合成生物学相关文章
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当前共找到 3707 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2025-10-01 |
A fragment in the 5' untranslated region of alcohol oxidase 1 promoter significantly influencing gene expression of Komagataella phaffii
2025-Oct-15, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2025.149745
PMID:40902693
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研究论文 | 本研究在Komagataella phaffii的醇氧化酶1启动子5'非翻译区鉴定出一个负调控元件D3片段 | 首次发现并验证了13bp的D3片段作为顺式作用负调控元件，敲除该片段可使异源蛋白表达提高3.5倍 | NA | 研究醇氧化酶1启动子调控元件对异源蛋白表达的影响 | Komagataella phaffii微生物及其醇氧化酶1启动子 | 合成生物学 | NA | 基因片段敲除、转录组分析、电泳迁移率变动分析、DNA pull-down、液相色谱-质谱联用 | NA | 基因表达数据、转录组数据、蛋白质相互作用数据 | NA |
| 2 | 2025-10-01 |
Advances in Metabolic Engineering for the Accumulation of Astaxanthin Biosynthesis
2025-Oct, Molecular biotechnology
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s12033-024-01289-1
PMID:39373956
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综述 | 本文全面综述了虾青素生物合成的研究进展，重点关注微生物发酵生产策略 | 系统比较了天然宿主Xanthophyllomyces dendrorhous与异源宿主Yarrowia lipolytica和Saccharomyces cerevisiae在虾青素生物合成中的应用 | 未提及具体实验数据和研究样本量 | 探讨通过代谢工程和合成生物学方法实现虾青素的大规模微生物发酵生产 | 虾青素生物合成途径及相关微生物宿主 | 代谢工程 | NA | 代谢工程、合成生物学、微生物发酵 | NA | 文献综述 | NA |
| 3 | 2025-10-01 |
A tool for modeling gene regulatory networks (GRN_modeler) and its applications to synthetic biology
2025-Sep-29, Molecular systems biology
IF:8.5Q1
DOI:10.1038/s44320-025-00148-8
PMID:41023501
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研究论文 | 开发了一个用于基因调控网络建模的用户友好工具GRN_modeler，并展示了其在合成生物学中的应用 | 开发了具有图形用户界面的GRN_modeler工具，使非编程用户能够创建现象学模型，同时支持命令行操作，能够分析动态行为和空间模式形成 | NA | 开发易于使用的基因调控网络建模工具，促进合成生物学研究 | 基因调控网络、合成生物学系统 | 合成生物学 | NA | 基因调控网络建模与仿真 | 现象学模型 | 网络模型、生物系统数据 | 多个合成生物学案例，包括新型振荡器家族和大肠杆菌光检测生物传感器 |
| 4 | 2025-10-01 |
A Modular and Customizable CRISPR/Cas Toolkit for Epigenome Editing of Cis-regulatory Modules
2025-Sep-29, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202503917
PMID:41024337
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研究论文 | 开发模块化CRISPR/Cas表观基因组编辑工具包用于顺式调控模块的表观遗传编辑 | 创建了模块化表观基因组编辑框架(dCd和dCm系统)，可在原位或异位编程解析和改造CRM活性，并在无DNA甲基化的酵母中重建甲基化依赖性CRM | NA | 解码和重编程顺式调控表观遗传逻辑，开发表观基因组编辑工具 | 顺式调控模块(CRMs)、表观遗传标记、基因调控 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas表观基因组编辑、DNA甲基化/去甲基化、光遗传学 | dCd系统、dCm系统 | 表观遗传数据、基因表达数据 | 植物和酿酒酵母系统 |
| 5 | 2025-10-01 |
Advances in Genetic Transformation of Lactic Acid Bacteria: Overcoming Barriers and Enhancing Plasmid Tools
