合成生物学相关文章
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当前共找到 4708 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-04-05 |
CellTarget: a convex optimisation approach to discover cellular objectives
2026-Apr-03, NPJ systems biology and applications
IF:3.5Q1
DOI:10.1038/s41540-026-00700-8
PMID:41932911
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研究论文 | 本文提出CellTarget算法，通过凸优化方法从实验通量数据直接推断哺乳动物细胞的代谢目标 | 结合凸FBA模块与误差最小化模块，利用隐式微分实现目标系数反向传播，解决了哺乳动物细胞目标难以指定的问题 | 存在细胞目标的显著不可识别性，预测准确性更多受网络约束而非目标特异性驱动 | 开发算法以推断哺乳动物细胞的代谢目标，改善代谢网络模型在哺乳动物系统中的应用 | 中国仓鼠卵巢细胞系（包括生产型和非生产型） | 系统与合成生物学 | NA | 通量平衡分析 | 凸优化模型 | 实验通量数据 | 多种CHO细胞系、生长阶段及网络规模（包括简化与全基因组尺度） | NA | 中国仓鼠卵巢细胞 | NA | 工业生物技术 |
| 2 | 2026-04-05 |
A highly limited amino acid library from asteroid Bennu yields wide-ranging protein folds
2026-Apr-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-71509-6
PMID:41932940
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研究论文 | 利用AI蛋白质设计软件探索古代蛋白质结构，发现极小规模的原始氨基酸库能产生多种关键蛋白质折叠 | 首次证明仅含6种来自小行星Bennu的氨基酸库即可复现所有测试蛋白质折叠，为生命起源提供了新见解 | 研究基于计算模拟和预测，缺乏实验验证折叠蛋白质的实际功能 | 探索原始氨基酸库能否产生复杂蛋白质折叠，以理解生命起源的化学基础 | 原始氨基酸库与蛋白质折叠多样性 | 计算生物学 | NA | AI蛋白质设计软件、AlphaFold2结构预测、Template Modelling Score比较 | AlphaFold2 | 氨基酸序列数据、三维结构预测数据 | 多个氨基酸库（6种、7种、8种氨基酸组成） | NA | NA | NA | 合成生物学、医学应用 |
| 3 | 2026-04-05 |
Transforming a fragile protein helix into an ultrastable scaffold via a hierarchical AI and chemistry framework
2026-Apr-02, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.109753
PMID:41925723
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研究论文 | 本文提出了一种分层AI与化学框架，将脆弱的蛋白质α-螺旋结构转化为超稳定支架 | 通过整合AI引导设计和基础化学原理，实现了从全局结构强化到局部化学调谐的系统性方法，创造出具有多轴稳定性的蛋白质 | NA | 设计在热、机械和化学应力下保持结构完整性的蛋白质 | α-螺旋结构域 | 机器学习 | NA | 分子动力学模拟 | AlphaFold3 | NA | 数百万个设计 | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 4 | 2026-04-05 |
Artificial intelligence revolutionizes cellular metabolic pathway reconstruction
2026-Apr, Trends in biochemical sciences
IF:11.6Q1
DOI:10.1016/j.tibs.2026.01.003
PMID:41850996
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综述 | 本文提出了一个整合逆合成规划与生物学约束的概念框架，以改进细胞代谢途径重建的生物可行性 | 将逆合成规划与生物学约束相结合，并利用大语言模型驱动代谢网络的理解、设计、评估与优化 | NA | 改进合成生物学中细胞代谢途径的重建方法 | 细胞代谢网络 | 合成生物学 | NA | 逆合成规划，大语言模型 | 大语言模型 | NA | NA | NA | NA | 代谢网络 | 工业生物技术 |
