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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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1 | 2025-05-29 |
Generation of cell-sized liposomes using laser-induced microjets
2025-May-28, Lab on a chip
IF:6.1Q2
DOI:10.1039/d5lc00149h
PMID:40302460
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研究论文 | 本研究提出了一种利用激光诱导微射流穿透含脂油相来生成细胞大小脂质体的新方法 | 采用高速激光诱导微射流技术可靠且可重复地生成细胞大小脂质体,实现了按需生产 | NA | 开发一种新型的细胞大小脂质体生成方法,推动膜科学和合成生物学领域的发展 | 细胞大小脂质体 | 合成生物学 | NA | 激光诱导微射流技术、高速摄像技术、数值分析 | NA | 视频数据(高速摄像)、数值模拟数据 | NA |
2 | 2025-05-29 |
CRISPR/dCas-mediated counter-silencing: reprogramming dCas proteins into antagonists of xenogeneic silencers
2025-May-28, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.00382-25
PMID:40434115
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研究论文 | 本研究开发了一种新型CRISPR/dCas介导的反沉默(CRISPRcosi)方法,通过使用无核酸酶活性的dCas酶来对抗Lsr2样异源沉默蛋白CgpS或Lsr2 | 提出CRISPRcosi方法,无需启动子工程即可有效反沉默异源沉默蛋白的靶启动子 | 在缺乏异源沉默蛋白CgpS的菌株中,反沉默效果因靶位点和链的不同而有所差异 | 研究如何通过CRISPR/dCas技术对抗异源沉默蛋白的抑制作用 | Lsr2样异源沉默蛋白CgpS和Lsr2 | 合成生物学 | NA | CRISPR/dCas | NA | 基因组数据 | NA |
3 | 2025-05-29 |
Structural Homology Fails to Predict Secretion Efficiency in Pichia pastoris: Divergent Responses of Architecturally Similar scFvs to Multi-Parametric Genetic Engineering
2025-May-21, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26104922
PMID:40430062
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研究论文 | 本研究通过基因剂量优化、表达盒设计和内质网分泌途径重编程三种策略优化了Pichia pastoris中scFv的分泌效率 | 挑战了结构同源性(63%氨基酸同一性;RMSD 0.47 Å)确保一致优化结果的假设,强调了合成生物学中蛋白质定制工程策略的必要性 | 研究仅针对两种scFv变体PR961和PR953,可能不适用于其他蛋白质 | 优化Pichia pastoris中scFv的分泌效率,以支持AI驱动的生物制剂制造 | 两种结构同源但基础分泌水平不同的scFv变体PR961和PR953 | 合成生物学 | NA | 基因剂量优化、表达盒设计、内质网分泌途径重编程 | NA | 蛋白质分泌数据 | 两种scFv变体PR961和PR953 |
4 | 2025-05-29 |
Multi-Omics and Functional Insights into Triterpenoid Biosynthesis Pathways in Neopicrorhiza scrophulariiflora (Pennell) D.Y.Hong
2025-May-21, Plants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/plants14101562
PMID:40431127
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研究论文 | 通过转录组学和代谢组学分析,研究了濒危植物Neopicrorhiza scrophulariiflora中三萜类化合物的生物合成途径及其关键酶编码基因的表达模式 | 鉴定了8个参与三萜类生物合成的上游氧化鲨烯环化酶(OSCs),其中NsOSC2是一种双功能酶,能够催化2,3-氧化鲨烯转化为α-香树脂醇和β-香树脂醇 | NA | 揭示三萜类生物合成的分子机制,为未来通过合成生物学方法生产关键三萜类化合物提供理论基础 | 濒危多年生草本植物Neopicrorhiza scrophulariiflora | 植物分子生物学 | NA | 转录组学, 代谢组学 | NA | 基因表达数据, 代谢物数据 | 不同组织样本 |
5 | 2025-05-29 |
The Transformation Experiment of Frederick Griffith II: Inclusion of Cellular Heredity for the Creation of Novel Microorganisms
2025-May-15, Bioengineering (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/bioengineering12050532