2025-Sep-19, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26189146
PMID:41009708
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综述 | 综述乳酸菌遗传转化的最新进展，包括DNA导入方法和载体工具的开发 | 系统总结了拓宽菌株适用性的最新方法，包括无残留选择标记的食品级性状改造策略 | 存在菌株间变异性和宿主特异性障碍，仍需定制化解决方案 | 克服乳酸菌DNA摄取障碍并增强质粒工具的开发 | 乳酸菌 | 合成生物学 | NA | 自然感受态、电穿孔、接合、噬菌体介导转导、基因枪技术 | NA | NA | NA |
| 6 | 2025-10-01 |
Smart Phages: Leveraging Artificial Intelligence to Tackle Prosthetic Joint Infections
2025-Sep-19, Antibiotics (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/antibiotics14090949
PMID:41009927
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综述 | 本文探讨如何利用人工智能和机器学习技术改进噬菌体疗法以应对假体关节感染 | 首次系统提出将AI/ML技术应用于噬菌体疗法开发，通过提升可扩展性、效率和精准度来克服传统疗法障碍 | NA | 研究人工智能在噬菌体疗法研究、开发和临床应用中的潜在价值 | 噬菌体疗法及其在假体关节感染治疗中的应用 | 机器学习 | 假体关节感染 | 基因组学、合成生物学 | 机器学习、人工智能 | NA | NA |
| 7 | 2025-10-01 |
Protein and Peptide in Cancer Research: From Biomarker to Biotherapeutics
2025-Sep-17, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17183031
PMID:41008874
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综述 | 全面概述基于蛋白质和肽的癌症诊断与治疗策略的最新研究进展 | 系统整合了蛋白质和肽在癌症精准诊疗中的最新技术进展，包括合成生物学、计算设计和多组学整合分析等新兴技术 | 肽类存在稳定性差、易被酶降解和递送效率低等局限性 | 探讨蛋白质和肽在癌症诊断与治疗中的应用潜力 | 蛋白质和肽类生物分子 | 生物医学研究 | 癌症 | ELISA、质谱分析、CyTOF、合成生物学、计算设计、多组学整合分析 | NA | 生物分子数据 | NA |
| 8 | 2025-10-01 |
The Role of AI-Driven De Novo Protein Design in the Exploration of the Protein Functional Universe
2025-Sep-15, Biology
DOI:10.3390/biology14091268
PMID:41007412
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综述 | 系统综述AI驱动的从头蛋白质设计在探索蛋白质功能宇宙中的作用、方法和应用 | 通过AI计算框架突破自然进化和传统蛋白质工程的限制，实现定制化折叠和功能的蛋白质设计 | 存在持续的技术挑战和局限性 | 探索蛋白质功能宇宙并扩展蛋白质工程的可能性 | 蛋白质序列、结构和功能 | 计算生物学 | NA | AI驱动的计算设计方法 | AI计算框架 | 蛋白质序列和结构数据 | NA |
| 9 | 2025-10-01 |
Engineering Antioxidants with Pharmacological Applications: Biotechnological Perspectives
2025-Sep-12, Antioxidants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/antiox14091110
PMID:41009014
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综述 | 本文探讨了利用生物技术方法生产抗氧化剂的最新进展及其在药理学中的应用 | 系统综述了微生物细胞工厂、酶催化合成、植物细胞培养和代谢工程等生物技术生产抗氧化剂的新策略 | 未提及具体的研究局限性，但指出了规模化生产和成本控制方面的挑战 | 研究生物技术生产抗氧化剂的方法及其在疾病治疗中的应用潜力 | 酶类抗氧化剂（超氧化物歧化酶、过氧化氢酶、谷胱甘肽过氧化物酶）和非酶类抗氧化分子（类胡萝卜素、多酚、维生素） | 生物技术 | 恶性肿瘤、心血管疾病、神经退行性疾病、衰老相关疾病 | 微生物发酵、酶催化合成、植物细胞培养、代谢工程、生物勘探、合成生物学 | NA | 文献资料、临床前和临床数据 | NA |
| 10 | 2025-10-01 |
The tae-miR164-TaNAC6A Module from Winter Wheat Could Enhance Cold Tolerance in Transgenic Arabidopsis thaliana
2025-Sep-12, Plants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/plants14182849
