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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-04-26 |
The gut-tumor connection: the role of microbiota in cancer progression and treatment strategies
2026-May, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.08.038
PMID:40850681
|
综述 | 本文全面探讨了肠道微生物群、肿瘤相关微生物群与肿瘤微环境之间的复杂相互作用及其在癌症进展和治疗策略中的角色 | 系统总结了肿瘤内微生物群在不同癌症类型中的多样性及其对肿瘤微环境中细胞、免疫和空间异质性的影响,并评估了多种表征和鉴定肿瘤内微生物群的方法 | 强调了该领域需要标准化方案、先进测序技术和改进的动物模型来克服当前挑战 | 探索肠道微生物群与肿瘤微环境的相互作用,并评估其作为癌症治疗靶点的潜力 | 肠道微生物群、肿瘤相关微生物群和肿瘤微环境 | 微生物组学、肿瘤学 | 癌症 | 测序技术 | NA | 微生物组数据 | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 2 | 2026-04-26 |
Mechanistic Insight into Conformational Control of Enzyme Activity by Genetically Encoded Metal-Responsive Switches
2026-Apr-28, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.70349
PMID:42033023
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研究论文 | 探究基因编码金属响应开关通过构象变化调节酶活性的机制 | 揭示金属螯合二吡啶丙氨酸残基通过局部构象变化调控酶活性,为合成生物学提供可编程蛋白质开关平台 | 未提及具体限制 | 研究基因编码金属响应开关的构象调控机制 | Pyrococcus furiosus 脯氨酰寡肽酶 (Pfu POP) | 合成生物学 | NA | 荧光金属竞争实验、分子动力学模拟、19F NMR光谱 | NA | 实验数据和模拟数据 | NA | 基因编码金属响应系统 | NA | 金属响应开关(基于BpyAla金属螯合) | 合成生物学、生物传感、可编程催化 |
| 3 | 2026-04-26 |
An in vitro approach for simulating divergent Golgi O-glycosylation of tumor-associated MUC1 from normal MUC1
2026-Apr-22, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-72151-y
PMID:42020444
|
研究论文 | 通过体外合成生物学方法模拟肿瘤相关MUC1与正常MUC1的高尔基体O-糖基化差异 | 首次通过体外一锅合成生物学方法模拟糖基转移酶在ER和Golgi中的空间重定位,揭示癌症相关糖基化异常的分子机制 | 体外模拟可能无法完全还原体内复杂的细胞环境,且仅聚焦于MUC1蛋白的特定糖基化位点 | 解码酶定位和底物特异性在肿瘤发生中的驱动作用 | MUC1糖蛋白的O-糖基化途径及肿瘤相关抗原合成 | 合成生物学 | 癌症 | 体外一锅合成生物学方法、动力学模拟、计算机反应动态模拟 | 计算机反应动态模型 | 实验数据、动力学模拟数据 | NA | NA | NA | 体外模拟糖基化级联反应路径 | 医学 |
| 4 | 2026-04-26 |
Tailored Base Editing Toolkits for Functional Genomics and Metabolic Engineering in the Halophile Salinivibrio
2026-Apr-22, Journal of biotechnology
IF:4.1Q2
DOI:10.1016/j.jbiotec.2026.04.012
PMID:42031218
|
研究论文 | 开发出适用于嗜盐菌Salinivibrio sp. TGB4的高效碱基编辑平台,用于功能基因组学和代谢工程 | 首次在非模式嗜盐菌中构建腺嘌呤和胞嘧啶双碱基编辑系统,并设计新颖融合蛋白PmCDA-TadA8e-nCas9-UGI实现协同双碱基编辑,同时揭示acs1基因在乙酸盐代谢和聚(3-羟基丁酸)生物合成中的主导作用 | 未提及对不同靶位点的编辑效率差异或脱靶效应评估 | 开发用于嗜盐菌的高效遗传工具并应用于代谢通路分析 | 嗜盐菌Salinivibrio sp. TGB4 | 合成生物学 | NA | 碱基编辑 | NA | 基因组序列 | 单一菌株Salinivibrio sp. TGB4 | CRISPR-Cas9 | Salinivibrio sp. TGB4 | 碱基编辑系统(ABE、CBE及双碱基编辑器) | 工业生物技术 |
