合成生物学相关文章
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当前共找到 3185 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2025-06-02 |
A cell-free biosensor signal amplification circuit with polymerase strand recycling
2025-Jun, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/s41589-024-01816-w
PMID:39806069
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研究论文 | 本文介绍了一种名为聚合酶链回收（PSR）的无细胞生物传感器信号放大电路，用于提高小分子检测的灵敏度 | 利用T7 RNA聚合酶的脱靶转录特性，在DNA链置换电路中回收核酸输入，显著提高了生物传感器的检测灵敏度 | NA | 扩展无细胞生物传感技术的能力，提高小分子检测的灵敏度 | 无细胞系统中的基因电路和生物传感器 | 合成生物学 | NA | 聚合酶链回收（PSR）技术 | 双平衡模型 | 核酸数据 | NA |
| 2 | 2025-06-02 |
Catalytic mechanism and engineering of aromatic prenyltransferase: A review
2025-Jun, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.144214
PMID:40379159
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review | 本文系统总结了芳香族异戊二烯基转移酶的催化机制和工程化研究进展，并探讨了当前挑战和未来研究方向 | 提出了整合人工智能和深度学习的创新工程化方法，以开发高性能生物催化剂 | 当前面临的挑战包括催化活性不足、底物特异性狭窄以及多酶级联系统和固定化技术的限制 | 指导芳香族异戊二烯基转移酶在合成生物学和药物创新中的工程化和规模化应用 | 芳香族异戊二烯基转移酶及其催化机制 | 合成生物学 | NA | 蛋白工程、人工智能、深度学习 | NA | NA | NA |
| 3 | 2025-06-02 |
From molecular mechanisms to clinical translation: Silk fibroin-based biomaterials for next-generation wound healing
2025-Jun, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.144266
PMID:40381758
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综述 | 本文系统总结了丝素蛋白及其复合材料在伤口愈合中的制备策略、功能修饰和多维应用机制，并探讨了其在精准医学中的潜力 | 整合了丝素蛋白分子机制和材料设计的最新进展，强调其在精准医学中的潜力，如开发基因工程丝素蛋白用于定制免疫调节网络 | 当前丝素蛋白材料开发面临的挑战包括机械稳定性、降解可控性以及大规模生产的标准化 | 开发高效、多功能且可临床转化的基于丝素蛋白的材料，用于伤口愈合 | 丝素蛋白及其复合材料 | 生物材料 | 伤口愈合 | 3D生物打印和合成生物学技术 | NA | NA | NA |
| 4 | 2025-06-02 |
Development of a chemically induced dissociation system via phage surface-displayed nanobody screening
2025-May-31, FEBS letters
IF:3.0Q3
DOI:10.1002/1873-3468.70084
PMID:40448527
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研究论文 | 开发了一种通过噬菌体表面展示纳米抗体筛选的化学诱导解离系统，用于调控蛋白质间相互作用 | 利用噬菌体展示方法筛选出可与FDA批准小分子药物相互作用的纳米抗体，建立化学诱导解离系统（CIDiss） | NA | 开发一种可诱导调控蛋白质功能的化学方法，用于合成生物学和细胞治疗 | 丙型肝炎病毒蛋白酶NS3a与纳米抗体的相互作用 | 合成生物学 | 丙型肝炎 | 噬菌体展示 | NA | NA | NA |
| 5 | 2025-06-02 |
A solution to the postantibiotic era: phages as precision medicine
2025-May-30, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2025.102613
PMID:40449069
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research paper | 探讨噬菌体作为精准医学解决方案以应对抗生素耐药性细菌感染 | 结合基因工程、合成生物学和人工智能技术，定制化设计噬菌体以扩大宿主范围、克服细菌免疫系统并调节宿主细菌 | NA | 解决抗生素耐药性危机，提供精准医学替代方案 | 抗生素耐药性细菌感染 | precision medicine | bacterial infections | genetic engineering, synthetic biology, artificial intelligence, machine learning | NA | NA | NA |
| 6 | 2025-06-02 |
Synthetic Biology for Designing Allostery and Its Potential Biomedical Applications
2025-May-21, Journal of molecular biology