PMID:41012001
|
研究论文 | 本研究揭示了冬小麦中tae-miR164-TaNAC6A模块通过调控抗氧化系统和冷信号通路基因表达来增强植物耐寒性的分子机制 | 首次阐明冬小麦中tae-miR164-TaNAC6A模块在耐寒性调控中的功能，并验证该模块可通过异源表达策略增强拟南芥的耐寒性 | 研究主要在模式植物拟南芥中进行异源表达验证，尚未在小麦本物种中完成功能验证 | 探究冬小麦中tae-miR164-TaNAC6A模块在冷胁迫响应中的分子调控机制 | 冬小麦品种东农冬麦1号(Dn1)和转基因拟南芥 | 植物分子生物学 | 非疾病研究（植物胁迫响应） | 基因过表达、短串联靶标模拟物(STTM)、异源表达、分子生物学分析 | NA | 基因表达数据、生理指标数据、形态观察数据 | 冬小麦品种和转基因拟南芥植株（具体数量未明确说明） |
| 11 | 2025-10-01 |
Synthetic Protein-Assisted Co-Assembly of Zeolitic Imidazolate Framework-8 and Novosphingobium capsulatum for Enhanced Saline-Alkali Resistance of Wheat
2025-Sep-09, Molecules (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/molecules30183669
PMID:41011563
|
研究论文 | 本研究通过合成蛋白辅助构建ZIF-8与Novosphingobium capsulatum的共组装体系，用于增强小麦的盐碱抗性 | 首次通过合成多糖结合蛋白介导的金属有机框架-益生菌共组装体系，实现了益生菌和抗逆分子在作物根际的高效固持 | NA | 开发提高作物盐碱抗性的新型纳米生物技术策略 | 小麦及其根际微生物群落 | 合成生物学与纳米技术 | 作物盐碱胁迫 | 金属有机框架组装、微生物共培养、微生物组分析 | NA | 土壤理化数据、微生物群落数据、植物生理指标 | NA |
| 12 | 2025-10-01 |
Sustainable Production of Ginsenosides: Advances in Biosynthesis and Metabolic Engineering
2025-Sep-09, Plants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/plants14182821
PMID:41011973
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综述 | 本文综述了人参皂苷生物合成与代谢工程的最新进展，重点关注可持续生产方法 | 系统整合了合成生物学在人参皂苷生产中的应用，包括植物细胞培养、工程微生物宿主和无细胞酶合成等先进方法 | NA | 探讨人参皂苷的可持续生产方法，替代传统农业种植模式 | 人参皂苷及其生物合成途径 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、代谢工程、植物细胞培养、微生物工程 | NA | 文献综述 | NA |
| 13 | 2025-10-01 |
Review of the Arbitrium (ARM) System: Molecular Mechanisms, Ecological Impacts, and Applications in Phage-Host Communication
2025-Sep-04, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms13092058
PMID:41011390
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综述 | 本文综述了噬菌体仲裁（ARM）通信系统的分子机制、生态影响及其在噬菌体-宿主通信中的应用潜力 | 首次系统整合了ARM系统这一新发现的噬菌体决策机制的研究进展，强调其在分子水平调控噬菌体群体动态的创新性 | ARM系统是相对较新的发现，相关研究仍处于早期阶段，许多分子细节和生态影响尚未完全阐明 | 深入理解噬菌体仲裁通信系统的分子机制、生态功能及其在生物技术中的应用前景 | 噬菌体及其与细菌宿主的相互作用，特别是ARM通信系统 | 分子生物学与微生物生态学 | NA | 群体感应样肽信号机制 | NA | 文献资料与实验数据 | NA |
| 14 | 2025-10-01 |
Streamline automated biomedical discoveries with agentic bioinformatics
2025-Aug-31, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf505
PMID:41016012
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综述 | 本文探讨了基于大语言模型的智能代理在生物信息学中的新兴领域——代理生物信息学的核心原理、方法和应用 | 提出了代理生物信息学这一新兴研究范式，通过自主、自适应和智能的代理系统解决复杂生物学挑战 | 存在伦理、技术和可扩展性方面的挑战 | 探索代理生物信息学在推动生物医学发现和临床应用的潜力 | 生物信息学系统和生物数据集 | 生物信息学 | NA | 大语言模型 | 智能代理系统 | 生物数据集 | NA |
| 15 | 2025-10-01 |