PMID:40428151
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research paper | 本文提出了一种改进的细菌转化实验设计(Griffith transformation experiment design 2.0),旨在实现DNA和非DNA结构与调控信息的高效交换,从而创造出具有显著形态/代谢表型差异的单细胞杂交微生物 | 提出了Griffith转化实验设计2.0,扩展了传统DNA转移的局限,整合了DNA、大分子、拓扑、调控和细胞遗传等多维度信息交换 | 该方法仍处于理论建议阶段,尚未经过实验验证,且跨物种应用可能仍存在兼容性挑战 | 探索通过改进细菌转化方法创建新型杂交微生物的可行性 | 细菌细胞(特别是(S)和(R)血清型的供体与受体细胞) | 合成生物学 | NA | 细菌转化实验(Griffith transformation experiment) | NA | NA | NA |
6 | 2025-05-29 |
Recent Advances in Multiple Strategies for the Biosynthesis of Sesquiterpenols
2025-May-03, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom15050664
PMID:40427558
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综述 | 本文综述了倍半萜醇生物合成的最新策略和进展,重点关注合成生物学方法 | 探讨了合成生物学在倍半萜醇微生物生产中的创新方法,包括适应性酶筛选、合成途径调控和细胞内区室化表达策略 | 面临产量低和生产成本高的挑战,阻碍了其工业化规模应用 | 推进倍半萜醇生物合成研究,解决当前生产中的关键挑战 | 倍半萜醇及其微生物生产系统 | 合成生物学 | NA | 微生物异源合成 | NA | NA | NA |
7 | 2025-05-29 |
Biosimilars Targeting Pathogens: A Comprehensive Review of Their Role in Bacterial, Fungal, Parasitic, and Viral Infections
2025-Apr-28, Pharmaceutics
IF:4.9Q1
DOI:10.3390/pharmaceutics17050581
PMID:40430873
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review | 本文全面综述了生物类似物在细菌、真菌、寄生虫和病毒感染中的作用 | 讨论了生物类似物开发中的障碍及创新技术,如抗体工程、合成生物学和无细胞蛋白合成 | 未提及具体研究样本或数据 | 探讨生物类似物在治疗感染性疾病中的潜力和挑战 | 细菌、真菌、寄生虫和病毒等病原体 | NA | infectious diseases | antibody engineering, synthetic biology, cell-free protein synthesis | NA | NA | NA |
8 | 2025-05-29 |
Attaining the Promise of Geminivirus-Based Vectors in Plant Genome Editing
2025-Apr-27, Viruses
DOI:10.3390/v17050631
PMID:40431643
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综述 | 本文综述了基于双生病毒载体在植物基因组编辑中的应用及其潜力 | 探讨了双生病毒载体如何克服传统转基因技术的限制,并加速基因组编辑过程 | 讨论了双生病毒载体应用中的障碍和挑战 | 评估双生病毒载体在植物基因组编辑中的应用前景 | 植物基因组编辑中的双生病毒载体 | 合成生物学 | NA | 基因靶向/插入技术 | NA | NA | NA |
9 | 2025-05-29 |
The Application of Multiple Strategies to Enhance Methylparaben Synthesis Using the Engineered Saccharomyces cerevisiae
2025-Apr-25, Biology
DOI:10.3390/biology14050469
PMID:40427658
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研究论文 | 本研究通过工程化酿酒酵母应用多种策略增强甲基对羟基苯甲酸酯的合成 | 通过代谢工程策略突破合成过程中的瓶颈,包括调控内源莽草酸途径的限速步骤、增强中心碳通量以及改善外源酶表达 | NA | 开发一种环境友好的甲基对羟基苯甲酸酯合成方法 | 工程化酿酒酵母 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、启动子工程 | NA | NA | NA |
10 | 2025-05-29 |
Metabolite-Responsive Control of Transcription by Phase Separation-Based Synthetic Organelles
2025-03-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00633
PMID:39954260