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.jmb.2025.169225
PMID:40409706
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研究论文 | 本文探讨了利用合成生物学原理设计变构调节及其在生物医学和生物技术中的应用潜力 | 通过合成生物学策略设计变构蛋白调节机制，包括变构调节剂的设计、从头变构蛋白开关的生成以及工程化变构机制在细胞功能控制中的应用 | NA | 探索合成生物学在变构调节设计中的应用及其在生物医学领域的潜力 | 蛋白质的变构调节机制 | 合成生物学 | NA | 人工智能生成蛋白质设计 | NA | NA | NA |
| 7 | 2025-06-02 |
Recent Advances in Multiple Strategies for the Biosynthesis of Sesquiterpenols
2025-May-03, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom15050664
PMID:40427558
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review | 本文综述了倍半萜醇生物合成的最新策略和进展 | 介绍了合成生物学在微生物生产倍半萜醇中的创新方法，包括适应性合成酶筛选与表达、合成途径调控、细胞内区室化表达策略以及对萜类相关毒性的耐受性 | 低产量和高生产成本阻碍了其工业规模应用 | 探讨倍半萜醇生物合成的最新合成生物学策略和进展 | 倍半萜醇 | 合成生物学 | NA | 微生物系统异源合成 | NA | NA | NA |
| 8 | 2025-06-02 |
The Application of Multiple Strategies to Enhance Methylparaben Synthesis Using the Engineered Saccharomyces cerevisiae
2025-Apr-25, Biology
DOI:10.3390/biology14050469
PMID:40427658
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研究论文 | 本研究利用工程化的酿酒酵母构建甲基对羟基苯甲酸酯（MP）的生物合成途径，并应用多种代谢工程策略突破合成过程中的瓶颈 | 通过调控内源莽草酸途径的限速步骤、增强中心碳通量及改进外源酶表达，实现了MP在酿酒酵母中的高效合成，产量达到68.59 mg/L，为目前报道的最高水平 | 研究仅在摇瓶水平进行验证，尚未进行大规模发酵或工业化生产的测试 | 开发环境友好的MP生物合成方法以替代传统化学合成工艺 | 工程化改造的酿酒酵母菌株 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、启动子工程、基因敲除 | NA | NA | NA |
| 9 | 2025-06-02 |
Crosslinking intermodular condensation in non-ribosomal peptide biosynthesis
2025-Feb, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-08306-y
PMID:39663458
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research paper | 该研究开发了位点选择性交联探针，用于构象约束和解析非核糖体肽合成酶中载体蛋白与其伴侣酶域之间的相互作用 | 利用四嗪点击化学捕获载体蛋白底物在缩合域活性位点的缩合过程，并报告了该复合物的高分辨率冷冻电镜结构 | 研究主要关注于酪氨酸生物合成前两个模块的载体蛋白与缩合域的相互作用，可能未涵盖其他模块的类似过程 | 理解非核糖体肽合成酶的分子细节，为未来合成生物学设计提供关键信息 | 非核糖体肽合成酶中的载体蛋白及其伴侣酶域 | 生物化学 | NA | 四嗪点击化学, 冷冻电镜, X射线晶体学 | NA | 结构数据 | NA |
| 10 | 2025-06-02 |
Cleavable donor-assisted CRISPR/Cas9 system significantly improves the efficiency of large DNA insertion in Physcomitrium patens
2025-Feb, The Plant journal : for cell and molecular biology
DOI:10.1111/tpj.70020
PMID:39981890
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研究论文 | 本研究开发了一种体内可切割供体辅助的CRISPR/Cas9系统，显著提高了大型DNA片段在小立碗藓中的插入效率 | 开发了含有两个Cas9核酸酶识别位点的IVC供体，能够在体内释放线性模板，从而提高大片段DNA的插入效率 | 该方法目前仅适用于能够进行原生质体转化和再生的作物 | 提高CRISPR/Cas9介导的大片段DNA插入效率 | 小立碗藓（Physcomitrium patens） | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9基因编辑 | NA | DNA序列数据 | 评估了两种不同的sgRNA和四种不同的DNA插入片段 |
| 11 | 2025-06-01 |
Label-free high-throughput live-cell sorting of genome-wide random mutagenesis libraries for metabolic traits by Raman flow cytometry
2025-Jun-03, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2503641122
PMID:40445753