| 5 | 2026-04-26 |
Unveiling the mechanistic principles and engineered exploitation of bacteria and derivatives in precision drug delivery
2026-Apr-20, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108902
PMID:42019701
|
综述 | 系统综述细菌及其衍生物在精准药物递送中的工程策略和应用潜力 | 首次全面比较四种前沿细菌衍生递送系统的机制、载荷特性和工程灵活性,并展望合成生物学与纳米技术的深度融合 | 临床转化挑战分析仍较宏观,缺乏具体案例的定量数据支持 | 阐明细菌衍生递送系统用于精准药物递送的工程原理并评估其应用前景 | 活体生物治疗产品、细菌分泌系统、胞外收缩注射系统、细菌胞外囊泡四种递送平台 | 合成生物学, 纳米技术 | NA | 基因回路设计, 蛋白质工程, 纳米工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson组装, Golden Gate组装 | 细菌(大肠杆菌、沙门氏菌等), 哺乳动物细胞 | 基因回路(传感疾病微环境), 分泌系统(分子注射器), 收缩注射系统(纳米注射器), 胞外囊泡工程改造 | 医学 |
| 6 | 2026-04-26 |
OptoChaperone─A Biohybrid Tool for Regulating Protein Condensates in Cells and In Vitro
2026-Apr-19, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.6c04074
PMID:42002974
|
研究论文 | 本文报道了一种名为OptoChaperone的光激活分子系统,用于在体外和活细胞中调控蛋白质凝聚体 | 利用光响应开关控制分子伴侣活性,实现蛋白质凝聚体的可逆、精准时空调控,无需化学添加剂或基因修饰 | NA | 开发一种可逆、精准调控液-液相分离(LLPS)形成的工具 | 疾病相关的蛋白质凝聚体(如融合肉瘤蛋白、TAR DNA结合蛋白43和热休克因子1) | 合成生物学 | NA | 光激活分子系统 | NA | NA | NA | 光响应开关 | 哺乳动物细胞 | 光控分子伴侣系统(蓝光激活抑制功能使凝聚体解离,紫外光失活使凝聚体形成) | 医学, 合成生物学, 生物分子工程 |
| 7 | 2026-04-26 |
A Combinatorial Strategy of Semirational Screening and Rational Design for Engineering an α-1,2-Fucosyltransferase toward Efficient 2'-Fucosyllactose Biosynthesis
2026-Apr-15, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.6c00566
PMID:41983305
|
研究论文 | 通过联合半理性筛选和理性设计策略工程化α-1,2-岩藻糖基转移酶,实现高效无副产物的2'-岩藻糖基乳糖生物合成 | 首次将理性计算设计与基于岩藻糖响应型生物传感器的半理性筛选相结合,工程化α-1,2-岩藻糖基转移酶BKHT,获得五重突变体M5,实现了无二岩藻糖基乳糖(DFL)副产物的高滴度2'-FL生产 | 摘要中未明确讨论局限性 | 开发无副产物的高效2'-FL微生物合成平台 | 酿酒酵母底物α-1,2-岩藻糖基转移酶BKHT及其突变体 | 合成生物学 | NA | 理性设计、半理性筛选、饱和突变、生物传感器、发酵工程 | NA | NA | NA | NA | 酿酒酵母 | 岩藻糖响应型生物传感器(FcsR-P)、α-1,2-岩藻糖基转移酶催化通路 | 食品工业、生物技术 |
| 8 | 2026-04-26 |
Plant Synthetic Biology Takes Off: Bryophytes Onboard with New Tools, Systems, and Opportunities
2026-Apr-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00092
PMID:41984537
|
综述 | 本文综述了苔藓植物作为合成生物学工具平台的最新进展,强调了其相对于被子植物的优势 | 首次系统总结苔藓植物在植物合成生物学中的潜力,提出利用其简单性加速工具开发和跨植物谱系工程 | 苔藓植物的应用仍处于早期阶段,大部分工作集中在模式物种苔藓上,角苔和地衣的研究相对有限 | 强调苔藓植物作为植物合成生物学新平台的重要性,推动跨谱系生物工程方法建立 | 苔藓、角苔和地衣等苔藓植物 | 合成生物学 | NA | 模块化克隆、基因电路、基因组编辑、合成基因组学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, 模块化克隆 | 苔藓植物(包括苔藓、角苔和地衣) | 基因电路 | 农业, 工业生物技术 |
