合成生物学相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
1	2025-05-16	Excavation of acoustic nanostructures biosynthesis gene clusters by combinatorial strategy 2025-May-15, Advanced biotechnology DOI:10.1007/s44307-025-00069-5 PMID:40372536	研究论文	通过组合策略挖掘声学纳米结构生物合成基因簇	构建了来自Serratia sp. ATCC 39006的结构基因簇和来自Bacillus megaterium的辅助基因簇的混合基因簇，合成了新型基因编码的气囊，能够在临床超声机器中成像	气囊的形状和大小限制了其在生物医学中的应用	开发新型基因编码的气囊，以扩展其在超声成像和药物递送中的应用	气囊纳米结构	合成生物学	NA	合成生物学策略	NA	NA	NA
2	2025-05-16	Microfluidic Fluorescence-Activated Cell Sorting of Convolutional Neural Network-Designed Synthetic Yeast Promoter 2025-May-14, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.5c00025 PMID:40368332	研究论文	本文开发了一种分支卷积神经网络（B-CNN）结合遗传算法，用于设计和筛选合成酵母启动子，并通过微流控荧光激活细胞分选（μFACS）系统进行高通量筛选	结合B-CNN和遗传算法设计合成启动子，开发了μFACS系统进行高通量筛选，提高了启动子强度和产物产量	未提及实验的具体样本量或筛选范围的具体限制	提高合成酵母启动子的设计和筛选效率，以增强基因表达和代谢物生物合成	酵母启动子，特别是酒精氧化酶1启动子（P）	合成生物学	NA	微流控荧光激活细胞分选（μFACS），遗传算法	分支卷积神经网络（B-CNN）	序列数据，荧光信号	未明确提及具体样本量，但提到细胞通量达到7000细胞/秒
3	2025-05-16	Protease engineering: Approaches, tools, and emerging trends 2025-May-12, Biotechnology advances IF:12.1Q1 DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108602 PMID:40368116	review	本文综述了蛋白酶工程的方法、工具和新兴趋势，重点介绍了定向进化和高通量策略在工程化蛋白酶底物特异性中的应用	讨论了新兴的蛋白酶工程策略，如抗体-蛋白酶融合和蛋白酶底物特异性切换，以及分裂和自抑制蛋白酶的设计原则	NA	探索蛋白酶工程的方法和策略，以实现对蛋白酶活性和特异性的精确控制	蛋白酶	合成生物学	NA	定向进化、高通量筛选	NA	NA	NA
4	2025-05-16	Characterization and Optimization of Vesicle Properties in bioPISA: from Size Distribution to Post-Assembly Loading 2025-May, Advanced biology IF:3.2Q3 DOI:10.1002/adbi.202400483 PMID:39692631	研究论文	本研究探讨了通过生物催化聚合诱导自组装（bioPISA）制备的囊泡作为人工细胞的形成和性质	探索了实现囊泡尺寸均匀性的方法，并研究了搅拌速度对囊泡形态的影响，同时证明了将大分子装载到预形成囊泡中的可行性	未提及具体应用场景的实际效果验证	开发具有可控形态的酶合成聚合物囊泡，用于合成生物学等领域	通过bioPISA制备的囊泡	合成生物学	NA	荧光相关光谱（FCS）、电穿孔	NA	NA	NA
5	2025-05-16	Regulating Protein Immobilization During Cell-Free Protein Synthesis in Hyaluronan Microgels 2025-May, Advanced biology IF:3.2Q3 DOI:10.1002/adbi.202400668 PMID:39957478	研究论文	研究利用透明质酸微凝胶作为实验平台，探索无细胞蛋白质合成（CFPS）与微凝胶内蛋白质原位积累的相互作用	首次提出利用透明质酸微凝胶作为平台，研究蛋白质合成的时间-空间调控，通过定制蛋白质结合或释放来调控反应环境	研究尚处于初步阶段，仅展示了平台的基本功能和GFP-His的结合能力，未涉及更复杂的蛋白质调控机制	探索无细胞蛋白质合成与微凝胶内蛋白质原位积累的相互作用，为合成生物学提供新的实验平台	透明质酸微凝胶、His-tag修饰的GFP、线性DNA模板	合成生物学	NA	无细胞蛋白质合成（CFPS）、蛋白质结合分析	NA	蛋白质积累数据	NA