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research paper | 该论文介绍了一种基于拉曼流式细胞术的无标记高通量活细胞分选技术，用于代谢特性的基因组范围随机突变库筛选 | 开发了基于正介电电泳诱导确定性侧向位移（pDEP-DLD）的拉曼激活细胞分选（pDEP-DLD-RACS），实现了高精度、高通量、高产量且能保持细胞活力的罕见目标细胞分选 | NA | 开发一种高效的无标记细胞分选技术，用于从基因组范围随机突变库中筛选具有特定代谢特性的细胞 | 色素和油脂生产酵母细胞 | 合成生物学 | NA | 拉曼流式细胞术（Raman flow cytometry） | NA | 拉曼光谱数据 | 基因组范围随机突变库中超过10个突变体 |
| 12 | 2025-06-01 |
Kinetic modules are sources of concentration robustness in biochemical networks
2025-May-30, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.ads7269
PMID:40435256
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research paper | 该研究探讨了动力学模块在生化网络中对浓度鲁棒性的作用，并提出了一种无需参数值即可识别这些模块的方法 | 提出了一种基于稳态反应速率耦合的动力学模块识别方法，无需参数值，并发现有序结合酶机制比随机结合更能增强代谢物浓度的鲁棒性 | 研究仅基于34个代谢网络模型，可能无法涵盖所有生化网络的复杂性 | 研究动力学模块在生化网络中的作用及其对浓度鲁棒性的影响 | 生化网络中的动力学模块和代谢物浓度 | 生物化学网络 | NA | 质量作用动力学 | NA | 代谢网络模型 | 34个代谢网络模型，涵盖26种生物 |
| 13 | 2025-06-01 |
MutS-mediated rapid and cost-effective error correction in in vitro DNA synthesis
2025-May-28, New biotechnology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.nbt.2025.05.002
PMID:40447215
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研究论文 | 本研究开发了一种基于MutS蛋白的快速、经济高效的体外DNA合成错误校正方法 | 利用重组表达的MutS融合蛋白和自制旋转柱，实现了高效、低成本的DNA合成错误校正 | 反应体积限制在10μL，可能不适合大规模应用 | 开发一种简单、快速、高效且经济的DNA合成错误校正方法 | DNA寡核苷酸和较长的目标分子 | 合成生物学 | NA | 重组蛋白表达与纯化，异源双链DNA结合分析 | NA | DNA序列数据 | 11种Cbm3-Egfp-MutS融合蛋白 |
| 14 | 2025-06-01 |
Structural Homology Fails to Predict Secretion Efficiency in Pichia pastoris: Divergent Responses of Architecturally Similar scFvs to Multi-Parametric Genetic Engineering
2025-May-21, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26104922
PMID:40430062
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研究论文 | 本研究通过基因剂量优化、表达盒设计和内质网分泌途径重编程三种策略，优化了Pichia pastoris中scFv的分泌效率 | 挑战了结构同源性（63%氨基酸同一性；RMSD 0.47 Å）确保一致优化结果的假设，强调了在合成生物学中需要针对蛋白质量身定制工程策略 | 研究仅针对两种结构同源的scFv变体PR961和PR953，可能不适用于其他蛋白质 | 优化Pichia pastoris中scFv的分泌效率，以支持AI驱动的生物制剂制造 | 两种结构同源的scFv变体PR961和PR953 | 合成生物学 | NA | 基因剂量优化、表达盒设计、内质网分泌途径重编程 | NA | NA | 两种scFv变体PR961和PR953 |
| 15 | 2025-06-01 |
Multi-Omics and Functional Insights into Triterpenoid Biosynthesis Pathways in Neopicrorhiza scrophulariiflora (Pennell) D.Y.Hong
2025-May-21, Plants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/plants14101562
PMID:40431127
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research paper | 该研究通过转录组学和代谢组学分析，探讨了濒危植物胡黄连中三萜类化合物的生物合成途径及其关键酶编码基因的表达模式 | 鉴定了8个参与三萜类生物合成的上游氧化角鲨烯环化酶（OSCs），其中NsOSC2是一种双功能酶，能催化2,3-氧化角鲨烯转化为α-香树脂醇和β-香树脂醇 | 研究未涉及其他可能影响三萜类生物合成的环境或发育因素 | 揭示胡黄连中三萜类化合物的生物合成分子机制 | 濒危多年生草本植物胡黄连（Neopicrorhiza scrophulariiflora） | 合成生物学 | NA | 转录组学、代谢组学分析 | NA | 基因表达数据、代谢物数据 | 不同组织的胡黄连样本 |
| 16 | 2025-06-01 |