| 9 | 2026-04-26 |
Bacteriophage research in India and its implications for human health: A scoping review
2026-Feb, The Indian journal of medical research
DOI:10.25259/IJMR_2923_2025
PMID:41949138
|
综述 | 系统调查并分类印度开展的噬菌体研究,重点关注其对人类健康的影响 | 首次系统梳理印度噬菌体研究现状,识别关键差距:缺乏监管框架、临床试验、药代动力学-药效学研究、合成生物学方法和一体化健康监测体系 | 纳入研究以实验室研究为主,临床与转化研究极少;缺乏人体试验和临床试验设计 | 评估印度噬菌体研究对人类健康的意义,并指出未来发展方向 | 印度环境下的噬菌体或噬菌体疗法研究(涉及人类、动物或环境样本) | 机器学习 | 传染病 | NA | NA | 文献数据 | 111篇研究文献 | NA | NA | NA | 医学 |
| 10 | 2026-04-26 |
A comprehensive ruminant microbial catalog (CRMC) reveals convergent selection for key vitamin-synthesizing pathways and genes across ruminants and human
2026-Jan-21, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giag016
PMID:41738843
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研究论文 | 构建反刍动物胃肠道微生物参考基因组目录并揭示维生素合成微生物的路径选择模式 | 首次基于8种反刍动物的大规模宏基因组样本构建统一的反刍动物胃肠道微生物目录,并发现维生素合成微生物在路径和基因节点上存在高度趋同选择模式 | 未明确提及研究局限性 | 系统性阐明反刍动物胃肠道维生素合成微生物的功能特征和生态作用 | 8种反刍动物的胃肠道微生物组 | 微生物组学 | NA | 宏基因组测序 | NA | 宏基因组数据 | 2325个宏基因组样本 | NA | 反刍动物(包括8种宿主) | NA | 微生物合成生物学设计、微生物组干预 |
| 11 | 2026-04-26 |
Repurposing the bacterial surface display technology for drug delivery
2025-Dec, Advanced drug delivery reviews
IF:15.2Q1
DOI:10.1016/j.addr.2025.115701
PMID:41046872
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综述 | 本文探讨了细菌表面展示技术用于药物递送的发展现状与未来方向 | 提出利用AlphaFold等计算工具理性设计外膜锚定蛋白,将合成生物学与免疫工程结合推进工程菌临床转化 | 面临监管障碍和微生物稳定性等挑战 | 评估细菌表面展示技术在药物递送中的应用潜力并规划发展路线 | 细菌表面展示系统(包括革兰氏阴性菌和阳性菌的锚定机制) | 机器学习 | 癌症 | 细菌表面展示 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Golden Gate Assembly | 大肠杆菌, 枯草芽孢杆菌 | 生物传感器, 偶联系统 | 医学, 农业 |
| 12 | 2026-04-26 |
The convergence of AI and synthetic biology: the looming deluge
2025-Jul-01, npj biomedical innovations
DOI:10.1038/s44385-025-00021-1
PMID:42032179
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评论 | 探讨人工智能与合成生物学的融合如何推动生物发现和工程创新,并分析其带来的机遇与风险 | 首次系统阐述AI驱动合成生物学在医学、农业和可持续性领域的变革潜力,并提出治理与伦理策略 | 未提供具体实验验证或案例研究,主要为前瞻性分析 | 评估AI与合成生物学融合的机遇、风险及负责任发展路径 | AI驱动合成生物学的应用场景及治理框架 | 机器学习 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学, 农业, 可持续性 |
| 13 | 2026-04-25 |
Ion- and Temperature-Programmable Reconfiguration of Subcompartments in Synthetic Cells
2026-Apr-28, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.202500928
PMID:42029428