| 5 | 2026-04-05 |
Engineering aminoacyl-tRNA synthetase activity to enhance branched-chain amino acid biosynthesis
2026-Mar-31, Biochimie
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.biochi.2026.03.014
PMID:41933685
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研究论文 | 本文探讨了通过工程化氨基酸-tRNA合成酶活性来增强支链氨基酸生物合成的策略 | 创新点在于将aaRS-tRNA对工程化为生长耦合选择系统，并整合tRNA修饰、靶向aaRS诱变和合成生物学工具，以优化微生物细胞工厂 | 直接工程化BCAA aaRS的研究仍然较少，这限制了其在工业规模生产中的应用潜力 | 研究目的是通过代谢工程增强支链氨基酸的微生物生产 | 研究对象是支链氨基酸（缬氨酸、亮氨酸和异亮氨酸）及其相关的氨基酸-tRNA合成酶 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、靶向aaRS诱变、tRNA修饰 | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | 大肠杆菌, 谷氨酸棒杆菌 | 生长耦合选择系统 | 工业生物技术 |
| 6 | 2026-04-05 |
Frontiers in polysaccharide biosynthesis: Decoding the catalytic logic of enzymes for future applications
2026-Mar-27, Carbohydrate research
IF:2.4Q2
DOI:10.1016/j.carres.2026.109907
PMID:41931921
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综述 | 本文系统分析了不同生物来源中天然多糖生物合成的分子机制，并综述了利用合成生物学策略重建和优化这些天然网络的最新进展 | 聚焦于从底物前体激活、糖链聚合到组装后修饰的完整过程，并探讨了人工智能和系统生物学等新兴技术在该领域的整合应用前景 | NA | 理解多糖的生物合成机制，并为未来在工程化系统中可控生产结构明确的多糖提供理论基础 | 动物、植物和微生物中的多糖生物合成系统 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 7 | 2026-04-05 |
Beyond the Sequence: Chemical and Topological Design and Innovations in mRNA Therapeutics
2026-Mar-24, Chemical reviews
IF:51.4Q1
DOI:10.1021/acs.chemrev.5c00347
PMID:41875901
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综述 | 本文综述了mRNA治疗中化学和拓扑工程的最新进展，包括修饰方法、合成策略、结构-活性关系及对下一代mRNA疗法的影响 | 引入了拓扑工程作为mRNA设计的新维度，如环状RNA、分支结构和合成套索架构，以调控稳定性、免疫原性和翻译效率 | NA | 探索mRNA的化学和拓扑工程设计，以提升其治疗潜力 | mRNA分子，包括其化学修饰和拓扑结构 | 合成生物学 | 传染病、肿瘤、遗传病 | 化学修饰、拓扑工程、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 8 | 2026-04-05 |
In vivo self-assembled SOD1-siRNAs mitigate muscle atrophy and denervation in amyotrophic lateral sclerosis
2026-Mar-05, Brain : a journal of neurology
IF:10.6Q1
DOI:10.1093/brain/awaf291
PMID:40795306
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研究论文 | 本研究开发了一种合成生物学策略，通过重编程肝脏作为组织底盘，在体内自组装封装SOD1-siRNA的小细胞外囊泡，以靶向脊髓神经元并特异性沉默突变SOD1，从而缓解肌萎缩侧索硬化症小鼠模型的肌肉萎缩和去神经支配 | 提出了一种创新的合成生物学策略，利用肝脏作为组织底盘在体内自组装靶向性小细胞外囊泡，实现了突变SOD1基因的特异性沉默，并设计了基于AAV的长期自组装系统 | 研究仅在Tg(SOD1G93A)转基因小鼠模型中进行，尚未在人类患者中验证；长期安全性和潜在免疫原性未充分评估 | 开发针对肌萎缩侧索硬化症（ALS）的新型基因沉默治疗策略 | Tg(SOD1G93A)转基因小鼠模型（模拟家族性ALS） | 合成生物学 | 肌萎缩侧索硬化症 | siRNA基因沉默技术、小细胞外囊泡递送系统、AAV载体技术 | NA | 动物实验数据、蛋白质水平检测、行为学评估 | Tg(SOD1G93A)转基因小鼠（具体数量未在摘要中说明） | AAV（腺相关病毒）载体 | 小鼠（肝脏细胞） | CMV启动子驱动的合成构建体，编码SOD1-siRNA及sEV表面RVG靶向标签，形成靶向性基因沉默递送系统 | 医学（神经退行性疾病治疗） |