6	2025-03-13	Distinct Network Morphologies from In Situ Polymerization of Microtubules in Giant Polymer-Lipid Hybrid Vesicles 2025-May, Advanced biology IF:3.2Q3 DOI:10.1002/adbi.202400601 PMID:40071650	研究论文	本研究展示了在由1,2-二油酰-sn-甘油-3-磷酸胆碱和两亲性嵌段共聚物组成的巨型聚合物-脂质杂化囊泡（GHVs）中原位聚合微管的过程	通过改变GTP或其缓慢水解类似物GMPCPP的浓度，观察到不同的微管形态，包括封装的微管网络、尖刺突起以及膜相关或聚集的微管	NA	模拟细胞骨架并揭示膜组成对微管形态的影响	巨型聚合物-脂质杂化囊泡（GHVs）中的微管	合成生物学	NA	原位聚合	NA	NA	NA
7	2025-05-16	Scaling Up Synthetic Cell Production Using Robotics and Machine Learning Toward Therapeutic Applications 2025-May, Advanced biology IF:3.2Q3 DOI:10.1002/adbi.202400671 PMID:40162738	研究论文	本文开发了一种自动化方法，用于大规模生产用于治疗应用的蛋白质合成细胞	结合机器人液体处理系统和人工智能图像分析，显著提高了合成细胞的生产效率和表征准确性	研究主要针对小鼠模型，尚未在更大规模或更复杂的生物系统中验证	提高合成细胞的生产效率和表征准确性，以用于治疗应用	蛋白质合成细胞	合成生物学	NA	机器人液体处理系统(LiHa)、人工智能图像分析	AI	图像	小鼠模型
8	2025-05-16	Machine learning-led semi-automated medium optimization reveals salt as key for flaviolin production in Pseudomonas putida 2025-Apr-18, Communications biology IF:5.2Q1 DOI:10.1038/s42003-025-08039-2 PMID:40251395	研究论文	本文介绍了一种基于机器学习的半自动化培养基优化方法，显著提高了恶臭假单胞菌中黄酮醇的产量	提出了一种分子和宿主无关的主动学习流程，通过半自动化管道快速优化培养基，并发现盐浓度是影响黄酮醇生产的关键因素	未明确说明该方法在其他宿主或分子生产中的普适性	优化培养基以提高恶臭假单胞菌中黄酮醇的产量	恶臭假单胞菌KT2440和黄酮醇生产	合成生物学	NA	机器学习，主动学习，半自动化管道	NA	实验数据	三个不同的黄酮醇生产实验
9	2025-05-16	Long-Term Yeast Cultivation Coupled with In Situ Extraction for High Triterpenoid Production 2025-Apr-02, Journal of agricultural and food chemistry IF:5.7Q1 DOI:10.1021/acs.jafc.5c00273 PMID:40129278	research paper	该研究通过结合长期酵母培养与原位提取技术，提高了工程酵母细胞内人参皂苷的生产和输出效率	结合长期酵母培养与原位提取技术，显著提高人参皂苷产量，并实现酵母的重复利用	研究未提及该方法在大规模工业化生产中的可行性和成本效益	提高人参皂苷的生产效率，支持其工业化生产	工程酵母	合成生物学	NA	酵母培养与原位提取技术	NA	NA	NA
10	2025-05-16	Advances in synthesizing plant-derived isoflavones and their precursors with multiple pharmacological activities using engineered yeasts 2025-Mar-29, Microbial cell factories IF:4.3Q1 DOI:10.1186/s12934-025-02692-2 PMID:40155940	综述	本文综述了利用工程酵母合成植物源性异黄酮及其前体的进展，包括其药理活性、生物合成途径及生产技术策略	总结了合成生物学和先进生物技术策略在环境友好型生物活性异黄酮生产中的应用	未提及具体实验数据或样本量，可能缺乏对当前技术局限性的深入讨论	探讨利用工程酵母可持续高效生产异黄酮的方法	植物源性异黄酮及其前体，如大豆苷元和染料木素	合成生物学	NA	工程酵母生物合成	NA	NA	NA
