合成生物学相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['synthetic biology']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价9.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 4821 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-04-25 |
Ion- and Temperature-Programmable Reconfiguration of Subcompartments in Synthetic Cells
2026-Apr-28, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.202500928
PMID:42029428
|
研究论文 | 提出一种纯镁离子介导的机制，实现合成细胞内亚区室的可逆组装与温度程序化重构 | 首次利用镁离子（Mg²⁺）作为单一介质，实现合成细胞中亚区室的可逆动态组装，并发现温度可编程控制其重新排列，为合成细胞设计提供全新物理化学框架 | 未探讨镁离子介导机制在更复杂合成细胞系统（如含代谢网络或遗传回路）中的适用性及长期稳定性 | 开发基于物理刺激（离子和温度）的可逆亚区室组装机制，推动合成细胞动态组织设计 | 负电荷巨型单层囊泡（GUVs）和中性大单层囊泡（LUVs） | 合成生物学 | NA | NA | NA | 图像 | NA | NA | NA | 可逆亚区室组装系统（基于镁离子桥接的粘附—解离） | 合成生物学 |
| 2 | 2026-04-25 |
Construction and Application of a Multicolor Bactosensor for Detecting Bioavailable Antibiotic Mixtures in the Environment
2026-Apr-24, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00891
PMID:42027138
|
研究论文 | 构建了一种多色细菌传感器，用于同时检测环境中的四环素和红霉素，并通过抗生素抗性基因增强性能 | 首次集成两个基于转录因子的传感模块于单个质粒，实现双抗生素混合物的定量区分，并结合智能手机图像分析进行现场检测 | 可能受限于检测特异性对其他抗生素的适用性，以及实际环境样本中复杂基质干扰的验证不足 | 开发一种可现场部署的多色细菌传感器，用于定量检测环境中的生物可利用抗生素混合物 | 四环素和红霉素抗生素混合物 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、荧光传感 | NA | 图像（荧光颜色差异） | 真实水样（未具体说明数量） | 合成生物学、转录因子传感模块 | 细菌（未具体说明种类） | 双转录因子传感模块串联质粒，包含抗生素抗性基因 | 环境监测 |
| 3 | 2026-04-25 |
A combinatorial screening platform for in situ gene delivery to adherent cells via digital microfluidics and flexible electrodes
2026-Apr-24, Lab on a chip
IF:6.1Q2
DOI:10.1039/d6lc00124f
PMID:42029944
|
研究论文 | 提出一种集成数字微流控与柔性电极的组合筛选平台，实现贴壁细胞原位基因递送 | 通过数字微流控与柔性叉指电极阵列结合，实现了贴壁细胞的低电压自动电穿孔，避免了酶消化带来的生理应激，并显著降低试剂消耗 | 平台验证主要在eGFP mRNA转染和circRNA重编程上，未评估长期基因编辑效果或体内应用 | 开发一种高吞吐、低试剂消耗且不依赖细胞悬浮的原位基因递送平台 | 贴壁细胞（如人皮肤成纤维细胞） | 数字病理学 | NA | 电穿孔 | NA | 细胞图像 | NA | 数字微流控、柔性叉指电极 | 人皮肤成纤维细胞 | NA | 再生医学, 合成生物学 |
| 4 | 2026-04-25 |
Systematic Categorization and Functional Diversity of Secondary Metabolites from Bacillus spp.: A Review
2026-Apr-24, Probiotics and antimicrobial proteins
IF:4.4Q2
DOI:10.1007/s12602-026-11007-9
PMID:42029996
|