| 9 | 2026-04-05 |
Advances in biocontainment strategies of engineered microbes for use in humans
2026-Mar-03, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2026.102727
PMID:41780106
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综述 | 本文综述了用于人体应用的工程微生物的生物安全策略进展 | 系统总结了多种生物安全策略的当前状态及其在临床试验中的应用与挑战 | NA | 探讨工程微生物在医学应用中的生物安全策略，以确保安全性和最小化环境影响 | 基因工程微生物及其生物安全策略 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | CRISPR, 毒素-抗毒素系统, 杀灭开关 | 微生物 | 生物安全策略包括毒素-抗毒素系统、杀灭开关、营养缺陷型、基于CRISPR的DNA靶向降解、非标准氨基酸和物理屏障 | 医学 |
| 10 | 2026-04-05 |
Synthetic soils for ecological and synthetic biology applications
2026-Jan-02, FEMS microbiology reviews
IF:10.1Q1
DOI:10.1093/femsre/fuag012
PMID:41860425
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综述 | 本文综述了合成土壤在生态学和合成生物学中的应用，探讨了其优势、局限性和未来发展方向 | 提出了“合成土壤”作为标准化可控实验平台的概念，用于在简化定义的环境中系统研究土壤理化性质与生物组分的相互作用 | 合成土壤无法完全复制自然土壤的复杂性和异质性，其简化设计可能忽略某些关键生态过程 | 为生态学和合成生物学研究提供标准化可控的实验平台，以理解土壤中生物与非生物组分的相互作用 | 合成土壤系统及其在生态过程和合成生物学应用中的表现 | 生态学与合成生物学交叉领域 | NA | 合成土壤构建与表征技术 | NA | 文献综述与系统分析 | NA | NA | 微生物、植物、土壤动物等 | NA | 环境, 农业 |
| 11 | 2026-04-05 |
A size filter at the Golgi regulates apical membrane protein sorting
2024-Oct, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-024-01500-0
PMID:39237743
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研究论文 | 本研究通过合成生物学方法揭示了高尔基体存在一种尺寸筛选机制，调控顶端膜蛋白的排序 | 首次发现高尔基体存在基于细胞质结构域尺寸的筛选机制，并阐明Pals1蛋白的适时解离对Crb3正常分选的关键作用 | 研究主要基于三种代表性顶端蛋白（Crb3、Ace2、Muc1），尚未验证该机制在所有顶端膜蛋白中的普适性 | 探究上皮细胞顶端膜蛋白分选的分子机制 | 顶端膜蛋白Crb3、Ace2、Muc1及其细胞质结构域 | 细胞生物学 | NA | 合成生物学方法、链霉亲和素结合肽-生物素释放系统 | NA | 蛋白质定位与转运的细胞生物学数据 | 三种代表性顶端膜蛋白（Crb3、Ace2、Muc1）及其突变体 | 链霉亲和素结合肽标记技术 | 哺乳动物细胞 | 内质网滞留-生物素触发释放的蛋白质转运控制系统 | 基础生物学研究 |
| 12 | 2026-04-05 |
Engineering water exchange is a safe and effective method for magnetic resonance imaging in diverse cell types
2024-Apr-22, Journal of biological engineering
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13036-024-00424-5
PMID:38649904
