检测肝素糖前体，实现对聚合过程的精细调控 | NA | 开发一种能够精确控制肝素糖生物合成的方法，以生产具有特定性能的生物材料 | 肝素糖的生物合成过程 | 合成生物学 | NA | 合成生物学技术 | NA | NA | NA |
| 13 | 2025-05-22 |
Hydrogels as promising platforms for engineered living bacteria-mediated therapeutic systems
2022-Dec, Materials today. Bio
DOI:10.1016/j.mtbio.2022.100435
PMID:36164505
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综述 | 本文综述了水凝胶作为工程化活菌介导治疗系统的平台设计策略及其在不同疾病治疗中的最新进展 | 探讨了水凝胶在活菌治疗中的创新应用，包括其可调节的物理化学性质、良好的生物活性以及对不稳定载荷的优异保护能力 | 讨论了当前水凝胶基活菌治疗策略面临的挑战和未来发展的局限性 | 旨在总结水凝胶在工程化活菌介导治疗系统中的应用及其在多种疾病治疗中的潜力 | 工程化活菌和水凝胶作为治疗系统的平台 | 生物医学工程 | 消化系统健康、皮肤真菌感染、伤口愈合、疫苗、癌症 | NA | NA | NA | NA |
| 14 | 2025-05-22 |
Digital switching in a biosensor circuit via programmable timing of gene availability
2014-Dec, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/nchembio.1680
PMID:25306443
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研究论文 | 该研究展示了通过编程控制基因可用时间，利用位点特异性重组酶在多基因电路中纠正不良效应，显著提高了内源性microRNA比例传感器的性能 | 通过编程控制基因可用时间，利用位点特异性重组酶在多基因电路中纠正不良效应，显著提高了传感器的动态范围和特异性 | NA | 提高合成生物学中基因电路的稳健性和性能 | 内源性microRNA比例传感器和多基因电路 | 合成生物学 | NA | 位点特异性重组酶技术 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 15 | 2025-05-21 |
Microbial secondary metabolites: advancements to accelerate discovery towards application
2025-Jun, Nature reviews. Microbiology
DOI:10.1038/s41579-024-01141-y
PMID:39824928
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review | 本文综述了微生物次级代谢产物的研究进展及其在人类健康和农业等领域的应用潜力 | 探讨了基因组测序技术揭示的次级代谢产物生物合成能力的新领域，以及预测工具和分子生物学技术在发现新代谢物和理解生物合成酶学中的应用 | NA | 加速发现微生物次级代谢产物的新生物化学、功能和应用 | 微生物次级代谢产物及其生物合成基因簇（BGCs） | 生物技术 | NA | 基因组测序、生物合成基因簇预测工具、分子生物学和合成生物学工具 | NA | 基因组数据、代谢物数据 | NA |
| 16 | 2025-05-21 |
Integrated metabolome and transcriptome analyses revealed key cytochrome P450 genes involved in the biosynthesis of oleanane-type saponins in Hedera helix L
2025-Jun, Plant physiology and biochemistry : PPB
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.plaphy.2025.109818
PMID:40147328
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研究论文 | 本研究通过整合代谢组和转录组分析，揭示了常春藤中参与齐墩果烷型皂苷生物合成的关键细胞色素P450基因 | 首次鉴定了常春藤中参与齐墩果烷型三萜骨架修饰的CYP450基因，并验证了其功能 | 研究仅聚焦于CYP450基因在齐墩果烷型三萜生物合成中的功能，未涉及其他代谢途径 | 解析常春藤中齐墩果烷型皂苷的生物合成途径 | 常春藤(Hedera helix L.)及其代谢产物 | 植物代谢工程 | NA | 转录组测序、代谢组分析、RT-qPCR、体外和体内功能验证 | NA | 基因表达数据、代谢物数据 | NA |
| 17 | 2025-05-21 |
Mapping the Edges of Mass Spectral Prediction: Evaluation of Machine Learning EIMS Prediction for Xeno Amino Acids
2025-May-20, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.5c00286
PMID:40329886
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research paper | 评估NEIMS质谱预测算法在单取代α-氨基酸上的准确性 | 评估了NEIMS算法在训练数据之外的氨基酸上的预测准确性，并发现其不准确性无法通过物理化学差异或氨基酸的衍生化状态解释 | 预测光谱对于算法训练数据之外的氨基酸不准确 | 评估机器学习质谱预测算法的准确性，以支持未知生物分子的检测 | 单取代α-氨基酸 | machine learning | NA | mass spectrometry | NEIMS | spectral data | NA |
| 18 | 2025-05-21 |
Nuclear Assembly in Giant Unilamellar Vesicles Encapsulating Xenopus Egg Extract
2025-May-20, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202412126
PMID:40390663
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research paper | 该研究提出了一种在巨型单层脂质体（GUVs）中组装细胞核的方法，利用非洲爪蟾的卵提取物诱导核重构 | 通过改进的倒置乳液法提高GUV形成效率，并在GUVs中成功组装具有功能核输入特性的类核结构 | NA | 构建更接近真核细胞的人工细胞系统 | 巨型单层脂质体（GUVs）和非洲爪蟾卵提取物 | 合成生物学 | NA | 倒置乳液法，免疫染色 | NA | 显微图像 | NA |
| 19 | 2025-05-21 |
Targeted high-level production of chuangxinmycin and its halogenated derivatives with antitubercular activity
2025-May-19, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-025-02740-x
PMID:40390016
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研究论文 | 本文通过合成生物学技术实现了创新霉素及其卤化衍生物的高效定向生产，并评估了其抗结核活性 | 首次通过生物合成而非化学合成获得创新霉素衍生物，并首次报道了卤化去甲创新霉素衍生物 | 研究仅针对实验室水平的生产优化，尚未进行临床前或临床试验 | 开发新型抗结核药物候选分子 | 创新霉素及其衍生物 | 合成生物学 | 结核病 | 异源表达、激活剂过表达、启动子优化、发酵培养基筛选、HR-MS、HR-MS/MS、NMR | NA | 化学分析数据、生物活性数据 | 多种创新霉素衍生物（包括6种纯化鉴定的卤化衍生物） |
| 20 | 2025-05-21 |
A generalizable approach for programming protease-responsive conformationally inhibited artificial transcriptional factors
2025-May-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-59828-6
PMID:40382329
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research paper | 本文提出了一种蛋白酶响应性构象抑制系统（PRCIS），用于设计可编程的人工转录因子（ATF）以构建正交和可组合的转录调控工具 | 通过分子内连接将ATF的自由DNA结合域与受限二聚化区域相连，实现转录结合的构象失活，并在蛋白酶切割连接后恢复DNA结合功能 | NA | 开发一种通用的蛋白酶响应性构象抑制系统，用于合成生物学中的基因调控 | 人工转录因子（ATF）和蛋白酶 | 合成生物学 | NA | 蛋白酶响应性构象抑制系统（PRCIS） | NA | NA | NA |