11	2025-05-16	TTLOC: A Tn5 transposase-based approach to localize T-DNA integration sites 2025-Mar-28, Plant physiology IF:6.5Q1 DOI:10.1093/plphys/kiaf102 PMID:40131780	研究论文	本文介绍了一种基于Tn5转座酶的T-DNA整合位点定位方法TTLOC，用于高效、低成本地检测转基因植物的T-DNA整合位点	开发了基于Tn5转座酶的新型T-DNA整合位点定位技术，相比传统方法具有操作简便、高通量、成本低等优势	未明确说明该方法在复杂基因组中的定位准确率或与其他方法的直接比较数据	开发高效检测转基因植物T-DNA整合位点的技术，以促进作物育种和植物合成生物学研究	转基因拟南芥、水稻、大豆、番茄、马铃薯和小麦	植物分子生物学	NA	Tn5转座酶介导的基因组DNA片段化，NGS测序	NA	基因组测序数据	65个转基因拟南芥株系和多种转基因作物（水稻、大豆等）
12	2025-05-16	Xenotopic synthetic biology: Prospective tools for delaying aging and age-related diseases 2025-Mar-28, Science advances IF:11.7Q1 DOI:10.1126/sciadv.adu1710 PMID:40153513	综述	本文探讨了利用其他物种的酶来逆转与年龄相关的代谢变化，以延缓衰老和年龄相关疾病的策略	提出利用非哺乳动物酶作为延缓衰老和年龄相关疾病的未开发资源	NA	探讨延缓衰老和年龄相关疾病的新策略	来自低等生物的一组酶，这些酶影响与年龄相关过程的代谢参数	合成生物学	老年病	NA	NA	NA	NA
13	2025-05-16	CAR-T therapy dilemma and innovative design strategies for next generation 2025-Mar-27, Cell death & disease IF:8.1Q1 DOI:10.1038/s41419-025-07454-x PMID:40148310	综述	本文综述了CAR-T细胞疗法面临的困境及下一代设计的创新策略	提出了基于合成生物学、生物支架、纳米材料等多学科策略的创新技术，以克服当前CAR-T细胞的障碍	NA	探讨CAR-T细胞疗法在肿瘤免疫治疗中的困境及解决方案	CAR-T细胞疗法	肿瘤免疫治疗	血液肿瘤	合成生物学、生物支架、纳米材料、溶瘤病毒、CRISPR筛选、肠道微生物及其代谢物	NA	NA	NA
14	2025-05-16	Last Decade Insights in Exploiting Marine Microorganisms as Sources of New Bioactive Natural Products 2025-Mar-07, Marine drugs IF:4.9Q1 DOI:10.3390/md23030116 PMID:40137302	综述	本文回顾了过去十年在利用海洋微生物作为新型生物活性天然产物来源方面的关键进展	强调了基因组学、代谢组学和生物信息学技术创新在发现和表征这些化合物中的作用，以及合成生物学和代谢工程在优化天然产物产量和生成新型生物活性化合物方面的进展	NA	探索海洋微生物作为生物活性天然产物来源的潜力及其在蓝色经济领域的应用	海洋细菌、真菌和微藻	生物技术	NA	基因组学、代谢组学、生物信息学、合成生物学、代谢工程	NA	NA	NA
15	2025-05-16	Applied photosynthesis: An idea whose time has come 2025-01-01, Biochimica et biophysica acta. Bioenergetics DOI:10.1016/j.bbabio.2024.149525 PMID:39571881	研究论文	本文介绍了生物混合能源系统在可持续能源生产中的前沿研究，特别是利用光合作用机制开发环保高效太阳能技术	结合合成生物学与纳米材料工程，优化生物混合设备的光吸收、能量转换和稳定性，探索独特的光活性色素	NA	开发可持续能源技术，替代传统太阳能技术	生物混合设备，包括蓝藻、藻类、紫色细菌和古菌等光合生物	可再生能源技术	NA	合成生物学、纳米材料工程	NA	NA	NA