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研究论文 | 提出一种纯镁离子介导的机制,实现合成细胞内亚区室的可逆组装与温度程序化重构 | 首次利用镁离子(Mg²⁺)作为单一介质,实现合成细胞中亚区室的可逆动态组装,并发现温度可编程控制其重新排列,为合成细胞设计提供全新物理化学框架 | 未探讨镁离子介导机制在更复杂合成细胞系统(如含代谢网络或遗传回路)中的适用性及长期稳定性 | 开发基于物理刺激(离子和温度)的可逆亚区室组装机制,推动合成细胞动态组织设计 | 负电荷巨型单层囊泡(GUVs)和中性大单层囊泡(LUVs) | 合成生物学 | NA | NA | NA | 图像 | NA | NA | NA | 可逆亚区室组装系统(基于镁离子桥接的粘附—解离) | 合成生物学 |
| 14 | 2026-04-25 |
Construction and Application of a Multicolor Bactosensor for Detecting Bioavailable Antibiotic Mixtures in the Environment
2026-Apr-24, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00891
PMID:42027138
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研究论文 | 构建了一种多色细菌传感器,用于同时检测环境中的四环素和红霉素,并通过抗生素抗性基因增强性能 | 首次集成两个基于转录因子的传感模块于单个质粒,实现双抗生素混合物的定量区分,并结合智能手机图像分析进行现场检测 | 可能受限于检测特异性对其他抗生素的适用性,以及实际环境样本中复杂基质干扰的验证不足 | 开发一种可现场部署的多色细菌传感器,用于定量检测环境中的生物可利用抗生素混合物 | 四环素和红霉素抗生素混合物 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、荧光传感 | NA | 图像(荧光颜色差异) | 真实水样(未具体说明数量) | 合成生物学、转录因子传感模块 | 细菌(未具体说明种类) | 双转录因子传感模块串联质粒,包含抗生素抗性基因 | 环境监测 |
| 15 | 2026-04-25 |
A combinatorial screening platform for in situ gene delivery to adherent cells via digital microfluidics and flexible electrodes
2026-Apr-24, Lab on a chip
IF:6.1Q2
DOI:10.1039/d6lc00124f
PMID:42029944
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研究论文 | 提出一种集成数字微流控与柔性电极的组合筛选平台,实现贴壁细胞原位基因递送 | 通过数字微流控与柔性叉指电极阵列结合,实现了贴壁细胞的低电压自动电穿孔,避免了酶消化带来的生理应激,并显著降低试剂消耗 | 平台验证主要在eGFP mRNA转染和circRNA重编程上,未评估长期基因编辑效果或体内应用 | 开发一种高吞吐、低试剂消耗且不依赖细胞悬浮的原位基因递送平台 | 贴壁细胞(如人皮肤成纤维细胞) | 数字病理学 | NA | 电穿孔 | NA | 细胞图像 | NA | 数字微流控、柔性叉指电极 | 人皮肤成纤维细胞 | NA | 再生医学, 合成生物学 |
| 16 | 2026-04-25 |
Systematic Categorization and Functional Diversity of Secondary Metabolites from Bacillus spp.: A Review
2026-Apr-24, Probiotics and antimicrobial proteins
IF:4.4Q2
DOI:10.1007/s12602-026-11007-9
PMID:42029996
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综述 | 系统分类基于芽孢杆菌属的次级代谢产物,并总结其功能多样性 | 基于生物合成逻辑和化学骨架系统分类芽孢杆菌次级代谢产物,并整合其作用机制与结构-功能关系 | 代谢产物在复杂混合物中的异质性、产量和可制造性、细胞毒性和稳定性,以及体内特定化合物因果归因的挑战 | 系统分类和总结芽孢杆菌属次级代谢产物的功能多样性及潜在应用 | 芽孢杆菌属产生的次级代谢产物 | 微生物学 | NA | 基因组挖掘、代谢组学去重复、合成生物学 | NA | 化学结构数据、代谢物数据 | NA | 合成生物学 | 芽孢杆菌 | NA | 农业, 食品, 医药 |
| 17 | 2026-04-25 |
Yeast MoClo Secretion and Surface Display Toolkit 2.0: Improvements and Applications for Analysis of protein-protein Interactions and Whole-Cell Biocatalysis