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研究论文 | 本文通过基于液-液相分离的合成细胞器,将代谢信号转化为基因转录调控 | 利用液-液相分离技术构建合成细胞器,实现代谢信号对基因转录的可逆和剂量依赖性调控 | 未提及具体应用场景或体内实验验证 | 开发具有生命感知和适应能力的合成生物材料 | 基于液-液相分离的合成细胞器 | 合成生物学 | NA | 液-液相分离技术 | NA | NA | NA |
11 | 2025-05-29 |
Engineering a New Generation of Gene Editors: Integrating Synthetic Biology and AI Innovations
2025-03-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00686
PMID:39999982
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research paper | 该文章探讨了如何通过合成生物学和人工智能创新来设计新一代基因编辑器 | 整合AI和机器学习技术优化基因编辑酶的发现与设计,提高活性、特异性和免疫原性预测 | 未提及具体实验验证结果或临床转化时间表 | 开发更安全高效的基因组编辑工具并推动其临床转化 | CRISPR-Cas基因编辑系统及其衍生工具 | synthetic biology | NA | AI/ML, rational design, mutagenesis screens, directed evolution | machine learning models | biological sequence data | NA |
12 | 2025-05-29 |
Improving Bacillus subtilis as Biological Chassis Performance by the CRISPR Genetic Toolkit
2025-03-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00844
PMID:40040244
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review | 本文讨论了利用CRISPR基因工具包提高枯草芽孢杆菌作为生物底盘性能的最新进展 | 介绍了CRISPR技术在枯草芽孢杆菌中的应用,包括基因编辑、转录调控和酶调节等方面的最新进展 | 未提及具体实验数据或样本量,可能缺乏实证支持 | 提高枯草芽孢杆菌作为工业底盘菌的性能,使其能与传统工业微生物如大肠杆菌和酵母相媲美 | 枯草芽孢杆菌 | 合成生物学 | NA | CRISPR | NA | NA | NA |
13 | 2025-05-29 |
Synthetic Biology Strategies for the Production of Natural Colorants and Their Non-Natural Derivatives
2025-03-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00799
PMID:40066730
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review | 本文综述了合成生物学策略在天然色素及其非天然衍生物生产中的应用 | 讨论了通过合成生物学方法提高天然色素产量及扩展其非天然衍生物颜色谱的策略 | 天然色素的稳定性、颜色谱有限以及从自然资源中提取的低产量问题尚未完全解决 | 探索利用合成生物学方法生产天然色素及其非天然衍生物的策略 | 天然色素及其非天然衍生物 | 合成生物学 | NA | 合成生物学方法 | NA | NA | NA |
14 | 2025-05-29 |
A Nitrate/Nitrite Biosensor Designed with an Antiterminator for In Vivo Diagnosis of Colitis Based on Bacteroides thetaiotaomicron
2025-02-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00602
PMID:39801064
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research paper | 本研究开发了一种基于Bacteroides thetaiotaomicron的抗终止微生物全细胞生物传感器,用于检测小鼠结肠炎 | 利用抗终止元件设计硝酸盐/亚硝酸盐诱导型启动子,优化了生物传感器对炎症环境中硝酸盐和亚硝酸盐的敏感性和特异性响应 | 研究仅在小鼠模型中进行初步评估,尚未在人体中进行验证 | 开发一种基于Bacteroides thetaiotaomicron的生物传感器,用于体内诊断结肠炎 | Bacteroides thetaiotaomicron和小鼠溃疡性结肠炎模型 | 合成生物学 | 结肠炎 | 合成生物学技术、微生物全细胞生物传感器 | 微生物全细胞生物传感器(MWCB) | 生物传感器响应数据 | 化学诱导的小鼠溃疡性结肠炎模型 |
15 | 2025-05-29 |
Construction and Characterization of MoClo-Compatible Vectors for Modular Protein Expression in E. coli
2025-02-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00564
PMID:39801078