16	2025-05-16	Digital switching in a biosensor circuit via programmable timing of gene availability 2014-Dec, Nature chemical biology IF:12.9Q1 DOI:10.1038/nchembio.1680 PMID:25306443	研究论文	该研究展示了通过可编程的基因可用时间控制，利用位点特异性重组酶在多基因电路中纠正不良效应，显著提高了比例传感器的性能	通过可编程的基因可用时间控制，显著减少了比例传感器的基底泄漏，并将动态范围从20倍提高到1000倍	NA	提高合成生物学中基因电路的稳健性和性能	内源性microRNA的比例传感器	合成生物学	NA	位点特异性重组酶	NA	基因表达数据	NA
17	2025-05-16	Analysis of rRNA processing and translation in mammalian cells using a synthetic 18S rRNA expression system 2012-Sep, Nucleic acids research IF:16.6Q1 DOI:10.1093/nar/gks530 PMID:22718970	研究论文	开发了一种用于哺乳动物18S rRNA的表达系统，用于研究rRNA的加工、组装和功能	首次开发了能够修改并功能性地检查哺乳动物18S rRNA的表达系统	未明确说明系统的普适性或是否适用于其他类型的rRNA	研究高等真核生物核糖体RNA（rRNA）的加工、组装和功能	小鼠18S rRNA	合成生物学	NA	杂交监测表达和切割，突变分析	NA	NA	未明确说明具体的样本数量
18	2025-05-15	Metabolic engineering for microbial production of sugar acids 2025-May-13, BMC biotechnology IF:3.5Q2 DOI:10.1186/s12896-025-00973-7 PMID:40361067	综述	本文综述了微生物生产糖酸的代谢工程方法及其应用	强调了代谢工程和合成生物学工具（如CRISPR-Cas和动态调控回路）在优化微生物菌株生产糖酸中的应用	未提及具体实验数据或生产效能的定量分析	探讨微生物生产糖酸的代谢工程策略及其工业应用	C5和C6糖酸	生物技术	NA	代谢工程、CRISPR-Cas、动态调控回路	NA	NA	NA
19	2025-05-15	Extracellular Bacterial Production of DNA Hydrogels-Toward Engineered Living Materials 2025-May, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany) DOI:10.1002/smll.202502199 PMID:40143682	研究论文	该研究通过合成生物学与人工材料的结合，首次实现了基于DNA水凝胶的工程化活材料（ELMs）的生产	首次利用外生电细菌Shewanella oneidensis生产DNA水凝胶，开发了可诱导细胞表面锚定技术，实现了活细菌背景下DNA水凝胶的原位生产	研究尚处于初步阶段，仅展示了在生物电化学系统表面生成稳定生物混合生物膜的能力	开发具有导电性和代谢活性的动态生物混合材料系统	外生电细菌Shewanella oneidensis和DNA水凝胶	合成生物学	NA	SpyCatcher/SpyTag (SC/ST)技术	NA	NA	NA
20	2025-05-15	A pectin acetyl-transferase facilitates secondary plasmodesmata formation and RNA silencing movement between plant cells 2025-May, The Plant journal : for cell and molecular biology DOI:10.1111/tpj.70194 PMID:40353833	研究论文	本文研究了植物细胞间RNA沉默移动的机制，特别是通过果胶乙酰转移酶调控次级胞间连丝形成的过程	首次发现果胶乙酰转移酶突变会减少次级胞间连丝数量，从而影响小RNA和蛋白质的细胞间移动	研究主要局限于拟南芥叶片组织，根部细胞间移动机制可能不同	阐明植物细胞间小RNA移动的分子机制及其调控因素	拟南芥中的小RNA（miRNA和siRNA）和胞间连丝	植物分子生物学	NA	正向遗传筛选、原子力显微镜、抗体标记技术	NA	遗传数据、显微图像数据	拟南芥突变体