合成生物学相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价5元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 3340 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2025-06-10 |
Sensl: a synthetic biology sensor for tracking strigolactone signaling in rice
2025-Aug, The New phytologist
DOI:10.1111/nph.70242
PMID:40484984
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2 | 2025-07-04 |
The horizontally transferred gene, CsMTAN, rewired purine traffic to build caffeine factories in tea leaves
2025-Jul-03, Journal of integrative plant biology
IF:9.3Q1
DOI:10.1111/jipb.13957
PMID:40607640
|
研究论文 | 本研究通过代谢组学和基因组关联分析，揭示了茶树中水平转移基因CsMTAN在嘌呤代谢和咖啡因生物合成中的关键作用 | 首次鉴定并功能验证了水平转移基因CsMTAN在茶树嘌呤代谢中的关键作用，发现其SNP变异导致酶活性显著改变 | 研究主要基于体外酶活实验和瞬时表达系统，未进行稳定的转基因植株验证 | 阐明茶树嘌呤代谢和嘌呤生物碱合成的遗传与分子机制 | 茶树(Camellia sinensis)叶片组织 | 植物代谢组学 | NA | 代谢组学分析、全基因组关联分析(GWAS)、体外酶活实验、瞬时表达系统 | NA | 代谢组数据、基因组数据 | 183个遗传多样性茶树品种的幼叶和成熟叶组织 |
| 3 | 2025-07-04 |
Engineered Membrane Vesicle Production via oprF or oprI Deletion Has Distinct Phenotypic Effects in Pseudomonas putida
2025-Jul-03, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00171
PMID:40607986
|
research paper | 研究通过删除oprF或oprI基因在Pseudomonas putida KT2440中诱导膜囊泡（MV）超产的表型效应 | 识别并表征了两种诱导膜囊泡超产的基因工程策略，揭示了不同基因删除对膜囊泡产量、大小、蛋白质组成及菌株适应性的影响 | 研究仅针对Pseudomonas putida KT2440，未在其他菌株中验证策略的普适性 | 探索膜成分操纵对膜囊泡生产的影响，为工业生物过程中的膜囊泡应用提供合成生物学工具 | Pseudomonas putida KT2440菌株及其基因工程改造后的膜囊泡 | 合成生物学 | NA | 基因删除、膜囊泡分析 | NA | 生物分子数据 | NA |
| 4 | 2025-07-04 |
Three-dimensional robotic structures fabricated and powered entirely with proteins
2025-Jul-02, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-025-01186-0
PMID:40604266
|
research paper | 该研究报道了一种全蛋白质基微三维打印机器人结构的逐步构建过程，这些结构由最小肌动球蛋白皮层涂层驱动 | 首次实现了全蛋白质基微三维打印机器人结构的构建与驱动，为合成生物学中生物分子活性的放大提供了新方法 | 该方法需要使用者具备生物材料专业知识，且完成过程需要15天时间 | 开发自供能软体机器人并推动三维蛋白质基机器人技术的发展 | 蛋白质基微三维打印机器人结构 | 合成生物学 | NA | 三维打印技术、肌动球蛋白涂层技术 | NA | NA | NA |
| 5 | 2025-07-04 |
Membrane-Anchored Polyproline Provides Controlled Microdomain Formation and Permeability in Lipid Vesicles
2025-Jul-02, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.5c06134
PMID:40605254
|
研究论文 | 本研究合成了一类由l-脯氨酸单体单元和磷脂引发剂组成的脂质聚合物，通过将聚脯氨酸链锚定在膜上，实现了可逆的相分离 | 通过锚定聚脯氨酸链到膜上，实现了温度调控的可逆相分离和微区形成，增强了膜的通透性，并实现了封装分子的尺寸控制释放 | 未提及具体的临床应用效果或长期稳定性数据 | 开发一种新型脂质聚合物系统，用于控制膜微区形成和通透性，应用于药物传递或合成生物学 | 由l-脯氨酸单体单元和磷脂引发剂组成的脂质聚合物 | 合成生物学 | NA | 共聚焦显微镜和FRAP分析 | NA | NA | NA |
| 6 | 2025-07-04 |
Merging the computational design of chimeric type I polyketide synthases with enzymatic pathways for chemical biosynthesis
