合成生物学相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价5元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 3231 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2025-06-11 |
Microbial production of torulene and its potential applications: a review
2025-Jul, Food science and biotechnology
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s10068-024-01780-0
PMID:40492047
|
review | 本文综述了托鲁烯的微生物生产方法及其潜在应用 | 总结了当前提高托鲁烯产量的上下游工艺策略，并探讨了其在食品、化妆品和制药行业的潜在应用 | 托鲁烯的微生物生产仍面临商业化挑战，未来研究需关注系统工程和合成生物学以提高产量 | 探讨托鲁烯的微生物生产方法及其潜在应用 | 托鲁烯及其生产菌株，特别是红酵母 | 生物技术 | NA | 微生物发酵、系统工程、合成生物学 | NA | NA | NA |
| 2 | 2025-06-11 |
DASH: a versatile and high-capacity gene stacking system for plant synthetic biology
2025-Jun-10, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70179
PMID:40493021
|
研究论文 | 介绍了一种名为DASH的多功能高容量基因堆叠系统，用于植物合成生物学 | 结合了Golden Gate克隆、重组工程和位点特异性重组酶系统的特点，解决了现有DNA组装系统的多个限制 | NA | 开发一种更高效、灵活的基因组装工具，用于植物合成生物学 | 植物基因组装系统 | 合成生物学 | NA | Golden Gate克隆、重组工程、位点特异性重组酶系统 | NA | DNA序列 | 一个116 kb的DNA构建体，包含35个转录单元 |
| 3 | 2025-06-11 |
A discovery platform for identification of host-induced bacterial biosensors from diverse sources
2025-Jun-09, Molecular systems biology
IF:8.5Q1
DOI:10.1038/s44320-025-00123-3
PMID:40490500
|
研究论文 | 该研究开发了一个用于识别宿主诱导细菌生物传感器的发现平台，扩展了生物传感器筛选的灵活性和能力 | 利用细菌记忆电路构建了来自多种肠道细菌的传感器组件库，并通过超变DNA条形码实现并行追踪数千个独特克隆 | 研究中使用的传感器组件库可能仍有限，且需要进一步验证其在不同环境中的稳定性和可靠性 | 开发合成生物学工具，用于复杂环境中的部署，如肠道内的合成功能自主控制和炎症性疾病的非侵入性监测 | 肠道微生物及其传感器组件 | 合成生物学 | 炎症性疾病 | 双组分系统识别和克隆流程，超变DNA条形码技术 | NA | 基因序列数据 | 数千个独特克隆，对应约150个潜在生物传感器 |
| 4 | 2025-06-11 |
Detection of TuMV by a toehold switch sensor coupled with NASBA amplification in Pseudostellaria heterophylla
2025-Jun-09, Plant methods
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s13007-025-01394-5
PMID:40490766
|
研究论文 | 开发了一种基于NASBA扩增和toehold开关传感器的细胞外表达系统，用于检测太子参中的芜菁花叶病毒(TuMV) | 结合NASBA扩增和toehold开关传感器，实现了快速、高灵敏度和高特异性的TuMV检测 | 未明确说明该方法在其他植物病毒检测中的普适性 | 开发高效诊断系统以控制和缓解太子参中的TuMV感染 | 太子参(Pseudostellaria heterophylla)及其感染的芜菁花叶病毒(TuMV) | 合成生物学 | 植物病毒感染 | NASBA(核酸序列依赖的扩增), toehold开关传感器 | NA | RNA片段 | 未明确说明具体样本数量，但包括纯化和粗提RNA样本 |
| 5 | 2025-06-11 |
Synthetic CRISPR Networks Driven by Transcription Factors via Structure-Switching DNA Translators
2025-Jun-09, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.5c06913
PMID:40491004
|
research paper | 该研究介绍了一个利用转录因子（TFs）通过工程DNA翻译器调控CRISPR-Cas12a反式切割活性的平台 | 通过动态DNA结构响应TF结合并调控Cas12a活性，建立了TF作为CRISPR-Cas系统有效调控因子的新方法 | 研究中仅使用了TATA结合蛋白和Myc-Max作为TF模型，可能不适用于所有类型的转录因子 | 开发一种新型的CRISPR-Cas系统调控平台，用于合成生物学应用 | 转录因子（TFs）和CRISPR-Cas12a系统 | synthetic biology | NA | CRISPR-Cas12a, DNA翻译器技术 | NA | NA | NA |
| 6 | 2025-06-11 |
Codes across (life)sciences
2025-Jun-07, Bio Systems
DOI:10.1016/j.biosystems.2025.105515
PMID:40490067
|
综述 | 本文探讨了“代码”在不同学科中的含义、意图和形式化，并试图构建一个跨学科的代码研究框架 | 提出了一个跨学科的视角，探讨代码在生物学、心理学、文化等领域的作用，并展望了生物代码与机器逻辑的未来融合 | 文章更多是概念性讨论，缺乏具体的实验验证或数据分析 | 探索代码在不同学科中的共性和潜在的统一理论 | 代码在数学、计算机科学、心理学、生物学等领域的应用和影响 | 跨学科研究 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 7 | 2025-06-11 |