Biofilms Exposed: Innovative Imaging and Therapeutic Platforms for Persistent Infections
2025-Aug-28, Antibiotics (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/antibiotics14090865
PMID:41009844
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综述 | 探讨生物膜持久性感染的分子机制及创新成像与治疗平台 | 整合超分辨率显微镜、微流控和AI建模等先进技术，提出CRISPR-Cas修饰噬菌体、群体感应拮抗剂等精准生物膜管理策略 | NA | 分析生物膜耐药机制并开发新型诊疗策略 | 临床和工业环境中的生物膜 | 生物医学工程 | 持久性感染 | 超分辨率显微镜、微流控、AI建模、CRISPR-Cas、合成生物学 | AI驱动建模 | NA | NA |
| 16 | 2025-10-01 |
Untangling the Complexity of Two-Component Signal Transduction in Bacteria
2025-Aug-28, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms13092013
PMID:41011345
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综述 | 探讨细菌双组分信号转导系统的非典型结构、调控机制及其在生物技术和医学中的应用潜力 | 系统阐述非典型双组分系统的转录调控多样性、替代性反应调节蛋白活性、磷酸化调控变异及负调控机制，提出信号特异性管理的新视角 | 对非典型双组分系统的生理相关性认知仍存在知识空白 | 解析细菌双组分信号转导系统的复杂性和多样性 | 细菌双组分信号转导系统（TCSs） | 合成生物学 | 细菌感染 | NA | NA | 文献资料 | NA |
| 17 | 2025-10-01 |
The Matter/Life Nexus in Biological Cells
2025-06, Annual review of chemical and biomolecular engineering
IF:7.6Q1
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综述 | 探讨物理学与细胞生物化学在生命/物质关联中的耦合机制 | 整合近十年实验与计算进展，关注空间组织和区室化对布朗运动与流体物理的影响 | 目前仍无法从原子和分子成分从头构建活细胞 | 揭示物质转化为生命的功能增益机制 | 生物细胞 | 系统生物学 | NA | 全细胞建模与合成生物学 | 计算模型 | NA | NA |
| 18 | 2025-10-01 |
Functionalized Protein Binders in Developmental Biology
2024-10, Annual review of cell and developmental biology
IF:11.4Q1
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综述 | 本文综述了功能化蛋白质结合剂在发育生物学中的应用及其技术发展 | 系统总结了蛋白质结合剂与功能域融合实现靶蛋白降解、重定位、可视化和翻译后修饰的创新方法 | NA | 探讨功能化蛋白质结合剂在发育生物学中对蛋白质功能研究的推动作用 | 纳米抗体和其他合成支架衍生的蛋白质结合剂 | 发育生物学 | NA | 蛋白质结合剂技术、计算蛋白质设计、支架工程、合成生物学 | NA | NA | NA |
| 19 | 2025-10-01 |
CRISPR Tools for Engineering Prokaryotic Systems: Recent Advances and New Applications
2024-07, Annual review of chemical and biomolecular engineering
IF:7.6Q1
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综述 | 回顾CRISPR工具在原核生物系统工程中的最新进展与应用 | 从分子工程角度系统阐述CRISPR组件设计策略及其在原核生物中的新型应用 | NA | 总结CRISPR技术在原核生物遗传工程中的应用现状与未来方向 | 原核生物系统 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas系统 | NA | NA | NA |
| 20 | 2025-10-01 |
Accelerating Diverse Cell-Based Therapies Through Scalable Design
2024-07, Annual review of chemical and biomolecular engineering
IF:7.6Q1
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综述 | 本文综述了通过可扩展设计加速多样化细胞疗法发展的方法与前景 | 整合合成生物学工具和先进基因组编写技术，为细胞疗法提供可扩展的设计方案 | NA | 探讨如何通过工程化方法增强细胞功能以推进细胞疗法发展 | 原代细胞和干细胞 | 合成生物学 | NA | 转基因方法、遗传载体设计、基因组编写技术 | NA | NA | NA |