2025-Jul-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-61160-y
PMID:40593699
|
研究论文 | 介绍了一种名为BioPKS pipeline的自动化逆向生物合成工具，结合多功能I型聚酮合酶（PKSs）和单功能酶，用于化学生物合成 | 开发了BioPKS pipeline工具，结合RetroTide和DORAnet两种互补工具，自动设计嵌合I型聚酮合酶与酶促途径，扩展了化学生物合成的可能性 | 未提及具体局限性 | 通过合成生物学方法更可持续地制造化学品，扩展生物制造的化学可及空间 | 嵌合I型聚酮合酶（PKSs）和单功能酶 | 合成生物学 | NA | 逆向生物合成 | NA | NA | 155种生物制造候选化合物 |
| 7 | 2025-07-04 |
Transient infrared nanoscopy resolves the millisecond photoswitching dynamics of single lipid vesicles in water
2025-Jul-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-61341-9
PMID:40593745
|
研究论文 | 本文介绍了一种无标记、非破坏性的中红外成像和光谱技术，用于研究单个光开关脂质体的动态变化 | 利用散射型扫描近场光学显微镜（s-SNOM）实现了高时空分辨率的中红外成像和光谱分析，能够在不干扰样品的情况下研究纳米载体的动态特性 | 技术可能对某些特定类型的纳米载体或环境条件下的适用性有限 | 推进光药理学、药物递送、纳米治疗诊断学和合成生物学的研究 | 光开关脂质体（azobenzene-based photoswitchable lipids） | 纳米技术 | NA | 散射型扫描近场光学显微镜（s-SNOM） | NA | 中红外图像和光谱数据 | 单个光开关脂质体 |
| 8 | 2025-07-04 |
Comprehensive datasets for RNA design, machine learning, and beyond
2025-Jul-01, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-07041-2
PMID:40594473
|
research paper | 该研究创建了一个包含超过32万实例的综合数据集，用于RNA设计和建模算法的基准测试 | 提供了一个来自实验验证来源的标准化基准数据集，用于RNA设计和建模算法的开发和评估 | 数据集的广泛适用性和模型训练的泛化能力尚未完全验证 | 提高RNA二级结构预测和序列设计的准确性，推动计算生物学的发展 | RNA分子及其二级结构和序列设计 | computational biology | NA | machine learning | NA | RNA sequence and structure data | 超过32万实例 |
| 9 | 2025-07-04 |
Divergent multifunctional P450s-empowered biosynthesis of bioactive tripterifordin and cryptic atiserenoids in Aconitum implies convergent evolution
2025-Jul-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-61188-0
PMID:40595667
|
研究论文 | 该研究通过挖掘乌头属植物的转录组数据，发现了多种能够催化二萜骨架形成的酶，并揭示了细胞色素P450单加氧酶在二萜结构多样化中的关键作用 | 发现了9种能够催化ent-kaurene、ent-atiserene或16α-hydroxy-ent-kaurene骨架形成的TPSs和14种功能各异的P450s，其中8种具有多功能性，能够在骨架的七个不同位点催化氧化反应 | 研究主要基于转录组数据挖掘和体外功能验证，体内代谢途径的完整性和调控机制仍需进一步研究 | 探究乌头属植物中二萜类化合物结构多样化的分子机制 | 乌头属植物(Aconitum carmichaelii和Aconitum coreanum)中的二萜类化合物 | 植物代谢工程 | NA | 转录组测序、功能验证、蛋白分析和定点突变 | NA | 转录组数据、酶活性数据 | 两种乌头属植物(Aconitum carmichaelii和Aconitum coreanum)的转录组数据 |
| 10 | 2025-07-04 |
Genetic characteristics of novel extreme alkaline-inducible promoter located in five prime upstream region of peptidyl-prolyl cis/trans isomerase from Vibrio anguillarum
2025-Jul-01, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-98559-y
PMID:40596401
|
研究论文 | 本研究鉴定并表征了Vibrio anguillarum NB10的启动子区域，该区域在极端碱性条件下增强FK506结合蛋白型肽酰脯氨酰顺反异构酶的表达 | 发现了一种新型极端碱性诱导启动子，可用于生物技术应用，如pH响应基因表达系统的开发 | NA | 研究Vibrio anguillarum NB10在极端碱性条件下基因表达的调控机制 | Vibrio anguillarum NB10的启动子区域及其编码的FK506结合蛋白型肽酰脯氨酰顺反异构酶 | 合成生物学与代谢工程 | NA | 蛋白质组学分析，β-半乳糖苷酶报告基因系统 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 11 | 2025-07-04 |