综述 | 系统分类基于芽孢杆菌属的次级代谢产物，并总结其功能多样性 | 基于生物合成逻辑和化学骨架系统分类芽孢杆菌次级代谢产物，并整合其作用机制与结构-功能关系 | 代谢产物在复杂混合物中的异质性、产量和可制造性、细胞毒性和稳定性，以及体内特定化合物因果归因的挑战 | 系统分类和总结芽孢杆菌属次级代谢产物的功能多样性及潜在应用 | 芽孢杆菌属产生的次级代谢产物 | 微生物学 | NA | 基因组挖掘、代谢组学去重复、合成生物学 | NA | 化学结构数据、代谢物数据 | NA | 合成生物学 | 芽孢杆菌 | NA | 农业, 食品, 医药 |
| 5 | 2026-04-25 |
Yeast MoClo Secretion and Surface Display Toolkit 2.0: Improvements and Applications for Analysis of protein-protein Interactions and Whole-Cell Biocatalysis
2026-Apr-23, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00085
PMID:42025218
|
研究论文 | 介绍了一种改进的MoClo酵母分泌和表面展示工具包2.0及其在蛋白质-蛋白质相互作用分析和全细胞生物催化中的应用 | 通过添加基于截短Aga1和C端融合Aga2的锚蛋白编码部件、GFP荧光互补检测部件及分泌增强蛋白编码部件，提升了工具包的检测通量和分泌效率 | 未具体说明局限性 | 改进和发展模块化克隆酵母分泌和表面展示工具包，拓展其在蛋白质相互作用分析和全细胞生物催化中的应用 | 酵母（Saccharomyces cerevisiae）及其分泌和表面展示系统 | 合成生物学 | NA | MoClo（模块化克隆）, 酵母表面展示, GFP荧光互补, 流式细胞术, 免疫共沉淀 | NA | NA | NA | MoClo, Golden Gate Assembly | 酿酒酵母（Saccharomyces cerevisiae） | 表面展示系统（Aga1-Aga2锚定系统），分泌增强部件，GFP荧光互补检测系统 | 工业生物技术, 合成生物学, 生物催化 |
| 6 | 2026-04-25 |
Tunable low-rate genomic recombination with Cre-lox in Escherichia coli: a versatile tool for anoxic environmental biosensing and synthetic biology
2026-Apr-22, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.01768-25
PMID:41870091
|
研究论文 | 开发了一种在大肠杆菌中通过Cre-lox系统实现低速率可调控基因组重组的工具，并展示了其在厌氧环境砷生物传感和合成生物学中的应用 | 首次实现了严格调控、可滴定的低速率Cre重组酶系统，在染色体上实现优越的遗传记忆保持，并将暴露检测与测量解耦，用于厌氧条件下的砷传感 | NA | 开发一种可在厌氧环境中实现低速率、可遗传基因组重组的工具，用于环境生物传感和合成生物学应用 | 大肠杆菌中的Cre重组酶系统及其在砷传感中的应用 | 合成生物学 | NA | Cre-lox重组，全细胞生物传感 | NA | 荧光信号 | NA | Cre-lox系统 | 大肠杆菌 | 可诱导的Cre重组酶系统，用于基因组可逆记忆存储 | 环境监测，合成生物学，生物工程 |
| 7 | 2026-04-25 |
Systematic investigation of double emulsion dewetting dynamics for the robust production of giant unilamellar vesicles
2026-Apr-22, Lab on a chip
IF:6.1Q2
DOI:10.1039/d6lc00098c
PMID:42018534
|
研究论文 | 系统研究双乳液去润湿动力学以实现巨大单层囊泡的稳健生产 | 揭示脂质组成、水相条件、液滴限制和流体动力学对去润湿过程的平衡作用，以及Maranoni应力与热力学界面力之间的关键平衡 | 未提及具体局限性信息 | 提高液滴微流控GUV平台的可靠性和可及性，推动生物物理学、合成生物学和药物发现领域的发展 | 巨大单层囊泡（GUVs） | NA | NA | 双乳液液滴微流体 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 生物物理学, 合成生物学, 药物发现 |
| 8 | 2026-04-25 |
Recurrent neural chemical reaction networks that approximate arbitrary dynamics
2026-Apr-22, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2026.101572
PMID:42025162
|