Expressing exogenous gene in Chlamydomonas reinhardtii chloroplast with viral replication elements
2025-Jun-07, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2025.132784
PMID:40490158
|
research paper | 开发了一种基于病毒复制元件的莱茵衣藻叶绿体表达平台，用于提高外源基因表达和生物合成产物的产量 | 利用甜菜曲顶病毒的复制机制构建了病毒启发的表达平台，显著提高了外源基因的表达水平和稳定性 | 研究仅验证了特定基因（mVenus和类胡萝卜素合成基因）的表达效果，未广泛测试其他基因 | 提高莱茵衣藻叶绿体中外源基因的表达效率和产物产量 | 莱茵衣藻叶绿体 | 合成生物学 | NA | 病毒复制元件介导的基因表达 | NA | 基因表达数据、代谢产物数据 | 未明确说明具体样本数量，但涉及莱茵衣藻转化体的长期（12个月）观察 |
| 8 | 2025-06-11 |
Modular and signal-responsive transcriptional regulation using CRISPRi-aided genetic switches in Escherichia coli
2025-Jun-06, Journal of biological engineering
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13036-025-00526-8
PMID:40481524
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于CRISPRi的遗传开关平台，用于在大肠杆菌中实现模块化和信号响应的转录调控 | 整合了转录因子生物传感器与FnCas12a CRISPR系统，利用FndCas12a的RNase活性直接从生物传感器响应的mRNA转录物处理crRNA，实现了精确的信号依赖性转录调控 | NA | 克服现有转录调控工具的局限性，扩展合成生物学中转录调控工具的功能 | 大肠杆菌 | 合成生物学 | NA | CRISPRi, FnCas12a CRISPR系统 | NA | NA | NA |
| 9 | 2025-06-11 |
Iterative deep learning design of human enhancers exploits condensed sequence grammar to achieve cell-type specificity
2025-Jun-04, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2025.101302
PMID:40472848
|
research paper | 利用迭代深度学习设计人类增强子，利用浓缩序列语法实现细胞类型特异性 | 应用迭代深度学习设计合成增强子，实现两种人类细胞系之间的强差异活性，并通过实验验证和模型再优化提高特异性 | 仅针对两种人类细胞系进行研究，未涉及更广泛的细胞类型 | 解决合成生物学中如何靶向特定细胞类型的基因表达问题 | 人类增强子序列 | synthetic biology | NA | iterative deep learning | deep learning | sequence data | two human cell lines |
| 10 | 2025-06-11 |
Small molecule- and cell contact-inducible systems for controlling expression and differentiation in mouse embryonic stem cells
2025-Jun-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.204505
PMID:40377146
|
研究论文 | 本文描述了三种小分子和两种细胞接触诱导系统在小鼠胚胎干细胞(mESCs)中用于基因表达和分化的特性 | 在小鼠胚胎干细胞中首次详细表征了小分子和细胞接触诱导系统的功能，并展示了这些系统在驱动mESCs直接分化为神经元中的应用 | 现有合成生物学工具在小鼠胚胎干细胞中的表征较少 | 研究合成发育生物学方法，以理解多细胞性并控制细胞行为 | 小鼠胚胎干细胞(mESCs) | 合成生物学 | NA | 基因表达控制系统 | NA | NA | NA |
| 11 | 2025-06-11 |
The Matter/Life Nexus in Biological Cells
2025-Jun, Annual review of chemical and biomolecular engineering
IF:7.6Q1
|
research paper | 探讨了无生命物质与生命之间的区别，以及物理学与细胞生物化学之间的紧密耦合如何揭示物质/生命关系 | 结合实验和计算进展，探索物理学与细胞生物化学的深度耦合，为理解物质与生命的关系提供新视角 | 目前仍无法从原子和分子成分从头构建一个活细胞，表明对生命本质的理解仍有限 | 探索物质与生命之间的区别，以及如何通过物理学和生物化学的耦合来理解这一关系 | 生物细胞及其物理和生物化学特性 | systems biology | NA | whole-cell modeling and synthesis | NA | NA | NA |
| 12 | 2025-06-11 |
Synthetic Genetic Circuits Enabled in Komagataella phaffii Through T7 RNAP/CRISPRa System
2025-Jun, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.70036
PMID:40490955
|
研究论文 | 本研究展示了在Komagataella phaffii中通过T7 RNAP/CRISPRa系统构建合成遗传电路的潜力 | 利用T7转录系统有效表达sgRNA，并通过插入tRNA序列增强转录激活效率，设计了能进行布尔逻辑运算的基因电路 | NA | 探索在工业Komagataella phaffii菌株中构建基因调控工具包 | Komagataella phaffii菌株 | 合成生物学 | NA | CRISPRa, T7转录系统, Tet-on诱导系统, split-T7系统, HH-HDV RNA切割处理 | NA | NA | NA |
| 13 | 2025-06-11 |