Iterative deep learning design of human enhancers exploits condensed sequence grammar to achieve cell-type specificity
2025-Jun-04, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2025.101302
PMID:40472848
|
research paper | 该研究应用迭代深度学习设计具有特定细胞类型活性的合成增强子 | 利用迭代深度学习方法设计合成增强子，实现了在两种人类细胞系中的强差异活性，并通过实验验证和模型优化提高了增强子的特异性 | 研究仅针对两种人类细胞系，可能不适用于其他细胞类型 | 解决合成生物学中如何靶向特定细胞类型进行基因表达的问题 | 人类细胞系中的合成增强子 | synthetic biology | NA | iterative deep learning | deep learning | enhancer activity and chromatin accessibility data | 两种人类细胞系 |
| 12 | 2025-07-04 |
FoldMark: Safeguarding Protein Structure Generative Models with Distributional and Evolutionary Watermarking
2025-Jun-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.23.619960
PMID:39554012
|
research paper | 本文提出了一种名为FoldMark的新型水印策略，旨在保护蛋白质结构生成模型，平衡水印容量与结构质量 | 首次提出结合分布和进化原理的水印策略，适用于蛋白质生成模型，并能在保持结构质量的同时实现高精度水印嵌入 | 未明确提及水印策略对模型性能的长期影响以及在更广泛蛋白质类型上的适用性 | 开发一种安全保护措施，防止AI驱动的蛋白质设计技术被滥用 | 蛋白质生成模型（如AlphaFold3、ESMFold、RFDiffusion等）及其生成的蛋白质结构 | computational protein science | NA | distributional and evolutionary watermarking | generative AI models (AlphaFold3, ESMFold, RFDiffusion) | protein structures | 测试了EGFP和CRISPR-Cas13两种蛋白质 |
| 13 | 2025-07-04 |
Expanding salivary biomarker detection by creating a synthetic neuraminic acid sensor via chimeragenesis
2025-Jun-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.13.598939
PMID:38915506
|
research paper | 该研究通过合成生物学技术开发了一种全细胞生物传感器，用于检测与口腔鳞状细胞癌相关的唾液生物标志物 | 利用合成生物学技术构建了一种新型嵌合转录因子（Sphnx），用于检测唾液中的N-乙酰-D-神经氨酸（Neu5Ac） | 目前仅为概念验证，尚未应用于临床筛查 | 开发一种非侵入性早期诊断口腔鳞状细胞癌的生物传感器 | 唾液中的N-乙酰-D-神经氨酸（Neu5Ac） | 合成生物学 | 口腔鳞状细胞癌 | 合成生物学技术 | 全细胞生物传感器（WCB） | 生物分子数据 | NA |
| 14 | 2025-07-04 |
Bioremediation of complex organic pollutants by engineered Vibrio natriegens
2025-Jun, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-08947-7
PMID:40335686
|
研究论文 | 本研究通过合成生物学方法改造Vibrio natriegens菌株，使其能够在含盐废水和土壤中生物修复复杂的有机污染物 | 利用合成生物学技术将tfoX基因插入Vibrio natriegens染色体并过表达，增强了DNA摄取和整合能力，构建了能够降解多种有机污染物的工程菌株 | 研究仅针对五种有机污染物进行了测试，未涉及其他可能的环境污染物 | 开发能够在高盐环境中生物修复复杂有机污染物的微生物技术 | 工业废水、石油污染和塑料污染中的有机污染物 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、基因组工程 | NA | NA | 来自氯碱厂和石油精炼厂的工业废水样品 |
| 15 | 2025-07-04 |
Advancing sustainable practices with Paenibacillus polymyxa: From soil health to medical applications and molecular engineering
2025, AIMS microbiology
IF:2.7Q3
DOI:10.3934/microbiol.2025016