研究论文 | 提出一种名为“递归神经化学反应网络”的分子版递归人工神经网络，可逼近任意动力学 | 首次将递归神经网络架构与化学反应网络结合，实现可训练、可编程的复杂动力学系统 | 实验验证依赖DNA链置换技术，实际合成网络的反应速率可能受限于现有实验条件 | 构建能模拟多稳态、振荡、混沌等生物化学动力学的合成化学反应网络 | 化学神经元组成的递归化学反应网络 | 合成生物学 | NA | DNA链置换技术 | 递归神经网络 | NA | NA | DNA链置换 | NA | 递归神经网络化学电路 | 合成生物学,分子纳米技术 |
| 9 | 2026-04-25 |
Enhanced tRNA array method version 2 for simultaneous in vitro synthesis of 21 tRNAs
2026-Apr-22, Journal of bioscience and bioengineering
IF:2.3Q3
DOI:10.1016/j.jbiosc.2026.03.014
PMID:42025521
|
研究论文 | 开发了tRNA阵列方法第二版，实现21种tRNA的同步体外合成并提升翻译活性 | 通过鉴定限制翻译的tRNA组（PIEN组）并引入序列修饰和前导序列，使阵列合成tRNA的翻译活性达到与单独制备tRNA相当的水平 | NA | 改进tRNA阵列方法以构建自我复制的基因表达系统 | tRNA阵列方法和翻译活性 | 合成生物学 | NA | 体外转录、翻译耦合实验 | NA | NA | 21种tRNA及多种报告蛋白 | NA | NA | tRNA表达阵列（含前导序列修饰） | 合成生物学、生物技术 |
| 10 | 2026-04-15 |
The next frontier: Exploring plant hypoxia sensing and response mechanisms through synthetic biology
2026-Apr-21, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2606254123
PMID:41973930
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 11 | 2026-04-25 |
A biosynthetic survey of hypocrealean biocontrol fungi
2026-Apr-16, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/s41589-026-02201-5
PMID:41991721
|
研究论文 | 通过系统发育基因组学、代谢组学和异源表达方法，对82种与植物和昆虫相关的肉座菌目真菌的生物合成能力进行了全面调查 | 首次大规模揭示了肉座菌目真菌的生物合成基因库，约80%的基因簇编码未知产物，并利用合成生物学鉴定了四种参与未知产物合成的非核糖体肽合成酶样合成酶 | 主要依赖于生物信息学注释和异源表达，部分未知产物的功能验证可能受限于实验条件 | 探索肉座菌目生物防治真菌的生物合成潜力，为可持续农业害虫防治奠定基础 | 82种与植物和昆虫相关的肉座菌目真菌 | 机器学习 | NA | 系统发育基因组学, 代谢组学, 异源表达 | NA | 基因组数据, 代谢组数据 | 82种真菌菌株 | 合成生物学 | NA | NA | 农业 |
| 12 | 2026-04-25 |
PHYCUT: Scalable Multiplex CRISPR/Cas9 Editing for Genome Engineering in the Diatom Phaeodactylum tricornutum
2026-Apr-14, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00843
PMID:41979903
|
研究论文 | 开发PHYCUT工具，实现硅藻Phaeodactylum tricornutum中多重CRISPR/Cas9基因编辑 | 首次在硅藻中建立基于Csy4核酸内切酶处理多向导RNA阵列的质粒型CRISPR/Cas9多重编辑系统，实现三个α(1,3)岩藻糖基化相关基因的同步敲除 | 未提及对非目标位点的脱靶效应评估及编辑效率的定量统计 | 建立硅藻多重基因编辑平台以优化其糖基化途径，降低重组蛋白免疫原性 | 海洋硅藻Phaeodactylum tricornutum | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9, Csy4核酸内切酶介导的多向导RNA加工 | NA | NA | 针对三个α(1,3)岩藻糖基化相关基因进行编辑的硅藻菌株 | CRISPR-Cas9 | 三角褐指藻(Phaeodactylum tricornutum) | Csy4处理多向导RNA阵列的CRISPR/Cas9编辑系统 | 工业生物技术, 医药 |
| 13 | 2026-04-25 |