2026-Apr-23, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00085
PMID:42025218
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研究论文 | 介绍了一种改进的MoClo酵母分泌和表面展示工具包2.0及其在蛋白质-蛋白质相互作用分析和全细胞生物催化中的应用 | 通过添加基于截短Aga1和C端融合Aga2的锚蛋白编码部件、GFP荧光互补检测部件及分泌增强蛋白编码部件,提升了工具包的检测通量和分泌效率 | 未具体说明局限性 | 改进和发展模块化克隆酵母分泌和表面展示工具包,拓展其在蛋白质相互作用分析和全细胞生物催化中的应用 | 酵母(Saccharomyces cerevisiae)及其分泌和表面展示系统 | 合成生物学 | NA | MoClo(模块化克隆), 酵母表面展示, GFP荧光互补, 流式细胞术, 免疫共沉淀 | NA | NA | NA | MoClo, Golden Gate Assembly | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae) | 表面展示系统(Aga1-Aga2锚定系统),分泌增强部件,GFP荧光互补检测系统 | 工业生物技术, 合成生物学, 生物催化 |
| 18 | 2026-04-25 |
Tunable low-rate genomic recombination with Cre-lox in Escherichia coli: a versatile tool for anoxic environmental biosensing and synthetic biology
2026-Apr-22, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.01768-25
PMID:41870091
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研究论文 | 开发了一种在大肠杆菌中通过Cre-lox系统实现低速率可调控基因组重组的工具,并展示了其在厌氧环境砷生物传感和合成生物学中的应用 | 首次实现了严格调控、可滴定的低速率Cre重组酶系统,在染色体上实现优越的遗传记忆保持,并将暴露检测与测量解耦,用于厌氧条件下的砷传感 | NA | 开发一种可在厌氧环境中实现低速率、可遗传基因组重组的工具,用于环境生物传感和合成生物学应用 | 大肠杆菌中的Cre重组酶系统及其在砷传感中的应用 | 合成生物学 | NA | Cre-lox重组,全细胞生物传感 | NA | 荧光信号 | NA | Cre-lox系统 | 大肠杆菌 | 可诱导的Cre重组酶系统,用于基因组可逆记忆存储 | 环境监测,合成生物学,生物工程 |
| 19 | 2026-04-25 |
Systematic investigation of double emulsion dewetting dynamics for the robust production of giant unilamellar vesicles
2026-Apr-22, Lab on a chip
IF:6.1Q2
DOI:10.1039/d6lc00098c
PMID:42018534
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研究论文 | 系统研究双乳液去润湿动力学以实现巨大单层囊泡的稳健生产 | 揭示脂质组成、水相条件、液滴限制和流体动力学对去润湿过程的平衡作用,以及Maranoni应力与热力学界面力之间的关键平衡 | 未提及具体局限性信息 | 提高液滴微流控GUV平台的可靠性和可及性,推动生物物理学、合成生物学和药物发现领域的发展 | 巨大单层囊泡(GUVs) | NA | NA | 双乳液液滴微流体 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 生物物理学, 合成生物学, 药物发现 |
| 20 | 2026-04-25 |
Recurrent neural chemical reaction networks that approximate arbitrary dynamics
2026-Apr-22, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2026.101572
PMID:42025162
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研究论文 | 提出一种名为“递归神经化学反应网络”的分子版递归人工神经网络,可逼近任意动力学 | 首次将递归神经网络架构与化学反应网络结合,实现可训练、可编程的复杂动力学系统 | 实验验证依赖DNA链置换技术,实际合成网络的反应速率可能受限于现有实验条件 | 构建能模拟多稳态、振荡、混沌等生物化学动力学的合成化学反应网络 | 化学神经元组成的递归化学反应网络 | 合成生物学 | NA | DNA链置换技术 | 递归神经网络 | NA | NA | DNA链置换 | NA | 递归神经网络化学电路 | 合成生物学,分子纳米技术 |