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研究论文 | 本研究构建并表征了与MoClo兼容的低拷贝和中拷贝载体,扩展了现有的MoClo工具包,用于在大肠杆菌中实现模块化蛋白质表达 | 扩展了现有的MoClo工具包,增加了低拷贝(p15A)和中拷贝(pBR322)载体,实现了蛋白质表达范围覆盖500倍的荧光输出差异 | 研究仅限于大肠杆菌系统,未在其他宿主中验证载体的适用性 | 开发兼容MoClo的载体系统,优化蛋白质表达水平 | 大肠杆菌中的蛋白质表达 | 合成生物学 | NA | Golden Gate克隆, MoClo技术 | NA | DNA构建体, 荧光输出数据 | NA |
16 | 2025-05-29 |
Microbial Production of Ectoine: A Review
2025-02-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00490
PMID:39834017
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review | 本文综述了微生物生产四氢嘧啶的策略,包括野生菌株筛选、突变育种和模型菌株的代谢工程 | 综述了利用合成生物学和代谢工程技术替代传统嗜盐细菌生产四氢嘧啶的方法,提高产量且环保 | NA | 探讨更经济高效的四氢嘧啶生产方法以满足市场需求 | 四氢嘧啶及其微生物生产 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA |
17 | 2025-05-29 |
Do the Shuffle: Expanding the Synthetic Biology Toolkit for Shufflon-like Recombination Systems
2025-02-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00790
PMID:39869770
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研究论文 | 本文研究了天然DNA倒位系统在合成生物学中的应用,特别是Shufflon倒位酶(SI)的改进和扩展 | 鉴定了14个先前未经测试的SI基因及其位点,并开发了一种基于单分子测序的测定方法,以量化这些酶的倒位速率并确定正交SI/位点对 | 研究中仅使用了公开数据库中的SI基因,可能未涵盖所有潜在的SI基因 | 扩展合成生物学工具箱,改进Shufflon倒位酶的应用 | Shufflon倒位酶(SI)基因及其识别位点 | 合成生物学 | NA | 单分子测序 | NA | DNA序列数据 | 14个SI基因 |
18 | 2025-05-29 |
Cell-Free Systems to Mimic and Expand Metabolism
2025-02-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00729
PMID:39878226
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research paper | 该文章探讨了无细胞合成生物学在代谢和遗传程序中的应用及其扩展潜力 | 将无细胞系统用于原型化代谢路径和设计新型反应网络,以探索非自然化学反应和替代代谢路径 | 目前仅探索了无细胞系统中代谢可能性的一小部分,且主要依赖模式生物的提取物 | 理解和工程化基于生物的化学转化 | 无细胞系统及其在代谢和遗传程序中的应用 | 合成生物学 | NA | 无细胞合成生物学技术 | NA | NA | NA |
19 | 2025-05-29 |
Considerations for Domestication of Novel Strains of Filamentous Fungi
2025-02-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00672
PMID:39883596
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综述 | 本文探讨了丝状真菌作为生物技术资源的潜力及其驯化新菌株的考虑因素 | 综述了利用合成生物学和系统生物学工具开发丝状真菌作为微生物细胞工厂的新方法 | 未提及具体实验数据或案例研究 | 探讨丝状真菌在生物技术应用中的潜力和挑战 | 丝状真菌 | 生物技术 | NA | 合成生物学、系统生物学 | NA | NA | NA |
20 | 2025-05-29 |
Characterization of Rationally Designed CRISPR/Cas9-Based DNA Methyltransferases with Distinct Methyltransferase and Gene Silencing Activities in Human Cell Lines and Primary Human T Cells
2025-02-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00569
PMID:39898483
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研究论文 | 本文描述了通过合理设计CRISPR/Cas9基础的DNA甲基转移酶,在人类细胞系和原代人类T细胞中实现不同的甲基化和基因沉默活性 | 通过突变DNMT3A的催化核心,稳定了dCas9-DNMT3A/3L融合蛋白在Jurkat T细胞中的表达,同时保持了DNA甲基化和基因沉默性能 | 研究主要局限于细胞系和原代T细胞,可能限制了在其他细胞类型中的适用性 | 扩展表观遗传编辑工具包,为工程化dCas基础的DNMTs在原代哺乳动物细胞类型中的应用提供路线图 | 人类细胞系和原代人类T细胞 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9, DNA甲基化 | dCas9-DNMT3A/3L | 基因表达和DNA甲基化数据 | 多种人类细胞系和供体来源的人类T细胞 |