Engineering oncolytic bacteria as precision cancer therapeutics: design principles, therapeutic strategies, and translational perspectives
2026-Apr-01, Protein & cell
IF:13.6Q1
DOI:10.1093/procel/pwaf085
PMID:41128615
|
综述 | 该综述总结了工程化溶瘤细菌作为精准癌症治疗平台的设计原理、治疗策略及转化前景 | 系统梳理了基于合成生物学的可诱导和自主回路设计，包括感知外源信号、细菌自身信号及肿瘤微环境特征，并整合了与免疫检查点阻断、CAR-T/NK细胞治疗等多模态协同治疗策略 | 未具体讨论临床转化中的安全性、制造工艺、剂量优化及患者选择等实际挑战 | 为工程化溶瘤细菌在精准癌症治疗中的应用提供设计框架和转化思路 | 工程化溶瘤细菌及其在肿瘤微环境中的治疗机制 | 合成生物学, 肿瘤学 | 癌症 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | 感知回路（外源信号、细菌自信号、肿瘤特异性生理信号）、定制化裂解和时空可控递送回路 | 医学 |
| 14 | 2026-04-25 |
From Gene Knockouts to Genome Remodeling: Large DNA Fragment Deletion Technologies in Plants
2026-Mar-15, Plants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/plants15060909
PMID:41901428
|
综述 | 系统比较植物中用于大DNA片段删除（LDFD）的主要技术，包括ZFNs、TALENs、CRISPR/Cas系统、位点特异性重组酶、转座子系统及引物编辑衍生策略，并讨论当前瓶颈与未来方向 | 首次全面比较植物中多种LDFD技术的机制与效率，强调植物特异性染色质组织和DNA修复对删除效果的约束，并展望AI辅助设计核酸酶与重组酶等新方向 | NA | 综述植物中大DNA片段删除技术的现状、瓶颈及未来发展方向，以推动功能基因组学与理性基因组设计 | 植物中已应用的大DNA片段删除技术 | NA | NA | ZFNs, TALENs, CRISPR/Cas系统（Cas9、Cas12a、Cas3），位点特异性重组酶，转座子系统，引物编辑衍生策略 | NA | NA | NA | ZFNs, TALENs, CRISPR-Cas9, CRISPR-Cas12a, CRISPR-Cas3, 位点特异性重组酶, 转座子系统, 引物编辑衍生策略 | 植物 | NA | 农业， 工业生物技术 |
| 15 | 2026-04-25 |
Engineered Bacteriophages: A Next-Generation Platform for Precision Antimicrobials and Therapeutics
2026-Mar-13, Viruses
DOI:10.3390/v18030355
PMID:41902263
|
综述 | 系统总结了工程化噬菌体在制备技术、抗菌应用和癌症治疗中的进展，并分析了临床转化的挑战 | 提出工程化噬菌体作为可定制的精准生物工具，融合合成生物学、医学和环境科学，为抗菌药物耐药性危机提供变革性解决方案 | 监管审批、大规模生产和长期安全性验证等关键挑战尚未解决 | 总结工程化噬菌体的制备技术及其在精准抗菌和医疗中的应用前景 | 工程化噬菌体 | 合成生物学 | 抗菌药物耐药性感染、胃肠道疾病、癌症 | NA | NA | NA | NA | 基因修饰、化学偶联、物理封装 | 噬菌体 | 工程化噬菌体作为精准抗菌剂、靶向递送载体、免疫佐剂 | 医学、环境科学 |
| 16 | 2026-04-25 |
A comprehensive ruminant microbial catalog (CRMC) reveals convergent selection for key vitamin-synthesizing pathways and genes across ruminants and human
2026-Jan-21, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giag016
PMID:41738843
|
研究论文 | 基于8种反刍动物2325份宏基因组样本构建了综合反刍动物胃肠道微生物目录（CRMC），并揭示了维生素合成微生物的途径偏好和分布模式 | 首次大规模构建了涵盖39,696个宏基因组组装基因组的反刍动物胃肠道微生物目录，绘制率高达83.45%；发现了维生素合成微生物在反刍动物与人类肠道中具有统一的途径选择模式，并揭示了功能基因节点的趋同共选压力 | 未在论文摘要中明确说明研究的局限性 | 系统阐明反刍动物胃肠道中维生素合成微生物的功能特征、生态角色及其在不同宿主间的分布规律 | 8种反刍动物的胃肠道微生物组（包括瘤胃、肠道等部位的宏基因组数据） | 微生物组学 | NA | 宏基因组测序 | NA | 宏基因组数据 | 2325份宏基因组样本，来自8种反刍动物宿主 | NA | 反刍动物（多种宿主） | NA | 农业, 医学 |