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研究论文 | 本研究证明水通道蛋白Aqp1可作为安全的遗传报告基因，在不同细胞类型中产生强磁共振信号且不影响细胞生理功能 | 首次系统证明Aqp1过表达不会引起内质网应激，且不影响多种细胞固有生物学功能，解决了其作为深层组织报告基因的安全性质疑 | 研究主要基于体外细胞系实验，尚未在完整生物体内验证长期安全性 | 评估Aqp1作为遗传编码磁共振报告基因的安全性和有效性 | 小鼠和人类来源的多种细胞系 | 合成生物学 | NA | 磁共振成像 | NA | 影像数据 | 多种小鼠和人类细胞系 | 遗传编码 | 哺乳动物细胞 | 水通道蛋白生物传感器 | 医学 |
| 13 | 2026-04-04 |
Reset-free DNA logic circuits for real-time input processing and memory
2026-Apr-03, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aeb1699
PMID:41921006
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研究论文 | 本研究提出了一种基于趾介导链反应的无复位DNA逻辑电路，实现了实时输入处理和记忆功能 | 采用无复位方法，通过趾介导链反应实现双轨单元内的连续可逆链迁移，并利用二维DNA折纸模板定位组件，构建了组合逻辑门和记忆元件 | NA | 开发无复位的DNA逻辑电路，以支持实时数据处理和记忆功能 | DNA逻辑电路，包括组合逻辑门（如AND和OR门）和记忆元件（如置位复位和数据锁存器） | 合成生物学 | NA | 趾介导链反应，DNA折纸技术 | NA | NA | NA | NA | NA | 双轨单元、组合逻辑门（AND和OR门）、记忆元件（置位复位和数据锁存器）、级联寄存器 | 生物传感、诊断、合成生物学 |
| 14 | 2026-04-04 |
Current Progress of Natural Product Export by Yeast
2026-Apr-02, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c08982
PMID:41926336
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综述 | 本文综述了利用酵母缓解天然产物胞内积累所致代谢负担、从而提高其合成效率的最新进展 | 聚焦于通过缓解代谢负担（而非传统代谢工程）来增强酵母天然产物合成的策略，并系统总结了三种具体方法 | NA | 增强微生物细胞工厂中天然产物的合成效率 | 酵母（酿酒酵母等）及其合成的天然产物（重点关注萜类） | 合成生物学 | NA | 代谢工程、转运蛋白过表达与改造、膜结构改造、原位提取 | NA | NA | NA | NA | 酵母（酿酒酵母等） | NA | 工业生物技术 |
| 15 | 2026-04-04 |
NUPACK: Computational Nucleic Acid Analysis and Design
2026-Apr-02, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00817
PMID:41926704
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研究论文 | 介绍NUPACK软件套件，用于核酸结构、设备和系统的分析与设计 | NUPACK 4引入了增强的物理模型、显著的速度提升、大规模复合物处理能力以及混合材料和序列约束设计 | NA | 开发计算工具以支持核酸纳米技术、分子编程和合成生物学领域的研究 | 核酸结构、设备和系统 | 合成生物学 | NA | 计算分析 | NA | 核酸序列数据 | NA | NA | NA | 动态杂交级联反应路径工程和结构工程，包括假结可能性 | 医学, 工业生物技术 |
| 16 | 2026-04-04 |
Food production from air: gas precision fermentation with hydrogen-oxidising bacteria
2026-Apr, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.08.003
PMID:40930898
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研究论文 | 本文探讨了利用氢氧化细菌通过气体发酵从空气中生产食物的技术路径 | 提出将氢氧化细菌工程化为细胞工厂，用于精密发酵，超越单一细胞蛋白生产，并以重组乳蛋白分泌为案例研究 | NA | 开发可持续、独立于农业的食物生产方式，实现碳中和与碳捕获 | 氢氧化细菌（HOBs） | 合成生物学 | NA | 气体发酵、合成生物学、代谢工程、计算建模 | NA | NA | NA | 合成生物学、代谢工程 | 氢氧化细菌 | 细胞工厂设计，用于精密发酵与重组蛋白分泌 | 食品、工业生物技术 |
| 17 | 2026-04-04 |
Are amyloid-based materials conducive to tissue engineering?