PMID:40600215
|
综述 | 本文全面分析了多粘类芽孢杆菌在农业、环境管理、医学和工业中的多功能应用及其在可持续实践中的潜力 | 强调多粘类芽孢杆菌作为蛋白质表达、代谢工程和合成生物学的多功能平台的潜力，并探讨了其遗传资源和代谢能力 | 天然多粘类芽孢杆菌生物资源的广泛利用受到遗传操作能力和工具的限制 | 推动可持续实践，特别是在农业、环境管理、医学和工业领域的应用 | 多粘类芽孢杆菌 | 合成生物学 | NA | 遗传编辑技术 | NA | NA | NA |
| 16 | 2025-07-03 |
Application of the Pipeline Metabolic Model in Food Synthetic Biology
2025-Jul-02, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c04173
PMID:40600973
|
research paper | 本文提出了一种名为管道代谢模型的概念和操作框架，旨在简化食品合成生物学中的代谢网络设计和工程 | 将代谢网络抽象为管道（代谢途径）和阀门（关键酶）的网络，实现了更直观的可视化和模块化工程 | 未提及具体模型在更复杂代谢网络中的适用性或验证范围 | 降低合成生物学研究的障碍，促进可持续食品生产的创新 | 功能性食品分子（如碳水化合物、蛋白质和脂肪）的生产 | 食品合成生物学 | NA | 代谢工程 | 管道代谢模型 | NA | 以乳四糖（LNT）合成为案例研究 |
| 17 | 2025-07-03 |
Synthetic Forms Most Beautiful: Engineering Insights into Self-Organization
2025-Jul-01, Physiology (Bethesda, Md.)
DOI:10.1152/physiol.00064.2024
PMID:39938118
|
研究论文 | 本文探讨了合成生物学在构建新生命系统中对生命自组织基本设计原则的理解扩展 | 提出了将长度或时间尺度强加于生物活动是自组织的基本策略，并展示了如何在合成系统中实现这一策略 | 未具体提及实验验证或具体技术实现的局限性 | 探索生命自组织的设计原则及其在合成生物学中的应用 | 合成生物学构建的新生命系统 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 18 | 2025-07-03 |
Establishment of a Visible Reporter System in Zymomonas mobilis through Random Mutagenesis and Rational Design of a Chromoprotein eforRed
2025-Jul-01, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00872
PMID:40590208
|
研究论文 | 本研究通过随机诱变和理性设计，在非模式乙醇生产菌Zymomonas mobilis中建立了一个可见的报告基因系统 | 利用荧光色蛋白eforRed建立可见报告系统，并通过氨基酸残基K201和T24的突变优化其光学特性 | 研究仅限于Zymomonas mobilis这一非模式菌株，可能不适用于其他微生物 | 开发一个可见的报告基因系统，用于定量和定性测量生物部件的活性 | Zymomonas mobilis菌株和eforRed色蛋白 | 合成生物学 | NA | 随机错误倾向PCR和蛋白质理性设计 | NA | NA | NA |
| 19 | 2025-07-03 |
Regulation and induction of fungal secondary metabolites: a comprehensive review
2025-Jul-01, Archives of microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00203-025-04386-0
PMID:40590991
|
综述 | 本文全面分析了真菌次级代谢产物的调控机制、鉴定方法以及提高产量的策略 | 强调了合成生物学和AI驱动的代谢工程在可持续利用真菌生物多样性中的创新应用 | 未提及具体实验验证或案例研究 | 探讨真菌次级代谢产物的调控机制及其在医药、农业和化妆品等领域的应用 | 真菌次级代谢产物及其生物合成基因簇 | 合成生物学 | NA | OMICS技术、响应面方法、人工神经网络 | 人工神经网络 | NA | NA |
| 20 | 2025-07-03 |
Evaluating the Potential of Co-supplementation of Zinc and Ferrous Iron Ion for Itaconic Acid Fermentation of Aspergillus terreus
2025-Jul-01, Applied biochemistry and biotechnology
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s12010-025-05317-x
PMID:40591109
|
研究论文 | 评估锌和亚铁离子共补充对土曲霉发酵生产衣康酸的潜在影响 | 首次评估锌和亚铁离子共补充对土曲霉发酵生产衣康酸的影响，并通过转录组测序揭示相关基因表达变化 | 研究仅针对纯葡萄糖和木糖作为底物，未考虑其他碳源的影响 | 探索锌和亚铁离子对土曲霉发酵生产衣康酸的影响 | 土曲霉(Aspergillus terreus) | 生物技术 | NA | 转录组测序 | NA | 基因表达数据 | NA |