| 17 | 2026-04-25 |
Unlocking lignin valorization and harnessing lignin-based raw materials for bio-manufacturing
2025-04, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-024-2792-x
PMID:39704933
|
综述 | 本文综述了利用生物策略实现木质素增值以及将木质素转化为生物制造原料的最新进展 | 综合了木质素降解酶、代谢工程、合成生物学和人工智能驱动技术等多学科交叉方法，提出利用数字系统和人工智能技术促进木质素商业化的创新观点 | 主要基于现有文献分析，可能缺乏大规模实际应用验证数据，且未深入探讨技术经济可行性 | 探索木质素增值的有效生物转化途径，推动将其作为可持续原料用于生物基制造 | 木质素及其衍生物的降解与转化工艺、相关酶系统、代谢途径及工程菌株 | NA | NA | 木质素降解酶、代谢工程、遗传工程 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 木质素降解菌株或菌群 | 三羧酸循环代谢路径重定向 | 环境、能源、工业生物技术 |
| 18 | 2026-04-25 |
Designing biological network motif-based controllers by reverse engineering Hill function-type models from linear models
2025-Apr, Journal of the Royal Society, Interface
DOI:10.1098/rsif.2024.0811
PMID:40262636
|
研究论文 | 提出一种逆向工程方法，从线性模型分析推断非线性Hill函数模型的动力学参数，用于设计实现完美适应的生物控制器 | 首次提出将线性系统理论与非线性Hill函数建模相结合进行逆向工程，实现生物网络基序控制器的设计 | 研究仅通过仿真验证了方法的有效性，缺乏实验验证 | 设计能够实现完美适应的合成生物控制器 | 三种基于生物网络基序的控制器 | 系统生物学 | NA | NA | Hill函数模型、线性模型 | 仿真数据 | NA | NA | NA | 生物网络基序控制器 | 合成生物学 |
| 19 | 2026-04-25 |
Advancing CRISPR base editing technology through innovative strategies and ideas
2025-03, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-024-2699-5
PMID:39231901
|
综述 | 重点介绍基于CRISPR平台的非DSB编辑器BE和PE的开发与创新，探讨改进策略及未来理想编辑器的发展前景 | 系统归纳了“替换”、“组合”、“适应”和“调整”等改进思路在BE和PE开发中的应用，并阐述了CRISPR技术创新中的巧妙思维反转与跳跃 | 未具体探讨CRISPR碱基编辑技术在实际应用中可能面临的脱靶效应或伦理问题 | 综述CRISPR碱基编辑技术通过创新策略和思路的进展，展望未来理想编辑器的开发 | 基于CRISPR平台的碱基编辑器（BE）和先导编辑器（PE） | 合成生物学 | NA | CRISPR碱基编辑, 先导编辑, AAV递送系统 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | NA | 碱基编辑器, 先导编辑器, 小型编辑器 | 医学, 农业, 工业生物技术 |
| 20 | 2026-04-25 |
Morphology remodelling and membrane channel formation in synthetic cells via reconfigurable DNA nanorafts
2025-Feb, Nature materials
IF:37.2Q1
DOI:10.1038/s41563-024-02075-9
PMID:39805958
|
研究论文 | 利用可重构DNA纳米筏构建合成细胞模型，实现形态重塑和膜通道形成 | 将DNA纳米筏在纳米尺度的重塑与巨型单层囊泡在微米尺度的重塑耦合，通过可编程方式改变囊泡形态，并利用生物孔辅助形成可密封的合成通道 | NA | 探索可重构DNA纳米结构与合成细胞之间的界面，扩展DNA纳米技术在合成生物学中的应用潜力 | 信号响应型DNA纳米筏、生物孔和巨型单层囊泡组成的合成细胞模型 | NA | NA | DNA纳米技术 | NA | NA | NA | DNA纳米技术 | NA | 可重构DNA纳米筏网络 | 合成生物学 |