2026-Apr, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.08.009
PMID:40975651
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综述 | 本文综述了基于淀粉样蛋白的生物材料在组织工程中的应用潜力，包括其作为细胞培养支架、伤口愈合和类器官开发的材料 | 强调了淀粉样蛋白的独特性质（如稳定性、机械强度和结构多样性）与结构及合成生物学进展的结合，使其成为创新生物材料的有前景候选者 | NA | 探讨淀粉样蛋白基材料在组织工程中的适用性和应用前景 | 淀粉样蛋白原纤维及其作为生物材料的特性 | NA | 阿尔茨海默病, 帕金森病 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学, 生物技术 |
| 18 | 2026-04-04 |
Fighting citrus Huanglongbing with evolutionary principles
2026-Apr, Trends in plant science
IF:17.3Q1
DOI:10.1016/j.tplants.2025.11.004
PMID:41330792
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综述 | 本文综述了基于进化原理的害虫管理策略，并结合人工智能和合成生物学技术，以柑橘黄龙病为例，探讨了可持续农业解决方案 | 提出了进化信息害虫管理（EIPM）框架，将进化原理与人工智能、合成生物学相结合，用于设计持久的生物防治工具 | NA | 开发可持续的农业害虫管理策略，特别是针对柑橘黄龙病 | 柑橘黄龙病（HLB）及其防治 | 农业生物技术 | 柑橘黄龙病 | 人工智能、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 农业 |
| 19 | 2026-04-04 |
Discovery, characterization, and application of chromosomal integration sites in the hyperthermophilic archaeon Sulfolobus islandicus
2026-Apr, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.11.003
PMID:41330849
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研究论文 | 本研究系统性地鉴定并表征了嗜热古菌Sulfolobus islandicus中的染色体整合位点，并利用CRISPR-Cas系统实现了外源基因的整合与表达 | 首次系统性地鉴定并表征了S. islandicus中的8个染色体整合位点，利用CRISPR-COPIES流程和多组学计算工作流程开发了13个人工CRISPR RNAs，并利用内源性CRISPR-Cas系统实现了基因整合 | 研究中发现整合位点存在显著的位置效应，可能影响外源基因的表达效率 | 扩展S. islandicus的遗传工具，推动其作为古菌合成生物学和工业生物技术平台的潜力 | 嗜热古菌Sulfolobus islandicus | 合成生物学 | NA | CRISPR-COPIES流程、多组学计算工作流程、β-半乳糖苷酶测定 | NA | 多组学数据 | NA | CRISPR-Cas | Sulfolobus islandicus | 基因整合系统 | 工业生物技术 |
| 20 | 2026-04-04 |
Techno-economic assessment-guided biofoundry for microbial strain development
2026-Apr, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.11.002
PMID:41330850
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研究论文 | 本文提出了一种基于实验价格指数（EPI）和机器人辅助模块（RAM）的标准化方法，用于评估和优化生物铸造厂中的自动化工作流程，以提高微生物菌株开发的经济效率 | 引入了实验价格指数（EPI）作为结合时间和成本的标准化指标来量化自动化工作流程效率，并提出了机器人辅助模块（RAM）作为即插即用单元来构建工作流程 | 未明确说明该方法在不同类型生物技术应用中的普适性验证程度，也未详细讨论实际部署中可能遇到的技术或操作挑战 | 开发一种标准化方法来评估和优化生物铸造厂中自动化工作流程的经济效率，以加速微生物菌株开发 | 生物铸造厂中的自动化工作流程，特别是用于微生物菌株开发的四个工作流程：gRNA克隆、基因组编辑、DNA组装和样品分析 | 合成生物学 | NA | 设计-构建-测试-学习（DBTL）工作流程、机器人辅助自动化 | NA | 实验时间和成本数据 | NA | CRISPR-Cas9（用于基因组编辑）、DNA组装技术 | 微生物（具体种类未指定） | NA | 工业生物技术 |