Recent Advances in Genome Base Editing Technology and Its Applications in Industrial Microorganism
2025-Jun, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.70052
PMID:40490981
|
review | 本文系统总结了碱基编辑技术的发展历史、最新进展及其在工业微生物构建中的应用 | 全面概述了多种主要碱基编辑器（如CBEs、ABEs、CRISPR-free碱基编辑器等）及其优化策略，并探讨了其在工业微生物构建中的应用 | NA | 促进碱基编辑技术在合成生物学中的广泛应用并加速其转化潜力 | 工业微生物（如枯草芽孢杆菌、谷氨酸棒状杆菌、酿酒酵母等） | 合成生物学 | NA | 碱基编辑技术（如CBEs、ABEs、CGBEs等） | NA | NA | NA |
| 14 | 2025-06-11 |
The people behind the papers - Sarah Soliman and Zara Weinberg
2025-Jun-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.204920
PMID:40493005
|
研究论文 | 该研究介绍了一套小分子和细胞接触诱导系统，用于控制小鼠胚胎干细胞中的基因表达和分化 | 开发了新的小分子和细胞接触诱导系统，用于模拟发育过程 | NA | 研究发育生物学的原理 | 小鼠胚胎干细胞 | 合成生物学 | NA | 小分子和细胞接触诱导系统 | NA | NA | NA |
| 15 | 2025-06-11 |
Iterative deep learning-design of human enhancers exploits condensed sequence grammar to achieve cell type-specificity
2024-Jun-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.14.599076
PMID:38915713
|
研究论文 | 本文应用迭代深度学习设计具有强细胞类型特异性的合成增强子 | 利用迭代深度学习方法设计合成增强子，实现细胞类型特异性基因表达 | 仅验证了两种人类细胞系中的增强子活性 | 解决合成生物学中靶向特定细胞类型基因表达的问题 | 人类细胞系中的合成增强子 | 合成生物学 | NA | 深度学习 | NA | 基因组序列数据 | 两种人类细胞系 |
| 16 | 2025-06-11 |
Harnessing iron‑sulfur enzymes for synthetic biology
2024-06, Biochimica et biophysica acta. Molecular cell research
DOI:10.1016/j.bbamcr.2024.119718
PMID:38574823
|
综述 | 本文探讨了利用铁硫（Fe-S）酶进行合成生物学的核心挑战及解决方案 | 总结了Fe-S酶在工程代谢途径中的三个核心挑战，并提出了克服这些挑战的方法 | 尚未实现工业规模应用，仍处于研究阶段 | 开发工业级Fe-S酶依赖的生物合成途径 | 铁硫（Fe-S）酶及其在生物合成途径中的应用 | 合成生物学 | NA | 蛋白结构预测与设计 | NA | NA | NA |
| 17 | 2025-06-10 |
Tryptophan-producing bacteria to mitigate osteoporosis and intestinal dysfunction
2025-Sep, Bioactive materials
IF:18.0Q1
DOI:10.1016/j.bioactmat.2025.05.013
PMID:40487243
|
研究论文 | 研究通过补充产色氨酸细菌来修复受损的肠道屏障并缓解骨质疏松 | 揭示了色氨酸代谢物在骨质疏松中的作用，并提出了一种基于合成生物学的治疗策略 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人体中验证 | 探索肠道微生物代谢物（特别是色氨酸衍生物）在骨质疏松中的作用及其治疗潜力 | 骨质疏松小鼠模型和老年小鼠模型 | 合成生物学 | 骨质疏松 | 微生物代谢物分析 | 小鼠模型 | NA | NA |
| 18 | 2025-06-10 |
Robust Synthetic Biology Toolkit to Advance Carboxysome Study and Redesign
2025-Jun-09, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00144
PMID:40488673
|
研究论文 | 本文设计并验证了一个名为pXpressome的工具包，用于稳健表达和纯化α-羧酶体，并研究了其结构和性能的调控 | 开发了pXpressome工具包，能够稳健表达和纯化α-羧酶体，并通过荧光标记构建体观察到更均匀的表达和更好的细胞健康状态 | NA | 促进羧酶体的研究和重新设计，以增强碳固定或作为其他纳米封装目标的平台 | α-羧酶体 | 合成生物学 | NA | 荧光标记 | NA | NA | NA |
| 19 | 2025-06-10 |
Sensl: a synthetic biology sensor for tracking strigolactone signaling in rice
2025-Jun-08, The New phytologist
DOI:10.1111/nph.70242
PMID:40484984
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 20 | 2025-06-10 |
Dynamical mechanisms of growth-feedback effects on adaptive gene circuits
2025-Jun-05, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.89170
PMID:40470804
|
研究论文 | 本文研究了工程基因电路在宿主细胞中的动态机制，特别是生长反馈对电路性能的影响 | 系统研究了400多种拓扑结构，揭示了电路失败的三种动态机制，并发现了一种电路鲁棒性度量与生长反馈强度之间的比例关系 | 研究主要基于计算模拟，需要进一步的实验验证 | 理解基因电路与宿主细胞间的相互作用机制，特别是生长反馈对电路性能的影响 | 工程基因电路的拓扑结构和动态行为 | 合成生物学 | NA | 转录调控电路 | NA | 计算模拟数据 | 400多种拓扑结构 |