The Transformation Experiment of Frederick Griffith II: Inclusion of Cellular Heredity for the Creation of Novel Microorganisms
2025-May-15, Bioengineering (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/bioengineering12050532
PMID:40428151
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research paper | 本文提出了一种改进的细菌转化实验设计（Griffith transformation experiment design 2.0），旨在实现DNA和非DNA结构及信息的有效交换，从而创造出具有显著形态/代谢表型差异的单细胞杂交微生物 | 提出了Griffith转化实验设计2.0，扩展了传统DNA转化范围，包括非DNA结构和调控信息的转移，为创造新型微生物提供了新方法 | 该方法仍处于概念阶段，实际应用效果和跨物种适用性有待验证 | 探索更高效的微生物遗传物质交换方法，创造具有新特性的杂交微生物 | 细菌细胞及其遗传物质 | 合成生物学 | NA | 细菌转化实验 | NA | NA | NA |
| 17 | 2025-06-01 |
Biosimilars Targeting Pathogens: A Comprehensive Review of Their Role in Bacterial, Fungal, Parasitic, and Viral Infections
2025-Apr-28, Pharmaceutics
IF:4.9Q1
DOI:10.3390/pharmaceutics17050581
PMID:40430873
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review | 本文全面综述了生物类似物在细菌、真菌、寄生虫和病毒感染中的作用 | 讨论了生物类似物开发中的障碍及创新技术，如抗体工程、合成生物学和无细胞蛋白合成 | 未提及具体研究数据或样本量，主要基于现有文献的综述 | 探讨生物类似物在治疗感染性疾病中的潜力和挑战 | 细菌、真菌、寄生虫和病毒等病原体 | NA | infectious diseases | antibody engineering, synthetic biology, cell-free protein synthesis | NA | NA | NA |
| 18 | 2025-06-01 |
Attaining the Promise of Geminivirus-Based Vectors in Plant Genome Editing
2025-Apr-27, Viruses
DOI:10.3390/v17050631
PMID:40431643
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综述 | 本文综述了基于双生病毒载体在植物基因组编辑中的应用及其潜力 | 探讨了双生病毒载体如何克服传统转基因技术的限制，加速基因组编辑过程 | 讨论了双生病毒载体在实际应用中面临的障碍 | 评估双生病毒载体在植物基因组编辑中的效果和潜力 | 植物基因组编辑技术 | 合成生物学 | NA | 病毒载体介导的基因编辑 | NA | NA | NA |
| 19 | 2025-06-01 |
Omics-driven onboarding of the carotenoid producing red yeast Xanthophyllomyces dendrorhous CBS 6938
2024-Dec-28, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-024-13379-w
PMID:39731599
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研究论文 | 本研究利用转录组学数据从红酵母Xanthophyllomyces dendrorhous CBS 6938中发现了组成型和光调控启动子，并开发了该生物的模块化合成生物学部件集合 | 结合系统生物学和合成生物学，开发了一种从组学到部件的流程，为非传统微生物提供了快速“入门”方法 | 许多假定的调控启动子在合成遗传背景下表现为组成型，仅有一个启动子在UV照射下显示出九倍激活 | 研究Xanthophyllomyces dendrorhous在不同光波长和氧化应激条件下的转录组学，开发其遗传工具 | 红酵母Xanthophyllomyces dendrorhous CBS 6938 | 合成生物学 | NA | 转录组学、差异基因表达分析(DGE)、基因本体(GO)分析 | NA | 转录组数据 | 在不同光波长(红、绿、蓝、紫外)和氧化应激条件下的Xanthophyllomyces dendrorhous样本 |
| 20 | 2025-06-01 |
Development of a xylose-inducible and glucose-insensitive expression system for Parageobacillus thermoglucosidasius
2024-Oct-23, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-024-13333-w
PMID:39441395
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研究论文 | 开发了一种木糖诱导且对葡萄糖不敏感的基因表达系统IExyl*，用于Parageobacillus thermoglucosidasius | 通过结合xylA5p启动子及其调节因子XylR，并减少葡萄糖对木糖摄取的分解代谢抑制，开发了IExyl*系统 | NA | 开发一种高效且多功能的诱导表达系统，用于菌株工程和合成生物技术应用 | Parageobacillus thermoglucosidasius DSM 2542 | 合成生物学 | NA | 基因表达调控 | NA | NA | NA |